CsaV3_3G019980 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_3G019980
Typegene
OrganismCucumis sativus (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionLOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC105852327
Locationchr3 : 15853683 .. 15871505 (+)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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mRNA sequence

ATGGATCCAATAAAATATATTTTTGAGAAGCCGTCATTATCTGGGAGGATTGCAAAATGGCAAGTATTGTTGTCAAAGTATGATCTTATTTATGTTACTAAAAAAGCAATAAAAGGAAGTGCAGTTGCTAATCATTTAGCTGCCCAACCAGTAGCAGATTACGAGCCAATGAGGGTTGATTTCCCTTACGAAAACATATTTCTAGTTGAAAAGGATGTTATAGATCATGAGACATGGATTATGCTTTTTAATTGTGTCTCAAATGAGTTGGGACATGGAATTGGAGCTGTACTAATTTTCCCAGAAGGAAAGAAATGGTGTAAAAAAGTTGATGGGTGTTCCTGTTGGCACTTGACAGCATGGAAGAGATTTGTTTATAATGTAGAAAAGTTTATTCAAAATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGATCCAATAAAATATATTTTTGAGAAGCCGTCATTATCTGGGAGGATTGCAAAATGGCAAGTATTGTTGTCAAAGTATGATCTTATTTATGTTACTAAAAAAGCAATAAAAGGAAGTGCAGTTGCTAATCATTTAGCTGCCCAACCAGTAGCAGATTACGAGCCAATGAGGGTTGATTTCCCTTACGAAAACATATTTCTAGTTGAAAAGGATGTTATAGATCATGAGACATGGATTATGCTTTTTAATTGTGTCTCAAATGAGTTGGGACATGGAATTGGAGCTGTACTAATTTTCCCAGAAGGAAAGAAATGGTGTAAAAAAGTTGATGGGTGTTCCTGTTGGCACTTGACAGCATGGAAGAGATTTGTTTATAATGTAGAAAAGTTTATTCAAAATTGA

Protein sequence

MDPIKYIFEKPSLSGRIAKWQVLLSKYDLIYVTKKAIKGSAVANHLAAQPVADYEPMRVDFPYENIFLVEKDVIDHETWIMLFNCVSNELGHGIGAVLIFPEGKKWCKKVDGCSCWHLTAWKRFVYNVEKFIQN
Homology
[Close]
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. NCBI nr
Match: XP_022155098.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111022231, partial [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 146.7 bits (369), Expect = 5.5e-32
Identity = 67/105 (63.81%), Postives = 87/105 (82.86%), Query Frame = 0 

Query: 1    MDPIKYIFEKPSLSGRIAKWQVLLSKYDLIYVTKKAIKGSAVANHLAAQPVADYEPMRVD 60
            MDPIKYIFEKPSLSGRIA+WQVLLS+YD++YVT+KAIKGSA+A++LA QP+ +YE M+ D
Sbjct: 1285 MDPIKYIFEKPSLSGRIARWQVLLSEYDIVYVTQKAIKGSALADYLAQQPINBYEAMKFD 1344

Query: 61   FPYENIFLV--EKDVIDHETWIMLFNCVSNELGHGIGAVLIFPEG 104
            FP E I  +  +++ +D + W M+F+  SNELGHGIGA+LI P G
Sbjct: 1345 FPXEYISTITTDEENLDPQAWTMMFDGASNELGHGIGAILIXPXG 1389

[Close]
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. NCBI nr
Match: XP_022150030.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111018303 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 146.4 bits (368), Expect = 7.2e-32
Identity = 67/106 (63.21%), Postives = 89/106 (83.96%), Query Frame = 0 

Query: 1    MDPIKYIFEKPSLSGRIAKWQVLLSKYDLIYVTKKAIKGSAVANHLAAQPVADYEPMRVD 60
            MDPI+YIFEKPSLSGRIA+WQVLLS+YD++YVT+KAIKGSA+A++LA QP+ DY P++ D
Sbjct: 1015 MDPIRYIFEKPSLSGRIARWQVLLSEYDIVYVTQKAIKGSALADYLAQQPINDYIPVKFD 1074

Query: 61   FPYENIFLV--EKDVIDHETWIMLFNCVSNELGHGIGAVLIFPEGK 105
            FP E I  +   ++ +D +TW M+F+  SNELGHGIGA+LI P+G+
Sbjct: 1075 FPDEYISTITASEESLDPQTWTMMFDGASNELGHGIGAILISPKGE 1120

[Close]
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. NCBI nr
Match: XP_022158986.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111025431 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 146.4 bits (368), Expect = 7.2e-32
Identity = 67/106 (63.21%), Postives = 88/106 (83.02%), Query Frame = 0 

Query: 1    MDPIKYIFEKPSLSGRIAKWQVLLSKYDLIYVTKKAIKGSAVANHLAAQPVADYEPMRVD 60
            MDPIKYIFEKPSLSGRIA+WQVLLS+YD++YVT+KAIKGSA+A++LA QP+ DY P++ D
Sbjct: 1219 MDPIKYIFEKPSLSGRIARWQVLLSEYDIVYVTRKAIKGSALADYLAQQPINDYIPVKFD 1278

Query: 61   FPYENIFLV--EKDVIDHETWIMLFNCVSNELGHGIGAVLIFPEGK 105
            FP E I  +   ++ +D +TW M+F+  SNELGHGIG +LI P+G+
Sbjct: 1279 FPDEYISTITASEESLDPQTWTMMFDGASNELGHGIGGILISPKGE 1324

[Close]
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. NCBI nr
Match: XP_022714561.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111274201 [Durio zibethinus])

HSP 1 Score: 145.6 bits (366), Expect = 1.2e-31
Identity = 64/103 (62.14%), Postives = 87/103 (84.47%), Query Frame = 0 

Query: 1    MDPIKYIFEKPSLSGRIAKWQVLLSKYDLIYVTKKAIKGSAVANHLAAQPVADYEPMRVD 60
            +DPIKYIFEKPSL+GRIA+WQV+LS+YD+IYVT+KAIKGSA+A  LA + V DYEPM++D
Sbjct: 1405 LDPIKYIFEKPSLTGRIARWQVMLSEYDIIYVTQKAIKGSAIAEFLADRAVEDYEPMKLD 1464

Query: 61   FPYENIFLVEKDVIDHETWIMLFNCVSNELGHGIGAVLIFPEG 104
            FP E++  +E++ +  ++W M F+ V+N LGHGIGA+LI P+G
Sbjct: 1465 FPDEDVMAIEENELVEKSWXMYFDGVANALGHGIGAILISPDG 1507

[Close]
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. NCBI nr
Match: XP_017408779.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC108321519 [Vigna angularis])

HSP 1 Score: 145.2 bits (365), Expect = 1.6e-31
Identity = 67/105 (63.81%), Postives = 87/105 (82.86%), Query Frame = 0 

Query: 1   MDPIKYIFEKPSLSGRIAKWQVLLSKYDLIYVTKKAIKGSAVANHLAAQPVADYEPMRVD 60
           MDPIK+IFEKP+L+GRIA+WQVLLS+YD++YVT+K++KGSA+A +LA QP+ DY+PM+ +
Sbjct: 636 MDPIKFIFEKPALTGRIARWQVLLSEYDIVYVTQKSVKGSALAEYLAHQPINDYQPMQPE 695

Query: 61  FPYENI---FLVEKDVIDHETWIMLFNCVSNELGHGIGAVLIFPE 103
           FPYE+I   F   K   D ETWI+LF+  SN +GHGIGAVLI PE
Sbjct: 696 FPYEDIMALFKEGKKYRDEETWILLFDGASNMMGHGIGAVLISPE 740

[Close]
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3UK42|A0A1S3UK42_VIGRR (uncharacterized protein LOC106766069 OS=Vigna radiata var. radiata OX=3916 GN=LOC106766069 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 140.6 bits (353), Expect = 2.6e-30
Identity = 63/107 (58.88%), Postives = 89/107 (83.18%), Query Frame = 0 

Query: 1   MDPIKYIFEKPSLSGRIAKWQVLLSKYDLIYVTKKAIKGSAVANHLAAQPVADYEPMRVD 60
           MDPIKYIFEKP+L+GRIA+WQ++LS+YD++YVT+K+IKGSA+A +LA QP++DY+PM+ +
Sbjct: 12  MDPIKYIFEKPALTGRIARWQMILSEYDIVYVTQKSIKGSALAEYLAHQPISDYQPMQPE 71

Query: 61  FPYENI---FLVEKDVIDHETWIMLFNCVSNELGHGIGAVLIFPEGK 105
           FP E+I   F+  K+  + + W +LF+  SN +GHGIGAVLIFPE +
Sbjct: 72  FPDEDIMALFVENKEDKNEKAWTVLFDGASNVMGHGIGAVLIFPENQ 118

[Close]
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A151SNR1|A0A151SNR1_CAJCA (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 OS=Cajanus cajan OX=3821 GN=KK1_002662 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 139.0 bits (349), Expect = 7.6e-30
Identity = 64/106 (60.38%), Postives = 87/106 (82.08%), Query Frame = 0 

Query: 1   MDPIKYIFEKPSLSGRIAKWQVLLSKYDLIYVTKKAIKGSAVANHLAAQPVADYEPMRVD 60
           MDPIKYIFEKP+L+GRIA+WQ+LLS+YD+IYVT+KA+KGSA+A +LA QP+ DY+ M+ +
Sbjct: 227 MDPIKYIFEKPALTGRIARWQMLLSEYDIIYVTQKAVKGSALAEYLAHQPIEDYQSMQCE 286

Query: 61  FPYENIFLV--EKDVIDHETWIMLFNCVSNELGHGIGAVLIFPEGK 105
           FP E+I  +  E++ I+ E W +LF+  SN LGHGIGAVLI P+ +
Sbjct: 287 FPDEDIMTLFDEEESINEEKWTLLFDGASNALGHGIGAVLISPKNQ 332

[Close]
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3EBP9|A0A1S3EBP9_CICAR (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC105852327 OS=Cicer arietinum OX=3827 GN=LOC105852327 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 138.7 bits (348), Expect = 9.9e-30
Identity = 65/106 (61.32%), Postives = 84/106 (79.25%), Query Frame = 0 

Query: 1    MDPIKYIFEKPSLSGRIAKWQVLLSKYDLIYVTKKAIKGSAVANHLAAQPVADYEPMRVD 60
            MDPIKYIFEKP+L+GRIA+WQ+LLS+YDL+YVT+KAIKGSA+A +LA QPV DY+ M+ +
Sbjct: 897  MDPIKYIFEKPALTGRIARWQMLLSEYDLVYVTQKAIKGSALAEYLAQQPVEDYQSMQCE 956

Query: 61   FPYENIFLV--EKDVIDHETWIMLFNCVSNELGHGIGAVLIFPEGK 105
            FP E I  +  E +  D E W ++F+  SN LGHGIGA+LI PE +
Sbjct: 957  FPDEGIMTLFEENESPDKEKWTLVFDGASNALGHGIGAILISPENQ 1002

[Close]
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3EHD5|A0A1S3EHD5_CICAR (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC105852935 OS=Cicer arietinum OX=3827 GN=LOC105852935 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 137.1 bits (344), Expect = 2.9e-29
Identity = 64/106 (60.38%), Postives = 83/106 (78.30%), Query Frame = 0 

Query: 1   MDPIKYIFEKPSLSGRIAKWQVLLSKYDLIYVTKKAIKGSAVANHLAAQPVADYEPMRVD 60
           MDPIKYIFEKP+L+GRIA+WQ+LLS+YDL+YVT+KAIKGS +A +LA QPV DY+ M+ +
Sbjct: 869 MDPIKYIFEKPALTGRIARWQMLLSEYDLVYVTQKAIKGSTLAEYLAQQPVEDYQSMQCE 928

Query: 61  FPYENIFLV--EKDVIDHETWIMLFNCVSNELGHGIGAVLIFPEGK 105
           FP E I  +  E +  D E W ++F+  SN LGHGIGA+LI PE +
Sbjct: 929 FPDEGIMTLFEENESPDKEKWTLVFDGASNALGHGIGAILISPENQ 974

[Close]
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3DZT2|A0A1S3DZT2_CICAR (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC101490564 OS=Cicer arietinum OX=3827 GN=LOC101490564 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 136.3 bits (342), Expect = 4.9e-29
Identity = 66/106 (62.26%), Postives = 87/106 (82.08%), Query Frame = 0 

Query: 1    MDPIKYIFEKPSLSGRIAKWQVLLSKYDLIYVTKKAIKGSAVANHLAAQPVADYEPMRVD 60
            MDPIKYIFEKP+L+GRIA+WQ+LLS+YDL+YVT+K+IKGSA+A +LA QPV DY+ M+ +
Sbjct: 1029 MDPIKYIFEKPALTGRIARWQMLLSEYDLVYVTQKSIKGSALAEYLAHQPVEDYQSMQCE 1088

Query: 61   FPYENIF-LVEK-DVIDHETWIMLFNCVSNELGHGIGAVLIFPEGK 105
            FP E+I  LVE+ +  D E W ++F+  SN LGHGIGA+LI PE +
Sbjct: 1089 FPDEDIMNLVEEIESSDKEKWRLVFDGASNALGHGIGAILISPENQ 1134

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_022155098.15.5e-3263.81LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111022231, partial [Momordica ch... [more]
XP_022150030.17.2e-3263.21LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111018303 [Momordica charantia][more]
XP_022158986.17.2e-3263.21LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111025431 [Momordica charantia][more]
XP_022714561.11.2e-3162.14LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111274201 [Durio zibethinus][more]
XP_017408779.11.6e-3163.81PREDICTED: uncharacterized protein LOC108321519 [Vigna angularis][more]
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. TAIR10
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_3G019980 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
tr|A0A1S3UK42|A0A1S3UK42_VIGRR2.6e-3058.88uncharacterized protein LOC106766069 OS=Vigna radiata var. radiata OX=3916 GN=LO... [more]
tr|A0A151SNR1|A0A151SNR1_CAJCA7.6e-3060.38Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 OS=Cajanus cajan OX=3821... [more]
tr|A0A1S3EBP9|A0A1S3EBP9_CICAR9.9e-3061.32LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC105852327 OS=Cicer arietinum OX=... [more]
tr|A0A1S3EHD5|A0A1S3EHD5_CICAR2.9e-2960.38LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC105852935 OS=Cicer arietinum OX=... [more]
tr|A0A1S3DZT2|A0A1S3DZT2_CICAR4.9e-2962.26LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC101490564 OS=Cicer arietinum OX=... [more]
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_3G019980.1CsaV3_3G019980.1mRNA


Synteny
The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CsaV3_3G019980Cucumber (Gy14) v2cgybcucB117
CsaV3_3G019980Cucumber (Gy14) v1cgycucB006
CsaV3_3G019980Wild cucumber (PI 183967)cpicucB144
CsaV3_3G019980Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cuclsiB231