ClCG01G013770.1 (mRNA) Watermelon (Charleston Gray)

NameClCG01G013770.1
TypemRNA
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (Charleston Gray))
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr01 : 27523094 .. 27546305 (-)
Sequence length255
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
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GAGCTCTAGAAGCTTGAATAATTGAGGTTGGATGCTCATGAGAACTCCAGAATTTATAAGGAAAAGACGAAGCTATTTCATGACCGATCACTCATCAGAAAGAACTTCAAAGTCGGTCAGAAAGTTCTTTTTTTTAATTCCCCCCTTCAGTTTATGCTAGGTAAGTGGTTGGGTTCGTTTGGAATTACTAACATCTTTCATCATGGTGCAGTTGAGGTTCAAAGTTTGGAAACTGAGAAAGTATTTAAGGTGAATGGGCACCGTTTAATGATCTTTAACGAAGGGGAGACTGAGTTAGCTACCTCGAGAATGGGTTTGGCACTTCCCTCGTATTCCTGAGCCCATATTCGCCAGTCGTTGAGCAACCAACATTAAACATTTGTGCTTCCTAGAGGTAGCTAGACATCAACTTTAAATGCTTTCTTTCATTCTGTTTTAGTTTGCTTTGTTTGGTTTTAGTTAGATAAGGGTTTTGATGATGATTTTCTGTGATGGCAGTAAATTCTTACATTGATGGTGTGAAGCATGCTCAACCCCACACATGCCTAAAAATCAGGGAAGTTCTCTGTTTCCCTCCCTTTCTCTTTGTCCTTGTGCGTTATTGTTCTTTATTGATACATTGAGAACAATGTATGATTTAAAAGTTGGGGGTGGTTTGGGTTACATGCTCGCATGTTCTTTGATTATTTGGGCTGAGAATATAATTTCTTTGTGATCTATGGATTGATTTTATGCTTGGTTTGTCTGGTGAACCCTTGAGCATTTGAGCTCAGGTTTTGCATGTATTGAATGTTTTGCTTAATATTTTGCTCATTGTTGCCTTGCTTGTTTCAATGAATGTTGATGATACACCTCTCTTATTTAGATTTGCATGACCTTACGATTAAAGAAACATTCATGATTTTTAAGCCCATTTTTAAAATTTTTGTTCTTGAAATCTCATGCATATTTAAATGTTTTGTTGAATCATTCAGATTCTTTGATGCTTAGAAATGGATTATCATGCTTGGATGTTTGTTGTCACCTCAAAAGACCCACTTTTGGTTAGAGACTTGCTTTCCCCAAATTAGTGTAATACTAGACTAGGAGAGTAAAAGAGAAATAAGCCTATGTGTCAAATAAAAAAGGTGTTGAAAAGAGAAGAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAGAAAGAAGGAAAAGCCAAAAAGAGTGAATAAGAGAAAGAAAAAAAGAAAAGTGTGTGTGAGTGCATAGGTAGGGGTGGAAAAGAGCTACCCTTGTTGTGATTAGTTAGAACGCCCACGAGAAAAAAGTGGGTACGAGTCCCTACAATAGGTTTGTAAAAGCTAGCACCTCAAGGTAAAAGCAATGCGCTTTTCTTTTACGTTGTGCGTGTGTTAGGCATCTTGCCAAAGTATTACACCCTTTTTGAGTGGGAGCAACTTAAAGACCAATGACCGAGTCAGAGTAGGGGGAAAAAAATTGGAAGCTTGATAAAACCTTTTCGAATATGCTTAGAATAAAAATGATGATGCTTTGCATTCACTCATGCATGATTTTACTTGAAAAGAGTTTTTAAATTGTTTCACAAATTGATTATCTGCAATCGGATTCCTAAGTAATTTCAAAACTACCTTGAGAATTGTTAAAACCTAAGTCACGAGTTTTGTAACCTAGTAAGCTATCATTGCATGATTGAGTGTATTTCTATCTTGCTCAGGAACGATCAAGAATCAAGTTTGGAGTGATTTGATTGCTCCTAAAAAGAGCTATCTTTCCCAGCTTTATTTGGGCTTGTTCCGTCATTTTATTGTTTTATTTGCTGCATTTTCAGGCTATGCGCATTGAGGTAGTAGGATGGACCATTGGGGTTGTTTTGGTGCAAAAACGAGTCAAAATGGAGCTCCAGAAGCATAAACCAAGAAAGGGGGTAGAATTGACCAAAATGCCCCTAGAAGCGCAGTTGTGCTGAGCTTTAAGCTGAAGACTTGAGAGCAAATTCGGCATCAGCGTTGCGACACTTCGGGGGAGTGCAGCGTCGCTCAGGAGTTTAATGGAAGTCAGAATGCGAGCGTTCATCTCAACGTAGCGCTTAGCGTCACTACGCTTGAGACTGGTGCCGACTTCTTTGATGAGCGTAGTGACGCTGTTGGGGAGCGTAGTGACGCTTTGGTGATTTCTTTATATACTTCGGATTTTTTAGGTTATTTTCATCACTCATCCGACCTCCAACCACCATTTTAGACTCTTTTTGCTACAAATCTTCATCTTCTCTTCCTTTTTTTTCTCATCATTTCTATTTCTAATTGCTTAAAGACTTGCTGATTTTGCTTCATGAGGATGATCGACTAAGGTAAGTGTATTTGGGGGTTAGATTTTAGGCTTAATTTCTTGAGATTGTATGAGATTGATTACCATTGAATGGATATGATTATGAATTTAATCCTTATTAAAGTTGCTTGATGTAATTGACGTCTCTTGATAGTATCTTCTTTAATTGCAAAATTTGTTGGCGCTGAGCATAATACAAATTAAATTACATGATTAATTTTGTAAAGAATTTGATTGAGGGCTTTTTCATTGATTGAATCTTTATGAATTAATTGAATCAAATCTCTAATCGAATGTTAGTCTAGGCTTTTCGAACTCTAATTCGTCCTAATTAAACTCCGTTTGCCTAATGCAAATTCGGTTCGTTATTGAAAACGTTATCGTTCTAAATAATTGAATTGGGTTTAGTTCAAATCATGCTTGCTTAGTTTGTTAATTTGGAACATCTAGTGACATTTTTTGTCATTTAATTATGGTTCATTGGTAATTTGTCTTTATGTTTAGTAATCAACGACAGGGATTAAGCCGAATCTGTTCCTATTCCTTATTCCTTTCTTATTCGTTCGATTCCTTTAAGCTCTCTTGCATCAATTTCTTTGATTAATTTTTACTTTCATGCTTTAAAATTCCCCATGTCCCCAACCCCTCCCCCTCCCAACCTAAAAGGATCGAATATTGAGTTAGACAAGTCACAAGCTCCCTGAGGATCAACCCGTGCTTGCCATTATTGCTACAGTTTGTGGTAATAATGGTATATTTGGAGTTATAAATTTAATTTGATAGTGGGATAGAGGGGTTTATGACGCCCATTTGTCTCGCATATCAACTGCCATAAAATTCTACAAGTTTTCACATAGAAATGATGAATTTTGCATATTTTCATACTACCAACAAGCTAGTTAA

mRNA sequence

ATGGCGACCGATGGCTCGAGGGCGGTTGGGCTCGAGAGTGACGGACAATCGGAAGTTGTTGCTGTAGCCGTCTATTTGCAGATATGGCGTTCGGCGTTCACGCAGGTTCCGTCTTTGTTCGCCGGTTGTCCGCACTGGGATAGAGGGGTTTATGACGCCCATTTGTCTCGCATATCAACTGCCATAAAATTCTACAAGTTTTCACATAGAAATGATGAATTTTGCATATTTTCATACTACCAACAAGCTAGTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCGACCGATGGCTCGAGGGCGGTTGGGCTCGAGAGTGACGGACAATCGGAAGTTGTTGCTGTAGCCGTCTATTTGCAGATATGGCGTTCGGCGTTCACGCAGGTTCCGTCTTTGTTCGCCGGTTGTCCGCACTGGGATAGAGGGGTTTATGACGCCCATTTGTCTCGCATATCAACTGCCATAAAATTCTACAAGTTTTCACATAGAAATGATGAATTTTGCATATTTTCATACTACCAACAAGCTAGTTAA

Protein sequence

MATDGSRAVGLESDGQSEVVAVAVYLQIWRSAFTQVPSLFAGCPHWDRGVYDAHLSRISTAIKFYKFSHRNDEFCIFSYYQQAS
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
ClCG01G013770ClCG01G013770gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG01G013770.1ClCG01G013770.1-proteinpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG01G013770.1.cds2ClCG01G013770.1.cds2CDS
ClCG01G013770.1.cds1ClCG01G013770.1.cds1CDS