Lsi03G005470 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTAAACACTCAACCCTTTATGTTACCCACATCTTTGAAGTCCTTGAACCTAACACCCCAGTTCACTTCAGCTCCTATGGATTTGCTTTCCTGACCCATAAGCAGGGTAAACATGAAAAATAGAAATTCTGAGAAAATGTAAGAAAATCTAGACAACAAAACTAGGTCACTGTTGGGAAGCAAATATTATCTGGAAAATATACAGGTGTAGTAGTACACCACTCTACTCCATCCACCGTTTTTCTTTTCTTCTTTAATTTTGCTGATGACTGAGATATTGGGGTGGGCCCCCCTTGCATTTTATTCTTGGCTCACCCATACTAATTTCCAAAGAGGATCTGCCAGTCCCAAGATGACTCTCATAACAAGGGTTTCAGATTATTGTATTTACACCAAAATCTTGTACCCAAACCCCTGAAGAGAATCCCCAAATTCCCCATTCCAGTAGTCCATCCACATATGGACAAAATAACGCATTTTCTATCATGATTTAACTCAAAAGGACTAATTTAAAGTTTCAATAATTCCAAAGGAAGTACCATTTATAGGCACAAATAGAAGCCTTAAACTAATAATAGTAATATTACACCAAAACCAAAAGACTAATAAAATCCTATTTATTACAGACATATAATAATGCCTTTATCATTCTATAATGCAGATCAAAGTGATAAACTTGCTTTGTCTACCCTTAATTCTCTACAAGTGAAACATTACGGTAGTTATCAAGTCTTGCTCACAGAGAAGATTGAAGATTTTCAGTGGTTTTAGTATACCCAGTACTCATACTGCATACTCTAATGCAGTAATATATTTAGTATTGTATTTTAACAAAAGAGTTTAGAAACAAAACGAGAAAAAATTGGAATTCAATTCAGCAAAAGAACACGTGAAAGGTAATGAAAAAGTATATGGCTTATTATCTCTTTGCCAAACCTGGATCAACCCAACTGCACGATCGTCCACCCCCCGACTATAATTCCATAACATCTCCCCTGTTTTTAATCCAAAGTCTTTCTGAAGAGAGTCCTGGACACATCAATATAAATTAAGCAATCGTTCCAAATAACTTAGTTTGAGAATAAAAAACTCAGCAAAATAACTTGGTCATAGCACAGCCACAACCAAACTCTCTATTATGTATACTCAACGTTAATACTCTTGCTTGATGTTAATGTATTTGTTTTTTGCTAAGTTATTTAAGTTTTTCATTTGTTATGATTGTTGGAATCTTTGTTTTTCTCTATCGTTTGTTCCTTTTTACCCCTTTTGAAGTTTGTATCCTTTGAGCATTGATCTGTCTTTTCATTGTTTCAATGAAAAGTTTTGTCTCTTATTAAAAAAGAACAATAAACTCATTAGCAATAAGATAATCATTAAGAATTAATTTGTCAATCATAATATAAAATAGTCTATCCCTCTTCATTCATCTATGTTCAATTTTCTCGCTTCGTTCAACATCTCCTCTCTACTAATTTCAAAATGCAATATAGAGCAAATTAATGTAGGCTACTAAAAACATATCACACACCATATAGGATTCTTATTGATGTAGCTGTTTTTCTAGTATACGTCACTTTTTAATCTTTTACCTTGTCTCTTGAGTCTTGACAAAACTTGTATGACACATGTTTAAGGGTTTTATATATAATGGCACATCATCTTGAAAAAAAATTAAAATAGATATCTCTCAATTTCTTGACATCAATGTAAACCTATAGTGACCAAACAAACAAGACAGACTTAGAAAGAACTATTGAGCCACCTTGGATATCGTACGCAGCTGACCACAAGTCAAAACACTTCTTTTCTTCAACTTCTCCTCTAAGGCATGCCCTATTCCAGGAAGATCCTTGATGGGAAGCGGATCTAAATAATCATCAACCTAGAAAAATGAAATGGAATGAGTGAAAAGAACAACTAATACACATTCTTCTCGACAATTAAGGAAGTACTTACTTGAATAATATATAAAGAAATAGATTTTCTCTATGATCTTTTATTTCCTTTCTCTGCTCATCGTGGGAGCTTCTTTTTTGTATTCTGTTCTTTGTTGAGTTTATATATTAGTTCTTTTTGTATTACGCTCAGTTCTTCTTCACCCCTTTTAGAGTTTGTATCATTGAGTATCAGTCTCTTTTCATTTTTCCAATGAAAAGTTTTGTCTCTTATTAAAAAAAATATATCTAAAATAATTCTTCCAAGTTTTGGAAATTGAAAGGACAATACCTTTTACCCTCAAGAATGCACATAAAAATAGTGAAGTGATTTATAAGACAAAATACACACAACATTCAAGACATCAAAATGGAGTAATGAGAATTGAAACACAATGTTGCAACGCTGGATGATTTGACCAAATAAAGGTTTAGGGCAAAAATTTCTAGAACCTACCTTCTCTGGAGGAATGTAACACTGACCATCAGGTTTTGCAGTTTTAGTGGCAAGGCGAGCCATTAGCATATTTGTAGCTATTCCAGCACTTGCAGTACATCCTGTTGTATAAAAAATTTCTTTTCTTATTTCTGAAGCCAATACCTCAGGATCTACCTCGTTTGTGCCCGAGATATCTAAAAATGCTTCATCACAACTTACAGCCTGCGTTTGACACAAGTAGCAAGATTAACGAAGCAAATCACATTGAATTGCCTACAAGAAATGTTATCTAAAACAGACCTGCACTTTCTCACAACGCTTATGCAATATGTCATAGAACTGATCGGCTACCTGCATATTTCCCAAGATGTCAGATGCCAACAAAACACCCTTGTATATGATACCAGAAGTAGAATATGATTTTCATCTTCCATAAGCAAACTAATTGACAAATGACAACCCGATGATAGTCAACCACTTACCTCCTCATAGGACTTGAAGTCATATGGAAAAATAACAAGATGGGGACAAAGAGCCTTTGCATCTCTAACGAACATTCCCGCTCTGACTCCTTGATAGATATGGGCAAAGAGAGAAGAATCAATTGATACTCTAGAAAAGCCTTGGATTTGAACTATAGCTTATATAAATAAAGAACTAGAAGACCAACCATAACCACGAGCTGGGTAGTTTGCAGATGAAATTTCTGCAGTTCCTTTAGGATTATCTGAGTGGCATACAGCTATAGGCCTATCCTTAAATTCTGGAATGTTTCGAATAACCACCGAGACAAAAAAGCAGTCCTGAGGCAGCAACATACTAGTATTACTACACTTCAAAATGAATTAACAAATATACAATGATGATTAAAAAATAACTAACAAGTTCAATCAAGTAATTCTTGTAAAGTAACCATCTAAAAAGAATAGTGACAACAAAAGCCAACATGCAAATATTTGAAGGACCAATACTGCTCAAAGATTACCATGTCAACATGGATAATAGTGGCAGACTGATGATGGGAAGAACCATTGATATGAGAAGTCGCAGGATTGGACCCAAACCGTGGAAAACGCTTATAATAACGATTTCTCCAAGTTCCAATGAAATGTAGCCTTGACTTCTGCAGATTGAATTAAAGAAAACAAATTTAGTCTATGAAATGGCAAAAAGTGAGAAGTTACCATCAAACTGTAATGAAATAGTAAAAATACTAGAAACAAGGCCCTAGAGTTTTTCTACTCCATCTGATTTTTCACTAAGACATCTGATAGGACCTCGTTCTACAGCTCTCTATTATAAATGTTAAGATTTAGAAAATGTGGATGAAAGTAAAGTAGTTAAGACAAATGCCATCAATAAACTCAGTGTGTAAGAAAAACTCTTGCATAACCTAAAATACCTTGAAATAATTTTCCACAAAATCTGGATTCTCACGTGTTGAATGCCACAGCTTAGAAGACCCAGCCACCATAGAACTTGATGATCCATCACTATGATAATTATTGGTGCTACCATTGTGAGATGATGCAGAAAAACCATGCAAACTAGATATATTTTCTTCACTGCTCTGCCCCACATCAACAATTCCTGGTTCTTCATCTGCATAATTACATTTTTCTTTGCTTGGCCCTTTCTGTACTTCTACATTAGCATCCTTTCGAGGAAGCATCTCAAAACTTTCACAAACTTGTTGTTTATATTCACTAGATACATCTACATCAAATATATTTGTATCCTTTAGATGGGTAGCCTCTAAATCATCATTTGACTTCTCATTCAGTTCAGCATCTGCATTATCTTGAAGATTCATTTCAGAATCAAAATGCATCTCTGCTCTATGTTCTATCGATTCATTCACTTTAGACGAAGTGGTATCCTTTAAATTCATAGCCACCAGGGACAGTGAATCCTCTGTTCCATATTTCTTTTCAGTAGTCATACAAATTTTGGGTTTCTCCAGCGTCGGACCTTTTTTCATAGAAAAGAATTCTGATAATCTTGGTTGATTACTTACAAGCTGATCAAGTTGGTAAGGAACCCCTAGAAACAGAAAAATGAGACCCATATCAGCTACCAGGGTCAAAATTTAGTCTGCATTTCTCTTCGAGACCTCTTTGTTTATTGGGACAAAGTAATACAGCAAAATGTGATCCATATCAGCTATAAGGTGCAAAAGTTAATTTGCATCTCTCTTTGAGACCCTTTTTTTTGGGGCAGGGGACAAAGGAAATGTCTTGATGTTGCATAAGCGCTGACAACTCCTGGTATTAAATAGTTCCTAATGCATTCCTCAAGCAATTATCCACTAATTAAACTTACGTATCTACACCTAAAAGCAATGCATTAACTTACAGCTTAATAGCTTATTAGAAGCAACAGAATCCAAGATCCATGTGGGTTTTACAACTGGGAGTCCACTGCTGAAGGACCTGAATAACCAACAAAAGAGTTTATCTTAATTCTTCACCAAAAGCAAGACTAGTGCGAGTTTTTTACAATGAAGATAAGTTGTGAACCAAACCTGAGATTCTTTATTTTACTGTCCGGTAAATTACTGCAAATTATATGAGAAACACTATGTCTTGAAAAATAGTTCTCAAATCTTCCACCAT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BLAST of Lsi03G005470 vs. Swiss-Prot
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BLAST of Lsi03G005470 vs. Swiss-Prot
Match: GDL39_ARATH (GDSL esterase/lipase At2g24560 OS=Arabidopsis thaliana GN=At2g24560 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 293.9 bits (751), Expect = 3.4e-78 Identity = 148/352 (42.05%), Postives = 225/352 (63.92%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. Swiss-Prot
Match: GDL1_ARATH (GDSL esterase/lipase At1g06990 OS=Arabidopsis thaliana GN=At1g06990 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 292.0 bits (746), Expect = 1.3e-77 Identity = 135/317 (42.59%), Postives = 208/317 (65.62%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. Swiss-Prot
Match: GDL44_ARATH (GDSL esterase/lipase At2g31550 OS=Arabidopsis thaliana GN=At2g31550 PE=3 SV=3) HSP 1 Score: 291.2 bits (744), Expect = 2.2e-77 Identity = 143/354 (40.40%), Postives = 226/354 (63.84%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. Swiss-Prot
Match: GDL43_ARATH (GDSL esterase/lipase At2g31540 OS=Arabidopsis thaliana GN=At2g31540 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 290.0 bits (741), Expect = 4.9e-77 Identity = 143/353 (40.51%), Postives = 225/353 (63.74%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. TrEMBL
Match: B9SQQ5_RICCO (Zinc finger protein, putative OS=Ricinus communis GN=RCOM_0839620 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 406.4 bits (1043), Expect = 5.2e-110 Identity = 196/367 (53.41%), Postives = 266/367 (72.48%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. TrEMBL
Match: A0A067JRA0_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_17570 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 401.0 bits (1029), Expect = 2.2e-108 Identity = 185/330 (56.06%), Postives = 253/330 (76.67%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. TrEMBL
Match: I1JIF3_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_02G264100 PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 374.0 bits (959), Expect = 2.9e-100 Identity = 186/356 (52.25%), Postives = 252/356 (70.79%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. TrEMBL
Match: M5X6K9_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa017759mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 372.5 bits (955), Expect = 8.3e-100 Identity = 191/359 (53.20%), Postives = 254/359 (70.75%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. TrEMBL
Match: G7K273_MEDTR (GDSL-like lipase/acylhydrolase OS=Medicago truncatula GN=MTR_5g083040 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 364.8 bits (935), Expect = 1.7e-97 Identity = 183/350 (52.29%), Postives = 242/350 (69.14%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. TAIR10
Match: AT2G40250.1 (AT2G40250.1 SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein) HSP 1 Score: 334.3 bits (856), Expect = 1.3e-91 Identity = 171/365 (46.85%), Postives = 246/365 (67.40%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. TAIR10
Match: AT2G24560.1 (AT2G24560.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein) HSP 1 Score: 293.9 bits (751), Expect = 1.9e-79 Identity = 148/352 (42.05%), Postives = 225/352 (63.92%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. TAIR10
Match: AT1G06990.1 (AT1G06990.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein) HSP 1 Score: 292.0 bits (746), Expect = 7.2e-79 Identity = 135/317 (42.59%), Postives = 208/317 (65.62%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. TAIR10
Match: AT2G31540.1 (AT2G31540.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein) HSP 1 Score: 290.0 bits (741), Expect = 2.8e-78 Identity = 143/353 (40.51%), Postives = 225/353 (63.74%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. TAIR10
Match: AT2G30310.1 (AT2G30310.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein) HSP 1 Score: 287.7 bits (735), Expect = 1.4e-77 Identity = 146/352 (41.48%), Postives = 221/352 (62.78%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. NCBI nr
Match: gi|720003875|ref|XP_010257136.1| (PREDICTED: GDSL esterase/lipase At2g40250-like [Nelumbo nucifera]) HSP 1 Score: 411.0 bits (1055), Expect = 3.0e-111 Identity = 193/354 (54.52%), Postives = 257/354 (72.60%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. NCBI nr
Match: gi|223532279|gb|EEF34082.1| (zinc finger protein, putative [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 406.4 bits (1043), Expect = 7.5e-110 Identity = 196/367 (53.41%), Postives = 266/367 (72.48%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. NCBI nr
Match: gi|643713747|gb|KDP26412.1| (hypothetical protein JCGZ_17570 [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 401.0 bits (1029), Expect = 3.1e-108 Identity = 185/330 (56.06%), Postives = 253/330 (76.67%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. NCBI nr
Match: gi|802724762|ref|XP_012085839.1| (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: GDSL esterase/lipase At2g40250-like [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 399.8 bits (1026), Expect = 7.0e-108 Identity = 189/340 (55.59%), Postives = 257/340 (75.59%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G005470 vs. NCBI nr
Match: gi|1000948229|ref|XP_002528324.2| (PREDICTED: GDSL esterase/lipase At2g40250 [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 398.7 bits (1023), Expect = 1.6e-107 Identity = 193/353 (54.67%), Postives = 258/353 (73.09%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Lagenaria siceraria
Date Performed: 2017-09-18
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |