CsaV3_6G006970 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTTCTATCCATCATGAAGTGACATCGTTCTATTATTATATATTGGTCTTCATTAATGTAACGAAGATTTATTGAAGCCTTTAAATATCTAAGCTCTATGCTTGGTTTTGGGTGTGTGACTGCAAATTTGATTTCAAAGAAACTCGAAAAAGTTTTGTTCTAGAAGGTATTTTAATTACCTTCTTTATTATGATGTATCACTCAAGATCTACAAGTGGTTTTTACTTCGTACTAGATAAGAAATATATTGAAGACTTAAATAGTTGAATGGCAGTGGATTTAGAAATATATTGAAGACTTAAATAGTTGAACTGCAATAAAAAAAATTAGAAAGGGCCATAGTTGAACTGCGGTCAATAAAATTCAGAAAGGGCCATAGTTGAACTTCTTTATTATGATGTATCACTGAAGATCTACAAGTGGTTTTTACTTCGTACTAGATAAGAAATATATTGAAGACTTAAATAGTTGAACGGCAGTGGATTTAGAAATATATTGAAGACTTAAATAGTTGAACAACAGTGGATTTAGAAATATATTGAAGACTTAAATAGTTGAACTGCAATCAAAAAATTCAGAAAGGGCCATAGTTGAACTGCGGTCAATAAAATTCAGAAAGGGCCATAGTTGAACTTCTTTATTATGATGTATCACTGAAGATCTACAAGTGGTTTTTACTTCGTACTAGATAAGAAATATATTGAAGACTTAAATAGTTGAACGGCAGTGGATTTAGAAATATATTGAAGACTTAAATAGTTGAACAACAGTGGATTTAGAAATATATTGAAGACTTAAATAGTTGAACTGCAATCAAAAAATTCAGAAAGGGCCATAGTTGAACTGCGGTCAATAAAATTCAGAAAGGGCCATAGTTGAACTTCTTTATTATGATGTATCACTGAAGATCTACAAGTGGTTTTTACTTCGTACTAGATAAGAAATATATTGAAGACTTAAATAGTTGAACGGCAGTGGATTTAGAAATATATTGAAGACTTAAATAGTTGAACAACAGTGGATTTAGAAATATATTGAAGACTTAAATAGTTGAACTGCAATCAAAAAATTCAGAAAGAGCCATAGTTGAACCGCGGTCAATAAATTTAGAAAGAGTGTGAGTTTATCTTCGATAAGATTCAAACACAAAATCATAGGAGTCTGTCTTTATTTAAGTTTTGATTATAACTTAAAAGAGCTCCTTGACCCAATTGCGATAACAATTTTTTTCTATTTCTTTAGCTATTCTAACGGTTAATAATTACTTTAGCTATAGCTAGAGGATATTATTGATTATCTCACTTATTTCATAATCCAAATTTTTATCTTCATTCATAATTGATAGCTGTTATTTGATGTGTTGTTACTTCATAAGGTAATTATTTCACTATACAGATGGATGTCATCGATCGATCGAAAATGTTAAGTAAATTTCAACGAATTTAAACAATAAGATCTTGACTAAGTGCGAAGGTGATTGGATAGTAAGCGAGCGGTGGAAAAATGAGATTTTTTATTTGGGAAATTGTATTAGATGAAATTTTTTTTAAGAAAAAAGTAGCTCATAATACATTTTATTTTGCATATTGCAATTTTGGCAAATATCACAGTAATCTGGTGGTAATGCTTTTAAATTTGTTATTTTTGCAATTTTAAAAATGTAATTGACATGAGCTGTATTATCATAATTTGTTTTGCTATTTTTGCAAACTCTCTTTCAGAGAAGAGGAAATCAATAAAGACAAAGATGCTTCACTCCATAAAATACTTTATTAAAATTTTCAATATATTTTGTAAATAATTTGATCCATTTTTCTACTCTACTTTAAAAAAATCTAACAAAATATTTATACTAAATTAATTAAAAAGGATGAAATGGACAAACTTACTTGGAAAAAAATAGAATAAAATACAAGAGACAAATGTTTGGTTTCATTCTACCACACACAAATTAAAATTTAATTAGTTTAAAACACAATTTAATTTAGACTTTAAATTTTATTATGCAACAATTTGTCCTTTCACATTTGTAGTAACTAACAATTTAATTCCACCATAAAATTCATTTCTTATTTATTATTTACTAATATAAACTTTGTAGGCTTTTTTGTAGGGAGCACTTGCAACCATCAAAAAAATAAGTTATAATAATTAAGTCCATAAAACACACGTTTTATTATTTGCAAAAATGGCATAACAAAGCCCAGTCCACACAGCAAAGAATAAAATGTCATAAATGCCCTCGTTATTAATATATGTTGGATACATTTTACACACGTATGATACTCCTTGATACACATGATATTTTTTGATACATTTGATTGATAACGTAGCCACCTATTTTATCCTACACATATATATCTTTTTTTTAAATATTTATATTAGTAATAATTGCTAAATTATTTATTTATTTATTTACTTAAAAAAAAGTAAAAGAATTAATAATAACATAATATCTTATAATATTTCATTTTTATCATTTTAGGAAACAAAATTAAATCAATTTATTTTTTAAAAATCTTTTAATATCATATTTGTACTATTTTAGGAAAAAAGAAAGAATTTGTTTTAAATAAAATCTTATAATATCAATTTTCACTTACTTAAATCATTTTAGAAAAAAAGAAAATCAATTTTAAATAAAAGTATTTTAATATTCATTTGATGTATTAATTTATTTTTCACAAAATCTCAAAATATCTCATTTAATTTATTTTAGAAAAATGAAAATTTGTTTTATTAATATAATATCAAATTTTGATTTTATTCTTATTACTTTTTTCTAATTTGTGGTACACTCTCGGTTTATAAATACGGACCCTGTCATTTGAAAAAAATGAGAAGAGTTTTTTTGAAACAAACAATTCTTTGGATAAAAAATTTCTTACAAAATGTCTTTAGAGAAAATTGTCAGAGAAAATTTTGTTAAAGAATCTCCGCAAATTGGAAGAGAAAAAAATTTATGCAAAGGTAAGTATTTTTATTTTTTATTTATTTGTTTATTCTTGGTTTCTTTTACTTTCATTGTTATTAATTCTTAAAAAAAAACCTTAGTCTTTTCTTCTCCCTAAAAAATAGAGAAAAAAAAAAAGACATAAAGACTCTTTTTTTTAATCTTTACTTTATTCTCTTTAAAAACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTTCATTTACTTATTATTATTAATATAATTTTATTTGTTATTAACATTTTTTTATTACTGTTTTTTTTTAAAATTTCTAAACTTTATTACTGTTTATTTTAACTTTTTTTTTTAACTTTATTATCATAACTATGGCTTTCTATATATTTAAAACTTATTATTATTGATTTATTTATATAATTATTTATTTGTTATAATAATAATAATTATTATTATGGGTCTTGCGGCCACACTTCTTTTTTTAGAAAAAATGTTTTTCTCTCTCCTAATTCTTCTTCCTTTTATTTCTTTTGTTTCCTTATTTCTTCTTTCCTTTTTCATTATTTATTTATGTATTTCATTTATTTATTTCTTCTTTATTTTTATTTATCTATTCATTTTCGTTATCTGTCGTTTCTATTTTCTTTTTATTTATTTTAAATTATTTTTATTGCATGCATAACAATTATTGTTATGTAGTTTTAAACTTATCAATATTTTTTTGCACTTTTGAATGTTTTCATGATATTTTATATCAATTATTTTTTTCTTCTTATATCATATTTATCTTTACATTTTATCCTTCTAAAAAAAATCTGACGATGGAATTAGAAATTCTGGGAGTTAGTTATTTTTAAATTCTTGAGGTGAGGGAATCGGTTCTTTGGGAGTCCAAGATCGATTCCCAATATTTAAAAAATAAAATAAAATCTTATCTTACTTGCTTAATTTAGGATATATTATCTTTGATTACATTGTGCATTATTTCCTATTGACTTAATTTTGAAGATCTTTCTTAAATTTCCTTTTTAAACTGTTTAGAAATTTTTACTTTACAACTATTTCTTCTATTTTTTTTTTAAAAAAAGTTTAAAATATAAATCTATATTTCATATGTTTTCCTTAATCAACTTTTTAATAACTCACTTCTATTTCGCTAAAAATATTCTTACGATGAAATTTAGGAAATTTGGGAGTCCGATTTCCTAGAATTCTTAAGGTGAGGGATCACATCTTTGGAAGTCCGAGATTTGATCCCAAGAAAAAATGAATTTAATTCATGTTTTAAAAAAAATCTTTATTCAAAGACTAGCTTATGATAGATTTTGGAAAATTGTAATAATTTCTCATTTTCTTAAGGTGAGACTTTTCTTCAATATATAGTCTAATTAATTGAATATAATTCCACTTATTTTATGAGATCATTGCTTCAAATATTGGAGTAATGAGGGATGAAATAAAACATCAGTTTTAAAATAAATTTAAAAATATTTTCAATTCAAGATTTTAAATTTCGCCATCGTTTTTCAATTCAAACTAATACCTTTCCCACACACAAATGACTCCCGAACTCAATTATATTTTTCACATACCATTTTTTAAAAACTGTTTATTTTATTTCGGTGTCCAATCACACCGTAAAAAAGGTTGGTGGCGACTCCTATTTTATTTTAAAACTAGCTGTTTTGAGGATGTCGGCCGCTCCGCGTCGTCTTGGGCACGTGGCGACAGATACACTTGATGCGTCTAATACTTTTTGATGCACCTAATACCTTTTGATACACACATGAAACATCTTGATACACATTATAATACTCCTCGTTACACACTTGATCCTTCTTGATACACCTTAGGCCTTGATAGTTTAATACACTTAAAGACTTCACTTATGTGGGAATAGCGCTTACTAAAACAGTTATCTCTTTGTAAAAGACATATAGTCAAATCTGCAAGTTTTAACTTCTTGTCTAACTAGAGTTCAACTAAGGGTCATAGGGTAGTCTATAAATACTATGTATCTCTTTGATATTTCATACACACAACAACAACAA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Match: XP_004140683.2 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101212952 [Cucumis sativus] >KGN46330.1 hypothetical protein Csa_6G085120 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 898.3 bits (2320), Expect = 1.4e-257 Identity = 537/537 (100.00%), Postives = 537/537 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_6G006970 vs. NCBI nr
Match: XP_008460195.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499080 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 870.9 bits (2249), Expect = 2.4e-249 Identity = 491/537 (91.43%), Postives = 499/537 (92.92%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_6G006970 vs. NCBI nr
Match: KGN46327.1 (hypothetical protein Csa_6G085100 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 753.4 bits (1944), Expect = 5.5e-214 Identity = 371/465 (79.78%), Postives = 393/465 (84.52%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_6G006970 vs. NCBI nr
Match: XP_022991799.1 (uncharacterized protein LOC111488338 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 713.0 bits (1839), Expect = 8.3e-202 Identity = 347/464 (74.78%), Postives = 384/464 (82.76%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_6G006970 vs. NCBI nr
Match: XP_022953933.1 (uncharacterized protein LOC111456341 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 709.1 bits (1829), Expect = 1.2e-200 Identity = 387/463 (83.59%), Postives = 422/463 (91.14%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_6G006970 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0K983|A0A0A0K983_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G085120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 898.3 bits (2320), Expect = 9.2e-258 Identity = 537/537 (100.00%), Postives = 537/537 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_6G006970 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3CBI1|A0A1S3CBI1_CUCME (uncharacterized protein LOC103499080 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 870.9 bits (2249), Expect = 1.6e-249 Identity = 491/537 (91.43%), Postives = 499/537 (92.92%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_6G006970 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0KD65|A0A0A0KD65_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G085100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 753.4 bits (1944), Expect = 3.7e-214 Identity = 371/465 (79.78%), Postives = 393/465 (84.52%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_6G006970 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0KA25|A0A0A0KA25_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G086140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 635.6 bits (1638), Expect = 1.1e-178 Identity = 330/467 (70.66%), Postives = 352/467 (75.37%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_6G006970 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2R6R6R8|A0A2R6R6R8_ACTCH (Natterin-3 like OS=Actinidia chinensis var. chinensis OX=1590841 GN=CEY00_Acc10740 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 389.8 bits (1000), Expect = 1.1e-104 Identity = 193/463 (41.68%), Postives = 276/463 (59.61%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber chineselong genome (v3)
Date Performed: 2019-03-04
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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