Lsi05G008410 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi05G008410
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionUnknown protein
Locationchr05 : 13726638 .. 13773365 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
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CAAATTTAACTATTTCTAATTTCGCCATTAATTTGATAAATGACGTGGCAATTTATTTCTAGTCCAAAATTTCTCATTCAACAGTGTTATATACATATGTATGCAAAATCTCTCTTTTATTCTAATCCATTTTAGTTTGAACAGAAAAGAAGACAGACAAGTTCCACGGCCTTCTTGCCTCAAAGTCAATTCATTGCGTCTATTTTGTATACAAAGTATGACTTGAAAACTAAAATGTTCTTCAGTTATTGTATAACTAAAATGTTTTGCAAAATCCTAAAAAAAAATCGAGATACTTTGTGCAGTCCAAATAATTGTCGAGTAAAAATTGTTAATATTTTCTTTTTATTAGGTAAGAAAAAAAATGCACCTAATCATTGTTCTAAACTACAAATAAACTACAATTGAGATTGAGAATCTATTTCTCATTCAAAGAGTCAAAATTTGAATTATATGATGCCTCAGTTGATGAAAATCCTTGAATAATTTATATAAATGAATTAATCTCCTTATCCGCACTCCATTTCGTCCCATCAAAATGGTTTTAACTCTTAATTAGGATTTGTGTACTATGTATAGATGGTTGGAATTTGATATAGATGAAAATGACACCATATAACAAGTTTTGTTTTAATCCATTTGAATAACGAACAAAAATAAATAATGGTAAAAATCAAATCACCAATATTTAAAACAGTAATAAAGTGTCGTGTCTAGTGATTGACACTCGTAGACTAATGTTGAATATACTAAACTAAAACAAACATCTAGAAAACTCGATGTTGATTCGCGACATGACTGCCTATAGTAGGTTACTAAATCTATAACCTCAACCTTAGAACTTTGATCGTTAGCAATATCAAGACAACTAACATATTCCTAACCCTTAAAAAAAACCATATAATATAATTATATAATTATATACTATATAGTTCTAAGATTTGCCCTACAAACAACTTGATGGTTGAACTAAACTAGCAACGCTTCCTTCAGCATGACTACATGAAGCTTTAGCTGCTTCATTTTTATAACTCAGCTTCACATCCTCCAGCGTTATGTCACTGCATGGAAATTTCGAGCTACAATCGAATTTCATCGCAACTTGTGTTGCTGATGTTCCGTGGATGCTTCGATATTTCACATCGCTAATTTTAACTCCAGAATCCTATTTGTAAAAAATAAATAAATAAATAAGATACAAAATATTTAAAAGAAAAAAATAATAGTTTGGCACGTGGCAAGCTGAAGTTGGATAACAAAAAAAAAATGTCAATACAGACCTGTCCAGGACAACCTTTGTTTTCGGGGCAATAATTTTGATCGATGATGATAGGATTTTCGACATTGACCATTACAATATCTTTAAAAATAATGTTTTTTGCAAATCCTTTGCTTGGCCTTCCCCATGTTTTAATTCTGACCCCATTTTGAGTGTTGGTGAATGTGGCAGATTTCACTGTTACATTCTGAACACCATTTTCTTGCATTTCTCTTCCTAAACTCCCAATGCTGCACCAACCCATCAAATAAAAATCATATGTTTAATTATCTCAATTAACACATAAACTTCATTAAAATTTGAAAATTTAGTACCTAATTCCATGGCCAGGTCCACAAGCAACATTCTCAATCCACAAGTTCGACGTGTCAGGACCTATTGAAATGCAGTCATCACCAGTGCCAATGATGGAGTTGAGGATAGTAACCGCTGAAGATTGTGCTACGTGA

mRNA sequence

ATGAGGATGTCGCTGCCTGAGAAGAAAAGAAAGAAAAAAAAATTAGAGAGAGTAGAGGAAGTGAGAAAGGGTGAGGGAGAAGATGAAGATTACCTAATTCCATGGCCAGGTCCACAAGCAACATTCTCAATCCACAAGTTCGACGTGTCAGGACCTATTGAAATGCAGTCATCACCAGTGCCAATGATGGAGTTGAGGATAGTAACCGCTGAAGATTGTGCTACGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGATGTCGCTGCCTGAGAAGAAAAGAAAGAAAAAAAAATTAGAGAGAGTAGAGGAAGTGAGAAAGGGTGAGGGAGAAGATGAAGATTACCTAATTCCATGGCCAGGTCCACAAGCAACATTCTCAATCCACAAGTTCGACGTGTCAGGACCTATTGAAATGCAGTCATCACCAGTGCCAATGATGGAGTTGAGGATAGTAACCGCTGAAGATTGTGCTACGTGA

Protein sequence

MRMSLPEKKRKKKKLERVEEVRKGEGEDEDYLIPWPGPQATFSIHKFDVSGPIEMQSSPVPMMELRIVTAEDCAT
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi05G008410.1Lsi05G008410.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Lsi05G008410Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB476
Lsi05G008410Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB314
Lsi05G008410Watermelon (97103) v2lsiwmbB352
Lsi05G008410Wax gourdlsiwgoB461