Lsi09G005080 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi09G005080
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionUnknown protein
Locationchr09 : 5316855 .. 5321557 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACGAATTTGAATTATGGTCTTTATAATGTCTCTTATTGTAGGAATAATTATTCATTTAGAGTTATTTTGATGAATATCAAATTGTTGTGTATGTTATATTCTCTTTACAATTCATTTGGGCATTTCAAATAGGAATCAATATTCTATTTCACCTGTCTAATGTTTCACTTTTTTATTAAACTTTACAATTTTGAATATGTTATTATGTGATAAATTGCACACCATTTGATTCTTAGTGTTCATTCAAAATTTATCCTAGTTATAATTCCTTCAATTTAAATTAATCATCCTATTATAATTCCTTAAATTTAAATTCGTACTAACAAATTGAATCTTTGATGCAGGTAAATGCTACACAAAAATATCTATGATCAAGAACTTTAATCTCTCATTAATTTTGAACTATATGCTAAAATATTTTATAGCTTTCCTTTCATAATAATCGATGTAATAATATATGCTATTATATGAATGCTAAATTATTCGAGATTTGGCTGATGAAATAAAGTCTATTTAAGAATTTTACAAAATTGACTGAAGAAAGTCAAAATGAATTTATCTCCTTTTTTAGGTAAAACTTCCATACTGTTAGATATTGGTTAAGTTGCTAATATATATATCTTTTTAAATTCTACTTGAACTTCTTTGACAAAGGATAACATTTCTTTAGGCGCTTGTAACTTCAATAACGTCTAATCTTTGATTGTAATTAATCTATACTATATTAAAAGGCAAAAATTCCTTAAAAAAACATTTTTAGACTACATTATCCTCTTTAATTTTAATTTATTACACTTATGCCATTTCAATAGTAATCATGGAAATTATTTTTTGCCATTATTTTTTGTAGTATTAAAATTACATTGAAGTTAACTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTCATAAACGTGTAAAGCCAAAAAAAATGAGCTTTTACTTTTTAAATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAGAAAAATAAGAGAAACTATTTACACAAAATAACAAAATTTGTAGATAGTTATGATAGATGCTGATAGAAGTCTATCAGGGTCTATTAGTGATAGAAATGAGAGAGAAGTCTATCACTGATAAATGTTGATAGAAGTCTATCCTGATAAAAGTCTATCAATGTCTATCGGTATTTTTTTTATTATTATTTTCTGTAAATAGTTTGACATTTTTTCTATTTGTAAAAATTTTCCGTATTATTAAGTTAAATGCCAAATTAATGTCAATAACAACACACACTACTATGGTTTTATTTTATTAATTTAATTAAAAATCAAATTAAAATTTTTTTTGTAACTCTTACCTTCTATCACTATAAAAATGACGCATCATTCTTCACCAACACCTAAAGTTTTATCCTTTCTTCATTTTTGTTATCTCAATACATTCTTCTCAAAGCCACTTTAATCCTTAAGATTTCTCAAAGATGATGATACATTCAAGTTGCAAAGGATCACATGACGTCATATTTAATATCTTGATTTTTAGGCTTGTGATGTTACAACTCAACTTTGATGAAGTTAAATAAGAGTTTTTGCCTACCGATTGTTATGTGAACAAATCTATTTGAGAAAATATGAGTATATAAAAAGAGTCTTTCCGCCCTCTTATAATCAATGTACTATTTTTTGTTTGGTTGAAAAAAAAATGAAAATTTAGGGGTCATTTAGTTTAAGGTTTTATAGATGTTTGGGTATAAGATATTGGGAATAAAGGATGACTGTGTTTGGTTGTGCATGTATCAGAATTTTATGAATAAAAATTATGTTTGTATTTAGTTTATGAATTTAAGCATGTCAATCTTATATAATTATAATATATTAATTAATTAATAATCAATAATAATTTTAATTATAAATATTTGAAAATGGAATAATTTATAATTAATCAATTAACCAATTAATATAGTTAATTAATGTCATATTACTTATAGTCTAATGCTTAATCATTTTTATAATTAATTAATTTTAACATTAGTGGTTTTAATTTTAATTAAATAGTATAAGAAAATATATTTTAATAAATCATATATTATATAAAGTGAAAAAATGAGATAAAAATATGATACGTTAATAAATATAATAAAGTCATAAAAATATTAACAAACTAAATTTGAACCTATTTTATTAATGTATAAAATTAAACTTAAATAATTAAAAAAACAATTGAACTAAACAATATTTCACTCAAATTATTTAAAATTTATTAAACTCACTTGCAATGCACGTAGTAAAAAACTAGTATTATAAAATGATGTAAACTTTAAAGCTTTAACAATATGCAACCTAGGTAGGCATTTATGCCCAAATTAACACTTTATACCTTGTATGTTGCATCTCAATCCAAGTCTTGCAACTCAATCTAATCCAAATCCATATTAAATCTCCTTTTATTGGCTCCCTAGCTGGTTGTTGAGCTTACAGAAGCAATCTCTTCAAAAACTACAACTCTTCTACTATTGCTATAAATTTAAGTGCTTTTTGTTACAATTAATCGCTTATCATTGGCTTATCTTTAGCCTTTTTGCGATTATGTACTCTCCTTTGGACTTAATGAATATATTCGATTGGGAGATGATGTCGGTGCTAAGAAGGTGTCCACCTAGTGGAGATGTTCGGGTGCACCCCTGATCCTCTGTATCCTTTTCAAAAAGAAAAAAAAAAGACCAAAAGAAAACAAAGTGAGATTCACTTTGATTTCTTACGACCCAACCATAAGTAGAAATGCGTATAGTTCAACTATCGACCTCAACATTTAATTCAACAATCCATTTATCAAAACTTGAGAAATTTCAATAGAAATTACTGTCGTAACATTTAGATTATTAAAGTTCAAATCAACACAAAATAGAGCTGGGATATACTTATATTATACAAAATGGTAAAGGACTTACATTTTAATTTTATCTTTTCAAGGAGTACTGGAGTTCTCTGTATATAAAATTTTAATGTATATATAAATATATACATAGATACAAATTTGATTATGCAAAACTAATGTTTAATCAAAAGGGTCGATTTGAAGAGTAACCTTATGACTGCTATTTTGTGGTGCTTATGGCTTGAACGTAATAGAAGGATTTTCCAGGATTCCATCAAAAACCAAAACCAACTCTGGAAAGACATTATTGCTTTGGCTGGTCTTTGGAGCTCCAAATCTCATTTATTTTGTAATTATGATGCTTCTTCTATTGCACTCAACTGGAATTCTTTTTTGTAACTCATTCCATTTTCCATTGTTGTCCCCCTTTCGTTTTGAGCTGTCCTCTAGCTTTTTGTACTTAACTTTTGATCGATTGAATACATCGCTATTAGTATCGGGGCATGATGAGGGTGTTACGGAGGTGTCAACCTAGTTGAGATGTCCTGGTGCACCTCCTGATCTCACTATCCTTTGGTATCTTGTTCAAAAAATCAAAAGGGTCGATTTGTGGGTCGTGTTTACGAACCATTTCCATACCAGTACGAAGAGACGTAGGGCACATAACCTACATAATAGAATTTGGAGTTAATTAAAAAGCTAGCTTCTCCTTTCCATTTGTGAGATTCATTGCTCTAAATACAAGGGTGGAAGTCCCTCAGTCCAACAAAACTTTTAGGTCAACTAAAAAAACAAATGCCTTTCCAATTGAAAGATAATAGGTTATCAATTGCATATTCAATTTAGACCATGTGAAATTTATGGATATTTCAACATATGCTTTTTCCATCCAAAATGAATATTTAATTCTTATTTTTTGGTTCAAGTAAATTATATATTAATCTTAAACCCTTTCAAGTCAATTACATATTCAAATCAATTCACTACAAGGAATTGGGCCTTTAATGTCGGTTGAAATAAATTGGCTCGAACGTACAATGTCAGTTTTAAAACACGATCTTCGATGCCGGTTGTCAACCGACATTGTACCTCTATAATATATGTTTTAAACCGACATTAAAGTCTAGTTTTGTACTAGTGATTTAATCTTGCCACTGTTTTTTATTTATTTATTATTATTATTTAACCAAAGAGCATGTTTTATTGATTTAACCAATGGGAAGATGTCTATGCTCCAATATTTTAAAGTATCAGTGGTTAAATGTGTCTATACGTACATTATTCTTGTAACTACCACCTCAAACATGATAAAAGTATTAGTGGTAGTTCAAGAAATCATACATTTCTTAATTCTGAACAATTTTAGCATATCTTTCAATTTTTGGTACCGACAGAGGCTGATCTTCACCATTTAAGATCGATATTGGCTCGATCAGCACAAGAGTTCCTATGTTTGAACAGCGAGTGTATGTGCCAAATATCCTGCTTCAATAACAAATTTACATCTCAAAGATTGAGGATGAAACTTTAACAAAAACGATTATCAGCACAATGTCTTTAAGTCAAGTTAGGAACTCAATATGTTTGCATTCTTTTATGCTCCTGTTGCTTTACATTGCTTACTTCAACAACCATTAGGGTTGAAATCAACTTGACTACAATTTGTCACATGAAGCATATTAATAATAAACATACGAATTTAACTTGCATGAAGAAATTCAATTGATTATTTCATATTTTCACTGATGCAACATGAATGCATCAGGTTGTAAGTTCTATATGCACTCCACAAGCCCAAAATTTCTAACTCTTGATCTTTGCGTTTTGTCTCATCAATTTCAAGGTCCATAG

mRNA sequence

ATGACGAATTTGAATTATGGTCTTTATAATGTCTCTTATTGTAGGAATAATTATTCATTTAGAGTTATTTTGATGAATATCAAATTGTTGTGTAAAACTTCCATACTGTTAGATATTGGCGCTTAGGCTGATCTTCACCATTTAAGATCGATATTGGCTCGATCAGCACAAGAGTTCCTATGTTTGAACAGCGAGTGTTGTAAGTTCTATATGCACTCCACAAGCCCAAAATTTCTAACTCTTGATCTTTGCGTTTTGTCTCATCAATTTCAAGGTCCATAG

Coding sequence (CDS)

ATGACGAATTTGAATTATGGTCTTTATAATGTCTCTTATTGTAGGAATAATTATTCATTTAGAGTTATTTTGATGAATATCAAATTGTTGTGTAAAACTTCCATACTGTTAGATATTGGCGCTTAG

Protein sequence

MTNLNYGLYNVSYCRNNYSFRVILMNIKLLCKTSILLDIGA
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi09G005080.1Lsi09G005080.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Lsi09G005080Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB266
Lsi09G005080Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB345
Lsi09G005080Watermelon (97103) v2lsiwmbB007
Lsi09G005080Watermelon (97103) v2lsiwmbB028
Lsi09G005080Wax gourdlsiwgoB010
Lsi09G005080Wax gourdlsiwgoB032
Lsi09G005080Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsilsiB018
Lsi09G005080Cucumber (Gy14) v1cgylsiB108
Lsi09G005080Cucumber (Gy14) v1cgylsiB201
Lsi09G005080Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB261
Lsi09G005080Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB301
Lsi09G005080Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB531
Lsi09G005080Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB625
Lsi09G005080Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB248
Lsi09G005080Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB289
Lsi09G005080Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB517
Lsi09G005080Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB614
Lsi09G005080Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB133
Lsi09G005080Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB314
Lsi09G005080Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB583
Lsi09G005080Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB243
Lsi09G005080Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB322
Lsi09G005080Cucumber (Chinese Long) v2culsiB322
Lsi09G005080Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB013
Lsi09G005080Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB039
Lsi09G005080Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB008
Lsi09G005080Watermelon (97103) v1lsiwmB016
Lsi09G005080Watermelon (97103) v1lsiwmB031
Lsi09G005080Cucumber (Gy14) v2cgyblsiB230
Lsi09G005080Cucumber (Gy14) v2cgyblsiB294
Lsi09G005080Melon (DHL92) v3.6.1lsimedB013
Lsi09G005080Melon (DHL92) v3.6.1lsimedB043
Lsi09G005080Silver-seed gourdcarlsiB339
Lsi09G005080Silver-seed gourdcarlsiB648
Lsi09G005080Silver-seed gourdcarlsiB943