CsaV3_1G045890 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGAAGGTCTGATATTATAAAACAAAATATGGGAAAAAGAGGCTTCTTTGTTTGATTGCATGTGGACACAATTGAAATAATCAATCACACACACTTCTTATATTCTTCACTACAATAATACTTGTAGCTCAATTAATATTATGGGGTTTCTTCTTCATCCTCATACTTCAATTTTTATTGTTTAGTTTCCAAACAAAGCTATGGCGTCCTCCACAAGTACTGCTTCACCTGTCTTTGCTCTCTCCTCCTCCTTCCAACTGAAGCCAAGCAACAGCAGAAACAACAACCTACCCTCCACTTTCTTTCCTTCTTCTCCTTTTATTTCCAGGTATTCTAAAATCACATCTACTACACTACTTTCTCCATTTTTACTACCGCACCTGATGCTCTCCAACTCCAAACAAAGAATACACAGAATCTAAAGCTTTGATTTGATTATTTCGTCTAAACCATAGGGTGTGTTTACACCAGATTTTGATTCATGTTTATCTTACTTCTAATGGGTTCCCTTACAATCTAATATCAATTCATTGGTGCTTTTATCTTTCTTTGTTCTAAGTATAGTTCATATATATATCTAACTGTGTAATTATATTCTAAATATAGTCCATATAGAAAATATCAAACATTAAGATATCACAAAAAGGGGAATATGAGGTATTGAAGAAGAAAGAAGTAAGTGAGTATTAAAAGTGTTTGTTCATATAATTAAGTATAAGAAACTATGGGTACCTCAATTGTAATTGGCATTTGTGATGTAGAAAATCATCATGTCGAGCGATGGCAACAGTTATCAAGGAAAATGAAGATCAAAAAGTGGTTGCGGAGGAATCATTCCCTCCTAAGGCTTTTCCTGTTCAGGACGGTGAAGGAGGCAGTAACCAAGGACCACAAAATTCATCATCCGATAATGATTCTGATAAATGGATCATTAAGTTTGAACAATCTGTTAATATTTTTCTCACGGTAAAACAATCACTTCAAACTCATCTCACTGCATTCTCTTCATTTCTGCATATATGATTGGTTCCCTATACTACTGATTGATATGTTGAATCATGTATGATGACTCTGATTTACTAATCTTTCCAGGATTCGGTAATAAGAATTCTCGACTCCTTCTACCATGATAGACACTACGCAAGGTTCTTTGTCTTAGAAACTATTGCCAGGGTTCCCTATTTTGGTGAGTCTTTATATATATATATATATATATCTTTCTTGTGTTCTTACATAGTTTTTGAAGAAAAGTGTTGTGTGGAGTTTGAACTTATGATTACGCGGTTGGATCTTGATTTGATTTGGAGATTTTTTTTTTTATTGGAAGAATTAGGTTCTTTCAAATTTCTCAACTTGTTAAGTTCTTTGGTGAGCTATTGGTTCAAAATTTATCATTAACTCCCTTGAAACAGAGCTAATCTGCAATAATCTTAATATGGGAGGGACTTTTTTTTTTCTTTCTAATTTTGGAGTCAGAGTTCACTCCTCCTATTGATGTTATTTGAGGACGAGAAGAGTAAGTAGTATTTAGTTTGTAATTTGTTTCTAATTTCTCCCTTTCAAATGGTAGCGTTTCTGTCAGTTCTACATTTATATGAAAGTTTTGGGTGGTGGAGAAGAGCTGATTATCTAAAAGTTCACTTTGCTGAGAGCTGGAATGAGATGCATCACTTGTTGATCATGGAGGTATTTATTATTATTAGCCCTTCCTTTGATGTCCTTTCCTATGTTTCCTCCCTGGAAGTGTATCTTTTTATTCCCATGAATTGCACTGTTTCATGAATGTATGTCTTTTCACGAACAACCAAATTGAAAAAGAGACGACACTAATTCAAATGACCATGGATAAGATTCTTCAAATTGCATTTAAACTTTTTCACAAGCATTCTTTTTCCTTTTATAATTTTGTTCAAATTCGATTTATTTTCAAAAAGTATAGCTTGACCAATGCTGCATAAGCTAATCTATTATATCTTGAGAAACAATTACCATGAAAGACACCAGAGTTAGTAAAATTGTCTCTTAAGAAGACAATATAAAATCACTCAGATCAAATTCTCTTATATATACAAGATTACGTATTTTCTGATTTTTTGTAACATTTTTATTCCCAGTATATTTCGGTTCCATTAGAATATATTGATCATAATAATGGTGGCTGCATGCATAAAACTTGCCTTTTTCCAACAATATATTTTGCTTTTAAACCATCTCTATGAACTGTTTAAGCTTGTCCACCCATCTAGACATTGAATTACTGAACAAAATGCCTGTTTCTGATTCGTGTGCAGGAACTCGGGGGTAATGATGGGTGGTTCGACCGTTTTCTTGCACAACATATCGCTGTTGCTTATTACTTCATGACAGTATTTATGTACATGATTAGCCCAAGAATGGCATGTAAGTATTGTTGGAGCTTATAAATTCACGTCAGCTGCTACTCTCTTTCTTGCATTCTTTTATGGACTTGTTCAGTTTTTACAACCAAGAAAACAGAAAATTGTCATGACTTTCCTTCTTAGTAAAACCTACAAAGGAGTTAATTATAATTTAAATTAAAGTTTGGCACATCAGTTTTGGTGTAATACACTCAGTTACTAGTTAATTTTTGACACCTTTCTACTTTGGCTTTAACATCTTCAAGTTTTTTGTATTTAACCTTTTAATGACATTGTTGTGTATTGATATATATTTGATTAGTGCAGATCATCTTTCTGAATGTGTTGAAAGCCATGCATTTTCAACTTATGATAAGTTTCTGAAGGCCCAAGGAGGTATGTTGCTTGCATTATATTGACAATGATCTAAGAATTAAGCATAGATACAAATACTAAGGAGACACATTTATTAAAAATGTTTGTTTTTTATACCAAAAGAAAATTAAGTAAATGGGTTGATGCATTTATATGTTTAAAAAGCTTAGTTTAATATATTTCACACTCAGAAATTATTGCTGTATACGCATCTTTTTCGTCTACTTTAACAAATGTTCTATGCATGCTTAACACATTTTGTTGCACTAACCCGTGTGTCCTATTAAATGTGTTCGAAGTTCTATCGTAGTGTCCAGGTAAGGTGTCAACAAAGACTCGTTAACCAAACTAAAGTGTCCTTGCTTCTTAGATAATGATCTTAATTTTCATTTGGTTAACGTTTATTCTGAAACACGAATATGGTTTTGACATGTTCCATTCCTTGTGTGTCATCATAGATGAGTTGAAAAAATTGCCTGCACCTGAGGTTGCTGTGAAATATTACACTGAAGGAGACTTGTACTTATTTGGTAAGTTCTATCTTTCTCAGCGCATGGCGCAGTTCTTTTGTTCAAATTGACACTAACAGATTGATTTCATTCAGATGAATTTCAAACTTCCAGACCTCCGAAATCACGAAGACCAAAGATAGGTAAAATAATTTTATAATCTGGAATATTTACTATATGACGATAACATACTGCCATCATGAAGCCATGTGTTGAATGCACCTGAAAAATTGATTAATGAAGGCATTATAGTTGGAATATTAAAAGTTTGATGATACCTTCAGAATTGACCTTAAAATTAGAATTGGTCGTGAAACATCAAAAGTTTTAACTCTTCAGTTGTAGAAAAGGGTTTTGATTCCTTATTTTATGCACCAACTTGTTCTCCTTTTTCTTCCTTTGCCTTAATTTACTTCAATATACACTGTTTTCGTTTGATTGCATTACTTCACAAAATAAATGGAGAATGTCCATAATGTGGGCATACTTCACGTCTGAATGTGTGATATCTTTTTTTGTAGAGAACTTGTACGACGTGTTTGTTAACATCAGAGACGACGAAGGCGAGCATTGCAAGACAATGAAAGCTTGTCAATCGCACGGGAATCTCCAGTCGCCACATTCTTATTCAGATAGCTTAGGTGAAGATAACGAGGCACTCTGCGACCCTGCAAAGTAGATTGTGAAAGCATTGTAGACTGTATAAAGAAATCAGTTACTTCTTCCCCTTCAATTACGCAAAATCTATGATATATGTAAAATGTAAGTTCACTAGATTCACACATAGTAAATATCTACCAGAGAACAAGAAATGCAAGGTCCATATATATGTATAGGCTATTTGATGATCTTACTCATTGTGCCCTATGAAATGCAGTGGTTAATGGTTATATCAGTTATGCGTAGAGTTCAAAATTCTAATTCATACAATAGTAAATGCATACGTTTGTAGGCAACCATTCATTTATGTATATCCTTAATCTTTAGCAGATGTACTATCAATTGAATCTGGAAACTATATGTTCATACAAGGTCTTTAAATAAACATGTTTTATGGAGTTGAACTTGTGTTTGTGTCCATTTTGATGCAATGTGGTTCAATATCTAGAACTTTATCCTCTATGGAGTTAAACTTGTGTTTGTGTCGATTTGAATGCAATGTGGTTCAATATCTAAAACTTGATCTTCTAATTTTTTCTTGGTTGAATGCATACGCTTTGAAAAAGCAGATGCGTGACTTTTTTAAGTTGAAGTCTTAGAAGGAAACTTGTATCTTCAACGAATTTTAGTCTTCAAGTGTCCTTTAGGACTTAGAGAGTTTCTAATTGTTGAAAAGATTATTTCTCACTACAAGAAAATAAGTATTTTCCGACGCACAACACGAACGTTGGGATAAAAGATGTCGGAAGAAAAAATAACGGCATTGGGAAACGTTTAAAATAAAAAAATATTAAACTTTTCTCGACGCCGTTAGCGAAACGTCGAGAATGAAGAACACTTTTTTTCGATGTTGTACTTTACGACGTCAGGAATAGGTGGATTGCTCGATGTTCATGAAGTGTGTCGGGAGATTTCCTACATATTTGAGTTTTGTATTCACATAACACAGAACTCAAATTGAAAAAAAAAAAAGAGGAAGAGGGCATGAGAGAGAGATCGTTGTACGCCCATTCCATTGTCGTCCGTTCTGTCCGCTGCCGCAACTTCCTCCATTTTCGTCTCTTTCACAACTT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MASSTSTASPVFALSSSFQLKPSNSRNNNLPSTFFPSSPFISRKSSCRAMATVIKENEDQKVVAEESFPPKAFPVQDGEGGSNQGPQNSSSDNDSDKWIIKFEQSVNIFLTDSVIRILDSFYHDRHYARFFVLETIARVPYFAFLSVLHLYESFGWWRRADYLKVHFAESWNEMHHLLIMEELGGNDWWFDRFLAQHIAVAYYFMTVFMYMISPRMAYHFSECVESHAFSTYDKFLKAEGEELKKQPAPEVAVKYYTEGDLYLFDEFQTSRAPKSRRPKIESLYDVFMNIRDDEAEHCKTMRACQSHGNLRSPHSYSESCPEEDEPLCNLAEADCEGIVDCIKKSITSSPPVKQKL
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. NCBI nr
Match: XP_011660298.1 (PREDICTED: ubiquinol oxidase 4, chloroplastic/chromoplastic-like [Cucumis sativus] >KGN66827.1 Alternative oxidase [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 629.4 bits (1622), Expect = 7.4e-177 Identity = 312/332 (93.98%), Postives = 323/332 (97.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. NCBI nr
Match: XP_004145426.1 (PREDICTED: ubiquinol oxidase 4, chloroplastic/chromoplastic [Cucumis sativus] >KGN66832.1 hypothetical protein Csa_1G699610 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 614.0 bits (1582), Expect = 3.2e-172 Identity = 309/355 (87.04%), Postives = 330/355 (92.96%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. NCBI nr
Match: XP_008458986.1 (PREDICTED: ubiquinol oxidase 4, chloroplastic/chromoplastic-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 614.0 bits (1582), Expect = 3.2e-172 Identity = 310/355 (87.32%), Postives = 331/355 (93.24%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. NCBI nr
Match: XP_008458984.1 (PREDICTED: ubiquinol oxidase 4, chloroplastic/chromoplastic [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 586.3 bits (1510), Expect = 7.2e-164 Identity = 295/360 (81.94%), Postives = 320/360 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. NCBI nr
Match: XP_022142688.1 (ubiquinol oxidase 4, chloroplastic/chromoplastic [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 576.6 bits (1485), Expect = 5.7e-161 Identity = 293/363 (80.72%), Postives = 321/363 (88.43%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. TAIR10
Match: AT4G22260.1 (Alternative oxidase family protein) HSP 1 Score: 429.5 bits (1103), Expect = 2.0e-120 Identity = 206/262 (78.63%), Postives = 229/262 (87.40%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. TAIR10
Match: AT1G32350.1 (alternative oxidase 1D) HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 2.7e-11 Identity = 49/178 (27.53%), Postives = 81/178 (45.51%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q56X52|AOX4_ARATH (Ubiquinol oxidase 4, chloroplastic/chromoplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AOX4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 429.5 bits (1103), Expect = 3.7e-119 Identity = 206/262 (78.63%), Postives = 229/262 (87.40%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q8LEE7|AOX3_ARATH (Ubiquinol oxidase 3, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AOX3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 4.8e-10 Identity = 49/178 (27.53%), Postives = 81/178 (45.51%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0M125|A0A0A0M125_CUCSA (Ubiquinol oxidase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G699560 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 629.4 bits (1622), Expect = 4.9e-177 Identity = 312/332 (93.98%), Postives = 323/332 (97.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3C992|A0A1S3C992_CUCME (Ubiquinol oxidase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498237 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 614.0 bits (1582), Expect = 2.1e-172 Identity = 310/355 (87.32%), Postives = 331/355 (93.24%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0M130|A0A0A0M130_CUCSA (Ubiquinol oxidase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G699610 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 614.0 bits (1582), Expect = 2.1e-172 Identity = 309/355 (87.04%), Postives = 330/355 (92.96%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3CAC6|A0A1S3CAC6_CUCME (Ubiquinol oxidase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498235 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 586.3 bits (1510), Expect = 4.8e-164 Identity = 295/360 (81.94%), Postives = 320/360 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G045890 vs. TrEMBL
Match: tr|B9HZH9|B9HZH9_POPTR (Ubiquinol oxidase OS=Populus trichocarpa OX=3694 GN=POPTR_011G021800v3 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 493.8 bits (1270), Expect = 3.2e-136 Identity = 254/365 (69.59%), Postives = 292/365 (80.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber chineselong genome (v3)
Date Performed: 2019-03-04
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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