CsaV3_5G013820 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

NameCsaV3_5G013820
Typegene
OrganismCucumis sativus (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr5 : 10570062 .. 10585630 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
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mRNA sequence

ATGAGAGTATGTATGTGGGCATACACTACGTCAACAGCGCCATCATCATCTTGTTGTGACATGTTGGCAAATGCAGCGACATGCGACCCAAATGAGATGAGAGTATGTATGTGGGCATACACTACGTCAACAGCGCCATCATCATCTTGTTGTGACATGTTGGCAAATGCAGCGACATGCGACCCAAATGAGATGAGAGTATGTATGTGGGCATACACTACGTCAACAGCGCCATCATCATCTTGTTGTGACATG

Coding sequence (CDS)

ATGAGAGTATGTATGTGGGCATACACTACGTCAACAGCGCCATCATCATCTTGTTGTGACATGTTGGCAAATGCAGCGACATGCGACCCAAATGAGATGAGAGTATGTATGTGGGCATACACTACGTCAACAGCGCCATCATCATCTTGTTGTGACATGTTGGCAAATGCAGCGACATGCGACCCAAATGAGATGAGAGTATGTATGTGGGCATACACTACGTCAACAGCGCCATCATCATCTTGTTGTGACATG

Protein sequence

MRVCMWAYTTSTAPSSSCCDMLANAATCDPNEMRVCMWAYTTSTAPSSSCCDMLANAATCDPNEMRVCMWAYTTSTAPSSSCCDM
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
The following terms have been associated with this gene:
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0006869lipid transport
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR033872nsLTP2
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0006869 lipid transport
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_5G013820.1CsaV3_5G013820.1mRNA


Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber chineselong genome (v3)
Date Performed: 2019-03-04
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableGENE3DG3DSA:1.10.110.10coord: 27..60
e-value: 7.2E-5
score: 25.0
IPR033872Non-specific lipid-transfer protein type 2PANTHERPTHR33214FAMILY NOT NAMEDcoord: 24..60

The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None