Lsi04G006960 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi04G006960
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionUnknown protein
Locationchr04 : 6348985 .. 6354057 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAAGATTGGTAAGAATTGTGGGATTGTAGAAGAAAATCTATATATATGTTTAGATTTAAGCCAAGAGATGGGTAGATTTTATTTGGGATGAAGAAAGTGTGGCCTCGCAGAAGTTGACGACGACTGTCAGATAGCAAGAATGGTAGATTGCGATTGGTATTGGTCTGAAAATATCCAAGAAAAATGTGGACACACTGGAAGAAGAACAGCAAAAGAAAGCGTAGAAAATATATTGATTTAGGGTTGTTTATTAATTTTTTCAATAATTTTTTCCTTCAAAATTAAAATTTAAAATTATTTGCCAACTCTGTTTTTTTTTTTCTTCTCAAAATTAAACCATTGATGCCATTGTTTATTAATTTTCTCAACAACGGCAGACTGTTTTTTTTTTCTTTTGTAGGAGAAGGCTCATGAGGAGGGTGGAGGAGAGAACGCAAAAATATCAAATTACTAATAAATAAATAAATCCAATTAAGTTTCATTTAATAAAAAAATATCATTCAATTTTTCATGTCATTTTTCCGTTAGTCAACTAACAGTCAAATTTAACAAATGGACCATTTAGAACTATTTACCAAACCTCGGGGACTAAAGTGTCACTTTTGAAACCTCAAGGACCAAATAGATATCAACACTAAACTTTAGGGACTAAAAATGTATTTTGCCCTAAAAAATATTTATGTACATCTCGAGTAACACTTATTTTTGTGTATCCCACTAAATTGTCCAATCATAATTTGTTATATCACAAATTCTTCTTACTTCTTTTTTGAAATATTTTTTTTATGTGCAATGAAAGTGAGATGCATAAATGGTGCATCTAATCCGTTACTTTTTTTTTTTTTTACATATATTGGTCATATCACATCTTCTATTATCTATTTTACTTTTTCATCCAGCTATGTGACTTGTGACTCTTACAATTAGGGATAGAAGATGATCATTAATAAATGATATCAAGCTCACTTGTGACAATAATATTCATTAGCATATATTTACCAACACGAGCATAACTTAGTCACTCCATCATTTTTTCTTCTAAAAAGTTATGTATTCAAATTCGCACTTAACACAATATATATATATATATATATAACACTAGCAATGGCTAATTAATAAACCTTAAAATAAGGGCCCATAAAGAAATATATATATTAAAAATGTGCAAAAAAAAAATAGAAAGATATTTGGCAAGGTGGAGAAATTAAGAAAAGGAAAAAGGTCTGAAAAGTGGAAAATTAGAAGTCAATATAATTTCAATAATTGGGGTCTTAAGTCTAATAAAGTAACAAACGATGAAGCGTGGAAGTTAGATATGAATATTATTATTGGAGGTCGCGTGAATTATATATATAATTTAATAAGATAGGCGATCTAGCTCGTGACAAATATTTTCATTCATATCACATGGGACTTAATTTTTTTTTTTTTTTAAGGGATGTATATAATATTAAATCATTGAAAAGTTAATTACAACATGTTTCTTATAGAAATTACTATAAAATTGCCAAAATAATTTCTTCTCCCATATGCGATCCATTATTTTCTACCCCATATAAATAATTTAAACGGATAAACTTTTGATTTCTCCTTTTCGAAATAGTTATTAAGATATATTAATTAATTTTATTAATAAAATGAGTTATTTTCAAATATAGAAAAATGTAACAAACTATTTATAAATATAGAAATTATATCTCAATCTATGGCCGATAGATACTAAAATTTTTATATATTTGTAAATAGTTTAATATTTTTTTTGATTGTTTATAGTAATTTTTTAAAAATTTAAATAATTTATTTATAGTTTTAAATCTAAATCTAAATTCAAGTATCTTCAATCTTCAGATTAAATTGTAAATTAAAATAAATGACAGATCATTATACGTGAAAAATAAAAAAAATATAATGAGGTTGAGAATAATATTCAACTAAATAATTGTGATTAATAAATTAAAGTATATTTATTTAAGTTCGATGCAATTGTGAGTAACAACAGAATAAAATAATTCAAGTGCTAATTCATTTATTAAATTTAAACCATTTTAATTATTAAATATCAATAATATCAAGGAAAATTTTTAAAAATAGAAAAATAAAAAAAAATATTTACACAAAATAGTAAAATTTTTAGATAGTTGTGATAAATATCGATAGAAGTCTATCAAAGTCTATCATTAATAGAAATGATAGAAGTCTATCGCTATAGATATCGATAGAAATCTATCAAAGTCTATCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTATTTTCTGTAAATAATTTGATATTTTTTTATGTAAAAATTTTTCTAATATTAATAATATCAATACATCTTGGAATCACATATCAAACTTTTATAAAAAAAAATTATATTTTAAAAATTGATAGCACACCCAGATGTAAGTTGTGATGAGTTAGTATATTTATATATGGATGTCTATGGACCTCTTTATTTATGATTTATGAATCCTCCCTCAAGTATATGTACAGATAGATGAATGAATAATTTTATCTGTTTGAATAGGTTTCTTAAAATTAAAAAAAGATGCAACAATGGGTATTTAATGGAGCAATCCATAACTGATAAATGTTGGTTAATTTAATTAATTAATCTTGAATCATTGGAGCTTCTAATCTACCATTAAAGTCCCCATGCTAGCTTACAACGGATAAACAAAGACTAATAGTTTGGAAAGAATTTAAATTGTTCAAATAAATTAAAGGAATAACGTTAATTGTATATGATACAATTAATATAATGTATTTAGATACATTATAATATAAAGTCCATTTTGAATAAGATTCAAAATCAAACTATATAATAAAATGAGATTTAACATCTCTTTCGTATTAATTTAATATTTGAATTATATTCAAATATTAAATTAATACGAAAGAGATTCATAATTTAATATTAATAAGATTCATATTAAAACTATAGATTATGAGAAAATTGTGCATTTGAATAGATTTAAATGTATACTTGATTAAATATGAGATCTTTAATTTGAAAAGTCAATTAATTAATTTGATTAACTAATTGTTTGATTTAGCTAAATAAATTTTATTTCATTTAATTAATAATTAATTTAATTTAATTTAAACTATTTCAATTTAAGGAAGTGAGAGGTTTTATTTTAAAGAGGTTTTGGTTATTGCAAGCATACTCCCTCCCAACGCTCAATCTCTCTCTCGAGATCTTCATTGAGAAAGAGTTCTAGGTGAAAAAGTTATCTAAAACCAAAATTCCCTTCTCTTTCAAAAGAAGGTTTCCACAATAAAAGCTAATAACATAAATTAAAATTAAAAATTAATTTGATTTATAAAGTACATATACTTCAAAGTATAGAGAATCAGTATCAAATACGTAACTGATATTGATACGTTGCATATACGTGTCAAATATTAAATAGAGTAATTGGATTTTCTTTTTAAATTTTGGACAAGCATGTGCGAGATATGTAAAGGGGACATGACAATAAAAGAAAAATTAATATTTGGGTTAAATTTTAAGTCCACAACCCACTTACCCTTAATTTCATAAAGAGATTTTTTTTTTAAAAAAAAATCTTAAAAATAGGCTCATATTATGTCTTAAACATTTCATTTTTTTAAAAAAAAACCCATTGTCTCCCTATTTTCACACTATTTATAATTTTTCATATATTGGTTTATATTATGATTTATGCCAAATATTGAGTCAATCTCTAATTTATAAACTGTAGTATATTTCATATATTAATTAGAATATTTTCAAATACTTGAAAAATGTTCTAAGTATATTTAAAATAACCATGAATCCATAAAAAAATCGATAAGTTGATACATGAAAACCAAAGTAAATAGAAAATAAAATTTCATTAAATACATTTTCTCTTTAAATTGAAAAATGTAAATTTTTTTTTATAATAAATGCATTTTCCCTCCCAATTGAATAATGAAAGGAAATATATATAAAAATCAGATATAAATAAAAAAAAAGTAAACTGTCCAAAAATAACATATTTTTTAAATATATGATCTATTTAGGTAAAAATTCATTTCATAAAATTATTAGGGACTCTTTTCAAATATAGAAAAATGAGCCAAACTATTTACAAATATAAATTTTTTTTACAATCTATCACTTTTTATCGCTCATGCGATAGAATTTATTTGCTTGAGCGATAGAAATCTATAGAATTCTATTCTATCGCGATCTATCACTGATAGACAATGAAAATTTTATTCGCGATCTATCACTGATAGACAATGAAAATTTTCTATATTTATAAATAGTTTGATATTTTTCCTGTTTATAGTAATTTTCCAAATTATTATAATTAGATCGGCCCAAAAAGAAAATAACTATTTCTTCTCTTAGTCTTCGCCTGCAACCCTAAAAATTTCAGTTCGTCTTCCCTTCGTCTTCAACGAGTCACGGCTCGCATCCCTCACCGCCGCGCAACCATTTCTTCAACAACCGCCTCAGCTCGCATCCCTCACCGCCGTGCCTCAGTTCTCTGTCGACCATCCTCGCCACGCCTTGCCGCCGCCGTCGCTGGTCAGTTTCAAAGCTGAAAGCTCTCTGTTTCAAAGCTGAATATGTGACCAAAATTCATAAATCAGTTTGGTATTTTATGTTGTAGTATCTTTTTTATGTTAAATTTTTATATATAAAGATAATAGATTAAAAAAATGGCGTATCCATATCTTAATTTTTTAGAAATTGACGAATCGCCGTATCGTGTCTGTGCTTCATAGAATTTGATTAACACCTTGCGTGAAAGCCATTATATTGGCATTGGATAGTAGTCTAATTGATTCAATATTGACAAGTTTGCAGCGTTAAAAGCTCGAAAACAGCAGTGTCTTTGGCTGCTAAGTGGCTGGAGTTTTGAGATATAGGGGCCTTGGACCCAAGACAAAGAATATTGTTGTTTCTTGAGGTTTAACTGCCTTCGTGTTCGGGGTATATTTCTACACGAAAAGCAACTAAGTGGCTGTAGTTTTGGGATAT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mRNA sequence

ATGAAAGATTGTTCGTCTTCCCTTCGTCTTCAACGAGTCACGGCTCGCATCCCTCACCGCCGCGCAACCATTTCTTCAACAACCGCCTCAGCTCGCATCCCTCACCGCCGTGCCTCAGTTCTCTGTCGACCATCCTCGCCACGCCTTGCCGCCGCCGTCGCTGGTTTAGCTGTTGGAGGTTCAGATGAACTGCAAGTAGCCGTGGACCAATTTGAAGCGCAGAAAAGCAACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAAAGATTGTTCGTCTTCCCTTCGTCTTCAACGAGTCACGGCTCGCATCCCTCACCGCCGCGCAACCATTTCTTCAACAACCGCCTCAGCTCGCATCCCTCACCGCCGTGCCTCAGTTCTCTGTCGACCATCCTCGCCACGCCTTGCCGCCGCCGTCGCTGGTTTAGCTGTTGGAGGTTCAGATGAACTGCAAGTAGCCGTGGACCAATTTGAAGCGCAGAAAAGCAACTAG

Protein sequence

MKDCSSSLRLQRVTARIPHRRATISSTTASARIPHRRASVLCRPSSPRLAAAVAGLAVGGSDELQVAVDQFEAQKSN
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi04G006960.1Lsi04G006960.1mRNA