Lsi06G005950 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTTCGTATGAGTGTTACTTGCCCCTTGTGTCGGAATTCCCCTGCTCTAACTCTTATTGCTAATCCTTTCTCTAAGATTGTGCCTCTGGCTCCCAATCCCAGGTGATCTTCTTCTTCCTCTTCACAAAATTTTTAGGGTTAGAGTTTATGATTTTTCTCTTTGAATTGGTGCATGTGTTTACTTTTGACCATTGATTTATGATAGATATGGGAACCTCCTGGATTATCTCTAGTGTTTAGTCATTATGTAAAGTTGGAAAAGTTTCTAATAAAGATCGACTCAAACATTTAATTTTGTGTCTGATAAATTAATAACATCGGTTCTTTAATACTTACCTTACATAAAAAGATATAACTGGAGAGCATGTACTTGAATTTTGATTATGATCTTTCTTTACTGATATACCAAGTGAGGTTTATCGGATCTTGGATGTAGTTTAGGCAGACTAGAGAAGTGGTAGGAGGTAAAACTTTCGTCACTTTTGACTTTGATATTGAAGAATGTATTTTATTTCGTTTCATTCATTGCTTTGTTTTTTTGCAAGTTGTGGAGCTACAAAAGCTAATTCTAGCTCATAATAATATTCAATTGTTGAATGAAGAATTGGAGAATTTGTCTTCTCTTGTTGTATATAAAATGTTAGTGACAACAAACTTTCTAAATTACCAGCTGCAATTAGAGAGTGAATTCTGATTTAGTGTTTTCCTTTCTCGTTTCTTAGACAAAATTTTAATATGGTTATATTTTGGTAATGGTTATGTTGTTATTAATGCACTTCTGCAGGGCTTCGATGTTTCCTTCGATTCATTAATGAGAATACTTGAGGAAATTGGATCCACCACTTCACTTGTCAAGTATTCATTTTCCCTTCTACATCTCCCCTGTTGATTAGAATTTATGAAAAGACAATCTAGTAGAATATTTTCTGAAATGGGAGATTGTTGATGAATTCATTTGCTTTAAGTTTGTACTTTTTTTTATTTTATTTTATGAGCATCTAGGGGAATGGTATTACAAGGACATAAGGAGCTGAACTAATTGAAGTCTGCTAAAAACTCAGTTCTTCTTTATTTGAAGTAATTATCAGCTTTGCAACTTTTTTGCAGACTTGTACATACATTATTAATTTTCCTTCCTTCACATAAGTTTTTTCTTTTCTTGACAACAGAAAAAATATGTGATATTTACTATTCCTCCAATTGTTCACTTCTAAATGTAGTTCCTACATGTAAAGAAATCCTTTTTTAGTTTTATAAATCCATCTTCATCTATTGATTTTTTTTTTTTAATATTAATTGACCTAAGGAACTATTAGGTGGACTTGGAAGGTGTTTAGATATGTTGGATCTTAAGGTAATTGTTTCTTACTGTGATCTATGCTCAGTTCCACAACCCAAAATGGTATGCTTCTTGGCCACTTTACCTTGGCCAACCTTGTGGGGTCCTTTCCATTTCTTAGTATAGTAACTCTCTTGAACTTGCAAATTGTAATACCTCCTCACAAGTATAATGAGATTATAAGACCTGTTTTCTTTTGCCATCTCTTGTTAAGTTTATTCTTGCTCATATCTTAGACGATAAATGTTGATTAAGTTTATCCTTGCTCATATCCTAGATGATAAATGTTGATTGTACTCTCTCTTAAGCTAAATTTGCCTTTATTTGATACGAAAGTTACACGGTTGATTGAGTCGGTTGAATTTGATACATTTGATGGTTAAACCAAAACCTACAAGTTATTGGTTTTTAAAAATATTAGGGCGAGGGTTGAGATATACCCACTAATAATTAATGGTAAAAGGACTCTTATTTATTTGCTTTTAGCATAATGTATCTAGCAAGATTTCTTAGTGTACCCTTCCTCAGGCATCAAACAGTATAAACTATTTGTAAATAGTTTATCTATATTTGTAAATAGTTTGAATCATTTTGCTATATTCGAAAATAGCCTTAAAAAGTATACTATGACTAAATTTTTGTTTTCTTATTGTTATTTTTGTAATATTTGTAAGGCCAACTTTGCATCATACATTGAAACACAAAATTAATAAAATTATACTTAGATTTTTATATGGTAAATTAGGTGTTCTCTTTATTTTCTTTTGTGGATTGACTTTCTAATTATGATATAATTTTGGAGACATTTGAATTCTGTTCGTCAATCCTCCTCTCTTCGATTGGAGCTTATTATAATTTCGTGTTATTGGTCTCTTTTTCTATTTTGTTCCTCTAATATTTTTATTTGGTATATAATGGCGTGCAAGTATATAAGAGAAAACAGTTAATGTATTTTAAATTGTTGTGTCGTGCAGAGTTGGTGCAGTAGGTCCAAATATTTCAGTTTTGGTGAAGCACTTGGGATTTTCTAAGTTTAAGACTTCCAATTTGTAAGATAATTTAGTTGCTAACACTAGTACTAAATTGGGCTTTAATGTCGGTTTAAAACTGACATTATATAGGTACAATGTCGGTTGTCAACCGACATCGAAAATCATAAAGCAGAATTGTTCTCGTTGCAGAAGAATCAGACATGGTCATTGGTTCCAAAGCCTCCTAATCAGAAACTCATTCAGTCAAAGTGGATTTATAAAATCAAACCAGGTACATGAGGTGACAGTAAGCCTAGGTATAAGGTTAGGCTGGTGGACAAGGACTACACTTAGAAGGAGGGAGTTGACTTTCATGAGATTTTCTCTCCAATGGTGAGACATTCGTCCATTAGATTGTTTTTATCTATTGTTGTTCACTTTGATAAGTTTCTTGAATTGATGGACGTCACCACAACATTCCTTCATGGAGAATTGGAGATGGCTTAACTTAAGCGCTATGAGGTGAAGGAAAAGGAAGACATGGTTTGTCGTCTTCATAAGTCCATCTATGGACTGAAGCAATCGCCGAGACAGTGGTATATTAGGTTTGATACCTTTATCTTAAAACAGGGGTTTCACAGGAGCTCATATGATGCATGTGTTTACTAAAAACTATCTGAAAAGGGTACATATATTTATCTACTGTTATATATAGATGATATGATATTGGTGTCTAAGGATAATGCTGAAATCTATGAACTCAAGAGACAATTGAGTAGTGAGTTTGAGATGAAAGATCTAGAAGAGTTGAAAAAGATCTTAGGCATGAATGTTAAAATAGATAGGGAGAAAGATTTGTTAACCATTTTGTAGGAGAGTTATGTGCATAAACTGCTTGAGAAGTATAATATCTCTGGTTGTAAGGCAGTTTCGACACCCTTAACATCTCACTTTAGATTTTCTTCGTCTCAGTGTCGTATTACTAAACAAGAAAGGTTAGAGATGTCTAATATTCCCTATTGTAATGTTGTTGGAAGCATTATGTATCTGATGATTTGTACTAGGCCTGACTTGGGTTATGCTATGAGTATGATAAGTAAGTTTATGTCAAATCTTGGGAAGGATCATTGGAACGCAGTTAAATGAGTGCTTTGATATTTGAAAGGCAGTGTTAGTGTATCATTATGTTTTAGTAGAGATTGTGATAAATCAGTACTATTGGAAGGCTTCACAGATGCAAATTATGCTGCAAACCTTGACAAAAGAAGGTTTTTATCTGGTCACATTTTTCATTTGTATGGTAATGTGGTCAGTTGGAAAGTTGCTCTATAGCTAATTGCTACTTTGTCTACTACTAAGTTAGAGTATACTTCAGTTGGTGAAGTAGTGTTATTGAAGAGAATAGTTGGTGAGTTGTTGTCGCAGGAGTTCTTTCCTATCATCCGTTGTGGTAGTCAGAGTGCTATCCATCTTGCGAAGAATCCATCTCATTGTGAACGGTCAAAGCATATCGATTTTAAATTTCATTTTATCAGAGAGGTTGTTGCTCAAAAAGATACTGAATTAGTCAAAGTTCATACAGTTGAGAATTTGTCAGATATGTTAACTAAGGTTCTTCCAGCTCATAAGTTTAAATACATGTTCAATGAGCTGAATATTAAATCTAGATGATAGGGTGATTGATTGGAGATTCAGTTTGGTGCCTTAAAAATTTTTGTTATGAGGGAGATTTGTTGAAAATAACAAGTTATTTAAGTGGACTTCTCATTAAAGGCATTTAAGTAAATAAGGCCAGTGATATTTATGTAAATTGTGCATGATGCCAATTTTGTGAATAAGTTGATCTTCATCAACTTAGGGTCTCCATCGTGATTCAATTTAAGGAGAAGAAAAGAGGGCAGTTGAAATATAGAAAACACACACTTTTGGAGAGAGAGAAAACTCAACAGAGAGAGAGAAGAAGCCGTAAGTATGGGGTTTTTCGATCAGCCGAGCTTGTCGTCCTTGCTTGTTGGACGACAGGAGCGCAACAACGTGGGTTCTTCGGTTACATCACGAGTGTTCTCGTTCTGCAGAGACGTTGTTTGATGCGTGGGTCTTCGATTTGGAGAGTTTCGTTTGGCGTGTGGGTCTCGATTTCAAGGGCTGGTTTCAGACGTTCTTGGCCTCGATTTTATAGGCTATTTTCTGTGCGTGGGTCTCTCGGTACAGTGGGTGCTTGGCCGGCACTAAAGTTGGGTCCGACAAGCAATTGCTCAAGCGATTGGTCTTGGTTAAGAGGCAAAATAATCGTGGTTTTATTCTTCTTGAATGGATAAATTGCATATTGTTGATTCTTTCTAATTTCTGTAATTGTGATTTCTCTTAATAAAATCATTCCAAGATGGTTATCAAAGTGGATGTAGACCAAATTGGTCAAACCACTATATATCGTTTTTTTTATCGCCTGCAATTTATTTTGCTGGCTATTGCTTCTATTTGGGTGTATTATGAAATCTGTTTATATTTTACAAAGAGATTTAATTGCAATTGATTTTGTCAAATTGTTTGTTGTACAATCATAGAATTTTTTTCTTCCAAACTCTTAAAGTGATTTTTATCTATTTAAAACTCTTAAAAGGGGTTTTCATCTTTCTTGAGTAAAATAGTTGGTTTTTCTTAGCCAAATTTCAAATTCCAAA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ATGGCTTCGGGAATGGAACTATTAGGTGGACTTGGAAGGTGTTTAGATATGTTGGATCTTAAGATTTTGTTATCAATGACGACCATGCCAAAGGGAATCACACTTGATTTTATTGGGATTCTCTTGGTTAACTTTAACATGATTGAGGTAACAAATGCAACAGATTACATTGGTTATGATCCAATAAAAGGAGATATTAGTCCTGGATGTAGTAAAAAGCATCCAGAACTTTGTAAATTAACTCCTGCAAATCCATATCAAAGAGGTTGCAATGTAATCCATCGTTGCAGGGCAGGAAATGATATTATAGATGGTGTAGAAGAGGATGCATCCACTAGCTCGGCAATGAGCCCTAATGCAGAACTGCATCTTCATTGA ATGGCTTCGGGAATGGAACTATTAGGTGGACTTGGAAGGTGTTTAGATATGTTGGATCTTAAGATTTTGTTATCAATGACGACCATGCCAAAGGGAATCACACTTGATTTTATTGGGATTCTCTTGGTTAACTTTAACATGATTGAGGTAACAAATGCAACAGATTACATTGGTTATGATCCAATAAAAGGAGATATTAGTCCTGGATGTAGTAAAAAGCATCCAGAACTTTGTAAATTAACTCCTGCAAATCCATATCAAAGAGGTTGCAATGTAATCCATCGTTGCAGGGCAGGAAATGATATTATAGATGGTGTAGAAGAGGATGCATCCACTAGCTCGGCAATGAGCCCTAATGCAGAACTGCATCTTCATTGA MASGMELLGGLGRCLDMLDLKILLSMTTMPKGITLDFIGILLVNFNMIEVTNATDYIGYDPIKGDISPGCSKKHPELCKLTPANPYQRGCNVIHRCRAGNDIIDGVEEDASTSSAMSPNAELHLH
BLAST of Lsi06G005950 vs. Swiss-Prot
Match: RLF9_ARATH (Protein RALF-like 9 OS=Arabidopsis thaliana GN=RALFL9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 7.7e-08 Identity = 34/74 (45.95%), Postives = 41/74 (55.41%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G005950 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L8B1_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G426350 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 117.5 bits (293), Expect = 1.2e-23 Identity = 61/98 (62.24%), Postives = 71/98 (72.45%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G005950 vs. TAIR10
Match: AT1G61566.1 (AT1G61566.1 ralf-like 9) HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 4.3e-09 Identity = 34/74 (45.95%), Postives = 41/74 (55.41%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G005950 vs. NCBI nr
Match: gi|700202865|gb|KGN57998.1| (hypothetical protein Csa_3G426350 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 117.5 bits (293), Expect = 1.7e-23 Identity = 61/98 (62.24%), Postives = 71/98 (72.45%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Lagenaria siceraria
Date Performed: 2017-09-18
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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