Lsi11G012700 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGATGTCTGTGATGTGTTTCCCCATATCGTATTTCCCTCGCTTGCTCAATGCCTTTATTATATGCTTTATATTCTGCAATAGATTGTTGAGCATTTTGTAAATTTTGAATGCACACGAGTGCTGTTGACATTAATGGTGCTGGCTTATTGCATTTGATAAAATTACTTCAAGACAACCTTCCATAATTGTAGGATCTTCTTTCCTCAAGGGAAGAACTTTTTATGGCACCATAAGGAAAGAAAAGGGTGTTTGCCATTGACTTTGATGGATTTTTTTTATAATTCTTCTTCATATTGTGTAAGATCAGAAACTCTGACTGACCCAATTTCTTAAGAGAGGTGAACTTTATGTTCTTTTAGTTCTTGTCCTGATTCTTCTTCCTTTGCTGCTTCATATTGCTTCTATTTATATGTGATATGCATTTAATTCCTTGAGTTCTTAAACTTCCCAGTCCCCACCGTACTTCCATCTGCTCACTTCCATGATTTTATCAGTAAAATTGAACAAGTAGATGTCCTCATTAGACTTTCTTCATGCAACTCTTTGATCAATCAGTTAAAAACTTAAAATGGTGATTATTATGGTGGAGGTGGCAAGATCCGTCATGATCGTTCAAGATAACTTTCATTTGCAGGAAACTGTTCAGCCTTACTCTAAGATAATTTAGCAAATTGTCTCTTAGTTGGAAGGCAACTTACCATATGATTCTTGAGCTTATCGCCATTACTGAGGCAATTGGAATCTTTGACAGTAATGCTAATCTTGATACTTAGCTTCATCAGATAACCATGGTTGGGTAATTGACCCTAGTTAACATTTAAAAAAAAAAGTGACATGAGAAACAATACTTGGAACAATAAACACTTTTCTCTTCATTCCTTAGCAGTTTAAACTACTTCAACCTCAAGTGAAAAATTTAGGTCTCCAGATGTTGAATTAGCAAAATTGTGATATGGATATAGGTTGTGTTTGTGTATTATTTTTCCCCCCTTTGAAACATAGCGCATATCACGCTGATCAATATAAATATTGGAAATTAATTGGCTGAAGAAGATGATTATACTAAACTCAAAATCTGATTTTGCTTCAAAAAGTTGATTCTCATAACAATAGAGATGTATATATATACACTTTGGTGTTTACATTTAACAAAAATGAATTCTCATGGCATTGACCATGATACTATTATCTAAATTCCATCCTTAGTGATTTAGGATATTGAGAAGGGAGACTCTATTTTTTATTAGATGCCTTTGTAGACTCTCAAGATCTTCTTCAAGATCTTGAATACTTGACTCAAATTTCCTCAGCGGGTCCTGCAGGCTGAAGGATTTATCAGTTGTGTGGCTGGCAATTGCAGATAGAGTGGCATCTACCATTTCAAGCTCATTTGCATATGCATCTTCATCTTCATCTTTGCTGGCAACTCTTTTGGTTTGTACCAGCTTGGAGACAAAAGACCATCGACTCAACTTTGATGGCAACTTTTGTCCTGCTATGAAGGACAATGCTGATTCAACAGTACTGAATGTGATTGCTTCTACTTCTTTTAACAAGCTTACAGTTGCTGAATTTCCTTCACTTTGCTGAGAACAGTTGCTTTTGATTCCTTTCAAGGCCTTGTGGACTGCCTTCTTTATCATCTTCCTAGAACTCAAGCATTTCTGAAGATCACTTGCAATAACAACTTCACCTCTTCTTCTACGCAAAACTGATTCTAGTTCACGTACACATTCTTTTGTCTGCAACAATGCATCCTTAGCAATATCACACAACTCTAAGACCCTCAAAGATCCTTCTAGCAAGTCATCAGTCCATATGTTATCGCTCTCATTGACAAGGGTTTGTTGGGTGAATGGTAGAAGAAGTAACTTATCAATGCAATCATGCAAATCTTGGAGGCTACTTATTCTGTGGCATAAAGTGGAAGTTGAACAAGTGGCTTCAGAGGACTTCAATCTGCACAAATGTTCATCAACTTGGTTAACAATTGGATGGAGCTTTGAGGGCAAGCTATTTGAGCGAACATGGAGTGTTTTCTTTGAGTTTACAGCAAAGGAATCCATTTTTCTTTCTTACTTGGAGAAGCCAAAAGCCTAGCTAATGACCTACACAAAAATTGAGCAATTTCAATCTGCCTTCATCCTTTGGTAATCAGGGAAGTATATATACAACAGGGGTTAGGGAGACATAAGGAATCTCATACTCATTCAAAATATAGTTTAAGTTATAGATCTACAAAACCAAAACTAATTCAGCTATGTTCATGCCATGTCTCCTTCCCACCTGTTTCATATCTCCATTATTAATGTTATTTATATTTATAATCACGTGCATGTATCTTATACAAAAATCAAATTCTTGAATATAACTAATTTCTAAAAGATATAGTTTTATTGTAATGGAGAAACGATATGGGATCATGCATGCCTCCTAACTATGCTATTATAAGCTTCTCATGATCTAGATCTAAACAACTTTGCAGTAATGTTTTGGCATTGTCTCTTCTCCTCCGAGTTTACAGCACATTAACTAATTAAATTAATTTGTTCTAATTGCATGAGAATCTCTCCATATACAATCTATTGGCATCAAGATTATTTTCTTATCAAGAAAAATGTGACTAGGCCTCTCTTGATAAAGACAAGATTGTTTTGTCACACGTGTATCAAATTATATATCTGTTATCAACTATATGTCAGGCCATGTTTGTGATATGTCACCCCATCACCAGGTTTTTAGCTCATTATTTATTTCTTTTTTGTTTTAGTATACACATATAACATAATCTGCAATTTTTTAGCAAATGCATAAATTATGAAGCCCCCGGGTGCTGTTGACATAGCTTAGTATCGTACACCAAGGATATGATTCCTTGACCAAAAGATCTAAATTCTCGGTTTCATTAGCTAATCTGCGGTTATTAATTGATCTCTAGTTAACAAAACATTGTTTAAGTGATAGGTAAAATAGTACTAGTACTTGGTAGGGTAATCACTTTTGTTTTCTCATTACTTTTTGCTTAGCAGTTTAAAATCCTTCAAGTAACAATATCTCAATGGTTGAAATACAGTTTTTATTTTTTATTTTTGAGTTCAATAACATGTGAGGTTGAGGATTTGAACACCTTTTGGTTGAGAGTATATGCCTTAACTAGTAAAGCTAAGCTCAGGTTGGCATTGAAATACAAAATTGGTGATATGGGTAATGGTAAGGGTGTTCATTTCATAGTTTGGCTTGGTCGGGGAGCTCTTGTTCTTTTTTATTTGGGTTCCGTCGTTCTCTTTCCGATAGGGAAATAACGGATGTGGCTGCTTTTCTTTCTTTACTCGAGGGCCATCCTTTTAGATTGGGGAGAAGGGATGTCAGATTATGGAGTCCCAATCCTTTGAAAGGGTTCTCATGTAAGTCTTTCTTTCATTGTTTAGATGATCATTCCCCCTTAGGCGAGTTGGTTTTTTTGGTGCTTTGGAGGATTAAGGTTCCTAGAAAGGTGAGGTTCTTTATTTGGCAGGTTCTTCACGGTCGTGCTAACACAGTGGAGAGGCTTGTCAGGAAGCTGTCTTTACTTGTTGGGCCTTTTTGTTGTATTCTTTGTCAGAAGGCAGAGGAAGACTTGAACCATATTCTTGGTGATGTGACTTTGCGAGTGGTGTCCGACATTCTTCTTTCCAGACGTTTGGTATGATGAGTGTTTGTCATAGAGATGTCAGCGCTATGATCAAGGAGTTCCTCCTCAATCCACCTTTTGGGGAGAAAGGCTAGTTTCTTTGGCGTACTGGAGTGTGTGCGATTTTATAGGTTTTGTTGGGTGAGCGGAACAGTAGGGTGTTTAGGGGAGTGAAGAGGGATTTTAGGGAGCTTTGGTTCCTTGTTCGTTTTCATGTTTCTCTTTGAATTATTCTATAAGTGTCATTTCGCATAGTTGGAGTCCCTTCTTGTAAAAGGAGGCCCCTTTTTGTGGACTTGGTTTTTTGTATGTCCATGTATTCTTTCATTTTTTTTTAAAGCCTTTATTCTCATTAAAAAAAATTAAAAAAAGTTTGAAACCAAACCAAACCACATGTTTGGTCAAAATCGAACCAAACTAAATTTTTTGGTTTTGTTTGTTCGGTTTTAGGTTTCATGGTCTCCTCAGATTCACAGCTATTTTTTTTAAGGAAAAAAAAACATTGACACCTCTACTTTCCTGCCTTTTACTATGTTTTTTTTCTAAAACAAATAATAATAATATGAGTAAATGCGATTTGTTTTGTTTGGGGTTTGGTTTTGAATCCTAAACTGAACCGCATTAATTGTAAAAGCCGAAATTTTGGTTCGGTTTGGTTTTCGATTATTTCGCTTTTGGTTTTGATGTCCACCCCTAGATGAAAAAGGTTAGTGTACTTTTCCACCCTTCAAACATTGCACAGTATTAATAATATAAACATCGCAAAACAGTTGGCTTGGAAAGAAGACGGAGTAACTCAAATCTGAATTTTGATCTGAAAAGATTTATTCCTAATAAACACAGAAATGCATATACACACAAGTTGGTATTTACATTATCAAAAATAAATTCTCATGGCATTGACCATCATACTACTACCTAAGTTCTAGCCTTAGCAATTTAGGATCTTCAGAAGTGAGACACCGTTTTTGATAAGATGCCTTTCTTCAAGATCCTGAATGCTTGGCTCAAGTATCTTCAATGAGACTTGCACGTTTCCAACTTGCAGAAGGAAATTGGATTTATCTGTTGTGTGTCTGGCAATTTAATAGAGTGTGTCATTGACCATTTCTATTTCGTTTGTGTATGCATCTTCACCTATGCAAGCTACTCTTTGTGGTTGTATACTTGGTCTTGCTATGAAGGACACTACTGATTCGTACTATATGTGATTGCTTCTACTTCTTTTAACAAGTTAACGGTTGCCGAATTTTCTTCACTGTTTTTACACTTGATTTTGATTCCTTTCAAGGCCTTGTGAAATGCTTTCTTAATTATTT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ATTAGAGAAGACAAAGGCCTAACAATTGAACTACCAATCAGTCTAAGCAATTTTAGTTTGGCTTCATCTATTGGCAATGATGGCAATATATATAACAGGGTTGAAGAAACAAGGGGAATATTAATCTCAATTTAAAGAGTACTCCTTAGCATAATTGAGATATGGATCTTCATCACCGTCTCAGCTATTGTCCAAACCATGTCTCCCTCCAACAGGTCCCTACTCACTGGCATCCTTTGTTTTTTTCTCTATAACCACACGAATGCATCTTATTTAATTATATACCTCTTTTTAATTTGATATTGTTTGATAGTTCCATTAGTTTGTTGCAAATTGTGTAAAAGCAATGCAATCAAGACAGTCTGTCTTCTGGATGAAGGAAACAAACACACAGACAAGTGTGCACACGTAAACCATACACACACATATATGAACAATAAAATAGGTTTTCTGTGATGTATTCTTCTTCTTATTTTTCTTTAGGTTGCTATTCACTTTCGACCTCGGGGGAATGAGTAACTCTGAATAG ATGGCGATCGGGTCCTGCAGGCTGAAGGATTTATCAGTTGTGTGGCTGGCAATTGCAGATAGAGTGGCATCTACCATTTCAAGCTCATTTGCATATGCATCTTCATCTTCATCTTTGCTGGCAACTCTTTTGGTTTGTACCAGCTTGGAGACAAAAGACCATCGACTCAACTTTGATGGCAACTTTTGTCCTGCTATGAAGGACAATGCTGATTCAACAGTACTGAATGCTACTCTTTTGGGTTGCACAAGCTTGGAAACCGAAGACCAGCAGCTCCATTTTGACGGCAACTTTGGTCCAGCTATAAAGGACAACAAGGATTCCATACTGTGGTTGCTATTCACTTTCGACCTCGGGGGAATGAGTAACTCTGAATAG ATGGCGATCGGGTCCTGCAGGCTGAAGGATTTATCAGTTGTGTGGCTGGCAATTGCAGATAGAGTGGCATCTACCATTTCAAGCTCATTTGCATATGCATCTTCATCTTCATCTTTGCTGGCAACTCTTTTGGTTTGTACCAGCTTGGAGACAAAAGACCATCGACTCAACTTTGATGGCAACTTTTGTCCTGCTATGAAGGACAATGCTGATTCAACAGTACTGAATGCTACTCTTTTGGGTTGCACAAGCTTGGAAACCGAAGACCAGCAGCTCCATTTTGACGGCAACTTTGGTCCAGCTATAAAGGACAACAAGGATTCCATACTGTGGTTGCTATTCACTTTCGACCTCGGGGGAATGAGTAACTCTGAATAG MAIGSCRLKDLSVVWLAIADRVASTISSSFAYASSSSSLLATLLVCTSLETKDHRLNFDGNFCPAMKDNADSTVLNATLLGCTSLETEDQQLHFDGNFGPAIKDNKDSILWLLFTFDLGGMSNSE
BLAST of Lsi11G012700 vs. NCBI nr
Match: gi|778723186|ref|XP_011658621.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC105436063 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 3.1e-09 Identity = 31/38 (81.58%), Postives = 34/38 (89.47%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |