CsaV3_1G042650 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

NameCsaV3_1G042650
Typegene
OrganismCucumis sativus (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr1 : 27585992 .. 27587968 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGATATCAAAACCTCCGCGACATTGGCTTCCGATGTTTTGTGTTGTCACATTATGTCTTCTTGCTACTACAGTTGTGGCTGGAAAGAACCCTTATGTTTATGCATCACCACCGCCACCACCATCTCCTTATTATTATACTTCACCACCTCCGCCATTGAACTCTCCACCACCGCCCTCACCGTATTATTACAAATCTCCTCCTCCACCATCCCCATCTCCACCACCTACATATGTTTTTAAGTCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCACCATATGTTTACAAATCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCACCATATGTTTACAAATCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCACCATATGTCTATAAGTCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCCCCTCCACCATCTCCATCCCCACCACCTCCATATGTCTATAAATCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCTCCTTATGTCTATAAGTCTCCACCTCCACCATCTCCATCTCCACCACCTCCCTATGTTTATAAGTCTCCTCCTCCACCATCATTATCTCCCCCACCTCCATACGTTTACAAATCTCTTCCACCGCCATCACCTTCTCCTCCACCTTCATATATCTACAAGTCTCCTCCTCCACCGTTTCCTTCTGCACCCCCTCCATATGCTTACAAATCTCCTCCACCACCTTCATATGTCTATAAGTCTCCTCCACCGTCTTCATGCCCACCAAAACCATACGTTTACAAATCTTCTCCTCCACCACCTTCTTATGTCTATAAGTCTCCACCTCCACCATCTCCATCTCCACCACCTCCTTATGTCTCTAAGTCTCCACCTCCACCATCTCCATCTCCACCGCCTCCCTATGTTTATAAGTCTCCTCCTCCACTATCACTATCGCTCCCACCTTCATACGTTTACAAATCTCCTCCACCGCCATCACCTTCTCCTCCACCTCCATATATCTATAAGTCTCCACCTCCACCGTCTCCTTCTCCACCCCCTCCATATGCTTACAAATCTCCTCCACCAGCATCACCTTCTCCACCACCTCCATATGTCTATAAGTCTCCTCAATCGTCTCCATGCCCACCAACACCATACATTTATAAATCTCCTCGGCCACAATCGCCTTCTCCTCCACCTCCATATGTCTATAAGTCTCCTTCTCCACCACTTCCAAACGTTTACAAATCTCCTCCACCACCATCACCATCTTCACCACCTTCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCTCCACCATCTGCATCTCCACCTCCTCCATATGTATACAAATCCCCTCCACCACCATCTCCATCCCCACCACCTCCTTACATCTATAAGTCCCCTCCTCCGCCTTCTTCATCACCACCTCCTCCATCTCCTTCACCTCCTCCACCATACTATTATAAGTCTCCCCCTCCATTGTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATATGTTTACAAATCTCCTCCACCACCATCACCATCCCCACCACCTCCTTATATCTATAAATCTCCCCCTCCACCATCTCCATCTCCACCACCTCCATACGTTTACAAATCTCCTCCACCACCATCACCATCTCCCCCACCTCCTTATGTCTATAAGTCTCCTCCACCACCTTCTCCATTTTCACCACCTCCATACGTTTACAAATCTCCTCCACCACCATCTCCATCTCCACCACCTCCTTATGTTTATAAGTCTCCTTCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCCCCCTATGTTTACAAATCTCCTCCACCTCCATCTCCTTCACCACCTCCACCGTACTATTATAACTCACCACCTCCACCGTCTCCATCGCCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCACCACCACCTTCACCATCTCCTTACATTTATAAATCTTCACCCCCTCCACCCCAATCACCACCACCCCCTTATTACTAA

mRNA sequence

ATGAAGATATCAAAACCTCCGCGACATTGGCTTCCGATGTTTTGTGTTGTCACATTATGTCTTCTTGCTACTACAGTTGTGGCTGGAAAGAACCCTTATGTTTATGCATCACCACCGCCACCACCATCTCCTTATTATTATACTTCACCACCTCCGCCATTGAACTCTCCACCACCGCCCTCACCGTATTATTACAAATCTCCTCCTCCACCATCCCCATCTCCACCACCTACATATGTTTTTAAGTCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCACCATATGTTTACAAATCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCACCATATGTTTACAAATCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCACCATATGTCTATAAGTCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCCCCTCCACCATCTCCATCCCCACCACCTCCATATGTCTATAAATCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCTCCTTATGTCTATAAGTCTCCACCTCCACCATCTCCATCTCCACCACCTCCCTATGTTTATAAGTCTCCTCCTCCACCATCATTATCTCCCCCACCTCCATACGTTTACAAATCTCTTCCACCGCCATCACCTTCTCCTCCACCTTCATATATCTACAAGTCTCCTCCTCCACCGTTTCCTTCTGCACCCCCTCCATATGCTTACAAATCTCCTCCACCACCTTCATATGTCTATAAGTCTCCTCCACCGTCTTCATGCCCACCAAAACCATACGTTTACAAATCTTCTCCTCCACCACCTTCTTATGTCTATAAGTCTCCACCTCCACCATCTCCATCTCCACCACCTCCTTATGTCTCTAAGTCTCCACCTCCACCATCTCCATCTCCACCGCCTCCCTATGTTTATAAGTCTCCTCCTCCACTATCACTATCGCTCCCACCTTCATACGTTTACAAATCTCCTCCACCGCCATCACCTTCTCCTCCACCTCCATATATCTATAAGTCTCCACCTCCACCGTCTCCTTCTCCACCCCCTCCATATGCTTACAAATCTCCTCCACCAGCATCACCTTCTCCACCACCTCCATATGTCTATAAGTCTCCTCAATCGTCTCCATGCCCACCAACACCATACATTTATAAATCTCCTCGGCCACAATCGCCTTCTCCTCCACCTCCATATGTCTATAAGTCTCCTTCTCCACCACTTCCAAACGTTTACAAATCTCCTCCACCACCATCACCATCTTCACCACCTTCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCTCCACCATCTGCATCTCCACCTCCTCCATATGTATACAAATCCCCTCCACCACCATCTCCATCCCCACCACCTCCTTACATCTATAAGTCCCCTCCTCCGCCTTCTTCATCACCACCTCCTCCATCTCCTTCACCTCCTCCACCATACTATTATAAGTCTCCCCCTCCATTGTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATATGTTTACAAATCTCCTCCACCACCATCACCATCCCCACCACCTCCTTATATCTATAAATCTCCCCCTCCACCATCTCCATCTCCACCACCTCCATACGTTTACAAATCTCCTCCACCACCATCACCATCTCCCCCACCTCCTTATGTCTATAAGTCTCCTCCACCACCTTCTCCATTTTCACCACCTCCATACGTTTACAAATCTCCTCCACCACCATCTCCATCTCCACCACCTCCTTATGTTTATAAGTCTCCTTCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCCCCCTATGTTTACAAATCTCCTCCACCTCCATCTCCTTCACCACCTCCACCGTACTATTATAACTCACCACCTCCACCGTCTCCATCGCCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCACCACCACCTTCACCATCTCCTTACATTTATAAATCTTCACCCCCTCCACCCCAATCACCACCACCCCCTTATTACTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGATATCAAAACCTCCGCGACATTGGCTTCCGATGTTTTGTGTTGTCACATTATGTCTTCTTGCTACTACAGTTGTGGCTGGAAAGAACCCTTATGTTTATGCATCACCACCGCCACCACCATCTCCTTATTATTATACTTCACCACCTCCGCCATTGAACTCTCCACCACCGCCCTCACCGTATTATTACAAATCTCCTCCTCCACCATCCCCATCTCCACCACCTACATATGTTTTTAAGTCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCACCATATGTTTACAAATCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCACCATATGTTTACAAATCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCACCATATGTCTATAAGTCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCCCCTCCACCATCTCCATCCCCACCACCTCCATATGTCTATAAATCTCCTCCTCCACCATCACCATCTCCACCACCTCCTTATGTCTATAAGTCTCCACCTCCACCATCTCCATCTCCACCACCTCCCTATGTTTATAAGTCTCCTCCTCCACCATCATTATCTCCCCCACCTCCATACGTTTACAAATCTCTTCCACCGCCATCACCTTCTCCTCCACCTTCATATATCTACAAGTCTCCTCCTCCACCGTTTCCTTCTGCACCCCCTCCATATGCTTACAAATCTCCTCCACCACCTTCATATGTCTATAAGTCTCCTCCACCGTCTTCATGCCCACCAAAACCATACGTTTACAAATCTTCTCCTCCACCACCTTCTTATGTCTATAAGTCTCCACCTCCACCATCTCCATCTCCACCACCTCCTTATGTCTCTAAGTCTCCACCTCCACCATCTCCATCTCCACCGCCTCCCTATGTTTATAAGTCTCCTCCTCCACTATCACTATCGCTCCCACCTTCATACGTTTACAAATCTCCTCCACCGCCATCACCTTCTCCTCCACCTCCATATATCTATAAGTCTCCACCTCCACCGTCTCCTTCTCCACCCCCTCCATATGCTTACAAATCTCCTCCACCAGCATCACCTTCTCCACCACCTCCATATGTCTATAAGTCTCCTCAATCGTCTCCATGCCCACCAACACCATACATTTATAAATCTCCTCGGCCACAATCGCCTTCTCCTCCACCTCCATATGTCTATAAGTCTCCTTCTCCACCACTTCCAAACGTTTACAAATCTCCTCCACCACCATCACCATCTTCACCACCTTCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCTCCACCATCTGCATCTCCACCTCCTCCATATGTATACAAATCCCCTCCACCACCATCTCCATCCCCACCACCTCCTTACATCTATAAGTCCCCTCCTCCGCCTTCTTCATCACCACCTCCTCCATCTCCTTCACCTCCTCCACCATACTATTATAAGTCTCCCCCTCCATTGTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATATGTTTACAAATCTCCTCCACCACCATCACCATCCCCACCACCTCCTTATATCTATAAATCTCCCCCTCCACCATCTCCATCTCCACCACCTCCATACGTTTACAAATCTCCTCCACCACCATCACCATCTCCCCCACCTCCTTATGTCTATAAGTCTCCTCCACCACCTTCTCCATTTTCACCACCTCCATACGTTTACAAATCTCCTCCACCACCATCTCCATCTCCACCACCTCCTTATGTTTATAAGTCTCCTTCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCCCCCTATGTTTACAAATCTCCTCCACCTCCATCTCCTTCACCACCTCCACCGTACTATTATAACTCACCACCTCCACCGTCTCCATCGCCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCACCACCACCTTCACCATCTCCTTACATTTATAAATCTTCACCCCCTCCACCCCAATCACCACCACCCCCTTATTACTAA

Protein sequence

MKISKPPRHWLPMFCVVTLCLLATTVVAGKNPYVYASPPPPPSPYYYTSPPPPLNSPPPPSPYYYKSPPPPSPSPPPTYVFKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSLSPPPPYVYKSLPPPSPSPPPSYIYKSPPPPFPSAPPPYAYKSPPPPSYVYKSPPPSSCPPKPYVYKSSPPPPSYVYKSPPPPSPSPPPPYVSKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPLSLSLPPSYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYAYKSPPPASPSPPPPYVYKSPQSSPCPPTPYIYKSPRPQSPSPPPPYVYKSPSPPLPNVYKSPPPPSPSSPPSYVYKSPPPPSASPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSSSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPLSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPFSPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPSPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYYYNSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPYIYKSSPPPPQSPPPPYY
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_1G042650.1CsaV3_1G042650.1mRNA


Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber chineselong genome (v3)
Date Performed: 2019-03-04
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availablePRINTSPR01217PRICHEXTENSNcoord: 90..107
score: 45.56
coord: 50..71
score: 41.82
coord: 30..42
score: 38.46
coord: 71..87
score: 44.71
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 566..658

The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CsaV3_1G042650CSPI01G30230Wild cucumber (PI 183967)cpicucB000
CsaV3_1G042650CsGy1G029580Cucumber (Gy14) v2cgybcucB001
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CsaV3_1G042650Cucumber (Chinese Long) v3cuccucB060
CsaV3_1G042650Silver-seed gourdcarcucB0199
CsaV3_1G042650Silver-seed gourdcarcucB0503
CsaV3_1G042650Silver-seed gourdcarcucB0557
CsaV3_1G042650Silver-seed gourdcarcucB0955
CsaV3_1G042650Cucumber (Gy14) v2cgybcucB312
CsaV3_1G042650Cucumber (Gy14) v1cgycucB031
CsaV3_1G042650Cucumber (Gy14) v1cgycucB213
CsaV3_1G042650Cucurbita maxima (Rimu)cmacucB0066
CsaV3_1G042650Cucurbita maxima (Rimu)cmacucB0099
CsaV3_1G042650Cucurbita maxima (Rimu)cmacucB0415
CsaV3_1G042650Cucurbita maxima (Rimu)cmacucB0647
CsaV3_1G042650Cucurbita maxima (Rimu)cmacucB1042
CsaV3_1G042650Cucurbita moschata (Rifu)cmocucB0053
CsaV3_1G042650Cucurbita moschata (Rifu)cmocucB0090
CsaV3_1G042650Cucurbita moschata (Rifu)cmocucB0410
CsaV3_1G042650Cucurbita moschata (Rifu)cmocucB0632
CsaV3_1G042650Cucurbita moschata (Rifu)cmocucB0676
CsaV3_1G042650Cucurbita moschata (Rifu)cmocucB1025
CsaV3_1G042650Cucurbita pepo (Zucchini)cpecucB0142
CsaV3_1G042650Cucurbita pepo (Zucchini)cpecucB0333
CsaV3_1G042650Cucurbita pepo (Zucchini)cpecucB0373
CsaV3_1G042650Cucurbita pepo (Zucchini)cpecucB0428
CsaV3_1G042650Cucurbita pepo (Zucchini)cpecucB0813
CsaV3_1G042650Cucurbita pepo (Zucchini)cpecucB0877
CsaV3_1G042650Wild cucumber (PI 183967)cpicucB383
CsaV3_1G042650Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cuclsiB003
CsaV3_1G042650Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cuclsiB043
CsaV3_1G042650Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cuclsiB068
CsaV3_1G042650Melon (DHL92) v3.5.1cucmeB075
CsaV3_1G042650Melon (DHL92) v3.5.1cucmeB040
CsaV3_1G042650Melon (DHL92) v3.5.1cucmeB042
CsaV3_1G042650Melon (DHL92) v3.6.1cucmedB037
CsaV3_1G042650Melon (DHL92) v3.6.1cucmedB039
CsaV3_1G042650Melon (DHL92) v3.6.1cucmedB070
CsaV3_1G042650Watermelon (Charleston Gray)cucwcgB050
CsaV3_1G042650Watermelon (97103) v1cucwmB025
CsaV3_1G042650Watermelon (97103) v1cucwmB081
CsaV3_1G042650Watermelon (97103) v2cucwmbB027
CsaV3_1G042650Watermelon (97103) v2cucwmbB041
CsaV3_1G042650Wax gourdcucwgoB024
CsaV3_1G042650Wax gourdcucwgoB079
CsaV3_1G042650Wax gourdcucwgoB091