Lsi11G001180 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) | Cucurbit Genomics Database (CuGenDB)

Overview


Name	Lsi11G001180
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
Description	Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3
Location	chr11 : 1276048 .. 1341326 (-)

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Gene Expression

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

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mRNA sequence

CTTCTCGGCAACCTGAACGGACGAGAGAAGTGTTGCCAAGAACGGACGAGAGAAGTGTGTTGGTGTAGGAGAGCTAATACGGACTCTGGAGCTTTCTAGTGGGGGCATCACGAACAAGTCGACCTCCATGGCTGCCAAGGCCGCCCCTCTTGGTTTACCGAAGTCCGGTGCAATTTCCAAGGGCTACAATTTTGCTTCTACCTGGGAACAGAATGCTCCTCTAACGGAGCAACAGCAAGCAGCTATTGCGACACTCTGTCATGCCGTTGCTGAGCGACCTTTTCCCGTTGATTTGGCACAAGACAGTATAGGAGGTAAAGAAAATGCTTTGTCTATTTCGGTTGAGGATACCACCAACGAAGATTCTGATGCTATTGAAGCCGTTTTGGTCAACACCAATCAGTTCTACAAATGGTTTTCTGATCTTGAATCAGCCATGAAATCTGAGACAGAGGAGAAATACCACCATTACTTGAATTCTTTAACAGATCGCATAAGAACGTGTGATGTTATACTTCGTCAGGTAGATGATACGTTGGACTTATTTAACGAACTTCAATTGCAACATCAGGCTGTGGCAACAAAGACTAGAACACTTCATGATGCATGTGATAGACTGGTAATGGAGAAGCAAAGGCTAATTGAATTTGCCGAAGCACTTCGCAATAAGCTAAACTACTTTGATGAGTTGGAGAATATTACTGCCATCTTTTATTCCCCAAACATGAATGTTGGAAATGAGAACTTTCTTCCCATGCTGAAAAGACTGGATGATTGCATATTATTTTCTGAAAGCAATCCCCAATATGCTGAATCCAGCGTTTATTTGCTCAAATTTCGACAACTACAGTCTCGGGCACTTGGTATGATTCGGTTTCATGTTGTTTCTGTTCTCAAAAGTGCTTCTTCTCAGGTTCAGGCAGCTATGCGTAGTAGTAGTGGCAGCAATTCTGCTGTTTCCGAGGGTGTAGAAGCATCTTTTATCTATGTGCGATTTGAGGCAGCTGCAGATGAGCTCAAACCTGTGCTGGAAGAAATTGAGAGCAGATCAACAAGGAAAGAATATACTGAGATCCTTGCGGAATGCCATAGACTGTACTGTGAGCAACGACTCTCCCTGATAAAAAATATAGTGCATCAACGAATATCTGAGTTTTCCAAGAAGGAGGCTCTCCCATCATTGACTAGATCTGGATGTGGATATCTGATGCAGGCGTGTCAGCTTGAGCACCGACTCTTTCATCATTTCTTTCCATCTTCCTCGGACAATGTTTCGAGTTTGGCACCTTTAATAGATCCATTGTCTACTTACCTGTATGATACATTGCGTCCTAGACTTGTTCATGAAACAAGTTTGGACTTTTTGTGTGAACTAGTCGATATTCTTAAAGTTGAAGTTTTGGGAGAGCAACTTATTCAACAGGGGGAGTCGTTAGTTGGATTACGTCCCACCCTTCAAAGGATTCTAGCTGATGTTCATGAACGACTAACATTTCGTGCTCGAACACACATTCGTGATGAGATTGCAAATTATTTTCCTTCCGATGAAGACTTGGAGTATCCAGAAAAGCTTGAGAAAACTGCAGTGGAAATGACAGAAAACACTTCTGTTGGCATGAATCAAGGTGCACCTAAGGCTTGGTATCCACCTTTAGAGAAAACTTTATCATACCTTTCAAAGTTGTATCGTTGTCTAGAACCAGTTGTATTCACCGGTTTAGCCCAGGAAGCTGTGGAAGTTTGTTCTACATCTATTCAAAAAGCAAGTAAACTTATTGCAAAAAGGTCGTCACCTATGGATGGACAACTTTTCTTGATAAAGCACTTCCTCATTCTAAGGGAGCAGATCGCGAGTTTTGATGTAGAATTTTCAGCAACTCACAAGGAACTCGATTTCTCTCATGTCCTGGTTGATACAGAGGAGAAGGTTTCCTTAGAGGAAGAAGGATTTCTAAAGGTCTTTGCTTCAGATAATGTGAAAACAAGTTGTCGGGGTAAAGTCAAAACAGTGTCGACAGTTTTATGGATTGAGAGAAACCAAAGGGGCTTATTTCCCTGGTTAGTTAGATTGGAGATGGTTGTTGTTGCTGTTTTTGTTCGCTTTGCTACACATTTCTTCCCCATTGTATTCGAGGAGCATCTTAGAAGGATTCTTAGAGGCCAAGCCTCTCTGTTTGACTGGACTAAATCAACTTCATTGGCAAGGACGTTATCCCCCCGAGTTTTGGAGAGTCAAATTGATGCCAAGAAGGATCTGGAGAAGAACTTGAAAGCAACTTGTGAAGAGTTTATTATGTCTGTCACTAAGCTGGTTGTGGATCCCATGCTCTCATTCGTGACTAAGGTGACTGCTGTCAAAGTGGCATTATCTTCAGGCAATCAGAACCAAAAGTTAGAACCGGTCTTGGAGAAACCACTAAGGGATCAGGCTTTTGCCACTCCAGATAAGGTGGCCGAATTAGTTCAAAAGGTTAATAATGCTATTCAGCAACAGTTGCCTATGGTTATGGAAAAAATGAAGCTTTATCTGCAGAACCCTACCACAAGGATGATTCTTTTCAATCCTATAAAAGTCAACATTGTGGAAGCTCATTTACAAGTACAAAATCTGCTAAAGGCAGAGTACTCTTCTGAAGCAATCAATATCACTCCGATACAAGTTTTGCAAACTCAACTTGATAATCTCCTGTAGATTGTTGCTGGCCAAGTTTTGTTCTATCACGAACAGTGGCATCCATCCGCAGAGTTCTTCACAAATGTTTTTTCTTTGTGTGAAGGTGTAGTTTTATTTGGAGGCAAACAGGGTTTTGTAATTCTATGTCTAGCCTTCATGATCTTATATTTTCTTTAACATATCTGATTAACTTACAGTTGCACTTGTTGCCTTTTCTTTTTTGAAATATTGATTGGGAAGTCAAAATGTCATTTTCTCATCATATTTACAGAAATAACTTGATTACAAATATTTACTCGAGCATAATTGGTTGTTATTTATCCGTCACAGTACAGTTTGCTAATTGTTG

Coding sequence (CDS)

ATGGCTGCCAAGGCCGCCCCTCTTGGTTTACCGAAGTCCGGTGCAATTTCCAAGGGCTACAATTTTGCTTCTACCTGGGAACAGAATGCTCCTCTAACGGAGCAACAGCAAGCAGCTATTGCGACACTCTGTCATGCCGTTGCTGAGCGACCTTTTCCCGTTGATTTGGCACAAGACAGTATAGGAGGTAAAGAAAATGCTTTGTCTATTTCGGTTGAGGATACCACCAACGAAGATTCTGATGCTATTGAAGCCGTTTTGGTCAACACCAATCAGTTCTACAAATGGTTTTCTGATCTTGAATCAGCCATGAAATCTGAGACAGAGGAGAAATACCACCATTACTTGAATTCTTTAACAGATCGCATAAGAACGTGTGATGTTATACTTCGTCAGGTAGATGATACGTTGGACTTATTTAACGAACTTCAATTGCAACATCAGGCTGTGGCAACAAAGACTAGAACACTTCATGATGCATGTGATAGACTGGTAATGGAGAAGCAAAGGCTAATTGAATTTGCCGAAGCACTTCGCAATAAGCTAAACTACTTTGATGAGTTGGAGAATATTACTGCCATCTTTTATTCCCCAAACATGAATGTTGGAAATGAGAACTTTCTTCCCATGCTGAAAAGACTGGATGATTGCATATTATTTTCTGAAAGCAATCCCCAATATGCTGAATCCAGCGTTTATTTGCTCAAATTTCGACAACTACAGTCTCGGGCACTTGGTATGATTCGGTTTCATGTTGTTTCTGTTCTCAAAAGTGCTTCTTCTCAGGTTCAGGCAGCTATGCGTAGTAGTAGTGGCAGCAATTCTGCTGTTTCCGAGGGTGTAGAAGCATCTTTTATCTATGTGCGATTTGAGGCAGCTGCAGATGAGCTCAAACCTGTGCTGGAAGAAATTGAGAGCAGATCAACAAGGAAAGAATATACTGAGATCCTTGCGGAATGCCATAGACTGTACTGTGAGCAACGACTCTCCCTGATAAAAAATATAGTGCATCAACGAATATCTGAGTTTTCCAAGAAGGAGGCTCTCCCATCATTGACTAGATCTGGATGTGGATATCTGATGCAGGCGTGTCAGCTTGAGCACCGACTCTTTCATCATTTCTTTCCATCTTCCTCGGACAATGTTTCGAGTTTGGCACCTTTAATAGATCCATTGTCTACTTACCTGTATGATACATTGCGTCCTAGACTTGTTCATGAAACAAGTTTGGACTTTTTGTGTGAACTAGTCGATATTCTTAAAGTTGAAGTTTTGGGAGAGCAACTTATTCAACAGGGGGAGTCGTTAGTTGGATTACGTCCCACCCTTCAAAGGATTCTAGCTGATGTTCATGAACGACTAACATTTCGTGCTCGAACACACATTCGTGATGAGATTGCAAATTATTTTCCTTCCGATGAAGACTTGGAGTATCCAGAAAAGCTTGAGAAAACTGCAGTGGAAATGACAGAAAACACTTCTGTTGGCATGAATCAAGGTGCACCTAAGGCTTGGTATCCACCTTTAGAGAAAACTTTATCATACCTTTCAAAGTTGTATCGTTGTCTAGAACCAGTTGTATTCACCGGTTTAGCCCAGGAAGCTGTGGAAGTTTGTTCTACATCTATTCAAAAAGCAAGTAAACTTATTGCAAAAAGGTCGTCACCTATGGATGGACAACTTTTCTTGATAAAGCACTTCCTCATTCTAAGGGAGCAGATCGCGAGTTTTGATGTAGAATTTTCAGCAACTCACAAGGAACTCGATTTCTCTCATGTCCTGGTTGATACAGAGGAGAAGGTTTCCTTAGAGGAAGAAGGATTTCTAAAGGTCTTTGCTTCAGATAATGTGAAAACAAGTTGTCGGGGTAAAGTCAAAACAGTGTCGACAGTTTTATGGATTGAGAGAAACCAAAGGGGCTTATTTCCCTGGTTAGTTAGATTGGAGATGGTTGTTGTTGCTGTTTTTGTTCGCTTTGCTACACATTTCTTCCCCATTGTATTCGAGGAGCATCTTAGAAGGATTCTTAGAGGCCAAGCCTCTCTGTTTGACTGGACTAAATCAACTTCATTGGCAAGGACGTTATCCCCCCGAGTTTTGGAGAGTCAAATTGATGCCAAGAAGGATCTGGAGAAGAACTTGAAAGCAACTTGTGAAGAGTTTATTATGTCTGTCACTAAGCTGGTTGTGGATCCCATGCTCTCATTCGTGACTAAGGTGACTGCTGTCAAAGTGGCATTATCTTCAGGCAATCAGAACCAAAAGTTAGAACCGGTCTTGGAGAAACCACTAAGGGATCAGGCTTTTGCCACTCCAGATAAGGTGGCCGAATTAGTTCAAAAGGTTAATAATGCTATTCAGCAACAGTTGCCTATGGTTATGGAAAAAATGAAGCTTTATCTGCAGAACCCTACCACAAGGATGATTCTTTTCAATCCTATAAAAGTCAACATTGTGGAAGCTCATTTACAAGTACAAAATCTGCTAAAGGCAGAGTACTCTTCTGAAGCAATCAATATCACTCCGATACAAGTTTTGCAAACTCAACTTGATAATCTCCTGTAG

Protein sequence

MAAKAAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQDSIGGKENALSISVEDTTNEDSDAIEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLTDRIRTCDVILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRNKLNYFDELENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQLQSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPVLEEIESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYLMQACQLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDILKVEVLGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPEKLEKTAVEMTENTSVGMNQGAPKAWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCSTSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVLVDTEEKVSLEEEGFLKVFASDNVKTSCRGKVKTVSTVLWIERNQRGLFPWLVRLEMVVVAVFVRFATHFFPIVFEEHLRRILRGQASLFDWTKSTSLARTLSPRVLESQIDAKKDLEKNLKATCEEFIMSVTKLVVDPMLSFVTKVTAVKVALSSGNQNQKLEPVLEKPLRDQAFATPDKVAELVQKVNNAIQQQLPMVMEKMKLYLQNPTTRMILFNPIKVNIVEAHLQVQNLLKAEYSSEAINITPIQVLQTQLDNLL

Homology

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. Swiss-Prot
Match: COG3_HUMAN (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Homo sapiens GN=COG3 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 329.7 bits (844), Expect = 9.4e-89
Identity = 214/646 (33.13%), Postives = 339/646 (52.48%), Query Frame = 1


Query: 3   AKAAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQN----APLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLA- 62
           A+AA L LP++ A        + W++     APLT++Q  ++  L  A    P P +L  
Sbjct: 2   AEAALLLLPEAAAERDAREKLALWDRRPDTTAPLTDRQTDSVLELKAAAENLPVPAELPI 61

Query: 63  QDSIGGKENALSISVEDTTNEDSDAI-----------EAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKS 122
           +D       +L I +     E ++ I           E  +    QF+ WF+ L++ M  
Sbjct: 62  EDLCSLTSQSLPIELTSVVPESTEDILLKGFTSLGMEEERIETAQQFFSWFAKLQTQMDQ 121

Query: 123 ETEEKYHHYLNSLTDRIRTCDVILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVM 182
           +   KY    + L+     CD IL  V+  L     LQ Q+  V+ KT TLH+AC++L+ 
Sbjct: 122 DEGTKYRQMRDYLSGFQEQCDAILNDVNSALQHLESLQKQYLFVSNKTGTLHEACEQLLK 181

Query: 183 EKQRLIEFAEALRNKLNYFDELENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQ 242
           E+  L++ AE ++ KL+YF+ELE I     SP ++V ++ F+PML +LDDCI +  S+P 
Sbjct: 182 EQSELVDLAENIQQKLSYFNELETINTKLNSPTLSVNSDGFIPMLAKLDDCITYISSHPN 241

Query: 243 YAESSVYLLKFRQLQSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSS-SGSNSAVSEGVEASF 302
           + +  +YLLKF+Q  S+AL +++ + V+ L++ +SQ+     SS   +++A +       
Sbjct: 242 FKDYPIYLLKFKQCLSKALHLMKTYTVNTLQTLTSQLLKRDPSSVPNADNAFT------L 301

Query: 303 IYVRFEAAADELKPVLEEIESRSTR-KEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFS 362
            YV+F AAA +++ ++E+IE RS +  EY ++L + H+ Y +QR  L+   +   ++E +
Sbjct: 302 FYVKFRAAAPKVRTLIEQIELRSEKIPEYQQLLNDIHQCYLDQRELLLGPSIACTVAELT 361

Query: 363 KKEALP--SLTRSGCGYLMQACQLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRP 422
            +      +L RSGC +++  CQ EH+L++ FF   +   S L  L++ L   LYD  RP
Sbjct: 362 SQNNRDHCALVRSGCAFMVHVCQDEHQLYNEFFTKPT---SKLDELLEKLCVSLYDVFRP 421

Query: 423 RLVHETSLDFLCELVDILKVEVLGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHI 482
            ++H   L+ L EL  ILK EVL + +    E L      ++++L DV ERL +R   +I
Sbjct: 422 LIIHVIHLETLSELCGILKNEVLEDHVQNNAEQLGAFAAGVKQMLEDVQERLVYRTHIYI 481

Query: 483 RDEIANYFPSDEDLEYPEKL-------------EKTAVEMTENTSVGMNQGAPKA----- 542
           + +I  Y P+  DL YP+KL             +K        + V + +G   +     
Sbjct: 482 QTDITGYKPAPGDLAYPDKLVMMEQIAQSLKDEQKKVPSEASFSDVHLEEGESNSLTKSG 541

Query: 543 ---------------------WYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCSTSI 590
                                WYP + +TL  LSKLYRC++  VF GL+QEA+  C  S+
Sbjct: 542 STESLNPRPQTTISPADLHGMWYPTVRRTLVCLSKLYRCIDRAVFQGLSQEALSACIQSL 601

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. Swiss-Prot
Match: COG3_MOUSE (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Mus musculus GN=Cog3 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 325.1 bits (832), Expect = 2.3e-87
Identity = 210/615 (34.15%), Postives = 327/615 (53.17%), Query Frame = 1


Query: 30  APLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQDSIGGKENA-----LSISVEDTTNE------ 89
           APLT++Q  ++  L  AV   P P +L  + +    +      L+  V D+T +      
Sbjct: 25  APLTDRQTDSVLELKAAVENLPVPAELPIEDVCSLASQSLPIELTAVVPDSTEDILLKGF 84

Query: 90  DSDAIEAVLVNT-NQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLTDRIRTCDVILRQVDDTL 149
            S  +E   + T  QF+ WF+ L++ M  +   KY    + L+     CD IL  V+  L
Sbjct: 85  TSLGMEEERIETAQQFFSWFAKLQTQMDQDEGTKYRQMRDYLSGFQEQCDAILNDVNSAL 144

Query: 150 DLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRNKLNYFDELENITAIFYS 209
                LQ Q+  V+ KT TLH+AC++L+ E+  L + AE ++ KL+YF+ELE I     S
Sbjct: 145 QHLESLQKQYLFVSNKTGTLHEACEQLLKEQSELADLAEHIQQKLSYFNELETINTKLNS 204

Query: 210 PNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQLQSRALGMIRFHVVSVLK 269
           P ++V +E F+PML +LDDCI +  S+P + +  VYLLKF+Q  S+AL +++ + V+ L+
Sbjct: 205 PTLSVNSEGFIPMLAKLDDCITYISSHPNFKDYPVYLLKFKQCLSKALHLMKTYTVNTLQ 264

Query: 270 SASSQVQAAMRSS-SGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPVLEEIESRSTR-KEYTE 329
           + ++Q+     SS   +++A +        YV+F AAA +++ ++E+IE RS +  EY  
Sbjct: 265 TLTNQLLKRDPSSVPNADNAFT------LFYVKFRAAAPKVRTLIEQIEQRSEKIPEYQH 324

Query: 330 ILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALP--SLTRSGCGYLMQACQLEHRLFHH 389
           +L + H+ Y +QR  L+   +   ++E + +      +L RSGC +++  CQ EH+L++ 
Sbjct: 325 LLNDIHQCYLDQRELLLGPSIAYTVTELTSQNNRDHCALVRSGCAFMVHVCQDEHQLYNE 384

Query: 390 FFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDILKVEVLGEQLIQQG 449
           FF   +   S L  L++ L   LYD  RP ++H   L+ L EL  ILK EVL + +    
Sbjct: 385 FFTKPT---SKLDELLEKLCVSLYDVFRPLIIHVIHLETLSELCGILKNEVLEDHVQHNA 444

Query: 450 ESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPEKL----------- 509
           E L      ++++L DV ERL +R   +I+ +I  Y P+  DL YP+KL           
Sbjct: 445 EQLGAFAAGVKQMLEDVQERLVYRTHIYIQTDITGYKPAPGDLAYPDKLVMMEQIAQSLK 504

Query: 510 --EKTAVEMTENTSVGMNQGAPKA--------------------------WYPPLEKTLS 569
             +K A      + V + +G                              WYP + +TL 
Sbjct: 505 DEQKKAPSEASFSDVRLEEGEASGLRKSGSTDSLNPRPQTTISPADLHGMWYPTVRRTLV 564

Query: 570 YLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCSTSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQI 590
            LSKLYRC++  VF GL+QEA+  C  S+  AS+ I+K  + +DGQLFLIKH LILREQI
Sbjct: 565 CLSKLYRCIDRAVFQGLSQEALSACIQSLLGASESISKNKTQIDGQLFLIKHLLILREQI 624

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. Swiss-Prot
Match: COG3_AEDAE (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Aedes aegypti GN=Cog3 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 297.7 bits (761), Expect = 3.9e-79
Identity = 240/832 (28.85%), Postives = 420/832 (50.48%), Query Frame = 1


Query: 26  WEQN----APLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQDSIGGKENALSISVEDTTNEDSD 85
           WEQ     APL+  Q   I  L  ++     P   A   +  +E +L      TT  D  
Sbjct: 24  WEQKDNPLAPLSSAQNEFINRLADSLTGATSPG--ANPLMESQELSLECK---TTLVDFK 83

Query: 86  AIEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLTDRIRTCDVILRQVDDTLDLFN 145
              +V+ +T  F  W++ ++S +    ++ Y  Y   L  R   CD +L ++D +L+   
Sbjct: 84  NSGSVIDSTQDFLSWYNSIDSEILEHYDDVYLDYYGQLKQRSVECDKLLEEIDVSLESLQ 143

Query: 146 ELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRNKLNYFDELENITAIFYSPNMN 205
           +L  +++ V+ KT +LH A + L+ ++ +L E  E +R +L YF + E+I     +P  +
Sbjct: 144 KLTNEYKFVSEKTSSLHQASENLLQDQTKLNEIGEEIRRRLKYFSQAESIYQRLQNPTFS 203

Query: 206 VGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQLQSRALGMIRFHVVSVLKSASS 265
           V N+ F+ +L  +D+C+ +   NP ++E+  Y +K+R   S+A  M+R +V ++L +A++
Sbjct: 204 VSNDTFVEILNTIDECLEYMRVNPGFSEAFAYGVKYRNCLSKATQMMRNYVSNILTNATA 263

Query: 266 QVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFI--YVRFEAAADELKPVLEEIESRSTRK-EYTEILA 325
           Q+    RS +G    + +G EA+F   Y +F+A+A  +K +   IE R  R  EY ++LA
Sbjct: 264 QILGPQRSETG----MEQGSEAAFALYYGKFQASAPRVKRITGMIEGRLDRSVEYEQLLA 323

Query: 326 ECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALP--SLTRSGCGYLMQACQLEHRLFHHFFP 385
             H+ +   R +++ + V Q I + SKK      +L RS C +++  CQ EHRLF  FF 
Sbjct: 324 ALHQQFLANRATIMSSGVEQAIRDLSKKHKGDHCALVRSACAFMVHVCQDEHRLFFQFFT 383

Query: 386 SSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDILKVEVLGEQLIQQGESL 445
           +SS  +++    ++ L T LYDTLRP ++    L+ L E+  IL+VE+L E +    ESL
Sbjct: 384 NSSPQLTAY---MEGLCTILYDTLRPFIIRIDHLETLAEICSILRVEMLDEHVTYNPESL 443

Query: 446 VGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPEKLEKTAVEMTENTSVG 505
                 + ++L DV ER+ FRA+ ++  +I NY PS  DL YPEKLE     M E+ ++ 
Sbjct: 444 EAFAKIVYQLLQDVQERIGFRAQNYLESDILNYRPSAGDLAYPEKLE-----MMESIALS 503

Query: 506 MNQGAPKAWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCSTSIQKASKLIAKRSSP 565
           + +              +YL +       V  T LA + VE  +   ++ASK    R+S 
Sbjct: 504 LQE--------------NYLRRADSRSSIVSMTSLASQEVESINQQAEQASK---SRASN 563

Query: 566 MDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVLVDTEEKVSLEEEGFLKVFAS-D 625
               L  + +  + R  +       S  ++ +D +     +++ ++   +      A   
Sbjct: 564 SPADLHGMWYPTVRRTLVC-----LSRLYRCIDRAIFQSLSQQALAYCIQSVSNAAAQIS 623

Query: 626 NVKTSCRGKVKTVSTVLWIERNQRGLFPWLVRLEMVVVAVFVRFATHFFPIVFEEHLRRI 685
             KTS  G++  +  +L I R Q   F    R++  V    + F+       FE     +
Sbjct: 624 QKKTSIDGELFEIKHLL-ILREQIAPF----RVDFTVKETSLDFSK-VKTAAFE-----L 683

Query: 686 LRGQASLFDWTKSTSLARTL---SPRVLESQIDAKKDLEKNLKATCEEFIMSVTKLVVDP 745
           L+ +  LF    + +L   L   +P+V E  +D++KD+++ LK  CE FI   T+ +V P
Sbjct: 684 LQKRKQLFALGSNNALLEFLLDGTPQVKEQLLDSRKDVDRQLKMVCEMFIKDATRQLVGP 743

Query: 746 MLSFV-TKVTAVKVALSSGNQNQKLEPVLEK--PLRDQAFATPDKVAELVQKVNNAIQQQ 805
           +L+F+ T    VK + +SG+     +   ++   LR  AFA P +++ ++Q+    I+ +
Sbjct: 744 ILNFIDTAQNHVKQSAASGSSQPGAKQQQQQGLALRMAAFAAPQQISSIIQESIRNIKTK 803

Query: 806 LPMVMEKMKLYLQNPTTRMILFNPIKVNIVEAHLQVQNLLKA-EYSSEAINI 841
           L  +   M+LYL N  T  ILF PI+ NI+ + ++++ LL    YS + + +
Sbjct: 804 LGALQRSMQLYLANKDTEFILFRPIRNNIIGSFVKLEQLLTTNSYSKDDLTV 805

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. Swiss-Prot
Match: COG3_DROME (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Drosophila melanogaster GN=Cog3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 279.6 bits (714), Expect = 1.1e-73
Identity = 179/546 (32.78%), Postives = 298/546 (54.58%), Query Frame = 1


Query: 87  LVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLTDRIRTCDVILRQVDDTLDLFNELQLQ 146
           L NTN+F  WF+D+ + ++   +  YH YL  L  R   C  +L Q+   ++    L  +
Sbjct: 89  LQNTNEFLLWFADVSAEIEQRGDADYHKYLQQLEQRKAECSHMLDQIAGAMERLGALCDE 148

Query: 147 HQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRNKLNYFDELENITAIFYSPNMNVGNEN 206
           +  V+ KT  L+ A ++L+ E++RL E +  ++ +L+YF ++E +     SP ++V +E 
Sbjct: 149 YDFVSQKTSALNTASEQLIEEQERLQELSHEIQRRLHYFSQVELLNQRLQSPTLSVASEA 208

Query: 207 FLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQLQSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAA 266
           F   L ++D+C+ + E NP++ +++ Y +K+RQ  ++A G++R +V SV+  A+ +    
Sbjct: 209 FRECLNKIDECLNYIEENPKFKDAAAYNVKYRQCLAKASGLVRNYVTSVINQAT-EATLH 268

Query: 267 MRSSSGSNSAVSEGVEASFI--YVRFEAAADELKPVLEEIESRSTRK-EYTEILAECHRL 326
            +++    SA  +  +A+F   Y +++ AA ++K V + IESRS    +Y +++A+  + 
Sbjct: 269 PKNNMPDASAALKAPDAAFALYYGKYQTAAAKVKRVAQLIESRSEHSLDYAQLMADLQQH 328

Query: 327 YCEQRLSLIKNIVHQRIS--EFSKKEALPSLTRSGCGYLMQACQLEHRLFHHFFPSSSDN 386
           Y  QR S++   V+  I   + + K    SLTRS C +L+  CQ E RLF+ FF + + +
Sbjct: 329 YLAQRASVMSPAVNLSIQNVKVAHKGDHCSLTRSACAFLVHVCQDEQRLFYQFFSTGAPH 388

Query: 387 VSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDILKVEVLGEQLIQQGESLVGLRP 446
              L   ++ L T LYDT+RP ++H   L+ L E+  IL++E+L E + Q   +L     
Sbjct: 389 ---LTVYLEGLCTILYDTMRPFIIHINHLETLAEICSILRIEMLEEHVQQNPVALEAFAT 448

Query: 447 TLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIAN----------------YFPSDEDLEYPEKLEKT 506
              ++L DV ERL FRA  +++ +I N                       L+ P  L ++
Sbjct: 449 IAHQLLQDVQERLVFRAHLYLQSDIQNFNPSSGDLAYPEKLEMMESIALSLQEPAPLRRS 508

Query: 507 ------------AVEM----TENTSVGMNQGAPK--AWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVV 566
                       AVE     T  T   MN  A     WYP + +TL  LS+LYRC++  +
Sbjct: 509 DSRNSMVSSVSSAVETESVATAYTVKQMNSPADLHGMWYPTVRRTLVCLSRLYRCVDRPI 568

Query: 567 FTGLAQEAVEVCSTSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKE 594
           F GL+QEA+++C  S+  A+  I+   +P+DG+LF IKH LILREQIA F V+F+     
Sbjct: 569 FQGLSQEALKLCIQSVSHAAGKISANKTPIDGELFEIKHLLILREQIAPFRVDFTVKETS 628

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. Swiss-Prot
Match: COG3_DROPS (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Drosophila pseudoobscura pseudoobscura GN=Cog3 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 261.5 bits (667), Expect = 3.1e-68
Identity = 177/570 (31.05%), Postives = 293/570 (51.40%), Query Frame = 1


Query: 71  SVEDTTNEDSDAIEAV---LVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLTDRIRTCD 130
           + E    + +D IE     L NTN F  WF D+ + ++   +  YH YL  L  R   C 
Sbjct: 72  NTEGAPTKSTDDIELPAEGLQNTNDFLLWFVDVNAEIEQRGDAVYHKYLQQLEQRKAECS 131

Query: 131 VILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRNKLNYFDE 190
            +L Q+   +D    L  +++ V+ KT  L+ A ++L+ E+++L + +  ++ +L+YF +
Sbjct: 132 HMLGQISVAMDRLGALSDEYEFVSQKTSALNTASEQLIDEQEKLQDLSNEIQRRLHYFSQ 191

Query: 191 LENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQLQSRALGM 250
           +E +     SP ++V +E F   L ++D+C+ + E NP++ +++ Y +K+RQ  ++A G+
Sbjct: 192 VELLNQRLQSPTLSVASEAFRECLNKIDECLNYIEENPKFKDAATYNVKYRQCLAKASGL 251

Query: 251 IRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASF--IYVRFEAAADELKPVLEEIE 310
           +R +V SV+  A+        S++ S+SA+ +  +A+F   Y +++ AA ++K V++ IE
Sbjct: 252 VRNYVTSVINQATEATLHPKNSATDSSSAL-QAPDAAFALYYGKYQTAAAKVKRVVQLIE 311

Query: 311 SR-STRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRIS--EFSKKEALPSLTRSGCGYLMQ 370
           +R     +YT+++ +  + Y  QR S++   V+  I   + + K    SLTRS CG+L+ 
Sbjct: 312 TRLEHSNDYTQLMTDLQQHYLAQRASVMSPAVNLSIQNVKTAHKGDHCSLTRSACGFLVH 371

Query: 371 ACQLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDILKV 430
            CQ E RLF+ FF   S     L   ++ L T LYDTLRP ++H   L+ L E+  IL++
Sbjct: 372 VCQDEQRLFYQFF---STGAPHLTVYLEGLCTILYDTLRPFIIHINHLETLAEICSILRI 431

Query: 431 EVLGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPEKL 490
           E+L E + Q   +L        ++L DV ERL FRA  +++ +I N+ PS  DL YPEKL
Sbjct: 432 EMLEEHVQQNPSALEAFATIAHQLLQDVQERLVFRAHLYLQSDIQNFNPSSGDLAYPEKL 491

Query: 491 EKTAVEMTENTSVGMNQGAPKAWYPPLEKTLSYLSKL---------YRCLE---PVVFTG 550
                EM E+ ++ + +  P          +S +S +         YR  +   P    G
Sbjct: 492 -----EMMESIALSLQEPTPLRRSDSRASVISSVSSVLETESVDNSYRIKQMNSPADLHG 551

Query: 551 LAQEAVEV---------------------------CSTSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFL 594
           +    V                             C  S+  A   I    +P+DG+LF 
Sbjct: 552 MWYPTVRRTLVCLSRLYRCVDRPIFQGLSQEALKLCIQSVSYAGGKIGAAKTPIDGELFE 611

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. TrEMBL
Match: D7TC86_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_11s0016g00350 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 944.9 bits (2441), Expect = 6.8e-272
Identity = 478/594 (80.47%), Postives = 530/594 (89.23%), Query Frame = 1


Query: 1   MAAKAAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQDS 60
           MA K A   LPKS AISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATL HAVAERPFP +L+ + 
Sbjct: 1   MATKPASATLPKSAAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLSHAVAERPFPANLSHEH 60

Query: 61  IGGKENALSISVEDTTNEDSDAIEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLT 120
           I G+EN LS++ +D T EDS AIE VLVNTNQFYKWF+DLESAMKSETEEKY HY+N+LT
Sbjct: 61  ISGRENGLSVNTKDNTWEDSGAIETVLVNTNQFYKWFTDLESAMKSETEEKYRHYVNTLT 120

Query: 121 DRIRTCDVILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRN 180
           +RI+TCD IL QVD TLDLFNELQLQHQAVATKT+TLHDACDRL++EKQRLIEFAEALR+
Sbjct: 121 ERIQTCDDILHQVDATLDLFNELQLQHQAVATKTKTLHDACDRLLVEKQRLIEFAEALRS 180

Query: 181 KLNYFDELENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQL 240
           KLNYFDELEN+   FYSPNMNVGNENFLP+LKRLD+CI + ESNPQYAESSVYL+KFRQL
Sbjct: 181 KLNYFDELENVATSFYSPNMNVGNENFLPLLKRLDECISYVESNPQYAESSVYLVKFRQL 240

Query: 241 QSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPV 300
           QSRALGMIR HVVSVLKSASSQVQAA+RSS GS +AVSE VEAS IYVRF+AAA ELKP+
Sbjct: 241 QSRALGMIRSHVVSVLKSASSQVQAAIRSSGGSKAAVSESVEASVIYVRFKAAASELKPL 300

Query: 301 LEEIESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYL 360
           LE+IESRS+RKEY +IL+ECHRLYCEQR SLI+ IVHQRISEF+KKEALPSLTRSGC YL
Sbjct: 301 LEDIESRSSRKEYVQILSECHRLYCEQRFSLIRGIVHQRISEFAKKEALPSLTRSGCAYL 360

Query: 361 MQACQLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDIL 420
           MQ CQLEH+LF HFFPSSS+++S+LAPLIDPL TYLYDTLRP+L+HET+LDFLCEL+DIL
Sbjct: 361 MQVCQLEHQLFDHFFPSSSEDISNLAPLIDPLCTYLYDTLRPKLIHETNLDFLCELIDIL 420

Query: 421 KVEVLGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPE 480
           KVEVLGEQ+ ++GESL GLRPTL RILADVHERLTFRARTHIRDEIANY PS++DL+YP 
Sbjct: 421 KVEVLGEQISRRGESLAGLRPTLHRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYLPSEDDLDYPA 480

Query: 481 KLEKTAVEMTENTSVGMNQGAPKAWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCS 540
           KLE++A   +  TS   N    K WYPPLEKTLS LSKLYRCLEP VFTGLAQEAVEVCS
Sbjct: 481 KLEQSAESKSGTTSADENPDVFKTWYPPLEKTLSCLSKLYRCLEPAVFTGLAQEAVEVCS 540

Query: 541 TSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVL 595
            SIQKASKL+ KRSSPMDGQLFLIKH LILREQIA FD+EFS THKELDFSH+L
Sbjct: 541 LSIQKASKLVVKRSSPMDGQLFLIKHLLILREQIAPFDIEFSVTHKELDFSHLL 594

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. TrEMBL
Match: A0A061GKS2_THECC (Sec34-like family protein isoform 2 OS=Theobroma cacao GN=TCM_037450 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 935.3 bits (2416), Expect = 5.4e-269
Identity = 473/590 (80.17%), Postives = 527/590 (89.32%), Query Frame = 1


Query: 5   AAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQDSIGGK 64
           A P  LPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLT+QQQ AI  L HAVAE PFP +LAQ+   G+
Sbjct: 7   ATPPNLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTDQQQGAIVMLSHAVAESPFPANLAQERTSGQ 66

Query: 65  ENALSISVEDTTNEDSDAIEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLTDRIR 124
           +N LS+S +D    +S+AIEA+LVNTNQFYKWF+DLESAM+SETEEKY HY+N+LTDRI+
Sbjct: 67  DNGLSVSTKDNNFGNSEAIEAILVNTNQFYKWFTDLESAMRSETEEKYQHYVNTLTDRIQ 126

Query: 125 TCDVILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRNKLNY 184
           TCD ILRQVD+TLDLFNELQLQHQAVATKT+TLHDACDRLV+EKQRLIEFAEALR+KL Y
Sbjct: 127 TCDDILRQVDETLDLFNELQLQHQAVATKTKTLHDACDRLVIEKQRLIEFAEALRSKLKY 186

Query: 185 FDELENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQLQSRA 244
           FDELENIT+ FYSP+MNVGN NFLP+LKRLD+CI + E+NPQYAESSVYLLKFRQLQSRA
Sbjct: 187 FDELENITSNFYSPSMNVGNANFLPLLKRLDECISYVENNPQYAESSVYLLKFRQLQSRA 246

Query: 245 LGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPVLEEI 304
           LGMIR HV+SVLKSASSQVQAA+RSS G+ +++SEGVEAS IYVRF+AAA ELKPVLEEI
Sbjct: 247 LGMIRSHVLSVLKSASSQVQAAIRSSGGNKASLSEGVEASVIYVRFKAAASELKPVLEEI 306

Query: 305 ESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYLMQAC 364
           ESR++RKEY  +LAECH+LYCEQRLSLIK IVHQRISEF+KKE LPSLTRSGC YLMQ C
Sbjct: 307 ESRASRKEYIHVLAECHKLYCEQRLSLIKGIVHQRISEFAKKEGLPSLTRSGCAYLMQVC 366

Query: 365 QLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDILKVEV 424
           QLEH+LF HFFPSSS++VSSLAPLIDPLSTYLYDTLRP+L+HET++DFLCELVDILKVEV
Sbjct: 367 QLEHQLFDHFFPSSSEDVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPKLIHETNVDFLCELVDILKVEV 426

Query: 425 LGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPEKLEK 484
           LGEQL ++ ESL GLRPTL+RILADVHERLTFRARTHIRDEIANY PSDEDL YP KLE+
Sbjct: 427 LGEQLSRRSESLAGLRPTLERILADVHERLTFRARTHIRDEIANYIPSDEDLNYPAKLEQ 486

Query: 485 TAVEMTENTSVGMNQGAPKAWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCSTSIQ 544
           +A   +E  S   N    K WYPPLEKT+S LSKLYRCLEP VFTGLAQEAVEVCS SIQ
Sbjct: 487 SADVKSETASPDANPDVFKTWYPPLEKTISVLSKLYRCLEPAVFTGLAQEAVEVCSVSIQ 546

Query: 545 KASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVL 595
           KASKLI KRS+PMDGQLFLIKH LILREQIA FD+EFS THKELDFSH+L
Sbjct: 547 KASKLIVKRSTPMDGQLFLIKHLLILREQIAPFDIEFSVTHKELDFSHLL 596

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. TrEMBL
Match: A0A061GJT4_THECC (Sec34-like family protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_037450 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 935.3 bits (2416), Expect = 5.4e-269
Identity = 473/590 (80.17%), Postives = 527/590 (89.32%), Query Frame = 1


Query: 5   AAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQDSIGGK 64
           A P  LPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLT+QQQ AI  L HAVAE PFP +LAQ+   G+
Sbjct: 7   ATPPNLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTDQQQGAIVMLSHAVAESPFPANLAQERTSGQ 66

Query: 65  ENALSISVEDTTNEDSDAIEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLTDRIR 124
           +N LS+S +D    +S+AIEA+LVNTNQFYKWF+DLESAM+SETEEKY HY+N+LTDRI+
Sbjct: 67  DNGLSVSTKDNNFGNSEAIEAILVNTNQFYKWFTDLESAMRSETEEKYQHYVNTLTDRIQ 126

Query: 125 TCDVILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRNKLNY 184
           TCD ILRQVD+TLDLFNELQLQHQAVATKT+TLHDACDRLV+EKQRLIEFAEALR+KL Y
Sbjct: 127 TCDDILRQVDETLDLFNELQLQHQAVATKTKTLHDACDRLVIEKQRLIEFAEALRSKLKY 186

Query: 185 FDELENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQLQSRA 244
           FDELENIT+ FYSP+MNVGN NFLP+LKRLD+CI + E+NPQYAESSVYLLKFRQLQSRA
Sbjct: 187 FDELENITSNFYSPSMNVGNANFLPLLKRLDECISYVENNPQYAESSVYLLKFRQLQSRA 246

Query: 245 LGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPVLEEI 304
           LGMIR HV+SVLKSASSQVQAA+RSS G+ +++SEGVEAS IYVRF+AAA ELKPVLEEI
Sbjct: 247 LGMIRSHVLSVLKSASSQVQAAIRSSGGNKASLSEGVEASVIYVRFKAAASELKPVLEEI 306

Query: 305 ESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYLMQAC 364
           ESR++RKEY  +LAECH+LYCEQRLSLIK IVHQRISEF+KKE LPSLTRSGC YLMQ C
Sbjct: 307 ESRASRKEYIHVLAECHKLYCEQRLSLIKGIVHQRISEFAKKEGLPSLTRSGCAYLMQVC 366

Query: 365 QLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDILKVEV 424
           QLEH+LF HFFPSSS++VSSLAPLIDPLSTYLYDTLRP+L+HET++DFLCELVDILKVEV
Sbjct: 367 QLEHQLFDHFFPSSSEDVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPKLIHETNVDFLCELVDILKVEV 426

Query: 425 LGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPEKLEK 484
           LGEQL ++ ESL GLRPTL+RILADVHERLTFRARTHIRDEIANY PSDEDL YP KLE+
Sbjct: 427 LGEQLSRRSESLAGLRPTLERILADVHERLTFRARTHIRDEIANYIPSDEDLNYPAKLEQ 486

Query: 485 TAVEMTENTSVGMNQGAPKAWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCSTSIQ 544
           +A   +E  S   N    K WYPPLEKT+S LSKLYRCLEP VFTGLAQEAVEVCS SIQ
Sbjct: 487 SADVKSETASPDANPDVFKTWYPPLEKTISVLSKLYRCLEPAVFTGLAQEAVEVCSVSIQ 546

Query: 545 KASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVL 595
           KASKLI KRS+PMDGQLFLIKH LILREQIA FD+EFS THKELDFSH+L
Sbjct: 547 KASKLIVKRSTPMDGQLFLIKHLLILREQIAPFDIEFSVTHKELDFSHLL 596

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. TrEMBL
Match: M5VWN3_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa001686mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 926.0 bits (2392), Expect = 3.3e-266
Identity = 479/596 (80.37%), Postives = 536/596 (89.93%), Query Frame = 1


Query: 1   MAAKAAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQDS 60
           MA+KA    LPKSGAISKGYNFAS WEQN PLTEQQQAAIATL H+VAERPFP +L QD 
Sbjct: 1   MASKA---NLPKSGAISKGYNFASNWEQNTPLTEQQQAAIATLSHSVAERPFPPNLGQDR 60

Query: 61  IGGKENALSISVEDTT--NEDSDAIEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNS 120
            G  ++ALS+S +D++  +E S AIEAVLVNTNQFYKWF+DLE+A+KSETEEKY HY+++
Sbjct: 61  TG-HQSALSVSTKDSSFGSEHSVAIEAVLVNTNQFYKWFTDLEAALKSETEEKYRHYVDT 120

Query: 121 LTDRIRTCDVILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEAL 180
           LT+RI+TCD IL QVDDTLDLFNELQLQHQAVATKT+TLHDACDRL++EKQRLIEF+EAL
Sbjct: 121 LTERIQTCDGILGQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTKTLHDACDRLLIEKQRLIEFSEAL 180

Query: 181 RNKLNYFDELENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFR 240
           R+KLNYFDELENIT  FYSPNMNV NENFLP+LKRLDDCI + ESNPQYAESSVYLLKFR
Sbjct: 181 RSKLNYFDELENITTNFYSPNMNVLNENFLPLLKRLDDCISYVESNPQYAESSVYLLKFR 240

Query: 241 QLQSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELK 300
           QLQSRALGMIR HV+SVLK ASSQVQAA+RSS GS ++VSEGVEAS IYVRF+AAA ELK
Sbjct: 241 QLQSRALGMIRSHVLSVLKGASSQVQAAIRSSGGSKASVSEGVEASVIYVRFKAAASELK 300

Query: 301 PVLEEIESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCG 360
           PVLEEIESRS+RKEYT+ILAECH+LYCEQRLSL++ IVHQRISEF+KKEALPSLTRSGC 
Sbjct: 301 PVLEEIESRSSRKEYTQILAECHKLYCEQRLSLVRGIVHQRISEFAKKEALPSLTRSGCA 360

Query: 361 YLMQACQLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVD 420
           YLMQ CQLEH+LF+HFFPSS+++VSSLAPLIDPLSTYLYDTLRP+L+HET++DFLCELVD
Sbjct: 361 YLMQVCQLEHQLFYHFFPSSAEDVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPKLIHETNVDFLCELVD 420

Query: 421 ILKVEVLGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEY 480
           ILKVEVLGEQL ++ ESL GLRPTL+RILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFP DEDL+Y
Sbjct: 421 ILKVEVLGEQLSRRSESLAGLRPTLERILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPLDEDLDY 480

Query: 481 PEKLEKTAVEMTENTSVGMNQGAPKAWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEV 540
           P KLE +  +  E T+   N    K WYPPLEKT+S LSKLYRCLEP VFTGLAQE VEV
Sbjct: 481 PAKLESSVADNLETTTADENL-VFKTWYPPLEKTISCLSKLYRCLEPGVFTGLAQEVVEV 540

Query: 541 CSTSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVL 595
           CSTSIQKASKLIA+RSSPMDGQLFLIK+ LILREQIA FD+EFS THKELDFSH+L
Sbjct: 541 CSTSIQKASKLIARRSSPMDGQLFLIKNLLILREQIAPFDIEFSVTHKELDFSHLL 591

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2SQ48_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_010G095200 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 924.9 bits (2389), Expect = 7.3e-266
Identity = 467/590 (79.15%), Postives = 521/590 (88.31%), Query Frame = 1


Query: 5   AAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQDSIGGK 64
           A P  LPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQ AI  L HAVAERPFP +LAQ+   G+
Sbjct: 7   ATPPNLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQGAILMLSHAVAERPFPANLAQERTSGQ 66

Query: 65  ENALSISVEDTTNEDSDAIEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLTDRIR 124
           +  LS+S +D    DS AIEA+LVNTNQFYKWF+DLESAM+SETEEKY HY+N+LTDRI+
Sbjct: 67  DAGLSVSTKDNNFGDSGAIEAILVNTNQFYKWFTDLESAMRSETEEKYQHYVNTLTDRIQ 126

Query: 125 TCDVILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRNKLNY 184
           TCD ILRQVD+TLDLFNELQ+QHQAVATKT+TLHDACDRLVMEKQ+LIEFAEALR+KL Y
Sbjct: 127 TCDDILRQVDETLDLFNELQMQHQAVATKTKTLHDACDRLVMEKQKLIEFAEALRSKLKY 186

Query: 185 FDELENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQLQSRA 244
           FDELEN+T+ FYSPNMNVGN NFLP+LKRLD+CI + E+NPQYAESSVYLLKFRQLQSRA
Sbjct: 187 FDELENVTSNFYSPNMNVGNANFLPLLKRLDECISYVENNPQYAESSVYLLKFRQLQSRA 246

Query: 245 LGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPVLEEI 304
           LG+IR HV+SVLK ASSQVQ A++SS G+ +++SEGVEAS IY+RF+AAA ELKPVLEEI
Sbjct: 247 LGLIRSHVLSVLKRASSQVQTAIQSSGGNKASLSEGVEASVIYIRFKAAASELKPVLEEI 306

Query: 305 ESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYLMQAC 364
           ESR++RKEY  ILAECH+LYCEQRLSLIK I HQRISEF+KKE LPSLTRSGC YLMQ C
Sbjct: 307 ESRASRKEYVHILAECHKLYCEQRLSLIKGIAHQRISEFAKKEGLPSLTRSGCAYLMQVC 366

Query: 365 QLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDILKVEV 424
           QLEH+LF HFFPSSS++VSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRL+HET++DFLCELVDILKVEV
Sbjct: 367 QLEHQLFDHFFPSSSEDVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLIHETNVDFLCELVDILKVEV 426

Query: 425 LGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPEKLEK 484
           LGEQL ++ ESL GLRPTL+RILAD+HERLTFRARTHIRDEIANY P DEDL+YP KL+ 
Sbjct: 427 LGEQLSRRSESLAGLRPTLERILADIHERLTFRARTHIRDEIANYIPFDEDLDYPAKLQH 486

Query: 485 TAVEMTENTSVGMNQGAPKAWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCSTSIQ 544
           TA   TE  S   N    K WYPPLEKT+S LSKLYRCLE  VFTGLAQEA+EVCS SIQ
Sbjct: 487 TADVKTETASADANPDVFKTWYPPLEKTVSILSKLYRCLESEVFTGLAQEALEVCSDSIQ 546

Query: 545 KASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVL 595
           KASKLI KRS+PM+GQLFLIKH LILREQIA FD+EFS THKELDFSHVL
Sbjct: 547 KASKLITKRSTPMEGQLFLIKHLLILREQIAPFDIEFSVTHKELDFSHVL 596

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. TAIR10
Match: AT1G73430.1 (AT1G73430.1 sec34-like family protein)

HSP 1 Score: 888.3 bits (2294), Expect = 3.8e-258
Identity = 456/597 (76.38%), Postives = 518/597 (86.77%), Query Frame = 1


Query: 1   MAAKAAPLG-LPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQD 60
           MA KAA    LPKSGAISKGYNFASTWEQ+APLTEQQQAAI +L HAVAERPFP +L  +
Sbjct: 1   MATKAASSSSLPKSGAISKGYNFASTWEQSAPLTEQQQAAIVSLSHAVAERPFPANLVHE 60

Query: 61  SIGGKENALSISVEDTTNEDSDAIEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSL 120
            +   EN LS+SVEDT   DS AIEAVLVNTNQFYKWF+DLESAMKSETEEKY HY+++L
Sbjct: 61  HVHRPENGLSVSVEDTHLGDSGAIEAVLVNTNQFYKWFTDLESAMKSETEEKYRHYVSTL 120

Query: 121 TDRIRTCDVILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALR 180
           T+RI+TCD IL QVD+TLDLFNELQLQHQ V TKT+TLHDACDRL+MEKQ+L+EFAEALR
Sbjct: 121 TERIQTCDNILHQVDETLDLFNELQLQHQGVTTKTKTLHDACDRLLMEKQKLMEFAEALR 180

Query: 181 NKLNYFDELENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQ 240
           +KLNYFDELEN+++ FYSPNMNV N NFLP+LKRLD+CI + E NPQYAESSVYLLKFRQ
Sbjct: 181 SKLNYFDELENVSSNFYSPNMNVSNSNFLPLLKRLDECISYIEDNPQYAESSVYLLKFRQ 240

Query: 241 LQSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKP 300
           LQSRALGMIR ++++VLK+A+SQVQAA R + G+ ++VSEGVEAS IYVRF+AAA+ELKP
Sbjct: 241 LQSRALGMIRTYILAVLKTAASQVQAAFRGTGGNKTSVSEGVEASVIYVRFKAAANELKP 300

Query: 301 VLEEIESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGY 360
           VLEEIESRS RKEY +ILAECHRLYCEQRLSL+K IVHQR+S+F+KKEALPSLTRSGC Y
Sbjct: 301 VLEEIESRSARKEYVQILAECHRLYCEQRLSLVKGIVHQRVSDFAKKEALPSLTRSGCAY 360

Query: 361 LMQACQLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDI 420
           LMQ C +EH+LF HFFP+SS+ VSSLAPL+DPLSTYLYD LRP+L+HE ++D LCELV I
Sbjct: 361 LMQVCHMEHQLFTHFFPASSEEVSSLAPLVDPLSTYLYDILRPKLIHEANIDLLCELVHI 420

Query: 421 LKVEVLGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYP 480
           LKVEVLG+Q  +Q E L GLRPTLQRILADV+ERLTFRART+IRDEIANY PSDEDL+YP
Sbjct: 421 LKVEVLGDQSARQSEPLAGLRPTLQRILADVNERLTFRARTYIRDEIANYTPSDEDLDYP 480

Query: 481 EKLEKTAVEMTENTSVGMNQGAP--KAWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVE 540
            KLE +    T  T +  ++ A   K WYPPLEKTLS LSKLYRCLE  VFTGLAQEAVE
Sbjct: 481 AKLEGSP-NTTSETDLRDDENADVFKTWYPPLEKTLSCLSKLYRCLEQAVFTGLAQEAVE 540

Query: 541 VCSTSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVL 595
           VCS SIQKASKLI KRS+ MDGQLFLIKH LILREQIA FD+EFS THKELDFSH+L
Sbjct: 541 VCSLSIQKASKLIIKRSTTMDGQLFLIKHLLILREQIAPFDIEFSVTHKELDFSHLL 596

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. NCBI nr
Match: gi|659121240|ref|XP_008460560.1| (PREDICTED: conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 1108.6 bits (2866), Expect = 0.0e+00
Identity = 572/594 (96.30%), Postives = 585/594 (98.48%), Query Frame = 1


Query: 1   MAAKAAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQDS 60
           MAAKAAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATL HAVAERPFPVDLAQD 
Sbjct: 1   MAAKAAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLGHAVAERPFPVDLAQDR 60

Query: 61  IGGKENALSISVEDTTNEDSDAIEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLT 120
           IGGKENALSISV++TTN+DSDA+EAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLT
Sbjct: 61  IGGKENALSISVKNTTNDDSDAVEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLT 120

Query: 121 DRIRTCDVILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRN 180
           DRIRTCDVILRQVDDTL LFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALR 
Sbjct: 121 DRIRTCDVILRQVDDTLGLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRT 180

Query: 181 KLNYFDELENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQL 240
           KLNYFDELENITAIFYSPNM+VGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQL
Sbjct: 181 KLNYFDELENITAIFYSPNMSVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQL 240

Query: 241 QSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPV 300
           QSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSS GSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPV
Sbjct: 241 QSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSS-GSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPV 300

Query: 301 LEEIESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYL 360
           LEEIESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYL
Sbjct: 301 LEEIESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYL 360

Query: 361 MQACQLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDIL 420
           MQ CQLEH+LFHHFFPSSSDNV+SLA LIDPLSTYLYDTLRPR+VHETSLDFLCELVDIL
Sbjct: 361 MQVCQLEHQLFHHFFPSSSDNVASLASLIDPLSTYLYDTLRPRVVHETSLDFLCELVDIL 420

Query: 421 KVEVLGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPE 480
           KVEVLGEQLIQQ ESLVGLRPTL+RILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPE
Sbjct: 421 KVEVLGEQLIQQRESLVGLRPTLERILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPE 480

Query: 481 KLEKTAVEMTENTSVGMNQGAPKAWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCS 540
           KLE+TAVE+ ENTSVGM+QGAPKAWYPPL+KTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCS
Sbjct: 481 KLERTAVELAENTSVGMSQGAPKAWYPPLDKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCS 540

Query: 541 TSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVL 595
           TSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVL
Sbjct: 541 TSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVL 593

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. NCBI nr
Match: gi|449449220|ref|XP_004142363.1| (PREDICTED: conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 1106.7 bits (2861), Expect = 0.0e+00
Identity = 569/594 (95.79%), Postives = 583/594 (98.15%), Query Frame = 1


Query: 1   MAAKAAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQDS 60
           MAAKAAPLG+PKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATL HAV+ERPFPVDLAQD 
Sbjct: 1   MAAKAAPLGVPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLGHAVSERPFPVDLAQDR 60

Query: 61  IGGKENALSISVEDTTNEDSDAIEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLT 120
           IGGKENALSISV++TTN+DSDA+EAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLT
Sbjct: 61  IGGKENALSISVKNTTNDDSDAVEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLT 120

Query: 121 DRIRTCDVILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRN 180
           DRIRTCDVILRQVDDTL LFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALR 
Sbjct: 121 DRIRTCDVILRQVDDTLGLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRT 180

Query: 181 KLNYFDELENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQL 240
           KLNYFDELENIT IFYSPNM+VGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQL
Sbjct: 181 KLNYFDELENITTIFYSPNMSVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQL 240

Query: 241 QSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPV 300
           QSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPV
Sbjct: 241 QSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPV 300

Query: 301 LEEIESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYL 360
           LEEIESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYL
Sbjct: 301 LEEIESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYL 360

Query: 361 MQACQLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDIL 420
           MQ CQLEH+LFHHFFPSSSDNVSSLA LIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDIL
Sbjct: 361 MQVCQLEHQLFHHFFPSSSDNVSSLASLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDIL 420

Query: 421 KVEVLGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPE 480
           KVEVLGE+LIQQ ESLVGLRPTL+RILADVHERLTFRARTHIRDEI NYFPS+EDLEYPE
Sbjct: 421 KVEVLGERLIQQRESLVGLRPTLERILADVHERLTFRARTHIRDEIGNYFPSNEDLEYPE 480

Query: 481 KLEKTAVEMTENTSVGMNQGAPKAWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCS 540
           KLEKTAVE  ENTSVGM+QGAPKAWYPPL+KTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCS
Sbjct: 481 KLEKTAVESAENTSVGMSQGAPKAWYPPLDKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCS 540

Query: 541 TSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVL 595
           TSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIA+FDVEFSATHKELDFSHVL
Sbjct: 541 TSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIANFDVEFSATHKELDFSHVL 594

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. NCBI nr
Match: gi|359484460|ref|XP_002273836.2| (PREDICTED: conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Vitis vinifera])

HSP 1 Score: 944.9 bits (2441), Expect = 9.8e-272
Identity = 478/594 (80.47%), Postives = 530/594 (89.23%), Query Frame = 1


Query: 1   MAAKAAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQDS 60
           MA K A   LPKS AISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATL HAVAERPFP +L+ + 
Sbjct: 1   MATKPASATLPKSAAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLSHAVAERPFPANLSHEH 60

Query: 61  IGGKENALSISVEDTTNEDSDAIEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLT 120
           I G+EN LS++ +D T EDS AIE VLVNTNQFYKWF+DLESAMKSETEEKY HY+N+LT
Sbjct: 61  ISGRENGLSVNTKDNTWEDSGAIETVLVNTNQFYKWFTDLESAMKSETEEKYRHYVNTLT 120

Query: 121 DRIRTCDVILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRN 180
           +RI+TCD IL QVD TLDLFNELQLQHQAVATKT+TLHDACDRL++EKQRLIEFAEALR+
Sbjct: 121 ERIQTCDDILHQVDATLDLFNELQLQHQAVATKTKTLHDACDRLLVEKQRLIEFAEALRS 180

Query: 181 KLNYFDELENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQL 240
           KLNYFDELEN+   FYSPNMNVGNENFLP+LKRLD+CI + ESNPQYAESSVYL+KFRQL
Sbjct: 181 KLNYFDELENVATSFYSPNMNVGNENFLPLLKRLDECISYVESNPQYAESSVYLVKFRQL 240

Query: 241 QSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPV 300
           QSRALGMIR HVVSVLKSASSQVQAA+RSS GS +AVSE VEAS IYVRF+AAA ELKP+
Sbjct: 241 QSRALGMIRSHVVSVLKSASSQVQAAIRSSGGSKAAVSESVEASVIYVRFKAAASELKPL 300

Query: 301 LEEIESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYL 360
           LE+IESRS+RKEY +IL+ECHRLYCEQR SLI+ IVHQRISEF+KKEALPSLTRSGC YL
Sbjct: 301 LEDIESRSSRKEYVQILSECHRLYCEQRFSLIRGIVHQRISEFAKKEALPSLTRSGCAYL 360

Query: 361 MQACQLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDIL 420
           MQ CQLEH+LF HFFPSSS+++S+LAPLIDPL TYLYDTLRP+L+HET+LDFLCEL+DIL
Sbjct: 361 MQVCQLEHQLFDHFFPSSSEDISNLAPLIDPLCTYLYDTLRPKLIHETNLDFLCELIDIL 420

Query: 421 KVEVLGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPE 480
           KVEVLGEQ+ ++GESL GLRPTL RILADVHERLTFRARTHIRDEIANY PS++DL+YP 
Sbjct: 421 KVEVLGEQISRRGESLAGLRPTLHRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYLPSEDDLDYPA 480

Query: 481 KLEKTAVEMTENTSVGMNQGAPKAWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCS 540
           KLE++A   +  TS   N    K WYPPLEKTLS LSKLYRCLEP VFTGLAQEAVEVCS
Sbjct: 481 KLEQSAESKSGTTSADENPDVFKTWYPPLEKTLSCLSKLYRCLEPAVFTGLAQEAVEVCS 540

Query: 541 TSIQKASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVL 595
            SIQKASKL+ KRSSPMDGQLFLIKH LILREQIA FD+EFS THKELDFSH+L
Sbjct: 541 LSIQKASKLVVKRSSPMDGQLFLIKHLLILREQIAPFDIEFSVTHKELDFSHLL 594

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. NCBI nr
Match: gi|590574815|ref|XP_007012512.1| (Sec34-like family protein isoform 2 [Theobroma cacao])

HSP 1 Score: 935.3 bits (2416), Expect = 7.8e-269
Identity = 473/590 (80.17%), Postives = 527/590 (89.32%), Query Frame = 1


Query: 5   AAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQDSIGGK 64
           A P  LPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLT+QQQ AI  L HAVAE PFP +LAQ+   G+
Sbjct: 7   ATPPNLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTDQQQGAIVMLSHAVAESPFPANLAQERTSGQ 66

Query: 65  ENALSISVEDTTNEDSDAIEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLTDRIR 124
           +N LS+S +D    +S+AIEA+LVNTNQFYKWF+DLESAM+SETEEKY HY+N+LTDRI+
Sbjct: 67  DNGLSVSTKDNNFGNSEAIEAILVNTNQFYKWFTDLESAMRSETEEKYQHYVNTLTDRIQ 126

Query: 125 TCDVILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRNKLNY 184
           TCD ILRQVD+TLDLFNELQLQHQAVATKT+TLHDACDRLV+EKQRLIEFAEALR+KL Y
Sbjct: 127 TCDDILRQVDETLDLFNELQLQHQAVATKTKTLHDACDRLVIEKQRLIEFAEALRSKLKY 186

Query: 185 FDELENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQLQSRA 244
           FDELENIT+ FYSP+MNVGN NFLP+LKRLD+CI + E+NPQYAESSVYLLKFRQLQSRA
Sbjct: 187 FDELENITSNFYSPSMNVGNANFLPLLKRLDECISYVENNPQYAESSVYLLKFRQLQSRA 246

Query: 245 LGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPVLEEI 304
           LGMIR HV+SVLKSASSQVQAA+RSS G+ +++SEGVEAS IYVRF+AAA ELKPVLEEI
Sbjct: 247 LGMIRSHVLSVLKSASSQVQAAIRSSGGNKASLSEGVEASVIYVRFKAAASELKPVLEEI 306

Query: 305 ESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYLMQAC 364
           ESR++RKEY  +LAECH+LYCEQRLSLIK IVHQRISEF+KKE LPSLTRSGC YLMQ C
Sbjct: 307 ESRASRKEYIHVLAECHKLYCEQRLSLIKGIVHQRISEFAKKEGLPSLTRSGCAYLMQVC 366

Query: 365 QLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDILKVEV 424
           QLEH+LF HFFPSSS++VSSLAPLIDPLSTYLYDTLRP+L+HET++DFLCELVDILKVEV
Sbjct: 367 QLEHQLFDHFFPSSSEDVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPKLIHETNVDFLCELVDILKVEV 426

Query: 425 LGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPEKLEK 484
           LGEQL ++ ESL GLRPTL+RILADVHERLTFRARTHIRDEIANY PSDEDL YP KLE+
Sbjct: 427 LGEQLSRRSESLAGLRPTLERILADVHERLTFRARTHIRDEIANYIPSDEDLNYPAKLEQ 486

Query: 485 TAVEMTENTSVGMNQGAPKAWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCSTSIQ 544
           +A   +E  S   N    K WYPPLEKT+S LSKLYRCLEP VFTGLAQEAVEVCS SIQ
Sbjct: 487 SADVKSETASPDANPDVFKTWYPPLEKTISVLSKLYRCLEPAVFTGLAQEAVEVCSVSIQ 546

Query: 545 KASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVL 595
           KASKLI KRS+PMDGQLFLIKH LILREQIA FD+EFS THKELDFSH+L
Sbjct: 547 KASKLIVKRSTPMDGQLFLIKHLLILREQIAPFDIEFSVTHKELDFSHLL 596

[Close]

BLAST of Lsi11G001180 vs. NCBI nr
Match: gi|590574812|ref|XP_007012511.1| (Sec34-like family protein isoform 1 [Theobroma cacao])

HSP 1 Score: 935.3 bits (2416), Expect = 7.8e-269
Identity = 473/590 (80.17%), Postives = 527/590 (89.32%), Query Frame = 1


Query: 5   AAPLGLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLCHAVAERPFPVDLAQDSIGGK 64
           A P  LPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLT+QQQ AI  L HAVAE PFP +LAQ+   G+
Sbjct: 7   ATPPNLPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTDQQQGAIVMLSHAVAESPFPANLAQERTSGQ 66

Query: 65  ENALSISVEDTTNEDSDAIEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLTDRIR 124
           +N LS+S +D    +S+AIEA+LVNTNQFYKWF+DLESAM+SETEEKY HY+N+LTDRI+
Sbjct: 67  DNGLSVSTKDNNFGNSEAIEAILVNTNQFYKWFTDLESAMRSETEEKYQHYVNTLTDRIQ 126

Query: 125 TCDVILRQVDDTLDLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRNKLNY 184
           TCD ILRQVD+TLDLFNELQLQHQAVATKT+TLHDACDRLV+EKQRLIEFAEALR+KL Y
Sbjct: 127 TCDDILRQVDETLDLFNELQLQHQAVATKTKTLHDACDRLVIEKQRLIEFAEALRSKLKY 186

Query: 185 FDELENITAIFYSPNMNVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQLQSRA 244
           FDELENIT+ FYSP+MNVGN NFLP+LKRLD+CI + E+NPQYAESSVYLLKFRQLQSRA
Sbjct: 187 FDELENITSNFYSPSMNVGNANFLPLLKRLDECISYVENNPQYAESSVYLLKFRQLQSRA 246

Query: 245 LGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPVLEEI 304
           LGMIR HV+SVLKSASSQVQAA+RSS G+ +++SEGVEAS IYVRF+AAA ELKPVLEEI
Sbjct: 247 LGMIRSHVLSVLKSASSQVQAAIRSSGGNKASLSEGVEASVIYVRFKAAASELKPVLEEI 306

Query: 305 ESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYLMQAC 364
           ESR++RKEY  +LAECH+LYCEQRLSLIK IVHQRISEF+KKE LPSLTRSGC YLMQ C
Sbjct: 307 ESRASRKEYIHVLAECHKLYCEQRLSLIKGIVHQRISEFAKKEGLPSLTRSGCAYLMQVC 366

Query: 365 QLEHRLFHHFFPSSSDNVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDILKVEV 424
           QLEH+LF HFFPSSS++VSSLAPLIDPLSTYLYDTLRP+L+HET++DFLCELVDILKVEV
Sbjct: 367 QLEHQLFDHFFPSSSEDVSSLAPLIDPLSTYLYDTLRPKLIHETNVDFLCELVDILKVEV 426

Query: 425 LGEQLIQQGESLVGLRPTLQRILADVHERLTFRARTHIRDEIANYFPSDEDLEYPEKLEK 484
           LGEQL ++ ESL GLRPTL+RILADVHERLTFRARTHIRDEIANY PSDEDL YP KLE+
Sbjct: 427 LGEQLSRRSESLAGLRPTLERILADVHERLTFRARTHIRDEIANYIPSDEDLNYPAKLEQ 486

Query: 485 TAVEMTENTSVGMNQGAPKAWYPPLEKTLSYLSKLYRCLEPVVFTGLAQEAVEVCSTSIQ 544
           +A   +E  S   N    K WYPPLEKT+S LSKLYRCLEP VFTGLAQEAVEVCS SIQ
Sbjct: 487 SADVKSETASPDANPDVFKTWYPPLEKTISVLSKLYRCLEPAVFTGLAQEAVEVCSVSIQ 546

Query: 545 KASKLIAKRSSPMDGQLFLIKHFLILREQIASFDVEFSATHKELDFSHVL 595
           KASKLI KRS+PMDGQLFLIKH LILREQIA FD+EFS THKELDFSH+L
Sbjct: 547 KASKLIVKRSTPMDGQLFLIKHLLILREQIAPFDIEFSVTHKELDFSHLL 596

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lsi11G001180 vs. Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
COG3_HUMAN	9.4e-89	33.13	Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Homo sapiens GN=COG3 PE=1 SV=3	[more]
COG3_MOUSE	2.3e-87	34.15	Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Mus musculus GN=Cog3 PE=1 SV=3	[more]
COG3_AEDAE	3.9e-79	28.85	Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Aedes aegypti GN=Cog3 PE=3 SV=1	[more]
COG3_DROME	1.1e-73	32.78	Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Drosophila melanogaster GN=Cog3 ...	[more]
COG3_DROPS	3.1e-68	31.05	Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Drosophila pseudoobscura pseudoo...	[more]

BLAST of Lsi11G001180 vs. TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
D7TC86_VITVI	6.8e-272	80.47	Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_11s0016g00350 PE=4 SV=...	[more]
A0A061GKS2_THECC	5.4e-269	80.17	Sec34-like family protein isoform 2 OS=Theobroma cacao GN=TCM_037450 PE=4 SV=1	[more]
A0A061GJT4_THECC	5.4e-269	80.17	Sec34-like family protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_037450 PE=4 SV=1	[more]
M5VWN3_PRUPE	3.3e-266	80.37	Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa001686mg PE=4 SV=1	[more]
A0A0D2SQ48_GOSRA	7.3e-266	79.15	Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_010G095200 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of Lsi11G001180 vs. TAIR10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G73430.1	3.8e-258	76.38	sec34-like family protein	[more]

BLAST of Lsi11G001180 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|659121240\|ref\|XP_008460560.1\|	0.0e+00	96.30	PREDICTED: conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Cucumis melo]	[more]
gi\|449449220\|ref\|XP_004142363.1\|	0.0e+00	95.79	PREDICTED: conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Cucumis sativus]	[more]
gi\|359484460\|ref\|XP_002273836.2\|	9.8e-272	80.47	PREDICTED: conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Vitis vinifera]	[more]
gi\|590574815\|ref\|XP_007012512.1\|	7.8e-269	80.17	Sec34-like family protein isoform 2 [Theobroma cacao]	[more]
gi\|590574812\|ref\|XP_007012511.1\|	7.8e-269	80.17	Sec34-like family protein isoform 1 [Theobroma cacao]	[more]

Annotated Terms

The following terms have been associated with this gene:

Vocabulary: **Cellular Component**
Term	Definition
GO:0016020	membrane
GO:0005801	cis-Golgi network

Vocabulary: **Biological Process**
Term	Definition
GO:0006886	intracellular protein transport

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR016159	Cullin_repeat-like_dom_sf
IPR007265	COG_su3

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0006888	ER to Golgi vesicle-mediated transport
biological_process	GO:0006886	intracellular protein transport
biological_process	GO:0000301	retrograde transport, vesicle recycling within Golgi
biological_process	GO:0006890	retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to ER
cellular_component	GO:0005801	cis-Golgi network
cellular_component	GO:0005829	cytosol
cellular_component	GO:0017119	Golgi transport complex
cellular_component	GO:0016020	membrane
molecular_function	GO:0008565	protein transporter activity

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lsi11G001180.1	Lsi11G001180.1	mRNA

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Lagenaria siceraria
Date Performed: 2017-09-18


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR007265	Conserved oligomeric Golgi complex, subunit 3	PANTHER	PTHR13302	CONSERVED OLIGOMERIC GOLGI COMPLEX COMPONENT 3	coord: 1..614 score: 0.0coord: 686..853 score:
IPR007265	Conserved oligomeric Golgi complex, subunit 3	PFAM	PF04136	Sec34	coord: 115..262 score: 3.7
IPR016159	Cullin repeat-like-containing domain	unknown	SSF74788	Cullin repeat-like	coord: 182..456 score: 6.2
None	No IPR available	unknown	Coil	Coil	coord: 700..720 scor
None	No IPR available	PANTHER	PTHR13302:SF8	CONSERVED OLIGOMERIC GOLGI COMPLEX SUBUNIT 3	coord: 686..853 score: 0.0coord: 1..614 score:

Synteny

The following gene(s) are orthologous to this gene:


Gene	Orthologue	Organism	Block
Lsi11G001180	MELO3C022888	Melon (DHL92) v3.5.1	lsimeB082
Lsi11G001180	MELO3C022888.2	Melon (DHL92) v3.6.1	lsimedB087
Lsi11G001180	Bhi07G000065	Wax gourd	lsiwgoB133

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:


Gene	Organism	Block
Lsi11G001180	Cucurbita maxima (Rimu)	cmalsiB635
Lsi11G001180	Cucurbita moschata (Rifu)	cmolsiB623
Lsi11G001180	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpelsiB319
Lsi11G001180	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpelsiB321
Lsi11G001180	Wild cucumber (PI 183967)	cpilsiB340
Lsi11G001180	Cucumber (Chinese Long) v2	culsiB338
Lsi11G001180	Cucumber (Gy14) v2	cgyblsiB309
Lsi11G001180	Silver-seed gourd	carlsiB255
Lsi11G001180	Cucumber (Chinese Long) v3	cuclsiB362
Lsi11G001180	Wax gourd	lsiwgoB134
Lsi11G001180	Cucumber (Gy14) v1	cgylsiB305