CsaV3_3G020730 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_3G020730
Typegene
OrganismCucumis sativus (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr3 : 16947376 .. 16954888 (-)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TAGAACCCAAAAAAGCCAACTTCAACCTCATTCTTCTCCATCTCCATGAACTTTCTTTTCAACAATGGAGACCCACTACGAAGGAGACCTACTGCAATGGAGACACATTGCGATGGAGACCCACAACGACGTCGAATCTAAACGTTTCAAAGACAACAACCCACATTTGTTTTCTCATCGACGGCAACCCACACTCGTGACCCATACTCTTTTTAAAGATTTCGAAGACAAGTTAGTGTTTAATACCTTTCACTTTTGTGTCTTTTCCTTTTCTAATTTTAATTAGTATGGTGTAAGAAATGGAACAAAACCATTTGTGAATAGTTTCTTACCTTTTCATTCACATCCTCCCCATATATATGTGATCTATATCTCTGATTGTTTCCTCATAAAATCTTAATAATCGTATTGTTTATGGTAGATCAAGGAATCTTTGAAAGTTAGAGAATATGTGTTTAGTGGGAAAAATTTTTTAGTACGGAAGGTGTTTGTGAAAATGCCTGAGAGAGAAAATTAGTGTTTTTTAGGATGTGGATTGTGGCTCTATTTTATACAATTTATTTTCTAAGCCTATTTTGACTGTGGAACTAGAAAGGGACTTTTGGAATCCAACCCATTTGTATTGCTAGTGGAAGAAAATAATATGCAACTCATGAAGTCCAACTAATGGTTTGTTATTACTATTAGCCTATTTGTCCAATTCTAGTGTCAATTATTAGAAACTTCCTACCTTGAGTTTGGTATATTATATAGGGAACAAAAATATTATTATCTTATTCTTGGTAATGAAAATAATAAATAACATAAGGATATGGTATAGTGTGACAAACCACTGAGTTTAAGAGTTGACATTAACTTGGAGGTAGCAAAGATTGTATAATTTTGTAAATGGACATTGGATTTTGTGAGATGTGAAGTTTTGAGAAATTTGAATGATGATGATAATGGAGAAGATTTTGTAGGAACCATTAAGGATGTTCTTACAAAATCCAACATTATGACTCCATTGAACTTGTACAAAATTTGGTCTCCCCTTTGATGGGTTTCAACTCACATTGTTGGAGGGTTTCTTTGACTGCTTGAGCTTGAGGGGAATTTGAAAGGAAAGAGAAAGAAGACAGGATTTGTGGGAGTTGTTTGAAGGAGAAAGGGATTTGATCAGCTTTTTCTTTTGGTAAAAATGGGGGAATTTTGAAGGGTCTCTTTTAAGGAAATAAATTGGGAGTTTTTTCCCAACTAATTTTAGGTCATTGATTGTGAAGAAAACTATGAGTAAAGGATTAATATTGTGACGATTCATATAAAATGAAGAAGAAGAAGAGTGATCATTATGGTTATTATTGTTCTTCATTGAAAATTCATCTATCTTGGGAAGTTTGAATATTATCTCTAATTGTGGTCACCATTTTTATGATGAGATTTTGTATTGTACTTGATGTTGCTTCAATAAAATCATTCATCTCAATTTGTTTCCTCTTCTCAACAATTTCGCTCATGGAAGATTTAGTTCTTCCTTCAACAAACTGCAAAATGTGAAAGTTAATTTATGTGAGATTTTTTTTGCCAAGAAAAAATGATATTGATGCCCCTTTTGACAACTGTTATATTTTTTAAATTTGAGCTTATAGAATACTATTTTTACATTTTTTTAAAACAAAAAACTTAGAGTAGGTCTGCAAAGAGGGACTGGTAGGTATACTTAGACATCTCAGTTAAATTAACACATCTATAATTACCCCTCTCGTGCCGACTATATATCATTGGCACAAAAGAACAATTACAGAGGGCACAAGCAGTGAGAAAATAAAACTAACAAAGGCAAAAGCATTGTGAAATATTCATCTATTTTTGATCTTTTGAAAATATTCATCTATTTTATCTTAGGAAAAAGTCTGAAAATATTGAAGCCAGAGTTGGAAAATGAGTTTCATACCTTAACCGGGAGAAGAAGTTGGATTCACTTGTAGGTTGATGTCCTTCTGCTCCACATGCCCCTAGAGGACGTTACATATATGGCAATGTTGGAAGTGGTATGTTTTAACTGTGATAAAATTTTATGTGACAAGCTTGGATATTTGTTATCAATTCATAAAGAATTTAAGTTTATAATCTAGAATCAATTTAATTTTGATTTACATAATTAATTTCTAATAATCTAGGAAAGACAATGTTCATGGACATGGTTTTCAATGCTACTGAAGGAATTGTTAAACTTAGAAAAAGGTACCATTTCCATGAGGTGAAGCTGATAGAACTAAGAGATGCACAGCGGAAAAAAGAATCGAATTTCTACCCTAATTGCCACAATTAACATGTAACCCTAAACTAATCAAGTTAGGGTTTTAGGAAATATTACCTAGTACTCAACTACTATCCTCTTGGACAAAGAATCGGGTTGTGGGACCCAATTTGGTGTAGAAAGAAATGGAGATAAAATGGGATTGGAATGTAGAAAATTTTTCTTTTGTTGAGATGTTGGAGGATAATAAAAAAGGCAAAAGTCTTCAACAATTTGAAAACTCCCCTATTTATAAACTAATTACATGCAAAAATGCGTGTAATTAATTTGCCAAATCTAAACACCTAATGTTCCACTAACAATTAGTGGAACTTAGTGGGCTAGGTGTCTATATCTCATATAGCCACATATCCCACTAAGAGTTAGTGGGATTATCCAACAAAATGTTGGATTTTCCCACTAACTTAGTCCAAGGGTAAAATGGTCATTAGATATTTCTAGTCAAAAGTCAAACTTTGACTTTTCTTAGTCAAAAGTCAATATTTTGACTTTTTACCATTTTGTCCGTCTTGACTAATTCCAACCTCCCGAGCATGAATCCGCATTCATTTTTCCAAAATTCAAATCACATTTGAATATAAGGCCGGTCAAAGTTTGACTTTTCAAAGTCAAAAGTCAACATTTTGACTTTTTACTATTTTTGACCAATTCCATCAATTCCGAGCTTCTTAGTATGAATCCGCATTCATACTTATAGTATGTAAAACATAAAGCTCTATTTCTAATTAGAAGACCGACGACTATATCACTATATTTGTCGGTTTCTCCTTTCTTCTCCCAATTCGAACAATTCGACTTATTTCATCACACTGTTCTAAGTTTAATCCATATGAGCTAGCAGAGGAACCTAATGGACCTATAGATCATGGGCTCCAACGATTCAAGATTAACTAGCTAAACTCTTTTAGACCGAGTTAATCAACATTCGTTAACTAACGGGTCATTCCACTAAAGTCCCGTAGTTGCACTCCCCTCACTATAGATATATTTGTGTCCATTTGATAAAACCATAATCAGTAAGTTAATCCTTCACAGGTTGCTCGTAACCTTGGCTGGGTCAAAATACCGTTTTACCCCCAAGATTACATCTTGCTCCTTAAGTCCCACTAATCCACTATTGAACAATTGGTTTAAGGTTCAACCTATAAACTTAATCCCTCTCGGGCCAATGAGAGGGTGGGGCCCCTTGTTCAAGACTTGGATTCAGTGCTTAAGAGAACAACCTATCTACTAACCCTAAAGCGGGTAGGAGTGAATTCCATCTTGTACCCTATGTTCCCAGCTATCCACCCGATCTTACCCCTGAAATGGGAGGCTTATTGGGCCAACGCTGATGAGCTGCCCTCACCTATGCAGATCTAAGGATAATCTCGTGTGAACAGGAGTTCATAGTTAACTCAGGATTAAGACTAAGTTACCTAGGTCATCAATAATCGAGATAGTCAGTTTTAAACAGTAAACGGTGTTATAACGTAAAAAAGACTAATTCATGGTTCAGTCTTATGTAAACACTTTACATAGGATGCTCCCACTTTCATGTCTCTACATGAACGATTCAGGATCACCTCGTTTGTACTACAAAATGGGTCGCATCCATAGTTTCTCTAAATAAGGCGTCCAACCTTTATTCATATACTATAGACTATTTAGGCTATATATACTCGAACTTGATCCACGTTTATGTTTATACATAAAGTTCAAGTTTATTCAAAAAATAGCCTTGGAACTTGATTTATTGGATTTAAGATTGTAATATTTAATTTCTCAATAACAACTTTATTGAAACAGAATATGATTACAAACTACGAGTTTTAGGACAAAAAATTCCAACATAAGCATTATTCTAGTTTGAGAAATTGGAAACATTGGAACATACATGAAAAACTAGAAAAGCGTTTTTCTAGTTACACCACAACAAGGGAGTAGCGAAGGTATGGAGGGGATGCAAAGGACTTTCTAATTCTCAAACCAATGATTAAATTTCTCTTTTATTTAATGATATTGGGAGGAGCTATGTAAAATAATTACTCCTATTATGATTTTTCAATAACTTTTCCTTTCTAGGAAAAACTAAAAAAGCGTTGAAGAACCATATCTATTGAAAAACAATATCACATGTGAGATTTTTGTATTTAAAACAAATTAAATACATACTTACATAAAAAAAGTATTATCTCTCTCCCTTTTGGACTTGTTTGCATGACTACAATATTGTTTGTTGTTTTGTTGATTCATATAAGGTTAAATTTTATACTTTATAGGGTTATTCTCTTGTTTACTGATTATACTACTATTATTTGCAACAAAAATTTATACATTAAACTTTGAAGTATGTTAGGGATTGTATCTGACCATGGTAACACAAATATTTTTGCATTTGAAATGACTTTGGAGTATTGTTATTATTGACTTATCTTATGATTTATGCTGTAATTGATATCATTCTTCACTGACTTGACAAAATAATTCATTGCTTTGTAAATTATGTACGGAATGTTAACTCATAATCTCACTAATTAATTATATATAAGTTTCCATGATCCTCTAAATTGTGTTAATGCGTAATGCTTGATTTATTTTTGTTTGTTATATTTTGGGACATTTTAATGTCTCTAGAACGCAGACTATTTAAACTAACACAAATTGCTACATATGGTGAGTTTCTTGAAAATCCAACTCTTTCGCCGCCTTCGATTAAGGTATTTTCTATATATTTCACCTCTGATTTCAAGATAGATAGACGAGATAAGTAGAATTTGGTGGTTAGAATTCCGAAGAGAATCCTTTTATTGTGGTTGGAGATCTTTAAGTTACAATTGGTAGATGCTCAAATTTCTAAACCGTGTGAGAAAGGATATGAATATGAAGTTTGGATGAATTTTAGTGTTTCTTACTAGTTCTTTAGAGTTAGATTATGTAGAAATGGATTCTACTTTGGAAAATGAACTAGAAAAAAAAGTTGATTACTAAGAGACTCTTTGTATATTGTACTGAATTATGCGTAGATAAATTGTACTGAATTATATTGGTTCTTTATCTTTGTATATTATACTGAATTCTGTCTAGATAAATTGAATTTGATTATAGTTTCTGCAAGTTTTACTTCTTTGGGATAAGTTTGCTGTAAAATTATGCCTAGGTATTTCCATGCATTATTTTAAATATTTGCCTTGATTTTTTTGCTATGATTAAGTACGGATTGTTGCAAAAGCAGTGGATACGTTTCATTATTATGTTATTGAACTCCATGTCCATCGAATGTTGTTATGCATTTAATATGTACTATCAAGTGAACACTCAAAAGAGTTGGAATTTGATTTTTATTGTGCAATATGATTAAGGGATGGACTTTGGTAATGATTTTTGTGATGAATTACTTAAGATCATTTGGAAGTTGTTAACCAAAGTTTTCTTATTATTTTGTGTACATCATTTGAAACTAATCTACTAGCTATTTTTAAAAATATTATATGGTATTTAAATTCTTGCATTTAGAACGGTTATATTTGTTGCCTTGGAGAGTTGACAAGTTATTTTGTGGTGTTAAATTCCTTGTAGGCATTTATATGATATACTTATTTTGGAAGAATACTATATTTAGTACCTAAGGCCTTAGTTATAACTTTACAGGTATTACATTTTTCATTATTAGAAATTGCTTTAACTTTATTTCCTTCTAATATGTTGCTCATGTTCGTAGAAATTAAATTATTGTTTTATCTTTTGCTGAGAGTTTTATACTTTTTTTCCTGTAGGTGCAGAAAGCACTTATCTCTCTCTGTCTCTTCCAGAATGAACTCCTGTTTGCTGAAAATGAGAATATGCGGAAAATGGTAAACTTTCATAGCCCAACTTGACCATACTTGTGCTTTTGATAGCTATTATATTTTCTTCTAATTTATAATCAAGGAAAGTGAGAGTTTTGAAATTCTATCGTTGAAAGTAGAAAGTCTGAGTTGAAAAGTCAATAGATTGTCTTATCAAAATGGAAAAGTTAATTCCATGGAGAGGAAACATATGATAATCTATCTACAAATAATGAAACCTAATTTTCTAGCAACTTGATGATTAATTTCAAGCAAAAGAAAGGAAAATTGTAAGTGAAAATTCTTGTGTGACAATCAAGAATAAGCTGTTAATGGGAATAAGAAGAAAAAAGAAGTACCAAGAACAATGGATCAAAAACAACTTTTCCTTCGGACAAGACAACATGGCTCTTCAAGTAGTATAAGGTTTTTGTTTGTTTTTACTGTTAAAATAAAACCAAATCTCTCTCTTTATATACACATATATATCTAACTAAACATTTCGTTGCAGTTTAATAATAAAATAGTTTAAAGCACTCTGATTGTGGTGGATTTGGATTATATATAAGGGAGTGCAAGCCTTTTGCTATATTTAATATGGAACTTACGTACCTTATTTAAGTTTTTTTTTTATATCCAATGCATAATTGTTTGGTATTCTACCTTGGTATGTTACTTGTAATTTTATTTTTCATTTTAAAAAATCTGTAAGTTCATGTTTGATATAAAACTTTTTATGTATATGTATGTACGCATGTATATAATTTGTATGTGTATAAAACTTTGTATGGATTGATTCTGTTGTTTTATATTATTTTTTTGCTATTTTTTGAGATCTAGATATTGTTTTAGAGATGGTTTTGTTGGTAGAGGATTGATTCTATTAGGGGGTGTTTGATAATGTTTGGATGAATTCTTGAGTTTTTTATGAGATTTGATTTGAGGGTGTTGTAATTTTGAAGGTTGTGCGTGCGATTGAGATTGTATTCTGTTTTTGTGGGGGTGTTTTTAAAGATGAAGATGGAAGATTGGTATGTAGATTGTATTATGTTTTTTGGTATGCACAACCATAATATTTACTTCCTTATATTCATGTTTTCTTTGTAGGTTCTAATGGAGCCGACAAAGTTCATGAAATTTTCTTCAAAGAAGCTAATCAGGGTCATCAAAATACACTGACTGTTTTTAGAAATGAAGGATTTGACTATGGTTCAAGCAACAAAAAATATTTTCAGAGATGAAGGATTACCGGTTGGTTGTTTATGTATTATGATGGTATTTACACTGGTTTTGATTAAAGGCTGTAATTTCATACTTGTAAATTGTTCAAACGTGATTGGAAATGTACGAATATTACAAAGTGTGTTATGACGTATATATATTAAAGTGTCGACCATTTG

mRNA sequence

ATGGAGACCCACTACGAAGGAGACCTACTGCAATGGAGACACATTGCGATGGAGACCCACAACGACGTCGAATCTAAACGTTTCAAAGACAACAACCCACATTTGTTTTCTCATCGACGGCAACCCACACTCGTGACCCATACTCTTTTTAAAGATTTCGAAGACAAGTGCAGAAAGCACTTATCTCTCTCTGTCTCTTCCAGAATGAACTCCTGTTTGCTGAAAATGAGAATATGCGGAAAATGGTTGTGCGTGCGATTGAGATTGTATTCTGTTTTTGTGGGGGTGTTTTTAAAGATGAAGATGGAAGATTGGTTCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGACCCACTACGAAGGAGACCTACTGCAATGGAGACACATTGCGATGGAGACCCACAACGACGTCGAATCTAAACGTTTCAAAGACAACAACCCACATTTGTTTTCTCATCGACGGCAACCCACACTCGTGACCCATACTCTTTTTAAAGATTTCGAAGACAAGTGCAGAAAGCACTTATCTCTCTCTGTCTCTTCCAGAATGAACTCCTGTTTGCTGAAAATGAGAATATGCGGAAAATGGTTGTGCGTGCGATTGAGATTGTATTCTGTTTTTGTGGGGGTGTTTTTAAAGATGAAGATGGAAGATTGGTTCTAA

Protein sequence

METHYEGDLLQWRHIAMETHNDVESKRFKDNNPHLFSHRRQPTLVTHTLFKDFEDKCRKHLSLSVSSRMNSCLLKMRICGKWLCVRLRLYSVFVGVFLKMKMEDWF
Homology
[Close]
BLAST of CsaV3_3G020730 vs. NCBI nr
Match: XP_011651375.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC105434875 isoform X2 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 226.1 bits (575), Expect = 5.7e-56
Identity = 106/106 (100.00%), Postives = 106/106 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   METHYEGDLLQWRHIAMETHNDVESKRFKDNNPHLFSHRRQPTLVTHTLFKDFEDKCRKH 60
           METHYEGDLLQWRHIAMETHNDVESKRFKDNNPHLFSHRRQPTLVTHTLFKDFEDKCRKH
Sbjct: 1   METHYEGDLLQWRHIAMETHNDVESKRFKDNNPHLFSHRRQPTLVTHTLFKDFEDKCRKH 60

Query: 61  LSLSVSSRMNSCLLKMRICGKWLCVRLRLYSVFVGVFLKMKMEDWF 107
           LSLSVSSRMNSCLLKMRICGKWLCVRLRLYSVFVGVFLKMKMEDWF
Sbjct: 61  LSLSVSSRMNSCLLKMRICGKWLCVRLRLYSVFVGVFLKMKMEDWF 106

[Close]
BLAST of CsaV3_3G020730 vs. NCBI nr
Match: XP_011651374.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC105434875 isoform X1 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 224.9 bits (572), Expect = 1.3e-55
Identity = 105/106 (99.06%), Postives = 106/106 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   METHYEGDLLQWRHIAMETHNDVESKRFKDNNPHLFSHRRQPTLVTHTLFKDFEDKCRKH 60
           METHYEGDLLQWRHIAMETHNDVESKRFKDNNPHLFSHRRQPTLVTHTLFKDFEDKCRKH
Sbjct: 1   METHYEGDLLQWRHIAMETHNDVESKRFKDNNPHLFSHRRQPTLVTHTLFKDFEDKCRKH 60

Query: 61  LSLSVSSRMNSCLLKMRICGKWLCVRLRLYSVFVGVFLKMKMEDWF 107
           LSLSVSSRMNSCLLKMRICGKWLCVRLRLYSVFVGVFLKMKMEDW+
Sbjct: 61  LSLSVSSRMNSCLLKMRICGKWLCVRLRLYSVFVGVFLKMKMEDWY 106

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsaV3_3G020730 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_011651375.15.7e-56100.00PREDICTED: uncharacterized protein LOC105434875 isoform X2 [Cucumis sativus][more]
XP_011651374.11.3e-5599.06PREDICTED: uncharacterized protein LOC105434875 isoform X1 [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsaV3_3G020730 vs. TAIR10
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_3G020730 vs. Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_3G020730 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_3G020730.1CsaV3_3G020730.1mRNA


Synteny
The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CsaV3_3G020730Melon (DHL92) v3.5.1cucmeB249
CsaV3_3G020730Melon (DHL92) v3.6.1cucmedB247
CsaV3_3G020730Watermelon (Charleston Gray)cucwcgB241
CsaV3_3G020730Watermelon (97103) v1cucwmB254
CsaV3_3G020730Watermelon (97103) v2cucwmbB220
CsaV3_3G020730Wax gourdcucwgoB274
CsaV3_3G020730Silver-seed gourdcarcucB0518
CsaV3_3G020730Silver-seed gourdcarcucB0801
CsaV3_3G020730Cucumber (Gy14) v2cgybcucB117
CsaV3_3G020730Cucumber (Gy14) v1cgycucB006
CsaV3_3G020730Cucurbita maxima (Rimu)cmacucB0281
CsaV3_3G020730Cucurbita maxima (Rimu)cmacucB0547
CsaV3_3G020730Cucurbita moschata (Rifu)cmocucB0272
CsaV3_3G020730Cucurbita moschata (Rifu)cmocucB0532
CsaV3_3G020730Cucurbita pepo (Zucchini)cpecucB0686
CsaV3_3G020730Cucurbita pepo (Zucchini)cpecucB0749
CsaV3_3G020730Wild cucumber (PI 183967)cpicucB144
CsaV3_3G020730Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cuclsiB231