CsaV3_2G008470 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATGGGTTTAGGAGTCTTCAATATAGTTCCTCTCTACATCAACGAGCATACTTGGGAAATGCTGGTAAGTTATTTCTCGCTAAAAAATCTTGTTGTAGCTAATTTCTTCTCCCAAACAGCATAGTATAATACTATGACCTAACCCTTTTTAGTACTCAATAGTTTCTACTACCTTTTTGTTTAGGACGATCTTATAACTTATGATATTGTAAAATGATCTTCGCTTCATCATTTCATCATCAAGTATAATAGTTTTTCATCCTAAGTTAGATACAGCATAGGAGTTCATAAAACAAAATTTTTGTGTAGAGTGTGCTTGCATGTGCAGTGAAATGTGTTGGACATTGTGCAATTGTTCGTGGAGGTTGCTTGATGATTTACTATTTAATGCTCGAGATTATCAGGAGATGACATGTAAACAAACTGGAGCACAATTTATTTTCTTTTATTTGAAAATTTTCTATGGTTTATTTTGATCATCTGCTAAAATTCGACAACCATGTGAGAGATTCTATACTTCTTGACTTTGTCATCAGGGTATTGTTGGGTTTTAATACACTCTGGTTATATTTGCATAATCTAATTGGCATGAATTTTCCTTTTAATGAAAGGGCCACTTCATTTGCCTTAGATGCATAAGCATGTTAATTTGATGCATATTTCAATGAAATGCTACATAAAATTTGATTTTTAGGGTTGGTAAACAGTATGTTTTCATTGTTATTATTTTATTATAGAAAGTTAGTTTTAGCCAAGGTTTTGATGTTTCTCTTCATCTACAGCTCAACAGTATTGCTTCTCATCGATCATCAGAAAACATGCCAGTGTATCTTGGTGTTATCTTACTCCAAACAAGAATTTATACAACTCTTGGCACAACCTTTCCAGTGGAAAAAGGAACAGTCGGTACATTATTGTTAGGTCTGAACTTGAGAAAATGGGGACTCATGAAGCTGGTTATCCATTATCAGGTCTCTTGGAAGAATTCTGTTTCTTTCTTGTCCCGTTGCCTTTTCTTTTGACCTCTTATCATATATGTCTAATTCCAATTTTGTTTTGTTTCTTTTTAACGGCCTAAAGTGCAGAAGTACCACTGAGCTCCAAAGTCAGAGGAACGTTCTTTTATGCTACTACTGCAATCACTGCTATTTTTCTCTTTATGCTTATGCTGGTGGCGCATCCATTTGTGTTATTGATGGATAGATACCGCAGAAGGATTCATTATTCAATTGCCAAAATGTGGGCAAGTTTGACTATTGCTCCATTTTTTAGGATCAAATATGAAGGGTTAGAGAATTTGCCATCTCCCAATTCTCCTGCTGTGTTTGTTTCCAACCATCAGAGCTTTCTAGACATATATGCACTTCTTACTCTGGGCAGAAGCTTTAAGTTCATTAGCAAGACTGCAATATTTCTCTTTCCCATTATTGGTTGGGCTATGTTTATGATGGGTGTCATTCCTTTGAAGCGTATGGATAGCAGAAGCCAGTTGGTACTTTCTTTGTTTATCTGTTTCAATTCCGCCAGTTAAACCACCAATTCACCAAAAGCTTAGGCTGGTGGTTGAAGATAAATTTAATTATATATCACCAACACTCCCCTTCACTTATAGGCTTGAAATATTTGAAAGATCCAACAAGTGGAAATCGATTTTAATTCGGGAGGAAACAACAATGCAAGGACTTGAACATAGGATCTACCACTTGCTCTGATACCACCAATTCATCCAAAAGCTTAAATTGACAAATTTAATTATATGGCGCACTTTATTTGTTCAAATACAAATTTTAAATAAATTTGTTGCACCGTTTTCTCGTTGTTAAGGATGATGTTTTTGGGTTATTACTTGAAAGTTTGTTAATTTTGTAATGAAAGGACTGTCTGAAGCGGTGCATGGAGCTTATAAGGAAGGGTGCATCTGTATTTTTTTTTCCAGAGGGAACACGTAGTAAAGATGGAAAATTAGGCACTTTCAAGGTAGGTAAACATTGTATTTCAAACCATTGTAGTAGGGGGACGCAGTAGTGTCAATTTTTGGTCATGAAATCTTTACTTTCTTTCACAAACTGAGTTTGAAATATTGATTCCATTCGTAATTCTGGAGTTATAGCATTGAAATAAACAGTGCTTGTTTGGGTTGCTTTGCATGTTTTTTTATTTAATCATTTGTTTGGGTTACTTTTTGTTAACCAATATGCTTGATCATATTTAGATCTTTAGTAAGCTTATTGTATATATGAAGTTAAAAGTAGTGGTTTGGGAAGATTGTAGTTGTGATTGACTAGAGAGCGTTAAAATATCTGTTTGTGTCTTATTGATTAGTTTTTAAATGTCTCTGTTCATGTGTATCAGAAAGGAGCATTCAGTGTTGCGGCAAAGACGAAAGTGCCAGTTGTACCCATTACACTGGTGGGAACAGGTAACATTATGCCAGCTGGATTTGAAGGCATCTTGAATAAGGGATTGGTGAAAGTCGTTATCCATAAGCCTGTGATAGGAAGTGATCCGGAAGCATTGTGCAATGAAGCTAGGAACGTAATTGCAGATGCATTGAGTGAGCATGTTGATTGCTGAGCTTTTCCAGTGAGTGATTTTCGGTCTCATTATCGTTTCAGTTACCTGATGTGGAAAATTTTTTTTCACATGTTTTTTTGGTTAATTTTAATAAATATAACAAACAAGCAAAATACTTACGGCTTGTGGAACAAAATGAAAGAGTTCATGAAGTTGTTCATATTTCTTTAAATATTTCAGGTTTGCCGGTCCCCTTTTTCTCCTTTCTTTTCTTCCTCTTTTGTGATTTTTTTCTTTTTGTCTTTTTATTTTCTTATATAATTTTTCTTTTATTTTTTTTTTCAAATTGTTATTTGGTTTAAAATCATGTGCCAAATATAAAATTTTTATTTAATTTTTTTTACAAACTGTTATTTGGTTGTTACAAATATTGAATAGTCAAATCTAAACAATCGTATATAAAAAATAGCTAAATCTAAATTAGGCACTTTCAAAATTTTATTGGTGATGGTTGCGTGGAGATTACTCTACAAACAGACCGGATTATTGTGGTGATTTGGGGGTACATGGTTTTACGTGATTATTTACTACAAAGCGTGATTATTGCTAGGTTTTGCTAAAACTGATATTAAGATTTACAGTTTACATGCTTTGTTAATAAACATGTTTTCAAATGTATTGCAAAAGGAAAAATGTATGTTTATTTAAACTGTTATTCACTGAGGTCGTTTAGCTTATGCTTTGAAATTGTTATGTTTTCCTCTCTCCCCAAGTAGCATGAGAGTTCATGGAACCTAAGCATGTTGACTGTTGACGCTGCTTCTGACCACACTTGCTATGTGTATGTTCATTAGCTTACTTTTGAGTCCAGTTGTGAGATTAAGTCCAAGTGTACTTGTGTTTCTGTGTGCAGTATTTGTTGGTTAAAATGTAACAAATGAATAATGTGTAACTAGCCTCTGTAAGGCTTATGTTTGTATAAAAATTTATCACTAGTTTGGTATTAGAGATGTAGCTTGTGAGTTATGTTTTGGTAGGCTTGTTATTTGGTACGTTGGTTACGACTAGTGCATGATATCGAGGGAGATATTATTCAGTAACCTTCCATCATGTTCCCTTCCAGGATAATGAGGGGTGTGACAAAGGATTGCAAGCATAACATAGAAGATCGTTAAAACTTGAGTTTCGAATTTAGCAACTTTTGAGAACATTGCCATTATTTCCTTGATTACTGACTTTAACTTTTTGCACGACATTCTTTGCTCAATGCTTGAGTGTATGATTTTATATTTGAGCAAGAGCTAAATTGTAGCTCTTGGCGGTGTTTGAGAACACCATAAAAGTGAAACTAGAAAGGCTTGAGATAATCCCACGCATCACATCTCTTATTTGATAGGAAATGTTGATTTAGAAAAGCAAAGAAGTCCAATGAAGCAAAATGACTCAATTTCAAGTTAAAACAAACAAAGAAAAAAGGGCAAAATTGTAATTTTACTCTTTTCGACGTCGTCTTTACCGCTTTGGTGCCATGTCATGATGCCCAGGATGCAAGGGCTCGTGAAACCCAATTCAATGTCGCGATGCCACACCCTAGTGTCCATTCCTATATAGAGCATCGCAGAACCGAAGACGGTTGATAGTGCTGCAATGCTCAACCCTAATGTTGAGGTGCTACGAACTTTTTGTTTGTGGCAACGCTCGCTCCTTGTGGGCATCAGCAGGCCATGTGGCTATAAAACCCCATTTTTCTTGTATTTTGAAATACGCTTCATTACATTTCATTAATTCGGCACACAATTCAATTTCCAAATAGTTACAACACTCCTATTAATAATTTTTCTCCAAATTCATCACTAAAATCTTTCATTCTTTGAAAGATGTCTTGTGTGTGTTCAACTTTCCTCTTGATGCTATACCAAAATCAATGAAGAACTAAAAGGTATCTTCTTGGGAATGGATTCTTAGTTGAATCTTTATTGAGAATTTATGTTTTAATTGCACCTAATCACAATCTTTAATTGAATTTCAATTGTGGTTTTTATGAGTTCTTGTTTGAATGACTTGATCAACAATGAAAGCATGAATCTTTGTTTAATTTCTAATGTAGCTAAACATAATCTTTGAATCAAGATTGATAATTGGTGATTCTTGAATTAAGCATGTCTTTCCTTTTAATCTTTTCTTGCACAATCTAATTTGGATTCAATTAATTAATCATTCTTAAGATAGAGACTTTTCTTGCTTTTGAATGTCACAACGTTGAAACTAAGTTCTTAATGCAAACTTAAAGATGCATAAAAACCGCTAAGGTGAAAGTGCATTTAATAAGTTTAGTATGAATCTTGATACAATTTTTGTTCAATTACTATCTTGAACTAGTTAGTTGTGGAATAATTTTATTTACAATATTGTGATTCGTTCAATGCAAGATGGATCGGCTAAAAATACTCATTTCCACTTTTACCATTGATTGAGAG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MNGFRSLQYSSSLHQRAYLGNAAQQYCFSSIIRKHASVSWCYLTPNKNLYNSWHNLSSGKRNSRYIIVRSELEKMGTHEAGYPLSEVPLSSKVRGTFFYATTAITAIFLFMLMLVAHPFVLLMDRYRRRIHYSIAKMWASLTIAPFFRIKYEGLENLPSPNSPAVFVSNHQSFLDIYALLTLGRSFKFISKTAIFLFPIIGWAMFMMGVIPLKRMDSRSQLDCLKRCMELIRKGASVFFFPEGTRSKDGKLGTFKKGAFSVAAKTKVPVVPITLVGTGNIMPAGFEGILNKGLVKVVIHKPVIGSDPEALCNEARNVIADALRSPFQESHLALVTQVAKGLLIMKKHKTELPGLGLDWHSRDNQHIGIQICRITHITAEPENFRSDPMSHSVKILGSIPTGCTPMGPSNKSIGIGSVSMESHHPYITNWCGSTRTEIKHWVELFFGVKVIAMNSHRLPGKGRRMGPIMGHTMHYRRMIITLQPGYSIPPLRKKRT
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. NCBI nr
Match: XP_011648932.1 (PREDICTED: 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, chloroplastic-like [Cucumis sativus] >XP_011648933.1 PREDICTED: 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, chloroplastic-like [Cucumis sativus] >KGN61148.1 hypothetical protein Csa_2G059790 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 637.9 bits (1644), Expect = 2.9e-179 Identity = 321/322 (99.69%), Postives = 322/322 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. NCBI nr
Match: XP_011653882.1 (PREDICTED: 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, chloroplastic-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 602.1 bits (1551), Expect = 1.8e-168 Identity = 306/323 (94.74%), Postives = 311/323 (96.28%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. NCBI nr
Match: XP_008442171.1 (PREDICTED: 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 599.0 bits (1543), Expect = 1.5e-167 Identity = 303/323 (93.81%), Postives = 309/323 (95.67%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. NCBI nr
Match: XP_008442172.1 (PREDICTED: 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, chloroplastic isoform X2 [Cucumis melo] >XP_016899551.1 PREDICTED: 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, chloroplastic isoform X2 [Cucumis melo] >XP_016899552.1 PREDICTED: 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, chloroplastic isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 560.1 bits (1442), Expect = 7.7e-156 Identity = 283/301 (94.02%), Postives = 288/301 (95.68%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. NCBI nr
Match: XP_022925498.1 (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, chloroplastic-like [Cucurbita moschata] >XP_022925499.1 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, chloroplastic-like [Cucurbita moschata] >XP_022925500.1 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 560.1 bits (1442), Expect = 7.7e-156 Identity = 283/323 (87.62%), Postives = 299/323 (92.57%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. TAIR10
Match: AT4G30580.1 (Phospholipid/glycerol acyltransferase family protein) HSP 1 Score: 357.5 bits (916), Expect = 1.4e-98 Identity = 173/260 (66.54%), Postives = 215/260 (82.69%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. TAIR10
Match: ATCG00840.1 (ribosomal protein L23.1) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 1.1e-31 Identity = 62/65 (95.38%), Postives = 64/65 (98.46%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. TAIR10
Match: ATCG01300.1 (ribosomal protein L23) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 1.1e-31 Identity = 62/65 (95.38%), Postives = 64/65 (98.46%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. TAIR10
Match: AT3G05510.1 (Phospholipid/glycerol acyltransferase family protein) HSP 1 Score: 47.8 bits (112), Expect = 2.3e-05 Identity = 61/234 (26.07%), Postives = 95/234 (40.60%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9LLY4|LPAT1_BRANA (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, chloroplastic OS=Brassica napus OX=3708 GN=LPAT1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 363.2 bits (931), Expect = 4.5e-99 Identity = 177/292 (60.62%), Postives = 224/292 (76.71%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q8GXU8|LPAT1_ARATH (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LPAT1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 357.5 bits (916), Expect = 2.5e-97 Identity = 173/260 (66.54%), Postives = 215/260 (82.69%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. Swiss-Prot
Match: sp|A8J0J0|LPAT_CHLRE (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase CHLREDRAFT_174358 OS=Chlamydomonas reinhardtii OX=3055 GN=CHLREDRAFT_174358 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 237.3 bits (604), Expect = 3.7e-61 Identity = 119/235 (50.64%), Postives = 164/235 (69.79%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q09FP7|RK23_NANDO (50S ribosomal protein L23, chloroplastic OS=Nandina domestica OX=41776 GN=rpl23-A PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 142.5 bits (358), Expect = 1.3e-32 Identity = 68/81 (83.95%), Postives = 73/81 (90.12%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q4VZK6|RK23_CUCSA (50S ribosomal protein L23, chloroplastic OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=rpl23-A PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 141.7 bits (356), Expect = 2.1e-32 Identity = 68/81 (83.95%), Postives = 72/81 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0LHA4|A0A0A0LHA4_CUCSA (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G059790 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 637.9 bits (1644), Expect = 1.9e-179 Identity = 321/322 (99.69%), Postives = 322/322 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3B534|A0A1S3B534_CUCME (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486104 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 599.0 bits (1543), Expect = 9.9e-168 Identity = 303/323 (93.81%), Postives = 309/323 (95.67%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S4DU89|A0A1S4DU89_CUCME (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486104 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 560.1 bits (1442), Expect = 5.1e-156 Identity = 283/301 (94.02%), Postives = 288/301 (95.68%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0L137|A0A0A0L137_CUCSA (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G476190 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 479.2 bits (1232), Expect = 1.1e-131 Identity = 242/248 (97.58%), Postives = 244/248 (98.39%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G008470 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P4LYA6|A0A2P4LYA6_QUESU (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase OS=Quercus suber OX=58331 GN=CFP56_14115 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 424.5 bits (1090), Expect = 3.3e-115 Identity = 219/313 (69.97%), Postives = 251/313 (80.19%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber chineselong genome (v3)
Date Performed: 2019-03-04
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |