CsaV3_2G010290 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGGAACCCCCCCCCCCCCCCGTCTACAACACCTCCGTTCTCAAATTATGATTCTTCAACACTGAAGGAATCAAAATTATGCTGAAGAGAGTAGGAAATATGAACATCTTTGCTCTCACTTTATGTTTTTGCTTCTTCCTTCCCTTTCTCCATGCAAGACCCCAAGATAATGGCGGATTCTCTCACTCAGAACCCACTAATTGGACTAACAGGAAAATAGTGGACGCCAAAGGAGCACCTCAATCTCTGATTTGGGTGGTTCAGCTCTCTGATCTCCATTTCAGTGTTCACCATCCCAACAGAGCTCTCCAATTCAGGGACTTTGTTGGGCCTGCTCTTGCTATGATCAATCCTTCCCTCGTTCTTATTACCGGTGATCTCACAGGTTCTGCTCTCTCTGTTTTCATTTTATGTATATTCATCTTATTCTATGATATTTCTGTCTTGTTTTCCTCTTTTTGTTTGACTTTTTATATATTGTTCGTAGTATCATGCCTCTAGAGTCATAGGCTTGGTGGTTGTTTCTGCTGGTCGTAGTCTTCATAACTTCTCAGCTTGTGGTAAAACTTTATTGTTAATTGCTTTCATTGGAAAGTTTCTTACTATTTCTTCTGGTTCATTTCTCTTTTTTGATGATGGCTAAAGCCTAAACATTACAAGAGTTCTGGGACCTTGTCATAGAATCTACTGGGATTCTTCAACCTGAAACTCAGAAAATCTCAACAAACGCAAAGAACCGAGACAATCTCTGATATATGTATAGTATTGAAAGTAAATCCAAGAGTCTCACAATATAATGTTAACCAAAGAACAATACAAACGATAAGGAAATAACAATAACAGTAAGCAAATGATAAAAATCCCAGCTCCTTCGAGAAGGCTGGAGCTGGTGGCTTCTCCTTCTAAAAGCTCACAGCAGCTTTTTTACCAAATAAAACCTACTTTCAGCAATCCCCAAAACATTCCTTAAATACAAACATCAGGGTCCCCTCATCCTCATCCGTTTTCTCCCTCTCCAATGTCCTTCCAAGAGCTGTCTTTTGTGCAATGCCCATCTTACCCTTGCGTTTATAGGTATGGATGTTATAAGGGTTGTAGCAGAATCTCTTTTCATTTTAATCATTTTTGAACGAGCTTAAAGCTCAAGGGAGGGATAAACCATAATGAGAAATATAAACAGGGAGATAATGACCTATGCATAACATAATAACAAATGACCAGCTATAAGTGATGCAAATGGTCAAAACGTAAAGAAAAATATTCAATGAAAATTGGTAATAACTGCATCATGGTTTATGATATCTCCTACATCACGTCATCACCAAACATGTTCAATTATACTTACCAATGAGGATAAATGAGCCTACGATTATTTTCTTTTCTTTTACTTTTTGTTTTTTGCATTCATCTTACAGTTCTTAATGGTAAAAATTAGAAATAGGACCTTGAATTTTTTATTTGCATGATATGGTAGGTTGAATGCAGATTTTGAGTAGCACTAGTATCACTAAGGAATGTGGACTCCAGCTATCTTATTCACACTACTAACCCTATCTACTGTAGAAACTTGATCTTCCTAATCCTTTAGAAGTCACAAACGATGTCAAAAAGATGTTACAACCTTTGAGATTTTTCGTATATTTATCAGATGGCAAAAGTAAGGACTTGTTAACAATGATACAAATTGAGGAGGAATGGATTGAATATCAAAATGTAATGGAAGAAGTTATAACAAGAAGTGGACTAGATAAAAGCATCTTCTTTGACCTCAGAGGAAATCATGATAAATTTGGTGTTCCAACTGTTGGTGGTTCGTTTGATTACTTTTCAAACTATAGCATCAGTGGGCAGCTGGGAAGAAATGCAAATGTGTATAGTGTCACTCTTCAGGTTAGTTATTATCTTTGATGAGGTTTGTGGTGAGTACATGTACTTGTATTATCATTGTTCTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAAACCAGACTCTTTATTGATGATAATAAACATAAAAGTACAAAAGGTTTATACAAAGAGCTAAACAAAAAGAGACCATAGGATCAGTAGGCGCTCTGACATCTCAACTAGGTTGACGCCCCCATTACTGCCCTCATCATATCCAACAAAAATACAGCCTAAAGATAAGTTCTTTCAGGAATCCAACAAGCATGTGCTGTAAAGCGAAAAAACCAAAACAACATGGAAAAAACAGCAGCAGCACAAAAGAGTAGACAATAATCTTTCGGTGATGACTGCAAAACATGATTTATAAAGAAGATAGCTAAGAAGCACGGACACTTCAGTTTGGATAGTGTGTCGGTGTTCGACATGTGTCGGACACTTGGACACTCTGACACTTGGTGGTCACCTATTGGACGTTTGGTAATCCAACAAATGTATTAAACATGCATAGAACACTTATTGAGTAGACTAAAAAGACATGACAATAATAATAACTTTTGAGCATGAAATACATCAAGCTAAGTCTTTTAAGCATATAAATGCATCAGTTCATTTACTATGAATTTTCTTTTACTATAAAAATGATATATATTTTAAAAATGAATATTTTAATAAACGTGTCCTTGCCCTTGCCCTGTTGTGTCCTAGATTTTTAAAATATGGTGTGTTGCTGTGTCCGTGTCGTATTTGTGTCTCGTATCCATGTCCGTGCTTCTTAGGAAGATGGTTACTAATGGTCTGGAAAAATGAGGACCTGGCAACTGAGACTAATTTCTTGGATGGAGAATGCTTCAAAGTCTTTGTGTAGAATACACCTAGCCGCAATGTTCCTATTAGCTATCTCAAAGTGTTCTAATTAATACATTTCCTTATTGTGGAAGATTCTTTGGTTTTGTTCAAACCAAATATCTGCAAACACAGCCTTTGATAAGTTTGCCCAAATTAGTCCCAGTTTTTTCTTTAAAATGGTCCCCAACATAACTTGATGTACATTTAGGTTAAAAGGTTCTCCAAAAATCCAATCTACTTCAAAATTGAGAAGAACTTCCACCAACAATTTGCAGAGTAGGAACAAGTAAAAAACAGATGCTGTAAATCTTCTCCTTCTTGCTTGCACAGTGGGCATCTCGAGGGTGATAAGCAGCTATTCGGTAACTTTCATTGCATGACTGAAGAGCAATTCAGGAGTCCAGAAATCATAACCCATTTGAGGATGTATTATCATTGTTCTCTAATATAGTCCTCCTTTTGTAGACTGAGGAAACTACATCCTCTCAGGTCATGGTAAGAATTATGGAATAAATAAGGCAGCCTTGTCAGAAGATTGAACTTACTCTTTGCCAAGCACATCAAGTATTTGACCTTCCAACAACCTCTATTATCCATTTTTTTTAATAGGAAACAACAACATCTGTTATCCTATAAATCTATCCCACAAGAATTCTTAAATTTTACTTTGGCATGTTAGACAGTCTTGTGTTCATAATGTATTTCAAGTGAACTACCATGTGTACACATGGAATATTTTGGTATACTAAGAACTCTTATATTTGGGTGTCCTTTTAAGTTGAGCTTTTTGGGGCTAGAAATGAACACTTACAATGCCAGGTATTTTTTTTTTTGAAAAGGATACGAGTCTCAATATTATTAATAATGAAAATAGAGAGACAAAGCTCAAAGTACATGAGGGACATACAAAAAGCAAAGGGGGAGGGGGAGGATCAGCAGGCGCACCCAGACATTTCAACTAGGTTGACACCCCCTTAGCTCCCTCATCACATCCATAAGCGAAATAAAAACCCACATAGTCATTTAAATAAAAGCAATACAACAGAACAATAACAAAATAAAGGCCACAATACAATGCCGGATAATTATGGACCAGTCACGTTCAAGAAGTAAAAGGTTTACTTATTTTTGGGTGAATGGGGATTTATGCACTTTAAAATTGAAACCTCATCGTTTGAACTGTAAATTAACGTACTTAATTTACTATAAGTGCAAAATTGCAACACTCATGTAAAATTGCTCTTCTTGGGGTTTATTTATTAACTTTATATATATACATTGCCAAACAATGTAATTTTGTGTATTTCACAAAGAGAGAAGGATTTTCTTATATAGAAGAACAACCCACTAAAAAGGAAAATGTAATGGGTTGTTCTTCTATCAGTCCCACTACTGCATTTGGAAAGAGGAAGATAGTTGTTTCACTGAAGATGTGGAAGCCTGCAGAAGCATTTCTATTTTCGTTAGCTAACTCGGATGGACTCAGTCAGTAATCTCTGATTTACTCAGAACTCTGGTGGACAATTATTTCAAAAAATTCAGGGACATTGACAAAGGAAGATTGAGAATTTCGAAGTTTCAAGCAAAGTCTAGATGGATCCTAAGCTGCAATCACTGGCCATATTCAAGGGGTCTTTTCAGTATTAGAGTTTGCTCAGGAAAAGATCAACAAGGATCGTTCTTCTATCAGTCCCATTAATGCATTTGGAAAGAGGAAGATAGTTGTTTCACTGAAGATGTGGAAGCCTGCAGAAGCATTTCTATTTTCGTTAGCCAACTCGGATGGACTCGGTCAGTAATCTTTGATTTACTTAGAACTCGGGCGGACAATTATTTCAAAAAATTCGGGGACATTGACAAAGGAAGATTGAGAATTTCAAAGTTTCAAGCAAAGTCTAGATAGGTCCTAAGCTGCAATCACTGGCCATATTTAGGGGGTCTTTTCAGTATTAGAGTTTGCTCAGGAAAAGATCAACGAGGATGGAAGTCATTTTGCAAGATTCTGGAAAAATTTGTAGAGAAAATGGACTAGCTCTGGTAATATTTCCAGTTTTCCTTCTCCACAAATGGTAGAAAAGTTGAGTTATGTTGATAAGGCTAAGTCCAGTAGCTCTAAACTCCCAACTCCAAGGCCTGAAAAAATGGAAATCAGCCTGGATTTTAGTCAAAAAAGGAAGCTACAAGCAGACAATCATCCTTCCCCTCCAAAACAGAAGCAATGGTTGACCAAGAACCATGAAGTTGCTAAGGTTA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ATGCTGAAGAGAGTAGGAAATATGAACATCTTTGCTCTCACTTTATGTTTTTGCTTCTTCCTTCCCTTTCTCCATGCAAGACCCCAAGATAATGGCGGATTCTCTCACTCAGAACCCACTAATTGGACTAACAGGAAAATAGTGGACGCCAAAGGAGCACCTCAATCTCTGATTTGGGTGGTTCAGCTCTCTGATCTCCATTTCAGTGTTCACCATCCCAACAGAGCTCTCCAATTCAGGGACTTTGTTGGGCCTGCTCTTGCTATGATCAATCCTTCCCTCGTTCTTATTACCGGTGATCTCACAGATGGCAAAAGTAAGGACTTGTTAACAATGATACAAATTGAGGAGGAATGGATTGAATATCAAAATGTAATGGAAGAAGTTATAACAAGAAGTGGACTAGATAAAAGCATCTTCTTTGACCTCAGAGGAAATCATGATAAATTTGGTGTTCCAACTGTTGGTGGTTCGTTTGATTACTTTTCAAACTATAGCATCAGTGGGCAGCTGGGAAGAAATGCAAATGTGTATAGTGTCACTCTTCAGGATGGTCAAGAGAAGTACCTCTTTGTTGGATTTGACAGCACCATGTCTGTTGGTTTGAGAGGGCCATCAAATGTCTTTGGGCATCCAACTGATGAGCTATTAACTGACTTAGATTTGGAACTCTCTCAATGGGATTCATCGGCAACTGATCGAGTAACTAAGATTTCCTTTGGTCATTTTCCTCTCTCATTCTCAGCTTCCTCCCTCTCAGGAAAGAGTCTGAGAGATGTATTTTTGAAACATTCTTTATCAGCTTACTTATGCGGACATCTCCATACAAGGTTTGGCAAAAACTTGAAGAGGCATCATCATTCAAGTTCTAATTTTTTGTTGCAGAAGTTTTTCCAGTTTAATGTGCACCAAATATCTTCTGGAAGTATCACCAACTGTTCACTTGAAGCTCCACCAGTTCAAGAATTCTGGGAGTGGGAGATGGGTGACTGGAGAAAGAGTAGGGCCATGCGAATTTTGGCCATTGATGGTGGTCATGTGTCATATGTTGACATTGACTTTAAGACAGAAATTAAGAAAACTATTTTGTTACCAACATTTCCATTAGATTCACGCTTCATGTCAAGATCTTCATCACCTAATGAATATAAATGCCATTTTGTGGCTTCTTCAGCTTATGAAAATATAAGATCACTTGTTTTTTCTGTTTCTCCTATTGTATCTATGGTGGCTAGAATATATGACTCTAATCCTGGAATTCTCAGTTTGATTCTAGAAGCACCTATGAGTAGAATTCACGTAGATAATATCTCAAGAGGAGATCTTTACACTGCTCCATGGAATTACAAAGCCTTTGAAGATCCATCTCCTGATAGATATTATTTGCAAATAGAAGCAATCGATATTGCAGGAAGGTCAACTTTATCTGACTTGAGGCCATTTTCTATCAATGGTCTCACTGCAAAGGTGTCCTGGACATGGAATGAGTTCAGGGTGATGGGAGTTCAATGGGCTGCCTTATATTACCCTGTTCTCTGGTCGACTCTCTTTATAATGCTTGCAATGCTAATTCTGCCAAAAGCGATTCTTATTTTTTCGAAGAAGCAATACACTTTCAACAATTTCAAGCTCAATAAAAGCTTCCTGAATGGCATGGCATGGGTTATACAGGAGCTTAGCAAGATTCCCATGGTATGGTTCTGCATTGTAGGTTACCTAATCTACCTTATATCATTTCCATGGTTCATTGGGAAAGTCTTCACAGATGGAAAAGACTGGGGATACATGACCTATATGGGATGGGTGGTCAAAACTTCGAATGAAACAGAGAAACATAGATATATTGGTTCTCCAGATATACTGGTGGTGGTTCTTTCCCATCTTCTTTTTGTGGTTTACCCTGCTATTTTCATCATGATTGTTTTTGCTGTTGAAAGAGGAGTCTATGCGGACCATTTCCTCTCTCTTTTGGCAAAGAAAGAAGATGATTATGACTACAATAATAAGAGGTCTGAATCATTTGACTTGAAAAGCAGTGGAAGGTTTAGTTTTTGGTTTAGATGGAGGTGGATACGGAAAGTTCTTCTGATCATTTGTGCACTCGTATGTTGGAAGCATTTTTTGAATTGCAGGGTTGTTATGAAGGCTTATGAGATGAATCCTTTTCTCCACTTCCCTGTGTACTGCTTCGTAACACCATTGTTGTTGGGTTATGTTGCTTACTATACCAGAGGCATCCACTGA MLKRVGNMNIFALTLCFCFFLPFLHARPQDNGGFSHSEPTNWTNRKIVDAKGAPQSLIWVVQLSDLHFSVHHPNRALQFRDFVGPALAMINPSLVLITGDLTDGKSKDLLTMIQIEEEWIEYQNVMEEVITRSGLDKSIFFDLRGNHDKFGVPTVGGSFDYFSNYSISGQLGRNANVYSVTLQDGQEKYLFVGFDSTMSVGLRGPSNVFGHPTDELLTDLDLELSQWDSSATDRVTKISFGHFPLSFSASSLSGKSLRDVFLKHSLSAYLCGHLHTRFGKNLKRHHHSSSNFLLQKFFQFNVHQISSGSITNCSLEAPPVQEFWEWEMGDWRKSRAMRILAIDGGHVSYVDIDFKTEIKKTILLPTFPLDSRFMSRSSSPNEYKCHFVASSAYENIRSLVFSVSPIVSMVARIYDSNPGILSLILEAPMSRIHVDNISRGDLYTAPWNYKAFEDPSPDRYYLQIEAIDIAGRSTLSDLRPFSINGLTAKVSWTWNEFRVMGVQWAALYYPVLWSTLFIMLAMLILPKAILIFSKKQYTFNNFKLNKSFLNGMAWVIQELSKIPMVWFCIVGYLIYLISFPWFIGKVFTDGKDWGYMTYMGWVVKTSNETEKHRYIGSPDILVVVLSHLLFVVYPAIFIMIVFAVERGVYADHFLSLLAKKEDDYDYNNKRSESFDLKSSGRFSFWFRWRWIRKVLLIICALVCWKHFLNCRVVMKAYEMNPFLHFPVYCFVTPLLLGYVAYYTRGIH
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. NCBI nr
Match: XP_011649029.1 (PREDICTED: putative metallophosphoesterase At3g03305 [Cucumis sativus] >XP_011649030.1 PREDICTED: putative metallophosphoesterase At3g03305 [Cucumis sativus] >KGN61332.1 hypothetical protein Csa_2G084270 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1526.9 bits (3952), Expect = 0.0e+00 Identity = 747/747 (100.00%), Postives = 747/747 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. NCBI nr
Match: XP_008441771.2 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: putative metallophosphoesterase At3g03305 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1434.5 bits (3712), Expect = 0.0e+00 Identity = 702/747 (93.98%), Postives = 722/747 (96.65%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. NCBI nr
Match: XP_023520912.1 (putative metallophosphoesterase At3g03305 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1343.2 bits (3475), Expect = 0.0e+00 Identity = 650/747 (87.01%), Postives = 696/747 (93.17%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. NCBI nr
Match: XP_022997019.1 (putative metallophosphoesterase At3g03305 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1336.2 bits (3457), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/747 (86.35%), Postives = 695/747 (93.04%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. NCBI nr
Match: XP_022933168.1 (putative metallophosphoesterase At3g03305 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1322.8 bits (3422), Expect = 0.0e+00 Identity = 643/747 (86.08%), Postives = 691/747 (92.50%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. TAIR10
Match: AT3G03305.1 (Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein) HSP 1 Score: 820.1 bits (2117), Expect = 1.1e-237 Identity = 402/706 (56.94%), Postives = 517/706 (73.23%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q0WVZ1|Y3330_ARATH (Putative metallophosphoesterase At3g03305 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g03305 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 820.1 bits (2117), Expect = 2.0e-236 Identity = 402/706 (56.94%), Postives = 517/706 (73.23%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q8BXJ9|TMM62_MOUSE (Transmembrane protein 62 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tmem62 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 5.3e-35 Identity = 145/542 (26.75%), Postives = 237/542 (43.73%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q0P6H9|TMM62_HUMAN (Transmembrane protein 62 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMEM62 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 150.2 bits (378), Expect = 9.1e-35 Identity = 148/537 (27.56%), Postives = 245/537 (45.62%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0LKQ4|A0A0A0LKQ4_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G084270 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1526.9 bits (3952), Expect = 0.0e+00 Identity = 747/747 (100.00%), Postives = 747/747 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3B3Q9|A0A1S3B3Q9_CUCME (LOW QUALITY PROTEIN: putative metallophosphoesterase At3g03305 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485828 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1434.5 bits (3712), Expect = 0.0e+00 Identity = 702/747 (93.98%), Postives = 722/747 (96.65%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2N9FTW3|A0A2N9FTW3_FAGSY (Uncharacterized protein OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS18487 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1004.6 bits (2596), Expect = 1.2e-289 Identity = 480/702 (68.38%), Postives = 570/702 (81.20%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A061EY73|A0A061EY73_THECC (Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein OS=Theobroma cacao OX=3641 GN=TCM_025118 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1004.2 bits (2595), Expect = 1.5e-289 Identity = 485/746 (65.01%), Postives = 592/746 (79.36%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010290 vs. TrEMBL
Match: tr|M5W891|M5W891_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_6G364500 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 991.1 bits (2561), Expect = 1.3e-285 Identity = 477/714 (66.81%), Postives = 571/714 (79.97%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber chineselong genome (v3)
Date Performed: 2019-03-04
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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