CsaV3_5G014010 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TCTCGATCAAGTTCAAGAACATAGTAGTTTCTCGATCGAGTTCAAGAACATAGTAGTGTTTGAGATGGAACTCAAGTCAGAAGAGAAGAATCTCGGCCCAAATAGGCCCCGGGATTGCCTGAGATCCCGCCATACTTCTTTTTTTTTTTCTTTTAAAAGTTTGTTGAACCGGTTTAGTCTATCACTTTAAATAACTGCTGAACCAACGGTTCGCGAATTTTTTTTTCCCTTCATCGTATTGGTGCGCTAATCAAACCCACTAAACGGAGGTGCCGCTGAGCTTGAAGTTGACGTTAGACGCACCACCCGGGCTTCAGATACGGAGGTGGACGGTAGAGGCTCCAACTCCCACAAACCGACCACCACCTCCAAAAGAGACCACTGGCGGTATCGTCAGAGACAGCAGCGGCTCTGGTATGTAGAGGCGGCGGTGAATGGTAAAAGTGACGTAACAAATTATTTTTCTTAAGCTTCTGATACCATGTCTAGTTCTGTATATTATTGAAGATAATTGTCTATTCACAATGGGAATTACAAAAGTGTATTGTATACATAAAGGAGATTACAAGAAAGAAAATATAAATTAGCCTAAAAGGAAGAGTAAACTGGCTGTTTAATAGCACAACATTCTGGCAATAGATTTGATAAGAGCATGCCTATGAGCCTATTCTTTTTTAGGATTATGGAATGGCTGGTAATGGATTGGTTAAACATCTCAAGGGTGACCTTTTATTCCTTGATTCATCGCCTTTTTCCAAGCTCTTGAACCAGTGTGCTCGCTCGAGGTCAGCTCGAGACACCAGTCGTGTACATGCTTGTATAATTAAATCACCTTTTGCGTCCGAAACTTTTATCCAAAATAGGCTCATTGATGTATATGGGAAATGTGGATGTGTGGATGTTGCTCGCAAGTTGTTTGATAGAATGCTTGAGAGAAATATTTTCTCTTGGAACTCTATCATTTGTGCATTCACTAAGTCCGGATTTCTTGATGATGCTGTCCACATCTTTGAGAAGATGCCTCAAGTTGACCAATGCTCGTGGAACTCTATGATTTCAGGTTTTGAACAACATGGTCGCTTCGATGAAGCTTTAGTTTATTTTGCTCAAATGCATGGCCATGGTTTTCTTGTGAATGAATATTCATTCGGTAGTGCTCTCAGTGCTTGTGCAGGTTTACAAGATTTGAAATTAGGTTCCCAAATCCACAGTTTAGTATATAGGTCAAACTATTTATCAGATGTGTATATGGGCTCTGCGCTAGTAGATATGTACTCTAAATGTGGAAGAGTTGAATATGCTCAAAGTGTTTTTGATGAAATGACTGTGAGAAGTAGAGTTTCTTGGAATAGCTTGATTACCTGTTATGAACAGAATGGTCCAGTTGATGAGGCTCTTAAGATTTTTGTTGAGATGATCAAATGTGGGGTTGAACCTGACGAGGTAACACTTGCAAGTGTTGTTAGTGCATGTGCAACTATCTCGGCAATCAAAGAAGGTCAGCAGATTCATGCTCGAGTTGTAAAGTGTGATGAATTTAGAAATGATCTTATTTTAGGAAATGCGTTGCTTGATATGTATGCTAAATGTAATAGGATTAACGAGGCTAGAATAATTTTTGATATGATGCCAATTAGGAGTGTGGTGTCTGAGACCTCAATGGTAAGTGGGTATGCAAAGGCATCCAAAGTTAAAGTTGCAAGATATATGTTCTCAAATATGATGGTGAAAGATGTAATTACTTGGAATGCGCTTATTGCAGGGTGTACTCAGAATGGAGAGAATGAAGAGGCACTTATACTCTTTCGTTTGTTGAAAAGAGAGTCTGTTTGGCCTACACACTACACATTTGGCAATCTCCTCAATGCTTGTGCAAACCTTGCTGATTTGCAGCTTGGCCGACAGGCTCACTCTCATGTTTTAAAGCATGGATTTCGATTCCAATATGGAGAAGATTCAGATGTTTTTGTTGGCAATTCTCTAATAGATATGTATATGAAATGTGGATCAGTTGAGAATGGTTGTAGGGTGTTTCAACATATGTTGGAAAAGGATTGTGTGTCATGGAATGCTATGATAGTTGGATATGCACAAAATGGTTTTGGCAATAAGGCTCTTGAAGTTTTCTGTAAAATGTTAGAATCAGGAGAGGCACCAGATCATGTAACAATGATTGGTGTTCTTTGCGCTTGTAGTCATGCCGGACTACTTGACGAAGGTCGCTATTACTTTCGGTCAATGACTGCACAACATGGTTTGATGCCATTAAAAGACCATTATACATGTATGGTTGATTTACTGGGCCGAGCTGGGTACCTTGAAGAAGCAAAAATCTAATAGAGGAAATGTCAATGCAGCCTGATGCTATCGTCTGGGGATCATTGCTTGCTGCTTGTAAAGTTCATCGGAACATCCAATTGGGGGAATATGTAGTGAAGAAGCTTTTAGAGGTAGATCCTGAGAACTCTGGGCCATATGTTCTTCTTTCGAATATGTATGCTGAAAATAGAGATTGGAAGAATGTTGTGAGGGTAAGAAAGCTGATGAGACAGAGAGGAGTGGTTAAACAACCAGGTTGCAGTTGGATTGAAATTCAAGGTGAGTTGAATGTTTTTATGGTTAAAGATAAAAGGCATGCGAGGAAGAAAGAAATCTACATGGTTTTGAGAACAATTCTACAACAAATGAAACAAGCAGGATATGTCCCATATGTTGGCAGTAATGAGTTTGATGAAGATGAAGAACAATAGAAAGAAGACGACATACTTCCATCGTACCAAATTGAAATGCTAGATGCAGGTGGCGACTAGGTTGTTCTAACTAATTTAAATATGGATAGTCTTGTGCAAATGGAACCAAAGAAGTGGTTGGAAATGGCTTGGCAAAAAAGAAGCTGGAGAAGGTGGATTCTTAAATGGTTTGTTAAATGGCCAAAAGTTGTTAAAATTCAGAGGAAGAAGGGGATTCTTAAACAGTAGTTGAAGATTCCACCATCTTTGAATCAGTTCACTAAGACCTTCGACAAAAATCTTGTGACTAACCTGTTCAAGATGCTTTTGAAATATAGGGCGGAGGACAAATCACAGAAAAGGTAGAAGTGGAGTTCAGCAGGAATCTGGAAGTCATTTAAGGCCAATTTCAACAAGTACGATGAGAACAAGAAGAAGTGGGGAATTGGAAATCATGGGCTCGAAGTCTTAGGCTAAAAAACGCAAAGGAGAAGCTGCTGAAAGATTGTGTTAGGGATCATTTAGTGAACTAATCTAAATAATCAGTTTGAGGATTTTTCTTTTTTTGACCTATCTAAGTAAGAATAAATTTTAAGGATATTGAGGGAAGTAGGGAAAAGTTCAGTCAATGAGTTTTATTCTTCTTTGAAATTGATCCAATGCTAAAGGCAAACCATGTTCATGATCATTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTAACATTCAATGTAAGAAGACATGGATTCCTCTAACTCTGATCAATATAGTGTTAGTCTAGATTGTTAAATTCTGTATTGTGTTCAATAACGTGAAAAATATTTCTGTGACCGCCTATTTGGATGCCACATCTTTTTTTTTCATTTTAGGATAGGATACTAATGTTTTTTTTTAAAAAAATAATAATAAAAAAAAACTGCATAATCTCAGTTTTCCTCGATTTTAAAAGGAAAAATGCAATTATAGAACTACATGCAATTTGCCTGTGTTTTTGTGTGATTTAAGAAGAAACTATTGAAATATCTTTAAATATATAGACAATAGTTCTGAATGTTGATTGTGTGGATGATTTGTGGTGGAAGAACCATCTTGTAGCTTCATTATGACTTCCATTTTGAAGAAGGTTGTAATATGCCATGATGGCCCCTTTCTTATTTTGTAAAATTGCATTCTTCTCATTGTTTATTACCATAATATGTTCCTTCTTATTTTGCCATTTTGTATTTTTCTTAAAACATGTTGCTACTAGTTTCTGTTCTATATTAGAAGAAAATATATTTTCTCTTATAATATAATAAAACAGGTGATAGTCTATTCGATTTGATCTATTTTGGGACTAACTAAGAACCAAACCAAATCAATCAGTTTTACACGTAAGGGATCTAAACTAATGTTCAATAAAGAAACAAAACCAATGGATTGGTTTTATTTGGATCGGTTTATTATTGGTTTGGTTTTTGGATAGCAGTCAACTTCTCCTTAAGCACTAGAAAGGACCTAACCTCTCTAACAAATTAGGGTATGGCAAGTTATAGATCACATCTACCTTAGCTTTATCAACCTTAATACCATTTGAAGAATCTAAATGTTCTGACACAATGTCATGGCTAGCCATAAAGTGACATTTTTCATAGTTTAAAATTAGATTAGTTTCTATGCATCTTTTCATGATTAAGAAATTATGCAAGCATTCATCAAATGAGCTATCATATACAGTGAACTGTCTATGAAAACCCCAATACAATCTTCAATAAAATCTAAAAACATACTCACCATTTATCTTTCGAGCATACTCGGGACATTGCACAAACCAAATGACATTCTCCTAAAAGCATATGTACCGTAGGTGCATGGGAAGGTAGTTTTTTTTTTGTCCTCTTGAGCGATTGGTATTTGATAGAAACCCGAAAAGCCATAAAAAAAATAAAATAAAAAATAAAGGCTTCCCCGCTAAACATTCTACCATTTGATTTGAGAAAAAAAAAAGGATGTGATCTTTCTATTGTTAACTCAATGAGCTTGCAGTAGTCAATGCACCTACACCACCCATTTGAACTCGAGTTTGCACCATCTTTCCTTTCTTGTTCTTAACTACCGTCATTCCAGTCTTTTTAGACACGACATGGATAGGACTTACCCATGTGCTATCAGAAACAAGGGTAGATAATGGCAGCTTCATTGAGCTTTAGAATTTCCTTAAGAACAACATCCTTCATCGTTGGATTCAATCTTCGTTTGGGTTGGGCAACAACTTTTGCTCCTTCGTCAAGAGAGATG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ATGGGAGAGAGGAAGGTGCTTAACAAATACTACCCACCGGATTTTGATCCGTCAAAGCTACCAAGGGTTCGTAGACCCAAAAACCAGCAAATGAAGGTTCGTATGATGCTTCCTATGAGCATCCGGTGCAATACTTGTGGTAATTACATATACAAGGGCACAAAGTTTAATTCTCGCAAGGAGGACGTCATTGGTGAGACATATTTGGGAATTCAAATTTTTAGGTTCTACTTCAAGTGTACCAGATGTTCTGCTGAGCTTACCATTAAAACAGACCCCCAAAACTCAGACTATGTTGTAGAATCAGGAGCCACACGTAATTTTGAACCATGGCGTGAGGAGGATGAAGCTTCTGAGAAGGAGAAACACAAAAGGAATGCGGAAGAGATGGGGGACGCAATGAAATCCTTGGAGAATAGAACCTTGGATTCGAAACGAGAGATGGACATTCTTGCTGCTTTGGATGAGATGAAGTCTATGAAGTCGAGACACGCAACTGTGAGTATTGATTCAATGCTTGTAGCTTTGCAACGAACTGCCGCTGAAAAGGAAAAGAAGTTAGAAGAAGAAGATGAAGCACTGATAAAATCAATAGTCTTCAATAACTCAAACAGTTATGTTAGAAGAATTTCAGATGATGAATTTGATGATGGTAGTATTGTTCAACATTTGACCAACAATGATATAGCATCGGACTTTAAAGCTAAGAAGCAGAGGGTTTCTGAAGGATCTCCTCATGATCCTACAAGTACTTCATCAAAAGCTGGTTTTCTCCATAGCCGCATGGGTGAAGGTGAAGATGGCAACATTGGGACGTCTACTGATACTAAATTTGTTTCGAAATCCTTTCCGGTCATAGTTTCTATTAAAAAGAAACCAGAAGTGACTGCTCGGGTGGAGAATAAACAGAGCTTGCAACTTCAAAGCAATGGTACCAAAACTGGACTCGAGTCATTGTGCCAATACGACAGTGACGAGGATTAA MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKEDVIGETYLGIQIFRFYFKCTRCSAELTIKTDPQNSDYVVESGATRNFEPWREEDEASEKEKHKRNAEEMGDAMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLVALQRTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVFNNSNSYVRRISDDEFDDGSIVQHLTNNDIASDFKAKKQRVSEGSPHDPTSTSSKAGFLHSRMGEGEDGNIGTSTDTKFVSKSFPVIVSIKKKPEVTARVENKQSLQLQSNGTKTGLESLCQYDSDED
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. NCBI nr
Match: XP_004149128.1 (PREDICTED: coiled-coil domain-containing protein 94 homolog [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 637.5 bits (1643), Expect = 2.5e-179 Identity = 327/327 (100.00%), Postives = 327/327 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. NCBI nr
Match: KGN49569.1 (hypothetical protein Csa_5G003615 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 517.3 bits (1331), Expect = 3.8e-143 Identity = 264/264 (100.00%), Postives = 264/264 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. NCBI nr
Match: XP_022159231.1 (coiled-coil domain-containing protein 94 homolog [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 481.5 bits (1238), Expect = 2.3e-132 Identity = 260/328 (79.27%), Postives = 276/328 (84.15%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. NCBI nr
Match: XP_022965295.1 (coiled-coil domain-containing protein 94 homolog [Cucurbita maxima] >XP_022965296.1 coiled-coil domain-containing protein 94 homolog [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 452.2 bits (1162), Expect = 1.5e-123 Identity = 243/329 (73.86%), Postives = 260/329 (79.03%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. NCBI nr
Match: XP_022923549.1 (coiled-coil domain-containing protein 94 homolog [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 448.0 bits (1151), Expect = 2.8e-122 Identity = 241/329 (73.25%), Postives = 259/329 (78.72%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TAIR10
Match: AT1G17130.2 (Family of unknown function (DUF572) ) HSP 1 Score: 350.9 bits (899), Expect = 8.5e-97 Identity = 207/349 (59.31%), Postives = 246/349 (70.49%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TAIR10
Match: AT2G32050.1 (Family of unknown function (DUF572) ) HSP 1 Score: 245.7 bits (626), Expect = 3.8e-65 Identity = 128/217 (58.99%), Postives = 161/217 (74.19%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TAIR10
Match: AT3G43250.1 (Family of unknown function (DUF572) ) HSP 1 Score: 216.1 bits (549), Expect = 3.3e-56 Identity = 108/178 (60.67%), Postives = 141/178 (79.21%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TAIR10
Match: AT2G29430.1 (Family of unknown function (DUF572) ) HSP 1 Score: 102.4 bits (254), Expect = 5.3e-22 Identity = 45/76 (59.21%), Postives = 58/76 (76.32%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TAIR10
Match: AT1G25682.1 (Family of unknown function (DUF572) ) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 3.8e-12 Identity = 54/199 (27.14%), Postives = 96/199 (48.24%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q54WR5|YJU2_DICDI (YJU2 splicing factor homolog OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=yju2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 225.7 bits (574), Expect = 7.4e-58 Identity = 115/213 (53.99%), Postives = 157/213 (73.71%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9BW85|YJU2_HUMAN (YJU2 splicing factor homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YJU2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 206.5 bits (524), Expect = 4.7e-52 Identity = 99/173 (57.23%), Postives = 129/173 (74.57%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9D6J3|YJU2_MOUSE (YJU2 splicing factor homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Yju2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 206.5 bits (524), Expect = 4.7e-52 Identity = 99/173 (57.23%), Postives = 129/173 (74.57%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. Swiss-Prot
Match: sp|A8WHR3|YJU2_DANRE (YJU2 splicing factor homolog OS=Danio rerio OX=7955 GN=yju2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 200.3 bits (508), Expect = 3.3e-50 Identity = 98/173 (56.65%), Postives = 123/173 (71.10%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9P7C5|CWF16_SCHPO (Pre-mRNA-splicing factor cwf16 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=cwf16 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 185.7 bits (470), Expect = 8.5e-46 Identity = 104/226 (46.02%), Postives = 142/226 (62.83%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0KL62|A0A0A0KL62_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G003615 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 517.3 bits (1331), Expect = 2.5e-143 Identity = 264/264 (100.00%), Postives = 264/264 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A151R6P8|A0A151R6P8_CAJCA (Coiled-coil domain-containing protein 94 OS=Cajanus cajan OX=3821 GN=KK1_040604 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 418.3 bits (1074), Expect = 1.6e-113 Identity = 229/334 (68.56%), Postives = 264/334 (79.04%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2I4GXN6|A0A2I4GXN6_9ROSI (coiled-coil domain-containing protein 94 homolog isoform X1 OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC109011793 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 412.9 bits (1060), Expect = 6.6e-112 Identity = 231/358 (64.53%), Postives = 268/358 (74.86%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2I4GT50|A0A2I4GT50_9ROSI (coiled-coil domain-containing protein 94 homolog isoform X1 OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC109010640 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 412.5 bits (1059), Expect = 8.7e-112 Identity = 231/346 (66.76%), Postives = 264/346 (76.30%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2I4GT60|A0A2I4GT60_9ROSI (coiled-coil domain-containing protein 94 homolog isoform X2 OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC109010640 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 411.4 bits (1056), Expect = 1.9e-111 Identity = 232/346 (67.05%), Postives = 264/346 (76.30%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber chineselong genome (v3)
Date Performed: 2019-03-04
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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