MELO3C017080 (gene) Melon (DHL92) v3.5.1

NameMELO3C017080
Typegene
OrganismCucumis melo (Melon (DHL92) v3.5.1)
DescriptionCalcineurin-metallo-phosphoesterase-like protein
Locationchr7 : 23987 .. 40052 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AAATCATGCGCCTCGTCACTCGATTCATCTACGCCCTGTTACATATCAGTGAACTTAGTGAATGGTTTGTTTTTCTTTATTGGTCAATACAATCTTGGACAAAAAAGAGAGAGTATGTATGCACCAGCCAAAATGAGTTTTGTAGATGATATCTGTATATGAGTTTCTGTTAATGTGAAATCCTTGACATCTAAATATGTCATTCAAGATGGCACCTTTTTGGTTCATTACTGCAGGACCATTAGGAGAAAAATAGTCCATTAGAAGAGTTCGAGTCCCTTGTTTTTTCTACAACGGATTCTGAACATCTAAACAAGCATCCGATTATCTTTTTATCAGGGCACGAGCTTCCCGAATCAAATTCTGCCATTTTCAAACAAATTCTGCCATTTTCAAACAAATTCTGCGTCCATCAGGAGGAAAAAAATATATAGATGGGCAACGAGGCAGGATGGAGCTGGTGGCGGTTTTTCATTGTGGCGGGAGTGGCGGTCACTGGATTTCTTTTTCCTAGCAGCAGTGCTTCACAACAGGAGCAATTGATGGAGACTCAGCCCGTGGTATCCAGGATCGCGTTTGGATCATGCGCCAACCAGGATGCTCCTCAGGTTTTTGTCTTGCTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTGTTTCCTTTTCAATGAATGTCAAAAACAGACTTGAAGCTGAAGAATGACAGTGGCAAGATTCGAGAATGAAAAAATTGGTGGAAAAAGTTCAAGATTTGAGCCTCAGTCATGTTTTAACCATAACAACGGCCACCCTTGTACGACCAAAACAACGGCCACAAGTTCTTGCTCATAAACTAGTTTCATACGATCTCTAATAGATAAAACATGAGCGAAATAAGCAATCGGCCTCTTGGATTGAAGGAGAACCTCACCAATACCAAACCTGGATGAATCAGTTTCGATTTCAAATGGTTGAGAAAATTTTGGTAGTGCTAATTTATGTAATGCAACCATAGCATTCTTCAATCTTTCTAACGCCACTTGAGCCTTTTTGTTCCATTCAATATCTCCCTTTTTAAAAAAATTACTCAACGGAGCTGCTAGGCTGCCATAATTGTTCACAATTTTTCGGTAATAACCAATAATCCAAGAAAACCATGGACTTTCTTGATGTTGGAACAGGCCACTCAAACATAGCCCTCAACTTCTCTGGATCAGCTTCGACTTCCTTGCTGGAAATTAGATGTCCAAGATACGCCACCCTTTTTCTAGCAAACTGGTACTTTGCTTGATTAACAAAAAGCTGAGTTTCCCAAAGAACAGAGAGGACTATGCATAAATGCTTGACATGTTCTTCTATCCCACGACTGTACTAAAATGTCATCAAAGAGCACCAATACAAATTTCTGCAAATATTGATGGAACGTTTTGTTCATCAAGGCTTAATTGATATTAATTGGAGAGGAAATAGCATTGCAGGGGCTTGAACGTAGGACTTCCCTGGACCACCTGCTCTGGTACCATCTTAAATTATCAATTCAATCTAATAGCTTAAACTAGTAGGTGAAAATAAATTTAATATAATAGCTAACATATATGATGTAAGAACCCAATCAAAGTAAGCAGTTAGATTGATTAATAAACTAATCATGAATAGAGATGTGCAATTCTAGGCTTTTAGGTTGCATATGCTAAGAAAATAACTAGTAAGCATTTGATTGTTTTTTTTACTCAATGAATAACTAAGAATAGCAAGATGATCCCTAAAATCTAGACAAGACCCATTTTCATTGAGTTTATCCTTTTAAATTTCATGTTCTTTAAGTTTCTTTGCATATATAAATTACGACACACAAAAACTCCCCTTTGGTTACCATTTGAATTCCACAATTAGCTAAATATATAGAGATTTCCTGAGGATCGGCTCCATACTTGACTATTACTATGTTATAGAGTTAGTAGTAGGTTTGGTGAAATTATAAATACATTTGTTTAGTTAAGAGTTCGTAGGCGACCACGGAATTTCTCGCTAACAAGTCACTAATGGGGTGTCATCTTAGTTGAAATTCACAGTTGCACCTCTTGATATTAGGTTATGTAGTTTCTTAGATTTACTATGTATTCTTTTGAGACTTAATATCTTTTCATTATCCTTGAAAAAAAGGCGTACACCTCACATGGAGTTGTTTTTTTTGCAGCCAATCTGGAACTCCATAATCAACTTTGACCCGCATGTTTTCATTTGGCTTGGCGATAACATCTATGGAGACATTAGGCGTCCATTCAAATTATTTGGTCGAGAAAGGACGGTGGGACCATGGAAAAATGTTCCACGTTTCATTCCTTCATCTAAGCAGGAAATGATGCTCAAATACAATAAGGGCAAGACAATTCCAGGCTATTCTCGGCTTAGACAGAGGACCAAGGTGCCAGATCCATTAAATTCATCGAAAATTTTATTACATTATTTGATTTTAAAATGACAAATTTTAAGAAATGGGTGGGTACCTTTGATTTTTAGTCGGTTGCATTGTGTTGTTTTAGGTAATCGGTGTCTGGGATGACCATGATTATGGATTAAATGATGCTGGAAAGGAATTTACCGAGAAGGTCACTAATCAGAAGCTTCTCCTTGATTTTTTAGATGAACCTCTTGATAGTCCAAGGTGGGAGTTCGTTTTCTACTTCTATATATTATTTGTCTAACCTAAAGGTTGTGCTTCTTTGGTTTATCTTATTATTATTTCTCCATATCAATCAATAGTTTAAAATAAAAGAAGAAAAGATGAAGTGGGGAATTTCTCTCTTAGAATGTATATTAATCAGAATTCACACAACTTTCTTCCTTATCGAACGAGGAAAAACTCACTGTTTATATACAGTTTAAAAGAATGATAAATCATAATAAAAGAAGAGGAACAATACATCAATATAGCAGATACGTGCAACGCGTAACCAAGCCATTGGAGAATGCGACTAACATGAATAGCTGAGATATTTTGGAATTTTCCTTTTTAAACCTGAGATGGAGTTTATGCAGTGGCCACACATCAGCTGCCAGGTATTGCTGATTCATCAGATTGACCGTGGTTTGACTGACTATTCTTTTCCTCAATAATATTAATCTTGCAGTTTATTCCGTATGTTAGATTACTTCGTAGTACTTACTTCCATTAACTAATATTAGAAAGTTGATGCTGGTATTTAAAAATTTTGTTGGCATTATGCATTTTGTTAAATATTATATGAAATTTGCCTTGATCCATCAACTTAAGCTTTTGGGTTGAATTGATGATTTAAGATGGTATCATAGGAGTAACAAACATTCTCCAACTTCTAATTCTCTTTGTTCTTCTTCTTGTAAGTCCTTACTAGATGTCTTTGATCTTGATGTTCCAATTGTCCCATAGGAAAGGTATCTATAAACGTGACAAGATCCCATTGCTAACTATCTTCTTATCATAGATTATCCGACAGACATAAACCTTCGGGTCCAAAATAACCAACAAGTTTGTTCCAAAAAGTACATTGGAGGCCCAAAATGATTTGAATTGGAAATTAACAATGATGGAAGAGATGAATGTGCTTAAACAAAATTGCACATAGGACATAGTTGAACTACCTAGAGGTAAGAAAACAGTTGGATGTAAGTGGGTGTTCACGGTAAAATGTAAAGCTGACGGTAGTTTTGAAAGGTACAAGGCCACATTGGTTGCTAAGAGGCCTATTCAGACCTATGGAGTTGGTTATCAAGAAACATTTGCTCTAGTTGCTAAAATCAATTCTATCAGAACTTTGCTCTTTGCGTAGTTAACTTTGATTAGTCTCTTTATCAACTAGATGTTAAGAATGTCTTTCTCAATGGGGAACTTGAAGAAGTATTTATGGACTTGCCACTTGGTTTTGAGATGGATCTTGAGATTAACAAAATGTGCAAGTTAAAGAGATCATTATACGGCCTTTGACAGTCTCCTAAAGCTTGGTTTGAACTTTGAACGTTTTGGAAAAGCAGTCACAAGCTATGGATTCAGTCAAAGTTAAGCTGATTATACAATGTTCTATAAACATACAAGGACAAGGTTATGATTTTGATAGTTTACGTTGATGATATCATTCTTACAGGCAATAGTGAAACAGGATTGATTCTTTTGAAGAAAAAGTTTGCCGATGATTATCATCAAAGACCTAGGAACTTTAAAATACTTCCTAGGCATGGGGTTTTCCAGGTTCAAAAGTTGCATTATTGTGAACCAAAGGAAGTTTATTCTTGTTATGCTAAAAGAGATAGGTTTACTTGAGGCAGAAACTCCCATTGAGCAGAATGTGAATGGAAGCTGCATTCAAAAATGATATAGGAAAGAGAAAAGTACCAGAGATTTGTGGGGAGACTCATATATCTTTCTCACGCACGTTTTGACATCGCTTTTATAGTGAGTGGTAAGTCAGTTCATGCATGCTCCTGGGCCAGCTCACTTTAATGTAGTTTACAGAATCCTAAGATATTTGAAGGGTACGCCAGGAAATGGCATATTTTTTAAAAGATAGGACAAGTTTACACTGATGCTGATTGGGCAAGTAACACGACTGATACTGATTGGGCAAGTAACACGATTGAGGGAAGATCTACTTTTGGTGAAATCTGGTTACTTCGCGAAGTAGAAAACAAAGTGTGGTTGAAAGGAGTAACGCAGAAGCAGAATTTAGAACTTTAGCCATGGTGTTTGTGAGAGTATATGGATAAAAAGACAGTGGAAAGAATTGAGATTCACTCATACAATGCCCATCTGCATTTACTGTGATAATAGGGAACCAATTTCCATTGCTCACAAGTGAGTCCTTTATAGCAGGACGAAACATATTGAAGTCGATAAACACTTTATAAAGGAAAATATCGATGTGGGAGTAATATGCATACCTTACCTTCCGACATTAGAACAAATTGCAGATGTGTTAACTAAAGGTCTTCCAAAGTGGCAATTCAACAACTTGATCGACAAACTAGCAATGGCTGATATCTTCAAACCAACTTAAGGGG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mRNA sequence

AAATCATGCGCCTCGTCACTCGATTCATCTACGCCCTGTTACATATCAGTGAACTTAGTGAATGGTTTGTTTTTCTTTATTGGTCAATACAATCTTGGACAAAAAAGAGAGAGTATGTATGCACCAGCCAAAATGAGTTTTGTAGATGATATCTGTATATGAGTTTCTGTTAATGTGAAATCCTTGACATCTAAATATGTCATTCAAGATGGCACCTTTTTGGTTCATTACTGCAGGACCATTAGGAGAAAAATAGTCCATTAGAAGAGTTCGAGTCCCTTGTTTTTTCTACAACGGATTCTGAACATCTAAACAAGCATCCGATTATCTTTTTATCAGGGCACGAGCTTCCCGAATCAAATTCTGCCATTTTCAAACAAATTCTGCCATTTTCAAACAAATTCTGCGTCCATCAGGAGGAAAAAAATATATAGATGGGCAACGAGGCAGGATGGAGCTGGTGGCGGTTTTTCATTGTGGCGGGAGTGGCGGTCACTGGATTTCTTTTTCCTAGCAGCAGTGCTTCACAACAGGAGCAATTGATGGAGACTCAGCCCGTGGTATCCAGGATCGCGTTTGGATCATGCGCCAACCAGGATGCTCCTCAGCCAATCTGGAACTCCATAATCAACTTTGACCCGCATGTTTTCATTTGGCTTGGCGATAACATCTATGGAGACATTAGGCGTCCATTCAAATTATTTGGTCGAGAAAGGACGGTGGGACCATGGAAAAATGTTCCACGTTTCATTCCTTCATCTAAGCAGGAAATGATGCTCAAATACAATAAGGGCAAGACAATTCCAGGCTATTCTCGGCTTAGACAGAGGACCAAGGTAATCGGTGTCTGGGATGACCATGATTATGGATTAAATGATGCTGGAAAGGAATTTACCGAGAAGGTCACTAATCAGAAGCTTCTCCTTGATTTTTTAGATGAACCTCTTGATAGTCCAAGGCGCAAGCAGCATGGTGTGTATGCATCATATATGTTCGGCCCTATAGGTAAACAAATTAAGGTTATCCTATTAGATACTAGATATCACCGTGATCCGCTGTTTAGTGATGGAACTATTTTGGGTACTGCTCAATGGACGTGGCTGAAGAGGGAGCTTAAGGGTCCAGAGTCGGCAGTAACAATAATTGGGTCATCCATTCAGGTGTCTCAAGCATACTTTGTCTACAAGCCTCTAGCCTGTGCACTTTTCCTGTAGATCTATTCTTACACTCATTCCGCGTTAAATCTTCCTTGCGTAACATAGCGTAGTAGTAGTGAGCTTTATTTTTATGAGTACATGTGACTGTTATTCTACAATTTAGGTTATATCAAATCTTTCCGCAACCACCAGACCTTTGTTCTATTTGGAGTCTTGGGGACGTTTCCCAAAGGAGAGAGATCTCCTTTTCAAATTGATTGCAGATAGCAAGGTAAAAAT

Coding sequence (CDS)

ATGGGCAACGAGGCAGGATGGAGCTGGTGGCGGTTTTTCATTGTGGCGGGAGTGGCGGTCACTGGATTTCTTTTTCCTAGCAGCAGTGCTTCACAACAGGAGCAATTGATGGAGACTCAGCCCGTGGTATCCAGGATCGCGTTTGGATCATGCGCCAACCAGGATGCTCCTCAGCCAATCTGGAACTCCATAATCAACTTTGACCCGCATGTTTTCATTTGGCTTGGCGATAACATCTATGGAGACATTAGGCGTCCATTCAAATTATTTGGTCGAGAAAGGACGGTGGGACCATGGAAAAATGTTCCACGTTTCATTCCTTCATCTAAGCAGGAAATGATGCTCAAATACAATAAGGGCAAGACAATTCCAGGCTATTCTCGGCTTAGACAGAGGACCAAGGTAATCGGTGTCTGGGATGACCATGATTATGGATTAAATGATGCTGGAAAGGAATTTACCGAGAAGGTCACTAATCAGAAGCTTCTCCTTGATTTTTTAGATGAACCTCTTGATAGTCCAAGGCGCAAGCAGCATGGTGTGTATGCATCATATATGTTCGGCCCTATAGGTAAACAAATTAAGGTTATCCTATTAGATACTAGATATCACCGTGATCCGCTGTTTAGTGATGGAACTATTTTGGGTACTGCTCAATGGACGTGGCTGAAGAGGGAGCTTAAGGGTCCAGAGTCGGCAGTAACAATAATTGGGTCATCCATTCAGGTGTCTCAAGCATACTTTGTCTACAAGCCTCTAGCCTGTGCACTTTTCCTGTAG

Protein sequence

MGNEAGWSWWRFFIVAGVAVTGFLFPSSSASQQEQLMETQPVVSRIAFGSCANQDAPQPIWNSIINFDPHVFIWLGDNIYGDIRRPFKLFGRERTVGPWKNVPRFIPSSKQEMMLKYNKGKTIPGYSRLRQRTKVIGVWDDHDYGLNDAGKEFTEKVTNQKLLLDFLDEPLDSPRRKQHGVYASYMFGPIGKQIKVILLDTRYHRDPLFSDGTILGTAQWTWLKRELKGPESAVTIIGSSIQVSQAYFVYKPLACALFL*
The following terms have been associated with this gene:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR018946Alk_phosphatase_PhoD-like
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0046656 folic acid biosynthetic process
biological_process GO:0046486 glycerolipid metabolic process
biological_process GO:0019497 hexachlorocyclohexane metabolic process
biological_process GO:0006470 protein dephosphorylation
biological_process GO:0008152 metabolic process
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0004035 alkaline phosphatase activity
molecular_function GO:0016787 hydrolase activity
molecular_function GO:0003674 molecular_function
This gene is associated with the following unigenes:
Unigene NameAnalysis NameSequence type in Unigene
MU53511melon EST collection version 4.0transcribed_cluster
MU53830melon EST collection version 4.0transcribed_cluster

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MELO3C017080T2MELO3C017080T2mRNA
MELO3C017080T1MELO3C017080T1mRNA
MELO3C017080T3MELO3C017080T3mRNA


The following transcribed_cluster feature(s) are associated with this gene:

Feature NameUnique NameType
MU53830MU53830transcribed_cluster
MU53511MU53511transcribed_cluster


Analysis Name: InterPro Annotations of melon
Date Performed: 2016-09-28
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR018946Alkaline phosphatase D-relatedPFAMPF09423PhoDcoord: 47..247
score: 3.2
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR11177CHITINASEcoord: 43..245
score: 8.6
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR11177:SF220SUBFAMILY NOT NAMEDcoord: 43..245
score: 8.6

The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
MELO3C017080Csa4G665670Cucumber (Chinese Long) v2cumeB313
MELO3C017080Cla000527Watermelon (97103) v1mewmB489
MELO3C017080CSPI04G27490Wild cucumber (PI 183967)cpimeB311
MELO3C017080CmoCh09G000040Cucurbita moschata (Rifu)cmomeB026
MELO3C017080Carg08586Silver-seed gourdcarmeB0107
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
MELO3C017080Watermelon (97103) v2mewmbB473
MELO3C017080Wax gourdmewgoB605
MELO3C017080Cucurbita maxima (Rimu)cmameB037
MELO3C017080Watermelon (Charleston Gray)mewcgB463
MELO3C017080Cucurbita pepo (Zucchini)cpemeB016
MELO3C017080Cucumber (Gy14) v2cgybmeB270
MELO3C017080Cucumber (Chinese Long) v3cucmeB316