Lsi10G000540 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTGTCTACTATAGAGAATATAATTTTTTTTCCCTTTTTTGAGTAGTATCTTGAGATTTATTTTTATAGTTCTAGCATAATTTTTTTTTTGTTATAAATTGTGATAATTAGTTTTAAAGATTTATAGTTGAGATCTAAACTTTGTTATTTATTTATTTTTATAGTTCTAGCATAATTTTTTTTTTGTTATAAATTGTGATAATTAGTTTTAAAGATTTATAGTTGAGATCTAATCTTTGTTATTTATTTATTTTTATAGTTTTAGCATAATTTTTTTTGTTATAAATTGTGATAATTAGTTTTAAAGATTTATAGTTGAGATCTAATCTTTGTTATTTATTTATTTTTATAGTTTTTAGCATAATTTTTTTTGTTATAAATTGTGATATTTAGTTTTAAAGATTTATAGTTGAGATCTAATCTTTGTTATTTATTTATTTTTATAGTTCTAGCATAATTTTTTTTTGTTATAATTGTGATAATTAGTTTTAAAGATTTATAGTTGAGATCTAATTTTTGTTATTTATTTATAAGGATTATCTAAGAAAAAATTTGCCCAATCTTTCAAGGTTATGTATTTAATGATTTATTTTTGTTTAAAATAAACTATTTTATTGTTTACATTATTCTAATATTTATTATACATATACTAATATATTTTTTTTAAATAAAAAAAAACTACATAAGTGCTCGGATTAAAATCCAAGCGCAGTGGAAACATATCAGAACCCTATCTCAAAATTAATTTTAAAAAAATGTTGAAATACTTCTACATTTGTAAAAAAAAAACTAAAATAATCTAGGTTAAACATATAGAATACAAAAAAAATGAGAGAAGAAAAAACTTTTACGTGTCACCACCACTTGGAGACCTTCCTTTTCTCTTAATCTTGAGGAAAGGTTTGTGGGAACCTTTTTGGCAAGGAAAAAATAAATGCAGAGAATATTTTTGTTGAGAGAATGAACCATTAAATTCTTTTCTGTTAGATGCTATATAAGGAAGTGAGAGAAATGGGAAACGTGAAGAGAGAGAAAATGGGAAACATGGGTGTTATCCCACGTATTAAGCAACTCCCCTACATGGGAGTTACAACTAATTTAATATTAATTAAATTAATTAACCAATTCATTTAAATCATATTTAAATGAACATCTCTCACATAACCTATAGTTTTAATTCAATTAATTAAATTAAATTAGATTAAATTAAATAACTAATTAATTCTCCAATTAATTAATTACTAAATTAAATATCAAATATTTAATTTTAACTTGCATTTGAATCAAATTCAAATACATTTCTCTCATAACCTATAGTTTTAATGTACATCTAATGCGCATTAATTTTAACCTATAGTTTTAATATAAATCTAATTCATATTAAAATAATATTTGAACAATTTCAAATATTTAATTCTCTTACAAATTAACTTTGAATCATATCCAAAATTATATTTATACTATAAAGTTTAATTTGTAAAATAAACTTTATATTATAATGTATCATTATACATTATACTTTTTCCTTAGTAAATTTGAACTTTTCAAATTTCATCCAAGAATAAATTTCCTCAATATTCTTTACGAGCTAGGAAGAGGACCTAATGGACCTACAGATCAGAAGCTCCAACGATATGAGATTAACGGGCTAAACTCATTAACCACATTAATCAATATTCGTTAATTGTGGGTACACTCCACTAAAGACCCACAGCTGCACTCTTCTCACTGTAGATATATTTTTGTGTCCACGGATATAGACCAATAACAACAAGTTAGTCCTTCACAAGTGTTCGTAACACCAGCTGGGTTAAATTATCGTTATACCCCTGGGTTACTTCTAAATAAGTAACAGTGCTCCTCTAATGAACAATCTGTTTATGGTCCAACCATCAAACAGAAACCCCTCTCGGGCAAGTGAGAGGGTAGGGCCCTTTGTTCAAGTCCCAGAGACACCATTTAAAGGAACACTTATCTACTTACCCTAAAGTCGGGAAGGAGTGAAATCCATCTTGTATAATTATGTTCCCAGCTCCCCACTCAGTCTTGTCCCCAAAATGGTAGGCATATCGAGTCGGCAAACGGGCCACTCTCACCCATACAAATCAAAGGACAATCCCTCGTGAACAGGAGTTCGTAATATACTCAAGATTAAGACTAAGTTGCCTAGGTCAACCTATTGAAATAGAAACCTAACAAGTCAACGGAGTTATATCTAGTGGTTACTATTTTGTGGTCCAGTCTTATGCAAACTCATTGCATAGGATACCCCCACTTGCATGTCTCCTACACGAACGCGTTAGATCATTACGTTTGTATCAAATACAAAGTGGGCCGTATCCATAGTGTTACCAGGATAAGGTACCCAGCCTTATCCTTATACTATAGACCCTTTAGGCTGTAACTTGAACATTGATCTCTATATGTCTCTATATATTGTTCAAGACTCATAAAACAGCCTAGGATGTTAGTTTATTGGATTTTAGGGTTATTAAAACAAGATAAAATAATCAATAACATTTATTGAATCATAATGAATAACCATTTATTAATGACGGTCAAAATACAACATTTATTGGTTGTCTTGCATGGCTATATAGACAGTTATGCAAAAGTGCAGTTATCGATGTAAAAGACATAGCAAGTCCTCTTATGTTACTGCAAATTTGGGCATGGGATCGGTTTCCTCTTCTAGCACCTCAACGACTCCACCGATATGAAAACAATTTGGGTGATTGACCACTAGCAGTACGGTAATCATTTTTAACTCATTAACATTTAATATTTATATTTTATATCGTGACTTCATAACCACTAATATTTGATTTCTATTTGTTGTAGGTGGAATGACGACTTTTCTGTTATCAGATCGCCTATGCATGTGTTAGTTCAGTATAGATACATATTAGATACACTTGCCCCTAACCAAGTAAAATCATATTCATTTATAACACATTTATTTATAACATTTCATTTTCTTGACTCACTCTTTGAATATTAAACATATGCAGATTATTTGGGAGCCATATAACCATTTAATCCGTAGATTGTCACCATATTGTCTCCAAGGTCATGAGATATGGACATCCAGGTGTCCACTTATATGTTTTTTTTCGTGGTAGAGTGGCATTACCCAAATCGTGTGATGCACCAGTTTGGGAGGTTGCAACGAATTCCAGATCCTTGCGATACGGACAAACGACTACATTCGCACGATCTACGAGGCAGACACGAGTGAGATTGGATTTCATATTTGGCTCCTCAAATATCAATTTGGGAGAATCGACATAATTTGATTGTTAGTGGACCTCCCATTAACAACGGTATAGTGTTGAGCCTGGATACATTGATTGGTATTCTAATATTAGCAGGCGATACATAACGAAAGTAGGAGTATCGTATCACTTTTTGGTATGAGTTTCTTGCTTACTAGGATGATTTCATTTTATTCTTTAATTTCTATATTAAATGTTCTAATATATTTCAATTATATTTCAGCAATATTTTACAAATATGCCAATATCTGAAAGAACGGCTGGAATGGCTGGAATAGCTAAAACTGCCTTGCGTACAATCACATCGATATATAGAGTACGATATTTCGAAGGTGATGTCCCTGATGAAGAACAGGGTGATCCTGCTAGACATCAGGATGTTCCAATTCAACCTAATGTTCAATATGAATATCCGGCAACTCCAGGCGATCATTTTACCCCTGGTTCCATGATGCCAACACCATCAACATTTGAACTTTTTCCAACAACTCTCAATATGCTAAATATGGAAGAAGGCCAAACTTCGCAAGCTCCTCGTCAAGAAGTTCATGATCAATATGTGACATACCGACATTATAGTGCAGACATACAATTTACAGACGGAGGCCTGCTGGGATTAAAACCCAAAACGCAGCGGAAACGTATCAGAACCGTATCTCAAAATTAATTTTAATAATTTTGAAATACTTTTACATTGGCAACAAAGACTTAAATTAATCTAGGTTAAGCAAAAAATTAGAGAATAAAAACTCTTACGTGTTGTGTCACCACCACTTGGAGACCTTCCTATTCTCTGAATCTTGAGGGAAGGTTTGTGGAACCTTTTTGGCATAGGAAAAAAATACAGAACTCTTCTGGATATTTTTTTTTAGAGAACGCTGAGAATTTTGTTTTTTGTTGAGAGAATGGTTCACCCCCAAACAAAATTCTGTTTTTGCACTATATAAAGAAGCGAGAGAAAAATGGGAAACGTATCCCACGTCTTAAGTAACTCCCCTACGTGGGAGTTACAACAAACTTAATTAATTAAAATTAAATTAATTAACTAAATCAATAATTAATTAAATTAATAATTAATAATTAATTAAATCTAATTTAATTAATCAATTAATTTAAATCATATTTAAATGAACATCTCTCACATAACCTATAGTTTTAATTCAATTAATTTAATTAAATCAAATTTAATTAAATTAGATTAAATTAAATAACTAATTAATTCTCCAATTAATTAATTACCATATTAAATATCAAATATTTAATTTTAACCTGCATTTGAATCAAATTCAAATACATTTCTCTCATAACCTATAGTTTTAATGTACATCTAATGCGCATTAATTTTAACCTATAGTTTTAATAAAATAATATTTGAACAATTTCAAATATTTAATTCTCTTACAAATTAACTTTGAATCATATCCAAACTTATATTTATACTATAAAGTTTAATTTGTAAAATAAATTTTATATTATAATGTATCATTATACATTATACTTTTCCCTTAGAAAATTTGAACTATTCAAATTTCAACCAATAATAACCTCAATATTCTTTACGAGCTAGGAAGGGGACCTAATGGACCTACAGATCAAAAGCTCCAACGATATGAGATTAACGGGCTAAACTCATTAACCACATTAATCAATATTCGTTAACTGTGGGTACACTCCACTAAAGACCCACAGTTGCACTCTTCTCACTGTAGATATATTT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MLWNDDFSVIRSPMHVFYTMHKLSRRSVSAVLRTSGARYHRNAASAVAPATHASLLPNSVGESDGKVRRYSLLTVGQLDAAKPSSQLNLKHTFSLARFESTATASDASATPPVEKYEYQAEVSRLMDLIVNSLYSNKEVFLRELISNAIRSTQKYPFSCQESYLLISKLNNDCCLFNLHSNASDALDKLRFLSVTDPGILQEATDFHIRIHTDKDNGIISITDTGIGMTRQELVDCLGTIAQSGTAKFLKALKDSKDAGGDNNLIGQFGVGFYSAFLVADRVVVSTKSPKSDKQYVWEGEANASSYTIREETDPEKQLPRGTCLTLYLKRDDKGFAHPERIQKLVKNYSQFVSFPIYTWQEKGFTKEVEVDEDPTEASKDEQDGKTEKKKKTKTVVEKYWDWELTNETQPIWLRNPKEVSTEDYNEFYKKTFNEYLDPLASSHFTTEGEVEFRSILYVPAVSPMDKEDLINPKTKNIRLYVKRFPRYLSFVKGVVDSNDLPLNVSREILQESRIVRIMRKRLVRKAFDMILGISMSEKKEDYDKFWDNFGKHLKLGCIEDRENHKRIAPLLRFFSSQSEEDVISLDEYVENMKPEQKDIYYIASESVTSAKNTPFLEKLREKDLEVLYLVDPIDEVAIQNLKSYKEKNFVDISKEDLDLGDKNEEKEKEIKQEFGQTCDWIKKRLGDKVANVQISSRLSSSPCVLVAGKFGWSANMERLMKAQTVGDTSSLDFMRSRRVFEVNPEHPIIKSLDAAYKSNPNDEDALRAIDLLYDAALVSSGFTPENPAQLGGKIYEMMGMALSGKWSVPQSQPLEAEVVEPVEADRQKIYIYRCEICEEPSRLGIWTLMLNESKAKANGRSFLGVDFGFPWVKSFDFVCFGNWHRVQKSKMKSRIEIIFGISRGAVEITAEALSPRVLLLVLVTPEVDRCFFLSHYNSLMLSISGSYIQQQLAEKMLLPRQQSQSGTLQTSFSLMPADGRLPQEEPRSNSGQVRESPTESASSRETWPNVEAMLAKKMESGKIENDNAEHSVVHRLSSADKISLRDIARERVDLISEKMHRLPDEFLEELKTGLRVILDGNGGSQQREEIFILQKLVQNRTDLTAKTLLIANRVQLEILVAINTGIQAFLHPNITLPQTTLIEIFVYKRCRNIACQNQLPADDCTCELCSNRNVNTCRWIGCDLCSHWTHTDCAIRDGQICMGASVKSAPGQTEMLFRCQACNRTSELLGWVKDVFQHCAPTWDLEALTRELDYVSRIFRGSEDTRGRKLFWKCEDLKEKMKNGVVDLSVACRTILAVFQELELDSPRSMENGEGGRLIAPQEACTRIADVVQEAIRKMEIVADEKKRRYKKARMDVEAFEREVEDKTREAAELKVEKQRKKLQIEELEKIVRLKLAEADMFQLKANEAKREAERLQMIALAKSEKSEEDYASNYLKQRLKEAEAEKQFLLEKIKLQESFRSQSSGGADQS
BLAST of Lsi10G000540 vs. Swiss-Prot
Match: HS906_ARATH (Heat shock protein 90-6, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana GN=HSP90-6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1140.2 bits (2948), Expect = 0.0e+00 Identity = 597/836 (71.41%), Postives = 684/836 (81.82%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. Swiss-Prot
Match: HS905_ARATH (Heat shock protein 90-5, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana GN=HSP90-5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 911.4 bits (2354), Expect = 1.3e-263 Identity = 469/702 (66.81%), Postives = 558/702 (79.49%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. Swiss-Prot
Match: OBE1_ARATH (Protein OBERON 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=OBE1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 649.4 bits (1674), Expect = 9.2e-185 Identity = 343/532 (64.47%), Postives = 418/532 (78.57%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. Swiss-Prot
Match: OBE2_ARATH (Protein OBERON 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=OBE2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 649.0 bits (1673), Expect = 1.2e-184 Identity = 353/536 (65.86%), Postives = 429/536 (80.04%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. Swiss-Prot
Match: PVIP_PEA (OBERON-like protein (Fragment) OS=Pisum sativum GN=PVIP PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 644.8 bits (1662), Expect = 2.3e-183 Identity = 338/477 (70.86%), Postives = 394/477 (82.60%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KFS9_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G111370 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1310.8 bits (3391), Expect = 0.0e+00 Identity = 698/827 (84.40%), Postives = 724/827 (87.55%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. TrEMBL
Match: F6HHM5_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_12s0057g00670 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1238.0 bits (3202), Expect = 0.0e+00 Identity = 649/833 (77.91%), Postives = 715/833 (85.83%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. TrEMBL
Match: A0A061DMZ0_THECC (Heat shock protein 89.1 isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_002328 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1225.7 bits (3170), Expect = 0.0e+00 Identity = 641/834 (76.86%), Postives = 715/834 (85.73%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. TrEMBL
Match: W9SBQ7_9ROSA (Heat shock protein 90 OS=Morus notabilis GN=L484_020019 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1221.8 bits (3160), Expect = 0.0e+00 Identity = 648/834 (77.70%), Postives = 711/834 (85.25%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2QU18_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_001G220600 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1189.5 bits (3076), Expect = 0.0e+00 Identity = 627/835 (75.09%), Postives = 693/835 (82.99%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. TAIR10
Match: AT3G07770.1 (AT3G07770.1 HEAT SHOCK PROTEIN 89.1) HSP 1 Score: 1140.2 bits (2948), Expect = 0.0e+00 Identity = 597/836 (71.41%), Postives = 684/836 (81.82%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. TAIR10
Match: AT2G04030.1 (AT2G04030.1 Chaperone protein htpG family protein) HSP 1 Score: 911.4 bits (2354), Expect = 7.3e-265 Identity = 469/702 (66.81%), Postives = 558/702 (79.49%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. TAIR10
Match: AT3G07780.1 (AT3G07780.1 Protein of unknown function (DUF1423)) HSP 1 Score: 649.4 bits (1674), Expect = 5.2e-186 Identity = 343/532 (64.47%), Postives = 418/532 (78.57%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. TAIR10
Match: AT5G48160.1 (AT5G48160.1 Protein of unknown function (DUF1423)) HSP 1 Score: 649.0 bits (1673), Expect = 6.8e-186 Identity = 353/536 (65.86%), Postives = 429/536 (80.04%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. TAIR10
Match: AT5G56030.2 (AT5G56030.2 heat shock protein 81-2) HSP 1 Score: 565.5 bits (1456), Expect = 9.8e-161 Identity = 324/740 (43.78%), Postives = 474/740 (64.05%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. NCBI nr
Match: gi|659128376|ref|XP_008464175.1| (PREDICTED: heat shock protein 81-1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1330.9 bits (3443), Expect = 0.0e+00 Identity = 707/825 (85.70%), Postives = 727/825 (88.12%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. NCBI nr
Match: gi|449444490|ref|XP_004140007.1| (PREDICTED: heat shock protein 81-1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1310.8 bits (3391), Expect = 0.0e+00 Identity = 698/827 (84.40%), Postives = 724/827 (87.55%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. NCBI nr
Match: gi|296085007|emb|CBI28422.3| (unnamed protein product [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1238.0 bits (3202), Expect = 0.0e+00 Identity = 649/833 (77.91%), Postives = 715/833 (85.83%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. NCBI nr
Match: gi|590712118|ref|XP_007049299.1| (Heat shock protein 89.1 isoform 1 [Theobroma cacao]) HSP 1 Score: 1225.7 bits (3170), Expect = 0.0e+00 Identity = 641/834 (76.86%), Postives = 715/834 (85.73%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G000540 vs. NCBI nr
Match: gi|703161427|ref|XP_010112788.1| (Heat shock protein 90 [Morus notabilis]) HSP 1 Score: 1221.8 bits (3160), Expect = 0.0e+00 Identity = 648/834 (77.70%), Postives = 711/834 (85.25%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Lagenaria siceraria
Date Performed: 2017-09-18
The following gene(s) are orthologous to this gene: The following gene(s) are paralogous to this gene:
The following block(s) are covering this gene:
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