Lsi11G010500 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACAGAGTTTCATCCCGCCACTTTTGCAATTCTTGAATCAGGGTTGCATGCCAAGAACATTCAGGTAAGTCTGATCATCTTGCTTGTGGAGTGTTCAAACTTGGAGTAAGGAACTAGTTCTCCTTATCTCTTGGTCTTCGATCAAAAGGTAATCCAATTCTAGTATTTTCCTTTGGATTGATGTCAATTGATTTGGGGGTTTTGGGATTTGTTGTTATTGGTTCAACAATTGGGTTCCTAATTTTCAAATTGCTAGGGTTTTCATATCACTCCCTTACATCCCCACACAACTCAGGCAGTGTCGATAAAAAGTGTGTTGCCCGATGGCCACTAAAAGTACGGGTGGTTTCCCGTCGCCAGTACAACGGGATCACTAGAGGTGAGAATTTCTCCCCAAAATATGAAGAAGAGCCAAGCAAGTGGAAATAAATATTAATTGGGGAGGAAACAATTGTTGGGGTTGGCGTCCTAAATCTCATGGAGTCTCGTAATTTGTAATTTGAACATGATAATTTATTTATTCAATAAAATAAGATGTATTTTATTTGACTTTTAGATCGCTCTAACTCAATCCAATAAACTAAGATCCTAGGTTATTAAATGTAGTTTGAACACAGTATGTAATAGACATACAAATGGATATTGTTCAAGTAATAACCTAAAATATCTACATTATATGGGTAAGGTTGGGTGTCTTATCCTGGTAACACTGCGGATACAGCCACTCTGTAATTGTTACATGAGTTTTAAGTGTTACAAATAATTTGACCCAAATCGTTCATGTGGAGACATGTGAGTGGGGATATCGTGTACAAAGAGTTTGTACAAGACCGGATCGTGAAATGATTAATCTCAAGTTATAACACCGTTAACTGTAAAGACTGACATTTCATAAGATGACCATAAATAACTCGATCTCAATCCTAAGTAAGATATGGGCTCCCGTCTATGAGGGCAATCCTTTGATTTGTATGGGTGAGAGTAGCCTATGTCGCTGACTCAATATGCCTTCCATTTTGGGGATTTGTCCAAATAGAGAGCTGAGAACATAGCTACACAAGATGGAGTTTACTCCTTCCTGCTTTTGAGGAAAGTAGATAAATTGTTCCTTTAAGTGCTGATTCTAGGTCTTGAACAAGGGACCCCTCCCTCTCATTGGCTCGAAAGGGATTTGTTTATGGTAGGACCATAAACAGGTTGTTCATTTGAGGATTAGTGAGACTTAAGGAGAATAAAGTGATTACAGGGGTAAAACAGTAATTTTGACCCAGCTATAATTTTGAGCAATTTGTAAAGGGTCGATTTATTGATGACTGGTTATCCATGGACATACAAATATATCTATAGTGCAAAGAGTGCAGTTGTGGGTCTTTAGTGGAGTGACTCACAATTAATGAATGTTGATTTAATTAATTAAAGAAATTAATCTAATCTCGAATCATTGGAGCTTCTAATCGTAGGTTCATTAGGTCCCCTTGCTAGCTCACTAAGGGTAAAATAAGATTCAATTATTTTTAGAATAATTTGAATTGTTCAAATTATTTAGGAAATTTAATATTAATAAAGATTAATATAAAGTATAATGTACATTGACACATTATATTATATAGTTAATTATAAATATGATTTATAACTAAACTATATAATAAGAGAACAATATTTAAATAAGATTCATAATGTGAACTAGATTCATATCAAAACTATATAATAAAATTAATATGAATGTGATTCATATTAAAACTATAGTATATGAGAGAAATATGCATTTAATGCATGATTAATTAATTGATAATTAATTATTTATTATTATTTTAAATTAATTAATCAAATGTTAATTAACTAATTATATATATATATATATATAATGATTTTATATAATAATAATAATAACAACACCATTCCTTTTCAGTTATGCAGGGGAATGGAGAACGTGGGGTGAGGGAAAATTATTCCCCTCACGTTACCTTTCAGTTCTTTGAAAAGGAAAAAGAAATTGAAGTTAAGGTGTTGCTCTCTCTCTGTTGTTGCTCTGTGTGTGAAATTCCATGCAAAAACAAAAATGAGGATCCCACCATCCCTTTTGATCTTCCTAGAGTCAAGGCAAGGAAGTTCAACTGGTTGTGTTCTTGTTGCTGTATAAGATTGCGCTTAACTTACTACTCTCTAAAGGTAATATCTCTAAATTCCTTTAGTGCATGCTTAGCTTAGTTTACTGTACATCGTTTTTGATTTTTTTTCCAATCCCAATTTCAAAGACACGGAGATTAAATATTTCCACTATTGGGATTCAATCTCTTTTAACAATAATGCAGGGGCTTGAACCTAAGACATCATAAAGTAACCTGCTCTAATACCATGTTACATTGTTGATTGACCCAAAAACTTAAGCTTATAGGTGAAGGTTGTTAGATTTATTTTAAATTTAATATTATTTCTAATGTGACCCATGTGCATTATCTACTACTTTATCTTTTGGGCCTATTATTTTATTAGGTCAATTAAGTAAAAGATAATTCATAAATTATGTAAAACATAATTCCCTAATTAAACACCCTTGTTAGAGTTTTGGAAATTGTAGACACGTCGATTACCACCTCCCAATGCAAACCTTGATTTTCTATGAACCAGTAACCTACAATAAGCTTACTGCAAAACACACCTTTTATTTTTTTCAAAGCAATCATAGCTTGCATCTAGTATGAAACCTTAACTCAATTTTAAGCAATTGTTTACAATCTAATAAACTCATAAGAAGAATATATGGTAACTAGATAGTAGCTTCAACATCTTCCAACGTCCAATCAAAATATAAAAGATGTAGCAAATACAAAGCAATCCATCTAAAATCATGAGCATTCTTGTCAAAATTAAATAACACATCTAAATCAGCATATGGAATTTGCTAGACTATATAATGGATCATCACAATTACTTTTCCTTACCCTAAGCAACTTCGTATCATGAAAAGAGAGAGGAGAGATGAAAAGTTTGAATGGAGGCGAAAAACTATTACAAAAGCACTTGGGGTGATTTAGTGGAAAGAGGTTGTTATTTTCATTTTTTTAAAATAGTAAGAAGGATAAGTGCATCAAATTGGATGAGAGATAGTGTGTGTAATTTATAGTTTGAAAAATATATTAAAATTACTCAATTGGAAATTAGGGAAATTAATACTTATTTTATTCCAAAAAAAAACAAACACATAATTTATCATCTATTTATGTTATTGAAATTTCAAGTTAAACGGAAGCTGAAATAGCTTATGACTCAAGCTTATTCATCAAGAAATATTGTGAGTGGTTTATTTTATTAAAGTTTTTATTATTTAACTAGTATTAGAATATTTTAATAAATGTGCAATTATGTATGATTTTAGAGGAGCTACGAAATTTAAAAAGTCACTATGATGCTTTTAGAAAAGTTTATGATTTTTGTTGAAGATTTTATTTTACAATTATTCGAGATATTTTGTGATTATCTAAGAGTTTTGACGAAATCTTTTATGTTCTTTGAAGGAATTCAAAGATAGTGAAATACTTTAGAGAAAATATGGATAAAAGTTAAGACTTGAAAAATGTTGTTTTAAGAGAAAAGTAAGATTTTAAAATAGCAATTGAGAATGAAAGAGTTCCATCTTGAAAGTAGTTTTCAAACCACTAGATCTTGGTACCCATGGTGATTACCTGTATACTACATGAATGTATTATTGTGGTATACTAGATAGAGAGATAGGTCTTTAGGACCCACTTCGGCACACACATAGGCTTTAGGCCGTGTATCGGGGTGCTTTGCCCTTTGAGGGCCCTCTGTGTGCACGTATGACAGGGATTGAACTGCTATGTATCTGGAGATTACTTGGGACATAGTATAACAGAGATTTGCTCTTCTATGTGTTGGGAGATGTCTTGATGCATAGTATGACAGAGATTGCGCTGTTGTGCGTGTTGAGTTTACTCTCTGCCAGTATGACAGAGACTTGGATATAGATTTGTTGATGACTTTTGTCAGTTTCTAATTATGTTACTGATTCATGCTATGAAATGCATGAAATTAGGCATTTATTTTAACACTTTTAATGTGAAAAATGAACTCTTGCATGATTTTTATCCTAAATTTAATCTTAATATACTTAAATGAGCTTAACGATGATTAATTATGTGTAAAGGATGATTTTTGCGGATTTAGTGCAGATCTGGTACGTTTTTGACAGGTTTCTGGCTAATTTTCATGTGATGCGCCCACAACAGCAAGTGATGTACCAGCGCTGTCGAGCCCTAATTTTCCAGATCCGATTCTGCCCGAATCAGCCGCGATTTTCTTGGCTAAAAATTCTCGATTCTGCTTGGTGGATCCTCATAACGCAAATCTCGGTCCTCCTTAACCAATTTGAGATCTATAAAAGGCAAAGAAACCCTACGTCTTGAGAGAGAACTCACCGTCGCCGCAATCATCACTTTTCTTCTCCATTCGACTGTCAAATTTCCAGCACCTTAGCATTCACTTTGAAGTTCAAGCCAGTAGTCTTAAGAACGAAAGTTCCTCTAAGGCGTAGCGGTTCTAGGATTACTCTTCCACAGAAGTATGCGTTGACGCAAGATTCTTTCTTGAAAAAGAAGGAATCGCCCTAGGGAAAGCCTTGTACTTGAGGATTCTCCCAAGTTTACTTGAGTTGTCTCTATTTTTCCAGCTTTATTATTTTTGTGTTATTTTTCATTCTACATTCTACCAATCAAACGTTATATTGTAGCTATGGTTTATGATTTAATAAGAATGATTATTTTATCAAAAGTCATGAGCTAAATATTTTTAGTGGTTTAACAATGTGAAAGTCTTAGGGTTGTTATGGCTTAGGTTATGTAATGCTCACACCACTTTGTGTAAGCACATTCTCTTTGTTGATTTTAAAAGATGAAATTGGTAAGTTAAACTAGCCATTTGATTTAACGATCTAGCGGAGCTTTAATACTGAGAAGGTTAAGGTATAAGCGGATT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ATGACAGAGTTTCATCCCGCCACTTTTGCAATTCTTGAATCAGGGTTGCATGCCAAGAACATTCAGCTATTGTTAATGGAAGAGGGGATCACTCCAACCGCTAATAACAATGAACAGATGAACGATACAATTGATGATACACAGGACGATCCCCTAGATGATATAATCAATGAAATATTCGACGATGCACAGGGCGATCATTTGGATGATATAGTGAATGATGCTCATGATAGTGATGGTTTTATGACAACACAAATGGAAAAAGAACTAGTGGACCTTAGAATGCATGAGATCACTCGTATATGCAGTGAAGGTCATAGGAGGGTGATTAAATACAATGAGCATGGTCAGCCAGGTGGATTTGTTGTTGATCCTAGATCAAAGAAGAACCTCATGCAAAATGCTGAAAAACTAAAATGTCCTCCAATTGAGTATTCCCATATTGAACAAGAACATTGGAACCCGTTCAATAATTTAAATTTGACAATTTCTTATATCATTTTATTAAAACTGTCAGTAATAAGAATCGAGAGAAGAGGAGAAAATATATGTATAATCATAGAAAGTCATGATAGGAATATGTATGATGTTCTGAAATGGGTGCAGAAAGAGTCGTCACCAAATGAAGATCTGATTGAGCAATGCATTTTATTGAAAAGGGGTCATGATGACATGTTAGTCACTCAGAAGGTCAAAGGTGATAACGCATCTATGAGTGGAGATATCCTATCACAAGCGTTAGGTACCAACAATCCTTCAGGGGTAGTTAGAGGAATGGGTAAATTTATCACACCCACGAAATATTTTTATACCCCAAAACAATGTGGAAGAAAAGGTCAAGATGGTTACACTTATCAAAAGGCCAGAAGAAGAATTGATAAAGCAAAAGAAGATTTCACGAGGTTGAAAAAATGA MTEFHPATFAILESGLHAKNIQLLLMEEGITPTANNNEQMNDTIDDTQDDPLDDIINEIFDDAQGDHLDDIVNDAHDSDGFMTTQMEKELVDLRMHEITRICSEGHRRVIKYNEHGQPGGFVVDPRSKKNLMQNAEKLKCPPIEYSHIEQEHWNPFNNLNLTISYIILLKLSVIRIERRGENICIIIESHDRNMYDVLKWVQKESSPNEDLIEQCILLKRGHDDMLVTQKVKGDNASMSGDILSQALGTNNPSGVVRGMGKFITPTKYFYTPKQCGRKGQDGYTYQKARRRIDKAKEDFTRLKK
BLAST of Lsi11G010500 vs. TrEMBL
Match: W9RSV2_9ROSA (Uncharacterized protein OS=Morus notabilis GN=L484_001825 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 1.4e-06 Identity = 62/226 (27.43%), Postives = 99/226 (43.81%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi11G010500 vs. NCBI nr
Match: gi|703120396|ref|XP_010102092.1| (hypothetical protein L484_001825 [Morus notabilis]) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 2.1e-06 Identity = 62/226 (27.43%), Postives = 99/226 (43.81%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Lagenaria siceraria
Date Performed: 2017-09-18
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |