Lsi11G008710 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi11G008710
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionUnknown protein
Locationchr11 : 11255905 .. 11266396 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
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TATAAAGAAAAAAACGGTTATTATTGTTTTGGCCTATAAAAACAGAGTGTGAAGCACAAAATAATGCTACCTTTCTTCTCTCTTCATTAGCAACACCTTCAAACCACCGCCGTCGCCGTCGCCATGATCCCCGGCAAGGATGTTGTCGACATTCTCGGTGCAATCGTTCCAATGTACTTCCCGCTAATAATCGCCTACATTAGTGTACGGTGGTTCAATCTCTTTACCGCTGAGCAATCCGTCGGAATAAACCGCTTCGTCAGACTTTTAGCCATTCCATTCCTCTGCTTCCAAGTAATCTCCACTAACAATCTCTTCGCCATTAATCTCAAACTCTTCCTTGCCGATTCGCTTCAGAAGCTTCTCTTCCTTGCCGCTCTGTTTCTTTGGAAATTTCTCTGTAAAAACGCCTCTCTTGATTGGGTGATCACTCTGTTCTCTCTGTCTTGTCTTCCGAATACCCTCATCATCGGCCTTCCGATGACGACGGCGATGTACGGCGAAGCATCGGTTAGTTTCATGATTCAGACTGTGGTTTTTCAGAGCGCAATTTGGGTGAATGTATTGATTTTTCTGTTCGAGTATAGAGCTGCAAGAATGGTTTTCACGGCGGAGAATTCAAAATTTTCGACAAAAGAAATACATTCGGAGAAAATAGAGGTGAGTGTTGTGTGTGTTGATGGTGATGGTGATAGTAATGAAGGTTTTCCGGCGAAAGATATACGTTCGACGGACAACGGCGGTGGTTCTAGACATTTTGGGTTTATTATGGAGGCTGAGAAGAAAGATGAGCTCCGATTGGAGGATACGTCTTCTTCCAAAGGTAATTAATTTTTAATCCTTTTATTTGCGTGTATATTTATCTATTTGACTTAATTACATATTAAAAAGACATATGGAAGTTTCATCATTTATTTAAGTGGAATTTTTAAAAATAGAAAAATAAGAGAAACTATTTATACAAAATAGTAAAATTTTTAGATATTTGCGATAGACGCTGATAAAAGTCTATTAGAATCTATCAGTAATAGAAATGATAGAAGTCTGATAGATGCTGATAGAAGTCTATAAATGTCTATCAGTATTCTTTTGCTATTTTCTGTAAATAATTTGACATTTTTTTTATCTGTGAAAATTTCCCTTTATTTTAAAATTTAAAATTTCGAAATTTTTTATTGGATATTGTCTAGTTAAAATGTTAAAAAAAAAAAATCATTTATAAAAAACAAAACAAGACAAAAGAAAAAAAAGAATATCCTTCCAAAAATAAATTATTATTTATTGAGAAATATTTAGGTATTGTTTGCATCTATATTTCTACCGCTTAGGCAGTTGTCTAATAAAAAATTGACATGCGATATATATTTTTTTTGAATGACTTTTTAAATTTTTTCTTTGTGTGAATTTTGATAGCCTATATATTTTGATCTTCACTAAACAATAATTTAATAACATATGAACTTTACATTAACAATTTGAACTTTTATCATTGACAAACGTAATTGAGAAGAAGAAAAATGGTATATTTTTTAAAATATTTGATTTTTCTCCCCTTGGCTTCCAATAGTATTTAATCTTTTAATTCTTTTTTTTTTTCTAATTTTGGTATCTTAATTTTCAAAATATTTGTTTTCGTTTTAAAATTTTTGAAATATATATTTTTATTTTTGATCTTATCGACTTTGAGTATATGTGTTAATCTAATGATAAGAGCATCGATGTCAATCACGTAGGTTGTACAGAGACATGAATTAGGTGATAAATGAATAGCAATAAATTGATTGGCATCATGAGCTAAAATAAAATAAAAATATTAAATTATTTTAAAGAAAAAATTGGTTGACTAAAATAGTCATTTTTAAAATTATAAGTGAATAAATCTAAAATGTTTACACGAAAATAGGTCTAGGGATTAAATTTTGAAATTGATGTAATTTTTAAAATAATAGATATTAATAGTTGTGCTTTTAGAAAAATCAGTTGTGACCGAATAATGTTCGATAAATTTTAATTTTAAACATTAATATAGATGTTTGGTAAATTAGTACTAATTTTTTATGATTTACTTATAATGACCCAAGTACACATACTATTTCATTTATTTCTATATTAACATTTAATATCATTAGTTTTTTTAAATGAATATTTAATATCAAATTTATTATAAGATAGTTATTTAAAAGTTTTATATGTTTCAAAGGATATACAAGGTCTGATAACTCATTTCGGTGCAATATCACCTATATCTTTGGGATAGTATGCCCGAGAAAAAAGATAATTTCACTAAAGAATAGTTAAGCGGTTACAACGTTGACTTATCTGTAAATACAAGACTTCTACAGTGACAAATGAACAACCTAACTTAGTGAAATAATAGTTAGGCTCGCTCTAAAGTGTGAGACTCCCTCTCAATGATAGCTTCGATTTTTCTCTTTGTCAAATGAAGATCACTTCAATCAAGAAACTTATGCTACCCCAAGTATGAGAATCCCTTCTCATGTGTAAGACATGCTTCAAGATAATCAAGATCTACAAAACTTTCACTCCCCAATCACTTAGATTGACACAATTGTTGTTTTTCGGCTAAACTCAGTAAAGACACAAATAATCTTCAATAGTGAATCCAAAATAACAAACCCTTAAATATATGTATCAAAAGGAAGGCATTAGACCATTACCATAACTAGTCGAGATTTAGAGGACAGAAAATATCCTTCAAAATGAACACACAAATTTTTTTAAAAAAAAGAAATAATTCAAATACACTATGTAAGACATTCCGTAGAATATCATGACAAGGGACAATTTAAATGAAAAAGTTACCAACATCCACGAACCACACCAAAAAAATATAGCCAACACTACAACACTAACAAAAGGCAATAAGTTGTTAAAATCAAAATTATTTTGTAAAATAAAAAAATTAAATAGATATATATAGATGAATTACATGTGTAATTTAATTATTAATTTTTGTAACAATTTTTTCTTTAAAGTTATGTTAAAAGTAATTGTTTGCTTGTGCAGGATCATCAAGTGGAATGACAAAATTTGTACTTTATATGTTGTGGAAGAAGATTAGACAAAATCCCATTGCTTATTCGAGTTTACTTGGCATCATTTGGTCTCTCATATCATTCAAGTATATATCCTTATTTTCATTTATATTTTTCAATACTTCCAACCCTTTCTAATTTCATTTTGCATCATTTATTTATTTATTTATTATGTTTATCTTAATTAATTCTCAAATATCTTCAAATAGGTTACAATTATATAGTTTTCATTCTAACACTCATATCAATTTTTCTAACTAAATTCTTATTCTCTTAAGATCCTCTTTGATCATGTTTGATAATTATTTCATTTTTCATTTTTCTTTTATAAAATTGTGCTTATTTTTCTTACACCTTTTTTTATTATACTTCTCATCTTTCTTAACTAAACATATTTGAATTCTTAACAAAATTCTAAAAAATAAAAAATAATTTTTAAGAATTACATTTTTTAGTTTTCAAAGTTTGTTTTTTTAGAACAAAATAAATAAAACAATAGGTAGAAGTAGTATTTATAAGCTTAATTTTAAATAACAACAAATTGTAAGTATCAAACAAGCCTTCATTTTTTTGTTTTCTATTTTTGAAATTTGTGTTTGTTTCCCTTTGCAAATATTCTTTAATATGACTTTCACCTCTGGATTCTTAATCAAAGTCATAAAACAAAAGCTACTTTTTTTTTTTCCTTCTAAAACTTGGTTTTGATCTTGAAAAATATGTTTGAATACTCGTAGGATATATATAAGAAACCAAATCACGAGTGGAAATAATATTTATAATTTTTTATAAAAAAACTACCAAATGGTTAATTATCAAACATGATCTAAATCTTTACCAATTTTAATTTTCATGATCTAAACAATTTATGACCGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGTAAATGTGAAGGTGAGAAATCAAACCTTCAAATTTAAAAAGATAATACATAAAATGTTCTATCAATATCGGTGGCAAATTTGACTTTTATTTTAGGAAAATTTTTACAAATAGAAATATGTCAAACTATTTACATAAAATAGTAAAAAAAACACTGATAGACATTGATAGACTTCTATCAGCATCTATCAGTGATAAATTTCTATCATTTCTATCACTGATAGACCCTGATAGACTTCTATCAGCGTCTATCACAACTATCTAAAAATTTTGCTATTTTGTGTAAATAATTTACCTTATTTTTCTATTTTTAAAAATTTTCCTTTATTTTAGCAATTCATATAGGATGGATACTTTTTGGGGCTAGGTAAGTTCTTAGGGGTTAGTTTATTTGATCAAACTAAAATAGGATATTTCTAGCCAAAATAATCAAATGTCATATATCATCATTTTGTCAATAAATTTTAATATTCAACAACAAAAAAAAAATAGTTTTTAAAAACTTATTTGTGGTTTTGGAATTTGACTAAGAATTAAACTCTTATACTAAAGAAAGATGCAAACCATTGTAAGAAAATGGTAAGAAATAGACTTAATTTTTAAAAACCAAAAACAAAAAATGAAGACTCCCATTTGGAAACCATTTCGTTTTTGGTTTCTTATTTTTAAAAATTGTCTATTTCCTTATATTTTCTTATAATGGTTTGCATCTTTCTTGAGTACAAGAGTTCAATTCTTAGTCAAATTCTAAAAATAAAAACAAATTTTAAAAAGCTACTTTTTTTTAGTTTTCAAAATTTGGCTTAGTTTTTAAAAATATGGATAAAAAGTATATTAGAGAACAAGAAATTTACGGGTGAGAAGTGTTTGTAGGCTTAGTTTTCAAAAACTAAAAACCAAAGACCAAATAACTATCCAACGTCCTAAAGAAAGTAGTTTTTAAGTTAAATATACACATAATGGAAGAAAAAGAAAAGATCACACATTAATGAGTTTTTTTTAACAACATTTCCATGATTTGAGCATATATATATATATATATACAC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mRNA sequence

TATAAAGAAAAAAACGGTTATTATTGTTTTGGCCTATAAAAACAGAGTGTGAAGCACAAAATAATGCTACCTTTCTTCTCTCTTCATTAGCAACACCTTCAAACCACCGCCGTCGCCGTCGCCATGATCCCCGGCAAGGATGTTGTCGACATTCTCGGTGCAATCGTTCCAATGTACTTCCCGCTAATAATCGCCTACATTAGTGTACGGTGGTTCAATCTCTTTACCGCTGAGCAATCCGTCGGAATAAACCGCTTCGTCAGACTTTTAGCCATTCCATTCCTCTGCTTCCAAGTAATCTCCACTAACAATCTCTTCGCCATTAATCTCAAACTCTTCCTTGCCGATTCGCTTCAGAAGCTTCTCTTCCTTGCCGCTCTGTTTCTTTGGAAATTTCTCTGTAAAAACGCCTCTCTTGATTGGGTGATCACTCTGTTCTCTCTGTCTTGTCTTCCGAATACCCTCATCATCGGCCTTCCGATGACGACGGCGATGTACGGCGAAGCATCGGTTAGTTTCATGATTCAGACTGTGGTTTTTCAGAGCGCAATTTGGGTGAATGTATTGATTTTTCTGTTCGAGTATAGAGCTGCAAGAATGGTTTTCACGGCGGAGAATTCAAAATTTTCGACAAAAGAAATACATTCGGAGAAAATAGAGGTGAGTGTTGTGTGTGTTGATGGTGATGGTGATAGTAATGAAGGTTTTCCGGCGAAAGATATACGTTCGACGGACAACGGCGGTGGTTCTAGACATTTTGGGTTTATTATGGAGGCTGAGAAGAAAGATGAGCTCCGATTGGAGGATACGTCTTCTTCCAAAGGATCATCAAGTGGAATGACAAAATTTGTACTTTATATGTTGTGGAAGAAGATTAGACAAAATCCCATTGCTTATTCGAGTTTACTTGGCATCATTTGGTCTCTCATATCATTCAAGTATGACATAAAATTGCCAACATTGTTGCAAAGATGTGTATTAACATTCTCAAACACAGGCCAAGCTCTCTCCTTGTTCAGTTTGGGCATTTTCATGGCAGCACAACCAAACGTCATCGCTTGTTCGATATCGGAGGCTGCCTCTGCCATGCTCGTTCGGTTCCTCATCAGTCCCTTGCTCATAACTATCATTTCCAAGCTCGTCAACCTTCATGGGATTGCATTGCATACGGCTATCATTCAGGCTGCTTTTCCTCAAGGAATTGTTTCATTTGTATTGGCTAAGGAATACAATGTTCATCCAAACGTAATCAGTACATCGGTAGTTTTTGGAATGTTGATTGCCTTCCCAATACTTCTGAGTTATTATCTGCTTCTGGGGGCCATTTTTAAATAAAGCAAACTGGAAGTCCTGAAGAGTAAAAAGTTGAAATTTTGGGGTTGCAGATAGAAAGCAC

Coding sequence (CDS)

ATGTGTATTAACATTCTCAAACACAGGCCAAGCTCTCTCCTTGTTCAGTTTGGGCATTTTCATGGCAGCACAACCAAACGTCATCGCTTGTTCGATATCGGAGGCTGCCTCTGCCATGCTCGTTCGGTTCCTCATCAGTCCCTTGCTCATAACTATCATTTCCAAGCTCGTCAACCTTCATGGGATTGCATTGCATACGGCTATCATTCAGGCTGCTTTTCCTCAAGGAATTGTTTCATTTGTATTGGCTAA

Protein sequence

MCINILKHRPSSLLVQFGHFHGSTTKRHRLFDIGGCLCHARSVPHQSLAHNYHFQARQPSWDCIAYGYHSGCFSSRNCFICIG
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi11G008710.1Lsi11G008710.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None