CsGy5G009970 (gene) Cucumber (Gy14) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCAAGAGAATTCAAATGGGGAAAGGAACACAAACTTCTACTTGTACGTTATACCCATTGCTATTTTGTTGTTGAATGTGAAATTTGGATTTGTCGTAGTTGACCACATAAATTGAATACGTTTTTTAGTAAAATAAACATGTGAAAATGTAGAATTGAAGTCCAAATTGTAAGGTTAGGAGTGTGTGTCAATTATCAATAAATCACTTTATCATCAATTCAACTACTTTGATAGACCATATGGATTATGCTATTCTTATTCTTATTAATGTTATTGTGTTATCTAAATAATGTAAAGTACTAGCAACATGCCTTTAGTGTTAAATGCACCCGTTGATGCTAATAATCTTACATTGTTGTTTCCAGTATTAGTAGAACACACTCTTGACAAACGAGCACTCGTCAAAAAGAGTTAGAATCATGAACACTTTATCTAGTGAGAATACACAAAGATGAGTAAGAAAAAGAAAACAAAAAAAATTGCTTGAGCTTGTTTTTAGAAGCAAAAGTTCATAGACTATTTTGCATTTGGACAAAATTAAAAAAGAAAAGAAAGAACAAATAATTGTTTTAAGGTGCAAGTGAGGTTATTTGAACTTTGAACTTGACAAACAATAGCCGCACAAGTGTGGGAAGTGTTAGTACCACTTTAAACACTATTTGTCAGGGGTATTAAAAAAAACCAGTAACTCGATCAACTCGTATTACTCAACTCAAATAGTAAAGGTTAGATTGACTTAAATTTTGTGTTGGGTTATGTTGGATTAGAAAATTTGAGGAAAAAATGGTTTTTGACTCAGATGACTTAAATGGTATACCATATTACAAGATTGACCCAAAATTTTCAGAAATGTCTAAATTGACTAATATTTTACGGCAAGCTAATTTTAAAGGTGCCAAGTGAATATTGATGTATTTTGTAGCCAACAAAGATTTCACCGGTTTTGTGTATCTCATTTTTTCCCATTTGCTCATGGAATTGATATAGATTCTTTCACTGCTTTGCTTATTGAAATTTTTTTCTTTGATGGTTTATGTGATATATTGATGGTTCGTTGTAGGAAAAACATCTCTCATAGTTTTGCTTTTATAGGAATGGTTCTTTAGATTCTTGTCAACATGTTTATGTATGCTTCCTTGATAGTGACTTCTAGATTCTTCCTTTGTAGTTAGCTCAACATAAAGGGATTATTTCTTCAAAACCATTACCTGCACTTGTTTTCACGTTTCTAGGAATAGGTTAGTAACTACTACAAGCAGGGGTAGATTGTTTATATTGAAGATGTAAAAGAAAGATTGGAAAATGCTCCAAGCACCATTTGATGGACTTTTTTGTGGAGATAACTTTGGTAAACAAGTTGTTTGTGTTGCACATCAATGATTTTTGGTGATCGATCGTTGCATGAAAATAGCATTTAACAGGAAAACTAGAAGCTAGATTGAATTCTTCTTCATTTTTTCATATTCTTATTAAGTTCTTTATTTCTTGAATGCCTGATTTTAGTTTGGTTTAAAAGATATAAGATTGGTTTGAGAAAGAATCTAAGCTCAGTTGAAGTCTCGTCCAGCAAAATGGTAGTTTCTCATGGGTGTGACTTCAATGATACTCTACTGCCATACTATATTTTAATGAGAAATAAATGGTTTTGCTCTTTCTTTATGTTGTATTTCTTCTTATTTTCTCTTTTTTCTTCTAAATTTAATGGTAAGCTTTGTCACGTTTGTTTGTGTACTAATGAGTCAGTTTTTGTGCTTTCTATTTAACTTCTTGTGTATCATGAAGTTTTTCTCTACTCTTGCTTATTCTGCAATATTTAAAGTCCATTATAGAGAACTTTCATGCTAAACAAGTTGTCTGGTGCGATTTTCCTGAACTTATACAAGGAGGAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAACAATTATAAGTAGTTGAATAATTCCTTTTTTCTCATCTTCTGAATTTTGCGGTGAAGAGTACCTTGGTTTACGCATTTCTTTCATGTTTACTATAGCTCAGAAGCAGTGTTGAATATCATTAGGGTTCAAGAAGAGATTTAAGTTTCACATTTTCTTTATTTTCTTATATTTCATTGGTCTGGTACAATAATTACTATAATACAGAGTTAATGATTCCCCCGTTTTGGTTTCATCTAATAAGTTATCCGTTTTTTTTTTTATGATTTATTCTGTAGTGGTAAAACAATTGAGCTTGATGATATTACTTTTAGCCAATGTGTAAATTTGACGAGGTTCAACTCATAGAAGACATTTTCATGCTTACACACGTATGTGCAAAGTATTTCTTCTCCTATATCTTATATAATCTCTTGTTCTTTTGTTGCAGATATCGTATTACTGAGGGTGTTAATCTTCCATTTTGAGTACTCCCAACAATTAAGGAGCTTGGTAGGACACATATGGAAGTTAATGTCAAGGTTTGTGGTTAACCTCCCATCTCTTGTAATTATTTGTTTGCGTTCTTATGGTTTTATTGTTCTTATGGTGTATAGTTTCCAATTATTAAGATTATGGAAAGGCTGAGTTTAGAGAAAAAAAAAACTATGTTACTTGTACACCACTCGAAGGAGGTGAGCTACATTTCTATAAAAAGAAAAAAAAAGTATAAATTCCGTTGGTTTGAGATTTTGGGAAAAAAAAATGGAACATACATATATTATTGAACGAGAATATTTATAATAAAATATAAATATTATATCTACGTAGATATAATTAACTTTAATTACAATCTTCTTTTAGGGAATGTTTTTTAGTCATACTCTAAAATGAGATTTTGTTTTCTTACTAGCTGGTGAAGCCAAAAGAAGATTTGGAAGAATCCATTGGAGAAGTGAAGCCAACTTGGAGCAATTGATTGATATAAAACTTTTTGTATGGTTGATAGCAAAATTTTGGTTCCAATCTACTTATTTTAGACTTGTTGGTAGCTAAAGATGTCAATGTTTATTCTTTTTTATGTAAACTATCTTTAACAAAAAATGGTTATTAGTTAATCCTAGTTTATGAAGATTACAAAGTGTATCATAACATATACATATTAAAATGTTAACTATTTGTTTTCATATGGGTGTGATTTATTATAATAACTTTGTGATTGAACTGGTTAGTGTAATGGCAGAGCGGCAAGAAGAACGACATATATTTTATTGCAAAAAAATGTAGTAATTGAAAAATATATTTTTTTGTGGAAATTTAAACCTGAGACCTCTTGTCTACATAAACATACATGTGCCAATTGAGCTAAGCTCATGTTGTAGATTGGAATTTTACGAAAAAATATGTAAATTTGGATTGTTTAGGACACTTGCAAAAATGACAAAATATAACTATTGGAATTTTATGAAAAAATATGTAAATTTGGATTGTTTAGAAAAAATATGTAAATTTGGATTGTTTAGGACACTTGCAAAAATGACAAAATAAGTTATAATAAGGGATAGTTTTGCAAATGATTAGGGCCTTAAAAGATGAGAGCATAAATAAATAATGGGTAGGCCATTAAAACAAGATAAAAAAATATGATGGAAAGAAACAAATCGCACAAGAGGAAGAAAAGAAAGAAGATGAAAAGAAAGAACGAACCTGAAATATTTTAAAAAAAGTGGCAAGTTTTATGCTTTTTTATTTTTTACACTAGCCGTAAATATTTTTTCGATTGGTTATGTTTACGAAGATTAACCTAATTTTATATATTTTATTGATTAAACAATAATAAAGACGAATCAATTTAAAAAATAAATAACTATGAATGATATTCATTGTATTAAAAAATAAAAAATAAATTGTATTCATTTTCCAATGAATGTCTTTTACCATGAATAGTATGTCGAATCAAAATTTGTAAATACATGATATCTAATCCAAGGTGCTAGGAATATAAAATGGAAAGTCATCATCGTTGAATTCACATAAATTTATACTATTTATCCATTCATCGTCAATGATCACATAAGGTGTGTTTTCAGTACCAAAACTAGCGCTTTCATTTGTGAACAATGAAGGCTTGTCAAACATATCAACATTATCTTGATTAGTGGCCATAATATTGATCATGTGAGCCATAACACCACTATCTAAATTAGTGGTCTTATCATACATGAGATCTAAGTTGTAGATCGTCTTAGATGTCATTAATCTTTGCTCATAGCCATTCAAGCCTCCTAAATTTAGACTATGATCTTTTCATCTGTTGTCAATGAGCATGCAAGGTACGTATTCAATACTCAAACGACTTTCTTTTGTGATCATTATAGGCATATCAAGTGTATCGATATTATCTTGTTTAGCAGTCATATATATTGGACACATGGTCCACAACACTAGTATCTTGATGAGTGGCTATATCATGCATGATATTTGAGTTGTAGATCGGCTCACATGTCATTAATCTTGGCTCTATTGATTGCAACTAATCAACAAAACATCTTTTCTTTGCTTTTGTCTTTGGTCTTTCATTACTAGAGATTTTTGGTGTTTATTCTTTTCTTATTAGTTTGTTGCAACTCACATGGTATTTCTAA ATGGCAAGAGAATTCAAATGGGGAAAGGAACACAAACTTCTACTTGTACGTTATACCCATTGCTATTTTGTTGTTGAATGTGAAATTTGGATTTGTCTTTGGTTTAAAAGATATAAGATTGGTTTGAGAAAGAATCTAAGCTCAGTTGAAGTCTCGTCCAGCAAAATGGTAGTTTCTCATGGTGGTAAAACAATTGAGCTTGATGATATTACTTTTAGCCAATGTGTAAATTTGACGAGAAGACATTTTCATGCTTACACACATATCGTATTACTGAGGGTGTTAATCTTCCATTTTGAGTACTCCCAACAATTAAGGAGCTTGGTAGGACACATATGGAAGTTAATGTCAAGTTTGTTGCAACTCACATGGTATTTCTAA ATGGCAAGAGAATTCAAATGGGGAAAGGAACACAAACTTCTACTTGTACGTTATACCCATTGCTATTTTGTTGTTGAATGTGAAATTTGGATTTGTCTTTGGTTTAAAAGATATAAGATTGGTTTGAGAAAGAATCTAAGCTCAGTTGAAGTCTCGTCCAGCAAAATGGTAGTTTCTCATGGTGGTAAAACAATTGAGCTTGATGATATTACTTTTAGCCAATGTGTAAATTTGACGAGAAGACATTTTCATGCTTACACACATATCGTATTACTGAGGGTGTTAATCTTCCATTTTGAGTACTCCCAACAATTAAGGAGCTTGGTAGGACACATATGGAAGTTAATGTCAAGTTTGTTGCAACTCACATGGTATTTCTAA MAREFKWGKEHKLLLVRYTHCYFVVECEIWICLWFKRYKIGLRKNLSSVEVSSSKMVVSHGGKTIELDDITFSQCVNLTRRHFHAYTHIVLLRVLIFHFEYSQQLRSLVGHIWKLMSSLLQLTWYF
BLAST of CsGy5G009970 vs. TAIR10
Match: AT5G46630.2 (Clathrin adaptor complexes medium subunit family protein) HSP 1 Score: 46.2 bits (108), Expect = 1.7e-05 Identity = 22/42 (52.38%), Postives = 27/42 (64.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009970 vs. Swiss-Prot
Match: sp|O23140|AP2M_ARATH (AP-2 complex subunit mu OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AP2M PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 46.2 bits (108), Expect = 3.1e-04 Identity = 22/42 (52.38%), Postives = 27/42 (64.29%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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