Cucsa.167370 (gene) Cucumber (Gy14) v1
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GACCCACTCTTAGCACACCCCTAACTCATTCCTTTCTTCACCAACATTCATTTTAATGCCCTGTTGGTTTCTTCAGTCTCTACCTAACTACCATGTTATCTCTGTAGCCTACACTTGAAATGGTGGCCATACTCAGCTGATTACCCTAACCCTACCAAGAGCCAGAATGCGTTTTCTTCATAACAATCACTGTCTCTATACCCCCTTTTCCAAACTCTCTTCCTTTTCCTCACCATCTTGTCTAATGGGTTCCTTTCCTTTATGCAAATCAACTTCTCTGGTTTTCCTGTCACACCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGCAGAAGTATTTCCTGTACAGAAGCATTTCTCTTCTCCATGGTTCATTTCCTGTACGACCCATGTCCCTTGTGAAACCCTTTGCCATGAAACCAAATGGGGTTTCTTCTTTTACTTCTCATGCCAATGTTCCCAGACCTCCAGGTGCTATTATTGGAACTTTTTATGGTTGTTTAATTGTAGTTGGGTTTATGATTGTTTCTGGTTAATACCCATGTTGTGGAGTAACTTGATGTTTCTTGGCTGGGTGGTTACTTTTTTTTTTCCCACTTTTTGGATTGGGATGAAACAGGAGAGGTTAAGGGTACATTTTTTAAGGCAGCAAAGTAGTTTGCAGGCAATGTATTCTGAGGATGGGATTTGGGAGAGGACTTGACGTTTGTTTAGTTTTAATGTTATTCGCTTTCTTCTTTGTGCAGCCCTTTTGGAGAATCCACCAGACAAGGCTTCAAGCTCCACTCGATTGAATATTCTGAGAAAAAAATTGCAGGATCTTGACATTGACATCGAAGCTTGTGTTCCCGGGCAGTTTTACAGTTTGCTTTGTCCAATGGTATTTTGTTTCTAATATCAGTTTCTTTATGCACATTGTATTCTGGTTTGAGATATTCAACCAATTTGTAGAAGTGAAATGAAAACAGCTGCCAACTTCTATATCTTATTTATTTATGTATTTATTTTTGGTAAGAAACCAGAAGATATATGGATGAAAAAAAGAAGACAGCCTAAGGGCAGGAAAGAGAGACCCCCTTCCAAAGGTGTTAATAAAATTAATAAAAGCAGCAAGCATATCTTCAGGAGTCCATTGACTTGTTGCGGTCAAAATTCATCAATTCTAACCAGTTTTCAATTGAAATTCATGAATTGGGGACTAATCTTGGTCTAAGTTCAAGAATTTGGACCACATCTCAGTTGGAATTAGTGAGTTTCAAAGAGTTTTCGGCAGAACTCATGAATTCAGATTTCGACTTCTTCTTTGAAAAGATGGATAAAAAAATCTATTTTACAATTCCTTATTCAATTTGGATAGGGAAAGTGGGTTAAAAAGTTGATGAATATGGAATGAAAGCAAAAAATGGAAAGAAAGGAAAAGATTTGCATTGGAATCTAGAAAGCAAAAGATGTGCATCAAAAAGAGTCTTTATCAACTTAAATTTGCTCCAAGGGACTCTGCTTCATTAGTTTTTGTTTGGGGCAATCGGATCTAGTTCTGATGTAGTTAGCTTGGCTGTTGGTTATTAGCTGATGTAATTAGCTTGGTTATTAACTGCTGGAAAGTACTCACACTTTTAGACTTTTGACTTGTTGTAAAGGTGGTAGGTCACCTTCTGCCTTAGTATAAAACTTGGAATTAGGCTGTTCTAATTTTTTTTTCAATTCATATTTTAATAAGAAGAATAAAGACTTCAGTTTTTTTGTTTGAACTTCTCCAAGACTTCATCAACTTGCTATCAGAGCTCTCGAAGAAGGGACTCATGGTGGGAAGGAACCCAGCCAACGCTGGCAAAGGCAAGCGTGTCAATGAGCAACCCTTGGAACCAGAGATTCTCTCGCTGAAGACTTCAACCCCACTCTTGTTGGCCGTTGAAGAAGCGATAGGAAAGATGAATACCCGTTTGGCCAATCTACAACTTGTAATCGAATGGGTGTCCTGCCAAATGGAATTAGGCACAAACGCCTTACCAAACTGGCAAGATGCCGCCACTAGAAATAAGAGAAGAAGATGCTAGCTGCAACTCGCCGACAACATGCAAGAACCAAGAACCAAGAACCGACGAGGATACCTCAGAAAGCGCCAAGAAGCTTCAAATGCACCTAGTGACCACTGACTTCTAAGACTTGTTGTTATACAAACAAATTCGAATGCATTGTCGAATGAAGAAAATGGGTTCGATCGTCAACTTGCAGACCAACGGTGGATGCAATGAAACAAAGAGGGTAAAAAATTATTTTGAGTGTAACGAGTTTCACCTTCTCTTCAAGGCTATCTTGTACTCAAAAATCCCTTTTTCATCACAGAGAGGGCCAGATAAGAGGGGATTATTACCAAGAATTTAAAATGAAGGTGGACTTAACCACATTCAGTGGAAAATTAGATGTGGAGGAATTTCTTGATTGGATCAAGAATGTGGAAAACTTTTTTGAGTACATGATAGCCTTGAAGAGAAGGTGAAACTCGTTTCACTCAAAATCAAGTCAGGAGCTTCAGCTTGGTGGGACCAAATCTAGGTGAATCGGAGATAGATCGGAAAAAGTCTCACTAGGAATTGGCCTAGAATGTTGAAACTAATGAAGGGAAGATTCTTGCCAACAGATTACGAACGGATTTTGTACCATCAATATAAAAAATGCAAACAAGGCAAGCATAAGATATTTGAATATGCGGAAGAGTTTCACTGATTGAACGCAAGAACGAGAATCAACGAAATAGAAAACCGAGATTTGTTAATGGCCTTAAAGAAGAGATCCAAGAACAAAGGAATCTCCAATTGATTAGCACCCAATCGGCGGCAATTTTGATGATTTACAAAGTCGAGATCAAGATGGAAAGAAGACAGAAAATACGAGATCCGTCAAGAACAAGTGAATGAACTCCTAGAGAAAGGGCATATTAGGCCAAGCCTAAGTCCTTGCATCTTTCAAGACCAATGAGGGCCTCTTTGAATGGTTGGTATGCCTTTCAAACTTTCCAATGCGCCTAGCATTTCCATGAGGTTAATGACTTAGGATTTACATTCTTGCCTTAATAAATTCTTGGTAGTCTATTTTGATGACATTTTAGTATGTATCCTTTCCTATGAAGAACATCTTTCTCACTTGCATAAACTTTTAAAACCCTTCAAAGAAACCAACTTAGTATCAATTTCAAGAAGTGTTGACGTGCTTTAATTTCTATTTCTACTGTTGAGCTTTTACTCTTCAGCTTTCAAGACCTTAGTATTGTTCTTGTATTTTGGATATGATGAGAATGCTAAGGGGGTGCCAGCCTAGCTGAGATGTCTGGGTGCACCTACTGATCCTCTCTCTCCCTCTCCCATTTCTAGGCTTTTCTATTACTCTCAATGTATACTCCTTTGTACTTTGAGTTTATTAATAATATTGAAGCTTGTCTCCTTTCTAAAAAAATATATCAATTTCAAGAAGTGTTCTTTCTTGGTCAAAGACATATTTTTTTGGGTTTTGTCACTAATGAATTTGGTATATCTGTAGATCATAAAATTTTTTACTACTATAGCATCCTTGCTAACTGAATGTTTAAAGAAAGGAAAATCCTCATGGTCTAACATGGTCTAACTCGCAAACACAAAGTTTTGTGCTTTTGAAAGAAAAGTTGTCTAACAAAACCGTTCGAGGTAGCGGTTGGTGCTTGTGGAGCACCTATGAACAAGAACTTTTTCGTTGGTAAGAGCTTTAAAGGCCTGGGAAAAATTATCTTGTAGGCCAATAATTCATTTAATATTCCAACCACTTGTCCCTCAAATATTTACAGACCCGAAAAACTATTAGTAGAATGCATGCTAGATGGCTCTCTTTTACCCAACGTTTTCATTTTGTAATAAAGCATAAGGCGGGTAGTACGTACTATGTTGTGGCGGGTGCTCGTAGTAGGAAAGCCAATCTTCTGACTATCCTAAAGACTCAAGTGGTAGTTTTTGATTCTTTACCAAACCTTTATAAGGATGACCTTAACTTTGGCAATATTTGGTTTTTATGTATTGATGAGGTTAATTGTCACTTGACTAACGAGTTTCTTTTGAAGAATAATTTTCTTTGCATTTTTGGAACATCGCTTCATGAGGCTTTGATTGAAGAGTTTCATAGCAATGGCCTTGTGGGGCGTTTCGATATTGACAAGACCTATCAACTACTTAGTGAAAGGTATTATTGGCCACATCTACGTAGGGATGTCATAAAGTTTGTCAAATACTGTTTTATGTGTCAAACTGCCAAGGGACAGCATCGAAATACGGGCCTTTACACCCCATTACCTATTACGGGAGGCATTTGGGAAGACTTGTCCATGGACTTCATCCTAGGCCTTTCAAAAATTCAAAGGGGGTATGATTCCCTTGTTGTGGTAGTTGATCGATTTAGCAAGATGTCTCACTTTTTACCTTGTAGGAAAACTTCGAATGCTGTTTATGTATCTAACATATTCTTTAAAGAAATTGTGCGTTTGCACGGAATACCTAAATCCATAGTGTTTGGTCGAGATGTAAAGTTTCTAAGCTACTTTTGGAGGACTCTTTGGAAAAAATTCAACATGACACTCAAAGTTAGCACCACGAGTCATCCACAAATGGATGGACAAACTGAAGTCAATAGTAGAACTCTAGCCAACCTTATAAGATGCATCGGTGGAGACAAACCTAAACAATGGGATCTCATCTTAGCACAGGTAGAGTTTGCCTACAATCATATGAAGAATCGATCCATTGGGAAGTCACCATTTGAGATTGTTTACACTAAATTACCTAGATAAACAGTTGACCTTGCCAATATTCCTTCTAATGTTGATCTTAGTGTAGAAGCCGAGAACATAGCCGAAAGAATAGCAAAACTGCACAAAGATCTAGCAAACCAACTAGAAAAGATGAATGAAAACTACAAGAAACAAGCGAATAAACATAGAAAATTCAAGGAATTTAAAGAAGGCAATCTCGTCATGATATA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ATGCGTTTTCTTCATAACAATCACTGTCTCTATACCCCCTTTTCCAAACTCTCTTCCTTTTCCTCACCATCTTGTCTAATGGGTTCCTTTCCTTTATGCAAATCAACTTCTCTGGTTTTCCTGTCACACCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGCAGAAGTATTTCCTGTACAGAAGCATTTCTCTTCTCCATGGTTCATTTCCTGTACGACCCATGTCCCTTGTGAAACCCTTTGCCATGAAACCAAATGGGGTTTCTTCTTTTACTTCTCATGCCAATGTTCCCAGACCTCCAGCCCTTTTGGAGAATCCACCAGACAAGGCTTCAAGCTCCACTCGATTGAATATTCTGAGAAAAAAATTGCAGGATCTTGACATTGACATCGAAGCTTGTGTTCCCGGGCAGTTTTACAGTTTGCTTTGTCCAATGTGCAAAGGTGGTGATTCAGAGGAACGATCCTTCTCCCTAAATATCTCAGAAGATGGGGGGGCTGCTGTTTGGAATTGTTTTCGTGGAAAATGTGGTTGGAAAGGCCATACTCTGGCCTTTGCTGATGGTCGGTCATCATATAAACATTTAGGACAAGTTGCACTTAAGCAGAACATACGGAAAATTACAGTGGAGAGTCTACAACTTGAACCACTGTGCGATCAGCTGGTTGATTATTTCGCGGAGCGATTGATATCCAAGCAAACATTGTTAAGAAATTCAGTTATGCAGAAAAGATCCGATAATCAGATTGCTGTGGCATTTACGTATTATCGAGGTGGAGCGCTAATTAGTTGCAAGTATCGTGATGCCAACAAAAAGTTCTGGCAGGAGCCCAATACTGAGAGAATATTTTATGGAATCGATGACATAGATGGCGCAAGTGATATCATCATAGTTGAAGGGGAGATGGACAAGCTCTCAATGGCAGAAGCTGGTATCCATAATTGTGTGAGTGTTCCTGATGGTGCACCAGCATCAGTTTCCGAAAAGGACGTACCTCCTGCAGACAAGGATAAGAAGTTTCAGTTTCTATGGAACTGCAAAGACTACTTGAATAAGGCCTCACGCATTATACTTGCTACTGATGGGGATACTCCTGGTCAAGCTTTAGCAGAGGAAATTGCACGCCGTGTTGGGAGGGAAAGATGTTGGAGGGTCAAATGGCCAAAAAAGAATGAGGTCGATCATTTCAAAGATGCAAACGAGGTTTTGATGTACTTGGGCCCTGAGGCCCTGAAGGAAGTTGTTGACAACGCAGAGTTGTATCCTATAAGTGGATTATTTCGCTTCAAAGATTACTTCCACGAGATTGATGCATATTATCACAAAAAATTTGGAAATGAGTTTGGTGTGCCGACTGGATGGAGGTGTCTCAATGATTTGTACAATGTGAGTTCAAACTAG MRFLHNNHCLYTPFSKLSSFSSPSCLMGSFPLCKSTSLVFLSHLSSSSSSSSQKYFLYRSISLLHGSFPVRPMSLVKPFAMKPNGVSSFTSHANVPRPPALLENPPDKASSSTRLNILRKKLQDLDIDIEACVPGQFYSLLCPMCKGGDSEERSFSLNISEDGGAAVWNCFRGKCGWKGHTLAFADGRSSYKHLGQVALKQNIRKITVESLQLEPLCDQLVDYFAERLISKQTLLRNSVMQKRSDNQIAVAFTYYRGGALISCKYRDANKKFWQEPNTERIFYGIDDIDGASDIIIVEGEMDKLSMAEAGIHNCVSVPDGAPASVSEKDVPPADKDKKFQFLWNCKDYLNKASRIILATDGDTPGQALAEEIARRVGRERCWRVKWPKKNEVDHFKDANEVLMYLGPEALKEVVDNAELYPISGLFRFKDYFHEIDAYYHKKFGNEFGVPTGWRCLNDLYNVSSN*
BLAST of Cucsa.167370 vs. Swiss-Prot
Match: TWIH_ARATH (Twinkle homolog protein, chloroplastic/mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana GN=At1g30680 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 466.8 bits (1200), Expect = 2.7e-130 Identity = 252/454 (55.51%), Postives = 314/454 (69.16%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.167370 vs. Swiss-Prot
Match: PRIH_ARATH (Primase homolog protein OS=Arabidopsis thaliana GN=At1g30660 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 359.0 bits (920), Expect = 7.9e-98 Identity = 181/311 (58.20%), Postives = 227/311 (72.99%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.167370 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LYM8_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_1G541890 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 945.3 bits (2442), Expect = 2.9e-272 Identity = 458/462 (99.13%), Postives = 460/462 (99.57%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.167370 vs. TrEMBL
Match: W9RPH9_9ROSA (Uncharacterized protein OS=Morus notabilis GN=L484_026953 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 549.3 bits (1414), Expect = 4.6e-153 Identity = 274/437 (62.70%), Postives = 334/437 (76.43%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.167370 vs. TrEMBL
Match: A0A059CFW7_EUCGR (Uncharacterized protein OS=Eucalyptus grandis GN=EUGRSUZ_D01628 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 535.0 bits (1377), Expect = 8.9e-149 Identity = 265/420 (63.10%), Postives = 321/420 (76.43%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.167370 vs. TrEMBL
Match: A0A059CGG0_EUCGR (Uncharacterized protein OS=Eucalyptus grandis GN=EUGRSUZ_D01628 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 535.0 bits (1377), Expect = 8.9e-149 Identity = 265/420 (63.10%), Postives = 321/420 (76.43%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.167370 vs. TrEMBL
Match: A0A061G8E8_THECC (Toprim domain-containing protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_027034 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 530.0 bits (1364), Expect = 2.9e-147 Identity = 271/448 (60.49%), Postives = 329/448 (73.44%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.167370 vs. TAIR10
Match: AT1G30680.1 (AT1G30680.1 toprim domain-containing protein) HSP 1 Score: 466.8 bits (1200), Expect = 1.5e-131 Identity = 252/454 (55.51%), Postives = 314/454 (69.16%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.167370 vs. TAIR10
Match: AT1G30660.1 (AT1G30660.1 nucleic acid binding;nucleic acid binding) HSP 1 Score: 359.0 bits (920), Expect = 4.4e-99 Identity = 181/311 (58.20%), Postives = 227/311 (72.99%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.167370 vs. NCBI nr
Match: gi|778662016|ref|XP_011659233.1| (PREDICTED: twinkle homolog protein, chloroplastic/mitochondrial [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 945.3 bits (2442), Expect = 4.1e-272 Identity = 458/462 (99.13%), Postives = 460/462 (99.57%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.167370 vs. NCBI nr
Match: gi|778662022|ref|XP_011659237.1| (PREDICTED: twinkle homolog protein, chloroplastic/mitochondrial-like isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 872.5 bits (2253), Expect = 3.4e-250 Identity = 425/462 (91.99%), Postives = 443/462 (95.89%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.167370 vs. NCBI nr
Match: gi|778662024|ref|XP_011659240.1| (PREDICTED: twinkle homolog protein, chloroplastic/mitochondrial-like isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 872.5 bits (2253), Expect = 3.4e-250 Identity = 425/462 (91.99%), Postives = 443/462 (95.89%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.167370 vs. NCBI nr
Match: gi|659068706|ref|XP_008445781.1| (PREDICTED: twinkle homolog protein, chloroplastic/mitochondrial isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 839.7 bits (2168), Expect = 2.4e-240 Identity = 414/474 (87.34%), Postives = 434/474 (91.56%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.167370 vs. NCBI nr
Match: gi|659068709|ref|XP_008445786.1| (PREDICTED: twinkle homolog protein, chloroplastic/mitochondrial isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 839.7 bits (2168), Expect = 2.4e-240 Identity = 414/474 (87.34%), Postives = 434/474 (91.56%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber (Gy14)
Date Performed: 2017-01-17
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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