MELO3C029991.2 (gene) Melon (DHL92) v3.6.1

NameMELO3C029991.2
Typegene
OrganismCucumis melo (Melon (DHL92) v3.6.1)
DescriptionExecuter 1 isoform 1
Locationchr03 : 5918617 .. 5922375 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
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ATGCACATTAGCGACTCCAACTCCCTCCACCGCCACAACTTTCATCAATCCACGCTTCAGGTAACTTGCTCTTCTGCCTTCTCTTTTCTTTGACTCTCTTCGAAGCCAACTACAAGAAGAACTCAGCGTCGCGCTGCTGACTATCGTTCTGTCATCCTTAACACTCCAATGACTAGTTGTTCGCCGCTCCAACAACTTTCGGAGCTCACGCCGTCTGTGGGCTTTCTTAAGGTGAGTTTTTCTTAGGGTGAGATTTCAACCTCAAGAATTTCAACCTAGGGCAAATACTTTGTGCTCTCTTCTCGCCTCAGTGTTCGTGAAAATTTTTCATTTACTGTCATACCCACTTGGATTTATTTAGATTTTCTTGCCCTTAGATCTGAATTGAAAATTTTTATTCACTGTCATATGCACCACCGAATTTGCTTTCTTCAACTAGTTTATCTTGTTGTTGTAAGATGCAAAGCTATTTTTAACTTATTTAATTATTTATTTCTGAACTTGTACTTATGGACTTTTCTTCTGTCAAGCTTTCTTGGTTTTGATTTCTTACAACTTGGTGGCTTTTTTCTAAGGAATTTGTTGTGAATAAATTTGCTTAAGGATGACTATTAAGGTAAATATTAATTTTTGTTTCTCAACTTCCTCAAACAGCTTGCCACAGCTGTAAATGGTGTCCCCTTGTTTGAGATTTTTCTTAGAGTGAACAAAATGGATAAATATAAACAGCAGGTACCAATCTTAAAGCATCTCATCTTATTTACTACACGAATAAACATTTTCTTTGATAAGATTACTAACATATCATGGTGGGCCAGCCGTAAGTGTTGTAGAATTAGAAAGGGACTTAGAGTGTTGGTCCAATGATTTTGAGATGATCTCAAACCCTAGGATTACTAGAGGCAATGCCAACTTTTGATTCAATTCGTCCTGAGTAGCATTCCTATTTACTTCTTGTCTTACTGTAAAGTCCTGTCTTCAATTGTCTTATTTTCTTTGTGCATTATGTTGAAAAGTTTTTACTTTCAATTCTGCTGCTACTTTGCTAGGTGATCTGTTACAACCAAGTTGATTCAACCACATACATTTATCAACTTACATAACCTAGAAATTTTAGTTATGAGTCCTTTTTCCATAACAAACTGACTTAATAAAGAGCTTGATGCTGAGATTTCTCAATTACATCTTTTGTGGCTTGTTAAGGTTTGTGCGATTTTGTGAGGTATTTTTGGTTATTGTAAGGAATAATAGATTATTGTTGGGCCAAGGGGTTTAGATGTCTAATGAGGATGTGTGGGTTGTTAGGTGCTACGTTTCTCTTTGGCCTTGTTAAAGTTTTCTGTAATTATCTCTGTGGCTATTAACAAATTGTAGAGAATATGGAATCTATGATTGGAGAAGGATTTTCCTTTACAACTAAAGTTGTACTTGCTTTATGTGTTTCACTTTTTGCTAAACCTTAAAGACACCATCTTGCCGTACGCTTAACCGATGCAATTAAATTTCTGTTTTACTTCTGTCAATATTAAATGTACATCCTCTTATCAATTTCTGTCTTACTTGCTAAACCTTAAACGTATTTAAGGAAACAAAAGAATTTGGTTATGTGGGGCATATCAAGGTAAACAATTTTTTTATGTGCACATATTAGGAGAAAAAAAATAGTAAATCTAAATAAAATATAGTGTTTTGATATTATGAAAAGAATATAAATATGTTTGTTCCTACCACTTTCTAATGATAATGATTTATCAAGAATGTAAATGAATGTCCTTGAGTTTCAAATGTTAAGCTAATTATGCTACTTCTCTTTAGGTTATGGTTTTCATGAGGATGAGTTAAAGGTAAGGATTATTAGTTTACACTATAATCTTCTAAAGCTCTCCATATGCCTTTTAAATTTGAATAATTCAATAAATATATAAATTACATTTAAATATTTGCAGGCAGTTATAGTGGCAGAACAAAATGTTTAGCCCCAATATTGGCCTGCGGAACAATTCGTAGTACCAGTAGAAGAGAACAACATATTCTTAAAATAGATCGTAAAGTTACACTTACTTATGACTTTCTTGTTTTTTTTCCAATTCTGAGCTTACATGTAAGAGTTAATTTGAGCTTAGGGTGATGAGAGTGGCAAACATTTTAACCAGGTATGTTGAATCAACTCATTAGTAGTGATTTTTTAGGATTTTTAAAAAAGTAAGGGATTTTTTCTACTTTCATCAACAGCTTTTTCAGAGCTCTTGGATAATTCTTTGGATGAGGTATTGAGAATTTGTCTCTTATTTAGGTGAAATACTTCAAAAAAATTCTTTAGTTTTATGTGCTTGATGTTAATTAATTTCTTATTGTTCTTATTAATATAACATATAATATGATATAGTTATCGCACTAAAGATGTTGTCTATGTTGGTGATTATTGGGTTCTCATTGAGGTTAACATCAACTCTTTGAGTAATTTTTATGACTGTAAACAATTTTATTTAGAAGTCACTTTTAATTATTTGAAGTAATTTTATGCTAGCTAGTTAGTTTAAGAATAAGTTAGTTGTTTGCACGGTATGCTGGTCCTAAACATTTAAGTTAGTTTGAGAATAAGTCAGTTGTTTGCACGGTATGTTATTACTAACTAAAATATGATGATGGTTAACATACCTTTCACTCTAGCAAATATTTGGATACCACAAATTGATTATTAATTTACTGAAATAATTCTGAATCTTCTCATGTGAGAGATGAAATAACTTGTTCATTCAAAGGTATCAACAAATAACTTATGCCATTGTGCCAAAGGAGGAAGTTGAACTTGTTGAGCTCAAAAACTGAGGGACTTATATTCTATGCCACTTTAAATGCCATTGCATCTTTCTACATGGTAAGACTTATATTCTGGTTTTGTTGATACCTTTATTTGTGTAAACTTTATGTTTTTGTTTACATGTGAATTGATTTGCATGTAAAATTTTCTTAGGTTAGTTTGCTACATGAGTTAAATAGTTATGTCGTTTTAGCTGGCTGAAACGTAAATACGAACATATCGTGTATGGCTGGTGGTGATCCATTGGGATCTGAATTTTTTTTTTCACTTTTAGTTACAAGAAACATGGAAAATTAACGATATCATAGTGGTGGATGATACTACTTATGTTGTATGTCTCTTTATTTGATTAAAAGAGAGGGTAAAATAAACGGAGCTAATGGAAGAAGAATGCATTGCTATGTCTACTTGGTTATCTTGTCAAGATTTGAAATTTCATATCTTCCATTTATCTTTACCTATTTCTCTTTGAAATTCTGTGATGTTGGGATTTCTTGTGGACATAACTGAATTGCCTTGATGATTGATTCAGTGGTTTTCATTTCAAACAATATGTTTCTGCTTAGAATGTATGAAGAAGCTAAGGTTTATAGAATTTGAGGCCACTTTGGAATTGTGTTGTATAATGGAAAAACTGTTTCATAGAATGGTTAGAAGTGGTTAAACTCCTTGATATTAGTTTAAATGACTTCAAAGTTATATTTCGGGAGATGATATATTGAGATATATTATGAACTAATAATTGAGTGAAATAGTTTCGATTTATCTCTCCTTTTAAGTAGGATTGGAATTGGTACCTTATGTTGGCATGACAAAGGGTAGAACCTTTCTTATATTCTTATATTGATATGTAGAGTCATACTCTAAAATTTGTTTTCTTACGAGGTTTTGCAAGAATCCATTTGAGCAGTGAAGCCATATTTGCAGCAATTGATTGA

mRNA sequence

ATGCACATTAGCGACTCCAACTCCCTCCACCGCCACAACTTTCATCAATCCACGCTTCAGCCAACTACAAGAAGAACTCAGCGTCGCGCTGCTGACTATCGTTCTGTCATCCTTAACACTCCAATGACTAGTTGTTCGCCGCTCCAACAACTTTCGGAGCTCACGCCGTCTGTGGGCTTTCTTAAGCTTGCCACAGCTGTAAATGGTGTCCCCTTGTTTGAGATTTTTCTTAGAGTGAACAAAATGGATAAATATAAACAGCAGGTACCAATCTTAAAGCATCTCATCTTATTTACTACACGAATAAACATTTTCTTTGATAAGATTACTAACATATCATGGTGGGCCAGCCGCAGTTATAGTGGCAGAACAAAATGTTTAGCCCCAATATTGGCCTGCGGAACAATTCGTAGTACCAGTAGAAGAGAACAACATATTCTTAAAATAGATCGTAAAGTTACACTTACTTATGACTTTCTTGTTTTTTTTCCAATTCTGAGCTTACATGGTGATGAGAGTGGCAAACATTTTAACCAGGGATTTTTTCTACTTTCATCAACAGCTTTTTCAGAGCTCTTGGATAATTCTTTGGATGAGTTACAAGAAACATGGAAAATTAACGATATCATAGTGGTGGATGATACTACTTATGTTAGTCATACTCTAAAATTTGTTTTCTTACGAGGTTTTGCAAGAATCCATTTGAGCAGTGAAGCCATATTTGCAGCAATTGATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCACATTAGCGACTCCAACTCCCTCCACCGCCACAACTTTCATCAATCCACGCTTCAGCCAACTACAAGAAGAACTCAGCGTCGCGCTGCTGACTATCGTTCTGTCATCCTTAACACTCCAATGACTAGTTGTTCGCCGCTCCAACAACTTTCGGAGCTCACGCCGTCTGTGGGCTTTCTTAAGCTTGCCACAGCTGTAAATGGTGTCCCCTTGTTTGAGATTTTTCTTAGAGTGAACAAAATGGATAAATATAAACAGCAGGTACCAATCTTAAAGCATCTCATCTTATTTACTACACGAATAAACATTTTCTTTGATAAGATTACTAACATATCATGGTGGGCCAGCCGCAGTTATAGTGGCAGAACAAAATGTTTAGCCCCAATATTGGCCTGCGGAACAATTCGTAGTACCAGTAGAAGAGAACAACATATTCTTAAAATAGATCGTAAAGTTACACTTACTTATGACTTTCTTGTTTTTTTTCCAATTCTGAGCTTACATGGTGATGAGAGTGGCAAACATTTTAACCAGGGATTTTTTCTACTTTCATCAACAGCTTTTTCAGAGCTCTTGGATAATTCTTTGGATGAGTTACAAGAAACATGGAAAATTAACGATATCATAGTGGTGGATGATACTACTTATGTTAGTCATACTCTAAAATTTGTTTTCTTACGAGGTTTTGCAAGAATCCATTTGAGCAGTGAAGCCATATTTGCAGCAATTGATTGA

Protein sequence

MHISDSNSLHRHNFHQSTLQPTTRRTQRRAADYRSVILNTPMTSCSPLQQLSELTPSVGFLKLATAVNGVPLFEIFLRVNKMDKYKQQVPILKHLILFTTRINIFFDKITNISWWASRSYSGRTKCLAPILACGTIRSTSRREQHILKIDRKVTLTYDFLVFFPILSLHGDESGKHFNQGFFLLSSTAFSELLDNSLDELQETWKINDIIVVDDTTYVSHTLKFVFLRGFARIHLSSEAIFAAID
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0010343 singlet oxygen-mediated programmed cell death
cellular_component GO:0042651 thylakoid membrane
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MELO3C029991.2.1MELO3C029991.2.1mRNA


Analysis Name: InterPro Annotations of melon v3.6.1
Date Performed: 2018-09-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 10..26
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..27

The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None