Lsi08G003870 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi08G003870
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
Descriptionbasic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
Locationchr08 : 10669510 .. 10673423 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSthree_prime_UTR
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AGCTTGGGAGGAAGAAAGAGGAAAAGAGAAAATGAAGGGGATGAGGAGAAGCCAAAAGGAGTGATTCATGTGAGGGCAAAAAGAGGCCAAGCTACTGATAGTCACAGTTTAGCAGAAAGGGTAAACTTTCTAAATTGGTTTGCTGATTAAAAATTAAAAAGGGGGAGTTTTTAAAAATAGAAAAATAAGGAAACTATTTACATAAAATAGCAAAATTTTTGGATAGTTGTAATAGACGCTGATAGAAGTCTATCAGAATCTGTCGGTGATAGAAATGATAGAAGTGTATCACTGATAGATGCTGATAGAAGTCTATCAATATCTATCCGTATTTTTTTTACTATTTTCTGTAAATAGTTTGACATTTTTTCTAAATGTGAAAATTTTCCAAAAACAAATGGAAAAAATATTGAGGTTTTTGAATTATTAGAAAAATAAAGATGTTTCTTAATTAAAATTAATAAGCTTGTTAAGAGAATATTTTTCTTGTTAATGAATGTATGTTGTCTAAATTAATTTGGATCAACAATTTGATTATTTAGACCCCATTTGATAATTAGTTTTTAATTTTTGGTTTTTGAAAATTAAGCTTATTTTTTCTCAACTTCTTAGCATGGTTTGCATCTTTCATAAGCAAAAGGGTTGAAATTATTAGCTAAATTTAAAAAACAAAAATAAATTTTTACAAACATTGATAAAAAACCGCTAACAATGCAAGAAATTTAGTGTTGAATTAATGTTTATATGTTTAATTTTCAAAACTAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACAAAAACCAAGGTCCCCTTTCGTAACTATTTTGTTTTCGATTTTGATTTTTGAAAATTAAGCTTATTTTCTCATTCTTGCATTTTTATTGAGTACAAGAGTTGAATTTTTAGTCAAATTTTAAAAATAAAAATAAATTTTTAAAAACTATTTTTTTTTAGTTTTCAAAATTTTGCTTGTGTTTTTTGAAAATATGGATAAGATAAAGAAGGCAACAAAAAATTAGGGGTAAAAAATCTTTAATTATATCCAACAATATATGTTTTTTTTTATTAGGAAAATTATTTGAAATTTGAACTTGAGAGAGAAAAAATATGTGCGGTGACTTTTAGAAGTATTAAGGATTTACAAATTGCTATTTGGTTATAGGTAAGAAGAGAGAAAATAAACCAAAGGCTGAGATTCTTACACGACTTGGTTCCAGGATGCTACAAGGTAATCAACACAAGGACGATCAAATCTACAGTTTTTTTTTTTTTTTTCAATTTTGGTAAGAGAAAAAATATTGAGATTTTTTCTTATAACTTTTATTTATTTATTTATTATTTTTTTTTAGACAATGGGAATGGCAGTTATGTTGGATGTGATCATAAATTACATCCAATCTCTGCAGAATCAGATAGAGGTAAGTAAATATACCATAAAACACAACGTTTAGTGGTATAAGTTTTTGAGTTTAATAGTAATTTAAATGTCATTTATGTGGAAAGTTTTTTTTTTCAATTTTGTATGTCTAAATGTTCTGATTTGAGTCATGATTCTAAATCCATGCATGTGGAGGAGTGGAGAGAATATATTAGATGAGTTGTTTTTAAATATAGAAAAATGATTCAAACTATTTATAAATATAAAAAAATTTATTGTGTATTGCGGTCTATCGCTAATAGATAGTAAAATTTTTCTATATATTGGTAAATAGTTTGATATTTTTCTGTTTATAGTAATTTTCCTATTAAATGATTAATTTTTTTTTAAAACAAAAGGTTTAGTTACTTTTTTTTTTTAATAGTATGTAGGATGATGACATTCGTCGAATCTCAAACTCCAAAATTTATAGTTTAAATTTATATTAGTTGAGTTATATTTATATTGGCTAAAAAAAATCTATAAATGAATTGCGAAAATATTGTTTATAATTTTAATTTTAACAAACAGAAAATTATAAATAAAATTGATTATAAAAGAAGATATTAATTTTTAAATTTTGTTAGTTGTTATATCAAGCTAATTTAATATAGTATTGTTTTTCATAAAGAAAAAGCTCACAACCCCATAGCGAAAAAGAGCGTATAGCCCAATTGATAGAGAGCATATAGTCCAATTGATATTTATATATGTTAGCGACCAAAAAATTTATAGTTCAAATCTCCAAATGCTTATTGCATTAAAAAAAATGTGGTTTAGAAATGGTGGTTAAAAATGTTAGGATAATATATTAATGATTAAGTTTAAATATCTAAATTCTAATACATATATTAATGAATTCTATAATAACACTATATAGTAAGTAAATAATAAAATGACTCCAATATTATGTTAATTGTTAATCCTAGCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAAGTTTCTCTCCATGAAGCTTTCAGTTGCTAGTCGCTACTATGACTTCAACAACAGCTCGGATACTAATGGCATTGAGATAATGCAGGTACGAACTTTCATGACATAATTTATCCTTCTACGATATAATAGTTTAAATCTTATTTTGGTTTCCCCATTTTGAATAATGTTTTATTTTGGTCTATAAATTTTTTAAAATGTTTGTTTTAGTCCCTAAATTTTGAATACTACTTTATTTTGGTCCCTAAACTTTTAAAAATGTTCGATTTAGTCCCTAAAGTTTTAAAAAATGCTTATTTTGGTCTCTGCTATATTAAGATTTGGTTAACTCTTTAACGAAATGGCTAGATGACGTGTATTTTTAGATTACTAGGCTACCAAATAAGTTAACTACACTAAAAAATCTAGAGTTCAATTTTGAATAAGGTGGAGAATTAGGAGAATTTAAAAGACATTTTTAGTTCAAAATTTTGGTCGTTTAGAATTTTGGCCTGTTAGTTATTGACATTTTACTTTACATTCATCTTACTCAATATATCTAGAGCCTAGTCATCCAAAAATACAAGCCCCTCACATTTATGTTAAATAGTGCATAATTTTAATAGTAGGGACTAAAATACACATTTTTTAAAAGTTTAGAGACTAAAACAAATGTTTTTAAAAGTTTAGGGACTAAATAGAACAAGATTTAAAGTTCACGAACTAACATAAGATTTAAACCTAAAGTTACAGAAGTTACAAGAGATCAAAATTTTAATATTAATATAACTTTTTCAATCTAGTTCTTATAAATAATTTTATGTTTCAAGGAGAATTCTACGTGAAGTTTTAATTTTGTATGATTTTCTCCGTTTGATAATGATGTATTTTAGTTTTTAATCTTTTAAAATTAATAGTTATTCATAAGTTTCTTTGTTTATGCCACAAAAAAAAAATCGAATGTTTTAATTCTATAGAAAGACGTAAAAACCATAGCAAAAAGAAATTAAAAAAAAAAAAAAACAATAACAAATTTTAAAAACAAAAAATAAAAAACGAAAAATGAAATCGTTATTAAGTGAAAAAATTCCCTTACGTATCAACTAAAATATATTCCCTTGTGAAACTATAATAAAATAAACATATTTTGAAATAGAAAACAAAAGGAAATCAATATATAATATATCATGCTTAATTTAAGATATACATGGCTTCACACTTTCTTTATTTCTTCCAATTAATCTTATATATGATCTTCTAGAATATTCATAATGAATCATTAATGGAATTGTTTGAGTTAATAACAAAAAACTTACAGGGTTGAGAAAGTTTTGCAGGCAACGAATGAGTGTAATGATATGCAAGAGATGGAGAGGATTGTACTTAGAGAAGAAGGTTATGGAGGGCCCTCTTACCACCACTCTAATTTCCCACCTATCTAATTTCAATACAAAATAATCTTTACTCTTCTTTCCAAACACATATAAGCTATTTATTCAACTTATAATGCTTTAATTTGTTCCCATTAAAATACATTACTATATATAGGTGGGACATTAAAG

mRNA sequence

AGCTTGGGAGGAAGAAAGAGGAAAAGAGAAAATGAAGGGGATGAGGAGAAGCCAAAAGGAGTGATTCATGTGAGGGCAAAAAGAGGCCAAGCTACTGATAGTCACAGTAAGAAGAGAGAAAATAAACCAAAGGCTGAGATTCTTACACGACTTGGTTCCAGGATGCTACAAGGTAATCAACACAAGGACGATCAAATCTACAACAATGGGAATGGCAGTTATGTTGGATGTGATCATAAATTACATCCAATCTCTGCAGAATCAGATAGAGTTTCTCTCCATGAAGCTTTCAGTTGCTAGTCGCTACTATGACTTCAACAACAGCTCGGATACTAATGGCATTGAGATAATGCAGGGTTGAGAAAGTTTTGCAGGCAACGAATGAGTGTAATGATATGCAAGAGATGGAGAGGATTGTACTTAGAGAAGAAGGTTATGGAGGGCCCTCTTACCACCACTCTAATTTCCCACCTATCTAATTTCAATACAAAATAATCTTTACTCTTCTTTCCAAACACATATAAGCTATTTATTCAACTTATAATGCTTTAATTTGTTCCCATTAAAATACATTACTATATATAGGTGGGACATTAAAG

Coding sequence (CDS)

AGCTTGGGAGGAAGAAAGAGGAAAAGAGAAAATGAAGGGGATGAGGAGAAGCCAAAAGGAGTGATTCATGTGAGGGCAAAAAGAGGCCAAGCTACTGATAGTCACAGTAAGAAGAGAGAAAATAAACCAAAGGCTGAGATTCTTACACGACTTGGTTCCAGGATGCTACAAGGTAATCAACACAAGGACGATCAAATCTACAACAATGGGAATGGCAGTTATGTTGGATGTGATCATAAATTACATCCAATCTCTGCAGAATCAGATAGAGTTTCTCTCCATGAAGCTTTCAGTTGCTAG

Protein sequence

SLGGRKRKRENEGDEEKPKGVIHVRAKRGQATDSHSKKRENKPKAEILTRLGSRMLQGNQHKDDQIYNNGNGSYVGCDHKLHPISAESDRVSLHEAFSC
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:2000488 positive regulation of brassinosteroid biosynthetic process
biological_process GO:0006355 regulation of transcription, DNA-templated
cellular_component GO:0005634 nucleus
molecular_function GO:0046983 protein dimerization activity

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi08G003870.1Lsi08G003870.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
Lsi08G003870Cla97C08G147880Watermelon (97103) v2lsiwmbB445
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None