Csa4G344090 (gene) Cucumber (Chinese Long) v2

Overview
NameCsa4G344090
Typegene
OrganismCucumis. sativus (Cucumber (Chinese Long) v2)
Description50S ribosomal protein L1; contains IPR002143 (Ribosomal protein L1), IPR023674 (Ribosomal protein L1, superfamily)
LocationChr4 : 14251113 .. 14252818 (-)
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Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
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ATGACTGTTGGACTTGTGATTGTGATTTTTGCAGGACTTGTGATTGTGATTTTTGTAGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTTTTGATATAATGTGTATGGTGATTTTTTAATATTGATATAATGTGAAGGAAGTTCCTGTAAGTAAAAAAAAGGGAAAATTTTCGAGAAAAGGAGGAAATTAAAGAAGAAGAAGATGGAGAGGTTAATAATGGGAAATAAGTAATGTTTTGGTTAATTTTTGTTTATGTTTACATTGATGTAGTAGTAGCGTGTGAAACTTGATTTTACTGTATGTATATCCTAAATCTTCAATGCTCACTTTTTTCATAGGTAAATTTGTCAAAGGGAACTGGACAGACAGTAAAGGTAGTTGTTTTTACTCAAGGTAATCGCTAAATTTGACTTGAATGATATTTTCATGGGTTAGGATTTAATGGTAGAAATATCTAGTTTTCTAATAGTTCTGGTTCCACTTCTTTCAATGAGGGAGTATCGTGGAATGGATGTTAATACATGATGCAACTAGTTATATGAACTTTAAAAAGGCTCAATGGAAGCTTGGTTTCTACCCAAAAAAAAAAAAAAAATAGCAGGTATTATTGTCTCCGAAGTGTTTGTGGATTAGATAGTTTGTGGTACAGAATCCTCTACTTGAAAGGGAGGTTTGCTTGCTCTGTTAGTGTCTTAGTGAGATTGCTTAAACTATCGTGGTGTTACTTATATGAATTTCCCTCTATAATTGATGAGTGAACCAGTTTGACATGTGGGATGTATTTGGAGAATGAAAATATTTATTTGTTCTTTATTAAATTTTCATACAGTTTTGCAGTGTGGCATGATTAATACTGATTAGTTGGTTTTCCCCCTTGAAATCAGTTTACAAATTTGAGTGAAGAGAATGAGATGAATGCTAGGATATGACTTTTTAATTAACTCTTATATGTATATATATATATATATATATTCGTTATTTATTTCCTCGATGTGGTCACATGTGGATTCTCTCATCTGTTACCATCTCTCTAATCAACTATAAATTTCTATCTTTTTAATTTACATTGGCCATATTATCGTGCTGCTTTTTAAAAAATGTTGTTTGTATCTGCATCATATCTCTTCTCGTGGTGCCTTTTTTCTTCTTCAGTTTTCATTTTCTTTCACTCGTTTCATATAATCTCATTGCTTTCTGAATCATGTAGGTGAAAAATTGGACGAAGCAAAAAATGCAGGAGCAGATTTGGTTGGAGGTAAGGATTTGATAGAACAGATCAAAGGAGGTTTCATGGAATTTGATAAGTTGATTGCTTCACCAGATATGATGCCCAAGGTATGGTTCTTAAATCTTTTCACTGCTGTACATTGTGGTGGGTTTCCAAAAGTATTAAGTATTTCTAACAACATTGTCCATAGCAATGAAGTAGTTTTCACATGTACTTTGAAACTAAGTACAAAATACGTACAATTCCGATTTTCTTGTATGCAATACTACCGATAA

mRNA sequence

ATGACTGTTGGACTTGTGATTGTGATTTTTGCAGGACTTGTGATTGTGATTTTTGTAGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTTTTGATATAATGTGTATGGTAAATTTGTCAAAGGGAACTGGACAGACAGTAAAGGTAGTTGTTTTTACTCAAGGTGAAAAATTGGACGAAGCAAAAAATGCAGGAGCAGATTTGGTTGGAGGTAAGGATTTGATAGAACAGATCAAAGGAGGTTTCATGGAATTTGATAAGTTGATTGCTTCACCAGATATGATGCCCAAGGTATGGTTCTTAAATCTTTTCACTGCTGTACATTGTGGTGGGTTTCCAAAAGTATTAAGTATTTCTAACAACATTGTCCATAGCAATGAAGTAGTTTTCACATGTACTTTGAAACTAAGTACAAAATACGTACAATTCCGATTTTCTTGTATGCAATACTACCGATAA

Coding sequence (CDS)

ATGACTGTTGGACTTGTGATTGTGATTTTTGCAGGACTTGTGATTGTGATTTTTGTAGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTGTGATTTTTGATATAATGTGTATGGTAAATTTGTCAAAGGGAACTGGACAGACAGTAAAGGTAGTTGTTTTTACTCAAGGTGAAAAATTGGACGAAGCAAAAAATGCAGGAGCAGATTTGGTTGGAGGTAAGGATTTGATAGAACAGATCAAAGGAGGTTTCATGGAATTTGATAAGTTGATTGCTTCACCAGATATGATGCCCAAGGTATGGTTCTTAAATCTTTTCACTGCTGTACATTGTGGTGGGTTTCCAAAAGTATTAAGTATTTCTAACAACATTGTCCATAGCAATGAAGTAGTTTTCACATGTACTTTGAAACTAAGTACAAAATACGTACAATTCCGATTTTCTTGTATGCAATACTACCGATAA

Protein sequence

MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMVNLSKGTGQTVKVVVFTQGEKLDEAKNAGADLVGGKDLIEQIKGGFMEFDKLIASPDMMPKVWFLNLFTAVHCGGFPKVLSISNNIVHSNEVVFTCTLKLSTKYVQFRFSCMQYYR*
Homology
[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. Swiss-Prot
Match: RL1_TRIEI (50S ribosomal protein L1 OS=Trichodesmium erythraeum (strain IMS101) GN=rplA PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 1.1e-14
Identity = 38/62 (61.29%), Postives = 48/62 (77.42%), Query Frame = 1 

Query: 104 VNLSKGTGQTVKVVVFTQGEKLDEAKNAGADLVGGKDLIEQIKGGFMEFDKLIASPDMMP 163
           V L KGTGQT+++ V  +GEK++EA  AGADL G ++LIEQI  G MEFD+LIA+PD+MP
Sbjct: 63  VALPKGTGQTIRIAVIAKGEKVNEALAAGADLAGSEELIEQISKGMMEFDRLIATPDVMP 122

Query: 164 KV 166
           +V
Sbjct: 123 QV 124

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. Swiss-Prot
Match: RL1_MARMM (50S ribosomal protein L1 OS=Maricaulis maris (strain MCS10) GN=rplA PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 79.7 bits (195), Expect = 4.3e-14
Identity = 37/61 (60.66%), Postives = 47/61 (77.05%), Query Frame = 1 

Query: 105 NLSKGTGQTVKVVVFTQGEKLDEAKNAGADLVGGKDLIEQIKGGFMEFDKLIASPDMMPK 164
           NL  GTG++V+V VF +G K +EA  AGAD+VG +DL+EQI+GG + FDK+IA+PDMMP 
Sbjct: 64  NLPNGTGRSVRVAVFAKGPKAEEATKAGADVVGAEDLMEQIQGGNINFDKVIATPDMMPL 123

Query: 165 V 166
           V
Sbjct: 124 V 124

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. Swiss-Prot
Match: RL1_JANSC (50S ribosomal protein L1 OS=Jannaschia sp. (strain CCS1) GN=rplA PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 79.7 bits (195), Expect = 4.3e-14
Identity = 37/62 (59.68%), Postives = 47/62 (75.81%), Query Frame = 1 

Query: 104 VNLSKGTGQTVKVVVFTQGEKLDEAKNAGADLVGGKDLIEQIKGGFMEFDKLIASPDMMP 163
           VNL  GTG+TV+V VF +G K +EA  AGAD+VG +DL+E ++GG +EFD+ IA+PDMMP
Sbjct: 63  VNLPNGTGKTVRVAVFARGPKAEEATAAGADIVGAEDLMETVQGGTIEFDRCIATPDMMP 122

Query: 164 KV 166
            V
Sbjct: 123 IV 124

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. Swiss-Prot
Match: RL1_ROSDO (50S ribosomal protein L1 OS=Roseobacter denitrificans (strain ATCC 33942 / OCh 114) GN=rplA PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 76.6 bits (187), Expect = 3.7e-13
Identity = 36/63 (57.14%), Postives = 46/63 (73.02%), Query Frame = 1 

Query: 103 MVNLSKGTGQTVKVVVFTQGEKLDEAKNAGADLVGGKDLIEQIKGGFMEFDKLIASPDMM 162
           +V L  GTG+TV+V VF +G K DEA  AGAD+VG +DL+E ++ G +EFD+ IA+PDMM
Sbjct: 62  VVGLPNGTGKTVRVAVFARGAKADEATAAGADIVGAEDLMETVQSGKIEFDRCIATPDMM 121

Query: 163 PKV 166
           P V
Sbjct: 122 PIV 124

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. Swiss-Prot
Match: RL1_BORPA (50S ribosomal protein L1 OS=Bordetella parapertussis (strain 12822 / ATCC BAA-587 / NCTC 13253) GN=rplA PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 2.4e-12
Identity = 38/59 (64.41%), Postives = 42/59 (71.19%), Query Frame = 1 

Query: 104 VNLSKGTGQTVKVVVFTQGEKLDEAKNAGADLVGGKDLIEQIKGGFMEFDKLIASPDMM 163
           V L  GTG+TV+V VF QGEK D A+ AGAD+VG  DL EQIK G M+FD +IASPD M
Sbjct: 63  VVLPAGTGKTVRVAVFAQGEKADAARAAGADIVGLDDLAEQIKAGQMDFDVVIASPDTM 121

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. TrEMBL
Match: G0R4N0_ICHMG (Putative uncharacterized protein OS=Ichthyophthirius multifiliis (strain G5) GN=IMG5_193900 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 140.2 bits (352), Expect = 3.0e-30
Identity = 87/98 (88.78%), Postives = 92/98 (93.88%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 63  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 122

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF 99
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF
Sbjct: 123 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF 160

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. TrEMBL
Match: G0R4N0_ICHMG (Putative uncharacterized protein OS=Ichthyophthirius multifiliis (strain G5) GN=IMG5_193900 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 139.8 bits (351), Expect = 3.9e-30
Identity = 87/104 (83.65%), Postives = 95/104 (91.35%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + L+IVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 19  LCIYLIIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 78

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 79  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 122


HSP 2 Score: 139.4 bits (350), Expect = 5.1e-30
Identity = 87/104 (83.65%), Postives = 95/104 (91.35%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 35  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 94

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 95  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 138


HSP 3 Score: 139.4 bits (350), Expect = 5.1e-30
Identity = 87/104 (83.65%), Postives = 95/104 (91.35%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 47  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 106

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 107 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 150


HSP 4 Score: 121.7 bits (304), Expect = 1.1e-24
Identity = 75/96 (78.12%), Postives = 84/96 (87.50%), Query Frame = 1 

Query: 9   IFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 68
           +F   + + F  + I ++IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 7   LFFIYINIFFSCLCIYLIIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 66

Query: 69  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 67  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 102


HSP 5 Score: 139.4 bits (350), Expect = 5.1e-30
Identity = 87/104 (83.65%), Postives = 95/104 (91.35%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 144 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 203

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 204 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 247

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. TrEMBL
Match: G0QZU4_ICHMG (Putative uncharacterized protein (Fragment) OS=Ichthyophthirius multifiliis (strain G5) GN=IMG5_159920 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 139.4 bits (350), Expect = 5.1e-30
Identity = 87/104 (83.65%), Postives = 95/104 (91.35%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 122 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 181

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 182 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 225


HSP 2 Score: 137.9 bits (346), Expect = 1.5e-29
Identity = 86/97 (88.66%), Postives = 91/97 (93.81%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 162 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 221

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 98
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI
Sbjct: 222 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 258


HSP 3 Score: 132.5 bits (332), Expect = 6.3e-28
Identity = 84/99 (84.85%), Postives = 89/99 (89.90%), Query Frame = 1 

Query: 6   VIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 65
           VI I    + VI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI
Sbjct: 105 VIYIIQQKIKVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 164

Query: 66  VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 165 VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 203


HSP 4 Score: 120.9 bits (302), Expect = 1.9e-24
Identity = 78/100 (78.00%), Postives = 86/100 (86.00%), Query Frame = 1 

Query: 5   LVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 64
           LV V    +  VI+++   + VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 94  LVAVYKKKIKNVIYIIQQKIKVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 153

Query: 65  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 154 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 193


HSP 5 Score: 100.1 bits (248), Expect = 3.5e-18
Identity = 69/100 (69.00%), Postives = 78/100 (78.00%), Query Frame = 1 

Query: 5   LVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 64
           ++I+ F  L  V  +V V    I  VI I+   + VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 80  IIILKFIKLNNVKSLVAVYKKKIKNVIYIIQQKIKVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 139

Query: 65  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 140 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 179


HSP 6 Score: 134.4 bits (337), Expect = 1.7e-28
Identity = 83/90 (92.22%), Postives = 86/90 (95.56%), Query Frame = 1 

Query: 9   IFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 68
           +F  + IVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 127 LFILITIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 186

Query: 69  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF 99
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF
Sbjct: 187 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF 216

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. TrEMBL
Match: G0R2U2_ICHMG (Putative uncharacterized protein OS=Ichthyophthirius multifiliis (strain G5) GN=IMG5_181430 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 132.5 bits (332), Expect = 6.3e-28
Identity = 78/86 (90.70%), Postives = 85/86 (98.84%), Query Frame = 1 

Query: 13  LVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 72
           +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 37  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 96

Query: 73  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF 99
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVI+++I++F
Sbjct: 97  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIIVIIILF 122


HSP 2 Score: 132.1 bits (331), Expect = 8.2e-28
Identity = 80/93 (86.02%), Postives = 86/93 (92.47%), Query Frame = 1 

Query: 5   LVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 64
           ++I++F    + I + IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 117 VIIILFYSYYLFILITIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 176

Query: 65  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 98
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI
Sbjct: 177 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 209


HSP 3 Score: 131.0 bits (328), Expect = 1.8e-27
Identity = 83/112 (74.11%), Postives = 95/112 (84.82%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVI--------FVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   ++++I        F++I IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 103 IVIVIVIVIVIVIIVIIILFYSYYLFILITIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 162

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 163 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 214


HSP 4 Score: 129.0 bits (323), Expect = 7.0e-27
Identity = 83/116 (71.55%), Postives = 95/116 (81.90%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 35  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 94

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV------------IVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI+++I+            IVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 95  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIIVIIILFYSYYLFILITIVIVIVIVIVIVIVIVIV 150


HSP 5 Score: 129.0 bits (323), Expect = 7.0e-27
Identity = 83/116 (71.55%), Postives = 95/116 (81.90%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIV------------IVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVI+++I+            IVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 91  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIIVIIILFYSYYLFILITIVIVIVIVIVIVIVIVIV 150

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 151 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 206


HSP 6 Score: 129.0 bits (323), Expect = 7.0e-27
Identity = 83/116 (71.55%), Postives = 95/116 (81.90%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 55  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 114

Query: 61  IVIVIV------------IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           I+++I+            IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 115 IIVIIILFYSYYLFILITIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 170


HSP 7 Score: 129.0 bits (323), Expect = 7.0e-27
Identity = 83/116 (71.55%), Postives = 95/116 (81.90%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV---------- 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI+++I+          
Sbjct: 71  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIIVIIILFYSYYLFIL 130

Query: 61  --IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
             IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 131 ITIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 186


HSP 8 Score: 128.3 bits (321), Expect = 1.2e-26
Identity = 48/112 (42.86%), Postives = 98/112 (87.50%), Query Frame = 1 

Query: 5   LVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 64
           +VI+I   ++I+I +VIVIV++I+I+IVI+I+I+I+I+I+IV++IVI+I+++I+I+I+I+
Sbjct: 140 IVIIILVIIIIIIIIVIVIVVIIIIIIVIIIIIIIIIIIIIVVIIVIIIIVIIIIIIIII 199

Query: 65  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMVNLSKGTGQTVKV 117
           I+I+I+++I+I+IV++I+I++VI+I+I+I+I++  I+ ++    G+G   ++
Sbjct: 200 IIIIIIVIIIIIIVVIIIIIVVIIIIIIIIIIVIIIITILTAVNGSGVEARI 251

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. TrEMBL
Match: A0A0L8GJB5_OCTBM (Uncharacterized protein OS=Octopus bimaculoides GN=OCBIM_22032518mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 125.2 bits (313), Expect = 1.0e-25
Identity = 49/100 (49.00%), Postives = 93/100 (93.00%), Query Frame = 1 

Query: 5   LVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 64
           ++I+I   LVI+I V+I+I+IVIVI+I+++I+I+I+IVIVIV++I+I+IVI+I+I+I+I+
Sbjct: 118 IIIIIIIVLVIIILVIIIIIIVIVIIILVIIIIIIIIVIVIVVIIIIIIVIIIIIIIIII 177

Query: 65  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           I+IV++IVI+I+++I+I+I+I+I+I+I+++I+I  ++ ++
Sbjct: 178 IIIVVIIVIIIIVIIIIIIIIIIIIIIIVIIIIIIVVIII 217


HSP 2 Score: 124.8 bits (312), Expect = 1.3e-25
Identity = 53/100 (53.00%), Postives = 93/100 (93.00%), Query Frame = 1 

Query: 5   LVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 64
           LVI+I   +V+VI ++I+I+IVI+I+I+IV+VI+I+++I+I+IVIVI+I+++I+I+I+IV
Sbjct: 96  LVIIIVIIIVVVIIIIIIIIIVIIIIIIIVLVIIILVIIIIIIVIVIIILVIIIIIIIIV 155

Query: 65  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIV++I+I+IVI+I+I+I+I+I+IV++IVI+I  I+ ++
Sbjct: 156 IVIVVIIIIIIVIIIIIIIIIIIIIVVIIVIIIIVIIIII 195


HSP 3 Score: 124.0 bits (310), Expect = 2.2e-25
Identity = 54/103 (52.43%), Postives = 93/103 (90.29%), Query Frame = 1 

Query: 2   TVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 61
           T  +VIVI   ++I++  +I+IV+VI+IVI+IV+VI+I+I+I+IVI+I+I+IV+VI+I++
Sbjct: 73  TTTIVIVIVIIIIIIVMTIIIIVLVIIIVIIIVVVIIIIIIIIIVIIIIIIIVLVIIILV 132

Query: 62  VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           +I+I+IVIVI+I+++I+I+I+IVIVIV++I+I+IVI  I+ ++
Sbjct: 133 IIIIIIVIVIIILVIIIIIIIIVIVIVVIIIIIIVIIIIIIII 175


HSP 4 Score: 124.0 bits (310), Expect = 2.2e-25
Identity = 50/104 (48.08%), Postives = 95/104 (91.35%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + V ++I+I   +VI+I ++IV+VI+I+++I+I+IVIVI+I+++I+I+I+IVIVIV++I+
Sbjct: 104 IVVVIIIIIIIIIVIIIIIIIVLVIIILVIIIIIIVIVIIILVIIIIIIIIVIVIVVIII 163

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           I+IVI+I+I+I+I+I+IV++IVI+I+++I+I+I+I+I  I+ ++
Sbjct: 164 IIIVIIIIIIIIIIIIIVVIIVIIIIVIIIIIIIIIIIIIIIVI 207


HSP 5 Score: 122.9 bits (307), Expect = 5.0e-25
Identity = 46/104 (44.23%), Postives = 95/104 (91.35%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + ++++I   +VIVI ++++I+I+I+IVIVIV++I+I+IVI+I+I+I+I+I+IV++IV
Sbjct: 126 LVIIILVIIIIIIVIVIIILVIIIIIIIIVIVIVVIIIIIIVIIIIIIIIIIIIIVVIIV 185

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           I+I+++I+I+I+I+I+I+I+++I+I+IV++I+I++VI  I+ ++
Sbjct: 186 IIIIVIIIIIIIIIIIIIIIVIIIIIIVVIIIIIVVIIIIIIII 229


HSP 6 Score: 115.5 bits (288), Expect = 8.0e-23
Identity = 53/109 (48.62%), Postives = 93/109 (85.32%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGL-----VIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 60
           + V LV+V+   +      IVI +VI+I+I+++ +I+IV+VI+IVI+IV+VI+I+I+I+I
Sbjct: 57  IAVFLVVVLIVPIPITTTTIVIVIVIIIIIIVMTIIIIVLVIIIVIIIVVVIIIIIIIII 116

Query: 61  VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           VI+I+I+IV+VI+I+++I+I+IVIVI+I+++I+I+I+IVIVI  I+ ++
Sbjct: 117 VIIIIIIIVLVIIILVIIIIIIVIVIIILVIIIIIIIIVIVIVVIIIII 165


HSP 7 Score: 105.9 bits (263), Expect = 6.3e-20
Identity = 48/108 (44.44%), Postives = 89/108 (82.41%), Query Frame = 1 

Query: 5   LVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIV--------IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 64
           ++I+I   +VI+I V++ I+ V ++V++IV        IVIVIVI+I+I+++ +I+IV+V
Sbjct: 38  IIIIIIINMVILIIVIMNIIAVFLVVVLIVPIPITTTTIVIVIVIIIIIIVMTIIIIVLV 97

Query: 65  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           I+IVI+IV+VI+I+I+I+IVI+I+I+IV+VI+I+++I+I+I  ++ ++
Sbjct: 98  IIIVIIIVVVIIIIIIIIIVIIIIIIIVLVIIILVIIIIIIVIVIIIL 145


HSP 8 Score: 99.4 bits (246), Expect = 5.9e-18
Identity = 50/126 (39.68%), Postives = 86/126 (68.25%), Query Frame = 1 

Query: 11  AGLVIVIFVVIVIVIVIV--------------------------------IVIVIVIVIV 70
           A  V++I ++I I+I+I+                                IVIVIVI+I+
Sbjct: 26  ATTVVIIIIIIFIIIIIIINMVILIIVIMNIIAVFLVVVLIVPIPITTTTIVIVIVIIII 85

Query: 71  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF 105
           I+++ +I+IV+VI+IVI+IV+VI+I+I+I+IVI+I+I+IV+VI+I+++I+I+IVIVI+I 
Sbjct: 86  IIVMTIIIIVLVIIIVIIIVVVIIIIIIIIIVIIIIIIIVLVIIILVIIIIIIVIVIIIL 145


HSP 9 Score: 127.1 bits (318), Expect = 2.6e-26
Identity = 52/122 (42.62%), Postives = 102/122 (83.61%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + V +V+V+   +V+V+ VV+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V
Sbjct: 27  VVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVV 86

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMVNLSKGTGQTVKVVVFT 120
           +V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+  ++ +V +       V VVV T
Sbjct: 87  VVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVT 146

Query: 121 QG 123
            G
Sbjct: 147 SG 148

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. TAIR10
Match: AT3G63490.1 (AT3G63490.1 Ribosomal protein L1p/L10e family)

HSP 1 Score: 99.8 bits (247), Expect = 2.3e-21
Identity = 50/62 (80.65%), Postives = 52/62 (83.87%), Query Frame = 1 

Query: 104 VNLSKGTGQTVKVVVFTQGEKLDEAKNAGADLVGGKDLIEQIKGGFMEFDKLIASPDMMP 163
           V+L KGTGQTV V V  QGEK+DEAK+AGAD+VG  DLIEQIKGGFMEFDKLIASPDMM 
Sbjct: 171 VSLPKGTGQTVIVAVLAQGEKVDEAKSAGADIVGSDDLIEQIKGGFMEFDKLIASPDMMV 230

Query: 164 KV 166
           KV
Sbjct: 231 KV 232

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. TAIR10
Match: AT2G42710.1 (AT2G42710.1 Ribosomal protein L1p/L10e family)

HSP 1 Score: 58.5 bits (140), Expect = 5.8e-09
Identity = 28/54 (51.85%), Postives = 39/54 (72.22%), Query Frame = 1 

Query: 114 VKVVVFTQGEKLDEAKNAGADLVGGKDLIEQI-KGGFMEFDKLIASPDMMPKVW 167
           VKV  F +G   ++AK AGAD+VGG +LIE+I K G ++FD+ +A+P MMP+V+
Sbjct: 240 VKVAFFAEGADAEDAKAAGADVVGGLELIEEILKSGKIDFDRCLATPKMMPRVY 293

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. NCBI nr
Match: gi|700199355|gb|KGN54513.1| (hypothetical protein Csa_4G344090 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 404.8 bits (1039), Expect = 9.4e-110
Identity = 219/219 (100.00%), Postives = 219/219 (100.00%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMVNLSKGTGQTVKVVVFT 120
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMVNLSKGTGQTVKVVVFT
Sbjct: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMVNLSKGTGQTVKVVVFT 120

Query: 121 QGEKLDEAKNAGADLVGGKDLIEQIKGGFMEFDKLIASPDMMPKVWFLNLFTAVHCGGFP 180
           QGEKLDEAKNAGADLVGGKDLIEQIKGGFMEFDKLIASPDMMPKVWFLNLFTAVHCGGFP
Sbjct: 121 QGEKLDEAKNAGADLVGGKDLIEQIKGGFMEFDKLIASPDMMPKVWFLNLFTAVHCGGFP 180

Query: 181 KVLSISNNIVHSNEVVFTCTLKLSTKYVQFRFSCMQYYR 220
           KVLSISNNIVHSNEVVFTCTLKLSTKYVQFRFSCMQYYR
Sbjct: 181 KVLSISNNIVHSNEVVFTCTLKLSTKYVQFRFSCMQYYR 219

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. NCBI nr
Match: gi|471219914|ref|XP_004025042.1| (hypothetical protein IMG5_193900 [Ichthyophthirius multifiliis])

HSP 1 Score: 140.2 bits (352), Expect = 4.3e-30
Identity = 87/98 (88.78%), Postives = 92/98 (93.88%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 63  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 122

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF 99
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF
Sbjct: 123 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF 160

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. NCBI nr
Match: gi|471219914|ref|XP_004025042.1| (hypothetical protein IMG5_193900 [Ichthyophthirius multifiliis])

HSP 1 Score: 139.8 bits (351), Expect = 5.7e-30
Identity = 87/104 (83.65%), Postives = 95/104 (91.35%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + L+IVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 19  LCIYLIIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 78

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 79  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 122


HSP 2 Score: 139.4 bits (350), Expect = 7.4e-30
Identity = 87/104 (83.65%), Postives = 95/104 (91.35%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 35  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 94

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 95  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 138


HSP 3 Score: 139.4 bits (350), Expect = 7.4e-30
Identity = 87/104 (83.65%), Postives = 95/104 (91.35%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 47  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 106

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 107 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 150


HSP 4 Score: 121.7 bits (304), Expect = 1.6e-24
Identity = 75/96 (78.12%), Postives = 84/96 (87.50%), Query Frame = 1 

Query: 9   IFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 68
           +F   + + F  + I ++IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 7   LFFIYINIFFSCLCIYLIIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 66

Query: 69  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 67  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 102


HSP 5 Score: 139.4 bits (350), Expect = 7.4e-30
Identity = 87/104 (83.65%), Postives = 95/104 (91.35%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 144 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 203

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 204 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 247

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. NCBI nr
Match: gi|471223442|ref|XP_004030500.1| (hypothetical protein IMG5_159920, partial [Ichthyophthirius multifiliis])

HSP 1 Score: 139.4 bits (350), Expect = 7.4e-30
Identity = 87/104 (83.65%), Postives = 95/104 (91.35%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 122 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 181

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 182 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 225


HSP 2 Score: 137.9 bits (346), Expect = 2.1e-29
Identity = 86/97 (88.66%), Postives = 91/97 (93.81%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 162 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 221

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 98
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI
Sbjct: 222 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 258


HSP 3 Score: 132.5 bits (332), Expect = 9.0e-28
Identity = 84/99 (84.85%), Postives = 89/99 (89.90%), Query Frame = 1 

Query: 6   VIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 65
           VI I    + VI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI
Sbjct: 105 VIYIIQQKIKVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 164

Query: 66  VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 165 VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 203


HSP 4 Score: 120.9 bits (302), Expect = 2.7e-24
Identity = 78/100 (78.00%), Postives = 86/100 (86.00%), Query Frame = 1 

Query: 5   LVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 64
           LV V    +  VI+++   + VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 94  LVAVYKKKIKNVIYIIQQKIKVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 153

Query: 65  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 154 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 193


HSP 5 Score: 100.1 bits (248), Expect = 5.0e-18
Identity = 69/100 (69.00%), Postives = 78/100 (78.00%), Query Frame = 1 

Query: 5   LVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 64
           ++I+ F  L  V  +V V    I  VI I+   + VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 80  IIILKFIKLNNVKSLVAVYKKKIKNVIYIIQQKIKVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 139

Query: 65  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 140 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 179


HSP 6 Score: 134.4 bits (337), Expect = 2.4e-28
Identity = 83/90 (92.22%), Postives = 86/90 (95.56%), Query Frame = 1 

Query: 9   IFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 68
           +F  + IVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 127 LFILITIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 186

Query: 69  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF 99
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF
Sbjct: 187 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF 216

[Close]
BLAST of Csa4G344090 vs. NCBI nr
Match: gi|471221231|ref|XP_004027559.1| (hypothetical protein IMG5_181430 [Ichthyophthirius multifiliis])

HSP 1 Score: 132.5 bits (332), Expect = 9.0e-28
Identity = 78/86 (90.70%), Postives = 85/86 (98.84%), Query Frame = 1 

Query: 13  LVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 72
           +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 37  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 96

Query: 73  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIF 99
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVI+++I++F
Sbjct: 97  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIIVIIILF 122


HSP 2 Score: 132.1 bits (331), Expect = 1.2e-27
Identity = 80/93 (86.02%), Postives = 86/93 (92.47%), Query Frame = 1 

Query: 5   LVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 64
           ++I++F    + I + IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 117 VIIILFYSYYLFILITIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 176

Query: 65  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 98
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI
Sbjct: 177 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 209


HSP 3 Score: 131.0 bits (328), Expect = 2.6e-27
Identity = 83/112 (74.11%), Postives = 95/112 (84.82%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVI--------FVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   ++++I        F++I IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 103 IVIVIVIVIVIVIIVIIILFYSYYLFILITIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 162

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 163 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 214


HSP 4 Score: 129.0 bits (323), Expect = 1.0e-26
Identity = 83/116 (71.55%), Postives = 95/116 (81.90%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 35  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 94

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV------------IVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI+++I+            IVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 95  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIIVIIILFYSYYLFILITIVIVIVIVIVIVIVIVIV 150


HSP 5 Score: 129.0 bits (323), Expect = 1.0e-26
Identity = 83/116 (71.55%), Postives = 95/116 (81.90%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIV------------IVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVI+++I+            IVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 91  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIIVIIILFYSYYLFILITIVIVIVIVIVIVIVIVIV 150

Query: 61  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 151 IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 206


HSP 6 Score: 129.0 bits (323), Expect = 1.0e-26
Identity = 83/116 (71.55%), Postives = 95/116 (81.90%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 55  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 114

Query: 61  IVIVIV------------IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
           I+++I+            IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 115 IIVIIILFYSYYLFILITIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 170


HSP 7 Score: 129.0 bits (323), Expect = 1.0e-26
Identity = 83/116 (71.55%), Postives = 95/116 (81.90%), Query Frame = 1 

Query: 1   MTVGLVIVIFAGLVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV---------- 60
           + + +VIVI   +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI+++I+          
Sbjct: 71  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIIVIIILFYSYYLFIL 130

Query: 61  --IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIFDIMCMV 105
             IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI  ++ +V
Sbjct: 131 ITIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 186


HSP 8 Score: 132.5 bits (332), Expect = 9.0e-28
Identity = 82/85 (96.47%), Postives = 84/85 (98.82%), Query Frame = 1 

Query: 13  LVIVIFVVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 72
           +VIVI +VIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV
Sbjct: 32  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIV 91

Query: 73  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 98
           IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI
Sbjct: 92  IVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVIVI 116

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csa4G344090 vs. Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
RL1_TRIEI1.1e-1461.2950S ribosomal protein L1 OS=Trichodesmium erythraeum (strain IMS101) GN=rplA PE=... [more]
RL1_MARMM4.3e-1460.6650S ribosomal protein L1 OS=Maricaulis maris (strain MCS10) GN=rplA PE=3 SV=1[more]
RL1_JANSC4.3e-1459.6850S ribosomal protein L1 OS=Jannaschia sp. (strain CCS1) GN=rplA PE=3 SV=1[more]
RL1_ROSDO3.7e-1357.1450S ribosomal protein L1 OS=Roseobacter denitrificans (strain ATCC 33942 / OCh 1... [more]
RL1_BORPA2.4e-1264.4150S ribosomal protein L1 OS=Bordetella parapertussis (strain 12822 / ATCC BAA-58... [more]
BLAST of Csa4G344090 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
G0R4N0_ICHMG3.0e-3088.78Putative uncharacterized protein OS=Ichthyophthirius multifiliis (strain G5) GN=... [more]
G0R4N0_ICHMG3.9e-3083.65Putative uncharacterized protein OS=Ichthyophthirius multifiliis (strain G5) GN=... [more]
G0QZU4_ICHMG5.1e-3083.65Putative uncharacterized protein (Fragment) OS=Ichthyophthirius multifiliis (str... [more]
G0R2U2_ICHMG6.3e-2890.70Putative uncharacterized protein OS=Ichthyophthirius multifiliis (strain G5) GN=... [more]
A0A0L8GJB5_OCTBM1.0e-2549.00Uncharacterized protein OS=Octopus bimaculoides GN=OCBIM_22032518mg PE=4 SV=1[more]
BLAST of Csa4G344090 vs. TAIR10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT3G63490.12.3e-2180.65 Ribosomal protein L1p/L10e family[more]
AT2G42710.15.8e-0951.85 Ribosomal protein L1p/L10e family[more]
BLAST of Csa4G344090 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|700199355|gb|KGN54513.1|9.4e-110100.00hypothetical protein Csa_4G344090 [Cucumis sativus][more]
gi|471219914|ref|XP_004025042.1|4.3e-3088.78hypothetical protein IMG5_193900 [Ichthyophthirius multifiliis][more]
gi|471219914|ref|XP_004025042.1|5.7e-3083.65hypothetical protein IMG5_193900 [Ichthyophthirius multifiliis][more]
gi|471223442|ref|XP_004030500.1|7.4e-3083.65hypothetical protein IMG5_159920, partial [Ichthyophthirius multifiliis][more]
gi|471221231|ref|XP_004027559.1|9.0e-2890.70hypothetical protein IMG5_181430 [Ichthyophthirius multifiliis][more]
Annotated Terms
The following terms have been associated with this gene:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR016095Ribosomal_L1_3-a/b-sand
IPR023674Ribosomal_L1-like
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0019752 carboxylic acid metabolic process
biological_process GO:0009073 aromatic amino acid family biosynthetic process
biological_process GO:0042793 transcription from plastid promoter
biological_process GO:0010027 thylakoid membrane organization
biological_process GO:0045036 protein targeting to chloroplast
biological_process GO:0015979 photosynthesis
biological_process GO:0006098 pentose-phosphate shunt
biological_process GO:0034660 ncRNA metabolic process
biological_process GO:0019288 isopentenyl diphosphate biosynthetic process, methylerythritol 4-phosphate pathway
biological_process GO:0016226 iron-sulfur cluster assembly
biological_process GO:0006354 DNA-templated transcription, elongation
biological_process GO:0051649 establishment of localization in cell
biological_process GO:0009902 chloroplast relocation
biological_process GO:0006351 transcription, DNA-templated
biological_process GO:0006412 translation
biological_process GO:0044711 single-organism biosynthetic process
biological_process GO:0042254 ribosome biogenesis
biological_process GO:0009657 plastid organization
biological_process GO:0019682 glyceraldehyde-3-phosphate metabolic process
cellular_component GO:0016020 membrane
cellular_component GO:0015934 large ribosomal subunit
cellular_component GO:0044434 chloroplast part
cellular_component GO:0009941 chloroplast envelope
cellular_component GO:0009570 chloroplast stroma
cellular_component GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane
cellular_component GO:0005634 nucleus
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
molecular_function GO:0003735 structural constituent of ribosome
molecular_function GO:0003723 RNA binding
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csa4G344090.1Csa4G344090.1mRNA


InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber (Chinese Long)
Date Performed: 2016-09-28
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR016095Ribosomal protein L1, 3-layer alpha/beta-sandwichGENE3DG3DSA:3.40.50.790coord: 109..165
score: 3.1
IPR023674Ribosomal protein L1-likeunknownSSF56808Ribosomal protein L1coord: 103..167
score: 1.7