Lsi05G007360 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi05G007360
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionUnknown protein
Locationchr05 : 10118662 .. 10129288 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
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ATGAGTAGTGTGTTTCAAAAGAATTTTGTTTTTTGTAATCAATTAATCGATTTTTTTCATATGAATAACATTGGTTAAAATCTTGATTTTTACGATCTTGCTTGACTCTATTTCGTCATTTTTGGGGGAGTAATTTTGCCCATCTAATCAGACCTAGAATTACTACTGAAAAAATATATAAAAGATCATTGGGCCATGCGGGTTCTCCGTAATAATTATGACCCATACCCTTAGCCATTGGTCTGAAACAGAAGGAAATTCGAGCAACCAGTAGTGTTTTGATGATTTCAAGCTGTAGAGTTCGAATTTAGAGCTAATATTTTGAGGTTAGTAAGTTAACACATTTATCTACAACTTCTATGAAGAATGCCAGAGATGAAAATGGTTGAAAGTAGATGAAATTATAGGTAGAAGGCAGTAAATAGGAAAACTCGCGAAACTGGAGGGACCTCTGGTTTTTGAAGCGGTTTGAGCTCTCTAGGAGGATTTAGAAGCTGAAATTAGTAAGGTGGAACAGAAGGAGGTTGCAGGAATCGTGAAGAAGGGTACCTTTTGGTACGAGGCAGTTTCTGGACAATCTAGTGATTTTTAGGTCTTCTTGTCTTCACTAAAATAGGGGTAAATCGTGATTCTTGAGCAGCCATTGATCTAAGGAATATTCTGGGCAAACCATACATTTTTAGGTCTTTCACTCTGAATGACAAATAGAGTTGGGAGAAGTCTACAAGTCGTTGTGAGCTAGTTGGCTACAAACAGTGAGTGACAAAAATGTTCCAATTTTACTTATTTAAGTTATTGAACGTTTGATATTATATCTTTATGAGCAAAGTTTCTTAGGCAAGCTATTTCTCATGTTTGTACACCCTATTTATGTATAAACATGATTTGGTTATGCCTGGACTACGTTGATCGCTTGATGTTCCCTAAGTGTTATTTATGAGCTCGTATTTACGACTATGAGACGTTCTCCGTCTTATGTTTCTTAAATATGTTTTACAAGCTCGGGATTGTTGAACATGTGTTAGTAAACGGTAAGTACCCTATGTACTGATACCTAAGGACATGGAGACGATATTGAGGTGAATGAGTATGAATGTGCAATGATACTTAAGGACATGGAGACGGTATCGAGGTGAATGTGCAATGATACCTAAGGACATGGAGACGGTATCGAGTTGAATGTGCAATGATACCTAAGGACATTGAGACGGTATCGAGCTGAACCATAAAACCAAGGACTTCGGTGACGTATCAGAACAGCCCGATGTATGCTAGCTCCACGAGCACGTACGACCATTTATGATGTCATGACGTTGAGAGTGTTGAGCTCGCTCCACCTCAACTAAGGAAATTTGGATACTAAATTTCTTAGGAATCTTACATGATAAAAAAACCATGATTCTTTATGTAATGTTTATGAAGTGTTATTAAGAGATTTATGATATTTAAGGCAAGCATGTTTTAGAACGTATGACAGTTTATGATAATACAATGTTTATGAACTATGTTTTCAAATGATTTCGATGTTATATGAACTACGTTTCTAGATGGTTACAATAGTTATTGAGCTATGATGTTAGGTGGATTAAGTACATATGAGTTATGGTTGTAAATGTTTATATCTATGAAATGTTTTATGTACAGGATTTCTCTATGTTGAAACCATCTTGTTTTAGTAAGAACGTTAAATAGCCTTGTTACTCACTAGACCTTATGTCTAATATTTTCCAAAATGTTTCTATATTTTCCAGGTAGTGGAAGAGGGACTAGTGTATATAATAGGAAAGTATATATGATTTCATGCTCTTTCTCAAGTTTAAGAGGGTAATCTGGGAGAGGGTGTGACAAGTTAGTATCAGAGCATAAGTTAATGGGAATTCTAGATTTTAAAAGGGGGAAGATTAGGCTCATGCATATAGTTAGGAGCATGTTATAACTATAATGTCCTAATGTGTGATATATTATTAGGAGTCATGCCCCGAACACACGAGCGAGGTAGGCAAGAGGACACTGGATTACCTGAAGCTACCAGGAGCGGCAAAGGAGCTCCAGTATCATAGGGAGAGTCTAGTAACCCTCATGTGCAGACTGAACCTAATATAGAAGAACAGATTTTTAACAAGATAACCCAGAGGTTGTGATATGAAAACCCTAGTAATTTGAAAATTAGGAACCCAATTGTTGAACCCCTAACAACAAATCCCAAAACCCCCAAATCAATTGATGTCAATCCAAAGGAAAATACTAGAATTGGATTACCTTTTTATCGAAGACCAAGAGATAAGGAGAACTAGTTCCTTACTCCAAGTTCGAACACTCCACAAGCAAGATGATCAAACTTACCTGAATGTTCTTGGCATGCAACCCTAATTCAAGAATTGCAAAAGTGGCAGGATGAAACTCTGTCATCTACCAGAGAATTCTCATTCAAGGAAACCCTAAAGTTCTAAAAACATCAAAAACTATTCCAACAACTTAATGGCTAGACTTTAAATAGTCTCCCAATAAAAAAAAACCCTAATGCAACTTAGTAAAATGACAAAATTACCCCTACTTAAATATCATAAAAAAAAGGATAAAATTAGAAATTATTAAATTACATCAAAATTATTAAATAATAATTTGATGCCTTGGGAGGTTCATATCATCCTCTCCTCCTTTTGAAGGATTCGTCCTCGAATCCAAATCAAAGCCTTGTAAAGCAGTTTTGAAGTCATGGAAAGAAAATGATGTCAATTGGTTTCATCTTGTAGCATCAATTGAAACCAATTATAAAGCTTTTGATCAAATGTTGCTGCTTGAATCCCCTCCATTGAGTTCACCTCTACTTGAATGTGAGAATTCAACGCTAATTGTAGCTTTTTGGCTCTTAAGCGTGTGATTGGCCCCAAAGGTAACACAAGGGCATCCTGGTTCATATCATCTTCTCCCCCTTTTGAAGGATCCGTCCTCGAATCAAGTTCATTATCTGCATCAAAAGGAGTTAAGTCAAAAATATTAAAAGAAGCACTCACCCCATATTTACCTTCAAGATCAATTTGATAGGCATTGTCATTGATTTTCTTCATCACTTGAAAAGGTCCATCTCCCTTTGGGTTTAACTTAGAATCTCGTTGATGTGGAAATCTTTCCTTTCGAAAGTGGACCCAAACCCAATCTCCCTCCTTAAATATCTTAGGCCTTCGATGTTGGTTAACCCTTTCTGCTACCTTGGCGTTTTGCTTTTCAATCCTTTCTTTAACCTCTTTATGTAGCTCCTGAATAGCGGTAGCCTTCTCATCAGCTTGAAAATTCACAACCTCGTTAGAAGGCAAAGGCAACAAATCAATAGGTGATAAATGGTTAAATTCGTACACAATCTCAAATGGTGTACATTTAGTGACACTATGAATAGCCCTATTATATGCAAATTCAATAAAGGGTAGAAAATTCTCCCAAGTTTTGATGTTTCTATCTATTATAGCCCTAAGCATAGTCACCATTGTCCTATTGACTACCTCAGTTTGTCCATCAGGCTGAGGATGACATGTAGTGGAGTAAACTAACTTAGTACCAAGCTTTCCCATCTCTATCACTAACAATGCTTCTAGGAATGCCATGTAATTTAACCACATCCTTAAAGAATAAGTCAGCCACATGTTTAGCATCATTAGTTTTATTACATGCAATGAAATGAGCCATTTTGCTAAACCTGTCAACTACCACAAAAATGTTATCCTTTCCTCTCTTAGATCGAGGTAGACCCAACACAAAATCCATTGAAATATCTAACCATGGTCCACTAGGGGTTGGCAAAGGCAAATATAGTCCATGTGGTTTCGACTTAGACTTAGCTTCCCTACATGCAATACATCTCTCACACTCCTTATGTACATCATGTCTCATTCTAGGCCAATAAAAATGTTCACTCAACATGTCATATGTCTTAGTGACCCCAAAATGTCCCATTAAACCTCCCCCATGCGCTTTCTTAACTAGTAACTCACGAATAGAACATGTCGGAATGCAAAGTTTATTTTTCCTAAACAGAAACTCATCAAACAACATATAATCAGACACAACACGTTTTTGCTTGAGATGTTCAATAATAGGTGCAAAATAAGTGTCTTGTGAATACAATGTCTTAATATGTTCAAACCCAAGCAACCTAGTGTGAAGGGCGTTTAGCAAAACATACCTCCGAGATAGTGCATCTGCTACTATATTTTTCTTACCTTTTTTATACCTTATCGCATAAGGAAAGGTCTCAATGAACTCTAACCATTTTGCATGTCTTCGATTCAGCTTATGTTGGCCTTTCAAATGTTGTAAGCTTTGGTGGTCAGTGTGAATAACAAACTCCTTTGGCCACAAATAATGTTGCCATGTTTGTAGTGCTCTCACCAAGGCATAAAGCTCCTTGTCATATGTAGGATATTTCAAGGCAGCTCCATTCAGCTTCTCACTGAAGTACATCAATGGTCTTTGATCTTGCTTTAACACAACTCCAATCCCTATTCCACTGGCGTCGCACTCAATTTCAAATGTTAGTTCAAAATTAGGTAAGGCAAGTAAAGGCGTATTACATAGCTTATCTTTTAAATCATTGAAAGCGCATTCTTGTGCTTGTCCCCAGTCAAACTTTATATTTTTCTTTATAAGTTTATTAAATGGTGCAACTATGGAACTGAAATCTCTAATAAACCTCCTATAGAAACCAGCTAACCCATGAAAACTCCTAATCTCACTAGCATTCTTTGGTGTAGGTCACTCCCTAATTGCTTTAACCTTTTTAGAATCAACTTACACCCCATGTTTAGAAACTACAAAACCTATGAAGTTTACATTTTCCATGCAAAAATAACATTTTTTTATACTAGCGTAAAGTTGTTCCTTTTTAAGTGCAACTAGAACATACCTAACATGCATAACATCATCCTCTACTGTCTTAGAATATATTAAGATGTCATCAAAATAAACCACTACAAACTCTCCTAAAAATTCATGCAATACATGGTTCA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CAACAAAATGCCACTAATGTAAATATAATATAAATAATATTTTTAAAAATCATAAAATGTTTATTTACTAATTTAAATTTATTTTTGAAATTATTTATTATTTTTATTTTTTTTAGAAATATCCATCGAAATCAATATTTTATCTATATTTCCATCATATTTTCTATAAAATTAAGATATCGATTTTTAGCTCAAATTGGCATAGTTAATCTACAACATAACAAATGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTGATTTTGTGCAGCAAATTGATGCAGTAATGCTAATGTAATTAACAATAAAACTAATGATTAAAGATTCTATTTACTTTCTTTTCATTTTCTTTACTTGTAAGGACATGATAAAGGGATCTCCATAACAAGTTACACATTCCTTTGCTTCCCTTTAATTACTTTCTTTTTACTTGAATCAAACCAGCCTATGCCTACCACATTCAAGAAGAAAAAAAAATGAAAACCCCACAATCATTTTCACTCAAAATTCCAATAAAACCTTCCTGTTCTTCAGCCATGGCCATCATTTCCCACTTTCGCACTTCACCACAGAGAAAGAGAGGCCAAGAACGTGATGAACAGGTGAAGAAATTGCAATTTCATTGA

mRNA sequence

ATGAGTACCTATGCCTACCACATTCAAGAAGAAAAAAAAATGAAAACCCCACAATCATTTTCACTCAAAATTCCAATAAAACCTTCCTGTTCTTCAGCCATGGCCATCATTTCCCACTTTCGCACTTCACCACAGAGAAAGAGAGGCCAAGAACGTGATGAACAGGTGAAGAAATTGCAATTTCATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGTACCTATGCCTACCACATTCAAGAAGAAAAAAAAATGAAAACCCCACAATCATTTTCACTCAAAATTCCAATAAAACCTTCCTGTTCTTCAGCCATGGCCATCATTTCCCACTTTCGCACTTCACCACAGAGAAAGAGAGGCCAAGAACGTGATGAACAGGTGAAGAAATTGCAATTTCATTGA

Protein sequence

MSTYAYHIQEEKKMKTPQSFSLKIPIKPSCSSAMAIISHFRTSPQRKRGQERDEQVKKLQFH
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi05G007360.1Lsi05G007360.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Lsi05G007360Cucumber (Gy14) v1cgylsiB074
Lsi05G007360Cucumber (Gy14) v1cgylsiB159
Lsi05G007360Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB313
Lsi05G007360Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB315
Lsi05G007360Cucurbita maxima (Rimu)cmalsiB687
Lsi05G007360Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB302
Lsi05G007360Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB305
Lsi05G007360Cucurbita moschata (Rifu)cmolsiB680
Lsi05G007360Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB173
Lsi05G007360Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB176
Lsi05G007360Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB366
Lsi05G007360Cucurbita pepo (Zucchini)cpelsiB370
Lsi05G007360Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB197
Lsi05G007360Wild cucumber (PI 183967)cpilsiB215
Lsi05G007360Cucumber (Chinese Long) v2culsiB198
Lsi05G007360Cucumber (Chinese Long) v2culsiB217
Lsi05G007360Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB371
Lsi05G007360Melon (DHL92) v3.5.1lsimeB380
Lsi05G007360Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB318
Lsi05G007360Watermelon (Charleston Gray)lsiwcgB319
Lsi05G007360Watermelon (97103) v1lsiwmB358
Lsi05G007360Watermelon (97103) v1lsiwmB355
Lsi05G007360Cucumber (Gy14) v2cgyblsiB183
Lsi05G007360Cucumber (Gy14) v2cgyblsiB203
Lsi05G007360Melon (DHL92) v3.6.1lsimedB387
Lsi05G007360Melon (DHL92) v3.6.1lsimedB400
Lsi05G007360Silver-seed gourdcarlsiB432
Lsi05G007360Silver-seed gourdcarlsiB508
Lsi05G007360Silver-seed gourdcarlsiB614
Lsi05G007360Silver-seed gourdcarlsiB616
Lsi05G007360Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB217
Lsi05G007360Cucumber (Chinese Long) v3cuclsiB235
Lsi05G007360Watermelon (97103) v2lsiwmbB323
Lsi05G007360Watermelon (97103) v2lsiwmbB322
Lsi05G007360Wax gourdlsiwgoB410
Lsi05G007360Wax gourdlsiwgoB414