Lsi09G015360 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTTTTTTTTTAAAAATTAGAATTCTCTCCCTCAGATTAACCAATACAACCATCAATGATAATTTGGATTTATTGCAAACATGAGTCATCTATATGCTTTATACTTCATGTTAAGTCATTATGGAGCTGAAAAGAAATTAATTGAGTGAACATGGAATCTTTTGGTCGATTGGGAGGCTTGGTAATCATGTGGGATGAGATGCAAGGTGAAGGTTTTAGAAGTGTTAAAAGGTGGCTATTTCCTCTCAGTGTAAGTATCTTTTCAGCAAAATAAAGTTTGTTGGATTTCAAATTTATATAGTGCAAATGATTGCAGAGAATTAAAGCATTTTCGGAGTGTGCTGAGATCTTTTCATTCTTATTGTGAAGATTCGTGGTGTGTAGGGGTGATTTTAATATAGTCCGTTGAGTTCACGAGCAACTCCCAATTGGAAGACAGACTAAAGGTATGAGAGTTTAATAAAATTATTGATGAGATTGGTTTGATTGGAATTCCTCTAAAATTCACATGGATTAGAGAAGGTGATGGGCCTCAGTCTTTGTTAAATCACATTCTTTGAGAATTAAAGAGCAGCTCCCAATTGGAAGACAGACAAAGAATAGGATTATATTACTACAATACTTTTCTTGAGTTTTTTCATTTAATGCAATTGGTTACCTATCAAAAAATATCTTTGAAATAAACATTTAGAAACACTTTATAGTATTTTTAGAAATCACCAGTATTACATTTTTAAAATCTCTCTCTCATAGTTTATACTACCAAAAGTTGTAGATTCATGGACGTTACCAAGAAAATTGATTGATTAAAAATACGATGAAATTTCGAGGTTATAAACTCTAATTAGGAGTGAAAAGGAAACAAAAAAAATCCAACAAACTAAGACATGGATATCACAGCGCCTCAATTTGTACAAATATCATTGAATTAGTAGCTTGCAAATAAAGAAAAGAGAAAACACCAATAAGAAACTTTAACGTTGATTCCAAAATGTTCTTGCCAAACTAAATGTTTATCTTAAAAAGCTCTCTAATTTTTTTCAAACCAAACGTCAGAGGTGATAGCCTCAACAAAATTAACTCATATTAGTTGAGCTTTTGTAAGCAATAAGAGAGAAAGTAAATTCGGTGTGAAGTTAGTTAGCTTTTGGGGAGGGGACCACTAAGAGAACGTTGTGGGAGTGAGTGTGGTCAGTATATAGAACAATGCTTTGGGGTAGAAGATTTTTATGCTTTTTGGTAGTAAGAAGTAAGTACTCGGTAGGGAGAGAACCATCCCTCTCATTTGGCTGGATTTTGTATCGCCTCAGGGCTTTCCAGTTATCGAAATATCACTAATAGTAAGGATATACCTTACATTTTTATGGGTCCCTTGGATAATCTTCACATAGATGAACCAAAAAAATATATCCAACTTGTCACTTGATTATTTCACACTCAAAAGTTATTATTATTGTCATATATGTGTCTTTTTGGTCTACTCAACAAGTGTTCAATGTATGTCTAACACATTTGTTGCACTAGCAAGCGTCCGATACGTGTCCAACAAGTGCGGTGTGTCCAAGTGTCCGACACGTGTCGGACACGGACACGCTAGCCAAACTAAAGTGTCCGTGCTTCTTAGTGTATAGCTGACGTCCCTTTTTGTGGGCTTGGTTTTTTTGTATGTCCGTGTATTCTTTCATTTTTTCTCAATGAAAGGTGTTGTTCTTATAAAAAAAAGATACAAAATCATTATTCACTTTCCTCACCACCAATAGACACTTACTCAACAATAGTTGGCTTACACATAAAACTATGGAGTTGTCCCCACCCGAAAAGAGTGAAATTCCTTCTTTGAGAAATCACTAACTCCTGTTTTAATACTATGGATAGGTTATAGAAACGCTGCCCTTGGATCAACCTATCTCCCTCTTGGTGCTACCTTTTCCAATCCAACAATGAATATGTCCAACATGTTTTCTTTGATTGTCCCTTTTCTAGAGGGATTTGGTCCGAGTTTTTCTCTGCCTTCAACTGGTCTGTTGCACTTCCTTTTGACACACATATTTGGCTTTGTTTACTGATCATCAATCCACCTTTCAAAGTCGCCAAAGACCATTTGTGGTTATGCATTATTTGTGCTGTTTTGGGGATTTGGGATAAAAGAAATGCAAGAATCTTTCAGAAAAAATACATAATGACAAAGGGCGTAATAGATACTATCATTCATAAACCATCATGTGTTGGCCTTGTGGTAAATAGGGGGACGTGACCTTGATAAAGGGGTAAGAGATTATGGTTTGAATCCATGGTGGCCACTTACCTAGGATTTAATATCTTACAAGTTTTCTTGACACCCAAATGTTATAAGGTCAGGCGGATTGTCCCGTGAGATTAGTTGAGGTGCACATAAGTTGGCTCAAACACTCACAGACATAAAAAAAATACTATCATTCATAATGCTTTTTTTTGGTGCAAAGATATACCGGCTATAAATAGTCATAGCTTTTTTTTCCTTATTACAAATTGGAAACACCTTTTGTATACTCTATGAAATGGGCCCTTTTGACCTTTAGATATCTTCGGATATTTCATTCAATCAATGAAATTATTTCATATAAAAAAAACTTGTGATTGGAACCATAGGTAATTGCAGTTTTGCAAGGATTAGAACATAGGGAATGATTTTTGGATCAGATTGAATACAAAAAAGATGTTAAATAGAATTAGAACAAAATATTGTGTTGAAGAAATTAAATTTTACTTTGGATATTATAGAAAGAGATAGACATATTTCATATTTTCAGTTCAATCAGTTTGTATCTTATTTGAACTTTTATTTTCAGTTTCAATTTTATTGTATTCTGAGCATCACACTATTTTCATTACTTCAATGAAAGGTCTTGTTTCCTTTTCAAAAAAGAAAGAGAGAAAAAAAAGGTAGACATATTGTTTGTATGGCTATTTGTAACTCTTCATCCATTTGTTTGTGATAATGCAGGTTGATGTGTTTATAGTAGCAGTGAAGGTTAAGTTGGGTTTAGTTGACTTGGTAGTAGAGTATTGTGGTGGTGCATGAAACTTGTTAATGATTGAGCTATGTCGTTGACACCAAAGGAGCCAGAGCATGTTATGAAGTTTAGAGGAGGATCAGTTCTGGGTAAAAAGACAATTCTTAAAAGTGACCATTTCCCTGGATGCCAAAACAAGCGCTTATCACCTCAAATAGATGGTGCTCCAAATTACCGTCAGGTGCATTCCCCCTCCTTTTGTTTTTCTTGCCTACTTCCATAGTTTTCTCTTGCTTTTTGTCATAACTTCATCACATCTTAGTGTACTTCCACCAATATTTATCATAATTATTCTCTATTTTTTTTGTGGTGCTAGTGCCACCTCAAATTTCTTCTCTAATAATTTATGGTTTTACAAATTTTCAACAAATATTGCTTCCAGTTCTATTTCTAATTAAAAAAGAGGTGTTTTTTTATTGCCTTTTTAACCTTTTCCCCAGATTTTTCCCTTGTTTTATTTAGTACTTTTTTTTTGTGCTCTTTCTTTATTTCCCTATTTTCTTGTGTATGGTTTTTAGTTCTAATTCAAAAAATTGATGTAGTTTAACAATATGATTAAGACATATAAGGTTTTACATTTTATGATTTTTATTTTATTTAAAATGAGGCGTACACCTCATACCACCTCAAAGCTTACACATCGCTTCTTTATGAGGAAAAGCCTTGAGGCCACCTTAAGCTTTTTAAAACCTCGGGTTAAATTTGTGGAGGTCTTGTTGGAATTTCTTTAGGCACTACTAGACTGTTGAATTACTTCAAAGCCTCTACAAAAGTGATGACAATGCAATGCTTGATAATACCCTCATTAATACTATTGAATTGTTTGAATGTTGTTCTGGTTCAAAAGTGAATTGGGCAAAGCCAGCTGACTCCAAGATACAACAAGTGTTCTTGTTTGAATTGTTAAGTAGAAATGCTGCCAATCACTTATCTTGGTTTTCCTTTTGGTAGCTACCCCAAAAAGACTTATTTTTGGGTGTTTGAAAAGATTCAAAAGAAATTAGATAGATGGAGGAGATTTAATTTATCAAGAGGAGGTAGATTGACTCTTTGTATGTCCGTACTCTCTTGCTTTATTATATGTGCATATTCTTAATGACCCCTAATGTTTGTTTGGTAGTGGAAAGACTAATGCGATCATATTTCTGGGAGGGTGATAAAATAAACCATCTTATGACGCTAGATGTTGTGAACAATTTATAGTTGACCAAAATAAAGCATTTGACTAGTAGAAGAAAAGCACCTTTACCTAACAAAATTAAGTGAATACCCAAAGTGGTAGTAATTTAATTTCTATCTTTCAACACATAATCAAAGAATGAAAAAGATTCTTCAATTCCCGGTCCTAGAAGTGCATGATAATTTGAAATACCACCAAAACTCAATATTGCGGTGGGAATTTAGTGAAGTATGGAAAAGTATTATATTGCAAGCTCTCATTGAGTTGTTTTGGTTCTTAGGCGGTGAGGATTTTGGAGCACTCTATTGTTCTTTAAATGTTTTATTGATTATAATTGTCTCTAATTTCTTGTTTTTAATTTTTAATTTTCCCTTGAGCATATATTCTTTATCATTATAAATCAATGAGGAGGCGTTCATTAAAAAACAATTATATATGGTTTCAATTTTCTATTCTAAAATCAAAGTGTCTCCACTTTGTTAAGCTTCCCAAAATCTTCCCCGGAGGGTGCTTTGTGTGAAACTGTAATTATGGATGCATTTCAATTAATTAACTGGATGGTTAATTGCGTAGTTCACCATTTACTAATCATTCTATTTTTCACAATGTTTCTTTAGGCCGATTCATTACAAGTCCATGGTGTTGCTATTCCTACAATTCTTGGAATTCAGAACGTTCTCAAGTATGTTGGAGCTCAAAAAGATGGGCAACAAGCTCAAGTTCTTTGGATTAACCTTCGGGAAGAACCGGTAAATCCCCTC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BLAST of Lsi09G015360 vs. Swiss-Prot
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BLAST of Lsi09G015360 vs. Swiss-Prot
Match: PALD_DANRE (Paladin OS=Danio rerio GN=pald1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 151.4 bits (381), Expect = 5.8e-35 Identity = 158/645 (24.50%), Postives = 286/645 (44.34%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. Swiss-Prot
Match: PALD_MOUSE (Paladin OS=Mus musculus GN=Pald1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 131.7 bits (330), Expect = 4.7e-29 Identity = 180/790 (22.78%), Postives = 313/790 (39.62%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. Swiss-Prot
Match: PALD_XENTR (Paladin OS=Xenopus tropicalis GN=pald1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 3.2e-25 Identity = 91/362 (25.14%), Postives = 175/362 (48.34%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. Swiss-Prot
Match: PALD_CHICK (Paladin OS=Gallus gallus GN=PALD1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 116.7 bits (291), Expect = 1.6e-24 Identity = 95/347 (27.38%), Postives = 168/347 (48.41%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KB71_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G001780 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2057.3 bits (5329), Expect = 0.0e+00 Identity = 1030/1075 (95.81%), Postives = 1051/1075 (97.77%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. TrEMBL
Match: V4TWI0_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10018541mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1805.4 bits (4675), Expect = 0.0e+00 Identity = 892/1071 (83.29%), Postives = 985/1071 (91.97%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. TrEMBL
Match: A0A061DTT1_THECC (Uncharacterized protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_004984 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1804.6 bits (4673), Expect = 0.0e+00 Identity = 900/1078 (83.49%), Postives = 984/1078 (91.28%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. TrEMBL
Match: D7U2V9_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_07s0005g02810 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1804.3 bits (4672), Expect = 0.0e+00 Identity = 897/1073 (83.60%), Postives = 980/1073 (91.33%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2PC78_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_004G148300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1795.8 bits (4650), Expect = 0.0e+00 Identity = 897/1074 (83.52%), Postives = 977/1074 (90.97%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. TAIR10
Match: AT3G62010.1 (AT3G62010.1 unknown protein) HSP 1 Score: 1689.1 bits (4373), Expect = 0.0e+00 Identity = 840/1077 (77.99%), Postives = 946/1077 (87.84%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. NCBI nr
Match: gi|659116821|ref|XP_008458276.1| (PREDICTED: paladin [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2078.1 bits (5383), Expect = 0.0e+00 Identity = 1041/1075 (96.84%), Postives = 1058/1075 (98.42%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. NCBI nr
Match: gi|449441486|ref|XP_004138513.1| (PREDICTED: paladin [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2057.3 bits (5329), Expect = 0.0e+00 Identity = 1030/1075 (95.81%), Postives = 1051/1075 (97.77%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. NCBI nr
Match: gi|658015800|ref|XP_008343230.1| (PREDICTED: paladin-like [Malus domestica]) HSP 1 Score: 1817.7 bits (4707), Expect = 0.0e+00 Identity = 904/1074 (84.17%), Postives = 984/1074 (91.62%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. NCBI nr
Match: gi|694427862|ref|XP_009341534.1| (PREDICTED: paladin-like [Pyrus x bretschneideri]) HSP 1 Score: 1814.7 bits (4699), Expect = 0.0e+00 Identity = 904/1074 (84.17%), Postives = 981/1074 (91.34%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi09G015360 vs. NCBI nr
Match: gi|1009148162|ref|XP_015891790.1| (PREDICTED: paladin isoform X2 [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 1813.5 bits (4696), Expect = 0.0e+00 Identity = 908/1074 (84.54%), Postives = 984/1074 (91.62%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Lagenaria siceraria
Date Performed: 2017-09-18
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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