CsaV3_3G017950 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

NameCsaV3_3G017950
Typegene
OrganismCucumis sativus (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr3 : 13654764 .. 13664109 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGCAACAAATCCACCACACAGTGAAGTTAAGTCAATTTCTGCATAACACTATGTACAGTTTGTGTAACGACCCAACTTTTCGGAGACAGAGACGATTAGGACGGGGCACGGCGACGCAGATCTGGGTCAGCCGCCGCGTGACCTCTGCCCAGCACCGCCGCGCGACCTCTGTCTCCGCGTCGTTACCCAGATCTGCGTCGCCGTGCCCCGTCCTAATCGTCTCTGTCTCCGTCGAAGCCACGGTTCTGCAACCGTCTCCGCCGGTTCTGTCTTCGTGAAGCCCTGCCGCGCAACCTCTGTTTCGAGCCGCCGCCCATTCCGTTCTCCTCTGTTTTCTGCACTGCGCGCGACTCTCCGACCGCGTCAGATCGTTGATCGATTTTGAGGCAGCCGCCACGTCTCCTTTGGCCGACCGCTGACCGACCCACACTTAGGATTTTTGCTGCGAGTCCGACAGTCGTGCGTTGAGGTGTGCTGCTGTCTCTGTTTTACAATTTTATCGAGGTTGCTTTGTTGGTAACAACTTAAGTATGAATGGTAATTGGTTTCAAAGTGGTTCAAGTGTTATGGTTGGAATGTTTAGCTAATTTGTTAATTGGTTCTTGAAGGTGTTGGGAGTAACGTTGGGCTCCCTTAAATTCACAACCAATTTGTGAATTGTTGAGGGTTCAGTTCGCCAATATATCGGTGAGTTGGAACTTACGTTGAGGAAAGTAAGTGAGATATGTATCGTGGAAGTAATTGAATTTTGTGTTGTTGTGCTTAGGATTGTTTCGAGGACGTTAGTTGATTAAGGAGCTTCCCCAACTTTGAGGTAAGGGATTTTCTACTGGACTCACCTAAAGTTTTTGAGTTGTGTTGGACTGTATGGATGATGATTAAGATGTACATGTTTGATTGCAGACTAAATGTTTAGTGTATGTTGTATTTGACTGGAAACATATATATATACATTGATGTGTGAATTGATGTGGATTGCCGAAAGTATACATGTGAATGACTGAAATTATGCTTATGTGTACATGATGATATTAATAGATTGTGCTGTATAAAGATTGGATGTGAACTAGTGAATTTGTTTCGGTTGGATGTGGATTATACTGAACTGTGGTTTGTGCTGGTGAACTGAGGGGTGTATTGACTTGACTGTATAGTGGATTGACTGATGTATTAGCATATTATTGACAGACATATATGATTGTAGTAAAATAAGTTGACTGTTAGGATGTTGAAAGAAAGGACTTTGTGATTTGAAGTAACTGAAAGATGGGTTGAATGGAATGAGGGGATAAATTGTTAGGTTGTATTGGGATGTTTACCTTGTAGGTGTCCCACGGGATCACCAATTTATTTTGCACCTTCGGGAGCATTTGACTGATATGTGTTTCTGCAGAACACTAGACTGATATGTACGTCCCTCGGGGCGTTAGACTGATATGTACGTCCCTCGGGGCGTTAGACTGATATGTACGTCCCTCGGGGCGTTAGACTGAGATGTGTATCCTACGGGATCACAAGACTGCGACTGTACAGGGTGTCCCAATAGAACTTTAACAATTTATTTTCCCCTGACGAGACCAGTAGAGGGTCTCTTACTGAGTATTGTTATACTCACCCTTCTTATGTTTAATTTTCAGGCAAAGGAAATAAAGGTGGCAAACCGGCGAGGGGCAGGAAGGAAGCGTGATTGCCATAGGGAATGTGTTATTTTGCTTCCGCTTATGATTTCTTTTAAGGTTTAAGATGTACTAAAACTTAGTTTACAAACTTTTATTTGTAAATAGTGTTATTGTTAAGTTTTATTGAATATTTGAAAATCAGGCCTGACATGTTTTGTTTTTAAATTGACTTATGTTTCAATTTGTATCAATCAAAGTTTATTTGTTAAAAATTAACGACCTCGACTTACCCAGAAAAGTTGGGTCGTTACAGTTTGAATGGACACACTAAGCGTGCGAGATTCCTCAGCAAGAACCTTCAGAACCCAAGATGTCATAACATGAGAAGAATCAACCCATCAAAAGGTAGAGGAACATCTGAAGACGAGGGTGTTGGATCGGTATGGCAACCATAGAGGGGGTGAATAGGGTTTAAATAAACTTTTTGACAAATAAAAAGTAAAATCAACTAATTAAATACTTTTTAAATTTAAATAAAGAACTTTGTAAACTTTGTTAAATAACAAGATTGATAAAAATATATGAACGGAAGTATGCAATCAAACTCAACCAATAAGAATATGTAACTAAAATTAAATTAAAAAATAATTGGAAAAGAGTTAGAGAAGAAGACATCGTAATTTTATAGTGGTTCGGTTAAACTCAACCTACATCCACTTTCCCAAGCACCTCTTGGGATTTTGATTGAAAATCTTCTTTGGACTCTTTCCACGGATTTGAGCCGAACCGATTCTTGCTCCTTTTTCGGGTTCAAGAGTAAACCCGATCCTTTCCACGGGTTAGGATCCAACCGTTACAATATGTTGAACTTTTTAAATCACACAAAAGAAAACTCTCTAAAAGAGTGAGTATACAATTTGAAGCTCACAAATTTAATCCTCACAATACAATAAGAAGCTCTCAAGAATAAGATGAAAAGAATAAAAATTGGAAGCTTTAGAGAGAATAACAATGTTAGCTTTTGCTTGAGGATTGTAAAGATTTAATGATCTTGTCTTTTAAAATTTGGGAAAAGTGAAGTATTTAAAAAGAGAGGAAAGATAAATTTAAAACCATTTTGGGTCATTAGATATAAGTAAAAGAAAAATGAATGGTTGAGATTTAAACTTAATTAGCCGTTAGACACAATACAAATAATAATATAATAATATGTCTTTTCAAAATATTTTGTTTAAAAAGAAACCAATAAAACAACTTCACCATCTTTTAAAAAAACTAGCCGTTAGACACAAGGAAAGATAATAATATTAAAGTCATTTTCTTTTTAAATTCATTTTCTTTATAAAAGCCAATAAAACATAACAAAGAACCACATTTGTTACTCCTTCATTGCTCCAAGTGGCTTTCTCTAATTGGTTCAAATTGAATGCTTGGTCGCCACGTCACCATCTCGGGTATTTTTTCGTTAAGCTTCTTTTAGCAATATTTTCTTCATTTGAACTTCGATTTGCGTGATTCAAGAGGCGTTAGAATCATTTTTCCAAGATCTACGATATGATCTATTCAAATTAATAAAATTGTCAATAAAAAAATCAGATTTGTTATCATCAAAACATAAACTAATTGAATAATTAAAATAAATTAATTTGAGATTAAGGGCCAAAAAGCCAACAGAGGGCTGAGAACCACCTTGAGTAGAACGAAAGGAAGATGATAAATCAGGGACATGAGACCCTTGATAACATAAAAAACATAGTCATTGTCTTAAGTTCCATGCCAGAAATGTCGGCAGTAGAGAGGATAGATGAGTGTTGGGATAGTAAAAACACATGAAGGAGAAGGAAAAAACAAATAGAAATATTAATTCCAAAAGTATCAATGTGACGCAACAAATGTTTAAAAACAAAATCCCCCACACCTATTGGAGAACCACTACCAATTAGGTAGATTAATTAAGCAAGGGAAGTAGAGGTAGTAGAAGCATGAGTCGAGGGGTACCAATTAGCAATGCCTATCTTTATGTAAGATGACATACTTAACGTTCAATAAAGCAGCATGTAATTGGCCATCTGACGACCAAGAATGGATCATGCCCCCAGACACTACCATATTTGTAAGAAAAAGACTTTTGATGAATGCAATTTGAAATCTCATTTTGAGACTTTTTACTTAATTTGCAATTCTTGTGATAGAATGCATGTGGACCATTCAATCTAAATATAATCAAGTTTGATTGTGGAGTGACTCAATTTAGAACAAGAATTTCAAATCTTGCTTCTAGATCTTTGATCTAAGAGATAATCTAATCCTAACTTTCTCTTGGTTGATCTAAATTAGTATAAGGAGGTGTTAGTTTCTTATTTCAAAGGTTCTTGCTACATTAATAGCTTGGATCTTTGAACCGAGAATCAAGATTACCTTATCATTTTATATCAGAGCATAGGTTGCATCTTTGTGGCCTACTCTAGAATTGATTTTATCTTTCTTTCTTACAAACTTTTAATTCTAGTTTTTGATTTCATCTTATCATCCATTGTTCTTCGTACCTTTATCTTATTTCCATCCTATTACACTTTACATATTAAAAAAATGTTGCAAAGAAAAGTAGAAAAAAAAAGTCGAGAAGAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAGAGAAGAAGAAAAAAAAGTTGAGAAAAAAATTGTTCTTACAATTAATAATATACAAATTGTGTGATTAATGTTGAGTTTGTAATCAAATTTTGCATAATTGAGTTCTTACAATAACTCTTTCTATGTTTCTACCATTTTCTAGGTCAATTGCATGATCATTTGAATGTCTTTTCACATTTCTATCATTAATTGTTGAAGACTTTCAAATCTGTGACTTTTAAACTTCTTTCCTATCTTTTATTTTCTTTCTCGTTGCAAAGGATCAAATTTTACTTTGCACCCTTCAACAAACTTTTAGATCAACCTCTTATCTTTAACTTTTAAGAATGAGAAAATTCATTGCTTAAAACCTTTCTATGTGCAATTCAATTTAGGTGTTCAGTTTCATCCAAAAATTGTGTTTTTCCTTATTTGTTTGAACCTTTAATTTCTTTTTTTGTTTTTTTGTGGTTGCCTTCATAATTATCTTGTCTTTCTTATATTGAATAACTTATTATTTCAAGGATTGCTTAGGCCTACCCAATATCATAATTTAACCACTTTCCCAAATATATTAGTGTGCAAACATGAGTGTTCCTAATTGAACAAACAATGAGTTAAGTGTGTGAGATCCTTTTTAGTTAGAGATAATGTTTTATCAAGAAAAAAATTGTTGTCTTGCCTACAACTATGATGCTCAATTTTGGAAGACTTTACGAGGTGAATTGGTAGACATACAAAAATCCACCTA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mRNA sequence

ATGAAGCAACAAATCCACCACACAGTGAAGTTAAGTCAATTTCTGCATAACACTATGTACAGTTTGTGTAACGACCCAACTTTTCGGAGACAGAGACGATTAGGACGGGGCACGGCGACGCAGATCTGGGTCAGCCGCCGCGTGACCTCTGCCCAGCACCGCCGCGCGACCTCTGTCTCCGCGTCGTTACCCAGATCTGCGTCGCCGTGCCCCGTCCTAATCGTCTCTTG

Coding sequence (CDS)

ATGAAGCAACAAATCCACCACACAGTGAAGTTAAGTCAATTTCTGCATAACACTATGTACAGTTTGTGTAACGACCCAACTTTTCGGAGACAGAGACGATTAGGACGGGGCACGGCGACGCAGATCTGGGTCAGCCGCCGCGTGACCTCTGCCCAGCACCGCCGCGCGACCTCTGTCTCCGCGTCGTTACCCAGATCTGCGTCGCCGTGCCCCGTCCTAATCGTCTCTTG

Protein sequence

MKQQIHHTVKLSQFLHNTMYSLCNDPTFRRQRRLGRGTATQIWVSRRVTSAQHRRATSVSASLPRSASPCPVLIVSX
BLAST of CsaV3_3G017950 vs. NCBI nr
Match: KGN57470.1 (hypothetical protein Csa_3G193880 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 1.7e-33
Identity = 76/76 (100.00%), Postives = 76/76 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 1  MKQQIHHTVKLSQFLHNTMYSLCNDPTFRRQRRLGRGTATQIWVSRRVTSAQHRRATSVS 60
          MKQQIHHTVKLSQFLHNTMYSLCNDPTFRRQRRLGRGTATQIWVSRRVTSAQHRRATSVS
Sbjct: 1  MKQQIHHTVKLSQFLHNTMYSLCNDPTFRRQRRLGRGTATQIWVSRRVTSAQHRRATSVS 60

Query: 61 ASLPRSASPCPVLIVS 77
          ASLPRSASPCPVLIVS
Sbjct: 61 ASLPRSASPCPVLIVS 76

BLAST of CsaV3_3G017950 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0L680|A0A0A0L680_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G193880 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 1.1e-33
Identity = 76/76 (100.00%), Postives = 76/76 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 1  MKQQIHHTVKLSQFLHNTMYSLCNDPTFRRQRRLGRGTATQIWVSRRVTSAQHRRATSVS 60
          MKQQIHHTVKLSQFLHNTMYSLCNDPTFRRQRRLGRGTATQIWVSRRVTSAQHRRATSVS
Sbjct: 1  MKQQIHHTVKLSQFLHNTMYSLCNDPTFRRQRRLGRGTATQIWVSRRVTSAQHRRATSVS 60

Query: 61 ASLPRSASPCPVLIVS 77
          ASLPRSASPCPVLIVS
Sbjct: 61 ASLPRSASPCPVLIVS 76

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN57470.11.7e-33100.00hypothetical protein Csa_3G193880 [Cucumis sativus][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
tr|A0A0A0L680|A0A0A0L680_CUCSA1.1e-33100.00Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G193880 PE=4 SV=1[more]
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_3G017950.1CsaV3_3G017950.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None