Lsi06G006620 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCCCATGTGAGAATCTACAGAGCAGATCCCTTTTGTTTGGTTCTACAAAATGGCCTTATTAGGGTTTTAACCCTCTTTTTAAGGGCCCAAATTTAAGCCTCTTGTATGGCTTGCCTTGGTGCAACTTGGGAGAGAAATCAGGTTAAAGAGCACTTTTCAAGTGGGTGCAGTAAGACTATCATAATCTACTTTATTGAAATTTGAAGGGGTTGTTTTAGGGATTGTAATATAATGGATTTGGATGGAGCGTTTTGAGCTCGATTTGTAATATTAAATGCATTCCGTACCAACAGCTTTTAACCAAAACTTTTTTCTACCAATTTCACGTTTCACGATTTTATTTCTGTTGCGTCTTCGATACCTCGCGCATTCCAACACTTTCTTAGTAATCCTGATTACATTCCAGCCTCCCAAACAACTCCTAATTATAATAGTAGCTATTTTCCTTCTAACTATTATAACCTATAATTATAACCAAGACTAGAATAGTCTACATTTTCAAATACAAACTATTATAACCTATAAACTATAATAACCACTAACTATAATAAACAATTCAGCACCCGAAATGCTTCCTTTTAGATCTGAACTTTGATAGAACTAACAAGTTAGGCTTCGTTTGATAACCATTTCATTTTAAAGTTTCTACTTTTACAATTGGTGATTGTTTTCTCTCAATATTCTTATCATAGTTTTCACTTTTCTTAAAGAAACATTTGAATTCTTAATGAAAATCTAAAAGCAAAAAACAAGTTTTTTAGGGCCCGTTTGATAACGTTCCTATTTCTATTTCTAATTTTTCTAGAAACGGACTTGTTTGATAATTATTCCCATTTCTCATTCCGAATTTTAAAGAACGTTCCTGAAAATTGAAGAAATTTTTGGAAACCACAAAAAGTAGTTTTGTCAGTTCTGTTTCTCGCTCGTTCTGTTTCTCCCTTGTTCTATTTCTCCCTTCGTGTTTTAGAGCTACCATCATCTCTTTCTTCTCACCGACAAGCAACGACTCTCTCCTATCAAGCTAACTAGGGCTTCCATTGTCTCCTTCTTTTCGACAATAACATCAGCAACGACTCTCTCCTCTCAAGCTAGAGCGCACACACAGAGGTATATCCATCTTTGAGATTTCTTCCTTCGACTGTATTATGTATCAACTTCATCTTTAATTTTTTTTCTAGGTTTTTGAATTTCAGATTCATTTCCTTTCACACACGAACGCAAAGAGTTTCCATTTAGAAGCAACAGTGTCTCCTTTTCATTGCATTCCCTTTTTAGTCCATATCTCAATCTCCTTTACAATCTTCTTCACATAGAGTTGCTTGTGCTCCCAATCCCGTAGTCTAGATTGCCTCTGTAGTTGAACTTTTAATATGGTGTAGTGAGTGTAGGAATTGAATTCCTAGCGGAAGCGATTTATCACATTGTGGTTTCAATTACTCAATTATGAAACTTAAAGAAACAGAGAAAAAAGAATAAAATAGGATAAACTAGCATGCAATTTAAAGAAGAGAAAACTTAAAGGAAGAAGAAGTTGCTTACCTTGATGAATCTTCTTCACAAAATTCTTCTACAAATGGATAAGGACACTACCACCAAAGAGCACTCACTATTCTCAAGGTTATATCCATGAGAGTGGTCTCAATTTGTCTATTTAAAGGGAGGAAGAAGAAGAAGTTATTTTTTCATTAGAGAGAAATTATGCATAGAGAGAGTTAGTGGAGAGGATTTATGGAGGAAAAAAAAAACTTCACACCATGTTCATCATAACTCCCAAATGGGAGTTATTATTTTCTTTAAGTTAATTTAAATAAACTAATAATATAAATTAAATTAAATTATATATATATTAAATCTTATTTAATAATAATTAGTTACCAATTAACCAAGTTCTCTCACATAACCTATAGTTTAATATGAATCATATTCACATTATTTTTAACCTATAGTTTTATATGAATCTCATTCATATAATATTTAATATTTAATCTTATTCAAATATTTCTCTTATGTAGATTATAAAGTTTAATTTTTACATTTCATATAAAAATCTACTTTCTATTATAATGTATCAATATACATTATTTAATTGTATCTCATACAATTAATTCTCATAACTTAATTTGAACAATTCAAATTAAACCAAGATAACTGACTGTCATCTTAACCTATATGAGCTAGCAAGTGGACCTAATGAACCTATCAGTTTGAAGCTCCAATGGTACAAGATTAATTAATTAAACTCTATAATTAAATTAATCAACATTCATTAACTGTCGGTCATTCCACTAAAGACCGACAACTGCACTCTTCTTACTGTAGATATATTTCTATGTCTACGGATATAATCAATCAATAGCGAGTCGACCCTTCACAAATTGCTCGTAACAACAACTGGATCAAATTACTGTTTTACCCCTGTGTTACCTCTAACTCCTTAAGTACCACTGATCCCTCTAATGAACAATTTAGTCATAGTCCAACTATGAGCTAGACCCCTCTCTGGCCAGTGAAAGGGTGAGGCGCCTCATTGTTCAAGACCTGACATCAACTCTTAAGGGAGCAATTCATAAGACATGAATTCCTTCTTGTACAGTTGAGTTTCCAACTGCCTGCTCGGACAAATCCTCAAAGTGGTAGACTTATTGAGTCCGCAAACCTGGCCACTTTCACCCATACAAATCAAAGGATTGCCCTCACAAGCAGGAGTTCACAACTGACTCAAGATTAAGGTCGAGTCACCTATGATCATCCTAGTGAAATGTAAGCCTCATTAAGTAACGGTGTTAATACGGGAGACTAATCATTTCGCAGTCCGGTCTTATATATATGTCTCACATATATAGGATACCCCCAGTCACATGTCTCCACATGAACATTTAGGATCTAAACGTTTGTGACACTTTACAACACTTGTAACGATCACAAAGTGGGTCGTATCCGTAGTGATACCAAGATAAGGTACCCAACCTTATCCATCTACTACAGATCGTTTAGGTTAGTACTTAAACACGATCCACTTGTATGTCTCTACATACGTGTTTAAGTTACTACTAATAACCTAGGATCTTAGTTTATTGGTTTGGTTATTGGTTTTTGGGTTAGTGTAACTAAATGTCAAAAAAAAAATAACAATTATTTTATTAAATAAATAATTTGATTTGTACAATACAAGTTTACAAAATACAATACCCACGAGATTTAGGGCATCAACCCCAACAGTGAGGAAATAGGAAAAGGGTTGAGAGGATGATAAGAAATTTTGATTTTGGTCTCTTTGAAGTTGTATGCCTTGAATGAAATTTTGATTAATGCTACTGCATATGAGAATATTGCTAATATGATAATGTTCTCTTTTTCTTGTTTTGTTTTATTAGGATGATGTGCATATTTTACCTTGAAGTAGATAATGCTATTGCCAAAAATTAATAATGTCAAACTTAGTCTTAGAGGATTATCCAATGTATTTCAAACTGTTTGCTTTTTATTTAATTGTTTGTTCATTAGTTAGCCTTCTATCTACAAGTTGAGTGGTTCTATTATTTGAGAGTTCTACAATACTTTCTTTTGGAGGGGTGGTGCTTATCGGTCAGTAAAAACAGTGATTTCTTTCTTAATTTTATAACGTAAATGATTTTGTTTTGCATTTGGTTGAGTTTTCATCCTAGGTTTGAGAAATTTTGTGAAGAAACTTCTCATTTTTAATCTTGTTGTCTTACTAAATAGATGTCACAAAAATCATTCGAAAAGCATTATGTTGATGAGATTGTTGAAATTGATGGATTGAAAAGTGAGGGACCATGGTCTGACAAGAATGAGGCTTTATTTGTTGACTTAATGGATGAAGAGGTTGCAAAGGGCAATCGACCAACCACAAAATTTACAAGGGCTAGTTGGAATTATATGAGTAACCAATTAAATACTAGTACTGGATAGCTTATACTCATGATCAATTGAAAAATAAGTTTAACAAATTAAGACAAATTTATGAAGACTTCAAAAAGATATTGAGTGATATGACAGGAAATGGTTGGGATCCATTATTGGGCACTATCACTCTAGAAGAGGAGCAATGGAATGATCTTTTTAAGGTATAGTTAAATTGCAAGTGCTTTTCTTTTCCATTTCTAATCATCTATCAAGTTATGGTTGATGTTATATATTGTTGTGTTATTTCTTATAGGCGAATAAGAGAGCTAAAAAGTTTTTTAAAAAATGGTTGCCCACATTATGCAAAGCTTATGAGGATTTTTGGACATACTACTGCTACAGGGGTAAATGTTTGCCCATCAACAAAACTTCCTTCAAATTCTGAAGATGAAAATGATGTTGGAAGTAATACGAACTTTGTTGGTGAAGAAAATGATAATGAAAAAAGTAGAAAACGAGTTCGAAGGAATAGGGACAAATTTAGTAGTTTCCTTTCATCATTTATAGATGTGTATGTTGAGAACTCAAAGAGAAAAAACGACATCCTTTAGAAAAGATCTTTTAGTTCTATCGCTAGTCAAGTTGATGAGGGTTAATCATCAAGGAAAAAAAGATGAAGTTGATGAAGAGCTGATGAAATGTTTCAAAATTTTAAATACAATGGAGGATATTGATGGAGAGGCTTATACTAAAGTACTGAAACTTTTGCATGGAGATCTTGCTTTGAGAAAATTATTTTTGCTCATGCCTGATTCAAGGAAGAAAGATTTCATAAACAATATCTAGATGTTACTTAGGGGTGTTTTAGTTTTATGTCATTTTGTTGTATGGTTTTATGGTTTTATGTTATTTGAACATGAATATTATGATTGTGATTCCTTTTGGAGTTTATGTTTGAACATGGATATTTTATACTATTGTGGTGAGATGGATTTGATTTATGTTTCAAATTTCTTTTCTCATGTTTGATTTAAGGATATACTATTGAAGTGAGATGGATTTGATTCAAGACAATGACTTTGAGAATTTTGATTTTGACGACGATGATGATGTCATGTATATCCTTTTCAATTTATTGTACGTCGGCTTTCACAAGATACAATCTTCTAGACAACCATGTAGACCCTCTACACTAAAAGGTCATGACTATGTGATTGAGATGTTAAATGGAAACGATAGAAGATGTTTTGATTGTTTTAGGATGAAAATAGCAACATTCATAAGGTTTTGTGAAGATTTAAAATCTAAGACAGATTTGAAAACATCTAGATATCTCACCGTTCAAGAAAAAATGCTATATTTTTATTAATCATATCACATAATGAAAGCAATCGTATAGCAGCAGAAAGGTTTTAACATTCAGGTCAAACTATTTCTCGAGCTTTTAACATTGTTTTGAGGAAGGTTTGTAAGCTTGGAGTAGAAATTATTTGTCCATCCAACATGGACACTGTACCACCAGAGATCATATCAAAACCGAAATATTACCCTTTCTTTAAGGTAATACTTTTGAGTTAATGTTTTGATTTGTTTTTCAGGAAATATAATATTTTGAGAATATATTTATGTTTATGCTTATTTTTCAGGATTGTATCGGTGCTATTAATGGCACTCATATTGCTGCATGTATTCTCCAAAACGAACAACTACCATTTCGTGGAAGAAAAATTAACACAACGTGAAATATAATGTGTCTTTTCATTTGAGATTCACGTATGTCATGTTTGGTTGGGAAGGATTAGCCAATGATTCTCGCATACTCCTTGAATGTATCAAGTATCCTGAGAATAAATTTCCTATGCCTAAAAGAGGTATATAATTATGTGCTTTTATTATTTTAGTTCAACATTTGACTTCATGATAAGTTTTTATTTGTTTTATTTTATGCAGACCAGTACTATCTTGTCAATTCAGGATATTCAAATATGCATGGATTTTTGGCACCATTTTGCTGTCAAAGATATCATTTACGAGATTTTAGAGAAAGGAGACATCGTCCTCGAGGTAGAGAAGAAGTGTTTAACTATCAACATTCTTCGCTGCAAAATGTCATTAAACGTTGTTTTGGCATGTTGAAGGCTTGATTCCCTATTCTTAAACAAATGCCTCCTTACCCAGTCAACACACAAAAATATATACCAACAGCATGTTGC ATGGCCCATATGTCACAAAAATCATTCGAAAAGCATTATGTTGATGAGATTGTTGAAATTGATGGATTGAAAAGTGAGGGACCATGGTCTGACAAGAATGAGGCTTTATTTGTTGACTTAATGGATGAAGAGGTTGCAAAGGGCAATCGACCAACCACAAAATTTACAAGGGCTAGAAATGGTTGGGATCCATTATTGGGCACTATCACTCTAGAAGAGGAGCAATGGAATGATCTTTTTAAGGCGAATAAGAGAGCTAAAAAGTTTTTTAAAAAATGGTTGCCCACATTATGCAAAGCTTATGAGGATTTTTGGACATACTACTGCTACAGGGGATTGTATCGGTGCTATTAATGGCACTCATATTGCTGCATGTATTCTCCAAAACGAACAACTACCATTTCGTGGAAGAAAAATTAACACAACGTGAAATATAATGTGTCTTTTCATTTGAGATTCACGTATGTCATGTTTGGTTGGGAAGGATTAGCCAATGATTCTCGCATACTCCTTGAATGTATCAAGTATCCTGAGAATAAATTTCCTATGCCTAAAAGAGACCAGTACTATCTTGTCAATTCAGGATATTCAAATATGCATGGATTTTTGGCACCATTTTGCTGTCAAAGATATCATTTACGAGATTTTAGAGAAAGGAGACATCGTCCTCGAGGTAGAGAAGAAGTGTTTAACTATCAACATTCTTCGCTGCAAAATGTCATTAAACGTTGTTTTGGCATGTTGAAGGCTTGATTCCCTATTCTTAAACAAATGCCTCCTTACCCAGTCAACACACAAAAATATATACCAACAGCATGTTGC ATGGCCCATATGTCACAAAAATCATTCGAAAAGCATTATGTTGATGAGATTGTTGAAATTGATGGATTGAAAAGTGAGGGACCATGGTCTGACAAGAATGAGGCTTTATTTGTTGACTTAATGGATGAAGAGGTTGCAAAGGGCAATCGACCAACCACAAAATTTACAAGGGCTAGAAATGGTTGGGATCCATTATTGGGCACTATCACTCTAGAAGAGGAGCAATGGAATGATCTTTTTAAGGCGAATAAGAGAGCTAAAAAGTTTTTTAAAAAATGGTTGCCCACATTATGCAAAGCTTATGAGGATTTTTGGACATACTACTGCTACAGGGGATTGTATCGGTGCTATTAA MAHMSQKSFEKHYVDEIVEIDGLKSEGPWSDKNEALFVDLMDEEVAKGNRPTTKFTRARNGWDPLLGTITLEEEQWNDLFKANKRAKKFFKKWLPTLCKAYEDFWTYYCYRGLYRCY
BLAST of Lsi06G006620 vs. NCBI nr
Match: gi|659095125|ref|XP_008448411.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490615 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 2.1e-15 Identity = 49/97 (50.52%), Postives = 65/97 (67.01%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G006620 vs. NCBI nr
Match: gi|449459522|ref|XP_004147495.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101212009 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 2.1e-15 Identity = 50/140 (35.71%), Postives = 71/140 (50.71%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G006620 vs. NCBI nr
Match: gi|778685560|ref|XP_011652236.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101212009 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 90.1 bits (222), Expect = 2.7e-15 Identity = 47/128 (36.72%), Postives = 65/128 (50.78%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G006620 vs. NCBI nr
Match: gi|659085415|ref|XP_008443406.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487000 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 8.0e-15 Identity = 49/135 (36.30%), Postives = 66/135 (48.89%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G006620 vs. NCBI nr
Match: gi|659085417|ref|XP_008443408.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487000 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 1.0e-14 Identity = 47/126 (37.30%), Postives = 62/126 (49.21%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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