Lsi05G010880 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi05G010880
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionSerine/threonine-protein kinase
Locationchr05 : 18640473 .. 18657993 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
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mRNA sequence

ATGTTGAACACTCATGCAATCACTTCGTTGAGCGTCCTACACTACAAGATATATATTAACGAGGCTAGATCTCCACATGTGATTGCATTGCCTGTACTCAAGGGTACGTTTCCTTCTATACCAAACATCACAACTTCAGAAACGACATTCGGTTTTGAACCCGCGATTCAGGCATACAATGGGGAGTTTGACATTTCCTCTTATTTCAAGCGCGCGGGCGCGTCGACGGTAGGCCAACTTCTATTCGCTGTTGCAGCACGTTGGCGGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTGAACACTCATGCAATCACTTCGTTGAGCGTCCTACACTACAAGATATATATTAACGAGGCTAGATCTCCACATGTGATTGCATTGCCTGTACTCAAGGGTACGTTTCCTTCTATACCAAACATCACAACTTCAGAAACGACATTCGGTTTTGAACCCGCGATTCAGGCATACAATGGGGAGTTTGACATTTCCTCTTATTTCAAGCGCGCGGGCGCGTCGACGGTAGGCCAACTTCTATTCGCTGTTGCAGCACGTTGGCGGTAG

Protein sequence

MLNTHAITSLSVLHYKIYINEARSPHVIALPVLKGTFPSIPNITTSETTFGFEPAIQAYNGEFDISSYFKRAGASTVGQLLFAVAARWR
BLAST of Lsi05G010880 vs. TrEMBL
Match: E5GB79_CUCME (Serine/threonine-protein kinase OS=Cucumis melo subsp. melo PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 6.1e-06
Identity = 28/44 (63.64%), Postives = 33/44 (75.00%), Query Frame = 1

Query: 38  PSIPNITTSETTFGFEPAIQAYNGEFDISSYFKRAGASTVGQLL 82
           PS+PN TTSET FGFEP IQ YNGEF++SS FK    + + QLL
Sbjct: 326 PSVPNTTTSETAFGFEPTIQGYNGEFNLSSDFK--VTNNINQLL 367

BLAST of Lsi05G010880 vs. NCBI nr
Match: gi|307135852|gb|ADN33721.1| (serine/threonine-protein kinase [Cucumis melo subsp. melo])

HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 8.8e-06
Identity = 28/44 (63.64%), Postives = 33/44 (75.00%), Query Frame = 1

Query: 38  PSIPNITTSETTFGFEPAIQAYNGEFDISSYFKRAGASTVGQLL 82
           PS+PN TTSET FGFEP IQ YNGEF++SS FK    + + QLL
Sbjct: 326 PSVPNTTTSETAFGFEPTIQGYNGEFNLSSDFK--VTNNINQLL 367

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
E5GB79_CUCME6.1e-0663.64Serine/threonine-protein kinase OS=Cucumis melo subsp. melo PE=3 SV=1[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|307135852|gb|ADN33721.1|8.8e-0663.64serine/threonine-protein kinase [Cucumis melo subsp. melo][more]
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0016310 phosphorylation
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0000166 nucleotide binding
molecular_function GO:0004672 protein kinase activity

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi05G010880.1Lsi05G010880.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Lsi05G010880Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB219
Lsi05G010880Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB234
Lsi05G010880Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB560
Lsi05G010880Watermelon (97103) v2lsiwmbB335
Lsi05G010880Watermelon (97103) v2lsiwmbB346
Lsi05G010880Watermelon (97103) v2lsiwmbB355
Lsi05G010880Wax gourdlsiwgoB459
Lsi05G010880Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsilsiB106
Lsi05G010880Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsilsiB156
Lsi05G010880Cucumber (Gy14) v1cgylsiB082
Lsi05G010880Cucumber (Gy14) v1cgylsiB225
Lsi05G010880Cucumber (Gy14) v1cgylsiB417
Lsi05G010880Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB247
Lsi05G010880Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB486
Lsi05G010880Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB585
Lsi05G010880Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB769
Lsi05G010880Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB837
Lsi05G010880Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB235
Lsi05G010880Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB470
Lsi05G010880Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB565
Lsi05G010880Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB761
Lsi05G010880Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB821
Lsi05G010880Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB209
Lsi05G010880Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB270
Lsi05G010880Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB616
Lsi05G010880Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB716
Lsi05G010880Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB199
Lsi05G010880Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB213
Lsi05G010880Cucumber (Chinese Long) v2culsiB200
Lsi05G010880Cucumber (Chinese Long) v2culsiB215
Lsi05G010880Cucumber (Chinese Long) v2culsiB526
Lsi05G010880Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB356
Lsi05G010880Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB382
Lsi05G010880Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB317
Lsi05G010880Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB337
Lsi05G010880Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB348
Lsi05G010880Watermelon (97103) v1lsiwmB357
Lsi05G010880Watermelon (97103) v1lsiwmB367
Lsi05G010880Cucumber (Gy14) v2cgyblsiB185
Lsi05G010880Cucumber (Gy14) v2cgyblsiB204
Lsi05G010880Cucumber (Gy14) v2cgyblsiB494
Lsi05G010880Melon (DHL92) v3.6.1lsimedB398
Lsi05G010880Silver-seed gourdcarlsiB066
Lsi05G010880Silver-seed gourdcarlsiB717
Lsi05G010880Silver-seed gourdcarlsiB879