Bhi10M001409 (mRNA) Wax gourd
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAGCTAATATTTATGATCTTAAGGTGCCTCTAAATCCACGGGACTTCATTAATGTAAGTTCTTGACCTTAATTAATTCATTTTATTTGCTTCATTTAGACACCATCATCAATTTTCTAAATCAATTTTTCATTTACTTGATTGAATGGATATTTGGTGTAGTATTTTTTTTTTCCGAAGAGAGAAATTTCATTACCACTGTAGTACTATATGACAAGTTGCATCCACCTCAATAATAAAGTGTGATAAAGGAGGTGTATAGAACCTCAAGACTTCAACACTAAAGAAAGAGAAACCATGGCACCTAAACCAACATCGAAATCTCGAAGGTAGGAACAAATTCAATTTCACTGAAATTACACATAAAGAACTTGTAAGGTCTTATAAATTTTATTCTTGTCCAACCAAATGGTCCACATCCTAACACAAGCTAAACAAAATTCAACATGCGATAGAAATTTCATAAAAAAAAAAAAAATCAAATATCCACAAATAGAATGATGTAGCACTCAAATCTTTGAGCAAATCTTAAAGAAGGTTTTATTAATGTGTGTGAAAATAAAAGATAAGTCCCCTTAAATGGACTTAAAGGGAAAGGGCTTGATCACCTCTAAACTAACTTACTAACTAATCTAAATCTAACCTCCGTAAATAGATCCTCGGGTCACACCTAAACTAAAATTAACAAAATGAAATTAAAAATATTAATGAAAAATGCATTTGGTAAAAACTTGTAAGAATTCCCAAAATACCTTACATCAATTTTCCTCCAATAAAGAATAACTTGACCTGAGTTATGTTGCTAGTTGAAAGTCATCCGGTGGGTAGTATGGAGTGAGGTTTACAACGTTGGATGTGGAATGGATGTTGAGTGAAGGAGGAAGTCAACTTGATAGGCCTTTTCTCCAATTTTATTGATGATTTTGAATGGTCTGAGCTTTTTGTTGGAGAGTTTTCTGTAATTTCCAGTGGGTAGCCTTGTTTCTGATGGATCATTACTAGATCTCCAAGTTGGAAGATTTGGATGCATTTGTGTTGATCGACTTTGGCTTTGTATGATGGCATTGGCAGCTTCTAGGTGGTCTATTACTTCTTGGTGTAATTTTTTTATTCGGTCCACCATTTGTTCTACTTCTACATTTCAATCAATAAATATGGAAGATTAATAAGATCAAAAGTTAGACGAGGAAGTTTAGTATAAACTACTTCAAATAGACACTTCCCTGTAGATTTGTTCTGTATATTGTTGTAAGCAAATTCAGCTTAGGCAAGACAAGTATCCCATTGTCTTGGTTTGTCGCTGGAAAGATATCTAAATAGGTTGCCAAGTGTCCTATTTGTTACTTCCATTTGGCCACCTATTTGAGGGTGGCTTGTAGCGCTGAATTTTAGGTTTGTGTCAAACCTTTTCGAAAGAATTTTCCAAAAAAAGCTCATAAATTTTATATCTCGATCTGATATTATTGATTTTAGGATCCCATGGATTTTGAAAATTCATCTGGAAAAGAGGTTAGCAATGAACATAGCTTCAAATGTCTTTTTGTAAGTAATAAAATGTGTCATCTTGCTAAATCTGTCCAAAACAATAAATATGGAATCAAAACCTCTTTGTGTTCTAGGTAATCCAAGGATAAAACCCATGGATAAATCCTCCCATATAGAATTTGGAATGGGTAAAGGTGTGTATAGTCCAGTATTTTGAGTTCTTCCTTTGACTTTTTGACATATAAAATATCTTTTTACAAAGTTGTTTACATCTTTCCTTTGTTGTGACCAATAAAAACATTCACTAATTGAAATTAGGGTTTTGTCCCTTCCAAAATGTCTGGCTAAACCGTTTGAGTGAGCTTCTTGGATAAGTGCTTCTCTAAGAGATCCTTGGGTATACATAATTGGCTGCCTTTGAAAAGGAATCCATCAAGTAAGTGGAAGTCTTTGCAGTTGTTGATAGTTAAACAAGATTGTCACGTGTCATGGAAATTGGGGTCATTTCCATATGATGTAGGAAGGTGGTAAAAAACAATAATAGATCTACGTAAAAGTGTTAATAAATTGGCATTCCTACTTAAAGCATCTGCTACCTTATTAGATGACCCTAAAGTGTGTTTGATCATGAAGTCAAATTTTTGGATAAAAGTAATCCATTTAATATGCATTATACTAACATGCTTTTCGGAATGGACAAAATTTAAGGAGTAGTGATCAATAAGTAAGACAAATTCTTTTCCAATGAGGTAGTGTTCCTAATGTTGGAGTGCTCGAACTAAGAAGTAGTTCTTGTGCATAGGTGAATCATTTTTTGTGAGGTTCACTTAATTTTTCACTAAAGAACTCAATTGGGTGATTTTTTTGAGATAAGACAGCCCCAATACCTACCCCACAAGCATCAACAACAACTCCAAATGCTTGGAGAAATCGGGTAAAGCTAGGATTAGAAGAGATGGTAATTTGGATTTCAATGTATTAAAGCTATGTAAGGTATCTTCATTCTATTCAAACTTTCCTTTCTTAAGGCAATAGATAAGAAGAGCTGCTAGAGAGCTAAACTTTCTAATGAATTTACGATAAAATGAGACAAGACCCCAAAGAAAGATTGCACCTCTTTTAGGGGGTGTTTGGCTCACCAACATGAGTTGAGTTGAGTTGGTATAATATACCAACTCATTGTTTGGTCCACCAACTTTAAATGTTAGTGGAGTTGAGTTGATATATTTTACCAACTCACCCCAACTCTCCATTCTTTTCATGTTTTCAATGACTCCACCCATCGGTAACTGTCACACTCCAAGAACTAACTTCGGACTCCGACAACCACCTTCGATGACAACTTTGACGACCAATTCCTGGCTCTGTCAATCACCTCTAATGAAAATTCTGGCGACAAAATTCGGTCTCCAACAACCACCTCCGATGATAGCTTCAGCGACCAACTCCAAGCTCCGACAACCTTCGCGCGGCCAACTCCGAAAACCAATTTTGGCCTCCAAAAATCTCTGATGACCCAACTCCGACGACCACCTTCACGCTACCAACTCCAACGACTAATTGACTTCGACAACAAACTCCGATGACCAACTCCGATGACCACCTTTGTAGGCTTCGACAACCACCGCTAACTACAAACTCCGATGAATTTCGCCCGGCCAACTCCGGGATTCGAAAACCACCTCCGATGACAAACTTCGACAACCAACTCCAATACACCTTCATGCAATCGACTTCAGACTTCGACTACAAACTCCAGCAAAAATCATCTTCGATAATCAACTTCGACAACCACTTCCGACTACTAATAAGACTGGTGACTGTTAAAGTATGTTGTAAGGTTGTTGATTATATAAAAAATATTATTTTGTCTACATTAAATGCAATATTTATACGTGATGAATTCATATATCAAATGAGTGTTAAGAATATTTAGACGAAAAGTATGTATGTAGTTGAAAAGTATGTAATATATAACAAAAAAAAACCATAAAATGAAATTTTTTTTCCTGGAACATTTTCCAACAAGAATTAGTGAAAAATAAATATTTGTTCTCTGATGATCCTCTAAATTTAGAGGAAATGAAAGTGAAACTGTTGAAGAAATGTGGTGACGTTCCTTTGGGTGTTACGATGATGAGGGAGATCTAATTAACAAAAATTCATGACATAGTAAAAATATAGAGCGACAATATGAAAAAGAAGAAAAAGAAGAAAATGATAATGAAATTCATTGAGAAAAATTAGCTAAAGTCAAAAGTTTTGATTTCGTTTTAGTTTCTCATTTTATTTAACCATATTTCTACAAGAAATCTAATGGGTAATTGTTGTTCATTGCCCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGTCTTAAAAATTAAAAGAAAAAATTGCAATCCATATATTATTCAAACAAAGATGGGCATAATTATTGAATAAAAAAGTTTCAAAACAAAAATAGTAATCATAAAAACATGTTATTTAGAGTTCAATAAATTGCATCAGATATCCAGACATATGAACTCAATTCTATACCCTAAACATAGACATATGAACTTAGACCAAATAACTTGCACCCCATACACAGACATATAAACTCTACAGATATATGAACCCCACAGACATATGAACTCCAAACATCCTATCTCAACTTAACGCCCTAAACAGCCCCTTACTGTTACTGTTTTAGGTGGTTGCCATTCTGTTATGGCTTGAAGTTTGGTTGGTGGCTACTGATGATGAAACCTAAAAAGTAAATATTGGAATTTAGAAATGCACACTTCTTAGTATTGATGACTAGAGAATTAGAAGCTAAAATAGAAAATACTTCCTTAAGGTGTACGAGATGGTATTCTGTAGATTTGCTGTAAACTAATATGTCATCAAAATAAATAAGAACATATTTGTTAAGAAGAGGAAGAAAAGTTTATTCATGAGCCTCATAAACGTGCTAAAGGCATTGGATAACCCAAACGGCATGATAAGTCATTTAAAGAGTCCCTCGTCGGTTTTTAAGGTTGTTTTCCATTCTTCACCTTGTCTTATACGAATTTGGTGATATCCACTAGCAAGATCAATTTTGGAGAATATTTTTTATCCAGCTAATTGATCCAACAAATCAGAAATTGGAGGTATAGGAAAATGGTATTTGATGGTTATTTTATTTATTGCACGACTGTCAATACATAAGCGCCATGAACCATCTTTCTTTGAGGTTAAAAGAGCTGGCACCGCAGAAGGGCTAAGACTCGATTGAATATGTTTTTTAGGAAGCAAATCCTGAATGATATCATGAAGTATTTGATATTCCGATGGGCTTATTTTTTAGTGAGGAAGGTGAAGTAAGGATGATCCTGGTTGAAGTCTATTTATGTTGGATGTCCCTAAGTGAGGGAAAGGTCGTTTGGTTGAGTTTTTAGGGTAGGAAACTGATCCAAAAAAATACTGGACCCTACTGTTTCAGGGGTGGGCAGAATAGGAGGTTTATTTTCCTTGGTAATAAGGGCCATG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BLAST of Bhi10M001409 vs. TAIR10
Match: AT1G63440.1 (heavy metal atpase 5) HSP 1 Score: 486.9 bits (1252), Expect = 1.7e-137 Identity = 275/557 (49.37%), Postives = 369/557 (66.25%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. TAIR10
Match: AT5G44790.1 (copper-exporting ATPase / responsive-to-antagonist 1 / copper-transporting ATPase (RAN1)) HSP 1 Score: 358.6 bits (919), Expect = 7.0e-99 Identity = 217/556 (39.03%), Postives = 322/556 (57.91%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. TAIR10
Match: AT4G33520.2 (P-type ATP-ase 1) HSP 1 Score: 175.6 bits (444), Expect = 8.4e-44 Identity = 109/300 (36.33%), Postives = 169/300 (56.33%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. TAIR10
Match: AT5G21930.1 (P-type ATPase of Arabidopsis 2) HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 2.2e-36 Identity = 105/311 (33.76%), Postives = 171/311 (54.98%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. TAIR10
Match: AT2G19110.1 (heavy metal atpase 4) HSP 1 Score: 122.5 bits (306), Expect = 8.5e-28 Identity = 97/325 (29.85%), Postives = 163/325 (50.15%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q6H7M3|HMA4_ORYSJ (Copper-transporting ATPase HMA4 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HMA4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 653.7 bits (1685), Expect = 1.9e-186 Identity = 336/550 (61.09%), Postives = 423/550 (76.91%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. Swiss-Prot
Match: sp|A3AWA4|HMA5_ORYSJ (Copper-transporting ATPase HMA5 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HMA5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 517.3 bits (1331), Expect = 2.1e-145 Identity = 270/555 (48.65%), Postives = 388/555 (69.91%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9SH30|HMA5_ARATH (Probable copper-transporting ATPase HMA5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HMA5 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 486.9 bits (1252), Expect = 3.1e-136 Identity = 275/557 (49.37%), Postives = 369/557 (66.25%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9S7J8|HMA7_ARATH (Copper-transporting ATPase RAN1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RAN1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 358.6 bits (919), Expect = 1.3e-97 Identity = 217/556 (39.03%), Postives = 322/556 (57.91%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. Swiss-Prot
Match: sp|A0A0P0X004|HMA9_ORYSJ (Cation-transporting ATPase HMA5 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HMA9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 339.0 bits (868), Expect = 1.0e-91 Identity = 209/551 (37.93%), Postives = 306/551 (55.54%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S4E2G3|A0A1S4E2G3_CUCME (probable copper-transporting ATPase HMA5 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497370 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 962.2 bits (2486), Expect = 5.1e-277 Identity = 495/564 (87.77%), Postives = 523/564 (92.73%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0LLU8|A0A0A0LLU8_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G279210 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 896.7 bits (2316), Expect = 2.6e-257 Identity = 470/589 (79.80%), Postives = 501/589 (85.06%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A067JRB6|A0A067JRB6_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas OX=180498 GN=JCGZ_25905 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 710.7 bits (1833), Expect = 2.7e-201 Identity = 367/555 (66.13%), Postives = 441/555 (79.46%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. TrEMBL
Match: tr|B9RIA4|B9RIA4_RICCO (Copper-transporting atpase P-type, putative OS=Ricinus communis OX=3988 GN=RCOM_1577390 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 706.1 bits (1821), Expect = 6.5e-200 Identity = 363/557 (65.17%), Postives = 441/557 (79.17%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2C9UHI8|A0A2C9UHI8_MANES (Uncharacterized protein OS=Manihot esculenta OX=3983 GN=MANES_14G001600 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 704.9 bits (1818), Expect = 1.5e-199 Identity = 361/557 (64.81%), Postives = 442/557 (79.35%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. NCBI nr
Match: XP_016902165.1 (PREDICTED: probable copper-transporting ATPase HMA5 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 962.2 bits (2486), Expect = 7.7e-277 Identity = 495/564 (87.77%), Postives = 523/564 (92.73%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. NCBI nr
Match: XP_004149709.2 (PREDICTED: probable copper-transporting ATPase HMA5 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 907.5 bits (2344), Expect = 2.2e-260 Identity = 470/564 (83.33%), Postives = 500/564 (88.65%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. NCBI nr
Match: XP_011649326.1 (PREDICTED: probable copper-transporting ATPase HMA5 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_011649328.1 PREDICTED: probable copper-transporting ATPase HMA5 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN61984.1 hypothetical protein Csa_2G279210 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 896.7 bits (2316), Expect = 4.0e-257 Identity = 470/589 (79.80%), Postives = 501/589 (85.06%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. NCBI nr
Match: XP_022947845.1 (copper-transporting ATPase HMA4-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 887.1 bits (2291), Expect = 3.1e-254 Identity = 466/579 (80.48%), Postives = 501/579 (86.53%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi10M001409 vs. NCBI nr
Match: XP_023533115.1 (copper-transporting ATPase HMA4-like, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 876.7 bits (2264), Expect = 4.2e-251 Identity = 456/545 (83.67%), Postives = 489/545 (89.72%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this mRNA:
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Analysis Name: InterPro Annotations of wax gourd
Date Performed: 2019-11-17
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