Lsi06G007170 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AACTATGGTTAATGTATTTATTAACTCCTAAAAGTGTATATAGAGTGCGGAAGCTCACCAGTAACAATCTCACAGCCATAGGCTTATCTTCTTCTCCGTCGCCTCCATAGTTGCCGGCACTCAGCTCTAAAACGTCGAACATGGCCACGACCGGAGCCAAACGGCGGAATGAGTTCTCCATTTCCATGCTGCTTCTTTTCTCACTCTTCTTCCTCCTCCCTGTTTCTTCCGCCGGCGAAACCTCCTCCTTCATCAACCACCGCAAGATATCCACCGTTGGAACTTCCTCTTCTTCCAGTTCCAACTCCAGCTACGCCGTGATCTTTGACGCCGGAAGCTCCGGCAGCCGCGTCCACGTCTTTCACTTCGATCAGGACCTGGATCTGCTGTTCATCGGTTCAGAGATCGAGGTTTTCTCACAGGTAGTTCAATGATTCAGAGCTCTGTCTAATTAAAATCTGTAATGTACTGGATTAATCGATTTGCATTGGTGTTTCAGATAAAGCCAGGGCTGAGTTCATACGCGGATGATCCTCAGAAAGCCGCGGACTCTCTAATTCCATTACTGGAGAAAGCAGAACAGGCGGTTCCTCAGAAACTGCAATCCGTGACGCCGATTCGCCTGGGGGTTCGTAAATGCTCTGTTCTTAAGTAGTTAATATCTCGAAAATGTTGCGTTAATGTAATGGCTGTTGTGGAATTTTTAGGCGACGGCAGGGCTTAGGTTTTTGGAAGGGGACAGATCTGAGAGGATTTTGGAAGCGGTAATTAGTGATTTAATTTGATTTGATTTGATTGAGAATGGAAAATTGATGGATTTTGTGTTTGTTGTTTTTGATTTCAGGTAAGGGTTCTTCTGAAAACGAAGAGCGGATTCAAGTACGAAGAGGATTCGGTTTCGATTCTGGATGGAAATCAAGAAGGCTCTTATCAATGGGTACGTTTTTTCTGTTCGTTTTTCTACTCATTATCGTTCTAATACTCACTTTCGCTTTCCTTATTTATTTAATTTTCTTTTCTTCCTTTTGTTTCACTTTTTTTGTTTCTTCCAAATCACCCTCGCTTAAAAAAAAGAAAATAATTAGAATGGATAACATTTTTAATCTAATAATTAAGGCATTGTTTAGTAATTATTTGACTTTTGATTTTTAGTTTTTGAAAATTAAGCCTATCAATACCTAATGTACCATTAAATCTCTTGATTTGATATCTATTTTTATCATGTTTTTAAATCAAGTCAAAATTTGAAGAGTAAAAAAAATAGTTTTTAAAAATTTGTTTTTGTATTTATTTTTGAAATTTGGCTAAGAATGTAACTCTTCTACTTAGATTGATACAAACCATGGTAAGAAAATGAAAAGAAATAAGCTTAATTTTGAAAAACCAAAAACAAAAAATGAAATAGTTACCAAACGGAGTCTAAGTGTATAGTAACATTTTTAAAAAAATTGTAATTATAGAAAAAATAGCGGGTAGAACTCTATGAGTGATAGACTCCCATAAGCGATACAATTTATTACTAATAGTTTTCGAAAGTTGGATCTAAATTTCACTTCGTGATGGTACAAGCAAAATATTATAAAACCTATGTTTTTAGAAAGTGGGTTAGATTTCATTTTATCTAAAGTAGCTTATTAGATTATTAAAATTGAACACATTTTAAAGGTTAGATTTAAGATTACAACAAGTTTCGAAGGTCGAGGTGCAGTTCAATGAAATTAAAATTTTATGGTAAAAATTAATACAACTCGACGAGTATAAGGCTATTTTTTTTTTTAAATATTACAAAGAGTTGATGAAATTTATAAATCAATAAACTGCTTATAGACCAAATGTGTTAATAAACCAAGTAGTTACCTAATAAAAAAAATGATATTTAATTTCTTTTGAAAATTTTTATTATAAAGATTCAATTGTTGCAAATTTGGCAAATTTGAAAGAAAAGAATCTAAATTGCTACAAATTTGAAAAAAAAAAAGACTAAATTATTACTCCATTAAAATTTAATGACTAAATTATTAATTTTTAGGGACTTATTAGCCTAAAAAAAGAAGTCACGTCCTAAAGTGAGCTTGGCTTAATGTTATTGACATTACCTCCATCCTTAAGATTTAGAGATTCAATTCTCCACCTGGCCGTTGTTGTATTAAATAATAATAATAATAAATATAAATATAAATATAAAAGAACTCACGCTTAGCATCTTTCAATAATGGAACATAATGGAATTGATTACTAGAACTTCCTTATTAATTATAAAAGTTGCTTTCGGAACTTTAGAGAGATGAAATCGTAACTTTCGAGATTGCTATTTATTTCGAAAATTTTGTTTTCAAGTGTTTTAAAGGGTTGATTTGATTTTGGAATAGTTTTTCTTTATTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATATTGCTTTTATGAGAAAAGGCTTCTATTAGTAAATTTTTGGACAAACAAAAAGCGATTAATTGTTTCTTATAAAAGAGTTCGGAATGACTTTTTAAAGTTAGATTATAAAATTAACTTTCAATATAAATAGCTTTTTTTTTCTTTTTTTGTTTACAATACGTGGCGTAGTAGAATCAAATCCTTAATTTCGATATTGATAATACAAGTACTATACCAATTGACTTAGGTTCATTTTAGCATAAATTAGCCTTCTTAATTTTTTATTTAATTTTTTTTTTGAAAGAGATGAAAATGCTTTTTGACGAAGCATAATGATAATTGTTTTTCTAAAAAGTGTTTGTAGAAAAAATACACTCAATAGTTTTAAAAATATTTCAAAAATGGTGAGGATGGTCATAAATCACTGTGAAACATAAAAAATGAAATTGCTTTTAGAAGAAGCATACAATGACTATTGTTTTTTTCTTTCTAAAAAGTGTTTATAGGAAAAATAAACTCTTAAGTTTTAAAAATAATTCAAAAAATGTGGTAACCTTCAGATCTTCAATCTGACGCTCTCCCAACTGAGCTATCCCCACATTGTTGAAAGTTTATTAAACTAAAAATAATATAATGTCGCTATATTGAATCATATCATTTGATAATCACAATTTATGAAGTTTGATTAAACTATAGTAATTAAATAGAAGCTTTTGAAATTATTTCGACTAAATTAAAATTAAATCATGACGATATTTAAACTAAGATCGAATTATATAGACTAAATTGAAATTCTAAGGCCTATAGACAAAAAAAATTGTATTTATTAACGTTTTCTTACACTATGCATAAATTATAGAAAAAAATTTTGAATTTTATATTTTGTTTTAAAAATATTCTTAAACTGTAAAAAAAAAAGTTAAAAAATGCCCTCACCTTTAATTTTGGATGGAAAATGTTAGTATTTTGTTTTAAAAATACCATTTAACGGAACAAAATTTCAAAAATGTCTTACTATATAAAAAAAAAAGTTTAAAAAAATGTCTTGAACGTTGGTATATGGATAGAAATCATTTATTTACACCCTATCATCTCCTTCATTCATCTCTCTCCTTTACTACAATCTATGGTCTAAAACTTTCCTATTTTCTCCTCATTTTTCCCTTTGGTAATACCCTCTTACTCTCTTTCTTCTATGCATTTTCCAACTTTTAAAACTACCTCAACGTTCAATTAACAACGTATATAGGCTATAACAACAAGAAAAAAAAAGAGAGAACAGTGGAACCACTACTTGTAGCAATGACGACTTTGTTGATCATTTTCCAATTCAAATAATTCAATTTGTTGATCAATAAGAAAGGTTCTCAATAATGGAAGATGATATTCTTTTGGAGGCTCTTTTTGTATTTTACGATTCATAGTTTTGTCGAATTTTAAGGGGAGGTTTTGATATCATAACTTTATGGGATTTTTTTTGAGATTTTATGCTTTAACTTAAATTTTTTAATTTTATTTGGTTGTCAATCAAATTGGTGTAATAATTGGTCAAATGAGAGCTAAAAGGAGAGTATCTAAATTAAGAAAAAAGTGAGGGTATCTATATGAGCTTTGCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTCCAAATTGCTTCTTTCCCATCTTAAAATAATTTCAAGAAAATTGACTATACGTACCAACATTCAGATACTGTTTGGTTTAAGGTCTTATAGATGATAGAAAAAAAGAACGTATGAAAATAAAATGGTTGAGAATAAAAGATCTTGTGTTTGGGTGTGCATGAAAATGCTATCAGGTTTTGAAGCTAACAAATTGTATTTGTATTTATTTTATGAAATTAATCCCGGTAACCTCATATAATTTTAATCGATTCATTAATTAATAATAAAATAATTATTTTAATTGGATAATTAATTACAAGTACTATTAAAAAAATAATACTTATCCTAAGTTAAAATAACAAATACTAAAATTATTTTTTATTTGAAATTAATACTAGAATTAACTAATAACTATTTTATTATTTAATAGAGTTTAATAATTTTAGTTAAGTAGAGTTTAATATTAGTTGCATCAATTAATTTTAATTATATAACATAAAGAAATGTATTTAATAAACAGTATAAAAAGAAAATTAATGTAAGAAAAAGGGACAAAATATGATATGCTATTAATGAAAGTCGATAAGAAATATTAGAAATTTTTAAAATAATCATGATACGTTAATAATGAATGATCTAATTAAAGCTAATTCCACTAAATAATTGTTTGATAAAAGCCTATAAGTAATCTATTATAATTATTGAAAAATAAATTTTTATACTAACTTAATTTAACTAATCCTAATTTACTAATTAAATATATATAAGATATTGTTAGCTAATTAATTAATTAATGATTTATGTAAATAAGTAATTACAATCATTCAATAAATTTTTATTTGTAAAAATCAATTAAGTAAATAGTTTAAGTGATTATTATTGATTTATTAAAATAAAAAATGGTTAAATTAAGATAATCATGGTAAAAAAGGGAGAGGAAATAAGTTTTATTTTTTCAAAGTTTATTACTATGTAATAATGAAT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MATTGAKRRNEFSISMLLLFSLFFLLPVSSAGETSSFINHRKISTVGTSSSSSSNSSYAVIFDAGSSGSRVHVFHFDQDLDLLFIGSEIEVFSQIKPGLSSYADDPQKAADSLIPLLEKAEQAVPQKLQSVTPIRLGATAGLRFLEGDRSERILEAVRVLLKTKSGFKYEEDSVSILDGNQEGSYQWLTINYLLENLGKRYSNTVGVIDLGGGSVQMAYAISDEDAAKAPIASDGNTKFVTKDLGNPCILAGYEGSSYGLCRKVILEALKINKSCGYNECSFDGIWSGGGGAGVNNLYVASFFFDKAAQTGFIDSNKPDAIVKPFDFKKAARIACQTKFVDAKAKYPNVYSSDLQFVCLDLVYEYALLVNGFGINSSKKITLVKQVAYHGSLAEAAWPLGNAVAIISSSKYSTANY
BLAST of Lsi06G007170 vs. Swiss-Prot
Match: APY1_ARATH (Apyrase 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=APY1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 367.1 bits (941), Expect = 2.6e-100 Identity = 206/447 (46.09%), Postives = 283/447 (63.31%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. Swiss-Prot
Match: NTPA_PEA (Nucleoside-triphosphatase OS=Pisum sativum PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 362.5 bits (929), Expect = 6.4e-99 Identity = 198/442 (44.80%), Postives = 276/442 (62.44%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. Swiss-Prot
Match: APY1_ORYSJ (Probable apyrase 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=APY1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 359.8 bits (922), Expect = 4.1e-98 Identity = 212/456 (46.49%), Postives = 284/456 (62.28%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. Swiss-Prot
Match: APY2_ARATH (Apyrase 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=APY2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 239.6 bits (610), Expect = 6.2e-62 Identity = 135/275 (49.09%), Postives = 183/275 (66.55%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. Swiss-Prot
Match: APY2_ORYSJ (Probable apyrase 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=APY2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 239.6 bits (610), Expect = 6.2e-62 Identity = 140/273 (51.28%), Postives = 180/273 (65.93%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. TrEMBL
Match: V7CUG8_PHAVU (Uncharacterized protein OS=Phaseolus vulgaris GN=PHAVU_001G096900g PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 439.5 bits (1129), Expect = 4.6e-120 Identity = 235/449 (52.34%), Postives = 312/449 (69.49%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. TrEMBL
Match: Q5NT84_VIGUU (Apyrase OS=Vigna unguiculata subsp. unguiculata GN=VsNTPase2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 437.2 bits (1123), Expect = 2.3e-119 Identity = 236/449 (52.56%), Postives = 311/449 (69.27%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. TrEMBL
Match: A0A103XH49_CYNCS (Aquaporin-like protein OS=Cynara cardunculus var. scolymus GN=Ccrd_007329 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 429.9 bits (1104), Expect = 3.6e-117 Identity = 227/429 (52.91%), Postives = 308/429 (71.79%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. TrEMBL
Match: A0A0L9U6T9_PHAAN (Uncharacterized protein OS=Phaseolus angularis GN=LR48_Vigan03g189000 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 429.5 bits (1103), Expect = 4.7e-117 Identity = 234/449 (52.12%), Postives = 310/449 (69.04%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. TrEMBL
Match: A0A072U8A0_MEDTR (GDA1/CD39 nucleoside phosphatase family protein OS=Medicago truncatula GN=MTR_6g033000 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 424.1 bits (1089), Expect = 2.0e-115 Identity = 228/448 (50.89%), Postives = 303/448 (67.63%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. TAIR10
Match: AT3G04080.1 (AT3G04080.1 apyrase 1) HSP 1 Score: 367.1 bits (941), Expect = 1.5e-101 Identity = 206/447 (46.09%), Postives = 283/447 (63.31%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. TAIR10
Match: AT5G18280.2 (AT5G18280.2 apyrase 2) HSP 1 Score: 187.6 bits (475), Expect = 1.6e-47 Identity = 113/240 (47.08%), Postives = 152/240 (63.33%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. TAIR10
Match: AT1G14240.1 (AT1G14240.1 GDA1/CD39 nucleoside phosphatase family protein) HSP 1 Score: 125.2 bits (313), Expect = 9.6e-29 Identity = 78/208 (37.50%), Postives = 122/208 (58.65%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. TAIR10
Match: AT1G14250.1 (AT1G14250.1 GDA1/CD39 nucleoside phosphatase family protein) HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 6.9e-27 Identity = 78/225 (34.67%), Postives = 127/225 (56.44%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. TAIR10
Match: AT1G14230.1 (AT1G14230.1 GDA1/CD39 nucleoside phosphatase family protein) HSP 1 Score: 115.5 bits (288), Expect = 7.6e-26 Identity = 63/168 (37.50%), Postives = 103/168 (61.31%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. NCBI nr
Match: gi|593797464|ref|XP_007161770.1| (hypothetical protein PHAVU_001G096900g [Phaseolus vulgaris]) HSP 1 Score: 439.5 bits (1129), Expect = 6.5e-120 Identity = 235/449 (52.34%), Postives = 312/449 (69.49%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. NCBI nr
Match: gi|951071630|ref|XP_014491292.1| (PREDICTED: apyrase 2-like [Vigna radiata var. radiata]) HSP 1 Score: 438.0 bits (1125), Expect = 1.9e-119 Identity = 237/449 (52.78%), Postives = 312/449 (69.49%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. NCBI nr
Match: gi|1009170926|ref|XP_015866463.1| (PREDICTED: apyrase 2 [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 438.0 bits (1125), Expect = 1.9e-119 Identity = 240/451 (53.22%), Postives = 310/451 (68.74%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. NCBI nr
Match: gi|56692309|dbj|BAD80837.1| (apyrase [Vigna unguiculata subsp. unguiculata]) HSP 1 Score: 437.2 bits (1123), Expect = 3.2e-119 Identity = 236/449 (52.56%), Postives = 311/449 (69.27%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007170 vs. NCBI nr
Match: gi|976902723|gb|KVH90660.1| (Aquaporin-like protein [Cynara cardunculus var. scolymus]) HSP 1 Score: 429.9 bits (1104), Expect = 5.2e-117 Identity = 227/429 (52.91%), Postives = 308/429 (71.79%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Lagenaria siceraria
Date Performed: 2017-09-18
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |