Cucsa.108610 (gene) Cucumber (Gy14) v1
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TCTCTGCTGGGCGGACTATTTACAACTCTTGGTCATAGGGTTGGTTCTTTCCTTCACAACTTCCCTCTTCTTCTTCCTTCAGATAAACAAGAATAAACCCGTATGTTGGCTCCTCCTATACGTTTCTCTCTGTTTCTTTTCATTTACATTCCTTTCTTTTTCTCTCTGTTGTTGATGTTTTATTCCCCTGATGACAGCAATCGCCGCACCGAACGTTCTTCCAGCTATGGCTGACGAAAATCACATTGAAGTTCCTGTTCCTGATGATGGGGCTCCTGAAACCAGTAATGGGCATGAACAGGATTCTGTCGAACTTGCTCCGGCGTCACAAAAGGGTGAAGATGATGTTAAAGGTGAATGTTTTGTTTCCAATTTGGGGTTCTTGTTTGATTCTGATTGTTGAATGAATAGAGAATCACGCTACACGTATTTTTTTTTTTTTATCGTTCTTAATAGTTATAGCGGAAGTTTTCAATGAAAAGATTAATCGTTTGGATAGGTTAGCTTTAGATTAGTTTCAATTACCTGTGAATGAAAATGGGGTTTTAAGGAGAATATTGAAATTACGTTTCTAAAGAAAGATTAATCGATTGGCTAGCTTCAGACTAGTTTCAATTATCTGTGTATGCAGATAGGGTTTATGAAGAATATTGAAATTACATTTTCAAATGAATATTTATCTTTTGGATAGATTAGCTTCAGATTAGTTTCAATTACCTGTGTGTGCAAATGGGGCTTTAGGGAGAGTATTGAAATTACGCAGTTGTATCTGTGTTTCTTGATTAAAGCTTGCTTAGTTTTAACTTTTAATCATGGGTCGATCTTTTAAGTTGGATGCAATTGGCATTTATGATTTATTGATCCTTTTGGTGCTTTCACTTTGAAGGTCTTTTATCCAGTTTCATTTATCACTGTCTGTGTTTCTATTTTTTTCTTCTGAACTTTGGAAGCTGAAAATTTCTAAGAAAAATTCGTTATTTCCTTTTGTTGATTTTAGGGAAGATAAACACCATAAAGATTACTTTGAGAGAGATGTCTTTTGTCCTTGGCGTTGTCTTTTCTAAGTGTACTTTGGAATATATAAATCATCTTTCTAGCTTTGTCGTTTTGCTAATGGGTATCAAGGTTTGTGGTGTTACTTCTTGCATGCTTCTGATATTTAATTGTGTGGTGATGATATATGTTATAGCAGTAGTTCTCTCTTTTGGGGTTAGCACGGTGTGTGTTGAATGATTGTCTATCTGTTTGCTTTCTTATTCCCCTCACTGTGTTGTGGAATATTTGGTTGGAATTGGCAAGATAGATTTATTGGGTATTGATGGGTTGAAGGAGGATGTTTGGAGTTGGAGTTTTAGTAATTGCTATTTGTACTGATCGTCTTTAATTGATCACCAAATGCTGCACTGCTTTTTGTTAATTTTCTTGGTTGGCTTATTTATTTATTAAGTTTTATTATATTTGGTGGTTCTCTTACGTACTTCCATTTATCATAATGAAAATTGGTTTGATTGTAAGAAGAAAAAGCTGAGACTCTTCTTCTCTTCTGCATGTAATATTTTTTCATAGTTAATAGTTTTCTTATTGCAAGTATTAAATAGTAAATTTTACTTAATACCCTGTAGATTGATTACTATAATAGATATGAATCCTATCAGGTTGAATTGTTGAGATTTCTACTTCCATTTTGTTAATGGTTTTATTGATGCTTGTACCAAACTGATATTTCTCCCTTATGTTGCAGAAGGGACAAAGAAAAAGAAGAAGAAAAATAAAAGCAAGTGAGAATCATTATTTTTAAATCAACTGCTTCTTTTGTGTGCGTGGATTCCCCTAGGTCTTGGAATTGACAGAGGATTGCAAGGCTATCTTATGGTTTGATAACTTTCTTTCATTAATAGGAAAAAGAAAGAGGCCCCTCAACAGACGGATCCACCAACTATTCCCATCACTGATCTTTTCCCATCTGGGGATTTTCCGGAGGGTGAAATTCAACAGTACAAGGATGAGTGAGTATTGAACTTGATTCCAATTCTAAATGCTAATAGTTTTCTTGCCAAGTATTATTGATCAAAGCATATATTGTTTTTGGATTGGACTGAAAAATCAAGAGTGACATTTTGAACAGGTATAGATACACTTGTTACTTATAGGTCTTCTTTCAAATTGAATAGAAAATATAGCAGGGCTCACCAGAAAAAGAAACAAAAAGCTTCTCGTATGTGTTTGTTTGTCAAGTATATTTTACATTTGTTGTGTAATTAAATGAAAATGTAGGGTCCCCATCTATTTAGTATTGACTCTCTTTGTTTAGAATTCTAGTTTTCGTGGGTGAAACCTTGGGGAGTTCAATGAGATTTTTCATGTGGAAATAAATTGAGGTGCGTGGGGGATCTCACTTGATTAGGTTGTGGTGGGAGGTTGTTTCGAAGCTGGTGGAGGTTGGAAGTTTAGACACTAGTGGCCTGAGATGACGAAACAAAACCTTATTGGCAAAACAGTTGTGGAAATCCTCCAGAGAATCAAATGGTTTGTGGCATTGGAATATTCCGTATGACTACGTTTTTTATGGACTTCTAATGATGGTTGAAAGGCTCTACAATCAATCTATGGACTGCTATTGTGTTGGGCCTTTTTTCCCATAGTTTGTGAAGTGCTCAGTTGGCCGTTGGGGACTCGGGGATGGGTCTATTCTTATTTTTGGTAGATTGGTGGGTGGGCACTAAACTTGTCTATGAGTTATTATTGTAGTTCTATCATTTTTCTGAGAAGAGATTACATGAGCCTTCCCCCTTGCTTTGTTTTGGTTTACACACTAATTGTGTTTTTGGAGGTGGTGAGGCTTCTTTCTATAATTCCAATAAGAGGCTGCTGGGTTTAAGTAGAAGGGGTTTCGGTTTTGGAAGCCTAATTCTTTGGAGGGTTTCTCTTATTGCCTGTTCTTTCTTATCCTTTATTCCCTTTCTCTCAGTCTGGGGTCTCAGTTTTTTCCTCTATGTGGTACGTTAACGTCTCCAAGTGAGGGAAATTGTTTGGTCTGCAAGTCTTACATGAGAGGATGAGTGCAGCACCCATGATTATATCCAATGATATTCTTCCTCGGTTTTGCAATTGCAATTGTGTGTTCTTTGTACAATGCAGGAGGCTCTAGATCATCTTAGGTGGGGTGGGCTGCTTGTTAGTCTACTCCATTCCGAGTCGGTGCTTTAGTTTGTTTAGGTGGGGTGGGCTGCTCGTTAGTCTACTCCATTCCGAGTCGGTGCTTTAGTTTGTTTAACGTAGTTGTAGTGTGTAGCATAATTAGGATAGTCGATCTTTGATTGAGGAGATTGTGATGAACTCTCCTTTGGAGGGTGAAGGGAGATCTTTTTGTGTGGCATGCCTGTAATTTTGCTACCTTGTGTGGCTTGAGAGATAGTTGGAATTTTAGAAAGATGGAGGAGTCTTTGGTGGAGGTGTGTGAGGTGATGAGATTTAATGCATCCATGAGTGTCTGTTAATGAGATTTTTTGTAATTATCTGCTTGGTTGAGTTCTTTAAAATTGAAGTTCTTTTTGTTGTTGAAGACTCCTTATGCTTTTTTTTCTTGTTGTATACTTTTCAAAAAACAAATCCCCCTTGTGTACTTTATTGAGTCAAAAGCAAGAAATTGACTTACAATTCAATAGGGGTTTGGTTGTCCAGCCATTCATTACAGTATATGGAGATCTCTAAAGCTTCTCCATTATGCCATGGTACAAAAGTTAACACTGGGCTATTCATCAAAACCTTGTTGTGTCTGAAAACTTAAAGCTAACTTCTAGCTATGAGGATTCTTTGTCAAATTTTTTTATAACTGACTCTATTTTTGTGGTTTCTACCTCAGTAACCTGTGGAGGACTACATCTGAAGAGAAGAGGGAGTTGGAGCGCCTTGAAAAGCCAATGTACAATTCCATTCGACGAGCAGCTGAAGTTCATCGTCAAGTAATGTAACTTGATCATATTAATGTTTACACTGGGAGGATCTGCCATGGTTTGCAACTACTTAACCTTTTTTGTCCCTCTTATTGCTATTAGGTAAGAAAATACATAAGAAGCATAGTGAAGCCAGGGATGTTAATGACTGACCTGTGTGAGACATTAGAAAACACAGTTAGAAAGCTAATATCGGAGAATGGTTTGCAAGCAGGCATAGCATTTCCGACTGGATGTTCTTTGAACTGGTAATAATATAGACATGGGATCAATTGCATATTTCTTTTTTTTTTGGAGGATTTATTGATGATTTAGGATTCTTTTCTTTCAGGGTTGCTGCCCATTGGACCCCTAACACTGGAGATACGACTGTGCTTCAGTATGATGATGTAATGAAATTAGATTTTGGAACACATATTGATGGTAAATTTTGTTGTTTCAGTGACTTTGCTGTGAAGTTGTTATTGTATCTTGTGGATGATTTCATATTCGAGGAGTCATTGAAACTGGTTTATTGGTGACTGCAGGATGCATAGTTGATTGTGCATTTACAGTTGCATTCAATCCTATGTTTGATCCACTACTCGAAGCCTCACGTGAAGCAACTAACACTGGCATTAAGGTAACAGTGGTTTTTAGGTCTGCTGGCGGTCACTACAATATTTTTATTACTCAGCTTTGATGAAGTATATTTTCTATGGAATAGTTTTAGACATTTTGATGACCTATTTTTGTGTACAAGATTGTCATCTAATTATTTGTAGTAGATGCAATTAGTATTTTAGAATTTTCTTCCAATTTTTTTTTATAGTAAATGCAACTCCATAGCAGTTATGTTTTTTTATTAATTTCTAAATGGGGAAAATGGCGTGTAAATGTTGTCTTCTTGACGAGGTGAGAATCTTAAAATGATACTGAATGCATATAGAAAAGTGCAAATAACTGAAGTGCTAGCTTCATAGTACACAGATAGATATAAATAAATTACGAAAAACATCACCTTCCTCTGAATGTAGGATTTGTCAAATTTTTATATTTATA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ATGGGGTTGGGTTCCCTTGCTTCCAGAGTTGTCAAGCCTTCATCCAGGCTTCTCACCTCCCAAAACCCTAGAAATCTCCTCCATTTTCGACCCATTTTCTCCACTACTGAGCTTCACAACGCTGATGCCTCCGCTGCCGCCCAGCCCCAGGCCGATCCTGCTCCGCCTCCTCCTCCTCCTCGCACCCCTCTTGCCGGCGCTCGTGTTCACTTTTCCTCTCCTGAGGATGCCATCGAGGTATTCGTTGATGGGTACCCTGTCAAAGTCCCCAAGGGTATGACGGTTCTTCAGGCTTGCGAGATCGCTGGGGTTGACATTCCTAGATTTTGTTATCATAGTCGCCTTTCTATTGCTGGGAATTGCCGTATGTGTCTTGTTGAAGTCGAGAAATCCCCCAAGCCTGTTGCTTCTTGCGCTATGCCCGCTCTTCCTGGAATGAAAATTAAGACTGATACCCCACTGGCAAAAAAGGCTCGAGAAGGAGTGATGGAGTTCTTGTTGATGAATCATCCATTGGATTGCCCAATTTGTGATCAGGGTGGAGAATGTGATCTTCAGGATCAGTCCATGGCATTTGGGTCTGATCGTGGGCGGTTTACTGATGTGAAGAGATCGGTAGTGGACAAGAACCTTGGTCCCCTTGTGAAAACTGTAATGACACGATGTATTCAGTGTACCAGGTGTGTAAGATTTGCTACAGAGGTTGCTGGGGTTCAAGATCTTGGCATGTTAGGTCGTGGTAGTGGGGAGGAAATTGGGACATATGTCGAAAAGCTAATGACTAGTGAGCTCTCAGGAAATGTCATTGATATTTGTCCAGTTGGGGCATTGACCTCAAAACCTTTTGCATTTAAAGCCAGGAATTGGGAATTGAAAGGCACCGAGACCATTGATGTTACAGATGCCGTTGGATCCAACATTCGAATTGATAGTCGTGGTCCGGAGGTTATGCGCATTGTGCCTCGGTTAAATGAGGATATTAATGAAGAGTGGATATCAGACAAGACTCGCTTTTGTTATGATGGCCTTAAGAGACAGAGATTAAATGATCCAATGATCCGTGGTGCTGATGGACGCTTTAAGGCTGTCAGCTGGCGTGATGCCCTTGCTCTGGTTGCTGAAGCTGCCCATCAGGTTAAACCTGAAGAAGTCGTTGGAATTGCTGGAAAACTATCTGATGCTGAGTCTATGATTGCTCTGAAAGATCTCTTAAATAGGTTGGGATCCAATAATGTATGGTGTGAAGGAAATGGACCACAACCTAATGCAGACCTGCGTTCTGGGTATATCATGAATACTGGTATTACTGGTCTTGAGAAAGCGGATGTCTTTCTTTTGATTGGCACTCAGCCAAGGGTTGAAGCGGCTATGATAAATGCAAGAATCCGAAAGACTGTAAGAGCAACTCAAGCTAAAGTTGGTTATGTTGGCCCACCTGCCGAATTGAACTATGATCATCAACACCTTGGAACAGGACCTCAAACACTTGTTGACATAGTTGAGGGTCGCCATCCATTCTGCTCGATCCTCAAAAATGCCAAAAATCCTGCCATTATTGTTGGTGCTGGACTTTTTGAAAGAAAGGACAAAGATGCAATCTTTTCTGTAGTTGAAAACATTGCCAAACAGAATAATGTGGTCAGACCTGACTGGAATGGTTACAACGTATTGCTTTTGAATGCTTCCCAGGCTGCAGCCCTTGACCTTGGACTCGTGCCAGAATCAGTAACTAGCATTGAGTCTGCAAAGTTCGTATATTTGATGGGAGCTGATGATGTGGAACTGGAGAAGGTTCCAAAGGATGCGTTTGTGGTTTATCAAGGACACCACGGGGACCGAGGAGTCTATCGTGCAAATGTCATTCTCCCTGCAGCAGCATTTAGCGAAAAGGAAGGAACCTACGAAAACACCGAAGGTTGCGCCCAACAAACACTGCCAGCAGTACCAACAGTTGGTGATGCACGAGATGATTGGAAGATCATTCGTGCTCTTTCTGAGGTAGCTGGTCTGCAGCTGCCATATGATTCGCTCGGGGCAATAAGGTCCCGGATAAAAACTGTAGCCCCAAATCTCTTGCAGGTGGATGAAAGAGAGGCAGCTACATTTTCTGCTTCAATTAAGCCTGAAAGCACCCAGAAGATGGACATGGCTGATTTTGGGAGTCCCATAGAAAACTTCTACATGACTGATTCCATTACAAGGGCTTCAAAGATTATGGCACAATGCAGTGCTTTACTATCTAAAAAGTGA MGLGSLASRVVKPSSRLLTSQNPRNLLHFRPIFSTTELHNADASAAAQPQADPAPPPPPPRTPLAGARVHFSSPEDAIEVFVDGYPVKVPKGMTVLQACEIAGVDIPRFCYHSRLSIAGNCRMCLVEVEKSPKPVASCAMPALPGMKIKTDTPLAKKAREGVMEFLLMNHPLDCPICDQGGECDLQDQSMAFGSDRGRFTDVKRSVVDKNLGPLVKTVMTRCIQCTRCVRFATEVAGVQDLGMLGRGSGEEIGTYVEKLMTSELSGNVIDICPVGALTSKPFAFKARNWELKGTETIDVTDAVGSNIRIDSRGPEVMRIVPRLNEDINEEWISDKTRFCYDGLKRQRLNDPMIRGADGRFKAVSWRDALALVAEAAHQVKPEEVVGIAGKLSDAESMIALKDLLNRLGSNNVWCEGNGPQPNADLRSGYIMNTGITGLEKADVFLLIGTQPRVEAAMINARIRKTVRATQAKVGYVGPPAELNYDHQHLGTGPQTLVDIVEGRHPFCSILKNAKNPAIIVGAGLFERKDKDAIFSVVENIAKQNNVVRPDWNGYNVLLLNASQAAALDLGLVPESVTSIESAKFVYLMGADDVELEKVPKDAFVVYQGHHGDRGVYRANVILPAAAFSEKEGTYENTEGCAQQTLPAVPTVGDARDDWKIIRALSEVAGLQLPYDSLGAIRSRIKTVAPNLLQVDEREAATFSASIKPESTQKMDMADFGSPIENFYMTDSITRASKIMAQCSALLSKK*
BLAST of Cucsa.108610 vs. Swiss-Prot
Match: NDUS1_SOLTU (NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial OS=Solanum tuberosum PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1254.6 bits (3245), Expect = 0.0e+00 Identity = 623/748 (83.29%), Postives = 676/748 (90.37%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. Swiss-Prot
Match: NDUS1_ARATH (NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana GN=EMB1467 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 1204.1 bits (3114), Expect = 0.0e+00 Identity = 591/749 (78.91%), Postives = 663/749 (88.52%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. Swiss-Prot
Match: NDUS1_MOUSE (NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial OS=Mus musculus GN=Ndufs1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 758.4 bits (1957), Expect = 7.2e-218 Identity = 394/696 (56.61%), Postives = 493/696 (70.83%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. Swiss-Prot
Match: NDUS1_BOVIN (NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial OS=Bos taurus GN=NDUFS1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 758.4 bits (1957), Expect = 7.2e-218 Identity = 394/690 (57.10%), Postives = 493/690 (71.45%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. Swiss-Prot
Match: NDUS1_HUMAN (NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial OS=Homo sapiens GN=NDUFS1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 757.3 bits (1954), Expect = 1.6e-217 Identity = 391/697 (56.10%), Postives = 495/697 (71.02%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L910_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G189850 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1498.8 bits (3879), Expect = 0.0e+00 Identity = 749/749 (100.00%), Postives = 749/749 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. TrEMBL
Match: M5WWP9_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa001643mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1291.9 bits (3342), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/751 (85.09%), Postives = 689/751 (91.74%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. TrEMBL
Match: B9T118_RICCO (NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative OS=Ricinus communis GN=RCOM_0458390 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1289.2 bits (3335), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/750 (85.20%), Postives = 686/750 (91.47%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. TrEMBL
Match: A0A067JPL6_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_22539 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1285.0 bits (3324), Expect = 0.0e+00 Identity = 634/749 (84.65%), Postives = 687/749 (91.72%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. TrEMBL
Match: F6HSN0_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_14s0006g02020 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1281.9 bits (3316), Expect = 0.0e+00 Identity = 637/754 (84.48%), Postives = 686/754 (90.98%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. TAIR10
Match: AT5G37510.2 (AT5G37510.2 NADH-ubiquinone dehydrogenase, mitochondrial, putative) HSP 1 Score: 1204.1 bits (3114), Expect = 0.0e+00 Identity = 591/749 (78.91%), Postives = 663/749 (88.52%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. NCBI nr
Match: gi|449445941|ref|XP_004140730.1| (PREDICTED: NADH dehydrogenase [ubiquinone]) HSP 1 Score: 1498.8 bits (3879), Expect = 0.0e+00 Identity = 749/749 (100.00%), Postives = 749/749 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. NCBI nr
Match: gi|659114577|ref|XP_008457124.1| (PREDICTED: NADH dehydrogenase [ubiquinone]) HSP 1 Score: 1473.4 bits (3813), Expect = 0.0e+00 Identity = 734/749 (98.00%), Postives = 741/749 (98.93%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. NCBI nr
Match: gi|657978842|ref|XP_008381363.1| (PREDICTED: NADH dehydrogenase [ubiquinone]) HSP 1 Score: 1304.7 bits (3375), Expect = 0.0e+00 Identity = 650/752 (86.44%), Postives = 693/752 (92.15%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. NCBI nr
Match: gi|694388790|ref|XP_009370067.1| (PREDICTED: NADH dehydrogenase [ubiquinone]) HSP 1 Score: 1301.6 bits (3367), Expect = 0.0e+00 Identity = 648/752 (86.17%), Postives = 693/752 (92.15%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.108610 vs. NCBI nr
Match: gi|694389863|ref|XP_009370539.1| (PREDICTED: NADH dehydrogenase [ubiquinone]) HSP 1 Score: 1297.0 bits (3355), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/752 (85.77%), Postives = 691/752 (91.89%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber (Gy14)
Date Performed: 2017-01-17
The following gene(s) are orthologous to this gene: The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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