Lsi03G007700 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCACGGTACGAGAATGCCCAAAAATACCTAAAGCCCATATGATAACAAGAGCCCAAATGATAATCAAAACCTGAATAAAAATGATAGCCCGCAAGATAACTAGAGCTAAAAAGATAACAAGAGGTCAAAAGATAACAAGAGCCTGCATAAAGTAGCGAGAGTCCGAAGTCATATGATAACGAGAGACCGTGTTATAACAAATATTTTGGTAATTAGTGGCATTTGTGTTAAATGTATTTTAAATCTTGTTTGTTAGACGGTTATTAGTGGCAAATTGTGGAGATTGTGTATAAATATCATATTTTTTTATTAATAAAAAGTGAGTTACGATTATTCATTCTTTTACCATTTAATATGGTATCAGAGCCCATAAAGCCCAAACGGGTAGTCGGTCGAATAAAATAAAAATTGGGATCCGATCAAGAATGGTGAACCCAAATGAGGCACCATCTTGAGGGGGCATGTTGAGGATCTCACATTGAAAAAATTAAGGGACCTCACACTCTTAATAAGATAGATGAGTTACTTTTCTCATTGCCAATTGGTTTTGAGATTGAACGTGTCTATAAGCTGGATTTCTTTTATTTTTTTCCCTTTTCTCCAATTTTGGCTATGTATTTCTCCCCTTCCATGTTTAGCGTTTTTTATATGTATTGTAATTATGTCCATTGGCAATGGTTGAGTTACTATGTTTTATATATAGATAAGACACGACTTTGTAGTCCGAGGAAGAAGAAAATATTGATTGTAGTAAACATGTTGGTTCTTTTCCTTTGTGAAATGCTTGCAATGTGTGTTGTCACTAGTGCCCATCTAAGCTTCTCTATCTAAGGACAAAATATGATCCTATTTTCACTAGAGTTACGTACCAAATATGTCACCTTCGATCTTTGGTTCAGGAGAATAATGTGAGTTGTGTCAATCAGATAAAATGGATAGACAAACATTCTTTTAGGGGTATTCAAACAACCCGATGACCCAAAAAACTCGATCATCCCAACCCAATCCAACACATATGGTTTGAGTTGAGTTAGGTTGGATTCAAATAAATGAAACTAATTTTTGGGTTGGGTTGGTTCATGGGTTCATTTAAAATAACCCGAACCAACCCAACTTATTCATTTAAAAAATATTTTTTTTTACTTACGATACAACTATATATACGTATATTTATTTTAATTTTATTTAAATTCATGATTTTCTGGATTAATTATTCTCAAACAACTATTAATAACATTTTTTTAACACTTTAGAAAGAAAATTTTCACAATATCAATTTAAATTGAGTTGTTAATCTTAATTCAAGGTATGGAAATAATTAAATAAGTTTTTTTACATATTAATATTTTATTTATTTCTAAACAATAAAATTTAATTAATGACTTAAGTAACCCAAACCAACCCAACCTAAATATTTCATGGTTGGGTTGAGTTCATTATTTAATAAGAGTTGTTCAGCTTGAAAAAACTTATAATTGAAAGGATTGAATCCCGTAGCGGAAGCGTTTAATCACTTTTGCCCCAATTTTTGTTATAAAAGTTAATACAGAACAGAGAAATAAGACATAAGCATGATTTTCTACGTTAGAAAAGGTGGGGAAGAAGTTATACCTTTGTAGATAAAAAAGAACTTCATTGTCTTCTCCCGGTATTAAAAAAAACGAACAACAGAATGTACCCAAGCTAGACACGACCAAAGATCTTCTTTGCTATTCTCTATTGGCATAAGGAGGATGGTGGGATTCTTGCTTTGTGGAAGTGAGGAAGGGAGAACTAAATTCTACTTTTTTGAGAGTTTTTGAGAGAGAGTTTGTGAGTGAGAGCAAACAATTGTGTAAAAATTTCTCAGTCTATCCAAATGGGATCTTCCATCACTTTATTGTAGTGTAGTTATATTTTAATTAATAAATAAAAAATATATATTAATTAATTAAATCAAATTTAATTAATTAATTAAATCTAATTCAATTAATTAAGTTTATTAAATATCATATATTTAATATAATGTACATATGCATCATATACATATACTTTCATAACCTATAGATTTAATATGAATCTAATTCACATTAATTTTAACCTACAGTTTTAATATGAATTCAATTCATATTAAATTTAATATTTGAATCTCATTCAAATATTAATACTCTCATATTAATAAAGTTTTAATTTGAATTTAATTCAAAATTAACTAAGTATTATGATGTATCATATACAATTAATTCCCTTAAACTAATTTGAACCCTTCAAATTTCTTCCACTTTAAAATCACTGTTTTAATCCGTTTGTGAGCTAGTAGAGGGACCTAATGGACCTACAGTTATAAGCTCCAATGATACATGATTAATTAATTAAAATCTTTAATTAAATTAGTCACCATTAATTAACTATGGGCACTCTACTAAAGACTCATAGTTGCACTCCTATAAACTGCAATATATTTATATGTCCATTGATTTAACCATATTATGTAAGTTAATTCTTCACAGGTTGTACGTAATTACAGTTAGATCAAATTACTGTTTTACCCCTGTAATTACCTTTTATACCTTAAGTACCACTAATCCTCTAATGAACAATTATGTTTCTAGTTCAACCATAAACAAAGTCCCTTTTAGGCCAATGAGAGGGTGAGACCTCATTGTTCAAATTCCGGAGTTAGCACTTGATGGAGCAACCTATCTACTTTCCCTATGGTCAGGAAGGAGTAAATTCCATCTTGTGAAGTTATGTTCCCAACTCCTCACTCGGTATCGTTTCTAAAATGGTAGGCATATTGAGTCGATAGCTAAGGTCACTCTTACCCATATAAGTCAAAGAACGACCCTCATGAGCGAGAGTTCATAACTCATTCAAGATTGAGATCGAGTTACATGATTAAATCTCTTCAATTGACGGTGTTATAGAGAGAGATCATATTTCGTGGTCCAATCTTATATAGACTCACTATATAGGATACTCCCACTTACATGTCATTACATGAATGATTTGGATTAAACTGTTTGTAACACTTACAATATTTGTAACATTTACAAAGTGGATCGTATCCATAGTGTTACCAAGATAAGACACCCAACCTTATCTATATACTATAGACCTTTTAGGTTATTACTTAAACATAATACACTTGTATGTCAACCATATATTGTTCAGGTTACATTGAATAACCTTGAATCTTAGTTTATTGGATTTTGAGTTATGCAAATAAATAGCACTTATTTGAAATTAAATAATACTTTATTTATTAATAATTGTTTATAAATTTAGAAACTACAAGATTTAAAACATAAATTCCAATAATAACTTGAGCAATTTAGTTGGGTCTAAAATGTGCTTCGACCTAACCTAAGTCAATCCACGAACACCTCTACATTTAAGTTATGCACGATTCTTAAGGTTGATGAACAACCAAAATGTACAAGAAATATAAATGTAGAAGAAACAGTTGTCATATTCTTACATATTTTAGGACACCATATGTAAAAAATAAGGTTATTAGTTTTGCCTTTAAGAGATCTAGAAGAGTTATTAGTAAATACTTTGATGCATGTTTAAGAGTGATGTTTTGATGTCAAAAATTATTTTGGAAGACGCCTAAACAAATTTTGGAAACTCCAATGGACCCTAGATGGAAGTGGTTTAAGGTATGTTAGCCATTTTTAAGATCAATACCTTGTTGCCATACTTATGAATATTACTAATGATATATTTTTTTTCTTTAAAGTTGCTTTGGTGCTTTAGATGAAACCCACATTAAGGTGCACGTTCCACAGTCTGAGAAAGGAAAATATAAGACAAGGAAGAATGACGTTGCAACCTATGTGTTGAGAGTTTGCTCCCCTGCTATGCAATTCGTATATGTTCAACCTTGTTGGGAGGGTTTGATACATGATAGGCGGGTAGTTAGGGATGCAATAAGTAGGCTGAATGGATTGAAAGTTCTTGAATGTATGGTTGTCATACATACATGGTCTTATGCAATATGCCTACTGCATAAAGTGGTCGTCATTTGAAGTTTCAATATTTTCCAACATAGGTTGTTAGTATTTGGTTGATGTTAGTTATACCAACTATAAAGGTTTTTTAAACACCACTTAGAGGTCAATGACACCATCTAAATGATTGGATGGATGACCACCAATCAACCACCCTAGAATAATCTTTCAATATGAAATACTTTCCTACTAGAAATGTAATAGAACGGTGTTTTGGATTCTAAAGATGTGTCGGGTAATCATTAGGAGTCATACTTTTCTTTGATATAGTCACACAGTGAAGAATTATTTCAGTATGTTGTATGCTCCACAATTTTATAAAAAAAGAAATGTCTAGTGATCAATTGGGTGACTTAGTGAATGAGGAAACAGTTGAAGGTAGGAAGAGTGAGTGACCTTACATTAATTTGGTTGAGACTTCAAATGCGTGGACTATGTAGAGACATATCTCGAACTTGAAATGTTCAACACTTGGTGACATAATATTGGATAATTTATGGATGTTTGATTTTACATTGTAGTTTTTAGTATTTTTTTTTTTTTTTACTTTGGTATGTACTGTCGAACAATTTTCCAACATATTTTCTCATTCATTAATATACATTCTTTTTTTGGTTCCATTTTTTTCATGACAAATATGTTGGGTTTTTGGCCTTTAATCTCGAATTAATTAATGTTTTGATGATAAGAAATCTACTTTTATTTATTAACAATTTGAGTGTGTTTTAAAGTTTCTATTGTGTAGAGCTTAGAACAATTGTTCCAACGCAATTTGAATCACTCAAATCGAAACTCAAACGAAGAAGATATAGCTGAAACAAGCTTAACGAAAAAATCTCGAGCTGATGATGTGGCATATTTTTTTCATCAAAGTGGACCAATTGAAAGGTGCCACTTGAACCAATGGAGGAGTGACACATGGTGGGCTTTTGAATTTTGTTGGTTTTAAAAAGAATGTTTTTAAAAAAAAATGAATTTAATATTATTTTATGTTTGT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Match: A0A0B2S1T5_GLYSO (Uncharacterized protein OS=Glycine soja GN=glysoja_028020 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 91.3 bits (225), Expect = 9.9e-16 Identity = 57/133 (42.86%), Postives = 77/133 (57.89%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G007700 vs. TrEMBL
Match: I1KR39_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_08G073500 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 90.9 bits (224), Expect = 1.3e-15 Identity = 57/133 (42.86%), Postives = 77/133 (57.89%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G007700 vs. TrEMBL
Match: W9R616_9ROSA (Uncharacterized protein OS=Morus notabilis GN=L484_017218 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 7.8e-13 Identity = 65/137 (47.45%), Postives = 78/137 (56.93%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G007700 vs. NCBI nr
Match: gi|659110421|ref|XP_008455215.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495434 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 177.9 bits (450), Expect = 1.2e-41 Identity = 97/124 (78.23%), Postives = 99/124 (79.84%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G007700 vs. NCBI nr
Match: gi|700188478|gb|KGN43711.1| (hypothetical protein Csa_7G062770 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 166.4 bits (420), Expect = 3.5e-38 Identity = 96/129 (74.42%), Postives = 99/129 (76.74%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G007700 vs. NCBI nr
Match: gi|449438185|ref|XP_004136870.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101218280 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 166.4 bits (420), Expect = 3.5e-38 Identity = 96/129 (74.42%), Postives = 99/129 (76.74%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G007700 vs. NCBI nr
Match: gi|1009137873|ref|XP_015886288.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107421544 [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 7.3e-20 Identity = 65/132 (49.24%), Postives = 81/132 (61.36%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G007700 vs. NCBI nr
Match: gi|1012101737|ref|XP_015957557.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107481763 [Arachis duranensis]) HSP 1 Score: 99.0 bits (245), Expect = 6.8e-18 Identity = 59/134 (44.03%), Postives = 83/134 (61.94%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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