MELO3C029615.2 (gene) Melon (DHL92) v3.6.1

Overview
NameMELO3C029615.2
Typegene
OrganismCucumis melo (Melon (DHL92) v3.6.1)
Descriptionprotein VTE6, chloroplastic
Locationchr02 : 13499441 .. 13519304 (+)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCGTTATAAGTTATGTTTAGCTAAATATGGACATCAACGCTTTGTTCTATTCGAGAGAAAAGATAATCGCATTGACAATAATCACCTGAAAAGTGAAAATTCGTATTTAACTAAGCAAACGACAAAGGGATTGTACAAATGCAATCTCATTGCTGAATTAATCCTTCACATGAGTTGTAGAGATGTTAACGTGTGTAGCGAAGGCTCTGAAAAGATGCTTGCCTTAAATTATAATGAATTTCTTATCATGCATACAAATGGATTAGATACAAATCATAGCTTAATTTTAAGTATTTAGATCCCAAAAGGCGAGCAAGTTTGGTGAAGGCACCGAGAGGTTAATAGATGCTTTGTATCACTTTGAGTTATTAATGCAAAATACATTGCGTTTAATTAGTTAAATATTCTTTCATGCCACACCTGTTACATGAGTTCACAATTCATTACACTCTATCACCATGTTCATCTTGTACCGCCAATTGCACCCTAGTGTATATAGTTATGATAAACATACTGTGCATACCTACATTGTATATAGTATACCGTATAGGATTAGCAGTACGATAGACTCAATTAGAACACCAATTCTCTGAGTTTGATTTTGGACTTATCAAGAAATTTTTCTTTGCTTACACTGGGGCGATAAAGAGGAAAAATTGTACTACATGCATATCATTATGAATTCAACAATGCGTAGGTAGGACCAGTGTTTTAAAAGGCTCAAGGCGCACTAAGGCGCATGTATGTATGTATGTATCTACAAAATTGAAAGGAAAAACAATGTATAAAATGTAAGTATATAACCAAGATGGAAATGAGACTTGACCAAGGTGGATTGTTGAAACCGCTCGGTTTAAAACGTAGAGTTGGGATGTTTCTTAGCTTAAAAGACAATTAGGTTTAAAAAATATATATTATAATATTATATATATTTTAAAAGCCCAGCCCAGAACTGAGTGAAAAGCCCGCACCTTAAAAGCCTTTTGTGCCTTTGTGCCTAATGTAATTCGAGCGCCTAAGCCGCGCCTAATGCATGACACCTCGCTTGTTCAAGGAGAAGCCCTAGTCGTGCGACTTAGGCCTAGGGCACGCCTTGCTGTGCCTTTCAAAACACTAGGTCGGACATGCATCTTTTATCACCTCATCCCATCCTAATCGCCTGTTAAGTTGCTTACTTAGAGCCCAACATGACATATTTGCGAAGCCTTGTTAATAATAAAAATTAGGGGTGAAAAAAACCGACCCGAACCAAACCGATTCGGTTCGGTTTGGGTTGGACCGGTTAGTAACAACAGAGTTACCGAACCGAACTGATTTGGATCGGGTCAGGTCGGGTTTAAAATAACCAATTAGGTTAAAAAAAATGGGAAATTGCCAAAAATAGGTTAAAAAAAGAGCTTTAAATGAATTTTGGGACAAGTTTTCAAAAGAAAGACTTTTAGGACAATTTGGATGTGAATGGACAAAAATGCCCTTCCTTTCCTTTCCCTCTTCCACGTTTGCTTTCCCTTCTATCCACGATCGATTCCTTCTCTTTCGCGTATAGTTCCCTTTCCCTTCTCTTTTCTTTCGCGTAGAACACCTGAACCTACTCCGCCCTTCGTCGCTTGCCCTTCGTCACTTGCCCTTCGTCGCTTGCCCTTCGTCGCTTGCCCTTCGTCGGTCGTTGTCCAGTGCATTTCGTCGCTCCTCTTCGGACCATTCAATCAACTTCGATCGTTTTCTCTTATTTGGGTGAGTTTCATGTCTAACCGATTTTCAATTTATCTGCTGTAAGTAAATGTTTGGTTGGGGTATTTGGTGCTATTTTCATCCGTAATTGTCTGGTTTTTGAAATTAGACTTATTTGTCGTAAATTAGTTTAGTCAAAGTTTGGTTTTAGGTTCTTAGAAAGTTCAATGGGTAGTGAAAAATGAATTGAACTAGAGGATGAAGATTTAGTTGGATCAAATAGAGGAGGAGTAAGCAATAGGAATAGAAAGAATGAAGGTTTTTTTTTATCTCGCACGTATTTTTTTTATCTCGCACATATCTCGCACGTTCCAAACTTTCACTATTTATTTCAAAATCAACTTGGTACACCTCCTAATCCATTTAGAGCTATTCTTTGCATGTTTAGTAACTCTCTTAGGCCCTCATGCTTTATCACGCACGTATTTCGCACGTATCTCGCACGTTCCAAACTTTCACTATTTATTTCAAAATCAACTTGGTACACCTCCTAaNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN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AGTCTTTCTTTTGAAAACTTGTCCCAAAATTCATTTAAAGCTCTTTTTTTAACCTATTTTTGGCAATTTCCCAAAAAAAAAATCTTTGTCTGCTTCATTTCGTTCGGCATTTCCAAATTCCACGATCTTCGTCCGCTTCATTCTTCGTCTTCGACTCGGCGTCATCATCAGCTGGTGGCATCGTCTTCGTCTTCTTCATTCTTCGTCTGGGTCGGCACTCGACATCATCGATCTTTTCGTCTGCGAACGCTGGcACTCGGCATCATCGATCTCTTCGTCTGTAAACATCGGCACTCGACATCATCGCGTCTGCACTACTCAGTGTCGGCATCATCTCTACTCGGCGTCGGCATCATCTTAGGTATTGTTGGGTTTATCACATTTGATTAATTTTGGTAAAACATAGCGAAATTAAGCATAAATCAGTTTAAATTTAACCGATTAGGTTAAAATCAACTTCATTTCTGATTTCCTCTTGTCTTCGTCTTCGACAGTTCGACTCTTCTTCACCCTTCGTCTGTGTCGGCATCACTTGGCAGTCTTCCCTTCTCAGCAACCTCTTCATTTTTGCCCTGGGTTCCCCTATTCTCGTCTCGGGCTTGTCTCTTTCTGGCATTGCTTCTGCTTTCTTGCTTGGTACTCTCACGTGGCGTGCTTTTAGGCCCTCTAGTTTCCTTCTTGTTGCTACCTACTTCGTTATTGTTCGTCTATATCCCCTCATTCTCCAATTCCACTTTGCTTTTGTGTTTGATTGATTCATTCATTGGCGGTGTTGTTTTATTTGTTTGATTTAATTTGTTTTATTCATTCATCTACCATTTTCTTTCCTAGATTTAATTTTTTGTTTTATTTGTTTTCATGTTTTTATTTCTTTCATGCTCACTTCGTTAACAAAATAGTTCAGATTTTTGTGATGGAATACTTAGAATTGCTGGCCTGAATTGATTCTTAAAGTACTGGTCTTTGAATCTTCATGTCAGATGTAGAGCTCATGAGGTTCAATGTTGTAGTGCTGCTATTCTATAATTGTTGCTATCTTATAATTCCAATTCTAATTTTTTCACCCCTAGTTTTGAAGATTGTTTCGAGGCCATTTGTAAATTAAAAAGAAAAAGAAGTGATGAATTGGGGTTTGATTGATTTTTTTAAAGGATGGAGAAAAGTGATTTGATTATATAAGGTGTAAATATTGTAGGTACTGATATTATTGTTCATATTGAGTGATAACAATGACTAAAAGGCAATGTGTTTAATAGGAAAAGGTGTTTAATTTCATCCTCAAGATTTTCTTATTTCCTAATTTCATGAAGGTGGTAAAGGTTATGCTTTTGTATGAAAGATTTGTTGCAATAATGAAGTCCATTTATGCCGATCTTCTCTATATAAAAGTAAAAAAAGGGGGGCCAGTCTTCCTATTTCAAGTCTCTTTGCTCTTTGTTTTATTTTCTCAACCTTTCTCTTACTCTCTCTTATTCTCCTCTAGGAAGGAAAATTGAGGCTATAGTGTGTTTGTGTATATATCATAATAGTATTAAATCTCAAAAGAAGCATGTGATAGAAATTATGATAAGGTTTCTTCCAAAGAAAAAATCCATGATTATTTTGTTAGTATACACCTAGAAAGAAATTAGCTTAAGTTGATTTTTCATGTAGTACATTTATATTACAGGATCAAATGGGCCACCATCATTCTTCGGGAAAAATTTCAAAGATATGAGCCCATGATCCATCTATGATAGAATATAAGACAAGTTCAAAGATACCACAATAATAATGATGACAATACATCTATTTTCAATATTACAAAGATGCAAGATGTATATGTTGATGTGTGGATACTATCTGGATAGGTTAATTGCATGATTTGTTCTTGGACATTTTCGTGACCTTTTTAAATACCAGGAATTAATTCCTTTAGTTTGATCTGACATTGGTTTATTTGCACTTGGCTTTTAAAGAAGTGTTTCACCATCACATGTTTCCTACAACATCTTCTGATCAATTCATTCTTTATGTTACAGGCGGCCATTGTTAATTTCCAAACCCTTGAAGAGGTTGCAAGGTTAGAACAGGTATGCTTCGCTTTTTGTCTTCTACAGTCCCTCCCTCCTCAAAAAGAAAATGGAGGAGAAAAATCAGAGTTGTATGAGAACTTGTAGTTATTGATTTGAGTGTTTTTTTTTTTTCTATGTGTTTTGTTTTTTGATGATTATTAGGATGACTTCATTCTCGGTAGACAAGACTTCAAATCAGAGTTGTTCTAGTCCAGTGTTTGGAAAAAGAAAAATCGGTTAAACCACCATCATCGGTATGAGAACATTTTATAAAAGTAGAAGGATGTGATCCTAAATATCCTAGGGCTGCTTGTAAACATTGTGGGACTTCATATGCTTGTGATTCCAAAAGAAATGGTACCACTAATTTAAAAAGACATTTAGAGAAATGTAAGATGTATGTAAATCCATTGGAAGATAATGTTGAAGGAGAGGGAGATTCTGAAAGTAGTTTGATGGCTGCATCATTCACTTAAGAAAATTGTAGAAAAATGCTTGCTAGGATGAATATCTTGGATGAATTGCCATTTAAGTTCGTAGAAAGTGAAGGGTTTCACCAATTTTGTCGGGCATTAAATCCAAAGTTTGTGATTCCATCAAGAGTAACCGTTGCAAAATATTGTTTTCAAATGTATATGAGGGAGAAAAAAAAGTTAAAAAATGCATTAACTCGAAGTGGCCAAAGAGTTTGTTTAACAACGGACTTCTGTGCAAAATATTAATTATATGGTTATAACGACTCATTTCATTGATGATGATTGGAACTTGCACAAAAGAATTTTGAACTTTTGTCAAGTAGCTAATCATAAAGGAGATACCATAGGTAGAGCCATTGAAAAGTGCTTAGAAGGTTGGGGTATTGATAGGCTCTTTACTGTAACGGTTGATAATGCAAGTTCAAATGATGTAGTCATTGCCTACTTGGTTAAAAAGTTTAAAGGCAGAAATGGGTTGGTGTTGGATGGTGATTCACACTAGATGTTGTGCTCATATTCTTAATTTAATTGTTAGTGATGCCTTAAAAGATTTGCATGTGTCTATCATTCGAATCAGAAATGCTGTGAAGTATGTTAGGTCATCTCCTGCTAGATTGCAAATATTTAAATATTTTGCTAAAGAAGATAAGATGTGAACAAAAAATTGTCTTACAATGGATGTTCCGACACGATGGCATTCTACTTTTACTATGTTGGATGGAGCAATTAAGTGTCAAAAGACTTTTGAAAGATTGGAGGAGCATGACCCTAGTTATTTGCCAAAGGATGATATTCCTACTACTGAAGATTGGGATAATGCAAAAGTGTTTGTAAAGTTCTTAAAGGCTTTTTCAGAGGTAACAATGAAGTTTTCTGCATCTATGTCTGTGACTTCAAACATATTTTTTCATGAACTTTGTTTGATCCAAGAAATAATTCGTGAATACTCTTCGTATGAGAATGCATTATTGAGTCAAATGACATTAAGCATGCAGACAAAATTCAACAAGTATTGGGTATAACTACAAGTGAAGACCAATTTATTATTGTATGTTTCTGTAGTTCTTGACCCTAGGTACAAGCTAGCTTATGTGAATTATTTTTTTAATGAATTTTTGGAGGAAGATTGTGCAAAAATATGGACGAATAAGGTTGAAGAAGCATTTCATCGATTGTGTGATGATTATTATATGAGAATGTCAAAAGAAAAATATTCACAAACACAATCATGTACACCTATCGAAGGATTTGGCTTTCAAAGTCAAAGTGAAATATCTTCTATCTCATCTAGTGGATCTTATAAGGCACGTGCTACTATTCGTGATAGATTTAAACAAAGTAACAAAACATGTCTAGATGATGCTAAAACAGAGGTGACTCGTTATCTAGATGAGGCTCGTATAGATTGTATGGTTACGATGAATATTTAGATTTGCTAACTTGGTGGAAGGTGAATTCCTCTCGATTTAAGATCATTAGCCAAGTAGCTAGGGACATCTACAGTATTCCTATATCAACTGTGCCTTCTGAGTCCGCCTTTAGCACTGGAGGACGGGTGTTAGATTCTTTTCGAAGTTCTTTAACTCCTCAAACTGCAGAGGTACTCATTTGTGTTCAGAATTGGATTCAGTTTAAACCTTTGGATGACATGACTGAAGAAATTGACGGGACTGAAGAAATTGATGAAGGTAATATTCTTTTTGAAGTACGCATTTAAAATTTTCAATTATCCCATATAAGCTAACTATTTGTCATTTTGATCTAGAATTCATAAACATAGGAAAGGAGATGGAAGCTGCATTTGAGAATTTGAATAATGACTCTATGGTTTAAATCCCTACTCTCAAATCTTTATTTACATTTTTTTTAAATTGTTAACTTGTTAAATATAGAATCTTCGTTTTTTAGAGTCTTGAAGCTCAGTGATGGAAGCACTTTGGGTTATACGAACAAGGTGGTCTCGTGAAGATGTTTATTAATTCATACCTTCACAATTGTAAACTCTGTTGTTTGCGTAAGGATTTGAAGGGCTAGTAGCTTCTCTACTATCAACTCTTTAATCCCGCTATATGTGTCCTCAGAAGATTTTTAGTTTATTTTCCTTTGTTTTCTGTTTTCCGTTTTTAAGTAATATACTTTATGTGCAGTTTTTACTTTTTATCCAAGTGAGGATATATGTTTTTCTCTCCTAGGTACAAATTAAAGAACTAACTATACTTTATTTAGCTTTTGATTATCATTTGGGAGATGGACAAGCTTGTGTTGTCACCATTATCGTTGCCTTTGATTATTTATTCTCATGGTTTCCATTTTCATTTTTAGTGTGAACTGTGA

mRNA sequence

ATGCGTTATAAGTTATGTTTAGCTAAATATGGACATCAACGCTTTGTTCTATTCGAGAGAAAAGATAATCGCATTGACAATAATCACCTGAAAAGTGAAAATTCGTATTTAACTAAGCAAACGACAAAGGGATTGTACAAATGCAATCTCATTGCTGAATTAATCCTTCACATGAGTTGTAGAGATGTTAACGTGTGTAGCGAAGGCTCTGAAAAGATGCTTGCCTTAAATTATAATGAATTTCTTATCATGCATACAAATGGATTAGATACAAATCATAGCTTAATTTTAAATCCCAAAAGGCGAGCAAGTTTGGTGAAGGCACCGAGAGGTAGGACCAGTGTTTTAAAAGGCTCAAGGCGCACTAAGGCGCATCTGGTGGCATCGTCTTCGTCTTCTTCATTCTTCGTCTGGGTCGGCACTCGACATCATCGATCTTTTCGTCTGCGAACGCTGGcACTCGGCATCATCGATCTCTTCGTCTGTAAACATCGGCACTCGACATCATCGCGTCTGCACTACTCAGTGTCGGCATCATCTCTACTCGGCGTCGGCATCATCTTAGGTATTGTTGGGTTAAAATCAACTTCATTTCTGATTTCCTCTTGTCTTCGTCTTCGACAGTTCGACTCTTCTTCACCCTTCGTCTGTGTCGGCATCACTTGGCAGTCTTCCCTTCTCAGCAACCTCTTCATTTTTGCCCTGGGTTCCCCTATTCTCGTCTCGGGCTTGTCTCTTTCTGGCATTGCTTCTGCTTTCTTGCTTGGTACTCTCACGTGGCGTGCTTTTAGGCCCTCTAGTTTCCTTCTTGTTGCTACCTACTTCGTTATTGTGGTAAAGGTTATGCTTTTGTATGAAAGATTTGTTGCAATAATGAAGTCCATTTATGCCGATCTTCTCTATATAAAAGCGGCCATTGTTAATTTCCAAACCCTTGAAGAGGTTGCAAGGTTAGAACAGTCCCTCCCTCCTCAAAAAGAAAATGGAGGAGAAAAATCAGAGTTGTATGAGAACTTAGTCTTGAAGCTCAGTGATGGAAGCACTTTGGGTTATACGAACAAGTGTGAACTGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCGTTATAAGTTATGTTTAGCTAAATATGGACATCAACGCTTTGTTCTATTCGAGAGAAAAGATAATCGCATTGACAATAATCACCTGAAAAGTGAAAATTCGTATTTAACTAAGCAAACGACAAAGGGATTGTACAAATGCAATCTCATTGCTGAATTAATCCTTCACATGAGTTGTAGAGATGTTAACGTGTGTAGCGAAGGCTCTGAAAAGATGCTTGCCTTAAATTATAATGAATTTCTTATCATGCATACAAATGGATTAGATACAAATCATAGCTTAATTTTAAATCCCAAAAGGCGAGCAAGTTTGGTGAAGGCACCGAGAGGTAGGACCAGTGTTTTAAAAGGCTCAAGGCGCACTAAGGCGCATCTGGTGGCATCGTCTTCGTCTTCTTCATTCTTCGTCTGGGTCGGCACTCGACATCATCGATCTTTTCGTCTGCGAACGCTGGcACTCGGCATCATCGATCTCTTCGTCTGTAAACATCGGCACTCGACATCATCGCGTCTGCACTACTCAGTGTCGGCATCATCTCTACTCGGCGTCGGCATCATCTTAGGTATTGTTGGGTTAAAATCAACTTCATTTCTGATTTCCTCTTGTCTTCGTCTTCGACAGTTCGACTCTTCTTCACCCTTCGTCTGTGTCGGCATCACTTGGCAGTCTTCCCTTCTCAGCAACCTCTTCATTTTTGCCCTGGGTTCCCCTATTCTCGTCTCGGGCTTGTCTCTTTCTGGCATTGCTTCTGCTTTCTTGCTTGGTACTCTCACGTGGCGTGCTTTTAGGCCCTCTAGTTTCCTTCTTGTTGCTACCTACTTCGTTATTGTGGTAAAGGTTATGCTTTTGTATGAAAGATTTGTTGCAATAATGAAGTCCATTTATGCCGATCTTCTCTATATAAAAGCGGCCATTGTTAATTTCCAAACCCTTGAAGAGGTTGCAAGGTTAGAACAGTCCCTCCCTCCTCAAAAAGAAAATGGAGGAGAAAAATCAGAGTTGTATGAGAACTTAGTCTTGAAGCTCAGTGATGGAAGCACTTTGGGTTATACGAACAAGTGTGAACTGTGA

Protein sequence

MRYKLCLAKYGHQRFVLFERKDNRIDNNHLKSENSYLTKQTTKGLYKCNLIAELILHMSCRDVNVCSEGSEKMLALNYNEFLIMHTNGLDTNHSLILNPKRRASLVKAPRGRTSVLKGSRRTKAHLVASSSSSSFFVWVGTRHHRSFRLRTLALGIIDLFVCKHRHSTSSRLHYSVSASSLLGVGIILGIVGLKSTSFLISSCLRLRQFDSSSPFVCVGITWQSSLLSNLFIFALGSPILVSGLSLSGIASAFLLGTLTWRAFRPSSFLLVATYFVIVVKVMLLYERFVAIMKSIYADLLYIKAAIVNFQTLEEVARLEQSLPPQKENGGEKSELYENLVLKLSDGSTLGYTNKCEL
Homology
[Close]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. NCBI nr
Match: XP_008451729.1 (PREDICTED: protein VTE6, chloroplastic [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 96.7 bits (239), Expect = 1.7e-16
Identity = 59/88 (67.05%), Postives = 63/88 (71.59%), Query Frame = 0 

Query: 190 IVGLKSTSFLISSCLRLRQFDSSSPFVCVGITWQSSLLSNLFIFALGSPILVSGLSLSGI 249
           +V  +S   L S    L Q + S        TWQS+LLSNL IF LGSPILVSGLSLSGI
Sbjct: 45  VVRAQSFHTLASGAFNLLQSNPS--------TWQSALLSNLLIFVLGSPILVSGLSLSGI 104

Query: 250 ASAFLLGTLTWRAFRPSSFLLVATYFVI 278
           ASAFLLGTLTWRAF PS FLLVATYFVI
Sbjct: 105 ASAFLLGTLTWRAFGPSGFLLVATYFVI 124

[Close]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. NCBI nr
Match: CDP06050.1 (unnamed protein product [Coffea canephora])

HSP 1 Score: 94.0 bits (232), Expect = 1.1e-15
Identity = 50/57 (87.72%), Postives = 52/57 (91.23%), Query Frame = 0 

Query: 221 TWQSSLLSNLFIFALGSPILVSGLSLSGIASAFLLGTLTWRAFRPSSFLLVATYFVI 278
           TWQSSLLSNL IF LGSPILVSGLSLSGIA+AFLLGTLTWRAF PS F LVA+YFVI
Sbjct: 28  TWQSSLLSNLLIFILGSPILVSGLSLSGIAAAFLLGTLTWRAFGPSGFFLVASYFVI 84

[Close]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. NCBI nr
Match: XP_024160328.1 (protein VTE6, chloroplastic [Rosa chinensis] >PRQ30894.1 hypothetical protein RchiOBHm_Chr5g0029561 [Rosa chinensis])

HSP 1 Score: 94.0 bits (232), Expect = 1.1e-15
Identity = 48/57 (84.21%), Postives = 53/57 (92.98%), Query Frame = 0 

Query: 221 TWQSSLLSNLFIFALGSPILVSGLSLSGIASAFLLGTLTWRAFRPSSFLLVATYFVI 278
           TWQS++LSNL IF LGSPILVSGLSL+GIA+AFLLGTLTWRAF PS FLLVATYF+I
Sbjct: 73  TWQSAILSNLLIFVLGSPILVSGLSLTGIAAAFLLGTLTWRAFGPSGFLLVATYFII 129

[Close]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. NCBI nr
Match: XP_022984475.1 (protein VTE6, chloroplastic-like [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 3.3e-15
Identity = 55/88 (62.50%), Postives = 65/88 (73.86%), Query Frame = 0 

Query: 190 IVGLKSTSFLISSCLRLRQFDSSSPFVCVGITWQSSLLSNLFIFALGSPILVSGLSLSGI 249
           +V  +S   L+S  + + Q  S+ P      TWQS+LL+NL IF +GSPIL SGLS+SGI
Sbjct: 50  VVRAESLQSLVSGAVNIVQ--SNPP------TWQSALLTNLLIFVVGSPILASGLSVSGI 109

Query: 250 ASAFLLGTLTWRAFRPSSFLLVATYFVI 278
           ASAFLLGTLTWRAF PS FLLVATYFVI
Sbjct: 110 ASAFLLGTLTWRAFGPSGFLLVATYFVI 129

[Close]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. NCBI nr
Match: POE81816.1 (protein vte6, chloroplastic [Quercus suber])

HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 3.3e-15
Identity = 54/89 (60.67%), Postives = 66/89 (74.16%), Query Frame = 0 

Query: 195 STSFLISSCLRLRQFDSSSPFVCVGITWQSSLLSNLFIFALGSPILVSGLSLSGIASAFL 254
           S S  +S  ++     SSS      +TW+S++LSN+ IF LG PIL+SGLSLSGIASAFL
Sbjct: 6   SLSSSVSEAVKKALIQSSS------LTWKSAILSNMVIFVLGLPILLSGLSLSGIASAFL 65

Query: 255 LGTLTWRAFRPSSFLLVATYFVIVVKVML 284
           LGTLTWRAF PS+FLLVATYF+IV +  L
Sbjct: 66  LGTLTWRAFGPSAFLLVATYFIIVERCFL 88

[Close]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. TAIR10
Match: AT1G78620.2 (Protein of unknown function DUF92, transmembrane)

HSP 1 Score: 81.3 bits (199), Expect = 1.4e-15
Identity = 44/73 (60.27%), Postives = 56/73 (76.71%), Query Frame = 0 

Query: 206 LRQFDSSSPFVCVGITWQSSLLSNLFIFALGSPILVSGLSLSGIASAFLLGTLTWRAFRP 265
           ++   S+SP      TW+S++ +NL IF LGSP+LV+GLS SGIA+AFLLGTLTWRA+  
Sbjct: 76  MKLIQSASP------TWKSAVANNLLIFVLGSPLLVTGLSASGIAAAFLLGTLTWRAYGS 135

Query: 266 SSFLLVATYFVIV 279
           + FLLVA YFVIV
Sbjct: 136 AGFLLVAAYFVIV 142

[Close]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9SYM0|VTE6_ARATH (Protein VTE6, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VTE6 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 80.1 bits (196), Expect = 5.5e-14
Identity = 43/72 (59.72%), Postives = 55/72 (76.39%), Query Frame = 0 

Query: 206 LRQFDSSSPFVCVGITWQSSLLSNLFIFALGSPILVSGLSLSGIASAFLLGTLTWRAFRP 265
           ++   S+SP      TW+S++ +NL IF LGSP+LV+GLS SGIA+AFLLGTLTWRA+  
Sbjct: 76  MKLIQSASP------TWKSAVANNLLIFVLGSPLLVTGLSASGIAAAFLLGTLTWRAYGS 135

Query: 266 SSFLLVATYFVI 278
           + FLLVA YFVI
Sbjct: 136 AGFLLVAAYFVI 141

[Close]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3BTA9|A0A1S3BTA9_CUCME (protein VTE6, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492936 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 96.7 bits (239), Expect = 1.1e-16
Identity = 59/88 (67.05%), Postives = 63/88 (71.59%), Query Frame = 0 

Query: 190 IVGLKSTSFLISSCLRLRQFDSSSPFVCVGITWQSSLLSNLFIFALGSPILVSGLSLSGI 249
           +V  +S   L S    L Q + S        TWQS+LLSNL IF LGSPILVSGLSLSGI
Sbjct: 45  VVRAQSFHTLASGAFNLLQSNPS--------TWQSALLSNLLIFVLGSPILVSGLSLSGI 104

Query: 250 ASAFLLGTLTWRAFRPSSFLLVATYFVI 278
           ASAFLLGTLTWRAF PS FLLVATYFVI
Sbjct: 105 ASAFLLGTLTWRAFGPSGFLLVATYFVI 124

[Close]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A068UBW1|A0A068UBW1_COFCA (Uncharacterized protein OS=Coffea canephora OX=49390 GN=GSCOC_T00021402001 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 94.0 bits (232), Expect = 7.4e-16
Identity = 50/57 (87.72%), Postives = 52/57 (91.23%), Query Frame = 0 

Query: 221 TWQSSLLSNLFIFALGSPILVSGLSLSGIASAFLLGTLTWRAFRPSSFLLVATYFVI 278
           TWQSSLLSNL IF LGSPILVSGLSLSGIA+AFLLGTLTWRAF PS F LVA+YFVI
Sbjct: 28  TWQSSLLSNLLIFILGSPILVSGLSLSGIAAAFLLGTLTWRAFGPSGFFLVASYFVI 84

[Close]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P6Q9R4|A0A2P6Q9R4_ROSCH (Uncharacterized protein OS=Rosa chinensis OX=74649 GN=RchiOBHm_Chr5g0029561 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 94.0 bits (232), Expect = 7.4e-16
Identity = 48/57 (84.21%), Postives = 53/57 (92.98%), Query Frame = 0 

Query: 221 TWQSSLLSNLFIFALGSPILVSGLSLSGIASAFLLGTLTWRAFRPSSFLLVATYFVI 278
           TWQS++LSNL IF LGSPILVSGLSL+GIA+AFLLGTLTWRAF PS FLLVATYF+I
Sbjct: 73  TWQSAILSNLLIFVLGSPILVSGLSLTGIAAAFLLGTLTWRAFGPSGFLLVATYFII 129

[Close]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P4JM17|A0A2P4JM17_QUESU (Protein vte6, chloroplastic OS=Quercus suber OX=58331 GN=CFP56_51974 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 2.2e-15
Identity = 54/89 (60.67%), Postives = 66/89 (74.16%), Query Frame = 0 

Query: 195 STSFLISSCLRLRQFDSSSPFVCVGITWQSSLLSNLFIFALGSPILVSGLSLSGIASAFL 254
           S S  +S  ++     SSS      +TW+S++LSN+ IF LG PIL+SGLSLSGIASAFL
Sbjct: 6   SLSSSVSEAVKKALIQSSS------LTWKSAILSNMVIFVLGLPILLSGLSLSGIASAFL 65

Query: 255 LGTLTWRAFRPSSFLLVATYFVIVVKVML 284
           LGTLTWRAF PS+FLLVATYF+IV +  L
Sbjct: 66  LGTLTWRAFGPSAFLLVATYFIIVERCFL 88

[Close]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5FL75|A0A2P5FL75_9ROSA (Uncharacterized protein OS=Trema orientalis OX=63057 GN=TorRG33x02_057630 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 2.8e-15
Identity = 48/57 (84.21%), Postives = 52/57 (91.23%), Query Frame = 0 

Query: 221 TWQSSLLSNLFIFALGSPILVSGLSLSGIASAFLLGTLTWRAFRPSSFLLVATYFVI 278
           TWQS++LSN  IF LGSPILV+GLSLSGIA+AFLLGTLTWRAF PS FLLVATYFVI
Sbjct: 87  TWQSAVLSNFVIFVLGSPILVTGLSLSGIAAAFLLGTLTWRAFGPSGFLLVATYFVI 143

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MELO3C029615.2 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_008451729.11.7e-1667.05PREDICTED: protein VTE6, chloroplastic [Cucumis melo][more]
CDP06050.11.1e-1587.72unnamed protein product [Coffea canephora][more]
XP_024160328.11.1e-1584.21protein VTE6, chloroplastic [Rosa chinensis] >PRQ30894.1 hypothetical protein Rc... [more]
XP_022984475.13.3e-1562.50protein VTE6, chloroplastic-like [Cucurbita maxima][more]
POE81816.13.3e-1560.67protein vte6, chloroplastic [Quercus suber][more]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. TAIR10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT1G78620.21.4e-1560.27Protein of unknown function DUF92, transmembrane[more]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
sp|Q9SYM0|VTE6_ARATH5.5e-1459.72Protein VTE6, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VTE6 PE=1 SV=1[more]
BLAST of MELO3C029615.2 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
tr|A0A1S3BTA9|A0A1S3BTA9_CUCME1.1e-1667.05protein VTE6, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492936 PE=4 SV=1[more]
tr|A0A068UBW1|A0A068UBW1_COFCA7.4e-1687.72Uncharacterized protein OS=Coffea canephora OX=49390 GN=GSCOC_T00021402001 PE=4 ... [more]
tr|A0A2P6Q9R4|A0A2P6Q9R4_ROSCH7.4e-1684.21Uncharacterized protein OS=Rosa chinensis OX=74649 GN=RchiOBHm_Chr5g0029561 PE=4... [more]
tr|A0A2P4JM17|A0A2P4JM17_QUESU2.2e-1560.67Protein vte6, chloroplastic OS=Quercus suber OX=58331 GN=CFP56_51974 PE=4 SV=1[more]
tr|A0A2P5FL75|A0A2P5FL75_9ROSA2.8e-1584.21Uncharacterized protein OS=Trema orientalis OX=63057 GN=TorRG33x02_057630 PE=4 S... [more]
Annotated Terms
The following terms have been associated with this gene:
Vocabulary: Cellular Component
TermDefinition
GO:0016021integral component of membrane
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR002794DUF92_TMEM19
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MELO3C029615.2.1MELO3C029615.2.1mRNA


InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of melon v3.6.1
Date Performed: 2018-09-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR002794Protein of unknown function DUF92, TMEM19PANTHERPTHR13353FAMILY NOT NAMEDcoord: 219..278
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR13353:SF7PROTEIN VTE6, CHLOROPLASTICcoord: 219..278

Synteny
The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
MELO3C029615.2Wax gourdmedwgoB302
MELO3C029615.2Wax gourdmedwgoB310
MELO3C029615.2Cucumber (Gy14) v2cgybmedB034
MELO3C029615.2Cucumber (Gy14) v2cgybmedB050
MELO3C029615.2Cucumber (Gy14) v1cgymedB645
MELO3C029615.2Cucurbita maxima (Rimu)cmamedB064
MELO3C029615.2Cucurbita maxima (Rimu)cmamedB114
MELO3C029615.2Cucurbita moschata (Rifu)cmomedB057
MELO3C029615.2Cucurbita moschata (Rifu)cmomedB107
MELO3C029615.2Cucurbita pepo (Zucchini)cpemedB397
MELO3C029615.2Wild cucumber (PI 183967)cpimedB038
MELO3C029615.2Wild cucumber (PI 183967)cpimedB056
MELO3C029615.2Cucumber (Chinese Long) v2cumedB035
MELO3C029615.2Cucumber (Chinese Long) v2cumedB055
MELO3C029615.2Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsimedB432
MELO3C029615.2Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsimedB420
MELO3C029615.2Watermelon (Charleston Gray)medwcgB230
MELO3C029615.2Watermelon (Charleston Gray)medwcgB239
MELO3C029615.2Watermelon (97103) v1medwmB254
MELO3C029615.2Silver-seed gourdcarmedB0906
MELO3C029615.2Cucumber (Chinese Long) v3cucmedB041
MELO3C029615.2Cucumber (Chinese Long) v3cucmedB058
MELO3C029615.2Watermelon (97103) v2medwmbB229
MELO3C029615.2Watermelon (97103) v2medwmbB238