Lsi03G007700 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi03G007700
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionPlant/MHJ24-14 protein
Locationchr03 : 10872474 .. 10894878 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
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TTACCGTCAATCTTTCCATACGTGACAAGTCACTCTTCGAACTTCCGCAGCCCTCCTCTCATCCCGGCCTGCCTTCTGCATTCGACGCTTTCTCCGAAGTACGCCTCTTTACCTAATCTCCTTGTATTTTGTTTACTTTCTTTATTCAGTTGAGCGAATTCGGAGACTGTTCGTTTCCTGATTTTGTTTTCCGTGGGCTACCGGAGGTTTCAGGACCGCCGGAGTTTCTGAATAATTCGGTTGAGGAGTACGCTGCACCGAAAGATATCGATCAGCCGCGAGGGGGCCATGGGAGCCGTAGGAATCGTAAGGAGAAGAAAGATTTGCCTACTGGTAAGGGTTCGGTTCCTGGCTTCTTTAGGCTGCTAGGAAGTTGAAGGGAAGCAAAATTATTTCTGAGTTGCCCTTGCACTTGGTTCACCAAATTGTTGGGTCAATTAAGGAATCTAAAAGTTTGCTTTAAATTGAAAGTAGCATAAATTTCACCACTTAAGTCCTTGCAACTTAGATGTCACCTCTTTCTTTTCGTAATAGAGAACTCATTGCTGCAAATTATCGAAATGTTCCATTGCTAACCAATGGTGGCTCTAAGTCTTGGGTGTGACCCCATGGTTCCTTGGGCTCCTTTTAGTTGTAGATTCATCTATAATTCAAGATCTTAATCCTATATCTCGATTTGTGCTCTATAATTTGGAAGGACAACTATCCGGAAAAGGTCAATATTTTCATTTGGGAAATTCTTCTAGCGAGCATTGATGAGACATGACTCAAATGAGATACCCTTTTTTTACATATTTGAAAATTCCACATTTTCCCTCCAAAGTTTGGAGTATTTGGGTATTTACGTACCTTGAGCCATGTATCTAGAATGTACCTTTGTCTAGCTGTGTGTGTCCTAGCCTATTGTAACCTGAATAATGATCTAAGAATGTTTTACAAGGAGAGAACCCCCAGGAGGAATCAATAGAACTGTAGAAGTATATAACAAGATCTAGTATTCAAGTTTGAATCAACAACTTTCGTTGAAGAGAGTGAGTAAAAGAAGCAAAGATATCCATAATATTTAATGTGCGTCAGTTCAAGGTACAAAATGCCCCCAAAGGTAGGGAAGATGGACATTGATATAAAAAAATTGTTGGGAGTGAGGGGTCACTATGTGTGGTTTTTGGTGAGGGATAGACTGTTAGGAGTGCAACCAAAAGCCTACTCGGCTAGAAAAGGTTAAAATCATGGGTATATAAGTAAAGATATAACATTTTTCTTGGTATGAGACCTTCTGGGTAATCAAAAGCAAAGTTTTGTGGGCTTATGTTCATGTACCATTGTGAAAATGTGAAGAGTCCATTGTGCGTACCAAAAATGCAAGGAAAAAATTGATAAGTAATGTGCTAAAAATGCACAATGCGATAATAATTGGAAACTTTGCTTGCTCTATGACGTCAAAGATGGAAATCAGAAAATGGAGTTGGGTCAAAGGGTCTACTAAAACTAATCAACTACATCTTTCTTTACAATGACATACTGTGTTCATTGTATACAAACTCCAGTTGCCAAACTTGCAAGGAACATGTGTTCATTGCATACAAACTGCAATCATTGTGAACAGTGGAGACAGCAACGATTGAACTTGCCTGGTAAGTGATTGGGGAATGGTGTTTCACCACACCTTGCTAATGGGTGGTAAAGGCAAGTTCATATGGTTGAAGTAGAAATTTATAAAACAAACACATTTTTTTATCTAATGAACCAATGAAGTGATCATGTATATTTTTAATTTCTTTGACTAGACTATTCGTTGCTTCACTGCTATATCTCTTCACTATAGGAAAGAAACTGATGCTGAATCAGTTATGTCATGTCATGCTATGAAATATTATATTCTCTCTATATACATTTACCTATAAAAATTATTTTCATTTTTTTCAAACATCAGTTTTTCTTGGCTTCTTCCATCAGGTAAAAAGTAAGCTTGTCACTTTAGATAAGTCAGTAATGTAAACTTGTATAATCTAATGCCAGATGGTTTGTTCATGATTTATCAGGATTTTTAGTGACTGTCTGGGTATCTAGTTGACATTGTTTATGCAATTGTTCTTCCTTCTAGTAGTTTTTATTTGGCATATTCCCTTATTCATATGTAGGCTGTAGGATATGATGGCCTATACATCCACCAGTGGCATGACGATAGAATCGATTGCCATCTTCCATAAAGTTTTTTTTTGGTAAAAGAAACAAAAAAACTATTCATCTTCCATAAAGTGAGTAGGTTAAGTGCCATGGTTTCTATGCTGGTCCAATTAGTATATTTGATTGAACCGGTGGAAAGAATAAGTGGAGCAATCCAAGGAGAACAATAATTTATTTATTCATTTGCAGTTATGCGGGTAGATGTTCGGCATGAATAG

mRNA sequence

ATGCACGCCGAAGAAGAAGCTGAAGACAACTCTGCCTTCAACCACACCTCTTCCGACGATGAGGACGAAGATCTTGCCGCCACCGCCGCCTCTACGGTTACCGTCAATCTTTCCATACGTGACAAGTCACTCTTCGAACTTCCGCAGCCCTCCTCTCATCCCGGCCTGCCTTCTGCATTCGACGCTTTCTCCGAATTGAGCGAATTCGGAGACTGTTCGTTTCCTGATTTTGTTTTCCGTGGGCTACCGGAGGTTTCAGGACCGCCGGAGTTTCTGAATAATTCGGTTGAGGAGTACGCTGCACCGAAAGATATCGATCAGCCGCGAGGGGGCCATGGGAGCCGTAGGAATCGTAAGGAGAAGAAAGATTTGCCTACTGTTATGCGGGTAGATGTTCGGCATGAATAG

Coding sequence (CDS)

ATGCACGCCGAAGAAGAAGCTGAAGACAACTCTGCCTTCAACCACACCTCTTCCGACGATGAGGACGAAGATCTTGCCGCCACCGCCGCCTCTACGGTTACCGTCAATCTTTCCATACGTGACAAGTCACTCTTCGAACTTCCGCAGCCCTCCTCTCATCCCGGCCTGCCTTCTGCATTCGACGCTTTCTCCGAATTGAGCGAATTCGGAGACTGTTCGTTTCCTGATTTTGTTTTCCGTGGGCTACCGGAGGTTTCAGGACCGCCGGAGTTTCTGAATAATTCGGTTGAGGAGTACGCTGCACCGAAAGATATCGATCAGCCGCGAGGGGGCCATGGGAGCCGTAGGAATCGTAAGGAGAAGAAAGATTTGCCTACTGTTATGCGGGTAGATGTTCGGCATGAATAG

Protein sequence

MHAEEEAEDNSAFNHTSSDDEDEDLAATAASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSSHPGLPSAFDAFSELSEFGDCSFPDFVFRGLPEVSGPPEFLNNSVEEYAAPKDIDQPRGGHGSRRNRKEKKDLPTVMRVDVRHE
BLAST of Lsi03G007700 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K7B5_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_7G062770 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 166.4 bits (420), Expect = 2.4e-38
Identity = 96/129 (74.42%), Postives = 99/129 (76.74%), Query Frame = 1

Query: 3   AEEEAEDNSAFNHTSSDDEDEDLA---ATAASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSSHPGLPSA 62
           AEEEA+ NS FNHTSSDD+DEDLA   A AASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSS PGLPSA
Sbjct: 24  AEEEAQHNSVFNHTSSDDDDEDLASAPAAAASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSSQPGLPSA 83

Query: 63  FDAFSELSEFGDCSFPDFVFRGLPEVSGPPEFLNNSVEEYAAPKDIDQPRG--GHGSRRN 122
           FDAFS                   EVSGPPEFLNNSVEEYAAP+D DQPRG  GHG RRN
Sbjct: 84  FDAFS-------------------EVSGPPEFLNNSVEEYAAPRDADQPRGGHGHGGRRN 133

Query: 123 RKEKKDLPT 127
           RKEKKDLPT
Sbjct: 144 RKEKKDLPT 133

BLAST of Lsi03G007700 vs. TrEMBL
Match: I1KR40_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_08G073500 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 92.8 bits (229), Expect = 3.4e-16
Identity = 57/128 (44.53%), Postives = 76/128 (59.38%), Query Frame = 1

Query: 3   AEEEAEDNSAFNHTSS-DDEDEDLAATAASTVTVNLSIRDKSLFE-LPQPSSHPGLPSAF 62
           AEEE +++    H S  +D D+D AA    T   + S+ D+S+F+ +P P S  GLPSAF
Sbjct: 12  AEEEQDEDQPQPHNSDLEDSDDDDAAAGTITAANHPSLGDRSIFDHVPNPPSASGLPSAF 71

Query: 63  DAFSELSEFGDCSFPDFVFRGLPEVSGPPEFLNNSVEEYAAPKDIDQPRGGHGSRRNRKE 122
           DAFSE                   ++GPP+FLNNSVEEY   +D D+ +G H +RR RK 
Sbjct: 72  DAFSE-------------------IAGPPQFLNNSVEEYKPSRDADEQQGKHANRRRRKN 120

Query: 123 KKDLPTVM 129
           KKDLPTV+
Sbjct: 132 KKDLPTVV 120

BLAST of Lsi03G007700 vs. TrEMBL
Match: A0A0B2S1T5_GLYSO (Uncharacterized protein OS=Glycine soja GN=glysoja_028020 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 91.3 bits (225), Expect = 9.9e-16
Identity = 57/133 (42.86%), Postives = 77/133 (57.89%), Query Frame = 1

Query: 3   AEEEAEDNSAFNHTSSDDEDEDLAATAASTVTVNL-SIRDKSLFE-LPQPSSHPGLPSAF 62
           AEEE +++    H S  ++ +DL A A  T   N  S+ D+S+F+ +P P S  GLPSAF
Sbjct: 12  AEEEQDEDQPQPHNSDLEDSDDLDAAAGRTTAANHPSLGDRSIFDHVPNPPSASGLPSAF 71

Query: 63  DAFSELSEFGDCSFPDFVFRGLPEVSGPPEFLNNSVEEYAAPKDIDQPRGGHGSRRNRKE 122
           DAFSE                   ++GPP+FLNNSVEEY   +D D+ +G H +RR RK 
Sbjct: 72  DAFSE-------------------IAGPPQFLNNSVEEYKPSRDADEQQGKHANRRRRKN 125

Query: 123 KKDLPTVMRVDVR 134
           KKDLPT   V+ +
Sbjct: 132 KKDLPTGAVVEAK 125

BLAST of Lsi03G007700 vs. TrEMBL
Match: I1KR39_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_08G073500 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 90.9 bits (224), Expect = 1.3e-15
Identity = 57/133 (42.86%), Postives = 77/133 (57.89%), Query Frame = 1

Query: 3   AEEEAEDNSAFNHTSS-DDEDEDLAATAASTVTVNLSIRDKSLFE-LPQPSSHPGLPSAF 62
           AEEE +++    H S  +D D+D AA    T   + S+ D+S+F+ +P P S  GLPSAF
Sbjct: 12  AEEEQDEDQPQPHNSDLEDSDDDDAAAGTITAANHPSLGDRSIFDHVPNPPSASGLPSAF 71

Query: 63  DAFSELSEFGDCSFPDFVFRGLPEVSGPPEFLNNSVEEYAAPKDIDQPRGGHGSRRNRKE 122
           DAFSE                   ++GPP+FLNNSVEEY   +D D+ +G H +RR RK 
Sbjct: 72  DAFSE-------------------IAGPPQFLNNSVEEYKPSRDADEQQGKHANRRRRKN 125

Query: 123 KKDLPTVMRVDVR 134
           KKDLPT   V+ +
Sbjct: 132 KKDLPTGAVVEAK 125

BLAST of Lsi03G007700 vs. TrEMBL
Match: W9R616_9ROSA (Uncharacterized protein OS=Morus notabilis GN=L484_017218 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 7.8e-13
Identity = 65/137 (47.45%), Postives = 78/137 (56.93%), Query Frame = 1

Query: 3   AEEEA----EDNSAFNHTSSDDE------DEDLAATAASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSS 62
           +EEEA    +D+   + TSSDDE      D+D  A+AA       S+ D+SLF+LPQ S+
Sbjct: 12  SEEEAKAHQQDHELLHRTSSDDEGGGDDDDDDEEASAA----FKRSMADRSLFDLPQASA 71

Query: 63  HPGLPSAFDAFSELSEFGDCSFPDFVFRGLPEVSGPPEFLNNSVEEYAAPK--DIDQPR- 122
             GLPSAFDAFSE                   VSGPP FL NSVEEY +    D+DQ   
Sbjct: 72  S-GLPSAFDAFSE-------------------VSGPPGFLKNSVEEYGSSSTGDVDQQLG 124

Query: 123 -GGHGSRRNRKEKKDLP 126
            G HG RRNRK+KKDLP
Sbjct: 132 IGRHGRRRNRKDKKDLP 124

BLAST of Lsi03G007700 vs. NCBI nr
Match: gi|659110421|ref|XP_008455215.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495434 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 177.9 bits (450), Expect = 1.2e-41
Identity = 97/124 (78.23%), Postives = 99/124 (79.84%), Query Frame = 1

Query: 3   AEEEAEDNSAFNHTSSDDEDEDLAATAASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSSHPGLPSAFDA 62
           AEEEAE NS FNHTSSDD+DEDLAA AASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSS PGLPSAFDA
Sbjct: 68  AEEEAEHNSVFNHTSSDDDDEDLAAAAASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSSQPGLPSAFDA 127

Query: 63  FSELSEFGDCSFPDFVFRGLPEVSGPPEFLNNSVEEYAAPKDIDQPRGGHGSRRNRKEKK 122
           FS                   EVSGPPEFLNNSVEEYAAP+D DQPRGGHG RRNRKEKK
Sbjct: 128 FS-------------------EVSGPPEFLNNSVEEYAAPRDADQPRGGHGGRRNRKEKK 172

Query: 123 DLPT 127
           DLPT
Sbjct: 188 DLPT 172

BLAST of Lsi03G007700 vs. NCBI nr
Match: gi|700188478|gb|KGN43711.1| (hypothetical protein Csa_7G062770 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 166.4 bits (420), Expect = 3.5e-38
Identity = 96/129 (74.42%), Postives = 99/129 (76.74%), Query Frame = 1

Query: 3   AEEEAEDNSAFNHTSSDDEDEDLA---ATAASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSSHPGLPSA 62
           AEEEA+ NS FNHTSSDD+DEDLA   A AASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSS PGLPSA
Sbjct: 24  AEEEAQHNSVFNHTSSDDDDEDLASAPAAAASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSSQPGLPSA 83

Query: 63  FDAFSELSEFGDCSFPDFVFRGLPEVSGPPEFLNNSVEEYAAPKDIDQPRG--GHGSRRN 122
           FDAFS                   EVSGPPEFLNNSVEEYAAP+D DQPRG  GHG RRN
Sbjct: 84  FDAFS-------------------EVSGPPEFLNNSVEEYAAPRDADQPRGGHGHGGRRN 133

Query: 123 RKEKKDLPT 127
           RKEKKDLPT
Sbjct: 144 RKEKKDLPT 133

BLAST of Lsi03G007700 vs. NCBI nr
Match: gi|449438185|ref|XP_004136870.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101218280 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 166.4 bits (420), Expect = 3.5e-38
Identity = 96/129 (74.42%), Postives = 99/129 (76.74%), Query Frame = 1

Query: 3   AEEEAEDNSAFNHTSSDDEDEDLA---ATAASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSSHPGLPSA 62
           AEEEA+ NS FNHTSSDD+DEDLA   A AASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSS PGLPSA
Sbjct: 12  AEEEAQHNSVFNHTSSDDDDEDLASAPAAAASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSSQPGLPSA 71

Query: 63  FDAFSELSEFGDCSFPDFVFRGLPEVSGPPEFLNNSVEEYAAPKDIDQPRG--GHGSRRN 122
           FDAFS                   EVSGPPEFLNNSVEEYAAP+D DQPRG  GHG RRN
Sbjct: 72  FDAFS-------------------EVSGPPEFLNNSVEEYAAPRDADQPRGGHGHGGRRN 121

Query: 123 RKEKKDLPT 127
           RKEKKDLPT
Sbjct: 132 RKEKKDLPT 121

BLAST of Lsi03G007700 vs. NCBI nr
Match: gi|1009137873|ref|XP_015886288.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107421544 [Ziziphus jujuba])

HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 7.3e-20
Identity = 65/132 (49.24%), Postives = 81/132 (61.36%), Query Frame = 1

Query: 3   AEEEAEDNSAFNHTSSDDEDEDLAATAASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSSHP-GLPSAFD 62
           AEEE ED     ++S DD+D D    +AS   ++ SI D+SLF+LP PSS+P GLPSAFD
Sbjct: 12  AEEEEEDVRVSYNSSDDDDDNDRREASAS---LSRSIGDRSLFDLPNPSSNPSGLPSAFD 71

Query: 63  AFSELSEFGDCSFPDFVFRGLPEVSGPPEFLNNSVEEYAAPKDIDQPRGGHGSRRNRKEK 122
           AFSE                   +SGPPEFLNNSVEEY    D+DQ  G HG RRNR++K
Sbjct: 72  AFSE-------------------ISGPPEFLNNSVEEYGLSGDVDQQHGRHGGRRNRRDK 121

Query: 123 KDLPTVMRVDVR 134
           KD+P    V+ +
Sbjct: 132 KDVPASSIVEAK 121

BLAST of Lsi03G007700 vs. NCBI nr
Match: gi|1012101737|ref|XP_015957557.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107481763 [Arachis duranensis])

HSP 1 Score: 99.0 bits (245), Expect = 6.8e-18
Identity = 59/134 (44.03%), Postives = 83/134 (61.94%), Query Frame = 1

Query: 2   HAEEEAEDNSAFNHTSSDDED--EDLAATAASTVTVNLSIRDKSLFELPQPSSHPGLPSA 61
           ++  E +D+   +H+SSDD+D  +  A  A  +   + S+ D+S+F+ PQPSS  GLPSA
Sbjct: 9   YSSAEEDDHPHLHHSSSDDDDAADHDAVAAEPSAASHPSLGDRSIFDRPQPSSACGLPSA 68

Query: 62  FDAFSELSEFGDCSFPDFVFRGLPEVSGPPEFLNNSVEEYAAPKDIDQPRGGHGSRRNRK 121
           FDAFSE                   V+GPP+FLNNSVE+Y   KD +  +G HGSRRNR+
Sbjct: 69  FDAFSE-------------------VAGPPQFLNNSVEDYNPAKDAEPQQGRHGSRRNRR 123

Query: 122 EKKDLPTVMRVDVR 134
           +KKDLPT + V+ +
Sbjct: 129 DKKDLPTGVVVEAK 123

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0K7B5_CUCSA2.4e-3874.42Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_7G062770 PE=4 SV=1[more]
I1KR40_SOYBN3.4e-1644.53Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_08G073500 PE=4 SV=1[more]
A0A0B2S1T5_GLYSO9.9e-1642.86Uncharacterized protein OS=Glycine soja GN=glysoja_028020 PE=4 SV=1[more]
I1KR39_SOYBN1.3e-1542.86Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_08G073500 PE=4 SV=1[more]
W9R616_9ROSA7.8e-1347.45Uncharacterized protein OS=Morus notabilis GN=L484_017218 PE=4 SV=1[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|659110421|ref|XP_008455215.1|1.2e-4178.23PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495434 [Cucumis melo][more]
gi|700188478|gb|KGN43711.1|3.5e-3874.42hypothetical protein Csa_7G062770 [Cucumis sativus][more]
gi|449438185|ref|XP_004136870.1|3.5e-3874.42PREDICTED: uncharacterized protein LOC101218280 [Cucumis sativus][more]
gi|1009137873|ref|XP_015886288.1|7.3e-2049.24PREDICTED: uncharacterized protein LOC107421544 [Ziziphus jujuba][more]
gi|1012101737|ref|XP_015957557.1|6.8e-1844.03PREDICTED: uncharacterized protein LOC107481763 [Arachis duranensis][more]
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi03G007700.1Lsi03G007700.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None