MELO3C020895 (gene) Melon (DHL92) v3.5.1

NameMELO3C020895
Typegene
OrganismCucumis melo (Melon (DHL92) v3.5.1)
DescriptionMethionine aminopeptidase 1
Locationchr11 : 3069615 .. 3083192 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGGTCGGAGCTTTGGTGTACGGAGAATCAAAACTCTTCTCGTCCTTTCTGGGAGTTGGTGCTAACCATTTACTTCGCTCTCGGCTGCCTGTTCATCAACTCTTTGCCAATAATCCAGGAGGCAAACATGTCTCCATGCAATTACCCAAGGCGCTTTCTGGTTTGACCAACCTCTTCTTCAGTAGAAGAAATTTGGACGAGATGCAAAATACGAAACGTAAACGTCTAAGACCTGGAAAAATTTCTCCTCGTCTACCTGTTCCAGACAATATACCAAGGCCTCCTTATGTGAAATCTAAACAACCACCTGGAATTGCTAGTGGACCTGAGGTGCATGATGAGAAGGGTATAGAGTGTATGAGAGCTTCTGGGAGGCTTGCAGCCCAAGTTCTAGAATATGCAGGGACATTAGTCAAGCCAGGTATTATGACTGATGATATTGACAAGGCTGTTCATCAAATGATAATTGATAACGGAGCCTATCCCTCACCTCTGGGCTATGGTGGCTTTCCAAAGAGTGTATGCACTTCAGTGAATGAATGCATTTGCCATGGAATACCAGATTCCCGAGCTCTTGAGGATGGTGATATTATCAATATAGATGTTACCGTCTATCTAAATGGATACCATGGTGATACTTCAGCAACTTTCTTCTGTGGAGATGTTGGTGATGAAGCCAGAAAACTTGTCCAGGTTACTAAAGAGTGCTTGGATAAAGCAATATCCATATGCGCACCAGGAGTGGAGTTCAAGAAAATTGGCAAAATAATTCATGACCATGCAGATAAGCATCGATATGGTGTCGTTCGACAGTTTGTTGGCCATGGTGTTGGACGTGTGTTTCATGCTGATCCTGTTATTCTCCACTTCAGGAACAATGATGGTGGGCGCATGGTGTTGAATCAAACCTTTACAATTGAGCCAATGCTAACCATTGGTAGCAAAAATCCTGTCATGTGGGATGATAACTGGACCGTCGTAACTGAAGATGGGAGCCTGTCAGCACAGTTTGAACACACTATCTTAATAACCAATGATGGAGCTGAGATATTAACGCGGTGTTAA
The following terms have been associated with this gene:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR000994Pept_M24
IPR001714Pept_M24_MAP
IPR002467Pept_M24A_MAP1
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0004177aminopeptidase activity
GO:0008235metalloexopeptidase activity
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0006508proteolysis
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0019408 dolichol biosynthetic process
biological_process GO:0031365 N-terminal protein amino acid modification
biological_process GO:0070084 protein initiator methionine removal
biological_process GO:0006508 proteolysis
biological_process GO:0009737 response to abscisic acid
cellular_component GO:0005575 cellular_component
cellular_component GO:0009507 chloroplast
cellular_component GO:0005739 mitochondrion
molecular_function GO:0046872 metal ion binding
molecular_function GO:0070006 metalloaminopeptidase activity
molecular_function GO:0004177 aminopeptidase activity
molecular_function GO:0008235 metalloexopeptidase activity
This gene is associated with the following unigenes:
Unigene NameAnalysis NameSequence type in Unigene
MU44642melon EST collection version 4.0transcribed_cluster

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MELO3C020895T2MELO3C020895T2mRNA
MELO3C020895T1MELO3C020895T1mRNA


The following transcribed_cluster feature(s) are associated with this gene:

Feature NameUnique NameType
MU44642MU44642transcribed_cluster


Analysis Name: InterPro Annotations of melon
Date Performed: 2016-09-28
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR000994Peptidase M24, structural domainGENE3DG3DSA:3.90.230.10coord: 111..354
score: 2.7E
IPR000994Peptidase M24, structural domainPFAMPF00557Peptidase_M24coord: 118..344
score: 3.6
IPR000994Peptidase M24, structural domainunknownSSF55920Creatinase/aminopeptidasecoord: 74..353
score: 4.19
IPR001714Peptidase M24, methionine aminopeptidasePRINTSPR00599MAPEPTIDASEcoord: 174..187
score: 1.1E-18coord: 196..212
score: 1.1E-18coord: 266..278
score: 1.1E-18coord: 296..308
score: 1.1
IPR002467Peptidase M24A, methionine aminopeptidase, subfamily 1HAMAPMF_01974MetAP_1coord: 109..354
score: 4
IPR002467Peptidase M24A, methionine aminopeptidase, subfamily 1TIGRFAMsTIGR00500TIGR00500coord: 111..353
score: 7.1
IPR002467Peptidase M24A, methionine aminopeptidase, subfamily 1PROSITEPS00680MAP_1coord: 272..290
scor
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR10804PROTEASE FAMILY M24 METHIONYL AMINOPEPTIDASE, AMINOPEPTIDASE Pcoord: 55..354
score: 5.0E
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR10804:SF82METHIONINE AMINOPEPTIDASE 1D, MITOCHONDRIALcoord: 55..354
score: 5.0E

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None