CsaV3_4G030440 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGGTTTGGGTGATGAAATTCCGGAGAAGGAATGAAGTGTAGAAACTGTGGATCGGACCGCAGGGAATCCCAACACATCCCTTCTCGTTTGGTTATTGTTATTGATCTCTGAAAGGATCTGCCATCTCCACAAAGCTGTGTGTTGCGCTTCACACACACACACACTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTTTCTCTCTTTCTCTCTGTTTCTCCATCGCCATGACCGAACCCACTGACCAATCTCCTTCACCTTCTTCTTCCTCATTGCCACCTAAAGATCCAATCTCTCTGATCCACCCACGTCGTGAACCCTTCGAACATGGCCTCCTTCCCATTCCCAAGCTCATCTTCTCCGACCCCATCCAAACCCTAATCCCACTCAAGCAAAAGCTCCTCCAATCTTCTTCCCCTTCCAATCGCCTCAACTCTTCCGCCATTTCCGAATCCCTTCAGATCTCCATCGACCATGCTCGCCTTGTCCTCGACACCCTCGCTTCCGTTCTCCACTCCGACTCCGACCCCCTCGTCAATGCTACTCCTCATGATGTCGACTCTGTTGGCGTCGATGTTCTTGATCTTCTTCTCTTTTTGTATATTCAGTCTTACAAGAGACTTCTCCCCAGATCGCATAAGGATTCCGCTGCTGTTGCCGATGTCTGGCCTTCCACTTCTGCTTTCGATGGCTACTTGTCCGCCCTTTCTCCTTTGCAGGTAACTCGAAACTCCTTTCTGGGGTGGCTTGCTGATTCTTTATTGCTCGCGATTCAAAGTTTTTATGATGGTTTCTCTTTGCGTCTTTGGTGGTTTCTGCATTGGTAGTGAATGACGCTAAGGAAATCTATATAATGTAATGTGGTGGGAATTAAGAGCTTCAGTTTACTGGATTGATATCTTCAATTTTATTAACTCAGAATATGTATTATCCTGACATATAGATTTCCCGTTTGGTGCTTGGTTACAGTGGTTTGTGGGTTAACACTAGATAATTATTTTCATAACAGACTGGTTTCATTTTTCTCTATTGGGTTAGAGTGTTTTTTCCCTTTCTTAGCAGGCTTCACTTTTAACTTGTTTGCTGAACCACAGATTGAATCACTTGCTTTCAACCATTGATGTTTTCTTGTGATTAATCTTTTTCTGGACATGGCTCTGTTAGTATCATTTGTTTGTCTTTGTTCTTCTGAGTTTTTCTTGTTGACAGTAATACTTCTGCACTGTAGAAATAGTGCTCCCTCTCTCTTTCCATGCATACGAGCAGGTGTTTAGATGTGCAAAGTAACTGAGGGAAGTTAATTGTTCACTTTTAGATGCTTTACCATTCAGGTTCATTGTACCTGCACATCTTTTAGAATTATCTTTATTTTTGTATGGTAGAAATATTTAGAGCACACCAATCACTTTATTATCAGTGTACTGCTATAATAGGCTCAAATTTTGTTCTTTACACTGCAGCTTGTGCGCAGCAATAGCCGTCGATTCATGCCATCACAGGCTGATGAAGAGGCTCACCAATTATCATATTTACAAAAGCACTTGGGTAACATTCTCTCTCTCTTGGCAGAGACCGTGGAGGGGGAAGGCGAGGAATCTTTGGTTAGTAATGTTAGGCTACTTCTCTCACTTTAGCTAAATCTACTTGTTATTTTAATTGTTTTCCTTTGGTACTTTTTAAAAAGTAGAAATTTACTACGATGAAGCTGGAGAAATTAGATAAGTAATACTGGTGTTTGATAATGAATCATTGTAACCCTTCACCTTTAGTTTAGTTTATGTTTTGTGTTTTTTTTCTTTTTTTTATTGGTTCCAATTTTTCCTTCAATGGGCACATAACCGTATTGTAACTTGTAAGCTATCTCTAAATGAAAAGGAGTCTGGTAATCTAATTGTTTCGAAATGCAGTTAGTTTACTGCTGTTGCATTGCGGTCAAGAAATATAATTTTGTGCACTCTGCAGATGTAATATTTCACCCTTATAGTCGTACTTGAGTGGCTTCATCAATGCAATTATTAGTTGAACTTGCTCATGCACTTGTGAGGTTGAAATATTGCTTTGATATTTGGTTGGTTCATCCTTGGATTCCTTGGTAATCCGCAAGATTGTGAAGTGTACACTGGCGGGGTGGGGGTGGATCAATGATAAAACTGTGATGTGCTGTGACAATATTTAGAGAGAAAAAAAACGATACTAAGTCATAATCATTATTTTTGGTTGCGCCATGTCAATATTTTTCTTGTTTTTTAATGTGTTAAGTTATCCATTAATTAATCGATGTGTCTAATGTAGATTGTCTTAATATTTTGTATTTGGCTTTTTTTAATAACTTGCTTGTGAGTTTTGGTTTAACTTTTAATTTAAACGTGCTACAACTTTGATCCATTTCCTATGTACTGCAGTTGCCTTCCCTAATATGTTACAGGCACCAAAGTACTTTATAGCTGATTCCAATTGATTTAGAATATAATTTATACACAAGAATTTGGAAAAGAGATTGGCCTCATTATTTGCATGCTTGTTAAGTCTTGATACCCTTGTTAGTTTGTATTCTCTCATTAGTAATTTAATAATTTTTTATCATTAGGGTGAATTTTTATTTGTTTATTATGGCCGTTGGCTGGTGTACCCGAAAATAGTCTACCATCTTAATTTTTGTGATAGGAATGCTATTAGAGTCTTATTAGGACATTGAGGCTATAGTAGTTCTTAGAGAAGAGAGATGTTTCTTTTGGTCAAAGAGTTAGGGCTTTGGAGTGATTTCTTGAGGGAGGGTGTACCTTGAAATACTTGGTTTGTATTGTAAATTTTCATCTATTATATTTCAATGTGGTTTAATTCTGTTTTGGTTCCTACCATTTTGCTTTCACTTACAAGTTTCAACACATCTTGTTCTTTGCTAACTGTATGCAATCTTGTAGGTTTTATCTGTGGAAAGATTTGAGCACCTTGGGTTTTTGGTTCATTTTGGTGATAAGGGATCTGAGGGAATTCAACTGAGCCAACATGCTCCATTTTTTGCTAACTCAGATCCCGATATGCCTGCTGTTCCTGTGCCAGCAGCTCAAGTGTTGGACTGGATTTTGCAAAACATTGCGTCTTCTTTAGAAAACATTTCAGAGAGAGCTTCTCTTAAAGAAAATGGACCATCTGGTGCATCAGATCCAGATGTTGCTATGGCTGATGCATCCACAAGTTCAGTCACTAAGGCTAGCATCAGCAGGGGTCCTAGTTATATTGAGGGAATTTCCAAGTCTTCTATTGTGAAGCAAGCATCTGATCTCAAAGGTTCTTCTGTGAAGGTTTGTCATTGTATTGTTTTGTTGTTGCTGCTTCTGTATAATAATAATCTGTTGTAGAGTAAGCTTCTTTTCTGTATTGTAAGGTTATTTTATTTTCAAGTGAGTATTGATCACTGGATCTGTCATTCTTTTACTTTTGAGTGTATGGATTGTGGTGTGCTGACAAGTAGATTCAGAATCTGGCTACTATGCGCCGAATTATTTGTGAATGTTTCATGTTACTTGCTAGTGTTGTTAATTCTAGGTGTTCTACTTGTTCCTCACTTATATCTTCCGGGAAGATAACTGATATCTGAACTCTACATCATATATGGGAACACAGATAATTTGTTTTAGGCAGAGAATCTATTTAGTATTTCCAAACTCTCTTCATCATATATGGGAGAGTTGAAATGCTCTATGAAACATAAATACTTTTTATTTGAAGAAGGGAATCTATGTTGGGCATGTCGTGGGCACGAATATGTCCATATAATGCTTTGGACACGTGTCTGCTATGCTAGTTTTCATATCCATTTGTTTTTTAATTTTTACCTTTTAGATACATGTATCCTATTAAAACATATATTAAGCGACACACTAGAAAAATTTTCTCCTCAGTTTTTGTGCAGATTTTTAAAAGTTTAGATAAAAGAAAAATAGAGGAAAGAAAAAAAAGATAATGATGATAAAGTTACCCTAAAACTAGTTCACTCCACTTCACTTGTTTCTGCTGTTCTGCGTACTAAACCTACCCAAATATCACAAATGTTGACTGGCTACACACGAACAGCAAGTTCCTTTCTCAGTCCACACCTCGAGTCACTACAAGCATATCTCCTCTCATACATCTTCCTTTGCCATTGGGTCAGCCTCACCATCGGTGTTCAGGGTTTGTTTATTCTTTTTTGTTTTCTTATATTTTTTAAGCTAACTTAGTTGGTTTCAAGTTGAAGTTAAATTTAATTTCAGATTTAGAAGTAGTGTCAGCTAAATTAATAATTAGCGTACAATGTGCTAAATTTGGATAGTCTTTTGTACTGTTGTGAATTAACTTGACTTTTATGGTGTTATCTTATGTTATTTACACATCCTAAAAAATAATGTATTCACAAGGTATGTGTATCCCTTTTTTTTGTTTTTTTGGAAATTGACGTGTTGTTAATTGCATTTGTGAGTGCTTTTTAGGTAATTCCAATTGGTATTTGATTGGAATCAATGTAGGCAATGCAAGACAAAGTAGATGGAAAAAATCTTAAAGTTGGCAGTTTTAATATTTTTGTTTTTATCAGTGAGTCATTTCTGGTTGTGATATCATTGTATGTTTACAACAATTTGTTAGGTGTTTCTCTCTTTACTATTTCTTTATGAAATCAAACAACCTTGGGATTTCTTCATGAGTTGCTACTATTTTGTCGCTTGCCTACATGAGGTAGTCAAGTCTCCAGCTTTGTAGATTTGAACTTCAATTTTTGAAGTAATAGTTACATACCAATCATCTTTGTTTATTTGGTCTACTGATGACTGTGAATGATTGTTTGGCTTGCTTTGTTTTTCTCTATTCAAGTGTGAAATGCAGTTTAAACCAAGGAGTTATTCTGTACTTTTTATTTTTTAGTGCTTTGTGAAATTGAACTTTATTTTTTAATATTTTATTTGTGTGCACAGGTGCTTAACAGCCATGAATCTGTCATTTACATATTAGCACCTTTGAGATATGC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ATGACCGAACCCACTGACCAATCTCCTTCACCTTCTTCTTCCTCATTGCCACCTAAAGATCCAATCTCTCTGATCCACCCACGTCGTGAACCCTTCGAACATGGCCTCCTTCCCATTCCCAAGCTCATCTTCTCCGACCCCATCCAAACCCTAATCCCACTCAAGCAAAAGCTCCTCCAATCTTCTTCCCCTTCCAATCGCCTCAACTCTTCCGCCATTTCCGAATCCCTTCAGATCTCCATCGACCATGCTCGCCTTGTCCTCGACACCCTCGCTTCCGTTCTCCACTCCGACTCCGACCCCCTCGTCAATGCTACTCCTCATGATGTCGACTCTGTTGGCGTCGATGTTCTTGATCTTCTTCTCTTTTTGTATATTCAGTCTTACAAGAGACTTCTCCCCAGATCGCATAAGGATTCCGCTGCTGTTGCCGATGTCTGGCCTTCCACTTCTGCTTTCGATGGCTACTTGTCCGCCCTTTCTCCTTTGCAGCTTGTGCGCAGCAATAGCCGTCGATTCATGCCATCACAGGCTGATGAAGAGGCTCACCAATTATCATATTTACAAAAGCACTTGGGTAACATTCTCTCTCTCTTGGCAGAGACCGTGGAGGGGGAAGGCGAGGAATCTTTGGTTAGTAATGTTTTATCTGTGGAAAGATTTGAGCACCTTGGGTTTTTGGTTCATTTTGGTGATAAGGGATCTGAGGGAATTCAACTGAGCCAACATGCTCCATTTTTTGCTAACTCAGATCCCGATATGCCTGCTGTTCCTGTGCCAGCAGCTCAAGTGTTGGACTGGATTTTGCAAAACATTGCGTCTTCTTTAGAAAACATTTCAGAGAGAGCTTCTCTTAAAGAAAATGGACCATCTGGTGCATCAGATCCAGATGTTGCTATGGCTGATGCATCCACAAGTTCAGTCACTAAGGCTAGCATCAGCAGGGGTCCTAGTTATATTGAGGGAATTTCCAAGTCTTCTATTGTGAAGCAAGCATCTGATCTCAAAGGTTCTTCTGTGAAGGTGCTTAACAGCCATGAATCTGTCATTTACATATTAGCACCTTTGAGATATGCCACAATATATGGATGTTCTGATACTACCATTGTTCTTGGAGCAGTTGGAAAGGCCGTTAGAGTTGAACATTGCGAGCGAGTTCAGTTAATTACAGTTGCAAAAAGAGTTTGCATTGCAAACTGTCGAGAGTGTTTGTTTTTTTTTGGGGTGAATCAACGACCACTGATTGTTGGTGATAATCACAAGTTGCAGGTGGCACCATATAATACATTTTACTCTCAATTGGGAGAACACATGAGTGAAGTTGGGGTTGAGGCAGCTCTGAACAGATGGGATGAACCACTTGCTCTTGGGGTTGTAGATCCACACGATTCACTATCTCATCCTGCGGGTGTTTCTGATGTACAAACTGAAACTGCAACATGTCTGGATCCTGACCAGTTCACAAATTTTTTGATTCCGAACTGGGTTTCTGGTGAATTTCCTGGAGATACTGACTGCAATCCATTCCCATTGCCAGATGCTTATTTGGCATCTCTTGAGAGGAATAAAAAGACTTTGGGGGAAGTAAAGCAAATACTAAGAGAAACCCCACTTGAAGAGAACCGCAAACGAGAATTATCTTCTGCCCTACATGTATACTTCAAAGATTGGTTATATGCTTCAGGAAACATCCGTCAGCTTTACTGCTTGCAAGGTGACTAA MTEPTDQSPSPSSSSLPPKDPISLIHPRREPFEHGLLPIPKLIFSDPIQTLIPLKQKLLQSSSPSNRLNSSAISESLQISIDHARLVLDTLASVLHSDSDPLVNATPHDVDSVGVDVLDLLLFLYIQSYKRLLPRSHKDSAAVADVWPSTSAFDGYLSALSPLQLVRSNSRRFMPSQADEEAHQLSYLQKHLGNILSLLAETVEGEGEESLVSNVLSVERFEHLGFLVHFGDKGSEGIQLSQHAPFFANSDPDMPAVPVPAAQVLDWILQNIASSLENISERASLKENGPSGASDPDVAMADASTSSVTKASISRGPSYIEGISKSSIVKQASDLKGSSVKVLNSHESVIYILAPLRYATIYGCSDTTIVLGAVGKAVRVEHCERVQLITVAKRVCIANCRECLFFFGVNQRPLIVGDNHKLQVAPYNTFYSQLGEHMSEVGVEAALNRWDEPLALGVVDPHDSLSHPAGVSDVQTETATCLDPDQFTNFLIPNWVSGEFPGDTDCNPFPLPDAYLASLERNKKTLGEVKQILRETPLEENRKRELSSALHVYFKDWLYASGNIRQLYCLQGD
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. NCBI nr
Match: XP_004146385.1 (PREDICTED: TBCC domain-containing protein 1-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1114.8 bits (2882), Expect = 0.0e+00 Identity = 570/573 (99.48%), Postives = 570/573 (99.48%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. NCBI nr
Match: XP_008442093.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: TBCC domain-containing protein 1-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1096.6 bits (2835), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/573 (97.91%), Postives = 564/573 (98.43%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. NCBI nr
Match: KGN54813.1 (hypothetical protein Csa_4G507430 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1085.1 bits (2805), Expect = 0.0e+00 Identity = 556/564 (98.58%), Postives = 557/564 (98.76%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. NCBI nr
Match: XP_022158963.1 (TBCC domain-containing protein 1-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1028.5 bits (2658), Expect = 8.8e-297 Identity = 526/574 (91.64%), Postives = 551/574 (95.99%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. NCBI nr
Match: XP_022928706.1 (TBCC domain-containing protein 1-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1021.9 bits (2641), Expect = 8.3e-295 Identity = 528/573 (92.15%), Postives = 544/573 (94.94%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. TAIR10
Match: AT3G57890.2 (Tubulin binding cofactor C domain-containing protein) HSP 1 Score: 806.6 bits (2082), Expect = 9.9e-234 Identity = 420/607 (69.19%), Postives = 481/607 (79.24%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. TAIR10
Match: AT2G42230.2 (C-CAP/cofactor C-like domain-containing protein) HSP 1 Score: 799.3 bits (2063), Expect = 1.6e-231 Identity = 402/571 (70.40%), Postives = 473/571 (82.84%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q640P7|TBCC1_MOUSE (TBCC domain-containing protein 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tbccd1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 2.3e-30 Identity = 124/471 (26.33%), Postives = 212/471 (45.01%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q5ZKT1|TBCC1_CHICK (TBCC domain-containing protein 1 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=TBCCD1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 130.6 bits (327), Expect = 5.7e-29 Identity = 115/469 (24.52%), Postives = 207/469 (44.14%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. Swiss-Prot
Match: sp|A4IF93|TBCC1_BOVIN (TBCC domain-containing protein 1 OS=Bos taurus OX=9913 GN=TBCCD1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 130.2 bits (326), Expect = 7.4e-29 Identity = 148/579 (25.56%), Postives = 255/579 (44.04%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9NVR7|TBCC1_HUMAN (TBCC domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBCCD1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 130.2 bits (326), Expect = 7.4e-29 Identity = 121/471 (25.69%), Postives = 211/471 (44.80%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q5FVR8|TBCC1_RAT (TBCC domain-containing protein 1 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Tbccd1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 129.8 bits (325), Expect = 9.7e-29 Identity = 122/482 (25.31%), Postives = 213/482 (44.19%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3B4W3|A0A1S3B4W3_CUCME (LOW QUALITY PROTEIN: TBCC domain-containing protein 1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486055 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1096.6 bits (2835), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/573 (97.91%), Postives = 564/573 (98.43%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0KZ85|A0A0A0KZ85_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G507430 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1085.1 bits (2805), Expect = 0.0e+00 Identity = 556/564 (98.58%), Postives = 557/564 (98.76%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5E691|A0A2P5E691_9ROSA (Protein XRP OS=Trema orientalis OX=63057 GN=TorRG33x02_231800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 902.5 bits (2331), Expect = 4.8e-259 Identity = 455/568 (80.11%), Postives = 500/568 (88.03%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2I4GIC0|A0A2I4GIC0_9ROSI (TBCC domain-containing protein 1-like isoform X1 OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC109008107 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 900.6 bits (2326), Expect = 1.8e-258 Identity = 457/577 (79.20%), Postives = 512/577 (88.73%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_4G030440 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2I4DN11|A0A2I4DN11_9ROSI (TBCC domain-containing protein 1-like OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC108981747 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 899.4 bits (2323), Expect = 4.1e-258 Identity = 453/576 (78.65%), Postives = 513/576 (89.06%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber chineselong genome (v3)
Date Performed: 2019-03-04
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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