CsaV3_5G014210 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CGATAGCGCACAACTCGCAATTTCTCTCTCACCGCTTGGCATCAACAGAGCCGCGAAATAAATAAATAAATAAAATCTCTCCATTTTATCTTTGGATGAAAAATCTCTCCACTTTAGGTCGGTACTGTTATTAACAAATTGCTGACTATTTCCTTCTACTTCTCCAATGGCCGCCATTTCACTGGACTCAGTATCCTCCATTTCTATCAGACCCACTTCTTCCGAATTCCCTTTCAAATTCCCTACTTACTCCAAACCTTTTTCTATACCGTTTTCTTCCCTTTCAAAATCCCGCACCTGCAACCATGAGATCAAGAAAGCGCCTCTCTCTGTGCAAAGCATCGCTGAAACAAGTCCCGGTCCCTCATTTTCTAGAAATTCTTCTTCTTCTTCTTCAAAGATTGTATCCGGGTATTGACCTATTGCTTTTTTTAATATGATATTTGTTTTCTTTTCGATTTTTTATTCACCATGCTCCATGCTCTGTGTAGAGATTCTGTTTCTTATTGCCCATCTACTCGTGGGTTTTTTCTAGTTTAGACGTTAGGTTTATTGTTAATGTTTTAGTGTCTTCCTCATCGATCAGTATGTCGTGAGACAGAAAATCATCTCATCTTTGAACTTAGAAAGGAGAGGGTGGGCAGATAAGGGATATAAGGAATCTCCATATGAGGAATGGATGGAAAAATGCGTTTATGTGATAATTTCATGCTAAATGATTGTTTGTTAGATTCTCTGTTTCTCTCCAGGTCTCGGTGTCTAGGATTTTTGTAATTACTCGTTAAGTCTTGTTTTATTTGATTGGATCCCCCTTCTTGTAGTTGCCTCTCTTTTTGTTGCTATTTTTATTATTATTTTTTAGAAGCCAGTGTATTCTTTCAATTTTTCTCAATGAAAACAGGTATTATCTACAAATAGCTCCATCTCTATCTTAGTAGTTTTGCAAGACCTTTGTTTTAATTCGATTCCAAACACTGGCAATAAATCTCAGTGGATTGTTCATTGTAATTACCTACTGATTGATCACTTTTTGAAGACAAGTTAAACTCTGGGGTGAAGTAATATTATGATTAACTTTATCTGGATATTAGCATTACGAATCAAGCATAGTGAAGCATGTGTAGTTAGAAGGTTGCTTCTCACGGCATTGTGGGAGCCATGTTGTCATTATGGACACAAAACGTAGTTAAGCAAGCTTGGAACTACTTGTGACCAATACGATTGGTAGGGTAGTCTTTCACGGCAAAAGGTCATGGAAACTATTATAGTTAGTTGGCTTGGCCCATAGGGAGATTACGAGAGATTTACCCTAAATCTTTTTTTTTTTTTATCTCATTATGTATTTTATTTATTCTCCTTATTGTACCTATTGTTTTTTATCAGAAAATAATAAGAACAAAAATATCGTGGTTTTTCTTCTGGCATTCGGGTTTCCACGTAAATTAGTGTTTCGTTCTTTTATTGCTTTCAATATAGTATCAGAGCAGCAACAACGAACAATTTAGGAGAAACTAGGGGTGTAACTCCAACCTAAATAACGGACAACACAGAGTACCAAACCCATATTATATGGGTTAGGTTGGATTAAAAATTTTGGTTTTTTCGGGTTGGTTGAGGTTGAAAATATTGGTTCAACCCAACCCAACCTGAGTTAATAATATATGTATAATCCCGAGCCATCTCGGTGCCACTAAGGCCCGAGATCCAATAACTATAGGAAAAATTCTTTCATCCTAGGCTATCCTGGGCACTTAAGGCAATGTAAGCCCGAGATCGAATGAATTAAAGGCAAAATTCTTTCATCCTAGGACATCTTGGTGCAACTAAGGCTCGAGATCATGTATCAAATTTGAAAGTCATCGTTTTAAAGAAAAAACAATACAACTTGACAACCCAACCTAATCTAACTCATATTTTATGGGTTGGGTTGGTTATACAATTTGGGTTATTCGGGTTGCCAACCCAACCAACTCAAAAATATGGGTTGAGTTGAGAATGTCCTCCAACCCAACCTGTTTACACCCCTTGGAGAAACCTAGATCGAACTAGATGCCGTTGTCGTGGACGCTGCCATGGTAAAGTTGCTTCACTGGTTACAATGGGCCTACCCTCGAGTCATCTACGTAGCCTAGTGGCCAGAATTTGCCTCACTTGTCATCACTGTCAGGCGTGTGGGCCTATGTGTCGTTGTCCAATCATCTCAGTGCCCAACCCAACTTCTCCCACATGTGATTCCTTGTTTAGCCATCGCATCCTTTTCGATCAGCTGCAGCCCCATGCACCACCTCTGCCTTTCGGTTATGGACAGCCACCACCAAATCCGTCAGTTGACATGTTGTCATTTGATCCTTTATAGCAGCCCTACTTCTGTGGTAACGGGATTGACCAAATCCATAACAGATTGGGGGTTGAAGTTGGCGAGTCTTTGATGCATTCCAGACCAACCGAGTGTCGATGTATTCCAAGAGCTCGGTAACACCTTGCCTTTAAATTATATAATTGGCTCTTTGGGATCATGTATAGGGAATTTTCTAGGAGAAATTAAATAGGGAATATCATTTTTCGTGGTCTCAATCAATCAAGGTGTTCCTCGAAGGTTGCCACTAGTTTGAATTTTTGAGAGGAGAGACTGTCCGTCCTCCATCGGGTGATGCCTTGGAACGACTTTGAAATGGGGAGGACTCACTCATTCGGTCCATGCTGATTAATAGTATAGAACCACAAATCTGCAAGCTTCTACTGTGTGCAGCCACTGCAAAAGATTTGCGGGCTACAACTTAGACACTTTTCTTAAAGCGTCAGAATGCCTCTCGATTGTATAAATTGAGAAAACAGGTCCAAGATCGCAAACAATAGACCCTGGACGTGACTTCCTATTTCAATAAGCTCTCCCTATTCTGGCAAGAGATGGATTTGTACAGGGAGACAGTTTGGGACACACCAAATGACGGTATATAATATGCTAAACTTGAGGAGGCTGACCGTATTTATGATTTCCTTGCAAGGCTTAATCCCAAATTTGATACTGTTTGTGGTTGTATACTCGGACAGAGGCCTCTTCCCTCCCTAATGGAAGTGTGTTTTGAAGTACGTCTTGAAGAAAACGGTACAAATGCCATGGGTGACTGATTACCCTTGCCACCGATTCTGCTGCCTTTAGGGACCGGTGCTTGACCCATGATAATGAAAAGAATAGTGGGAAACCAATCCCTATTTGTGAGCACTGCAAGAAACCGTGGCACACCAAGGATCAATGTTGGAAACTCTACAGTCGTTCTCCAGGAGGTAAGAAATGATCCTCCATTGAGAAACAAAACACAGGGCGTGCCCACATTAGTGAGACTGCCACTGCTTGCACCTCTTAGTCAAATGGCTTTACTACAAGCTAGACCAAGACACTAACTCTGGGTTCCATTGCTCAGTCAGGTATGCTTCAGACCCTTGGCCTTATTAGTGTTGATGGGAAGCCGAATTTTAGATTCGGGGGCAACAGATCACTTGATAGGTTCTTCGGAGCACTTTGTTTCTTATACCTTCTGTGCCGGTAATGAGAAAATTTGGATAGCCGATGGCTCTTTCGCCCTGATTTTTGGCATAGGACAAACAGTTCCATCTGACGGACTTGTTCTTCAGAATGTTTTGCATGTGTCTAAGCTTTCTTACAATTTGCTATCTATTAGAAAAATCACTCGTGAGCTGCACTGTAAAACTACCTTCTTACTTGAATCTGTTTGTTTTCAAGATGTGAGCTCAGGGAGGGTGATTGGCACTGCCCGACATAGCAGGGGACTTTACATCTTTGATGATGATACCTCTAGTAGTAGTATCTCTAGGACTAGTTTATTGGCTTCCTATTTTAGCACTTCTGGACATGATTGTATGTGGTGACATTTTTTGTTGGGCCGCCCAAACTTTAATTATATGAAATATTTGTTTCCCCATCCATTTTCTAAAATTGATGTCTCCTCTCTATCTTGTGATGTGCATATTTGGGCAAACCAACATTGGCTTTCATTTCCCTCGCAACCATATAAACCCACACAACCATTCACCTTTATCCATAATGACGTTTGGGGTTCGTTCAAAGTCACTACCTCCTATAGGAAACGGTGGTTTTGTAACTTTCATTGATGATCGTACCCCTCTTACCTGGGTCTTCCTTATCATAGAAAAATATGAGATTTCATTTGTTTTCCAAAACTTCTACCACACCATTGAAATGCAATTCAATACAAAATATTGCAATTCTTCGGAGTGATAATGAGCGAGAATTCCAAAACCATAACCTTAGTGAGTTTCTAGCCTCGAAGGGGATTGTTCAACAAAGCTCGTGTGCCTACACACTACAACAAAATGGGATGGCCGAGTGAAAAAACTGTCAATAGAATGCTTTTTCATGTCTTCTACCTTCGAACTTCCTTAGATTGTCTTAAGGAGTCCCACCCTTCTACTTTGTCTAATTTCTGAGGTTCCCATTTGTGTGTTTGGGTGTACTGCATATGTCCACAATTTCGGCCCTAATCAGACCAAATTTATCCCTAGGGCTCAAACATGTGTGTTTGTTGAGTATCCCCTTCATCAGCGCAATTATAAATGTTTTTGTTAAATTTGGTAGTATGGGGTTCCATCTCAAAACCAATTGGCAATGAGAGGAGTAGCCCATCTACCTTATATGGAGTATGAGTCCCCTTGGTTTTTCCAATGCGGGACTCTCAACTTCTCCAACAGTTTTCATCCGCCTTCTAGGAAATACTTTATCACTATGGATGTTACTCTCTGTAAGGACCGACCCTTCTTTTTTGTTAATCATCTTTAGGGGTAGAGTATGAGTGAAGAGTCTAACCGTACCTTAGAGTTTGTTGAACCTACTCCTAGTACCATGTCTGATTGCGATCCTCATCCCATAGTCCTACCCACAAACCAAGTTCCCTATGAAACATACTACAGGAAGAATTTCAGAAAGGAAATTGAGTCCCCTACTAGTCAGTTGGCTT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ATGGCCGCCATTTCACTGGACTCAGTATCCTCCATTTCTATCAGACCCACTTCTTCCGAATTCCCTTTCAAATTCCCTACTTACTCCAAACCTTTTTCTATACCGTTTTCTTCCCTTTCAAAATCCCGCACCTGCAACCATGAGATCAAGAAAGCGCCTCTCTCTGTGCAAAGCATCGCTGAAACAAGTCCCGGTCCCTCATTTTCTAGAAATTCTTCTTCTTCTTCTTCAAAGATTGTATCCGGGGTGAGACGACATACAATTTCTGTGTTCGTTGGTGATGAAAGTGGAATGATTAATCGTATAGCTGGAGTTTTTGCTAGAAGGGGATATAACATCGAATCACTTGCGGTCGGCCTGAACAAGGACAAGGCTCTTTTAACTATAGTTGTCTCTGGGACTGAAAAGGTGTTAGAACAAGTTATTGAGCAGCTCCACAAGCTTGTAAATGTTCTGAAGGTTGAAGATCTCTCCAGTGTGCAACAGGTGGAACGTGAACTGATGCTTATAAAAATAAATGCTGAGCCTACATATCGTGCTGAGATTAAGAGACTAGTGGATGTCTTCAGAGCAAAAATTGTAGATATCTCAGATGATTCTGTAACAATTGAGGTAACTGGGGATCCAGGGAAGATGGTTGCTTTCCAAAGAAATTTAAGCAAATTTGGAATTAGAGAAATTGCTAGAACTGGAAAGATTGCTTTAAGGAGAGAAAAGCTAGGTGCATCTGCTCCATTTTGGCGATACTCTGCAGCTTCTTATCCAGATCTTGAAGAAAAGAGGCCTGCTAATGCTTCCATGGGAATTGAAAATAAAGTATACAACAGTGAACTGAGTGAATCCAATTCATCAGGTGATGTATATCCTGTGGAGCAGTCAGATGACTTTACTATCAAACCAGTTCTTGATGCTCACTGGGGAGTTCTCAATGACGAAGATGTGGATGGTCTTCGTTCACATACTTTATCTATGCTAGTAAATGATTCTCCAGGGGTTCTTTATATTATCACCGGACTTTTTGCAAGAAGGGGATATAATATTCAGAGTTTAGCTGTTGGTCATGCAGAAGCGGAGGGCATTTCACGCATAACAACGGTTGTTCCCGGTACAGATGAATCAATCTACAAGTTAGTACAGCATCTTTATAGGCTGGCCGATGTTCATGAGGTTCGGGATCTGACCCACATTCCGTTTTCAGAGCGGGAGCTGATGCTGATTAAAATTGCTGCAAATCCTTCTGCTAGGCGTGATGTTCTTGATATTGCCCAAATATTTAGGGCCAAGGCAGTTGATGTCTCCGACCATACGATTACACTAGAGCTTACTGGAGATTTGCATAAGATGGTTGCACTCCAGAGGTTGTTAGAGCCTTATGGCATTTGTGAGGTAGCGAGAACGGGACGAGTAGCGTTGGTGCGTGAATCAGGAGTAGACTCAAAATATCTTCGTGGATACTCATTTCCTCTTTAA MAAISLDSVSSISIRPTSSEFPFKFPTYSKPFSIPFSSLSKSRTCNHEIKKAPLSVQSIAETSPGPSFSRNSSSSSSKIVSGVRRHTISVFVGDESGMINRIAGVFARRGYNIESLAVGLNKDKALLTIVVSGTEKVLEQVIEQLHKLVNVLKVEDLSSVQQVERELMLIKINAEPTYRAEIKRLVDVFRAKIVDISDDSVTIEVTGDPGKMVAFQRNLSKFGIREIARTGKIALRREKLGASAPFWRYSAASYPDLEEKRPANASMGIENKVYNSELSESNSSGDVYPVEQSDDFTIKPVLDAHWGVLNDEDVDGLRSHTLSMLVNDSPGVLYIITGLFARRGYNIQSLAVGHAEAEGISRITTVVPGTDESIYKLVQHLYRLADVHEVRDLTHIPFSERELMLIKIAANPSARRDVLDIAQIFRAKAVDVSDHTITLELTGDLHKMVALQRLLEPYGICEVARTGRVALVRESGVDSKYLRGYSFPL
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. NCBI nr
Match: XP_004149627.1 (PREDICTED: acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 933.7 bits (2412), Expect = 2.5e-268 Identity = 489/489 (100.00%), Postives = 489/489 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. NCBI nr
Match: XP_008450269.1 (PREDICTED: acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 880.2 bits (2273), Expect = 3.3e-252 Identity = 463/495 (93.54%), Postives = 472/495 (95.35%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. NCBI nr
Match: XP_022932952.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 845.5 bits (2183), Expect = 9.0e-242 Identity = 439/489 (89.78%), Postives = 465/489 (95.09%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. NCBI nr
Match: XP_023554791.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 842.0 bits (2174), Expect = 1.0e-240 Identity = 439/489 (89.78%), Postives = 465/489 (95.09%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. NCBI nr
Match: XP_022973872.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 831.2 bits (2146), Expect = 1.8e-237 Identity = 434/489 (88.75%), Postives = 461/489 (94.27%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. TAIR10
Match: AT2G31810.1 (ACT domain-containing small subunit of acetolactate synthase protein) HSP 1 Score: 612.1 bits (1577), Expect = 3.1e-175 Identity = 338/493 (68.56%), Postives = 385/493 (78.09%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. TAIR10
Match: AT5G16290.1 (VALINE-TOLERANT 1) HSP 1 Score: 571.2 bits (1471), Expect = 6.0e-163 Identity = 297/407 (72.97%), Postives = 348/407 (85.50%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q93YZ7|ILVH2_ARATH (Acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g31810 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 612.1 bits (1577), Expect = 5.5e-174 Identity = 338/493 (68.56%), Postives = 385/493 (78.09%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9FFF4|ILVH1_ARATH (Acetolactate synthase small subunit 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VAT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 571.2 bits (1471), Expect = 1.1e-161 Identity = 297/407 (72.97%), Postives = 348/407 (85.50%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9SMC2|ILVH_NICPL (Acetolactate synthase small subunit 1, chloroplastic OS=Nicotiana plumbaginifolia OX=4092 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 565.8 bits (1457), Expect = 4.5e-160 Identity = 302/400 (75.50%), Postives = 335/400 (83.75%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q55141|ILVH_SYNY3 (Acetolactate synthase small subunit OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=ilvH PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 188.7 bits (478), Expect = 1.5e-46 Identity = 92/164 (56.10%), Postives = 129/164 (78.66%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9MS98|ILVH_GALSU (Acetolactate synthase small subunit OS=Galdieria sulphuraria OX=130081 GN=ilvH PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 186.0 bits (471), Expect = 9.8e-46 Identity = 91/164 (55.49%), Postives = 126/164 (76.83%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3BPI4|A0A1S3BPI4_CUCME (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491925 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 880.2 bits (2273), Expect = 2.2e-252 Identity = 463/495 (93.54%), Postives = 472/495 (95.35%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0KL76|A0A0A0KL76_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G013280 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 787.7 bits (2033), Expect = 1.5e-224 Identity = 409/414 (98.79%), Postives = 411/414 (99.28%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3BPV4|A0A1S3BPV4_CUCME (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491925 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 761.5 bits (1965), Expect = 1.1e-216 Identity = 414/495 (83.64%), Postives = 421/495 (85.05%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. TrEMBL
Match: tr|M5VPI2|M5VPI2_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_7G268500 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 666.8 bits (1719), Expect = 3.8e-188 Identity = 363/491 (73.93%), Postives = 407/491 (82.89%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014210 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2R6S0G9|A0A2R6S0G9_ACTCH (Acetolactate synthase small subunit 2 like OS=Actinidia chinensis var. chinensis OX=1590841 GN=CEY00_Acc00368 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 657.1 bits (1694), Expect = 3.0e-185 Identity = 358/492 (72.76%), Postives = 405/492 (82.32%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber chineselong genome (v3)
Date Performed: 2019-03-04
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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