Lsi05G004360 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) | Cucurbit Genomics Database (CuGenDB)

Overview


Name	Lsi05G004360
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
Description	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein isoform 1
Location	chr05 : 5597783 .. 5609579 (-)

Genome Viewer

Gene Expression

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

GCGGAGGACGGTGCCACCTGCGAAGCAGCCTTGTTGGTACATCATGTAGCGCTTGACGGAGGGGCGGAGGCCGAGGAGCTTGCGAAGCTGGTAGTCAGCGCCGAGCATGTCAACGCCGGAAGTGGTGCAAAAGATGAGATGCGTGATTTTGGATTTGGGTTGACTCCACTCTTCAATGGCTTTTGCAGCAGCGTCTTTGCCCAGTTTCGGCACTTCGACTACCACTATATCCTGACGCGTGTCCAGAGAAGGTGCCATGTACGCGCATATATTCGGATTTTCTCGAAGAATCTCCTCCATTAGATACATCTGTCGCTTTCTGATCATCGACTTTTCACCTTCCCATGTTGTCGTCATCGTAAGAATAATGTAAGTAAAAAAAAATTAAATTATAAATTTAGTTTATGCTATATCCTGTGTCCCTAGCATATGTATTATTAGGGTTAAATTATACATTTTGCTAAATTTTAAAGTTTAGGGTTTACAAATTATAAAATTTTCAAAAATAAAAAATATTAATAGACATTGATAGACTTTTATCAACATCTATTAGTGATAGATTTCTATATAGACTTTGATAGACTTCTATCAGTGTCTATCACAACTACCTAAAAATTTTGCTATTTTGTGTAAATAGTTTCCTTATTTTTCTATTTTTAAAAATTCTCCAATAATGACTAAATTCTATTTTTTTTAAAACTAGAAATAAAGTTCTAATTTTTTTTCTAATCTTTGGGACCAACTTTGTAATTTAATTTTTTGTATCTAATAGACAAAACGAGTATTGTTCAATTGACCCACGAATGTGTTAGCAATCACAAAGTGTGTGATCAAATCTCCCTACCCGTATGTACTCAAAAATATAAATTAAAAAACTTTTTGTGTCTAATAAAATTGTACAAATTTAAAAAAAAAAAGTTAATTTGAACTCTAAATTTTTATTTTGTATAGTCTAAAAAAATTTAAAAACTTAAAGATTGAATTAGTAATTTTAAATGTTTGATCAAATTTAGTTCTTCAACTTCTAAATTTTTTATATTTAATTTTCAAACTTCTAAAATAATGTTGAACCTTTAAACTTAAAAGAAAAGAAGTATTCTAATTCTTTAATTTTAATTTTAATAAAGTAAGAGTAAAGAATGTACTAATAACTAGTAAGTCATTTTAATTTCAAAATAACCATAACTAGTTATTAATTTAGAAGGCAATCTCCTCATCAAATGACATAAAGAAGACTATCAATTTAGAAGACAATCTCATTCCTCCCATACCGTAAAAAAAGAGAGAGAAATATGATCATAGCCTAAAGTGATATTTTTTTAAAAAAAGTTTTAAGGATTCAAGTGCACATTTTAAAAATTTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAAATTAAAAATATAACACAACACAAATGTCCACATAAAATAACAAACAACATACAGATTCTAGTGAACTTCTCCTTCAAGTAAGTCATATGTTCGGAATTAGTAATACGAAAATAGTAGTCAGGATAGTCTGACTGTAGAACGCTGTGCGGCGGCGTGGCGGTACCGATCGCCAACACGGTGGCGGGGCCGTCGGCTCTTTGTGCCTTGCAGATTTCAGCCATGACGGAGGCCATTGAAATTGAAAGAGTTTAAAATTTTTGTAATTAATGTTTTGCAAAAAAAATAATAATAATACAAGAAGTGGGGAAGGGAAAGGGTGAGGAATGTTTGATATGTTTTGGAGTCCAAAAATGAAGTTACATTTAAAAGGAGGGTGGGTACATTGGACATGGCGCATCCACGTGGGGGCAAATGGGGCACGTGACACTTCAATTAATTGAAATTTATTTCATTTATTACAATACTCTCTAGTATTAAATTTTCATCGATATGTCGATATTTCTATCGATATTTTCACGTTTCTATGAGTTCGATATCGAAATAAGGGACGAATCGATATTTCCATTATATTGTAGAAAATCCACGAAACAGAAAAAATAAGCATCAAAATGTCACTAATATAAATCTAATATAAATAATAAACATGTTTACTTATTTGAAAATAATAAAATGTTTATTTATTAATTTAAATTTATTTTTAAATTTTTTATTTTTATAATTTTTTTCAAAAATATTCATCAAAATCGATATTTTATCGATATTTCCATTGAAATTTCAGTAAAATTAAGACCTCGATATTTCCATCGACATTGATATTTTAAACCTTGTAGTGGGCAGAGAGAATGAAACGTGGCCCCCTGCGTCATTGTTTTGAGTCTCGCTTATAGAAACTTTTTATTTTTATTTTTTTTTCAAAAGATTCCTATTAATTTATAGGAAATTTTTTTAAAAATAAAAAAAGTAAGAGAAACTATTTACACAAAATAGTAAAATTTTTAGATAATTGTGATAGACGCTGATAGAAGTCTATGGGGGTCTATCAATGATAGAAATTATAGAAGTCTATCACTGATAGAGGCTGATAGAAGTCTATCAATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGCTATTTTATGTAAATAGTTTGACATTTTTTATATTTATGAAATTTTTCTTAATTTATAAGTATTTATAAATGTAATAGTTTATAGACGTGCATGGTAATCATTCAAACAACCCACCTCCCATTTATAACGATTTCAATTCATACCTCTAAAACAAAAATCAATAGTTATTTTTCTAGATGAAGACGGCATGAATTAGAAATTGAAACAATATCATTTCATGACATTACAAAACTCAATCAATCATCCATATTAAGTGGGTCAACAGATTTAATAGAACCAAAAAATTGAAAAATTGAATAAAAGATGTTCAATCGGTTCAATCAAGACATATGTGACAAAGGCCTACCACCTCTAACTCGAGTCATTTTTCTTAAATGATGTTGAGTCCAATCCAACTTAATTATATTATTATTATGTAAATGTCGTGGTTGTAAAATATTAAAGTAAAGCTAAATGAATTAATGTCTTAGTCAACAAAATTTATGTATCGTAGAATTCTACTCAATTTTAGATATACTAAAAATATTAGAATTAAAATAATATATAAATATGCAAATTGCAAAATTTAATACTCAAAAGTTGAATTATAAATTTTTTTTATACATATTGAAAATTAAAATAATATATAAATCTAAATATTGGAGAATTTTAAAATTCAAAATTAAAATAAAGTATAAATATAGCAGAATTATTTTTGTAAATGGAAAAATTAATAAATAAAGTATAAAATATGGAAATAAATATAAAACAAAATAAAAGTGTTCATCTTAGAAGTTGAAATTTGAAATATAAAAAAATTAATATAAATATTAAAAATTAAAATAATATATAAATATAAATATTAAAGAATTTTAAATTTTAAAATAAAATACAATATAAATATAGAAGGATTATTTTTGTAAATAACAAAACTAGTGAAGAAAATAAATAAAATATAAAAGATGAAATAAATATAAAAGTATCCATCTTAGAGGTGGAAGGGTAAAATAGGCATGCATGACAACTAATAGGCCAACAATGAATTTTGATAAATAAAAGAAACAACATTGTATAAAATAGAAACAAAACTGGGTTGTAGTTTCTCAAATTTGGCCTCATTTTCATAAACGTTTCTCAAATTTGGCCTCATTTTCATAAACGTTTCTCAAATTCTAGAAACAAGAAACGGGAACAATTATCAAACAAGTTAGTTCCTTAAAAAATGAGAAACAGAAAGAGGAAACATGAAACAACAACGTTATCAAACGGGCCCTTAATTACTTGCATGATGATCTGTTCTTTATTTGGTTTGCTTGAGGACAAACAAAGGCTTCAATTTGGGAGTGTGATACATGCCATAAAATACATGTTTTAAGGCTTTATGTTGATATCTTTTCTTGATAAAAATGGCATTTTGCATGTTAAAAGCCCAAAATTGCGCTCTAAATGATTAAGCATGGTTAAACGTAGGTGCTTAGAGTGCTTACAGTATATTTCTATCAGTTTGAGCCTATTTTAAGAGCTTTTACATTGATTTTTGGCTGTGTTGCAAAAAATGTCTGTGATGCACTCGCATCGCCAAAACATGATATGGCTGCAACAAAAACCATAATTTCCAGAAGTCTTGACGGTTGTGTGCATATGCGATATACCAAGTCTTCAGTCATTCTCCAGCACCGAAATTGACTGGAGAGATCCGAAAACGTGATATTCGGCCTTCCCACCCATTTGAAAGCCAATAAAAAGAGAGGGAAGCATTTCTCCTTAAGGGATTGAACACACCTATCATGAATTTAGATCCTCCAAGGCAGTTTCTCACCTAAAAATCCAGACTCTCCAAGAACAAAAGTTCTTCTGGAGAAACTAGAATTAGGACTTCCTACCACGTGAAAATGAGTGTAGAGAGTAAGGATTCATCCTCAGGACAGAAGAATCCAACCTAAAGAGCTTGAGAGGGTGAAAAAGCTATCCAAGGAGGTTGTTTACTGTATTTCCAGCTTTGTTTTTCTCTTTTCTTCTTGTTATTTATATTTTTTGAACATTTACATTGTACCTATGATTATGGAAGCAATTAAATCAACTCATTTATTCTTAATCATGAGCTAAATTCACTAAGAGATGTAATTATGTGGATACCCTAAGGATTCATGGCTTGAGCATTTGTCAAAGTATCATACTTTGCTTAATTGCACATTTCTTCTGTTGATTGTATGGTTAAATATTGTTAAGTTGAATTGACCACTTAATTTAGCAATCTAGTGAAGTTCTAATACTGAGAAGGTTAGAGTGTAAAAGAAAATTCACAAAGGAATAAGGAGTTAAAGCCTATAAATATGATCGCCAAGCAACATTAAAGATAAGGGGCACCATAGGATAAAGAATTCACACTAAAATTCATCTAAGTTGTAGTTAACAATAGAAATATAGGATTAGCTCCTTAGGCTCCTAAAAGAACTTGAGACAAGACCGAATAGGAGAAGATTCTGTCCATGAGTAAGTCAATGCGCTGGTATGATGTGGCCGCACCGCTCAAGGCATAATGATTCTTGGTTGAAACATAGTTGCATCCTTACTTCTACCATTGATTACTTTTATTCTCTTAAACATCACTTATTTACTTCATGTTACTTTGTTTTGGTTACTTAGGTCACTTTGATTTCATTGTTTAAAGCAAACTTAATTGGATAACTAATTTCGTGGGATTCGACTCATGGAATACTCTAAGATTTATTACTTCACCGATAGTGTATGCTTGCACTTAGATTACCTTCATCTATATTTTTGTCACTCATACATATTTGGTCAATCAACATAGTTTGATGGTAAAGAGCTTTACAATTTAACGCCAAGTGTCATATGGTCCTCTTTAATTTGCTACCAATACCATGCATGATGCATTTGCCATGAAGCTTCCTTATGACTTAGGAGATAAAGTGATCATTTTATGATTTCCTTTTCTTTTAATATCTAAGTTAATTTCTTTTAATATCTAACTTACTCCATCACTATTACTATTTTGTTATAGGTTGATCTCCTTCCTAAGGGGACTGATCTGAACTGTATTTGTGATTGGGTTGTGGAGGGCACTACCAAAGAGAAGCTTAGGTAAGTTGGATTCTTTTTGGCCTTGTGGAATGTCTTTCCATCCACATCATTTTGAATGTATAGAGTATAATTTTGTGGCATACTTCTTACGCAAGAATCCATCTTATATTAATTAAAGGTCAGTTTGGATTAACTTTCTAAGTGTTTATAAATACTTTTCTGCACTTATAAACACTTATTTAAAAACTGATAAGAAAGTCAATCCAAACGCACCCTAAAGCGTTCATAAACTTTTAGTTAATGTGATTCATCGTGTTCGGTTAGAGCAAGAGCATGATCTTTGTGATCTAATGTTCCTGGTTCAACTTCTAAATTATGAATCATTGCTTAAACTTTAATTTGAATTGTTCTGCTCGAAGTCTTTGGTTGGAGTAGCTGGAGTTAGATGCTTATAGATTTTCCATCTCAGGGCCAATACTTATATTCCAAGTAATATTATCGCAAGTCTTTTCTCTACTTTTAAAGATGAAGAAACCAAACACAAATTGACCATTTTTGTTTGTTAATTCAAAGGGCTTAGAATATTACAACAATCTCATCAATGAACTTATTAGTCATGCTTAAATTTCAATTTTGTCAGTTTCAAAGTTGAAATTATTATTCATATTTCCTTTGCTTTGATTCAATCTTCTTATGTGACTTTATTCAGCTATGATCTTCCACAAGCACAACCTTTGCAGAATTATGCTTCAAAGAATTTGGAGATAAAAGTATTGTATTGGGCAACCATAAATGAGCCTAATGTGTTTGTTGAGGGAGGATATGACTTGGGATTTTTGCCACCTCAGCAATGTTCAGCTCCATTTGGATTAAGAAATTGTGGAGTTTAAAAACTATCAAGTAACATATCAAAATTTTCACTAACCTTCATTGGATGATTATTTAGTTTGTGTAAACTAAGCTTATAGACATTATTTCTAACTCTAGAATTCTTTATTTTGTTATTTTCTACTAAATTCTGGTCAAATTTTGAAAACTAAAAAGAGATGATTTTTTAAATAAAAAATTAGGAGAATTTGGCTATAGATATTCAAATGTTACCTTAAAAAATATAGAAGACCATCATAAAGAAATTGAGAGAAAATTAACACATTTTTCAAAATCAATAATTGTGTGGGATTAGTTAAATTTGGACTTCCATTAATGTAAGGTTATGATGATATATAGTAATTTAACTTTTGTTAAATAAGATTTGCCAATTGATTAGCATGTAAAGAGTATAATAACTATTAAGGATACTTTGAATATTATACATTATTTTGTTTCCATATGTTTTGCGTAATTTGGAAGATCATGTTCATTCTGTTTGATGTGCTTGTCAATCATTTTTCTCTGTGTATGATATAAATACTGATGTTCTTTAATGTTTACAACATATTGATTTTTTTACATAATAATGTCGTAGGACAAACTGGGGAACGTACATCAAACACAACAAGTCACAACAAAAGAAATTTTAACAAGGTTGACAAGTGGATAAGGTAGTCATATAATTGTCCCTAACATTTGAAAGCTTCTGTTTGTAGCTTGGGATTAGTTTATGACTCCTTCAATCACTTTTCAACTAGGACTCAAGTCATTTTCGGTAAGTTTTATGTATTAAAACTTCGTTTAGATCAATCAATTAAGACATTACATATTAGTTTACAAACCTTGGAAAATTTATGACTTGTAAAAGGTTGTTCGTTGTAGGTTTGGACTAATTCGGATGATTAGTAAAGGTTTATGGTGGATTTTGGACTAATTCGGATGCTCCAAAATAGACAACCAATTCTCTCAATCTTTAGACTTTAGAGCTTTTTGTATATAATGATCAATGTAACTTTTTAATAGGTTACTTAGTTAAACAATTTGTCACTTTCTTTGTTGTGAGAATTAGTTAATTTTTGTGTTTGTTGAAAGTTAAGTAGTATATACAAAAGCAATTCATATTTTATTTTGTTCATGCATGTATAGGTAAAAGGGAAATATTATTGATTTGCAGGTGCAAGCAAATTTTTATTTTATTTTATTATTTAATAAGAAAACCATGAGAGACATGGGTTGTCATAAAAACAGACGAATTGACATTAAAGGCAACCAAAATTGAAAAAGGTGTTATTAAAGGTGTTTAATATCGCTGTTCTCCTTACGTAAATATCTTTAATGTCGATTTTCAACCAACATTAAAGACAACTGGCATTGAAGACTTTTAATAACACGATCTTCGTATTCGGTTGTCAACCACATTGTACCCCTATAAATAGGGTTGGCAAAAAAACCTGCAAGGCCGAAGAAGTAATGGAATGTCTGTTATGTTAGGTTTATATATGTGTCTTCTCCATACACTTCTGAGATGCTTCACGAATAAGTACTAGAATGTTTATTAGATTGAAATATTGATCGGAAATTATCATCTATAATTGTAGTACAAATGACTCCATAGTTAATATGCTTGTTGATAGTCTGTCTGGAAAATTAATATTGAATGGATGAAATATGCGGTGTTGTGCTCATATTCTGAATTTGTTTGTGAAAGATGGGTTGACAGTGATAGGAGATGGGATTGAAAAAGTTCGTAGTAGTGTGCCTTTTTGGGTGCATATATAAAAGGAGGAGACATTTGAGGAAACTGCTCATCATTAAATGTTTATGACGGTCGGATGTTGAGTCTTCATTGTTGTGCTAGATGAAATTCTACATATTTTATGCTAGCCACTGCATTGAAGTACTAGGCTGTTTTTTATCGATTAAAACAACGAGAGCCAAAGTAGAAGTGTTTGCCTTTGGATCAAGATTGGGTATTAGTAACATAGATATGTGAGAAACCAAAAATATTTCATCATGAGACTGAAATATTTTATGGATCCAAATATCCTACTGCTAATATTTTTTCCAAAAATTTGTAAATTGAAATTGGCTATTTCTGAATGGACGAATTCTAGCTTTGAGCAGGTAAGAACGATGGCTTCAAATATGATTATAAAGTTTGATAAGTATTGGAAGAAAATTCATGGTGTAGTGGCTGTAGCTGCAGTTTTAAATCCTCATTACAAATTGAAGTTGATTGAGTTTTACTTCCCTTGAATTTATGGAGACACTTTTCTTCTTGAAGTGGAAAGGATTAAAAAAGTTTGTTCATATTTGGAGAAAGAATATCAGTTGAAGCATGAAGTTGAAGGTGATGATTCTCACTCTAAAAATTTAGATGGAGCATCAAAGAATTTAGAATTTGATGATTTTAATGATGATGACTTATTTGTATCAAATTCTAATACGATGAATCAAAAGCAGCTGTTTGATACATATTTAGATGAACCTGTCTTACCTTGATTATCTGATTTTGACATTCTGAGTTGGTGGAAATTGAATGGAGCGAAATATCCCATTTTACAAGAAGTTACCAGAGACATATTAGCAATCCGGTTATCTAGTGTTGCATCAGAGTCTGCTTTCAGTACTTGTAGTAGGATTGTAAGTCCATATCGTAATAAACTTCATCCGAAGACAATAGAGGCTTTGATGTGCGCTCAATGGATTGCAACTGAAGTTTTGATAGGTTTGTTAGTTTGTATATATTGTTTAACCTATCTTTTTTATTTAATATATTAACAAATATTCTTTTGTGTTATAAATATGTGACAAGATAAGGTACTAGCATAGGAAAAGAAATGGTAAAACATTTAGTCACTGTTCTACCAGATTCATAATTTGATGAAGATGGAGTGACGACTGAGGTATGCTTAATAATTAAAATTATTTTTTTATGACACTTTGTTAAGTGGTTTTGTTGTCTAATTTTTTTATGACATTATTTGTTAATTATATATTAAATATAGGAATAATACTCACAGCTAAAGACAAGACGTCGACGAAAAAGGAGAAAAAATTAAACATAAAGACATCGGCGAAGAGAGAATGATGAACAAGTTTATGATTGTGATTGTATAAGATGTTTGACGTTATTTTACTTTGTACTTTTATTCAAACTTTATTTAACATGAGTTGTAAACTTATTTCTATTTTATTTCATGGATTTGTAAACTTATGAACTGAAAAATTTGTCTATTTTATTTCAGGGATGTAAATTTATGAATTGTAAAATTTATCTTTCATGTATTTGTGGACTTTCTACTTGAATTGTACAATTTAAATAAGGAATCCCCGCAGGCAATTAACAGGGGAAACGATTGCAAGAAATTGATCCCCATGGGGACCTGGTTCCCCCGAAGAGGAATCCTCGCCCCTGTCCTTGCCTTCAAATGGCAGAGATGGGGGCAGAGATGGGGTAAATTCCCCCCAGGGGATGGGGACGGGGACCCCTCGCCCCGACCCCTTTGCCAACCCTACCTATAATGTCGGTTTTCAACTAATATTAAAGTCCATATTTGTACTAGTGTACAAATTTAGTACATACGCTAAACTTGTAATCTTATACGGAATTGTGCCCCCTAGTTGGATCTACCACTGAGATCGGATATATGGACTCTTATGCTCCCACGTTATTCTCTTCCCTACATCTTTCCATTTCTCATAACATTAATTCCCCACATACACCTGTGAAAAAACGATAAGCTACTTCACCACTCAAACCACAATGTTAAACGAAAAGCATTAACACACACTGTAACAACTGAAAAACTATCAGCATGTAAAAGAGTAATTGCACACAGAAGTTGGTAACCCAGTTTGGCTATAAACCATCTACGTCTGGGGGCAGTGTGACCAGGAAAGATAATCCACTAATATTGAATGAGTTAAGCGTTTACAACAAAGTACTTATCTGTAAAGTAACTACTTTTACAATGACTCTTACAGAGCTTAATTTGCAATGCACCTAGGCTCCCCCTAGATGTGAGACTCCCTTTCAATGGTACTTAGGCTCCCCCTAAGTGTTGCAATATTAGTGATGAACACTTCAGCTTCCGATAGTGTGTGAGACTCCCTCTCAACTTGATTATCTTTCTCGTGACTTAATGAACTCCATTCACGTGAGAACTTAGGTCCCCCTAAGTCTTGAGAACTCATTTTTCTTAATTTGCAACTTCTTAGCTCCTCATAAGGCTTGAGAAATTTCTTTTCGATGAATGAAGTCTTAGGCTCCCCTTATGACCGAGAATCCCTTCTCTTCAATGATGCCTTAGGCTCCCCCTAAGACAGAAATAATTTTCACGTTCTTGAACAATTCAATCAATGGATACGCACAACGAAATAAATGAGCAAAGATCAAATCACTATGTTGCACGAATCGGCCACCTAGAACAAAAACTCTTTCTCACCAAGAACAAAAGTGGTCGGATCCCAAAACAACAAAACTTCAAAATATTCAATAATCACGACCTCACAAAGTTGATAGATCTACTAGCAAAGAACGACCTCTCAACAAAAACTACACAAATTATTTTTAATGTTCTGAATAAAAATGGCAACCCTAACTTGGCCACAAACACCCCAATAAATAATTCCTTTTGAAAAGGAAAACATCTTCACAATAAATCACACAGCCCATAAAGAAGGAAAATATCCAACAAAATCAACTCTGCAGAATATTCCAAGTAAAGAAAGTATAATCTGCAAGAATGACACTTGCTACAACAATAGTAAAGACAACTTTTGTGACAACTAATAAGGTGAAGACTTGTACAACATAATATTTAAAAATAAACCTTTAGCGTCACTATATAAAATCTTATTAAGAGTGTGAGTCACCATTCTTGATGGCATGGGATCTCAATTTCATTTTATTGAACTGGATACCCGTTTGAACTTTATGGGCTCTGATACCATATCAAATAGTATGAAGTTCCATCTTCAAACCAATTGACAATGAAAGGAATAACCTATCTATGATATTAAGAATGTGAGGTCCCTTGATTTTTGGGATCCTCAACACGCTATTTATGGATAAACGGAAAAAAACAACATTGGAAATAATAAACTTACTAGTCACCTTATATAACAATAAGATAACATGAAAAGTTTTCATCTTATATTATAGCAATTCTCCTTTCTCCTTTTCTTACCCTTTTGCCTTTAATTTATAATAACTAACCACTAACTCTTGCTTTTATTTAATTACTGCCAACTACCAAACCAAACGATTAAAGATCCATATCCATCGATGAAAACACCTTCATCAATTGCTAACCATTTATAACTATAACAACTTCAGCATGATGCAGCAGCACATAGTGTTAATGAGAGGCAACTTTCACGGTAG

mRNA sequence

GCGGAGGACGGTGCCACCTGCGAAGCAGCCTTGTTGGTACATCATGTAGCGCTTGACGGAGGGGCGGAGGCCGAGGAGCTTGCGAAGCTGGTAGTCAGCGCCGAGCATGTCAACGCCGGAAGTGGTGCAAAAGATGAGATGCGTGATTTTGGATTTGGGTTGACTCCACTCTTCAATGGCTTTTGCAGCAGCGTCTTTGCCCAGTTTCGGCACTTCGACTACCACTATATCCTGACGCGTGTCCAGAGAAGGTGCCATAAGGCAATCTCCTCATCAAATGACATAAAGAAGACTATCAATTTAGAAGACAATCTCATTCCTCCCATACCAACGCTGTGCGGCGGCGTGGCGGTACCGATCGCCAACACGGTGGCGGGGCCGTCGGCTCTTTGTGCCTTGCAGATTTCAGCCATGACGGAGGCCATTGAAATTGAAAGAGTTGATCTCCTTCCTAAGGGGACTGATCTGAACTGTATTTGTGATTGGGTTGTGGAGGGCACTACCAAAGAGAAGCTTAGCTATGATCTTCCACAAGCACAACCTTTGCAGAATTATGCTTCAAAGAATTTGGAGATAAAAGTATTGTATTGGGCAACCATAAATGAGCCTAATCATGATGCAGCAGCACATAGTGTTAATGAGAGGCAACTTTCACGGTAG

Coding sequence (CDS)

GCGGAGGACGGTGCCACCTGCGAAGCAGCCTTGTTGGTACATCATGTAGCGCTTGACGGAGGGGCGGAGGCCGAGGAGCTTGCGAAGCTGGTAGTCAGCGCCGAGCATGTCAACGCCGGAAGTGGTGCAAAAGATGAGATGCGTGATTTTGGATTTGGGTTGACTCCACTCTTCAATGGCTTTTGCAGCAGCGTCTTTGCCCAGTTTCGGCACTTCGACTACCACTATATCCTGACGCGTGTCCAGAGAAGGTGCCATAAGGCAATCTCCTCATCAAATGACATAAAGAAGACTATCAATTTAGAAGACAATCTCATTCCTCCCATACCAACGCTGTGCGGCGGCGTGGCGGTACCGATCGCCAACACGGTGGCGGGGCCGTCGGCTCTTTGTGCCTTGCAGATTTCAGCCATGACGGAGGCCATTGAAATTGAAAGAGTTGATCTCCTTCCTAAGGGGACTGATCTGAACTGTATTTGTGATTGGGTTGTGGAGGGCACTACCAAAGAGAAGCTTAGCTATGATCTTCCACAAGCACAACCTTTGCAGAATTATGCTTCAAAGAATTTGGAGATAAAAGTATTGTATTGGGCAACCATAAATGAGCCTAATCATGATGCAGCAGCACATAGTGTTAATGAGAGGCAACTTTCACGGTAG

Protein sequence

AEDGATCEAALLVHHVALDGGAEAEELAKLVVSAEHVNAGSGAKDEMRDFGFGLTPLFNGFCSSVFAQFRHFDYHYILTRVQRRCHKAISSSNDIKKTINLEDNLIPPIPTLCGGVAVPIANTVAGPSALCALQISAMTEAIEIERVDLLPKGTDLNCICDWVVEGTTKEKLSYDLPQAQPLQNYASKNLEIKVLYWATINEPNHDAAAHSVNERQLSR

Homology

[Close]

BLAST of Lsi05G004360 vs. TrEMBL
Match: C0HFI4_MAIZE (Uncharacterized protein OS=Zea mays PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 5.0e-09
Identity = 38/86 (44.19%), Postives = 51/86 (59.30%), Query Frame = 1


Query: 1   AEDGATCEAALLVHHVALDGGAEAEELAKLVVSAEHVNAGSGAKDEMRDFGFGLTPLFNG 60
           A+  A  EA LLVHH A+ G A+ + L +LVV A HV+   GA+ ++RD   GL PL + 
Sbjct: 230 AQHRAAREAPLLVHHQAVHGRAQPQRLGQLVVGARHVHPRRGAEHQVRDPRLGLPPLLDR 289

Query: 61  FCSSVFAQFRHFDYHYILTRVQRRCH 87
                  Q RH  +H++L RVQRR H
Sbjct: 290 LLRRRLPQLRHLRHHHVLPRVQRRRH 315

[Close]

BLAST of Lsi05G004360 vs. TrEMBL
Match: A0A0P0Y2X6_ORYSJ (Os11g0530650 protein (Fragment) OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=Os11g0530650 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 3.2e-08
Identity = 41/86 (47.67%), Postives = 49/86 (56.98%), Query Frame = 1


Query: 1   AEDGATCEAALLVHHVALDGGAEAEELAKLVVSAEHVNAGSGAKDEMRDFGFGLTPLFNG 60
           AE  A  EA LLVHH A+  G +AE L +LVV A HV+AG GA+DE+ D G  L PL + 
Sbjct: 178 AEHRAAGEAPLLVHHEAVHVGPQAEHLGELVVGAGHVDAGGGAEDEVGDAGARLPPLLDR 237

Query: 61  FCSSVFAQFRHFDYHYILTRVQRRCH 87
                  Q    D   +L RVQRR H
Sbjct: 238 LLRRRLPQLGDLDDDDVLPRVQRRRH 263

[Close]

BLAST of Lsi05G004360 vs. TAIR10
Match: AT3G47450.1 (AT3G47450.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein)

HSP 1 Score: 48.9 bits (115), Expect = 4.6e-06
Identity = 20/30 (66.67%), Postives = 26/30 (86.67%), Query Frame = 1


Query: 144 IERVDLLPKGTDLNCICDWVVEGTTKEKLS 174
           I ++DLLPKGTD+NCI DWVVE T ++KL+
Sbjct: 222 ITKIDLLPKGTDMNCIGDWVVEVTMRKKLN 251

[Close]

BLAST of Lsi05G004360 vs. NCBI nr
Match: gi|223943407|gb|ACN25787.1| (unknown [Zea mays])

HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 7.2e-09
Identity = 38/86 (44.19%), Postives = 51/86 (59.30%), Query Frame = 1


Query: 1   AEDGATCEAALLVHHVALDGGAEAEELAKLVVSAEHVNAGSGAKDEMRDFGFGLTPLFNG 60
           A+  A  EA LLVHH A+ G A+ + L +LVV A HV+   GA+ ++RD   GL PL + 
Sbjct: 230 AQHRAAREAPLLVHHQAVHGRAQPQRLGQLVVGARHVHPRRGAEHQVRDPRLGLPPLLDR 289

Query: 61  FCSSVFAQFRHFDYHYILTRVQRRCH 87
                  Q RH  +H++L RVQRR H
Sbjct: 290 LLRRRLPQLRHLRHHHVLPRVQRRRH 315

[Close]

BLAST of Lsi05G004360 vs. NCBI nr
Match: gi|937939367|dbj|BAT14280.1| (Os11g0530650, partial [Oryza sativa Japonica Group])

HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 4.6e-08
Identity = 41/86 (47.67%), Postives = 49/86 (56.98%), Query Frame = 1


Query: 1   AEDGATCEAALLVHHVALDGGAEAEELAKLVVSAEHVNAGSGAKDEMRDFGFGLTPLFNG 60
           AE  A  EA LLVHH A+  G +AE L +LVV A HV+AG GA+DE+ D G  L PL + 
Sbjct: 178 AEHRAAGEAPLLVHHEAVHVGPQAEHLGELVVGAGHVDAGGGAEDEVGDAGARLPPLLDR 237

Query: 61  FCSSVFAQFRHFDYHYILTRVQRRCH 87
                  Q    D   +L RVQRR H
Sbjct: 238 LLRRRLPQLGDLDDDDVLPRVQRRRH 263

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lsi05G004360 vs. Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Lsi05G004360 vs. TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
C0HFI4_MAIZE	5.0e-09	44.19	Uncharacterized protein OS=Zea mays PE=2 SV=1	[more]
A0A0P0Y2X6_ORYSJ	3.2e-08	47.67	Os11g0530650 protein (Fragment) OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=Os11g0530650 ...	[more]

BLAST of Lsi05G004360 vs. TAIR10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT3G47450.1	4.6e-06	66.67	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily pro...	[more]

BLAST of Lsi05G004360 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|223943407\|gb\|ACN25787.1\|	7.2e-09	44.19	unknown [Zea mays]	[more]
gi\|937939367\|dbj\|BAT14280.1\|	4.6e-08	47.67	Os11g0530650, partial [Oryza sativa Japonica Group]	[more]

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0008150	biological_process
cellular_component	GO:0005575	cellular_component
molecular_function	GO:0003674	molecular_function

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lsi05G004360.1	Lsi05G004360.1	mRNA

Synteny

The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:


Gene	Organism	Block
Lsi05G004360	Cucumber (Gy14) v1	cgylsiB248
Lsi05G004360	Cucurbita maxima (Rimu)	cmalsiB126
Lsi05G004360	Cucurbita maxima (Rimu)	cmalsiB249
Lsi05G004360	Cucurbita moschata (Rifu)	cmolsiB115
Lsi05G004360	Cucurbita moschata (Rifu)	cmolsiB237
Lsi05G004360	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpelsiB511
Lsi05G004360	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpelsiB553
Lsi05G004360	Wild cucumber (PI 183967)	cpilsiB212
Lsi05G004360	Cucumber (Chinese Long) v2	culsiB214
Lsi05G004360	Melon (DHL92) v3.5.1	lsimeB368
Lsi05G004360	Watermelon (Charleston Gray)	lsiwcgB332
Lsi05G004360	Cucumber (Gy14) v2	cgyblsiB199
Lsi05G004360	Cucumber (Gy14) v2	cgyblsiB201
Lsi05G004360	Melon (DHL92) v3.6.1	lsimedB401
Lsi05G004360	Silver-seed gourd	carlsiB443
Lsi05G004360	Cucumber (Chinese Long) v3	cuclsiB231
Lsi05G004360	Cucumber (Chinese Long) v3	cuclsiB233
Lsi05G004360	Watermelon (97103) v2	lsiwmbB329
Lsi05G004360	Wax gourd	lsiwgoB436