Lsi09G011350 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi09G011350
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionUnknown protein
Locationchr09 : 18240185 .. 18247047 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGATATCCTGCAACACCCGCCAACAACAAAACTTTACCTTCAACGATAATTTACTTTTCCAGAGGAAATTCCATAAGGCCACTGTCATCTCTACAGATGATGGTGAACCCTCCCCAAGTGAAGCCAAATTTAGACCCAACATGTATGCACTTTTCATCAAAACGACACCTTGTGTATCTAGTGACCAGTAAATATCATCAGCTCGTCGAAGCCCATTGACTGAAATAGATAAGATCAAGTTCGCCTCCTCCTCTAATAAGTTATTGTAAACTTTGTCAACATCCCACCTCCAACTATCTTTTAAAAAAGATACAACCCAGTCATTCCTACAACTCTCTCCAACCTAACTCACCTTACCATTTCTTGGCCTAGGGAGTTAGGAATCTGCCTCAATCTGGATGGGCAAACCATTGCCCACCCCCCATCGATACCCTTGAGTGAATACCTCACGACCCCACAAAATGCTTCTCCATGCATAAAACGAACTTGTTCCCAACCGGGCGTGTAAGAAAGATTCAGTTAAAAAATACTACCCTATTAGTACTTGAAAAAAAAGACTCTCAGGGTGTCTGTATAACTGCCAAACTCTGCTTAGCCAACATTGTGTAGTTAAAAGCTTTTAAATCTCGAAAGCCTAAGCCCCCCATCTCCTTAACAACACACAACTGTTACCACCCCTGCCAATGCAACTTCCTATACCCTTCACCTGAGCCCCACAAAAAATTAGCACACAAAGAATTCAATTCATCACATAAAGAAGAAAGGAGACAGAAGCAATTCATCGTGTATGTTGGAATGGCTTATGCCACAACCTTGATGAGTACCTCATTTTCCTTAACTGAGAACAACTTCTCCTTCCACCCCTGTAACACTTTCCACTAGGGGTGCAAGGAAAAAACGAAAAACCAAAAAAATTGCTTAAGCCAATTGAAAATCACTCATCAGGCCAGGTTGAAGTCGGTTGATTTCGCAACGTTGGGTTGGAAATATTAACAACCAAATATTATCAGTCGATTTCGGGTTTGGCAAAAAAAAGAGCTGAAAAATCGAACCGGCCAATATATATATATATTAAGTTTCAAATAATATTTCAAACACTTCCTCGGTTAAGTTGGTCAATAATCATCCTTGAAAACAATTGGTCGTGATTTTGAATCTGAAGGAGTGCAAAAAGTTTTATTTTATTTTAGATTTAATTAAAAAAGTGTTCTAATTTGTCTCTCTCCCAACCACATACTCGTCGCACATCCGTTGTTTGGTCAACCAAGACCTGAGCCGACCAAACCCGTCGGTCTAACGGTTTGGGCAGCTCAGTTTCTTAAAAAATTTGGTTCGGGTTTGATTCACAGAAATCCTTCACCGATTTGAGCAGTTCAATTCTGATTTTCTCCAAAAATGGCACCGAACCAAACCGCTTACACCTTTACTTTCCACACCATGTCCTTTATCGACAAAAGGATCAAATACCACCCCAAAGAATCAGTCTAACCCACCCCCAACTCCTGAATAATAAAATCGCCCACCATTTGAAATGATGCACCGCAATTCGATTAATATTTGGCTTGCTAATTTGCCACTAGCCCCCCTCCCGAAGTAGGTTGATAATCTTGTTCCACTGCTATCTTTGAGAAGCTAGCCAATCTTCACGAGATCTTTGCTTCCAATACATATCATAGTCCTCCAACAGTCTTGAAAAGCACCTAAAAAGTGCTTTACTTGCTTTTAATTTAGAGATTTTTTAATTAGATTTAATGTTATTTGCTAGTGCTTTTTAGATATAAATGAATAAAATAAGTTTTAGAAGTCAAAAGAACCAAACTGAACCAAAATCGGGTGAAAAATAGAAGAAAAGTGCAAAAACCCTAAAACAGGATAGCACTACGGGCGCTAGGGTGGTGCTGCCTTAGCGTTAAGAACCCGAGAGCATGGTTTTTGACACAGGTTGGGAGCACTGCAACGCTACAAGGAGCATCGCAGCGCTATGTAAGAAGCGCCACAACGCGCGTTGGGTTGGCATTGCGGCACAATGCTAAGGACTAGATTTTAATGATGGGCAGCATTTCATCGCTATCTCAGAGCGCTGCGACGCCAGCTTTCCTAATTTAAAATTTTTGTTTTTTTGGAAAGTTCTTGGGTTGCAAGTTTGTGAAATTCTATAAATTAGGAGGTTGTCAGTAGCCTAAGCACGAAATATCAGAGCCTAAGAGTGTGAGTTTGCTACAAATTGAGAGAAAAACTATTGGAGAAGAGTTGGAGGTTGTTCGAGATCACGAGGTGACGACCAAGTGGAGATTGACGAAGTTCAACATCAGGAGCAATTCGAGAATCTTGTCTTCCTAAGTTTCTCTTTCCCTTTATCTTTATGCTTGAGAACTCATATGCAATTATGTATTTGATGACTATATGTGGCTAAACTCTTAGTTTTAGGTATTGGATGATTTAGTTATGGATTTAAGTTAATGTCTTAGTGTTTTTCATGAATGTTGCTGAATGATATGTTTTTCAATATTAGTGTGCTTTATTCTCTATTGATTGATCATCAATGATTGTTAAATTAGATGTATGATTGAGTAATTATGTATGTCTAATTGGATCTATGGTATTGAATTTTTATCAATCTTTCATGAAAATAGCTAGATTGATGGAGAAAGTTGTTAATGATTATGATTAATGCTATGCTTCTTAACTTAGTTTCAAGAAATTAGTAATCAATTGAGTTGCATGAGAGTTTTTTAGAGAAAATAATCCGAATAATAGTTTTTACTTAAACATATTGTTTACACATAATTCCATAAAAACCTAAAGCATGATTAATGAAGTAATTAATGAAATCAACACCCTATAGTGCTTTTGTCTCTTTATTTTTAACTTGTCTTTACTTTCTTTATTTGTTTTCAAAATTCAATCACAAACTCGATTTCGATTCTTTAGATAAAGTTGATTCAATTCTAGAATAGCTAGGTAATTAAACTGTTCAATAGTTCTCAGTGGAACGATACTAGATCTTGACCATTTTATATTATAACTTGACCCGTGCACTTGCGGTTATCGCATCAAGTCCTTCAAAATCCTACTGTGCCTCCACCTAACTGAAAAGCACTCAAAAAGTACTTTCTTGGGCTTGGAACTTAGTTAGTCTTATGCTTAATTTGTGATTGTTGATGCTTTTTATATTTAATTGTAGGAAATCAAACATTTTGACTGGAACGAGCAAATTTGAGTGAAAATGACCAAAATAACCCCCAAAGAGGGCAAACTTTGACTTAGGGCAAGAAAAGATGTGAAAATAGGCCAAAGGGGGTGAAAATACGTGGAGAAGGGTGTGGACAGTGCGCTGCAACAAAAGCCTGGAAACAGGGTAGCAACGCAAGAAATTTCGCGCATCTGTTTGTTTTTTTAGACAACGTCGTGGTGCTGCGACAGAAATTATAAAAAGAATTTTTTTGTTGAGAGCTAAAGGGAGGTTGGTCTTAGGGTTTTAGAGTCCGTCAAAAGCCTCCACCGTGAGCCGAATTCTAGGTAGAGATGACGACTTGGAGCTTCAGAGGAGTCAATGAATGAGGAGATCATTGGAGGACAATCCCATGCTTGAGGACTCGAGTCAAGAGCCCAGCTTGCATCTCTTTCCCTCTTTAATCTTCGATTTTTCTGTACTTCGAACATCATGAATTGTCTATGTTTGTGTTGTAACCATGAGTAACTGAGTTGTGTTTTTAAAGTTTTTTATGTAGTTTTTGGATTGCATCAAACTATTTTATTTGTTTATTAGATTTATTGAATGCATGAACTATTTTAACGTGTTTATGTTTATTGCTTTCGAATAATTGGCCACTATTTGGATGATAATTACTTGATGTCTTGGTTGAGAGAGAGGGTGTTAGGTTATATCTAGCATGTTAAATTGTTAATCAATTATGGACGAAGGTGATAGGAGATTAATAGAGATTAAAGATGAAGGAATATAATGTTGTACTTAATTAATTGATTGCATGAAAATGAATTAGTGGTTAGGTATTAGAAAGGGTTAAGCTCGAGAGAGAATACCTAGATAAATTAAAAGACTTCTAAGTCTATAGTTAGCATAAAATCAATCTAAGGTTAAAACAAATAATTTAGTTAATCCATTAACGAAGTCATTACCCTAGGACGTGTCTTTGCTTGGTTTCGCTCCGGTGTTATCATTTAGTTTCTTTCTAGGACTAGATTAAATTAAGTATTCATCACAGTTCAGTTCCTTAGATAAAATTAGAAGAATCTCTAAGTAGCTAAAAGAATTAAAAACCAATTTCTCAAATAACGATATTCGATCTCTTGACCGTTTGAACTATATTATTACTCGACATGTGCACTTGTGAGTTATCACCAACACACCTCCCAGTCTCTATTTGCTCCACCAATACCTGCAACTCCTTCTTTCGTTGAATTGCACCCGCCAAAGAACCTTTATGTTATTGTATTTCCATGTCCTAAGCTCCTTTAAACATTCCTTCAATAATAATAATAATAATAAAATTTAAAAAATATCTACATCATTTAACCAAGGTTGATAATAATAAAAAATTGTTAAATGATTAATTTTAATTTTTTTAAAACATATTAACTAAATTTTGATATTTAAAAGTATATTGATTAAAATGGAATTAAATTCTTAATATAGAGTCCAAAATTGTATTTTAATCTCCAAATTCTTAATACACATGAATTCTCGACTATGAGGTCAAAGATTTGAATCTCCTAGACTAAGTTGCCGTACTAAAAAAGAAGCATTTTAACTCTTGCAAATTCAAGTTTTATCCCATAGGTTTTCTAAAATAAAAAAATCATTAGCCTAGATTAAATAGAGAATAGAAAGAGATGTCTTTCCCACGTAGCGGTAAGAAGAGTAACTTTTCGTTGACAAAAAGATATTATTTGACACATATAAAATTAATTATAAATAGATACTCTAAATAAAAAAAGTGGAAAGAAATAAAGGTATCTATCAATTTCTTATCCTCCTTGAATTTGAGACGTTGCATGTCTGTGAAGGGATGAAGCCTCATAAGATTGTCAATATAAATTTAGTCCTTAAACTTTCAAATCAGTGATTATTTGGTAAAAATGTCTAATAAGTAAATACTCTCTACGCATTCAATTTTGTTTCGAATATATCTCTACATTTTAAAAATGTTTAATATGTCTCTAAAATTTCAATTTTGTTTTTAATAACTCTATCACATATTTCAACTTTTAAAAAATTAACTAATCTAATAGATATAGAATTTTATTTAATGTCTAATGATATTCTAAACTTTTAATTTTGTATATATTCATAAAAATATATTCAACACTTTTTAAAGTTAAAAAACATATATGACATAAAATTGAAAATTTGACATTGTGCTAGACACTTTTTATTATGGCTAAAAGTCTGTTCGCTTTGTCCATTTTGTTGATTTTGGGGCCAACCAAAAATCAAACCAAACCAAATCGACTCATTTTATAAAGAAGAAAACCAAACTGATGTCTAAACCAATAGATTGGGTTTAATTTGGTTCAGTTTATTATCGGTCTAGTTCTCAAATTTAGGCCTTTTTTTTCGCTTCCAATTTTTCATTGTTATTTTGGCTTTTGTTTTGAATGGGCCCTTTCTACTATTTTTAAATTAGAATTGAGTTTTTTTTTAAATACTTTGTTTGTTTTTTTAGCTTTATTCTAAATAACAAACACCAAAGTGAACTCAGTACTAATTGGTATGACCTTTGGCTCTAGAGGTCGGAGATTTAATCCCCACCTCCACAATTGTTGTACTAAAAAATAATAAATATATATATACCATAATAATTTATTTTTTTTCTAACAAATATACATGCATCATAATAATAAAAATACTAAGGTGGCGTTTGGCACGCAAAGTTGAGTTGAGTTGGTAATTATTGTCTGCGGAGTTAAATTATCGTAATTATTGTCTAGTCTGTGTTTGGGGTACAGAGTTGAGTTAAGTTGCGGTATCTGGTGCAGTTTTTCTAATTTAAATTCATTTTTTTCTCTTGTTGATTTTAATTTTCAATTATGCACATATTTTCTTAACTTTTTTAGGACAAAAAAATAACTTCCATATTTTTATCATTCTTAAAATATAACAAATTCTCTACAAAGTATTCATATACTAAACACAAAATTATTCAATTTTTGAACATGATTATATAACATATTTTTCTCCATTTCTAAATACCAAACATATTCCAAATAAATTGTAACTAAACACAGGTACTTAGCACTCAAACATGAACACCAAATAATTTTAAAAATTGGACAACATTTTTTTCTCTTTTTGAAAAATGTAACAGATTTAATTTTAATAACACAATTTGAACACTCAATTGCAAACAATTATATTTTCTACCCTAATACATGTCATATTCCAATAAAACGAACAATTTTCAGTCACTTTTTAACCTTCAATGTCTTCCACAGTTGATATATATATATATATATAATCTCACTAACTTAATATTATTATAAAAAATTTAAAGGTGCTATACTATAGCAAAGTTACATTGTTTTTTACATCACAAAATAATATAAGACGGCCAAACATGTGTCTGGTTCAAAAAACAAGTTAACAACAAAAAAGGGGATTGGGTTGAAATATTAGGTGGTCAATCTAAAGGGTCCGACCAAGTAGACAGATGCAATAACGTTTTCATTTTTAATCCAGTACAACAAGGAAACAGTCAGTCTTTTGTATGTTTGTGCCAATGGTGTCAATAAGGTCGCATTTATCATCATCAGTTGGCCCGTCAATAGCAAATATTGTGTCAATTACCTCCTTTCGATGTCCAAATTCCAGCTCGTAAATGGGTGTTTGAGCATATATTAA

mRNA sequence

ATGATATCCTGCAACACCCGCCAACAACAAAACTTTACCTTCAACGATAATTTACTTTTCCAGAGGAAATTCCATAAGGCCACTGTCATCTCTACAGATGATGGTGAACCCTCCCCAAGTGAAGCCAAATTTAGACCCAACATGTATGCACTTTTCATCAAAACGACACCTTGTGTATCTAGTGACCACCCCCCTCCCGAATACAACAAGGAAACAGTCAGTCTTTTGTATGTTTGTGCCAATGGTGTCAATAAGGTCGCATTTATCATCATCAGTTGGCCCGTCAATAGCAAATATTGTGTCAATTACCTCCTTTCGATGTCCAAATTCCAGCTCGTAAATGGGTGTTTGAGCATATATTAA

Coding sequence (CDS)

ATGATATCCTGCAACACCCGCCAACAACAAAACTTTACCTTCAACGATAATTTACTTTTCCAGAGGAAATTCCATAAGGCCACTGTCATCTCTACAGATGATGGTGAACCCTCCCCAAGTGAAGCCAAATTTAGACCCAACATGTATGCACTTTTCATCAAAACGACACCTTGTGTATCTAGTGACCACCCCCCTCCCGAATACAACAAGGAAACAGTCAGTCTTTTGTATGTTTGTGCCAATGGTGTCAATAAGGTCGCATTTATCATCATCAGTTGGCCCGTCAATAGCAAATATTGTGTCAATTACCTCCTTTCGATGTCCAAATTCCAGCTCGTAAATGGGTGTTTGAGCATATATTAA

Protein sequence

MISCNTRQQQNFTFNDNLLFQRKFHKATVISTDDGEPSPSEAKFRPNMYALFIKTTPCVSSDHPPPEYNKETVSLLYVCANGVNKVAFIIISWPVNSKYCVNYLLSMSKFQLVNGCLSIY
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi09G011350.1Lsi09G011350.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Lsi09G011350Silver-seed gourdcarlsiB204
Lsi09G011350Silver-seed gourdcarlsiB713
Lsi09G011350Silver-seed gourdcarlsiB876
Lsi09G011350Silver-seed gourdcarlsiB981
Lsi09G011350Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB101
Lsi09G011350Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB163
Lsi09G011350Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB173
Lsi09G011350Watermelon (97103) v2lsiwmbB015
Lsi09G011350Watermelon (97103) v2lsiwmbB026
Lsi09G011350Watermelon (97103) v2lsiwmbB029
Lsi09G011350Wax gourdlsiwgoB007
Lsi09G011350Wax gourdlsiwgoB043
Lsi09G011350Wax gourdlsiwgoB051
Lsi09G011350Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB341
Lsi09G011350Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsilsiB011
Lsi09G011350Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsilsiB017
Lsi09G011350Cucumber (Gy14) v1cgylsiB329
Lsi09G011350Cucumber (Gy14) v1cgylsiB412
Lsi09G011350Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB225
Lsi09G011350Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB331
Lsi09G011350Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB465
Lsi09G011350Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB534
Lsi09G011350Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB811
Lsi09G011350Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB213
Lsi09G011350Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB320
Lsi09G011350Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB329
Lsi09G011350Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB450
Lsi09G011350Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB518
Lsi09G011350Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB733
Lsi09G011350Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB797
Lsi09G011350Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB101
Lsi09G011350Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB107
Lsi09G011350Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB254
Lsi09G011350Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB484
Lsi09G011350Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB584
Lsi09G011350Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB697
Lsi09G011350Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB088
Lsi09G011350Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB149
Lsi09G011350Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB156
Lsi09G011350Cucumber (Chinese Long) v2culsiB090
Lsi09G011350Cucumber (Chinese Long) v2culsiB157
Lsi09G011350Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB025
Lsi09G011350Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB029
Lsi09G011350Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB016
Lsi09G011350Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB029
Lsi09G011350Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB032
Lsi09G011350Watermelon (97103) v1lsiwmB017
Lsi09G011350Watermelon (97103) v1lsiwmB040
Lsi09G011350Cucumber (Gy14) v2cgyblsiB083
Lsi09G011350Cucumber (Gy14) v2cgyblsiB136
Lsi09G011350Cucumber (Gy14) v2cgyblsiB143
Lsi09G011350Melon (DHL92) v3.6.1lsimedB027
Lsi09G011350Melon (DHL92) v3.6.1lsimedB032