CsaV3_5G025400 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

NameCsaV3_5G025400
Typegene
OrganismCucumis sativus (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr5 : 20480036 .. 20487590 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonpolypeptideCDS
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ATATGATGAAGCATTTTGCTAGCTTACAATGTGTTTGATGAAATGCCTCAATGAAGCATTTAGTTGATTTTTAACTTATTTTTGTTCGTTCGAATTAGGAAATCAAGGCCAAGGGAGATTTCATGGCTATGGGCTGAAGCTTTGAGAAAAAAAGAATGAAAAATGAAATGTGAGATTTTAAACTTTGATGGTGTATAGGGTTTTTTTGTTTGTCTATGCATTTTTCAAGTGAATTTGAGTACTTTTGACTTTTCTATTGATCTTTTGTTTATGGTTGCTATTGAGTTGTATCGTAATTGCATGATATTTGTGAGGTAAGACATTTTCTATTAAACCTAAATGTATCACCCTAATTTTGAAACTCATAACAAAGTTACCCCCATCTCGAAGGAACTTTACCCCGAGTTTACAACTTGGGGGTGATCTCAAAACAACCAATGTCAATATCTTCTTTAAAGATCCTTCCAATACTTTCACCAAGAACAACATAATAATCAACAATCAAATTGTCATCAATTGAAGAGCATGAAGTTGAAATTGGGTTTTAAAGTGGAGTTGAGTGTGGGGTTGGACTTGAAATTGGGCTTACAATTGGAGTTGGTACTTATACTTGGACTTTGTGAACCTTTATTTGTTGAAGGTGATGAAGTCATTGATTTTTTAAGCTTAGCAAATTATCAGACAAAATGAAACAACAATAATAGTGATATACAGAACTTAATAATAGAAAAGTCAATGAGCTCATGCCTTGAGAAAATGAGTTGAATGTATTTCACTCTCCAAAGTTCTTGTATTTGTCTTAGATATGTATGTGTCTATTATTTATTAGCTTACCAAAATGTTCTTCACTCTCCAAAGTTCTTGTATTTGTCTCAGATATGTATGTGTCTATTGTTTATTAGCTTACCAAAATGTTCTTCAATACATATCTAATGTCCAACTCACAAAGACTTGGTGACAATAAAATGTTCATCTTCTTTTTGCATAACTATTGAGGCATAAGTCTAACCAATTTGTTTAATATCATTTGACAGTACAAAAGTTTATGGAGCCCTTGTTTAGATAGGTTTCTTTTTACTATTTAATATATTGAAATGTCCCTTGTTTATCTTTTTTATAAATATCTATTTTATAAGAAGCATAAAATGGAAAATTTAAGTTAGTTTGCATATTATTCGATCCTAGATATATATAGAAGAAAAAAACTTTGAGGTGAGGAAACTAGTATTTGGAATATATTTATGTATGAGATTTGCACTTTATATTTTCATCCTAAAGTGTACATACTGAAAATGACTTGAAGTTGTGATAAATTTTGTAATAGTACCATCTTACTATGCACGAATGATAAATTTTGAGCAAGAGCCATTGTTGTAACAAACAGGTTTTTAAGCATATAACATTTCTATTTATAAGCAGTATATCATGTAAATTTTCTCAAATCTCCATCAATGACTGCATATCTCTTTCTATACGACCCTTTTTGTAGCATATCTCCATTGCAACAATGTAATTATCTTATCTTTCTCTCTTCCACTTGTTAAGTATTATTTGGTTGATATCTTTTCTTAGATTGTCATTGAGTTCATTAACCCAATGTTGGTAAATATTCTTTCATATCTCTTTTTTGGTTAGTGATGTTAAACTTTACTCTTAAAATATTGAAGGTGTTGGAACGGTGGAGAAGTGCAAATGCAGTATGCTTTGATGTTGATAGCACAGTTTGGTTTAGTAACAATCATTGAGGTGACCTTGCTAGTTCTCAATCTCTAAGGTCAGTTGCCAATATTATACAAATTTCACATATATGACTCATGTTTAATTGATCTAGGCAAAATATTACATTATGATCTCCAAATTGCCAAATTACATGCCAATTATTTCATGATTTTAGTGTTCTTACTGCTAGGAGAAAAAATATACATTTTCTTTTATCATTTGTTGATTTTCTGTTGAGATTTGCCATATACTTTGATTCGTTTTTCATTGGATTTATCCTCAAGGTATAGTTCACTGAAGCCTCATTAGTAAATCTTTAGACCAATTGGTCATTGTCTATCTTTTGGAATGTACTTTAATCACATCTTTCTTTTGAAATATATATGTGTTCTATATTTTTATAATTTTATCATTTAGGCACAAGTTATTTATTTCTTAACTAAAATCAATCCACTATACATTATATTTACAAAGTATTGTACTCAATTGGGCAACTGTTTCCAAATCCCACCATGTTTTCATCCACCAAATCCCTCTTAACAACTGTCTTATCATCCCTACTTCAAAATATATTTGATAAGAATGAAGAACCACGTAGTGAAGTAAAAAAAAAAAGAAGGGCTCGAGATAAGCCCAAGAAACTACCAAGCCAATATTTAAGAGTTAAAATTTGACATTTGAATTCATATATTGTTGTTTGAATTTGTTTAAAGAGATTAATTTTTACAATTTAAGGGTTGAATTTATAAAATTATTATAAATTTGTGGGTCATAAATTGTATAAACTTGAGAGTTTAATTTTTATTCATATAGTTTCAACTTCCACCATATACTTCAGGAGTTTTTAGAATTTGTTCAAAAAGTTATAAATCCTACGCCTTGAATCTCAAGTTTGTATGGATTAAAATTTTAATCTATTTAGTTATGGTACTTTCATAATACTTTTCTTTTTGCCCATGCTCCATTTTCCATATTTTAACTATTTCTTGTTATTTGTTTCTTACTTTTAAGAAATGTTTCTTGAAAAATAAATCGAATTTAAAAATCAAGTTTCGAAAACTCAAAAATGTAAGTTTTTAAAAATTGTGTTTTATGGATTTATTAGTAACTACTATCCATTTACCGGCATTTGCTTGGATTTGTTTTGTTCTTGGGATAGTGTTTGGCGAATTTGATGGAAGAAGTTCCTCAAGTGGCGGATCTCTTCGGCTTTTTTTCTAGGTTTAATTCTCAATTTAATTAGTTTATTTGTTCTTCGTTTTACAAAAGTCAATTCTTATTTTGAGTATATTTGGTAGTGATTAAGATTAAGATTAAGAGAGAATGAAGTGAAGAAAACAAGACGTATCCATTTCAATTTTTCTTCAATCTCTCTGATTCTTACTTACACTAGAAGAAAACCGGTCTACTATGACAGTTATATATCTCAAAAAATGAATGGGAAAAAAAACTGTCATAAAATAGAAAATTTCGCGTTTTTGGTGGGAAAAGACGGAATTTTTCGGAAAACACTTTTCGCGACAGTTATTTAATGTCATAGAATGTTACCATTAAAAAATTTATTATTTTATATTTAAAAAATTAAAATTACATATTTTTATTTTTAAAAAAACCCAAATTCCCCAAAATTTTCCCCAAATTCTTCCTCCCATCCGCGTGCCCTAAATTTCCCCCAAATTTTCCCCAATTTCTTCCTCCCATCCGCGTGCCCTAAATTTCCCCAAAATCTTCCCCAATTTCTTCCTCCCATCCGCGTGCCCTAAATTTCCCCAAAATCTTCCCCAATTTCTTCCTCCCATCCGTGTGCCCTAATAACACCCCCCTCCTGCCCGGCCGTCCCTCCGTTCGCAATCGCATTGTGCCCAAAATTTCTCCCATTCCGAAACCGTTCGCTTTTTTCCCAATTCCGACCGTCTGAAGTCCCGTCGCCACCACCACCCCCTCCTGCCCGTCCGTCCAAACCTCCTCCACCAACCCGTCGCCACCACCCCCGTCTTCTCCAAACCTCTGCAATCAACCCGAAGCTTCAAATCGTGGGCGTCGGTCGTCACCCCTCCCCTCCGCCGGTAAGCTTATCTCTTTCTCTCTTTCTCTCTCTATGAAGTTCTTCTTTGTCTCCATTGGATTGTTTCATGAGTTTCAGTTTTTCCCAATTTCAGTCATTAATCGTTGATTTTCTGTTATATGACCTTAATTCGTTCTTGCAACCACATGAGCTTATTTTGTGAATTTGAGTTATGCCCAATTTCTGTTTTCTAACTGTTAATTTCTCTTCAATTTTAATTTCTGGCAGTGTACTGTGGCACAATCTAAAATTAGTCTAATTACTTGTACAATGTAAGCCAAACTACTTATACAAACCTACCCTAATCAACTAACTAAAGACAAACTATTGTTATAATTATTTGTCAACTAATTCCCTTCATCATTCATCATGTCTGTAAAGGAAATTGTCCTTCAAATGTTTTATGCTAATTGGGGGTTGTTGAACCTAGTCCAGAAGTTTCCTTCAAGATGGTTTCATCACTAATGTGGTAATGAGACAACCTTTCAAATTAATGTAACAAATTTCATTACTTTTCATCATGGCATTCGAGTGATTCGTTTAATAGGGACGAAAGTCTTCAAAACTGTCAAAGTCGACAAAATCCAATAGGGGAGGTCTGAATTGACTCAAGTCTTAGGAGAATGTTTCATGGTATTTGAGTGTTAATAGGTGGATTACGATATTTTCTTCGTATATATAGTTACAATATTTTCTTTAGTATATATAATTTTGATGTTGATTATCTATTTTGGAAAATATACTTTTGTGTGTCTATCTGTGACGCTTTTTCCTACCACAATCGTTTCAAATACAGCTAGAAAATTCCTAAATGGTATGAAATAAATTATTAAGTACTTTGAGGATCATCTACCGTTTTGAAAGTTTGAGTTTTAAAAGTTGTTGCCTATAATCTCTTTTGTAATCAGGTTTATTTCGAGGCCAACTTAGACCTCTACACAATGGACAAGTCATGGATGACCCAAAATAGGATGTCAAGAGAATATGATTTAGGAGTCGAAAGGTTCATTAAATTTGGGTTGAGTCATGCCAAAGGTCTTAATTCAATTAGATGTCCATGTTTGAATTGCGGCAATCGTTTACTTAAGGATGTCTCAACAGTTCGGTATCATCTGTATGCCAATGGAATTGATAAGAGTTACAAGGTATGGTTCTGGCATGGTGAAGAATTGAACTCAGATAACGTTGCCAACACGATGGAAAATACAGTGGATGA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mRNA sequence

ATGTTTTCATCCACCTTGTGCAGTTGCAGTAGCTGCAGGGGGAAGTTTGGAAGAATCTATTGGAGCAATGAATCCAACTTGGAGCAATTGATTGATATAACACTTTTTGGTTTTTTTAGAAATGAAGGATTCGACCATGGTTCAAGCAACAAAGAATATTTTCAGGGACCATGGTTCAAGCAACAAAGAATATTTTCAGGGGTGAAGGATTACCGGTTGGTTGTTTATGCTTGTACAAAAAATCATGTTATATGTATTATGATGGTATTTACGCTAGTTTTGATTAAGGGCTGTAATTTCATACTTGTAAATTGTTCAAATTTGATTGGAAATATACGAATATTACAATGTGTATTATAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTTTCATCCACCTTGTGCAGTTGCAGTAGCTGCAGGGGGAAGTTTGGAAGAATCTATTGGAGCAATGAATCCAACTTGGAGCAATTGATTGATATAACACTTTTTGGTTTTTTTAGAAATGAAGGATTCGACCATGGTTCAAGCAACAAAGAATATTTTCAGGGACCATGGTTCAAGCAACAAAGAATATTTTCAGGGGTGAAGGATTACCGGTTGGTTGTTTATGCTTGTACAAAAAATCATGTTATATGTATTATGATGGTATTTACGCTAGTTTTGATTAAGGGCTGTAATTTCATACTTGTAAATTGTTCAAATTTGATTGGAAATATACGAATATTACAATGTGTATTATAG

Protein sequence

MFSSTLCSCSSCRGKFGRIYWSNESNLEQLIDITLFGFFRNEGFDHGSSNKEYFQGPWFKQQRIFSGVKDYRLVVYACTKNHVICIMMVFTLVLIKGCNFILVNCSNLIGNIRILQCVL
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_5G025400.1CsaV3_5G025400.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CsaV3_5G025400CsGy5G016080Cucumber (Gy14) v2cgybcucB232
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None