Lsi01G019400 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

Overview
NameLsi01G019400
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionRhodanese-like
Locationchr01 : 24820297 .. 24870481 (-)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSthree_prime_UTR
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CTTCCATCAGCCCATGAGTGTGCTCCGCGCCCACTCAACATGGTCCACCTACCATGTCATATGCTTCGATTTTGGGGGTCTGACATATACACCTTTTGAAACTTTCTATATATTCTTCTACTGTACATGAAATCTCATTGATTTATACATCCTATATTATTCATATCTTTTGTGTATTTTATAGTTTAGTACACAATATATATGCACTTACATATTGGAAATACTATTTATATATTTTTTATATAGTGATTATATGTTGCATATACGGATTGCAGCATATTACATTTTAACAATCTTTTAGAATGTAAATATGATAAGTTTGTCTGTATTAGTTTGTTTGAATATTAAACATTGATATTTATTTGTATTAGTTTTTATATGAATCATTCTTTAAAATTTATAGTGGAACTGTGTCAAACCCCTAGATCTCGATTCACATGGGGGCGCTTGACAAAGAAGTGTAGGCATGTTGTGTGGACCAAGTCAACCAAGGGGTCTCCACTCGAGCATGGGTGGCTCGAGAGACTCTTAACATGGACTACATCTTCAAATAAAAGTGGGGATGAGAACTCTTGATGAAGGATTCTTATATAGCCGAGAAAAGGAAGGGGAAGGGAAATTCTCAATCACAAGAGTTTCCCTCCAAGGAGATGGTGCCACGAATCACTATGACCAAGTTCTACTTCTTGAGAAGGGGAAAAGTGGTATTGGGAGAGTCAAAATGGGAGTGGATGAACATGTCCATGAAATAAAAGGGAAGTGAGCATATGGGTGGTTGGTTACTTGGGTAGTGGGGAACTGCCCAAGTCATGGAGAATGTGGGGGTGGTTATCAAGTAGTGGTAGTTTACTACATTTTAGGATAGTGGGTAGTGTTAAGTTTAGCCCATTAAGTCCTTCATCCCTCCTCATCCACGGCTATAAAAGGAAGAGCTTGGGGATTGTTCAAGCTATGTTCTTTGTGGTGGAAAATCTTTTGAGACACTTTGTATTTCCCTTGAGTCTTGTAAGCATTACAAGTGAGTTGACTTGTGTGACTTGTGAGTGGCTATTTCGTGTAGTGCTTTATTAATAAAGTAACATAGTCGACATTGTAACCAAAGTTGTGTTCTCTTCTTCTTATCTTGCTTATTTGAGTGTCTGAGATTAAGTGTGAAAATGCCCTTGCGTGAGGTATCGTTTCTGAGTGTTTTGTGAATGTTTTTGGGCAAAAATTAAGGTTGGACTAAGGAAAACCTCCTTAGACCGCACGGGTTGAGGGCAAAAAATTCACCATCAAATTCTACCTAGTGACAAACTATCTAATAACAAAGTTTGTAAGATAGGTGTATAAGATATGTGTAGTAGTTAATTACTCTTTCTAAAGTTAATTGTAATTTCGATGCACTTAAAGTTGCATAAATCAATAAGTGTTCATTTTTATAATACACCCCTGATGCTACATAATTTAAAATCAAGAATTGCTCACTTTAATTAAATTTAACTGTAGTTGCAGGATTGCGAGTGATTTTAAACTAATAAACATACATGATAGAGAAGGCATGTCTTCTTTTATAGAAATGCTCCTGTATTAGCAATATCAAGAAATATATTTTTAAATATTGTAATAAGCTTATATGTTGTCTTCTTGAGGCGGAATAAAAGAAATGATCATTAAAATCATAAAAACCTCGGCCAACTATTTCGATATCATTCTTGGAATGAATTGTGGTAGAGATTGAAGTCATTATCACGATAAAGAAAGAAGTAATTATTCATTTTGTGGTGATTTAACTTTAAGAGCCTCAAGTAATGAAAATGTAAACAATGTGGAAATAAACTTTGCAAATCTCCTAAAAAGATTATTGATTTATTTTTTATTCCCTAAATGTCATATATTTAGATCATATAAATTTCTTTGAATCTCCAGAAGAGACAATTAATTCTTTTACCCACTCAAATGTGAAATATATAGATGTTGCAAAATTATTTTAAATCTTCCGAATAGTAGAGAATTATGCTTGGAAAATGTGCAACTAGCACAAATTATTATACTTAAAAGCATACTCTTCAAAATTGGCAATGTTGGAAGCAAAGTTAATAAAATATTAAATATTGCAGATTAGATTGAAGATTTTGAAAAAGAAAGTATTATTTTGTCCATATGAGCAAAATTTACCATTGATATATTTCTAACCATACCTTGTGTAATGGTTATCATATAGAGATTGACAATAAGAATAATATAGAGTCATTATATTATATTTATTATCTAATATGGAAAACATATATTATAAAATCTTACTACTTTTCTTCTGGTTTATATTACACATATATTAGTGGTATTCAAATTATGCAACAACGAATCTGAAGTTCATTTATCCACATAAATTGTTGTTTAGCATGATCAATTATATCATCCTAGGCCAATGAGTATGATTATTGAAAAAGTCACATGAACATCTTGATATGACAATCCTAGCAATTTGAAAATTAGGAACCCAATTGTTGAACCTCTAATAACAAATCCCAAAACTCCCAAATCAATTGATGTCAATCCAAAGGAAAATATTAGAATTGGATTACCTTTTGATCAAAGACCAATAGATAAGGAGAACTAGTTCCTTAATCCAAGTTCGAACACTCCACAAGCAAGATGATCACACTTACCTGAATGTTCTTGGCATGCAACCCTGATTCAAGAATTGCAAAAGTGGCGGGTGATGAATCTCTGTCATCAACACAGAGAAAAATTATCATTCCACACTCAAAATCCAAAAATTGTTTTTAAACAACCTAAAGGCAAGACTTTAAATAGTCTCCCAATAAAACCCTAACGACTTATCATAATTTATAGTAAAATGTCCAAAATAACCCTACTTAAAATGTTTTTAACAAGGATAAATTTAGAAATTATTAAATTATATCAAAATTATTAAATAATAATTTGATGCATTGGGTGGTTCATATCACATCCATGGAAGAAATAAAATATTTTTCAATTAAACAAATTGCTATGTGTTGCTTTGCTTTGTAAGGGACATCAATTATTAGACCTTCACCTGCTAAAATTGGTATTGAATCCTTGCATTTTTAGAACGAGCTCATGGTAATATTTGTGGTTTCATTATTAATCGACCTAAATATTAAGGTTTTGACAAGATATATAATCTTCCTAGGTTACACATTCATCCATTAATCTCTCCATTAATCTCCATAATTTTCTTGCCTCCTCTTTATGTTTGGTTCTTGTAACCATTATTCTCACAATCCTATAAATAGAGGTTGTAAAGATTATTTGTAAACATACTTCAACAAAGAAATAACATTTGCTTTCTTTAGCTTTTTCTCTCTACTTTCTTGTTCTCAACATCTTCGCTCTCTTGTGTTCATCTTGTTCGTATTTTGTTCCCATTTTATAACATTTTAGACTATTTGTCCAAATAATAATTTCATTATTCATATTATGCTCCTTTAATTAGGTGATTATTTAAGCACTTAAAATTATGTGGACACTAAAAAAAAAAAAAAAACAAACTATTTGATATAGTTTTGATTTCCTCTACAATTTTTTTTTATAGATTTTATTCCTTCCTAGATATTATTATTTGTTGTAACTTCTCCTTAAATAAAGGAGACTTTGTTGTCCAAAATTTAAAATATCGATGTCGATGGAAATATCAAGGTCTTAATTTTACAGAAATTTTGATGGAAATATCGATTTCAATGGATATTTTTGGAAAAATTATAAAAACAAAAATTTAAAAAATAAATTCAAATTAGTAAATAAACATTTTATTATTTTCAAATAAGTAAGTATGTCTATTATTTATATTATATTATATTAGTGACATTTTGATGCTTATTTTGTGTGTTTCGTGGATTTTTTTTACAATATAATGGAAATATCGATTCACCATCCTATCAATATCGAACCCATGAAAACGTAAAAATATCGACATATCGATGAACATTTAATACTACTTGTAACACCCTATTATAAAAGGGTTATCTTGTTTTACAAATCATTCAAGGAAATACAGATTAAAAGTTCATTACTTAGTTTATTTCAAACCACTACTACATGCATAAAATGAAAGGTTAAACATTTTATGATTACGTGGTTTGTGGGTATTTATGATTATGTGGTTTGTGCATGTAACTCATTAGACTCATATCCATCATCGATTTACCTCTGCAATTTGTCCAAGAAAAGAACTAGAGAAAGTTGACAATTAATATACTTAATTTGTAACTATTTGTAGTGGCCTTCAAACTATAATTTGTAATATTTTGTGGGAAATTAATTTATAATTTAATAATAAATAGATATAAGTATTATAATAAAAGATGTTTGCAATCTTTCTAAATCTCATAACCAAAAAAATCAATGACCCAATTGTAGTATACATCTTGCATTCTCTACAAATAGTTGCAACATTTGCTATATGCAAAGTTCATTGTTGTTTTCATTCTCTCTTTTTTTGTGTCAAATTAAACATTAATTGATTTCAAATTTATGCTAATATTTAAATTTTGTTGCATTCAATTATTTTGTAATTTCATATTTTAACCATTTTAAATTTACAAACATAATAGAGTATGTGCTAATATGAAATTTGGAATATTTCCAAAATAATTGGAACTTCAAAAGAAAGTGTTATTCACAAAAGTGTTTCTTGAAAAATATCAAACTAAAAAAAGGAGACTTGTTAGAGATATTAAACCTCATTGTCATGAATGTAGAGGTGATCATACATTTCTTATGTTCATTTCTTATTTTTTACTTTTCATTGTCATAAACATTATTTTTTAGGAGTCTGTTGGAATAATTATTAACATTTAATTTTTACTTCAAATAAAAATCTGAATAAAATGACTCAACCAACCCAACCCAAATATTTGTACTTCGGTTGGGCTAGCTTCATTATTTAATATGGGTTATTTGGTCTAAAATATTTATAACATGAACAATTGGATTGAGTCTAAAAAGTGTCTTAACTCGACCCAATCAACTCATGAATACTCTTAACTAATGGTGTTGTTTATTTACCTCCGAAATTGGAATTAAAATATATGTACTGTAATGCTCTTTTATATTTCTATCAATTGAGAGGCAAGATCTTTTTTAATTTTAGGGTTCTTTTCAAATATAGAAAAATAAGTCAAATTATTTATAAATATAGAAAAATTTTACCGTCTATCAG

mRNA sequence

TCCACTGCTGCTGCTGATAAGTTAGAGAAAGCTGGTTTTGAAAACATAGCTTGTATAACATCAGGACTCCAATCTGTCAAACCAGGTCAAATTTTCAAACCTTACTCCAAATACTCTATATATTTTAACTCCAAGTTTAAAACAAGAAATCACATTTTTGGCACATTTGACTCGGTTGGTTCGACCGAGTTACAAGATGCTGGCAAAGCTGGTTTGGTGACGATCCAAGGCAAAATTTCAGCTGTACTAGGAACTGTTCTCATCTGTGCATATTTATTCATAACTCTCTTTCCAGAACAGGCTGAGAAGCTGCTTCAAATGGCACCAACAAATTAAACTATTGTCTAAACATTAGCCTTTTAATTTTAATTTTAATTTTTGTTTAGGTATTATAATTAATTGCCATTTTTAAGTGCATATTTCCATACCATCTTGACGACTTTATAAACGTAATGTTTATTAGCTCAATTGGTTAGATATCAATGTCTTTCCCTATGAATTGTAGATTTAAATTAGGGTTGTTTTCAAATATAGAAAAATGAGCCAAACTATTTACAAATATAAAAAATTTTACCGTCTATCAG

Coding sequence (CDS)

TCCACTGCTGCTGCTGATAAGTTAGAGAAAGCTGGTTTTGAAAACATAGCTTGTATAACATCAGGACTCCAATCTGTCAAACCAGGTCAAATTTTCAAACCTTACTCCAAATACTCTATATATTTTAACTCCAAGTTTAAAACAAGAAATCACATTTTTGGCACATTTGACTCGGTTGGTTCGACCGAGTTACAAGATGCTGGCAAAGCTGGTTTGGTGACGATCCAAGGCAAAATTTCAGCTGTACTAGGAACTGTTCTCATCTGTGCATATTTATTCATAACTCTCTTTCCAGAACAGGCTGAGAAGCTGCTTCAAATGGCACCAACAAATTAA

Protein sequence

STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPGQIFKPYSKYSIYFNSKFKTRNHIFGTFDSVGSTELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKLLQMAPTN
Homology
[Close]
BLAST of Lsi01G019400 vs. Swiss-Prot
Match: STR9_ARATH (Rhodanese-like domain-containing protein 9, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana GN=STR9 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 121.7 bits (304), Expect = 5.0e-27
Identity = 66/104 (63.46%), Postives = 75/104 (72.12%), Query Frame = 1 

Query: 1   STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPGQIFKPYSKYSIYFNSKFKTRNHIFGTFDSVG 60
           S AAA +LE+AG+ENIAC+TSGLQSVKPG                         TF+SVG
Sbjct: 151 SAAAASRLEEAGYENIACVTSGLQSVKPG-------------------------TFESVG 210

Query: 61  STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKL 105
           STELQ+AGKAGL+TIQGKISAVLGTVL+CAYLFI  FP+QAEKL
Sbjct: 211 STELQNAGKAGLITIQGKISAVLGTVLVCAYLFIQFFPDQAEKL 229

[Close]
BLAST of Lsi01G019400 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L2N4_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G563690 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 147.5 bits (371), Expect = 9.5e-33
Identity = 82/110 (74.55%), Postives = 85/110 (77.27%), Query Frame = 1 

Query: 1   STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPGQIFKPYSKYSIYFNSKFKTRNHIFGTFDSVG 60
           STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPG                         +FDSVG
Sbjct: 161 STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPG-------------------------SFDSVG 220

Query: 61  STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKLLQMAPT 111
           ST+LQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLF+TLFPEQAEKLLQMAPT
Sbjct: 221 STQLQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFVTLFPEQAEKLLQMAPT 245

[Close]
BLAST of Lsi01G019400 vs. TrEMBL
Match: A0A0B0MIU4_GOSAR (Uncharacterized protein OS=Gossypium arboreum GN=F383_19260 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 139.0 bits (349), Expect = 3.4e-30
Identity = 77/109 (70.64%), Postives = 83/109 (76.15%), Query Frame = 1 

Query: 1   STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPGQIFKPYSKYSIYFNSKFKTRNHIFGTFDSVG 60
           STAAA+KLE+AGF+NIACITSGLQ+VKPG                         TFDSVG
Sbjct: 148 STAAANKLEQAGFQNIACITSGLQTVKPG-------------------------TFDSVG 207

Query: 61  STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKLLQMAP 110
            TELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFP+QAEKLLQM+P
Sbjct: 208 KTELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPDQAEKLLQMSP 231

[Close]
BLAST of Lsi01G019400 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2MEK3_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_002G225000 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 137.1 bits (344), Expect = 1.3e-29
Identity = 76/109 (69.72%), Postives = 82/109 (75.23%), Query Frame = 1 

Query: 1   STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPGQIFKPYSKYSIYFNSKFKTRNHIFGTFDSVG 60
           STAAA+KLE+AGF+NIACITSGLQ+VKPG                         TFDSVG
Sbjct: 148 STAAANKLEQAGFQNIACITSGLQTVKPG-------------------------TFDSVG 207

Query: 61  STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKLLQMAP 110
             ELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFP+QAEKLLQM+P
Sbjct: 208 KAELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPDQAEKLLQMSP 231

[Close]
BLAST of Lsi01G019400 vs. TrEMBL
Match: B9N6X5_POPTR (Rhodanese-like domain-containing family protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0006s05810g PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 136.7 bits (343), Expect = 1.7e-29
Identity = 74/111 (66.67%), Postives = 82/111 (73.87%), Query Frame = 1 

Query: 1   STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPGQIFKPYSKYSIYFNSKFKTRNHIFGTFDSVG 60
           STAAA KLE AGF+N+AC+TSGLQSVKPG                         TFDS G
Sbjct: 150 STAAATKLEAAGFKNVACVTSGLQSVKPG-------------------------TFDSEG 209

Query: 61  STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKLLQMAPTN 112
           STELQDAGKAGL+TIQGKISAVLGTVL+CAYLFIT FPEQAEKLLQ+AP++
Sbjct: 210 STELQDAGKAGLITIQGKISAVLGTVLVCAYLFITFFPEQAEKLLQLAPSS 235

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BLAST of Lsi01G019400 vs. TrEMBL
Match: M0U2I6_MUSAM (Uncharacterized protein OS=Musa acuminata subsp. malaccensis PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 136.0 bits (341), Expect = 2.9e-29
Identity = 75/111 (67.57%), Postives = 81/111 (72.97%), Query Frame = 1 

Query: 1   STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPGQIFKPYSKYSIYFNSKFKTRNHIFGTFDSVG 60
           S AAA+ LEK GFEN+AC+TSGLQSVKPG                         TFDSVG
Sbjct: 147 SAAAANTLEKQGFENVACLTSGLQSVKPG-------------------------TFDSVG 206

Query: 61  STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKLLQMAPTN 112
           STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICA+LFIT FPEQAEKLLQM+P +
Sbjct: 207 STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAFLFITFFPEQAEKLLQMSPAS 232

[Close]
BLAST of Lsi01G019400 vs. TAIR10
Match: AT2G42220.1 (AT2G42220.1 Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein)

HSP 1 Score: 121.7 bits (304), Expect = 2.8e-28
Identity = 66/104 (63.46%), Postives = 75/104 (72.12%), Query Frame = 1 

Query: 1   STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPGQIFKPYSKYSIYFNSKFKTRNHIFGTFDSVG 60
           S AAA +LE+AG+ENIAC+TSGLQSVKPG                         TF+SVG
Sbjct: 151 SAAAASRLEEAGYENIACVTSGLQSVKPG-------------------------TFESVG 210

Query: 61  STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKL 105
           STELQ+AGKAGL+TIQGKISAVLGTVL+CAYLFI  FP+QAEKL
Sbjct: 211 STELQNAGKAGLITIQGKISAVLGTVLVCAYLFIQFFPDQAEKL 229

[Close]
BLAST of Lsi01G019400 vs. NCBI nr
Match: gi|659083191|ref|XP_008442228.1| (PREDICTED: rhodanese-like domain-containing protein 9, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 148.7 bits (374), Expect = 6.1e-33
Identity = 83/111 (74.77%), Postives = 86/111 (77.48%), Query Frame = 1 

Query: 1   STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPGQIFKPYSKYSIYFNSKFKTRNHIFGTFDSVG 60
           STAAADKL+KAGFENIACITSGLQSVKPG                         TF+SVG
Sbjct: 161 STAAADKLDKAGFENIACITSGLQSVKPG-------------------------TFESVG 220

Query: 61  STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKLLQMAPTN 112
           STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKLLQMAPT+
Sbjct: 221 STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKLLQMAPTS 246

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BLAST of Lsi01G019400 vs. NCBI nr
Match: gi|449453846|ref|XP_004144667.1| (PREDICTED: rhodanese-like domain-containing protein 9, chloroplastic [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 147.5 bits (371), Expect = 1.4e-32
Identity = 82/110 (74.55%), Postives = 85/110 (77.27%), Query Frame = 1 

Query: 1   STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPGQIFKPYSKYSIYFNSKFKTRNHIFGTFDSVG 60
           STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPG                         +FDSVG
Sbjct: 161 STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPG-------------------------SFDSVG 220

Query: 61  STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKLLQMAPT 111
           ST+LQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLF+TLFPEQAEKLLQMAPT
Sbjct: 221 STQLQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFVTLFPEQAEKLLQMAPT 245

[Close]
BLAST of Lsi01G019400 vs. NCBI nr
Match: gi|728809968|gb|KHF99363.1| (Uncharacterized protein F383_19260 [Gossypium arboreum])

HSP 1 Score: 139.0 bits (349), Expect = 4.9e-30
Identity = 77/109 (70.64%), Postives = 83/109 (76.15%), Query Frame = 1 

Query: 1   STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPGQIFKPYSKYSIYFNSKFKTRNHIFGTFDSVG 60
           STAAA+KLE+AGF+NIACITSGLQ+VKPG                         TFDSVG
Sbjct: 148 STAAANKLEQAGFQNIACITSGLQTVKPG-------------------------TFDSVG 207

Query: 61  STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKLLQMAP 110
            TELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFP+QAEKLLQM+P
Sbjct: 208 KTELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPDQAEKLLQMSP 231

[Close]
BLAST of Lsi01G019400 vs. NCBI nr
Match: gi|743816819|ref|XP_011020266.1| (PREDICTED: rhodanese-like domain-containing protein 9, chloroplastic [Populus euphratica])

HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 1.1e-29
Identity = 75/111 (67.57%), Postives = 83/111 (74.77%), Query Frame = 1 

Query: 1   STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPGQIFKPYSKYSIYFNSKFKTRNHIFGTFDSVG 60
           STAAA+KLE AGF+N+AC+TSGLQSVKPG                         TFDS G
Sbjct: 150 STAAANKLEAAGFKNVACVTSGLQSVKPG-------------------------TFDSEG 209

Query: 61  STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKLLQMAPTN 112
           STELQDAGKAGL+TIQGKISAVLGTVLICAYLFIT FPEQAEKLLQ+AP++
Sbjct: 210 STELQDAGKAGLITIQGKISAVLGTVLICAYLFITFFPEQAEKLLQLAPSS 235

[Close]
BLAST of Lsi01G019400 vs. NCBI nr
Match: gi|823136426|ref|XP_012467974.1| (PREDICTED: rhodanese-like domain-containing protein 9, chloroplastic [Gossypium raimondii])

HSP 1 Score: 137.1 bits (344), Expect = 1.9e-29
Identity = 76/109 (69.72%), Postives = 82/109 (75.23%), Query Frame = 1 

Query: 1   STAAADKLEKAGFENIACITSGLQSVKPGQIFKPYSKYSIYFNSKFKTRNHIFGTFDSVG 60
           STAAA+KLE+AGF+NIACITSGLQ+VKPG                         TFDSVG
Sbjct: 148 STAAANKLEQAGFQNIACITSGLQTVKPG-------------------------TFDSVG 207

Query: 61  STELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPEQAEKLLQMAP 110
             ELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFP+QAEKLLQM+P
Sbjct: 208 KAELQDAGKAGLVTIQGKISAVLGTVLICAYLFITLFPDQAEKLLQMSP 231

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lsi01G019400 vs. Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
STR9_ARATH5.0e-2763.46Rhodanese-like domain-containing protein 9, chloroplastic OS=Arabidopsis thalian... [more]
BLAST of Lsi01G019400 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0L2N4_CUCSA9.5e-3374.55Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G563690 PE=4 SV=1[more]
A0A0B0MIU4_GOSAR3.4e-3070.64Uncharacterized protein OS=Gossypium arboreum GN=F383_19260 PE=4 SV=1[more]
A0A0D2MEK3_GOSRA1.3e-2969.72Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_002G225000 PE=4 SV=1[more]
B9N6X5_POPTR1.7e-2966.67Rhodanese-like domain-containing family protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_... [more]
M0U2I6_MUSAM2.9e-2967.57Uncharacterized protein OS=Musa acuminata subsp. malaccensis PE=4 SV=1[more]
BLAST of Lsi01G019400 vs. TAIR10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT2G42220.12.8e-2863.46 Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein[more]
BLAST of Lsi01G019400 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|659083191|ref|XP_008442228.1|6.1e-3374.77PREDICTED: rhodanese-like domain-containing protein 9, chloroplastic isoform X1 ... [more]
gi|449453846|ref|XP_004144667.1|1.4e-3274.55PREDICTED: rhodanese-like domain-containing protein 9, chloroplastic [Cucumis sa... [more]
gi|728809968|gb|KHF99363.1|4.9e-3070.64Uncharacterized protein F383_19260 [Gossypium arboreum][more]
gi|743816819|ref|XP_011020266.1|1.1e-2967.57PREDICTED: rhodanese-like domain-containing protein 9, chloroplastic [Populus eu... [more]
gi|823136426|ref|XP_012467974.1|1.9e-2969.72PREDICTED: rhodanese-like domain-containing protein 9, chloroplastic [Gossypium ... [more]
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
biological_process GO:0019344 cysteine biosynthetic process
biological_process GO:0019684 photosynthesis, light reaction
biological_process GO:0010103 stomatal complex morphogenesis
cellular_component GO:0009534 chloroplast thylakoid
cellular_component GO:0016020 membrane
cellular_component GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi01G019400.1Lsi01G019400.1mRNA