CsGy5G014280 (gene) Cucumber (Gy14) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCAGGCGTTATCATATGCTGTAATCCTCTCACGATTCTGTTTAAAAACTATGCATCTGGGAGGCTTTTGAATGCTCATTAGACCAGATAGGGCAAATGAAATAGTTCCATGGCCATTTTCTCTTTCATTATTGTTCTAGGTGGAATGAATGGAAAAGTTCCCAAGCTAATTCACTAGGCCCGACTTTGGTGGAAGCTAAGCTGAGAATCTCAGATAAGCTTTTTCTACCCATTTCTTTCTCTTTTCCTAAACCTCCTTTTAGTCTTATAATGTATTGCTTAAGCTCTAGCTATCTTTCCTCGACTAATTTAATGGCCACGAAACTTCTTAAAAAATTTGTCTGGTACAAAATTACCCACAACACTGACCTCTCACTCACAAGTTGGAGCCCATGAAGTAACATGCAATTTATGATTCTAGTACGTATTGGGAGTTATAATCTTTGTTTTGTTAGATTGATATATGTGCTTGGTTTACATAACGATGGTTTGCGCACTTAAAACCCTGTAACTCCAGGGTATCTAACTAAGACACTCTTAATTTTACATTGTACCTGTTCTTCCCATTTTCATAGGTATATGGATATCGAACTTAACTCACATGCACTTCATTGTTATCCCCTGTTGATATTTATGTAAACTAGTGTCCTAAAATCTCACTTAGTTTTCATTAAACAAAATTATTTATTTAAGAAAGCCTGAAATATTTTATTTTACTTTTAGACAATATTAATTCAATTCAATAAACAAAGACCCACGTTATATAATGTTAGTCAAATAATACGTGGATGACATACAAATAGTTCATGTGTTCAAGTTATAATCTAAAAGGTCTATGGTTACGACCCACTTTGTAATTGTTACATGAGATGTAAATGTTACAAACAATATGAATTGTATTGTTCATACGAAGATACGTGAGTGAAATGTATAAAGGGGTTCATACATGGGATAATGGATGGTGAAATAATTGATTTCTTTTTATATCATTATTACGTCCAGTTCCATAAAATTTACTTTTGTTGGAATTTTATATACCCGTGCACTTAAGGTGCTTGAGAAGAAAATTATTCACCTAATTCTTTTAACGTATATTTAAAGAGGCTAGAGTTTCAAGTGAACTTGAGAATCAAATAGAGACAAATGAAAAAATCAAAGAGTCAATTTGTAACTGGGTCGTGATGATTGTCAAATTACTTGACAGTAGCATAAATGAATAGTTGTTTGAGCATGCATCACAAACTTTTATTCAATTGCTCAAAGATTTAGAGAAGGTGAAGAAAAGTATTTGGATGGAAAATAATAGTGCAGGTAGTTGGTGTTTAAAATACTCGATGGTGTAATATGCGATGTGATAGAGGTGTGTGAATATTAGTAATGCATCTTTAAATGTGTTGGTAATGCTCTACCACAAGTTTTTCTATATATAACCCCAAGTGTAAGTTAAGCAAAGGTTTTTTGAAAATGATTCGAGGTCAAACACGAAAAATAAACAACATATGGTTAAAAGATCGAAGAATGTTGTCTATGCAACTGAGTGTTTATCAAATATACGGGCTGTGGTTTATTTTTAACTATAAGAAAGTATGTGTTCTAATTTAAAGAGAGTGTGACAACTAAGTGACAACGCCAAAAAGGAGATGAATAAGATCAAAGGATGAAGTGAATTGAAGGATGTGATAGCGTCATATTTATATTTGTAGCCTTGCATTGTCTCCACTGTGCAATGAGTTAGCCACATGTGTCATATTTTTATGATGCATGCTAAGGTTAGTCCAGAAATAAAGAGAACTTCTTTACCCGACTTAATAAATTCTGCAATCACTTATTTGCTCGAGCAGTTAATTGCTACCACTTGATTCGAATTGGTATTGGGGTCAACAGTTAGGAATAGGATATCGCATCCATATGACTATGAATGCCAACGCATGCTTCACAACTTACTATGTACTAATCTCATTCTCCTATGAAATTAATTAAGCTGCTATGACAAAGTGAGAAATCAGTGTCGACAACAAAACAATAACTTTAGCTATGGAATGTGATTAATAAGAAAATATAAAAAGACAAAAGAATGATGATGTTGTAACAATTATAGAAGGAATTGTAACAAATGAATATGATAGAAGGAATTGCAGCTGTAACAATTTCCTGCTCTTAGCTTTAAGTCAAGGTTTTATACAAAGTCTCAATGAAATGATACTAGATAGGATTCTTTCGAACTCTCTTAAATCTCTTCACTTTCTCTGTAAAGAAATTACTTAAATTGTACTCCTATGATATCTCAATCTGTTATTTGATTGATTTTAAGGTCTCTCACACTTAGTTGATTGAATCCATACAAGTGTTTGTCACGGAAAGATGATTAAAATACAATCTCAATCTTAGAATGTTAACTAGAGTGCCATAAGTTCCAACAAAAATTTCAATCTAGTAGCTTATTTGGCTAGTTAGATGATGATTTGAAAAAAAGACTTCATTGGCCTTTTATAGATGTTGGACATAGAAGATAACTTCTAATAACCCATATCAGTGAATGTTGAAAGTTGAAATATTCTTCATGTTTTCTGGCACTATCTTTGTGTTATTCAATATTATGGCAGTGAAACTCATGTTGGTATTGAGTGGGTGTAAAATGTGAGTCCAGTGTGTCCTTGCATCATTTTTTGATATTAATTGCACTGCATTGAATCTTGCTATTATTCGTCATGCTTCAACTCTATATTGATATCTTGTCCGTGCCTAGTTATATTTGTGTTCATCTTTCCTGATGCATCTCAGTTTCCAGTTTTCTATTATAATCTTGTGTTAAACAACATGAAATATTAAAGATTATGGTGGATATGGTTCTTGCAAACTATGACATATAGTTTCTTGGGCTTATTTCATTTTGAGTCCAACCCACAACCATTTTTAGGTTAATTTTATTATGCAATTGATTAATGAAGACATTAAGTTGGTAACGGCCACAATGTAAAAAAAAAATAGAAAAAGCAAAATTTGTATGGTTCGTATTTCAAACATTTGGGGATGGATCTGTCGTCCGATCGAGCTGAAATTTTGATAATATATTCTTGGCACGAGGGTTTTCATTCTGAACGGTGGAGATTTTGTTTGGAGCTAAGTCAGATTCTAGTGGATAGTTGGTTACCACATATTGTGAGATATTTCTATTTTTCTTTCATTGTATTGCTATTGTCGTTTGTTGTCGGGATTTTTATTTATGAGATATTTGTCTCTAGTTGTGATTAGGGAGAACTTTGTTGTACCCATTAAAAATTATAGTGCATATTTTTTACTTCGGTATGTGGTTCTCTACTCCTCACATTGAGGGAATTTTTCCACGTTAGATTTGTTGTGTCCATACTTTGATAATTGTTGTTATTATTGTTGATTAGTATCCTATCAGGTTCACACAAGAGTGGAATAATTGATCCAAGTTAAAAATGTTTATCACAACAAAGTGGTATCAGAGTGTTGGTTAATAATTAATTGGGATTTAATTGAAATTGCTTTGTTTTGAATATAGATACTAGTTCAACTAAGATGGTTAGCCTTAATGGGTCAAATTATCAAGTATGAAAAAGAAAAATGGAAGACATATTTTATGTAATTGACTTTCACTTTCCATTTTTTTCTAATGAAAAACTTGACAACAAAATTGATAGAGAATGAGAATTATGTCATAGGAAAGTGTGTGGGTTTATGAGGCTATAGGTAGGAGATAATTTTCTAAACAATATTTGTGAAGAAACTCATGCACGAACTATGTGGAATAAGCTCGAATCGCTATGTGCCCTTAAAAGTGGTAATAATAAAATATTTCTGATTAAACAGATGATAGAGTTAAAGTATCAAGATGGAACGTCCATGTTAGATCACTTGAATACATTCCAAAGTTATTTTGAATAAGTTATCTAGGATGAATATCAAGTTTGAGGATGGGATACATGGGTTTTGGGTTCTCGGTCCATTGCCGGACTCGGGAAAAATATGTAGAACTTCCCTATCGAACTCAACCCCAAATGGTGTACTAAGTATCGGCATAGTAAAAAGTAGCATGTTGAATGAGGAGATGAGAAGAAAGTCTTAGAGTTCTTCTTCGCATTCAGATGTTCTAGTTACTAAAAAAAGGGAAGGAGTAAAAGTAGAGGTCTGAGAGGTAATAATAGAAGCAAAAGCAAGAGTGATCAGTTTGCAACTGTTGAGTGTCACTATTGCCATGAAAAAGGGCATATAAAGAAGTATTGTCGAAAATTGAAAAGAGATAATAAAAATCATAAGGGCAAGGAAAAGAAGAATGACAGTGACAGTGATACTGATACAACCACTGTAGTCATTGAAGATTTTTACATCTTGTCTAATAGTGATGTTGTAAATCTTGCCACACAACAGAGCAGTTGGGTGAGATTGATAGTGGTGCTTTAGTTCATGCTACTTCAAAGAGGAAATTCTTTGCATCCTATACTCTTGGTGATTTTGGTAGTGTTAGGATGGGCAACGATGGATTGGCAAATGCAGTTGGCATCCAAGAGTATACTTGAAGAGAATAGAAATGGTTATAGGCCGATTTTAAAAAATGTAAAACGTATTTTGGATATTCGCATGAACTTGATTTCTACAGATAAGCTTGATGACGAAGTTTTCTACAATACCTTCAATAATGACATATGGAAGCTTACTAAAGGTTTCTATGGTCATAGCAAAGGGACATAAATTTTCTTCATTGTACTACATAGATGCTAAAATCATGGATTCTGATATAAATACAGTAAATGATGGAGCGAATGTTGAGCTTTGACATAAGAGACTTAGCCATATGAGTGAGAAGAGTTTAAAGATTTTAACCAAGAAAAATCATCTTCCTGATTTAAAGAGTGCACCTCTGAAACAGTGTCCTCATTGCTTGGCAGGAAAGCAGACGAGGGTTTATCTTTAAATCATCTCAACATTCAAGAAAGTCAAATGTACTAGAGTTGGTACATTCTGATGTGTGTGGTTCCATGAAAATAAAGACGCTTGAGGGTGCATTGTACTTTGTGACATTTACTGATGATCATTTAAGAAAAATATGGGTTTACACCTTGAAGACTAAAGATCAAGTGTTGCAAGCGTTTAAACAGTTTCATGCATTTGTTGAGCGAGAAACTGGGAAAAGTTTAAGTGTATTAGAACCAAAAATAAAGGTGAGTACGGTGGGGCTTTTGATGAATATTATGCATAAATCATAGCATTTGACATCAAAAGACATCTCTTAAGACTCTGCAGTTAAATCGGATAGCTTAAAGATTTTGAACAGAACATTGGTGGAGAGAGTGAGATGCTTACTATCTCAGTATCTCACTCACAGTTGCCACAATCATGTTGGGGTGAAACATTAAATATAGTTGTACATGTTTTGAAATCTCACACCATGTGTTCCATTGAAATTAGAAGTTCCAAACAAAATATGATCAGGTAAGGATATATCTTATAGTCACCTACGTGTCTTTAGTTGTAAAACTTTTGTTCATGTATCTTAAAGATGAGAGATCAAAGCTTGATGCAAAAACTAAAGTATGTGTGTTCCTTGGCTATGGCCAAGATGAGTTTGGTTACAGATTCACTACGAAAAATAGGCTTTCTTGACGTTTGTAGTTATAATTACTAAAAACGTATTATAACTACAAACGTCAAGAAATGGATGATTTCAAAGAAAAAACGTCAAGTAATAACTATTAAATTCTTAACGTTTTTAAAACGTCAAGATTTTTATGAAAAGGCATAATGGAGGTAAGTTTTTTAATTTCTTCACATTTTTTAAACGTCAAGTGAGATGTTTTTCTTGACGTTTTAAAAACGTCAAAGTTCTATAAAATAATAATAATAAAATATATATAAATTTTTTATAACCCCCAATTTCTTGATTTTGGGCAAGATATTAAAAACGTCAGTGACGTTTTTCTTGATTTTTTATGGTCAGCCCATCCACCCACGTAGTGCGCAAGATACATTTTGGCAACCCACGACAAGTAACGTTTGGACAACCCACTATTGGCAACGTCACATTATTCAACCGACCCACTCCTTCTCAACGATGGTGACCCATGGCTGACGACGACTCGAAGAAAAAGGTACGTAGTATTATTTTCTCTGTGTCGATCATCTTTGATTAAATTGTTCTATCTTGTTCCCTTCCATTTGGGGGTTTTCAGTTTATATTACGCTAATGTTTCAGTTGGAATGTCGTCGTTAGATTTCCTTATGGTGTTGGGCACTGAAAGCGATTTGTTTTTATTACTGTGTGAATGTTCTAGTTTTTTTATCCATTTAAACACATCAAATGAAGGAAATGTATTTAAACCGACGATGCAAATCTTGAAGTTGATGTTCTCTCCGATGAAATCAACTGGTTGATTCTTGTTTTGATTAACTTTCTACGGTATGTTTTGTTTATCTTTCTACAGTTTGTTTTCTTTTTTTATCAATTTCCTCTTTATCATTTTGTTATTTTCTTAGTCTAATTATTTTTAAAAAGAATCAAGGAGAAAGATGAAGTGCAAAATTTGGGGATTTGCTTTGCTTTGGGTTCCCTTCCAAGCTCTGCTTTGGTCAAAGATATTTACTTGTCTTTATTGTTGCCATGGTACTGTTGTTTGAACTTTATGAATAAACCATGTTTATAAGAAATTATTCCTCTTATTAGGCCTATGTTGTTTTCATGAATATCCTTTGTTTAACCACAGTTGTATTGTGTGATTTGGCTTTTTACATCTTTGACATTGATTTTTATTTATAAAGAGAGTAAGCATGGTTGTGGCGGAAATGTGAAAATATTCCAACTCCTCAGCTTGTTCATGATATGTTTTTTCTTTTCTTCTTTGATTTTAATTCTTACGACCAAATCAAGATTAGTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTCTTATTTCTCGTTTGTGTTCTTAATTTTTTTTATGTGTTGAATTTATTGAGTTTGAATAATATATAGAGGATAATATTACATGGAGTATGATGAATAATTTGCAAGAGAAATGTTGGTTGGAGTTAACCTAGTAGTCATTGCTCGTTATTGAAGATGCAAAGATTATTGTTACTAAGTGTAAGTTTGTTGTTCTTTGTGTGTTTGGTGGAGGGTTGGGTGTGAAATATTAATGTCTTACAATTGGACTTGTTTTAGTGTCTTACAATTGTTTGAATAATATCATTAGGTTTTTAGTTTCTAGCTATAATTTAGTTTGAATTTTTATGTTGTTTCTTTTGAATAATATGTTTCTTTTGAATGATAAGTTTTATATATGTGTTAGAATCTTTTGACAAAATTCAATACATCAAACTCCATTCAAGTGGTTCATTGTCCGCCAAGTATTAAAGAAACTGTCCAATGGTTGACGAGCCACAAATTTATAATGTTTAGATTGTCTTATATTAGCTCCCTAATTTATAATGTCATTTTCAGTTAAGTAAGTTGCTATGGGTAGACATTTCTCTCCAATGTTGTACTTGTTTTTATCTTTGGTAAATTATTGATAATCACATGGCACAAGAATTGAACCATTACGAGGGAGACGTCAAAGAACTATTTCTCTTTGCATCCTCTAGTAGATTTTGGATTTTTCCCTTCCACTGTAATGGAATTGGACTGAGAAAAGTTAATGTGTTCTAGTTATTTCAAGGTGCTGGCACTTACGTTTATAGAATTGATGATGAACGAGTAATTGATGCTACAAGGGCTGGTGAGAAATGGTTAAAGAACTATTTCGATTCATTCAGTGGAGGCTTCTTGTTTGAGGTGAGAATTTATCTATTTCTTTTGCAGTTTAGATTATTTATCTATTCAGGTGAGAAATGCATGTATGTGAAAAAATGTTGAGTTATCTATGTTGAGTATGCATGTATGTGAAAAAATGTTGAGTTATCTATGTTGAGTACTTAGTGATTCCTAATGTCATATTGCCTTCATGATGTCTTGGATTGTTGGGTTAGAGTCTGTTTGATAGATAACAAGATTCTTAGGATTAAATGTGATAATAGTGGATGTAAAGAAACAAGACTCGTATGTTTAAGAGAAGTGGAGATAATATGTAATTGGTCATTTGGATTACATCTTGTGAACTCTCTCATATCATTTCTTAGTTGTAGTAGAAAAGTGATTTGA ATGGCAGGCGTTATCATATGCTGGTATCTAACTAAGACACTCTTAATTTTACATTGTACCTGTTCTTCCCATTTTCATAGTTTATATTACGCTAATGTTTCAGTTGGAATGTCGTCGTTAGATTTCCTTATGGTGTTGGGCACTGAAAGCGATTTGTTTTTATTACTGTGTGAATGTTCTAGTTTTTTTATCCATTTAAACACATCAAATGAAGGAAATTTAAGTAAGTTGCTATGGGTAGACATTTCTCTCCAATGTTGTACTTGTTTTTATCTTTGTTTAGATTATTTATCTATTCAGGTGAGAAATGCATATAACAAGATTCTTAGGATTAAATGTGATAATAGTGGATGTAAAGAAACAAGACTCGTATGTTTAAGAGAAGTGGAGATAATATGTAATTGGTCATTTGGATTACATCTTGTGAACTCTCTCATATCATTTCTTAGTTGTAGTAGAAAAGTGATTTGA ATGGCAGGCGTTATCATATGCTGGTATCTAACTAAGACACTCTTAATTTTACATTGTACCTGTTCTTCCCATTTTCATAGTTTATATTACGCTAATGTTTCAGTTGGAATGTCGTCGTTAGATTTCCTTATGGTGTTGGGCACTGAAAGCGATTTGTTTTTATTACTGTGTGAATGTTCTAGTTTTTTTATCCATTTAAACACATCAAATGAAGGAAATTTAAGTAAGTTGCTATGGGTAGACATTTCTCTCCAATGTTGTACTTGTTTTTATCTTTGTTTAGATTATTTATCTATTCAGGTGAGAAATGCATATAACAAGATTCTTAGGATTAAATGTGATAATAGTGGATGTAAAGAAACAAGACTCGTATGTTTAAGAGAAGTGGAGATAATATGTAATTGGTCATTTGGATTACATCTTGTGAACTCTCTCATATCATTTCTTAGTTGTAGTAGAAAAGTGATTTGA MAGVIICWYLTKTLLILHCTCSSHFHSLYYANVSVGMSSLDFLMVLGTESDLFLLLCECSSFFIHLNTSNEGNLSKLLWVDISLQCCTCFYLCLDYLSIQVRNAYNKILRIKCDNSGCKETRLVCLREVEIICNWSFGLHLVNSLISFLSCSRKVI
BLAST of CsGy5G014280 vs. NCBI nr
Match: KGN48951.1 (hypothetical protein Csa_6G507250 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 4.2e-07 Identity = 33/45 (73.33%), Postives = 35/45 (77.78%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G014280 vs. NCBI nr
Match: XP_011658499.1 (PREDICTED: aspartic proteinase-like protein 1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 4.2e-07 Identity = 33/45 (73.33%), Postives = 35/45 (77.78%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G014280 vs. NCBI nr
Match: XP_016899154.1 (PREDICTED: aspartyl protease family protein 1-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 7.9e-06 Identity = 31/45 (68.89%), Postives = 34/45 (75.56%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G014280 vs. NCBI nr
Match: XP_022132579.1 (aspartyl protease family protein 1-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 8.7e-05 Identity = 28/45 (62.22%), Postives = 32/45 (71.11%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G014280 vs. NCBI nr
Match: XP_022926492.1 (aspartyl protease family protein 1-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 3.3e-04 Identity = 27/48 (56.25%), Postives = 33/48 (68.75%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G014280 vs. TAIR10
Match: AT3G51350.1 (Eukaryotic aspartyl protease family protein) HSP 1 Score: 41.6 bits (96), Expect = 5.2e-04 Identity = 21/35 (60.00%), Postives = 23/35 (65.71%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G014280 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0KML0|A0A0A0KML0_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G507250 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 2.8e-07 Identity = 33/45 (73.33%), Postives = 35/45 (77.78%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G014280 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S4DT41|A0A1S4DT41_CUCME (aspartyl protease family protein 1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485161 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 5.2e-06 Identity = 31/45 (68.89%), Postives = 34/45 (75.56%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |