Lsi11G015070 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi11G015070
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionUnknown protein
Locationchr11 : 23537385 .. 23545978 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTATTTTATGCTATTTGTACTGTTTTATTATTCCCCCAGCTTGTAATTTTGTTACCATTAAAAAAAAAAAAGATTGGTTTTTATACTATATTACATTCATCCTTTAATTGTCTTTTTTTTCTTATACATAATCGATGCAAATATTGTGGAAAATTAAGAAGTATTGAAAGATGGTATAATTCAACTTTTTTCTATGCCTTGTAAATTAAGCGTTTTGAAATTTGAGTTGGAATAGAGGGGTACGTAATTTTAATTTTCAAATGAAAATTGTGTCAAAAATAATTAAATATTAGGTAAAGATTGTTTTTATTAGTATTGATTCAAACCGCAAAATCTCTTGATGATTAATACATATATATGCCAGTTAAATTATGCTCGCTTCAATCTTTTTTTTAAATCATTCATAAGTTATAAGTAATTTGGATAGAAATGGATATTGAATTGTCTATATTTATGGTAACTTATAAGGTCAGTTATATATCGAGATCATAATTTCTTTGTGTTGTTCTCGGTATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAATTTCAAAATTACCTTAGATTTCGTTTACATTTGAAAAACATTTCTGTAAAGTACATTACAAAGAATGTTAGTGCTTTTTAATAATATTCAAAAAGACTTTTGAATATTGTGTGAAAATGGGAAAAAGAAAAAGAGTTTAATTACAATATTGACTAACTTTAGAAAATATACATATTAGTTTAAACACATAAGATGAGGTTTTTTCCATCTTTGAGGAGTTACACAATAAATTTAAATAAAATGTGAAAAGTAGGGATAACATGATGATAACCATGAAAATATGTTATATTAATATTTTTTTCCTTTTCTAAAAATGATATTATAAAAATAAAAACAAATGGGGCCACAAATTTAGAAAATTTATATTATTTTTGGTGTAGAGAACTCCCCCCACAAGTTGGAAAACCATTATTGACTTGTAGTAAACATGACAAATTAAAAGGAAAATTCATTCACATTACCTTTTTTTTCTCAAAAAATAATAATTAAATTTAAAGAGAAATTTTAAAAATAGAAAAATAAGGAAACTATTTACAAAAAATAGCAAAATGTTTAGATAGTTGTGATAAACGCTAATAGAAGTCTATCAGTGATAGATGCTGATGGAAGTCTATCAGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTATTTTCTATAAATAGTTTGACATTTTTTTCTACCTGTGAAATTTTTTCTAAATTTAAAGTGGAAAATATTGAATTTTAAACCAATGTTTTTTTTAGTACAAGAAAGACAAGAAACATACAAACAAATTAAACATAAGTAGTATCATCAAAACTAGTTACTCTCTTATTCAAGGAAAGTGGAGGTCTTAAAGCATTTCGACGAGAATAAGAGCTAAGATTATGAGCTTTTTTGTTGCAAGCTCGTGTTGTGTGAAGGAAGCCTCAAACAATTTTCTGTCTCATGTTAAAGAGAATTTCGATCAATGAAAATTTCCACGTCAATTTCTTTTAGTTAAATTATTATAGAGGTGAAGAATTGAACCATTGTGAAACACATTATACGCATACGCAAGTTAATATATACACACATTTTTCGAAATACTGAACCGCCCAAACCATATGCATTAAAGCAATTTCACATTCCAAAAAAGTTGAAATTTGTCTCAATTCAAATAATAACCATTGGTTTACACACACAAACTTCAACCCCTAAAAAGTGTTATTTTGTCCATATATATATATATATATAGATGCTACTTTTTTTGTACACAGAGAGGACATAATGTGGCTTGGAGATTGATGAGCTGTGTGAAACTAAAAACAATGTGTGGGAAAGCATCCTCATAATTTCCTTTTACCACTTTTGCTATCTTCTCCTAACTTTATGGACAATAACATAAGTCATAACAACAGCTTATTATATTGACCAAACCTAAGTTTTAGTAATTATTATGATATAATTATCAATACAAATTATTTGAGGGGACCTCACCATCTATATTAATGATCATCGCAACAATTTTCCTCTTTCATATTCAACTTTGAGTTGATAAATAATAAGAGTTATCATTAATGTATTCATTACTAGTTTGTTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTTTGATATGATATGTGAAAGTAGAGATTAATTACAACCTATGACCTTTTAATCGAAAATATAATTCCTTTATTGTTGGAAAAAAAAAAACTACTCGACACTAAGCAGAAAAATTATCGAGATATTAAAATAAAACAATAAAATTATTACAATCACACAAAATAATTGACATTAATTACAAGATCACTTTCTCAAAAAATTATACCACTCACACAATTGAGCGAATATATCAAGCTTAAAGTGCTTCAAATTGGGATGATTAGAAACTGTTAAATCGTCAATTGACCCAAAAGCTTAAGCTGATGGTTGAAGATAAATTTAATATCATATCATCTAACACTCCCTCTTACTTGTGGGCTTGAAATATGAAGAAGACTCAACAAGTGGAAATCAATATTAATTGGCGAGAAAATAATATTGCAGAAGTTTGAACACAAAACTTTCTTGGACCACATGTTCTGATACTATGTTAAATCGTCAATTAACTCAAAAGCTTCAAAGACATAGATTCCTTTTATAGTGCTTTGGAGCACATTACTTCCTTAAATCTTTCGAATGTGTGACAACTATTTTTTTAATAATATATTTTTTTTTTCAAAATCGAACATTTATTAGATGAGTTACGCTAGGTTAACATGTACTGGTTTCCTGTGTTTATTGAAGTCAATAAATTAATCCTCCCACTATGTTAACAATGGAATAATATTATATTATCTATTTTTAACCTAAATTTTTATGACTTTGTATTTGGTTTCAACGGATAAAAATTAAAATGTTGTCGTTCGCACTTATACATCCGACATCTTTCTTATTGGATTGGAACACTTTTGTAATTTGATATTGAAGTTGAAATGGATAAGGTGGGTAATGGTCGACACCAAATAATTCAAAAAAAGTGAGATGAAAGGCGGCAGAAAGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAAGGTCCTGCTATAAGGTGAGCCAAATGAAAAGTAAGGACTTTTTCTACAAATAATATCATTTTAATAAGTAATGACAAGAATAGGATTTAATTGAAAAAATTAACAAAAATAGGGTAGCAAAATTATGTACGGAATCCACGATTTCAACTGTCCTCAAAATCGTAGACCGAGTTCATGATTTATCCTGCCAAGTGTCAAGGGGGTCCAAATTGGTCAGCAAAATTATGACATGTGAATAAAATGAGTGCAATTGTGGCAGAGTTCACGTAGACATGGAGCAAAATTGTAGACCTAGTCCACGATTTACATGCCATCTGGGCTAATTTTATGGAATCGTGGACTTGTCTACAATTCTTTCACCTATTTTTTAAAATACTTTTATCCTTACTTTATTTTTTTCATTATTTATTAAAATAATATTATTTAAAAAAATCGAAAATTATAGGAATAAATTTATATAATTAATTAGAAAATTGAATGGAAGCAAATTGCGTGAGACTGCGAAACAATTTGCTCATTGAAATTGGATTAAAAGTCAATTATTTCTACTTTCTAATTTTTTGTTTTTATTTTTATTTTGTCAATTACGGATTTAGAAACCTTTTCTACTGTCGGTGACGCGTGTTTCTCTTTTTTGTCGTTCCCTTGACTGATTTCACCTTCAGGTATACTGTATTATTTTCCTTATTTTGGAAAAAAAAATAATGAAAATTAAATTACCCTACCTTTAGATGGATAGCCATGGCTTTGCCATACAAAATTGGGCTCAATTGGGCTAATTACATGGGCCTCCGAGCCTTTGCCATTGAACATTGGGCCGTGAACCATTGAGCCCACATCACTGCTATTTATTAATCAGAGATTGAATTTTTATACTTTTATCTTTTTGGTTAAAAAAACATCTTTGGTCTCTAAACTTTCGGAAAAGTAACAATTTAGTTACTGAACCTTGGTTTGTAACGATTTAGTCCCTATACTTTCAATTTTATAATAATTTAGTCCCTGAATTGTAGTATGTAACAAGCCCACATCACCGCTATTTATTTATCAGAGATTGAATTTTTATACTTTTATCTTTTTGGTTAAAAAATACTTTTGGTCCCTAAACTTTCGTGAAAGTAACAATTTAGTTATTGAACTTTGGTTTGTAATGATTTAGTCCCTATACTTTCAATTTTGTAACAATTTAGTCCTTAAACTTTAGTATGTAACAATTTAGTCTTTGAATTTTCAAATTTGTAACAATTTGGTTCTTAACATAATTTCTTTTAATCAAAATTAGATGTTAATTTTTATTATTTTATGATGTAGACTTTGTATTTTATAAAAATATTGAGTCTCTAATTAATTTATCGATTTATTTATGCAAAAAAAAATATCATTAAATCTTAACACCAATATCTACGATAGCTACTAAATTGTTATAAATTTTGAAGTATAAGGACTAAATTATTATTATATATTAAAGTTCAAGAACTAAATTGTTACTTTTATGAAATTTTATGAACTTTTTTTTAACCCATACTTATGCTTTGTAACTATTTATTTCTTATTATTATCTATTATGTATCTATTTGATTCTTACGTCCGCACAATTAAATTTCTGTTTAATGCTTACATGACATGCTAGTCATGTTTTATGAAAGGAATATATGGGTGACTTGATTGGTTTGTGCCATTATTTAGTGCTTATATATATATAACATGCTAAACAACATTATTTATAGTAAACTTGAGTATAAGTTAGTGAATAATGTGTCTATTACTATTATATCAAATATCAATGGTTAATGATTAAAGAGGAAATATTAAAAATTTTAAGAATTTATTAGAAATATTTGAAGGTACAATGAAACTAAATAAATACATAAAAATTGGACCAAGGTTCCAAAACGTGCATAGCTCTCAATAGTTATTAGCATTTAGACCTTCTCTCAAGCTTAGTGATAGTTGAGTCTTTTGATGATCTCGTGAAATATTTGGAATGGTAAAAAAGAGTTAGGAGTCAAAGTCCTCCTCCTTAAACTAAATAAGATCAATAAAGAAGTTTAAACCTCAATTTATGTGTAATTTATCCATTTTTACTTTTTTATGCCAATATTTGATCAGGGACGAAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTCTATTTAGGATAGTCTAATCCTGCGATTAAGATAGTTATGCCAAAGGTTGCGCAACAACTCCTCGTAGGCAATAGAAACCTACTCATGCTGCTTTGATCGAACTTTTTTGCTAATTGTCAAATCAATAATCACTTGGAATTTTAAATCCTCGTACCTCACTTTATTGTATTACGAAAAAAGAATTGTCGATAAAATTCTACATATATTAGAAGTTCTTATTTGAGAAACTGAAAGTTCACCTAAACAATTTTGATCAAACGTAAACACAATTTGGTAGTTAGGTGTCATTTTATTTTCTTAACGTTATCTCGTCCAACATTTGTTGAACAAAAGTGAACAAATTTAAATTTAGAAAGAAAAAAAATACACCTTTGTTTGTTTGTTAGACTAAGTGTATAGGTTAAGGCATGCTTGTGTGTAAATTCTAAGTTATTTAGGACTATCCTTTTACAACATCACATGATTAATCAATTTAAGAATTAAGTCAATTAGTAACTTACGCTATCCAGATTATTAATTGTCTTGGCTAGATTCCCTAGGCTTAATGCAGGTGTTTAATTGATTAGGACGCTATCAAAACTGATTAGTTGTGAGCATATAGATTAATTAATAAATTAAGGCATCTTGCTTTGGTCTTCTGAGTAAACGAGCCAAGGATAAAAACCACCAAGCATTGCATCTTTAGAGTTCTACGATCAACTAAGTAAATGGGTGGAATCTAAATTCCCTAGGCTTGATCAATTTGAATTCTATTTCAATTCCGCTCTTTTTGTTTATGCAATTCAAACTCTCGCCATTTAATTTCTTGTAATCACAACAACCAAACCTCCCCCCCACCCCACCCCACTTGTAACCGTCAAATTTATTCAATAAGCTAATTGCGATATTTTTTTAAGTTTTATAAGCATTAATAAAAGATATAATAGCTACCGATTAATACTTAATCTAACCCTCTAGTTTACAACGAATATTTTAGAACCTCTTTGGTAAGCAAACTGAAAATAGGAATTTAAAAATAATGGATTCAATGAAAATAGAGTTGTATTTCATGTCTTCATATATGTGTTTGATAGCAAGTTTAGAATTTAAATGTCAATCTAAACAAAATTTCAAAATGTGTTTGATAATATATTTAAAAACCATAATACTAATCTAGTTACTCACTAAATATTAAGTTAAATATAAATATTTACTAATTAATTTATGAATTTTTTTTTAGGTAGAAAAATGGGGTCTTTTCACAAATAGAAAAAAAAAACTAATTACACATATAGAAAAAAAGTGGAAAATACAAAAGCATGAAGTGCATTTTTTTCTATATGTGTAATTAGTTTTGTTTTTTTTCTATACACAACAATTTCTCTAGAAAAATTAGTATAATTATTATTTTACAATAATAATTTATTTAGTTTATAACCTACAATACTATATTTGTTAATGTTTTTATCTTTTTTATTATAATTTTATATTTTAAAATATCAAATTCAAAATCTAAATAGATTGAAAATACAAAAATATTATTTTCAAAATTTACCATATTTGTATCACAAAATCCAAAAAGAGCTTTCCAAAACAAAATTTAAACTACATATACAACATATATTCGTTGAATTGAGTGAATGTGAGTTGTCTATTAAACAAAGCTTAATCTTGGTTCATGTGACATTATTATTATTTTGTTGTCTCTGTAGCTCATCCATAGCTGCCGCTGCCGCTGCCGTGAGGGTGGCGGTGGCTGTGGTTGTTGAAGAGGTGATGAAGCAACGTCACAAAAATGGCAAAATAATGAAATTGGGGTTTCTGAGTGTGGGGTTATAGCCTGACACAATCCTAACCATCCAAAATTACTTTTCCCTTTGCTCAATTACCAACGCCTTACCTGCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCATCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTCTCTCATGATGCATGTAATGTATGATATTGATATTGATATTGTGTTGTATTGTACTATTGATTGAATAAATCATCTAAAGTTAAAAACCCTTCTTTTCTTTTGTTTTCTCGATACAAGTGATGGGAAAGTTGGGGCCTTTTCTTTATTTTTCTAAGACATTATTGAGTTGTTGGATTGAAAGTTTAAGAAAATTAAAACAAGGGACCCAAAAATAAAAACAAAAAAACTAGCTGATTGGAAGTTCAAAAAGGCATTTTATTTTGTAAATAATAATTATATATGTATATATAAAGATAACACAAACTATGTTGGAGTGGTTTGATAATTCAAATCTTTAGTTTGTATGGTTGCTGCGAGAAACTTGCAGGCATTCGTCGTCGTCGTGGACTTGACCGTCGACCTGCTTCTCTTGATCTGCGGAGAGTTCTCTTTCACACTGGTATGATGTCAAGCTTACCACAATATGATGTCTAACTTACTAACTTACTACAAAGAGTGTATAGTTCAGTTAAATACACGAACATAAGGTAAGAGTAAAGCTTTCTTTGGGAGGTTACTTACTATTTTTCTTTTCGGTCTTTGAATGAGATTATTTATAAGGGTAGTTTGCAACGTTTGAGGCTGCAGGGAGCTAGACCGAGCATGACTCGGTCATTTCTTGATTGCCCAAGCCTTTGATTTTTTTTTTCTTTTGAGACGCGAATTTGTCCGTGCGACATTCTTCTAGTTTTTTCTTTTTGGGTTTAGGCTCACCCTTAACATCTGTAAATCTTTGTGAAATGAGAATACTTGAATACTTAGATAACTGTGTTTGTTTAGCAGGATTTTTACTTGTAAAAATTTTAAATTAACATAATGTTCTAAGAATATTCTTACGACTATTATTCTTAAAAGTTAATTAAATATGATTTAAATTTATATACAATATTTGTTTTTATTAATTTCAATTCCTTTATAAATCAATATATAATTTACATTATTTTATAATGTAAAAAAAGCATGATTGGAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCATCGTATAGTTTGGAAAAATAATAATATATAATACAAATTAGAAAGCATGTATGGGATTGAGAAAGTAGTATAGTAGGAATAGGAGTGGCCTTTTTATAAACCAAAAAGTTATTGTTTGATTAATTTTTTGGCTTCATTATTGCCGCCTTTATATCTCATCTTTCCATAAGGAAAATGCCCACCACCTCTTTCATATTCGTCCTCAATCAAAAACATAAAAAAATAAAATAAAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAATGGAATATTATGCAAAGAAAACACCAAAATTTGTCTCGAAGATTAAGATTTTGGATTGGATTTTTTATTAAAGAGACACCCAAATCGCCAAATTTACATATTTTTTTTCTTTGATGCAGATTAAAATAGTTATTTGA

mRNA sequence

ATGTATTTTATGCTATTTGTACTGTTTTATTATTCCCCCAGCTTATTTCGTTTACATTTGAAAAACATTTCTGTAAAGTACATTACAAAGAATAGAACTCCCCCCACAAGTTGGAAAACCATTATTGACTTGTAAAACCTTTTCTACTGTCGCTCATCCATAGCTGCCGCTGCCGCTGCCGTGAGGGTGGCGGTGGCTGTGGTTGTTGAAGAGATTAAAATAGTTATTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTATTTTATGCTATTTGTACTGTTTTATTATTCCCCCAGCTTATTTCGTTTACATTTGAAAAACATTTCTGTAAAGTACATTACAAAGAATAGAACTCCCCCCACAAGTTGGAAAACCATTATTGACTTGTAA

Protein sequence

MYFMLFVLFYYSPSLFRLHLKNISVKYITKNRTPPTSWKTIIDL
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi11G015070.1Lsi11G015070.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Lsi11G015070Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB091
Lsi11G015070Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB198
Lsi11G015070Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB472
Lsi11G015070Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB561
Lsi11G015070Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB785
Lsi11G015070Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB080
Lsi11G015070Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB188
Lsi11G015070Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB457
Lsi11G015070Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB544
Lsi11G015070Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB581
Lsi11G015070Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB199
Lsi11G015070Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB526
Lsi11G015070Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB606
Lsi11G015070Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB011
Lsi11G015070Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB430
Lsi11G015070Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB505
Lsi11G015070Cucumber (Chinese Long) v2culsiB012
Lsi11G015070Cucumber (Chinese Long) v2culsiB494
Lsi11G015070Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB090
Lsi11G015070Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB095
Lsi11G015070Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB119
Lsi11G015070Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB104
Lsi11G015070Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB089
Lsi11G015070Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB097
Lsi11G015070Watermelon (97103) v1lsiwmB093
Lsi11G015070Watermelon (97103) v1lsiwmB099
Lsi11G015070Watermelon (97103) v1lsiwmB100
Lsi11G015070Cucumber (Gy14) v2cgyblsiB462
Lsi11G015070Melon (DHL92) v3.6.1lsimedB096
Lsi11G015070Melon (DHL92) v3.6.1lsimedB101
Lsi11G015070Melon (DHL92) v3.6.1lsimedB126
Lsi11G015070Silver-seed gourdcarlsiB028
Lsi11G015070Silver-seed gourdcarlsiB584
Lsi11G015070Silver-seed gourdcarlsiB659
Lsi11G015070Silver-seed gourdcarlsiB795
Lsi11G015070Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB009
Lsi11G015070Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB453
Lsi11G015070Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB529
Lsi11G015070Watermelon (97103) v2lsiwmbB073
Lsi11G015070Watermelon (97103) v2lsiwmbB086
Lsi11G015070Watermelon (97103) v2lsiwmbB092
Lsi11G015070Wax gourdlsiwgoB116
Lsi11G015070Wax gourdlsiwgoB129
Lsi11G015070Wax gourdlsiwgoB130
Lsi11G015070Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsilsiB024
Lsi11G015070Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsilsiB048
Lsi11G015070Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsilsiB049
Lsi11G015070Cucumber (Gy14) v1cgylsiB021
Lsi11G015070Cucumber (Gy14) v1cgylsiB237