MELO3C031216.2 (gene) Melon (DHL92) v3.6.1 | Cucurbit Genomics Database (CuGenDB)

Overview


Name	MELO3C031216.2
Type	gene
Organism	Cucumis melo (Melon (DHL92) v3.6.1)
Description	GDSL esterase/lipase At5g22810
Location	chr05 : 16033006 .. 16043117 (+)

Genome Viewer

Gene Expression

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGACCCACGCCGCGACGACCCATTCCGCGCTGACTCACGCCGTGACCTATTCCGCGACAACCCACGCCGACGACGACCCACGCAGCAGACTCCTACCAACGATGATTTCGACCCAAATCTGGTTCCACCCAAACGTTGTTGTTGTCCAACAGAGTAAAGATCAGGTAGTTTCTTATTCTACGAAGTTTTAGCCACCGTtTGATTTTGCTGACTCGAATGTCGATTTCACTATTAAGAACATTTATTCCACTTTTAGGTGCCAAACCCTAACTCCTTTAAAGGTATGAATCTTACCCATTTTATATAAACAAGTGTTGATTATTTTTACTTTGTAATCTTCAAATTTTCTGATGTGTTTTAAATATTTGATTTGTGTTCAATCATTTCTGTCGTTGATTTGAAGCAAAGATCAATGTTATCCATTAAGGTGCTTTTGATTTTTGGTTCTATATTGAGTAGTTTGGTCAAGTAGAGTTTGATTTTAGGTTGTAGGCGATTCATGGGTTCTATAATTTTTATTTTTATCGAATCAATATTTTTGCATTCAGTTATCCTAGAaCTAAAAATTTTGTTTGCATTTCAGAATTACCATGCTTGTTTTGAAAGCCAATGCTATATTCTCTAGTGCAATTCATCTTCTTAGTGCAAGCAGCAGTGATTTCATTCAGAATTACTATGTTTACCCTCTTTGGTTCTGGCAACAATTAGTGCATCCAAAGGTGAAATCAACATGTCGTTGCATTCAACACTAAACTGCAAAGCGCAACTAAGAGTTTGCAGAACAGATTCTTTGATCTCAAGCTTGTTGTCTTTGATATCTATCAACCTCCACTACTACAAAATCTACTTTACTTGACTCTAGGCAGTTTTACATACTTGACGCTTTTGTTAAAAAAACGTCAAGTATTGACAATTTTAAAGGAAAAACGTCAAGTATAATCACAAAAAAGCGGAGATTTCACAGAGTTTTTCGGATAATTTTACGCTAAACTTTACTTGACGTTTTTTTCGCGTCAAGTATAAAGGACATTTTACTTGACGTTGTATTCGTGTCAAGTATTGCGATGTCAAGTATTGCGAAACGTTACTTGACACGAAAACAACGTCAAGTATAGTTTAAAGAAGACAAAATTTTCACCAAAATTTTCGAATTATTTTTACTTGACGTTTTGTGTCCCGTCAAGTATAGTTGAGATTGTACTTGACGGTTTTGTTGCGTCAAGTATAGTGCAGATTTTACCTAACGTTGATTCCGCGTCAAGTATAGTTGACATTTACTTGACGTGGAAATAACGTCAAGTATAGTTAAAATTTTTATTTGATACTTTGAAAATTAATATTTTAAAAATGTCAAATATAAAAATATAAAAATATAAAATATAAAAATATTTTTTATTTCTCTCATTTCATTAAATAAACTTATTAAAATAAATTTATTAAAATAAAATTACTAAAATAAAGTTATTACAATGTTATTAAAATAATCTTATTAAAACAAACTTATTAAAACAAATTCTCCAAAAGAAACTTATTAAAAATTAATTTAGTAGAAGAAATGTATTAAACTAAATTTAATAAAAAGAAATGTATTAAAATAAATTTAGTAAAAGGGAATTTATTAAAATAATAAAAAAATTATTAAAAAATTCCCTCCAAAACAACTTTTCATTTTACCCTTTTCTCTCCCAAAACCCTTCAATCTCTCTATCTCCATCTCTTTATCTCCACATCTCTCAGCCCCCCGCCCGCCGCCCTCTGTCCATATCCCAGCCGACACGGTCCCGAACACCCACCGCCCGAACCCGTGCGAAGCTCCCGCCGTCGAAGACCACAAAGGCCGAACCAGCCGCCCGAACGCCCGCCGCCCGAAACGTCTCTGCCCGATTCCACCCGCGCCAACGACCTGCGAAGACCCGCGCCGACGTCTCGTTTTCACCCTCGTTATCTTGCAGCAACTTTTCGGTCACCAATCAGCAAGGTTTCGAGTCTTTTCGGTAAGAGTCGGTAAGGATTATTGCTAGTCGGTAAGGATTATTGCTAGTCGGTAAGGATTATTGCTATACTTTCTTTTTCAAATTGGATTTAAGTATTTGAATATTCATAATTGCTATTGGAATTCGTTTGTTGTTCTGTTTGGGTATATTACTAACTGTTTGCTATACTTTCTTTTTGGACTAATTCTCACTTGATTAAGATGTCTTAGATCAGTTTTTGAACCGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN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AAAAGATTTGAAATCATTCAAAAATCTAAACTGGCAGATGTTGTATCAGTGTCTTCAGCTATTGTCCATGCAAATTTGCTCATGGGATGCTTTTCATATAAAGGCCTTTTAA

mRNA sequence

ATGACCCACGCCGCGACGACCCATTCCGCGCTGACTCACGCCGTGACCTATTCCGCGACAACCCACGCCGACGACGACCCACGCAGCAGACTCCTACCAACGATGATTTCGACCCAAATCTGGTTCCACCCAAACGTTGTTGTTGTCCAACAGAGTAAAGATCAGCCACCGTtTGATTTTGCTGACTCGAATGTCGATTTCACTATTAAGAACATTTATTCCACTTTTAGGTGCCAAACCCTAACTCCTTTAAAGTTTGGTCAAGTAGAGTTTGATTTTAGAATTACCATGCTTGTTTTGAAAGCCAATGCTATATTCTCTAGTGCAATTCATCTTCTTAGTGCAAGCAGCAGTGATTTCATTCAGAATTACTATGTTTACCCTCTTTGGTTCTGGCAACAATTAGTGCATCCAAAGCCCCCCGCCCGCCGCCCTCTGTCCATATCCCAGCCGACACGGTCCCGAACACCCACCGCCCGAACCCGTGCGAAGCTCCCGCCGTCGAAGACCACAAAGGCCGAACCAGCCGCCCGAACGCCCGCCGCCCGAAACGTCTCTGCCCGATTCCACCCGCGCCAACGACCTGCGAAGACCCGCGCCGACGTCTCGTTTTCACCCTCGTTATCTTGCAGCAACTTTTCGGTCACCAATCAGCAAGGTTTCGAGTCTTTTCGTATCATAAAACTAAGCTTACCATCCAATAGTGTTGTTAACATTGAGTTCTCTCAAGCATCTCATTATTTCAAGCTGGGCATCTTGGCAGATGTTGTACCATTCCATCTTCATATAAAAACCATAAAAGATTTGAAATCATTCAAAAATCTAAACTGGCAGATGTTGTATCAGTGTCTTCAGCTATTGTCCATGCAAATTTGCTCATGGGATGCTTTTCATATAAAGGCCTTTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGACCCACGCCGCGACGACCCATTCCGCGCTGACTCACGCCGTGACCTATTCCGCGACAACCCACGCCGACGACGACCCACGCAGCAGACTCCTACCAACGATGATTTCGACCCAAATCTGGTTCCACCCAAACGTTGTTGTTGTCCAACAGAGTAAAGATCAGCCACCGTtTGATTTTGCTGACTCGAATGTCGATTTCACTATTAAGAACATTTATTCCACTTTTAGGTGCCAAACCCTAACTCCTTTAAAGTTTGGTCAAGTAGAGTTTGATTTTAGAATTACCATGCTTGTTTTGAAAGCCAATGCTATATTCTCTAGTGCAATTCATCTTCTTAGTGCAAGCAGCAGTGATTTCATTCAGAATTACTATGTTTACCCTCTTTGGTTCTGGCAACAATTAGTGCATCCAAAGCCCCCCGCCCGCCGCCCTCTGTCCATATCCCAGCCGACACGGTCCCGAACACCCACCGCCCGAACCCGTGCGAAGCTCCCGCCGTCGAAGACCACAAAGGCCGAACCAGCCGCCCGAACGCCCGCCGCCCGAAACGTCTCTGCCCGATTCCACCCGCGCCAACGACCTGCGAAGACCCGCGCCGACGTCTCGTTTTCACCCTCGTTATCTTGCAGCAACTTTTCGGTCACCAATCAGCAAGGTTTCGAGTCTTTTCGTATCATAAAACTAAGCTTACCATCCAATAGTGTTGTTAACATTGAGTTCTCTCAAGCATCTCATTATTTCAAGCTGGGCATCTTGGCAGATGTTGTACCATTCCATCTTCATATAAAAACCATAAAAGATTTGAAATCATTCAAAAATCTAAACTGGCAGATGTTGTATCAGTGTCTTCAGCTATTGTCCATGCAAATTTGCTCATGGGATGCTTTTCATATAAAGGCCTTTTAA

Protein sequence

MTHAATTHSALTHAVTYSATTHADDDPRSRLLPTMISTQIWFHPNVVVVQQSKDQPPFDFADSNVDFTIKNIYSTFRCQTLTPLKFGQVEFDFRITMLVLKANAIFSSAIHLLSASSSDFIQNYYVYPLWFWQQLVHPKPPARRPLSISQPTRSRTPTARTRAKLPPSKTTKAEPAARTPAARNVSARFHPRQRPAKTRADVSFSPSLSCSNFSVTNQQGFESFRIIKLSLPSNSVVNIEFSQASHYFKLGILADVVPFHLHIKTIKDLKSFKNLNWQMLYQCLQLLSMQICSWDAFHIKAF

Homology

[Close]

BLAST of MELO3C031216.2 vs. TAIR10
Match: AT5G03810.1 (GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein)

HSP 1 Score: 45.4 bits (106), Expect = 7.0e-05
Identity = 23/42 (54.76%), Postives = 31/42 (73.81%), Query Frame = 0


Query: 90  EFDFRITMLVLK--ANAIFSSAIHLLSASSSDFIQNYYVYPL 130
           E+  ++T +V K  AN IFS AIHLLS  SSDF+Q+YY+ P+
Sbjct: 139 EYQNKVTNIVGKERANEIFSGAIHLLSTGSSDFLQSYYINPI 180

[Close]

BLAST of MELO3C031216.2 vs. TAIR10
Match: AT3G53100.1 (GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein)

HSP 1 Score: 44.7 bits (104), Expect = 1.2e-04
Identity = 21/38 (55.26%), Postives = 29/38 (76.32%), Query Frame = 0


Query: 94  RITMLVLKANA--IFSSAIHLLSASSSDFIQNYYVYPL 130
           R+T ++ + NA  +FS  IH+LSA SSDF+QNYY+ PL
Sbjct: 142 RVTRMIGRGNARILFSRGIHILSAGSSDFLQNYYINPL 179

[Close]

BLAST of MELO3C031216.2 vs. TAIR10
Match: AT5G03820.1 (GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein)

HSP 1 Score: 44.7 bits (104), Expect = 1.2e-04
Identity = 22/42 (52.38%), Postives = 31/42 (73.81%), Query Frame = 0


Query: 90  EFDFRITMLV--LKANAIFSSAIHLLSASSSDFIQNYYVYPL 130
           E+  ++T +V   +AN IFS AIHLLS  SSDF+Q+YY+ P+
Sbjct: 139 EYQNKVTNIVGSERANKIFSGAIHLLSTGSSDFLQSYYINPI 180

[Close]

BLAST of MELO3C031216.2 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1Q3C9A4|A0A1Q3C9A4_CEPFO (Lipase_GDSL domain-containing protein (Fragment) OS=Cephalotus follicularis OX=3775 GN=CFOL_v3_20299 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 9.4e-04
Identity = 30/56 (53.57%), Postives = 37/56 (66.07%), Query Frame = 0


Query: 76  FRCQTLTPLKFGQVEFDFRITMLV--LKANAIFSSAIHLLSASSSDFIQNYYVYPL 130
           +R  TLT       E+  ++  LV   KANAIFS AIHLLSA SSDF+QNYY+ P+
Sbjct: 124 YRAITLTQQLNYYKEYQTKVVNLVGKAKANAIFSGAIHLLSAGSSDFVQNYYIDPI 179

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of MELO3C031216.2 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of MELO3C031216.2 vs. TAIR10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT5G03810.1	7.0e-05	54.76	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein	[more]
AT3G53100.1	1.2e-04	55.26	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein	[more]
AT5G03820.1	1.2e-04	52.38	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein	[more]

BLAST of MELO3C031216.2 vs. Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of MELO3C031216.2 vs. TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
tr\|A0A1Q3C9A4\|A0A1Q3C9A4_CEPFO	9.4e-04	53.57	Lipase_GDSL domain-containing protein (Fragment) OS=Cephalotus follicularis OX=3...	[more]

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0008150	biological_process
cellular_component	GO:0005575	cellular_component
molecular_function	GO:0016788	hydrolase activity, acting on ester bonds

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
MELO3C031216.2.1	MELO3C031216.2.1	mRNA

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of melon v3.6.1
Date Performed: 2018-09-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 142..204
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 147..165

Synteny

The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:


Gene	Organism	Block
MELO3C031216.2	Cucumber (Gy14) v2	cgybmedB115
MELO3C031216.2	Cucumber (Gy14) v2	cgybmedB123
MELO3C031216.2	Cucumber (Gy14) v1	cgymedB316
MELO3C031216.2	Cucumber (Gy14) v1	cgymedB317
MELO3C031216.2	Cucurbita maxima (Rimu)	cmamedB193
MELO3C031216.2	Cucurbita maxima (Rimu)	cmamedB833
MELO3C031216.2	Cucurbita moschata (Rifu)	cmomedB184
MELO3C031216.2	Cucurbita moschata (Rifu)	cmomedB823
MELO3C031216.2	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpemedB131
MELO3C031216.2	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpemedB916
MELO3C031216.2	Wild cucumber (PI 183967)	cpimedB135
MELO3C031216.2	Wild cucumber (PI 183967)	cpimedB129
MELO3C031216.2	Cucumber (Chinese Long) v2	cumedB129
MELO3C031216.2	Cucumber (Chinese Long) v2	cumedB135
MELO3C031216.2	Bottle gourd (USVL1VR-Ls)	lsimedB121
MELO3C031216.2	Bottle gourd (USVL1VR-Ls)	lsimedB125
MELO3C031216.2	Watermelon (Charleston Gray)	medwcgB364
MELO3C031216.2	Watermelon (97103) v1	medwmB413
MELO3C031216.2	Watermelon (97103) v1	medwmB416
MELO3C031216.2	Silver-seed gourd	carmedB0173
MELO3C031216.2	Silver-seed gourd	carmedB0493
MELO3C031216.2	Cucumber (Chinese Long) v3	cucmedB131
MELO3C031216.2	Cucumber (Chinese Long) v3	cucmedB137
MELO3C031216.2	Watermelon (97103) v2	medwmbB363
MELO3C031216.2	Wax gourd	medwgoB460