Lsi06G009300 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi06G009300
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionUnknown protein
Locationchr06 : 19166702 .. 19174277 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCAGTTTAGCGTTTAATCTTGGTTGTGTCAAAAAAATGACAGTGTTTAGTCCTGTCTGTCTCCCAGTTTTGCGTTTACCCCAAATTAAAAAATTGCAATTTAACGTTTACTCTGTTAACGTCTAAAAAAATGACAGTTTAGCTTTGTCCCGTAGTTTAGCGCTTACCTGGGTTGTGACGTCGTTTAGCGTTTACCCATGTGCTAAAAAAACATAACTAAAAAGAGATTTTTCTTAAGAAAATCAGAGATTAATAGAAAAGCAAAAAGCAAAACTCTAACGTGGATTGAATGAAGTTGTGGAGAACATCAATAAAGGTCAGCCACCTATGAAAATTATCCTCATCAATGCCTTTTCACCTTTTGGTATTTTTTGTGTAATACAACAAAAAATATCATACTCATCCTTACGTCTGCCCGGTCAAGGCTAACCCAAAAAAGTGAAAAATATCATCATTTTAGTATAATACAACCAAGAATATCATTCTTGCTATATTTTGATATAGGGGCTACACATCAAGACAGAATTAATGATCAATATGAAAAGAATTAGTAATTGTCCAATAAATTTGCTAAATGGGCCTAGCTCACAAGCAACACATAAAGGGAGCGTTTTGTTGCCTGAAAATTTGCAACTTGATAATGTGTTATTAGTCCAGGATTGTATGCTGATTTATGTGACAAAATTAGGCATCAACCGTGTATAATTATTCATGGCGATCACCTTTTCTTTTTCTCTAGTGTTCCATATGCGAGGATTCTAGGTGTAAAAGATGGTAAATCAATGGTAAATTAGTTTTGACCTAATTAGTTCAAGCCGACATTCTATTGTATATAGACTTGAGATGAATAAGAGAGAGAAAAAATTACATTTGTTTGTCACTAAATAACATGCTAGATAGTTCAAGCAAACTTCATTTGATTCCTTCCAGGTTTCGGTTTCTGAAGAGTATATTTGAAATGTGTAATACATTTCCTCTTGCTCATTCTTCAAGGGTTGAATTGTAACTATTTTGAAATTCATTGAAATGTTTACATAGTCCAATATGGGATCAAATGCTAGAGCAATGTTGTTGAACCCGTCCAATTAAGCCACTCCAAAAATCACCCACTACTTAAATAGTAAGAACCAAGAAAATAAACTAAATAGTGTTTATCCTGTTCAGCGTTTAACCTTGGTTGTGTCAAAAAATGATAGTGTTTAGTGTTGGTTGTCTCCCAGTTTTGTGCTTACAAATGTTAAGAAAGTGACCAAGTCATATATTCCAGCTGTTAATGCTCCATCTAGAATTGAAATTCCAACTCAGCAAGTTGTTACAACTAATGAGTCAACGGTACGCCAGAAGCGTGGTAGACCAGTAGGTTCAAAAGATAAAAATCCTCGAAAAAGAAAAGTAATCAATAGTCAAAATGACTAAATTGAAAATGAGAAGATTCAAAAAGAATCTCCAGACATGACTATTGATAAAAATGTCGAAGAGACTCAAGTATATGAAGATAACAGTGAGATCTCGATAAATTATGTAATGACAGGAAAAAGATGGAATAGAACTGATGTAGCCATAGACAACATTTTCGCTTATACTGTTGCTCATGATATTATACATGAAAATGAGGATTGTGAACCTAGATCTGTTGAAGAATGTCGCCATAGAAAGGATTGGCTTAAGTGGAAAGAAGCCATCCAAGCAGAATTAAACTCACCTTCAAAACGTGAAGTTTTTGGACCTGTAGTCCATACACCTGAAGGTGTAAAACCTGTGGGATACAAATGGGTATTTGTACGTAAAAGAAATGAAAATAATGAGGTCACGAGATACAAAGCACGATTGGTTGCACAAGGATTTTCTCAAAGACCAGGCATTGATTATGAGGAAACATATTCACCTGTGGTGGACGCTATTACATTAAGATATTTAATTAGCCTGACTGTATATGAAAAGCTTAACATGCATCTTATGGATGTAGTCACAACATATCTATATGGATCTCTGGAAAATGAAATCTATATGAAAATCCCTGAAGGATTTAAGATACCTGAATCATATAATTCAAAATCTAGAGAATTATATTCAATCAAATTACAGAGATCATTGTATGGATTAAAACAATCAGGACGGATGTGGTACAATCGTCTAAGTGAATATTTATTGAAAGAAGGTTATCAAAATAATCCAATTTGTCCATGTGTGTTTATTAAGAAATCACAATCAGGATTTGCTATTATAGCTGTATATGTTGATGATTTAAATATAATTGGAACTCCTGAAGAGCTTTCAAAGGCAATAAACTATCTCAAAAAAGAATTTGAGATGAAAGACCTTGGAAAAACAAAATTTTGCCTTGGCTTGCAAATTGAACATTTAGCTGATGGAATTTTTATTCATCAAACAACATATACAGAAAAGATTTTAAAAAGGTTTTACATGGACAAAGCACACCCATTGAACATTTCAATGGTAGTTCGATCACTAGACGTGAAAAAGGATATCTTTCGACCTCGAGAAGATAATGAAGAACTACTTGGTCCTGAAGTACCATATCTTAGTGCAATAGGTGCACTAATGTATCTTGCTAACAACACAAGACCAGATATAGCATTCTCAGTGAATTTATTAGCAAGATACAGTTCTTCTCCAACAAAAAGACATTGGAACGGAGTTAAACATGTACTCCGTTATCTTCGAGGAACAGTTGATATGGGTTTGTTTTATTCAAACAAATCAAATTTTGATCTAGTTGGTTATGCAGATGCTGGATATTTATCTGATCCACACAAAGCTAGATCTCAAACAGGTTATCTGTTTACATGTGGAGGAACTGCTATATCTTGGCGGTCTGTAAAACAGACCATTACAGCCACTTCCTCAAATCATGCAGAAATTCTTGCAATTCATGAAGCTAGTAGAGAATGTGTATGGTTGAGGTCAATGACTCATCAGGAACATGTGGCTTGTCTTCTGGAAAATTTTTACCAACAATATTATATGAAGACAATACAGCATGTATAACCCAAATCAAAGGAGGGTATATAAAAGGAGATAGAACAAAACATATCTCACAAAAACTCTTCTACACGCATGACCTCGAAGAAAATGGCGACATTAATGTTCAACAAATTTTTTCAAAAGATAACTTGGCAGACTTATTTACAAAGGCATTACCCACATCGACATTCGAAAAGTTGGTGCACAACATTGGAATGCGACGACTCAGAGAACTCAAGTGATATATTCATGAGGGGGAGTAGAATTACTGTACTATTTTTCCCTTGGCTATGCTTTTCCCCATAGGGTTTTTGTAGCAAGGTTTTTTAATGAGGCAGGAAAGTATATAAAATAATGTACTCTTTTTCCTTCACTAGGATTTTTTTTCCCATTGGGTTTTTTCCTAGTAAGGTTTTAACGAGGCATTTATTTTATATAATATGGATATTTAAGGGGGAGTATTATAAATGTAATATATAAATGTAGATATCCATAACCTATATAGGTTACAAAATATCATAAAACTCCCATTGAATTTGATATTGTAACATACCTCCCCATTGAATTCAATCTTGTAACATATACCATCTCATATCCTATAAATAGTGGTATATGTTACCTTTGTAATACACACCACAATTGAGTTCAATTGTCATTTCTACTTTCTTATTTCTCTCTACTTTACTACTTTTGTTCTTCCTTTGTTCATTGTATTGTTCTTATTTTATAACAAAAAATTCTTTTTTTTTAACATATATAATAATAAGAAGAACTATATATATATATATATATGCATATTTGGGTTAGTCTAATAATGACAAGTCCATTCAGCTGGCTTGACGGACCGGTCCAAATGTGACCCAAAAGAGTTAGGTCATGTAATTATATAGATTTGCAACCGTGAAATCACAAATTTCATCTTTTATCTAGTTATTTATATTCATAGACTATAAAAAAAAGTTTTATAGTTTGTTTTTTTAAAAAAATTATAGTCTAAGTTTATCTATTATTCTATTCATTGAATGCTCTGAATTAAGAAAATTAAAACATATATAAATTAAGAAAACAATTAGTTTTTTATGATAATGTAAATGACAATATATCAACCTAAGTTATATCGAGGTTAATTTCAATATCACTTTTATAGTTTGAAAAAAAAAATCTCAAAAAAAGTTTTACAGTTGTCCTAAAAACATCATAACTATTTATATAGAAACTAAAATTTATTTAATATTTTTACAATAACACTGTTTATTAAATAAAAAAAAAATAAACTTATCAAATGTATATTATGTAAATATTTATAATAAAATTAAAACCATGTATTATAATAAAAAAGAAAGAAAGAAACAACCTATTAATAAACTAGGTCTTTTTAAAGGGTCAAATAATGGAGATTCATGGATTGTTTTAGGCTATATGCATGCCTAATAGTTATAGAGGTGGAACTATAATGAATTACTTCAATTTTGGACTTTACTATTATTGTTATTATTACTTTTTAAACAATAAATTGGGTAATGCTTGTTTTAGTGGCCATGTTAAAAAAATATATATATTTAGTTGCATCTTATACTTACACAAATGGTTTAGATTTAGTATAAAAAAAGTGAAGTTCTTCAAATCAAGTTTAGAAAACTATTTTCTAGTCAATCCAAATAGGGTATTAATCTCTCTTTTAAAAAATTTCTTCAAAATTTGAGTACCAAGTTTTAATAAAATTGATTTAAAATAAAATTTTAAAGTCTTTCAAAAGCTATTGAGGGGTTGTCAAACACTTCAATTTTTCTAAAATAACTTATTATTAAAATTAAACAGTTAGTTAAACTAAACACACTCTTACCCAAAGGTATATTTAAAACAAAAATTGGAATTATGAAGATAAAAAGTTATAAAATTGTGGGACCCACCGTGTAATAAGTTAATTTGATGTGTTTTGATCTTAGAACTCACTGACACCTTGGACCATACAGTGAGCGAAATTCATAGCTTCACCCTCCAACTCCAACTCAACTCTTTAGGCCTGGTCTATCCCAAAATAGTATGGGCCTTATGATACTTTTCAAAATGAGAACCCTAAAATATTTTATAACAAAAAAAACTGTAAAATATCAAAATTCATAGTAGTCTTTGTTATTAGCAGTAATAATAATAATAATAAAATATGAATTTGATCCTACAATTTTTATTGAAAATGATGAACCGTGCAATCTTTCCAATCTTCCCTACGAAGGCAATGCATCTTGTGGCCGATGCAGCCAACGACACCATTTGAGGCTAATGCGCCACTTCTGCTACCTCGCCCCTGCACCCACCTCGCCCTGCATCTGCATCGGCGCAACTGTGTGGAAACACTATGTAAATAGAACCGGTGCAGGTGTAAACACAATTGTGTAGTGAAGGGCGTTTTTTTCATAGCATCGAATACATTTGTCATAACCTTTTCACCAGGTGAGTTTTAGAAGTTATAGGTCAATAAATATGTATGAATAATGATGCTATGTATTAGAATGATCAACCGTGTCTATTGATGTGTATATGGATGGAACTCACTCTTTATAGACATATTTGAACAGTAATAATCATAAAAGGGCCTATTACATAGTTGGATCAAAGGGCAAAAATGTAAAAGCTAGGCAGAAAATGGGCCGAATAGAGAGACCCAGGATCAATCGAGATCAAGAGGAGGCGTGTCAAGCCACGAGTTCGACCTCGACCCAAGCTGAGGCTGACCCGACCAACATCTCCCTAAATAGGGGCTGCATGTGAAAATGAAGTCCAATCAGAATAGGGAGGGGATCAATCATATACTTGTTGCACAACTATGTTTTCTCACTTTAAGTATTGAATTCTGTGTGGCAAACATCGGTCTGCAGTTTTTCTCATCTTGCAGGTCACATTCCTTCCAAATTACAAATTTACGGTTGTTGCGTGGAAGTGAAGGGTGTTATCCCTTGGCAAAATGTTGGCATCAACATTTACAACTGGTCTTAATGATACTCAAAATTGAGAGTAAATCATTAAGATCGAGTTTGATATTAGATTTTTTATGTTTTTGTTAAAATTTATGCTTAATAATTTTCACCTATCTTACGGAAGAAGAAGAAAAACTTGAATTTATCAATCTTATCATTGATTAACTACCTTCATAAGTTAATGGTTAAACATTTCTTGTTTTGATTTGGTAGTCCAAATCATTATGCTTCATATTTGCTCAATAACTATCATTTTAGAGAAATCTATGATTTTAAAATTTATTAGTGTTGGATTAATTTGTAAGTGATTATGCTAGGTACTAGTAATTTCATAATAAGGATTTAGACACATTTTTTACATACAAGTGTTTTGTTGGTTCAATTTTGCATGATTTATTAGTTGGTTGACAAGCGTTTTTTTAGTTTAGTTTCAATGAGGTGTTAATAGCAACATTAATTAATGTTAAAATTGATATGAGTGATTATCCTTCTACAAGGAAGCCTATAAAAAAACATATCTTAGAGGGTGATATTTTCTTTTTAAGTTTTGAAGTTACATCTCTTGTAAATGAAGGAAGCTTTTTCATGATTTATTATAGTGTAAAAAATGTTTTATTGATGTGTAAAAGATGAGGGTGGCTTCTTCATTCATGATTTATTCATTGTTTTCATAAAATTTAGGACAAAATATCAAATTATACTCCCAAATTAATAATGGTATCAATTTAAACTTTGAATCTTCGTAAATGTATCAATTTACACCCTCATCTAGATTTCTTTTGACCAATATCGTATGAAACTTATGATTTGAGTAAATTAAACTCCAAAATTTTCATAGCCAATCCATTTAGACATTTCATTATGATTCCCTCTAAAAAATCATTTCATGTATTGATTCTCAAACTTGTGTAGACCTATTCAAATGTTGTTTTACAAAATAGACAAGTTTAAAAAAAAATTTTGATTAAGAGTCTAAATTGGTTCATTTATGAAAGTCGAAGGGTTTAATTGATATAATTATAAGTTTCACATAAGGCCCTTTTTCGAAATGAAAAGTAATTGAGAGTGTAAATTGACACAATTATTAATTTATGGTTTAAATTGATACAACATCTAAAATTTACGGGTAGAAATTGATATTTTTCTTTAAAATTTTATGTTAAGATTTGTATGATTTTTCGTAATTCAATAATTATTTAACTTGTTTTGAGAGGAAAAAGGAGCATGCTTCGAGATGAAAAAAATTTAAACATTATATCATTATTAGACTTATATTGTATGTGTCTGTATATATAGAAAAATTGCAATAGGTAGCAAATTAAAAATATGGTTTAGCAACTATGTCTTTAACTTTTGAAATTTTGCAGATATCACAAATTATCTTATCACTAAATTAATCACGTTATTGGGTTTTGATTTTTAATTTTTTTTATTCCAAAATTAACCCTAACAAAAAATCTCTCTATTATTTCCTTTTCTTCCATGTTTTCTCCTTTGATTTTTACGGATTCTCTTTTAGCTAATTGTTGATTTCTGCGATTGCTTAAAGATTGCGATTATGTGAAGATTTCGATCTCTTGGATATTGAAGATTTTGTTTTCGTTTGATTCTTGA

mRNA sequence

ATGGCAGGGCTACACATCAAGACAGAATTAATGATCAATATGAAAAGAATTATAATAATAATAATAATAAAATATGAATTTGATCCTACAATTTTTATTGAAAATGATGAACCGTGCAATCTTTCCAATCTTCCCTACGAAGGCAATGCATCTTGTGGCCGATGCAGCCAACGACACCATTTGAGGCTAATGCGCCACTTCTGCTACCTCGCCCCTGCACCCACCTCGCCCTGCATCTGCATCGGCGCAACTGTGTGGAAACACTATGTAAATAGAACCGGTGCAGATTGCGATTATGTGAAGATTTCGATCTCTTGGATATTGAAGATTTTGTTTTCGTTTGATTCTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCAGGGCTACACATCAAGACAGAATTAATGATCAATATGAAAAGAATTATAATAATAATAATAATAAAATATGAATTTGATCCTACAATTTTTATTGAAAATGATGAACCGTGCAATCTTTCCAATCTTCCCTACGAAGGCAATGCATCTTGTGGCCGATGCAGCCAACGACACCATTTGAGGCTAATGCGCCACTTCTGCTACCTCGCCCCTGCACCCACCTCGCCCTGCATCTGCATCGGCGCAACTGTGTGGAAACACTATGTAAATAGAACCGGTGCAGATTGCGATTATGTGAAGATTTCGATCTCTTGGATATTGAAGATTTTGTTTTCGTTTGATTCTTGA

Protein sequence

MAGLHIKTELMINMKRIIIIIIIKYEFDPTIFIENDEPCNLSNLPYEGNASCGRCSQRHHLRLMRHFCYLAPAPTSPCICIGATVWKHYVNRTGADCDYVKISISWILKILFSFDS
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi06G009300.1Lsi06G009300.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Lsi06G009300Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB096
Lsi06G009300Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB300
Lsi06G009300Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB557
Lsi06G009300Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB566
Lsi06G009300Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB061
Lsi06G009300Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB130
Lsi06G009300Cucumber (Chinese Long) v2culsiB060
Lsi06G009300Cucumber (Chinese Long) v2culsiB131
Lsi06G009300Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB394
Lsi06G009300Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB403
Lsi06G009300Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB418
Lsi06G009300Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB354
Lsi06G009300Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB373
Lsi06G009300Watermelon (97103) v1lsiwmB412
Lsi06G009300Watermelon (97103) v1lsiwmB415
Lsi06G009300Cucumber (Gy14) v2cgyblsiB057
Lsi06G009300Cucumber (Gy14) v2cgyblsiB120
Lsi06G009300Melon (DHL92) v3.6.1lsimedB416
Lsi06G009300Melon (DHL92) v3.6.1lsimedB425
Lsi06G009300Melon (DHL92) v3.6.1lsimedB440
Lsi06G009300Silver-seed gourdcarlsiB035
Lsi06G009300Silver-seed gourdcarlsiB037
Lsi06G009300Silver-seed gourdcarlsiB115
Lsi06G009300Silver-seed gourdcarlsiB518
Lsi06G009300Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB070
Lsi06G009300Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB142
Lsi06G009300Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB565
Lsi06G009300Watermelon (97103) v2lsiwmbB358
Lsi06G009300Watermelon (97103) v2lsiwmbB375
Lsi06G009300Watermelon (97103) v2lsiwmbB385
Lsi06G009300Wax gourdlsiwgoB473
Lsi06G009300Wax gourdlsiwgoB497
Lsi06G009300Wax gourdlsiwgoB510
Lsi06G009300Wax gourdlsiwgoB518
Lsi06G009300Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsilsiB057
Lsi06G009300Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsilsiB115
Lsi06G009300Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB074
Lsi06G009300Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB130
Lsi06G009300Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB182
Lsi06G009300Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB735
Lsi06G009300Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB060
Lsi06G009300Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB119
Lsi06G009300Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB172
Lsi06G009300Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB725