CsGy5G004770 (gene) Cucumber (Gy14) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTAAATCTAGACACAAAATTAAAATTAGAGAAAATTACCTTTTTTTTAACTCAAGTTTTAAAAGAAAATGTAGGTATCTTTTGGAGAGTTTTAGTGTGGAAGTTGAGGGGACTCATAGGGTAAATGAATCTAAAGTGAAGATTAAAAAGTTATAGTTTACAATTACAAGTCGGGGAAGAAAGTAAACATATTCTTATTCATGAAATCTTCACAACATAAAACTTTGTTTTTTTCATCAAAATTAAATTACTATTTCCCTTTTAATTTCTATTATAATATTTTCGAGAGATCCGCGACCACCCAGTTCTGATCCATTTCTCTCTACCGCCCCATCTTTTTCTCGCCACCACCCGCCGCCCTTCTCCGACGACCAACTCCCGAACCTCCAACCTTACGTCCTCGCTGCATTCGTTCTTCTTTTCTCCCGCGGATTTCTCTTCAGCTACCTTCAACGCGGCGGTGCTACTCAAGCTCACCCCTCAACCCAACACTGCTTTTGCCCTCAAATCAGTTCGTATATAGCTTGAAGCGCACAAAACGGCGAAATCGTAGTAGTTTCGTACCATTTTGAACTCCTTCCAGCAGCATTCCCAAGTCAATTTTGGTAAGATTTGGATAGTGAAGTTGTGTTTAAACTCTTTCAATCTTGATTAAAGTAGGTTAGATCATTCTTTAACCTTTGGAAAGTCTCTGTATGCATTTTTTTTTTTTTATGAATGGTTTGATAATGAGATTGATGCAATGATGGAGATTGGAGGAAATGAATTTTGTTAATGCAATTATATGAGGCTTTTATCTCAGTGGGATATACAAAAAATGGACTAAGGTGTGATCAAAGTTCATTTGGTAAGATTCGTACTTGCAAGCCTTTGTAAGTAATAAGTTTAAAATGGAGGTTCCTCTATTGGATGAGACGGTCGAGGGTGCAGTTGGTTACAATGGCAACCCAGTCTGTAGATCCAATTCCGGCGGCTGGAGATCTGCCTCCCTCATTATAGGTAAATGTAAATCATCATTAGCGTCTTCTCTTTCCCTATGATCCTATCCAATTTATGTATCCTGTCCGATTGTGATCAGGAGTGGAGGTTGCTGAGAGATTTGCCTACTATGGAGTTTCCTCCAACTTGATTAACTTCTTGACGGACCAGCTTCAGCAGTCAACGGTCACGGCAGCTAAGAATGTCAATGCCTGGTCCGGTACCGCCTCCTTGCTACCTTTACTCGGTGCCTTTCTGGCTGATTCATTCCTTGGACGATACTGGACTATTGTTCTTTCGTCTGCCCTCTACATTCTGGTTCTTCCACTACTTTATCCTCTTGTTTTGTGTGCTTTCTTTTTCCATTCTCAATTCCCAACTATAAAGTTTTACAAGAGGATGCAAGTTTTTGGGTAGGGATATGGTAATTCAGGATTATTTTTCCTTTTGTTGTTTCTGGAATTTAGGGCCTTGGGTTGTTGACCATGTCTGCATTGATACCTTCTCCAAGCACTTCTGCCTGCCAACAGACTGAAAAATCCTTACCATGTTCTCCCAATCTTTTCCAAGTTATTTTGTTTTTCTTCTCCTTATATTTGGTCGGATTGGCTCAAGGGGGACACAAGCCTTGCGTCCAAGCTTTTGGAGCTGACCAATTTGATGGACAACATCCAAAAGAGAGCAGATCTAAAAGCTCTTTCTTCAATTGGTGGTATTTTGGTATATCTTTGGCCACATTTGCAACTGTTAATATCTTGAACTATGTGCAAGATAATCTCAGCTGGAGTCTTGGTTTTGGAATTCCTTGTATTGCTATGGTTTTAGCACTTGTAGTCTTCTTGCTTGGAACTAGGACGTACAGGTTCAGTAACAGAGGGGATGAGGAAAATCCATTTGTAAGAATTGGACGGGTGTTTGTCACTGCAGTAAAGAATTGGCGAGTGAATTCTTCAGAAATGGCTCATGAAGAGGAAATCCGTGGCCTGTTACCTCACCATAGCTCTAAACAGTTGAGGTAAATCAGATGTCTAAAGAAGGGTAACATTGGCTTAGAAACAATTTTAATTTGTATGTATTATTGTAACACTTTTCTTTACTGGATTCTATAATTTGGTAGGTTTCTCGATAAAGCTTTGATCACACCTAATAGTTTGAAGGAAGACGGTCGTGCATGTAGCATAAGTGAAGTTGAGGAAGCAAAAGCAGTACTGAGGCTTGTTCCAATATGGGTGGCATGTTTAGCATTTGCTATTGTATTCTCTCAGTCATCAACTTTCTTTATAAAACAAGGAGTCACAATGGACAGATCTATAACTTTTGGGTTTGAAGTACCCTCTGCTTCACTTCAATCATTTATTAGTCTATCCATTGTCATTTCCCTCCTGATATACGATCGCATACTCATTCCAATTGCTAGAAATTTCACTGGAAAACCTTCTGGAATTACAATGCTACAAAGAATTGGATTTGGGATGCTATTATCTGCTATTTCCATGGTCATTGCTGCATTAGTTGAGATTAAAAGGCTGAAAACAGCTCAAGAATATGGTTTGGTTGATCAGCCTAAGGCGACTGTTCCTTTGAGTATATGGTGGCTGGTTCCTCAGTATGTACTGTTTGGAGTTGCCGATGCTTTCACCATGGTTGGGTTGCAGGAGTTTTTTTATGACCAAGTTCCGAGTGGATTAAGAAGCATTGGTCTCTCCTTGTACTTGAGTATTTTTGGGATTGGCAACTTTTTAAGTAGCTTTCTCATCTCCGCCATTGAAAAATTAACTAGTGGGGATGGGAAACAAAGTTGGTTTGACAATAATCTCAACAAAGCTCATCTCGATTACTTCTACTGGTTGCTTGTAGGGCTTAGTGTTATTGGGTTGGCTGCTTTCGTATTTTGTGCAAGAACTTATATCTATAATAAGGGGAACACCACGTAAGTGTAAGTATAATTTGGTAAGGTGTATTTGGTTTGAGGAGTAAGAGAAATTGGAGTTGAGAAGTAAAAGTAGTAAACTCTAGTCTCGTTTGTTCTAAGGGGATTTGTTGATCCCACTATTGAAAACATCAAATTTTTATATTATCAATTATTTACGTCGTGACCGTGGGTTTGAGTGTTCACGAAACCCAAGATTTCAGGATTCCTCAAAGCTCACTATTCCATTGCTTACCTAAAATGCATCTTTACGTACTGTAATGTATTTGAATTTTTGGGAATCCTATTTTTAAAAGTTTTCATAGTTACTTGCGTAGAAGCCTCTCTTGCTTTGTGGGAACAAGAAATTACATCCACCTTGAACTCAACCATATGTTGATTGGGCGGTAATCTTAAGTTAAGTTTGTCAATGAAGATGAAATTTCGTTGATTTGACTGATTTTGTGATTTGTCAAACTTTCCATAAAGCTTAGGAATTTGAGAAGTAGGCATGAAAAGGTGAAGTGCATTTGTTATGTACATTTATACATGATTTTTTTTGCTAATTTTTCTATTTAAAATACCTTCATTTTAATATGAATTGTTTTAAAAGTTATAACTTAAACTACTTATCAAAAGCCAACCTGAAATATAATATAATAGTATAATTACATAATTATATAGTAAAGCAAACTTAAATCTCTAAAATAATTTGGATCAATATTATATGAGTAATTCAAAACTACAAAAACAAAACAATTTTTTTAAGAACAAATGTTTTAAAATTTGCAAATTATTGATTTCATACTTTTACATAATTGAGTAAACGTTTCATACCATATAGCATATACTTTATATTAAGTTAATTTTTAAATATAATATTATCACATTCTATCCTTTTCGTGTTAAGAAAACTATATATATTTAGGATAGTATAAATTCATATATTTATAATTTTAGACTCATTGATATAATGTTTTTAAATAATATAATAGTGTGAAAACAAAACTTTATTAACTTCTAAATTTGTACTCGTTTTAAATATAATATTATCACATGCAATATTCTCTCTCTCTATATATATTTGGGTGCACATCATCGTCTCTCTACCACACAAATTAACGGCCATCATCTATCGACCGTCCACGCTGCTTTATTTCTTTATCTCATGTGCATATTTCCCTTCAGGTAGGCTCAAGGGTGTCTGTGCTACACAAGCTCACGACAGTGACGAAACAAACCGGCCACTTTCACCCATGAATGCAGCGGTGAGGCTTCCTTTTCTTGGCTGTTTATCGACTTTCGCCGCTTTTGGACTCAAATCAGTTTGTCCAAATCTTGAAAATGACAGAGAACGACGAACTCCAACTTATTCGATTACCAATCAGACTACATTTGATGCTGTATGGCTTCTTTCGGTAAACTTGGAGTAGTTTCGCACCAATGCGAACACCTTTTAGCAGCAATTCAAGTCAATTTTGGTAATATTTGGATCGTAAAGTTATGTTTAAACCCAGTAAATCTCTATCGAAGTATGTTGGATCATTCTTTATTCATTGGAAAGTCTCTGTTTTCCTTTTTTGACTTTTTGTTAGACCAAGAGATACTGTAGAACAGTACATTTGTTTTGTTTCTATCTTGTGATGGGTATAAAAAATTCAAAGTTTGAGCACATTATTGATTTCGGTGTGGGTTTTGTAAATATCATTGGAGATGAATGGTCTGCTGATGAGATTGATGCAATGATAAAGCTTAGAGGAAATGGTTTTGATAATGCAATATTCAAAGCCTGGACTAAGTGGTGGTGTGTTCAAAGTTCAAGAAAGTTATCTGTTTTGATAATGCAATAATGGTTTTACCAGTATAGGTATTATGATTTCCCTCCTGATATATGATCGCATACTCATTCCAACTGCAAGAAAGTTCACTGGAAAACCTTCTGGAATTACAATGCTACAAAGAATTGGATTTGGGATGCTTTTATCCATCATTTCCATGGTTGTTGCGGCCTTAGTCGAGGAAAAAAGGCTCAAAACAGCTCAAGAATATGGTTTGGTTGATATGCCAAAGGCGACTATTCCTTTGAGTATATGGTGGCTGGTTCCTC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BLAST of CsGy5G004770 vs. NCBI nr
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BLAST of CsGy5G004770 vs. NCBI nr
Match: XP_016903723.1 (PREDICTED: protein NRT1/ PTR FAMILY 5.10-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 532.3 bits (1370), Expect = 1.1e-147 Identity = 265/290 (91.38%), Postives = 269/290 (92.76%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G004770 vs. NCBI nr
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BLAST of CsGy5G004770 vs. NCBI nr
Match: XP_011654838.1 (PREDICTED: protein NRT1/ PTR FAMILY 5.10-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 500.4 bits (1287), Expect = 4.5e-138 Identity = 245/291 (84.19%), Postives = 258/291 (88.66%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G004770 vs. NCBI nr
Match: KGN50307.1 (hypothetical protein Csa_5G167000 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 497.7 bits (1280), Expect = 2.9e-137 Identity = 241/291 (82.82%), Postives = 263/291 (90.38%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G004770 vs. TAIR10
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BLAST of CsGy5G004770 vs. TAIR10
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BLAST of CsGy5G004770 vs. TAIR10
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BLAST of CsGy5G004770 vs. TAIR10
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BLAST of CsGy5G004770 vs. TAIR10
Match: AT1G72140.1 (Major facilitator superfamily protein) HSP 1 Score: 285.8 bits (730), Expect = 3.2e-77 Identity = 151/297 (50.84%), Postives = 201/297 (67.68%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G004770 vs. Swiss-Prot
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BLAST of CsGy5G004770 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q8VZE2|PTR22_ARATH (Protein NRT1/ PTR FAMILY 5.14 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NPF5.14 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 298.9 bits (764), Expect = 6.5e-80 Identity = 152/289 (52.60%), Postives = 192/289 (66.44%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G004770 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9SK96|PTR10_ARATH (Protein NRT1/ PTR FAMILY 5.16 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NPF5.16 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 297.0 bits (759), Expect = 2.5e-79 Identity = 149/267 (55.81%), Postives = 193/267 (72.28%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G004770 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q0WSZ6|PTR23_ARATH (Protein NRT1/ PTR FAMILY 5.13 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NPF5.13 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 288.5 bits (737), Expect = 8.8e-77 Identity = 151/292 (51.71%), Postives = 196/292 (67.12%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G004770 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9C7U1|PTR25_ARATH (Protein NRT1/ PTR FAMILY 5.12 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NPF5.12 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 285.8 bits (730), Expect = 5.7e-76 Identity = 151/297 (50.84%), Postives = 201/297 (67.68%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G004770 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0KN24|A0A0A0KN24_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G167020 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 614.0 bits (1582), Expect = 1.9e-172 Identity = 303/310 (97.74%), Postives = 306/310 (98.71%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G004770 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S4E667|A0A1S4E667_CUCME (protein NRT1/ PTR FAMILY 5.10-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483057 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 532.3 bits (1370), Expect = 7.1e-148 Identity = 265/290 (91.38%), Postives = 269/290 (92.76%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G004770 vs. TrEMBL
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BLAST of CsGy5G004770 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0KPF0|A0A0A0KPF0_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G167000 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 497.7 bits (1280), Expect = 1.9e-137 Identity = 241/291 (82.82%), Postives = 263/291 (90.38%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G004770 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3ATI3|A0A1S3ATI3_CUCME (protein NRT1/ PTR FAMILY 5.10-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103482564 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 492.7 bits (1267), Expect = 6.2e-136 Identity = 241/291 (82.82%), Postives = 260/291 (89.35%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber Gy14 genome (v2)
Date Performed: 2018-09-25
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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