Cucsa.266170 (gene) Cucumber (Gy14) v1
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTGTTTTTtATTTTTtGCAAAATTGGTTACCCTACTAGTGTTTCTGCTTTCGAGGATGGAGTGTTTGTATTTCCTGAGATCAGGGATGAAGATGGGAGGGGAGTGATTGATAGATATCCTTTTtGGTGAAGTTTAGTTTATAGTCGTGAAGAAATTGAGTTTTTTTTtGGGTATAAATTCAACTTTTCAAAGTTGGTGTTTGAGAGATAAAGATTGGATGTGACAGTTAGCACCATTAGACGCTTAAAACGGGAAGTCAAAAGTCTTTGCGGCTTTCGAAACAAGCCGGTGGAGTTGATCGGTGGTGCAAAATTGAGGGGAGATGGAGATGGAGATGGTGATCGGGAGCAGGGAAGATTTGAATTCCATATTGCCCTTtCTGCCGCTGCTACTGAGGTCCTCCACTCTATTCTGGCCCTCCCAAGTAGTGGAAACTCTCAAGTCTATGGCAGCAGGCCCTGATCACAGTGGTGTCAATTCTGGTGAAGCCCTCTTCCGTTCCATCTCTAACATCAGGAACTCTCTCTCTCTCTCCAATCATCGCCTCGCTTCTTCTTCCCAACGTGGCTACGCCCTTTTCTTCGATAAGGTACTTCGTTTTTCCTGCTTCTTCTTCTGATTCACACGCAAATACTGATAACCATTTTGTGCAGTGAAGTGATATTAAAAGGGCATTGAGTATCTGTTGTTTTAATTCGAATTCACATGCAAATACTGATAACCATTTTGTGAAGTGAAGTGATATCAAAAGAGCATTATTTGTTGTTTTAATTTGGACTGTAACACTAGTTGGAGAACACTTCGATTCGTACTTCCCTTGAAAAATTCTAAGGTACCTTCAACCCATAATTCTCGTACACTAGGACAATGACTATAGTTGAAGGGGGACCCTTGAAATCAGGCTAACGGGCCATCAAATTTTCCTACAATATTTTACTTCTACTTGAACTTAATATGGTTTTCATCTTCGACACTTCTGTTGGGCAGCACACACTAGTCAGGATTTTTGAGTCTATAGAGAAACATGGAACCTAATAACGGACCAAACAATTGTCTAACAAATAATTATTAACAAATGCCTAACAAATAAAGACTTTTGAGTCTATAGAGAAACATGCAACCTGATAATGGACCAAACATCACAAGGGTCACTCTTCACTCCTCTAAGGACTCTATTTGTTCCCTTACTCCCACAATCCCCACAAATGAAGCACACTCTTCTCGTCTTGTCTCAAAAACCTCCCCTTCTTCTTCTTCTTTAGAAAATGCAGATGGAAGAGGAACTCTTTGATCCTCTCCTTGTATTCTGTGTCAGGTCACCTGGAAACGGAAGATCTCATAAAAATAACTCCAAATTGATGACAAGAAATCACAACTCCAAGGTATACGATCTAAGTCTCCCTTTGCCTTTTGACAAAGAATACAACAGAATGGTTTAATCAAAGAGAGCAACTTCCTTCAAAATAGATTTTACTTGTTAATTTGTTTGTGGGATCGCTTGCCAAATAGAAAACCTTCGTTAGAGGAGGAAGGTTTGAACAATCTACAAGAGAACGAGTTACAAGAAATCCTAAACATCACTGCAAACATGACAATCTGCTGTAAAAAGGGAGAAGAAATATATCGGGATTTTGCTCAAAATTGAACATATGAGGGTTCATTTTTCTCCTTTAGAGAAGAAACTTTTCCTCTTGCCTCCAGAAAGGAAGGTTTTTTGATATGCCTTCTCCATACACTGTTCCACTCCCTACCAACATTGTTTCATTCTCTCGGTCGGGTTCATCTCAGGAACACTGAAAATTTTGTTTTtCTTGGGGTCAATCTCAGCCGAGATCGACCTCGAGATTCTTCCCAAATTTTAAAAaCTTGAAGGAAATGTCTCGGTCTCTCTCGGTCGAGTGTGTCACCGAGATAGTACGTTTTTTtATTAAAAATTTGAAATTGAGGTTAACTCTTCTCGGGCCAAATTTGCCATGACAGTCCTCGAGTTGAATATAAAAGCATTTAGGTTAACTATTCCCAGGCCATTGTGGCCCCGAGATGGACCGAGCTGAAAAaCAAAAGCAATTATGTCAATGATCTCGGGCCAAAGTTTCCCCGAGCTAAAGCATTATGTAGTATGATCTCGGGCTAAGGTTACCTCGAGAGAGACCGAGAAATTTCCTTTAAAGATTTTTTATAATTTGGGAAAAATCTCGAGGTCGATCTTGGTCGAGATTGACCTTGAGAATTTTTTTTtCAGTGGTCCCAAGATGCACCCGGTCGAGAGAATGGAATAGTGATAGTTGCTTAGTCTATGCCCCAAACGTGGAGTGGAGTGCACTCCAGTCCCCTCAAGTCTGAGGGCCAAACACAGACTATAAGAACTCATAATATAATAATCTACACCCTCAAACTCAGACTATTATAAGTCTAAACTATTATGAGGCACTCCTCACCCCAAACGCCCCCAAGAATCTAGAATGAATGGTTTTCTGGATTATGTCCAAGAAGGAGACCCCGATATGAGGTAGCAACAAACTTTACAATAGATTCGATGTGGTGAATGGGATAATGAATACATTTATTTTATTTCATGTCTGTAGAGAGAGGATAATTTTGTCTTCTATTTGAGGTTGAAATATACATTCATTTCTGGAGGGATAGATTCTCCTTCATGGTGGATCTCACTTCTTATGAAGTCCTTCTGATAAGAAAGgATAACAAGAGAGTGAGAAAGAGGAAGAAGAAAGCAAGATGACTCAAAGAAAAATTTAGTTTTtCTTTTtAATTTACATTTTCCAGTGATAGTTGTATTGAGCAGGTAAATAGTTAGCTAATAAACCATACCGATGTATTTTTTGGGGTCCCCATAGTTAGCTTAAGGAACATGGAATGGGTTGAAAACTCGTCTGAAGCATGTATCTTCCAGCGTAACCTGTTCCTGGTGCTGTTTACCACTTAGTCAGTCAGCAGCTAAGCTAGAACAATATAGCTGCCAATTTCTCTATCAAAAAGCCTTCTCCTCAGCCCCAAATCCCAATCTTGGTTTAGATTACAGCTTCCCTACGGTCAATCTTATTTGGAAGCAACAACATTTCTAAAAAGGTGAAATATTCCTATGGTCCTTTGCTTACGGAAGTCTGAATACTCAAGAGAAGCTCCAAAGGAAGTTCCCGAACTGATCTCTTTCCCCTTCTATGTCTTGTCTTTGTTTGAGAGAGTTGGAAACCATTGATCACTTGTTCTTACATTTTGATTTCACTTCTAAAGGGCGGACTGTTCTTAATACCTTTGGGTTGGATAGCTGCCTTCCTAAGAAGATTGATGACTTGATCATGGATGGTCTAATGGTAGAAGTTTTCTTGGAAAAGGAAAAATCCTTTGGAGTTATGCTTTCTGAGCGCTTTTATCGCATCTTTGGATAGAAAGGAATTATAGGACATTTAAAGATAAGTTTACTGATTTTGATTCTTTTGGGCTGTTGTTCAACATACATCCTCTTGGTGGTGTACAAATTACACTAAGTTCTTTTGTAGCTACAACCTCCGTATGATTATTAACAATTAGGAGGTTCTTCTTGTATACATTTGGGTGTGGGgTGGgGGGGGGgTACCTCAACCACTGCCCCCACTAGGTTGTTCTTTTGTTCCTCAAGAGGTTTGTCCTTTTGTTTTATGTAATATGTTTTCCTACTTTCAGCTTATAATTTTCAAGTGCTAGATATTTGTACTTTTGTATTTTCTCAGCTTGATGTGTGCTTGAGTTTTCTGATGTAACTGTTTCAGTAAGTCGTAGTATTCTTGGATATGATGAGGGTGCTTGGAGGGTGTCAATCTAGTTGAGATGTCTCGCGGCTATTGATCCTTAGTTTTATTGTTCTTTGTATATCCCTCATGTACTTAGAGCTTTATCTCTTTGTTATTTTCTATTTAATAAAGAGATCTGTTTCCTTTTTTtAAAAAAAaGTAATATATTCCTCTGTTCCTTATCCCAAAAAAAAaGAAACCCATACCAACATACCTTGTTGACCAGCTCTAACTTTTACTTTAAATTGTATACCTTAGCAATGAATTGAAAGATGGATTTTTTTtAGATTTGGTTGTGGAAATTTTTTTtCCGAGACTTGGAATGATTATGTTTTCATTATCTATGGTCTACAATAGATGTGGAAAATTCATGGCATGGTTTTAGTTTTGGGATGTATATTACTGTTACTGTTAGTTCAATTTCGAATTATCATGTATAAGTGTTTCAGCCAGCCAAAAGGTTCTATTTTAAAAAATGTGAAAAAAATAGTAGTCCGGATGTATCATATTCTAGTTGTTTTTTGTTTGTTGAATGGTGGCCGCGGAACTGTGGATGTTTTTTtGATCATGAATGAGAGGTGAAGTAGTTACCGCCAACATAAATTTACATTGTAATATGAATGTTGAGACTAATCAAGATGTTGTGAACAGCTTATGTCCGAAACAGAATCTATGCAGTGGTTTCGTGAGGTTATTCCAGCATTGGGAAATCTACTTCTTCAGTTTCCATCTTTGCTGGAAACTCATTATCGAAATACCGACCAGCTTGCTAGTAAAGGAAGTGGCAAAGCTAAAACTGGTCTTCGTTTGTTAGCTTCTCAAGTTGCAGGCACTGTGTACCTCAGTCAGGTGTGTCAATTTGTTTCTTATTTTATATAAAATTTTGGTCACTCTTAACAGGACTTTTATTTCATCAGTTGTTTTCATGTTGGTTTGAGGCAATGTTAGCGGAGTCTTGTGATTAATTATTCGGAACCCATAAGCATGAATTTCTATATCCAACAATTTGTTTACCACCATGCCTTTACCTAGTGTTAAGGTTGATGACTAAGAAGCAAAGTCATGTAAGAGACCTAGAGATCTATGAGGTTGTCAGTAGAATAACAGTATGGTTATTAGGAGGGGTAGGGGTGAGCAAAGCTATTGGAGAAACTGAGCCAAATGGTCGAACCGAGGAAACCGGTCGATTTTCCTGATAATTCAGTC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MEMEMVIGSREDLNSILPFLPLLLRSSTLFWPSQVVETLKSMAAGPDHSGVNSGEALFRSISNIRNSLSLSNHRLASSSQRGYALFFDKLMSETESMQWFREVIPALGNLLLQFPSLLETHYRNTDQLASKGSGKAKTGLRLLASQVAGTVYLSQELIGALLACAFFCLFPVNDRHVQNLPTINFDYLFAILYDGRSKMQENKIRCIVHYFRRICSNIPVGFVSFERKVLPLNNCAGSFCCPKANFWINSTIPLCQFKVKDSGLIEDQTFGALEVDFANEYLGGGALHSGCVQEEIRFMINPELITGMLFLPAMADNEAIEIVGAERFSNYTGYAFNFCFAGNHEDKREMDSLGRHKTFIAAIDALCSPGMRQYRLEFLLREVNKAFCGFFNQSKYNQYESLFLESGEDVTNHTDKSRNSLPVHESISDARENFLGTSLTPESLDHKDDIGIATGNWGCGAFGGDPEVKSIIQWLAASQALRPSVMYYTFGTGPLHHLEKVSEWILAHKWTVGDLWSMLVEYCSQISNRQTHVGFFDWLLPASSKTNLKCNCT*
BLAST of Cucsa.266170 vs. Swiss-Prot
Match: PARG1_ARATH (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=PARG1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 608.2 bits (1567), Expect = 8.9e-173 Identity = 315/555 (56.76%), Postives = 393/555 (70.81%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. Swiss-Prot
Match: PARG2_ARATH (Probable poly(ADP-ribose) glycohydrolase 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=PARG2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 516.2 bits (1328), Expect = 4.6e-145 Identity = 278/536 (51.87%), Postives = 355/536 (66.23%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. Swiss-Prot
Match: PARG_DROME (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase OS=Drosophila melanogaster GN=Parg PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 191.8 bits (486), Expect = 2.0e-47 Identity = 124/318 (38.99%), Postives = 170/318 (53.46%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 62.4 bits (150), Expect = 1.8e-08 Identity = 34/83 (40.96%), Postives = 47/83 (56.63%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. Swiss-Prot
Match: PARG_MOUSE (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase OS=Mus musculus GN=Parg PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 174.5 bits (441), Expect = 3.3e-42 Identity = 114/310 (36.77%), Postives = 164/310 (52.90%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 65.5 bits (158), Expect = 2.1e-09 Identity = 38/104 (36.54%), Postives = 59/104 (56.73%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. Swiss-Prot
Match: PARG_HUMAN (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase OS=Homo sapiens GN=PARG PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 174.5 bits (441), Expect = 3.3e-42 Identity = 112/310 (36.13%), Postives = 165/310 (53.23%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 69.3 bits (168), Expect = 1.5e-10 Identity = 39/104 (37.50%), Postives = 62/104 (59.62%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LNA3_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G123570 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 826.2 bits (2133), Expect = 2.3e-236 Identity = 395/395 (100.00%), Postives = 395/395 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. TrEMBL
Match: A0A067K079_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_19255 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 686.0 bits (1769), Expect = 3.7e-194 Identity = 349/550 (63.45%), Postives = 408/550 (74.18%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. TrEMBL
Match: B9T530_RICCO (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase, putative OS=Ricinus communis GN=RCOM_0211520 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 681.4 bits (1757), Expect = 9.2e-193 Identity = 344/550 (62.55%), Postives = 411/550 (74.73%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. TrEMBL
Match: V4VQK9_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10019560mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 671.0 bits (1730), Expect = 1.2e-189 Identity = 343/552 (62.14%), Postives = 415/552 (75.18%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. TrEMBL
Match: W9RGD8_9ROSA (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1 OS=Morus notabilis GN=L484_009352 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 667.5 bits (1721), Expect = 1.4e-188 Identity = 338/549 (61.57%), Postives = 415/549 (75.59%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. TAIR10
Match: AT2G31870.1 (AT2G31870.1 Poly (ADP-ribose) glycohydrolase (PARG)) HSP 1 Score: 608.2 bits (1567), Expect = 5.0e-174 Identity = 315/555 (56.76%), Postives = 393/555 (70.81%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. TAIR10
Match: AT2G31865.2 (AT2G31865.2 poly(ADP-ribose) glycohydrolase 2) HSP 1 Score: 512.7 bits (1319), Expect = 2.9e-145 Identity = 274/536 (51.12%), Postives = 353/536 (65.86%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. NCBI nr
Match: gi|449442353|ref|XP_004138946.1| (PREDICTED: poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1-like isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1123.6 bits (2905), Expect = 0.0e+00 Identity = 550/550 (100.00%), Postives = 550/550 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. NCBI nr
Match: gi|659082095|ref|XP_008441668.1| (PREDICTED: poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1042.3 bits (2694), Expect = 2.9e-301 Identity = 510/548 (93.07%), Postives = 522/548 (95.26%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. NCBI nr
Match: gi|659082103|ref|XP_008441672.1| (PREDICTED: poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 984.6 bits (2544), Expect = 7.3e-284 Identity = 489/548 (89.23%), Postives = 500/548 (91.24%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. NCBI nr
Match: gi|659082105|ref|XP_008441673.1| (PREDICTED: poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1-like isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 846.7 bits (2186), Expect = 2.4e-242 Identity = 434/551 (78.77%), Postives = 451/551 (81.85%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.266170 vs. NCBI nr
Match: gi|778668329|ref|XP_011649080.1| (PREDICTED: poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1-like isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 829.7 bits (2142), Expect = 3.0e-237 Identity = 397/407 (97.54%), Postives = 401/407 (98.53%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber (Gy14)
Date Performed: 2017-01-17
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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