Lsi08G007940 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi08G007940
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionUnknown protein
Locationchr08 : 16332349 .. 16337345 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
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ATCGGCTCGCCGACTTGTCCCTCAAGATATCTCGATTCATTTTTTCCAATAGAAATCAGGCAACTCGAGACTCCCTCGATCTTCCCTGCTCGACGGCTCTCTCACAAATACTCTCCCAAGGTTCTTAGCTCATTTCTCTCTCCATTTTTTATCTGCCTAGAATTTAATGTAAAATTTCTCACTCTCGACTATGCTTTACTGTTTGTCTTGTGAATTACGGTGTATTTGATGGCTTGTTTTATAATTTCTGATGTGATTCTCCGCAGAATTAGAGGGGAAGAGAACGAACATATGTATTTGCTTGTTTTTCCTTTTGCTTCCAGTCCTCTCCTCTGTGTCTGCTTTCTTCTCTGTTTTTGTCTAGTATCTGCAACCTCATCTCTACCGAAAAAGTATTGAATGAGGCCACCTCAGTGTGGCTGCGGGATGCCTCAAATAACCGTTTCGCAGAATAAAAAGTGTCCAGTTTCTGAGCTCTCAATTATGTATTTGGAAAACAGAAAAATTTCAGAACTTAAGACCAAATATTTGATATTTGAAGGTTACCGTTTTCAAAGATTTCCTTTTCCTTTTCGAATAGGCTGTTGTTTGAACCCCCCCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAATGTCGCGTTACTGTATGTACCCTTCCTTCAATTGCCAAAAGCACATGTCAATATCAGTTGATATGTACTCATTTCCTTAAGGTGGAAGATTTAAATCTCCCCACTTCCAATTGTAGTACTTTAAACAATGTAAAAATCCCCTTTAGTTCATGGAATTATTTTAGTACAACTTTAAAGTGTAGTTAGATGTTGTGTACGTGGAGAATAGTGGGAGTGGGTGTTACTCCTTTTATCTTATGGTCTTATATTTTGATAGACCTGCATGGTCTTGTTACCAGTTGATCTATAAACTTAAGAGACGTTCATGATTGTGCTATTGATGATGTGTTGTTTCGATGAGTCGACAACATCAACATTTTACATAGATTTTATGAGTACACCTGTAGATTATAGAGGTTTTTGGTACAACTAGAGGTTATATTAAATTTTCAGTGAGCTTCATATCTGAATAAATACGTGACTAAGCGTGCTTAAAAAAGTCTCTATATGTAGGGAGAGTTCAAAAAACCAGCGTAAAAATTGCCTGTTTGGTCAACCTAGGTCAACTCTTCCGGGGTTGGCTTGGTGTGGAAATTCAAGTTGGATAAACAATCAAACTAAAAATTTGGGTACATTGACTCCCTCTTTAGGATCCCCTTGTTTGGTTTGTAAGACCATTGAGAAGCTATGAGGGATTTCTTGTGGGAAGAGGTAAATGAAGGAAAAGGGGCCTACTTTGTGAACTGGGACGTGATTCCCTCTTGAGCCTATGGTGGAGGATTATTGCAAGTAAGTATGATTTCACCCCTTTGAGGGGCTGTCAAATGGGATTAAAGACCCTCATAGAGATTTGTGGAAGGATATCTCTATTGAGCACCCTTCTTTCTCTCATTTAGTCTTTGGGGGAGGGGATGAAATGTATTTTTGGGAGGATCATTAGGTGGGGGATAGACCCCTTTGCACTAGGTTTCCACGTCTTTACCATTTATCTTATCCCTTTCAAAAAGTTGTTTTGTGATTGAGTTCTTAGTATGGTCTGGGTGCTTCCTCTCTTTTTGATTCTCCCGTTTTCCTTTGTCCTATAGATAGATGCCACAATGCTCCTGTCTTTGATAGAAGAGTTTGATTTTAGGATCAGGAGAAGTGATGTTTGTATTTGGTGCCCTAACCCTTATAGAGGCTTCTCTTGTAGCTCCTTTTTTCGTTGTTTGATGGACCTTCACCTAATAAGGATTCTTCTCTTGGCTCTATTGAATATTAAGATTCCAAAGAATGTTAAGTTCTTTTTCTGGCTGGTTATCCATGGACAAGGCAACACTTCGGTTAGGGTCTCGAGAAAGTGACCTTCATCGGTTGGCCCATTTTTTTGTATCCACTATTGGAAGACAGAGGAAGACCCGGATCATAGCCTTTGGAGATTGACTTGATGCGTTTTATGTGGAGTGATTTTTGTAGGTGTATGGCTTTCTGTTAGTCCGCCATAGAGATTTGAATGAGATGATGGCGGATTTGAATGAGATGATTGAGGAATCCCTTCTCCATCCGCCTTTTAAAGAGAAGAGTTATTTCTTGTGGCTTATTGGGGTGTGTGTTTTATTGTTGAATCTTTGGGAAGAGAGGAATAATTGGATGTTTAGAGGTTTGGAAAGGGATTCAAGTGATGTTGGGTCCCTTGTCCTTGTTTGATTCCATGTTTCTCTTTGGGCTTTGGTGACAAAGGTTTTGTTGTAATTATTCGATAGACTCATAGACATTATTTAATAACACTATTGGAGTCCCTTCCTTCATTGCGCTCCCCTTTTGTGGGCCCCTTTTTTATAAAAAAAAATGCTTGTGTACTCTTTCATTTTTTTCCCCAAGTTAAAAGGTTTTAGGAAAGAGGAGGGGGTTGTGTATCTTTCACTTGTTAATTTATTTCAAATTTTTTGCTGATCTATCAGAATACTAAAGATTTGTAGATCAAAGTGAGCTTTGTGATGGCAACTGAACTGAAAGCAGCTTCTGAGGAAGTGAAAGTTGACCTCTTTGAGGATGATGATGAGTTTGAAGAGTTTGAGATTAATGAAGGTTTGACTTGGAACTATTTGTCTTTTCTATTCCTTCCCTTCTTTGCATAACTTCATGATCGGCTTTAAATTGCACTCGTTTTTTGTTTATCAGTGCTTGTGTTGTGCAATTTCTCCTTCGTTTCAGCCGAAAGAATGTGAATGTTGTGCAACAGTCTGGGAATCCTGCTACTGACTCAATCCTAACTGCTAGCATTCTTCATTTGGATGCCTCATTACTGTTGCACTCATTTTTTTTTGACAGAGACCAGTCTGTGTCAAAAAAAAAAAATCATTATTTCGTAGTAAATTCTAATCCAGAGTATGAAGAAAATAAGCCAAAATGTTTGTAAACTCAATTGTAATAGTAACAATCAATGAAACGTATTGATGAGGTTAAAGAAAAGTTGGAATAATGCATGGTTTTTTAAAAAATATGCCCCGTAAGTGTACTATATTTGGATGGACCTTTTTCTCTTTAAAAATTAAGCTATTAAAATTCTCTAGCTGTTTGTTTTAAGTTAATGTAATAACTTTTTTTAAAAAAAGAAGTTTATAGAATTACTTCTTTTCCAAAAAGGAAAAAAAAAAGGTTTTTATGGAGTTAATTTCTACTGTGACATACATATTCCTTGTATGCTCAAAAGTGCGTGGGGTGGTACATAAGGAAGCTGGTAGAATAGCTTTTGAACGGAGTTTGTTCAGATTTTGCTTTGATTACTGAAATGGTCCTGGAAGAGTAAACTTTTTCCAATTTATATTCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATGATGACCATAAAACCACTTCTCTTTGTTCAGTGGAAGCGGGCGCTTTTCTTCATTTTTCAGAAATGGTTACGGTTACTTGATTGTTAGAAGAGAATAAAGAATCTTTAGTTTTTCATTCAGATCATATGGTTGCTTGATGATGTTGTCAACTGAAACTATGATTTGAAGGTCCTGCAAGTCTTGCATTTCCTTTAAAAAGAAAAACATTTCAGCGACAAGGAAGTTTTGGAGTTTGTTAAATGGAGCATTAGAGATTGTTGGTGTGTGAATACTAAACTCTTGATAGCTTGTTAATTTAACTCCCCAAGTATGTGCTTGTATATGTCGCACTAGTATAACATTGTGTTAGCAAAAATTCGTCACAATGTGTTGGCAAAAATTCTTGTAAATTTCGAAATGAAGTGAAGGATTTGATGCATTACTAGTTAAGGGTGAACTTGTGACTAGAATATCTCTCTCAAATAGTGTCATCACCAGATTGTAATTACCAGTTGGGTAGGCAGGCGGGTGGGAGCAATTCTGATCTTGTCTGAGAGCCTTTATGCATTTATTACTATTTATCTAGAGTGTGCATGGGGTGCTTCAGTGCACTGATCTCACAGAACTAGCACTGGATTCTATGACGTTATAACATATGACTGTCAAGAAACTCGTGAGATTTTGTTCTAAGTAGGTAACCACCATGAGGTTTTTTAACACATTCCTTCAAGGTATTTTTACTTTTTCACATGCTCTAGGGCAATATTAGGGCAGGTTCTTGTTTGAGAGCATATAGAAGTTAGAAGTTAGAACTTTGTAATATATATCATATAGGTCATAGTCCTAGTCCTAGCAAAATATTGCTGCTAATCAGAGAATTCAGAGATCGTTTCTTCCTTTTCAAATTTATTTTGCAACTCTAATCTTCCTCAGATTCTGGTGTAAAACTCATTACTCTGCTTCTTGTTGTTGGCCTAACATCTTTAAGCCTTATGATATTCTTATAATCTTTCCTTCTGGTTCTCATTGGTAAAAATCGATTACAGAGTGGGAAGTCAAGGAAGGCAAAGAAATTACTCAGCAGTGGGAAGATGACTGGGATGATGATGATGTTAATGATGACTTCTCGTTGCAGCTTAAGAGAGAATTGGAGAACAATGCTGAGAAAAAATGAAGAGACTCTAGGCACTTCCTTTTTATCTGCCAACATCTATGTTTTATTTGCGCTGTTTGACCTTCAAGATGGTTTTATTATGCCTTCTATCTCTCAAATATTGTCATTAATATGCTCAGAAGCCCGAATTGGAAACATTATTAGCATTTAAGATCAGCATATTGAACACCTATGGCCGTTGGCCCAGGAGATAAGGCATTCAGTTAATTTAGTGATAATCCTTGCTTTTACAATTCACTTCACTTTCAAGATTTGTCAAGTTATTTAAGTTATCGGAACAATTACAGTTATAATTTCGTTGTAATTCTATGGTAGTCGCCTATTTAAATTTTATGAATTTTCTGTGATCGAGTAATTGTTCTATGACATTAACTAATGTATCAGTAAGCTCATTATGTATTGTCTTG

mRNA sequence

ATCGGCTCGCCGACTTGTCCCTCAAGATATCTCGATTCATTTTTTCCAATAGAAATCAGGCAACTCGAGACTCCCTCGATCTTCCCTGCTCGACGGCTCTCTCACAAATACTCTCCCAAGAATACTAAAGATTTGTAGATCAAAGTGAGCTTTGTGATGGCAACTGAACTGAAAGCAGCTTCTGAGGAAGTGAAAGTTGACCTCTTTGAGGATGATGATGAGTTTGAAGAGTTTGAGATTAATGAAGAGTGGGAAGTCAAGGAAGGCAAAGAAATTACTCAGCAGTGGGAAGATGACTGGGATGATGATGATGTTAATGATGACTTCTCGTTGCAGCTTAAGAGAGAATTGGAGAACAATGCTGAGAAAAAATGAAGAGACTCTAGGCACTTCCTTTTTATCTGCCAACATCTATGTTTTATTTGCGCTGTTTGACCTTCAAGATGGTTTTATTATGCCTTCTATCTCTCAAATATTGTCATTAATATGCTCAGAAGCCCGAATTGGAAACATTATTAGCATTTAAGATCAGCATATTGAACACCTATGGCCGTTGGCCCAGGAGATAAGGCATTCAGTTAATTTAGTGATAATCCTTGCTTTTACAATTCACTTCACTTTCAAGATTTGTCAAGTTATTTAAGTTATCGGAACAATTACAGTTATAATTTCGTTGTAATTCTATGGTAGTCGCCTATTTAAATTTTATGAATTTTCTGTGATCGAGTAATTGTTCTATGACATTAACTAATGTATCAGTAAGCTCATTATGTATTGTCTTG

Coding sequence (CDS)

ATGATGATGAGTTTGAAGAGTTTGAGATTAATGAAGAGTGGGAAGTCAAGGAAGGCAAAGAAATTACTCAGCAGTGGGAAGATGACTGGGATGATGATGATGTTAATGATGACTTCTCGTTGCAGCTTAAGAGAGAATTGGAGAACAATGCTGAGAAAAAATGAAGAGACTCTAGGCACTTCCTTTTTATCTGCCAACATCTATGTTTTATTTGCGCTGTTTGACCTTCAAGATGGTTTTATTATGCCTTCTATCTCTCAAATATTGTCATTAATATGCTCAGAAGCCCGAATTGGAAACATTATTAGCATTTAA

Protein sequence

MMMSLKSLRLMKSGKSRKAKKLLSSGKMTGMMMMLMMTSRCSLRENWRTMLRKNEETLGTSFLSANIYVLFALFDLQDGFIMPSISQILSLICSEARIGNIISI
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi08G007940.1Lsi08G007940.1mRNA